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Sequence
The following sequences are available for this feature:
transcript sequence >TCONS_00022224 ID=TCONS_00022224|Name=TCONS_00022224|organism=Clytia hemisphaerica|type=transcript|length=3686bp TTATGCCGACCATTACTTGAAGCCAAATTAATGACTTTGGGAATTTGATA ACTATTTGCTTTAAAAACATTAATTGTTCCCTGGCTAGTGAGatccgttt tttttttcaaacacacTTACTTACTCCGTTAATGTTATTGTACAGGTCAA CTAAAAGCACACATTGCTAAAGTGAGAAGGATGTATCATCCCTACAAACA GGCTACAAGCTAACTTCTACCATCCTAACTCTCTTAAAATTCACTGTTAC TTTCTAATCGGTGCGTAATCATTTATTTTCGTTTTATGTTTGTTACTGTA TAATACACCGGTATCTAAGAAAGACATAGTTGAATATACCGACCCAATCT TTCTTAGACACCACCATGAAGTCTCTTTATCTCCAGACATGAATGAAAGC GACAAATTTTCTTTCCCCAAAAAAGACTCCTTATCTGTTCAAAAAACTTT AGGCACCTTGCCTGATACATCGAGATAAAGAGGCTTTACAAATCTTACCC ATGCCCCCAAAATAACCCTCTATATTTCTAATTGAACAGTTTTTTAATTG ATTGACACTGTTTCCCTTTAAACTGTGAATACTGACATGGATCCCTGATG AGTTTTAGTGTGGGGTCAATAACTCTTTAGTTATGTTTATAAGTTCACAT AATGTTTATCTTCGCTCTAAGTCATGTTTTCTCTCCAAAGAATCCTGACT TTCCTGCTGATGACAAAGTGATAGCTttcatgttttaattttcatccGTT CCCCCCTAAGCCCCATTAATTTCCTCTCCACTCTATGATTTACTTTATTT GCTTACAAACTaatcattttttgttgtttttaatattttccttttccatt ATAATAACAGATTTAATTCTTGGGGAATGGATCGACTAATTGATTAATCG AATACTGTGTTCACACACACTACCATACATTGACAGTTTACATTCACGGA TTTCATGGATTTACCTCATGACCACGACAAAAATAATACCCCACAAACAC GTGTCTATGAGATGACACTATGTGTTTTAATTTTcgttttaaaaaacaat tttaacagAATCTTTATAACTATACATATAATTCGTATTTTTACACAATG CAacctttatttttatatttttagaagtCTAGAAACCGAAACTTTTTAAG TCAAGTTTAAAGTTTCTAGTCCCTCTACATAAATATTTGACTAGAATTTT ATATTAGATTAGTTCAGTTTAGTTTGAATACGTAGTCTGTTTAACCCTGG TTCGCTTCtctttcttgaaaaaatgtaaCGGCTTTTCTTCTTGAGGGCGT GAtaggaagaaagaaaaaatggtATTAAAAACCATCTGCTGAAACCACAA GCGACATTGGAATCAGGAGATTTTTTcggaaagaaataaaaacattggaa tattttttgatcttaTCAATCTGTTacatcaatattttttaacttcaata aaaaaacttaactTTGTTGTATCTAGATAAGATTTAAAACGAAATTTTTC TTGGCTTTTACGAACAAGAAAGGACGTACTGATTTTCGTTAAAAGAAAAG CGAAAAATTCTACTAACAATAAATGTTTTTAACAATTAATTCATAGCCGC TAAAGACTAACtttcttgaagaaaaaaaaaaattatgtaacaTCACATGA TACATCCAGGTAATTCTAGATTCCAGAGACCCCTTTCAAGGAGGAAACCT TCGAATTCTGGtgtgtttttttaaatattcttccATCTTCTTTTAAACCA GGCTCTTGTAGAAAACATGTGTATGATTCGATCTCGAATGTTGAGTTCGC TAGTTTTGGATTTATGACTTTGTAGTTTTAAATGCGCATAACGTACTGGA ATACACCCTTATTTCACTCATTTGGAAAAcaaaactaaagtctattcacg ataagtgtgcactcttttttcttttacctataacttttgaaggaattctt caatctttataaatttggtatcattggaaaNAACCATCTGCTGAAACCAC AAGCGACATTGGAATCAGGAGATTTTTTcggaaagaaataaaaacattgg aatattttttgatcttaTCAATCTGTTacatcaatattttttaacttcaa aaaaaaacttaactGCGTTGTATCTAGATAAGATTTAAAACGAAATTTTT CTTGGCTTTTACGAACAAGAAAGGACGTACTGATTTTCGTTAAAAGAAAA GCGAAAAATTCTACTAACAATAAATGTTTTTAACAATTAATTCATAGCCG CTAAAGACTAACtttcttgaagaaaaaaaaaaatatgcaaCATCACATGA TACATCCAGGTAATTCTAGATTCCAGAGACCCCTTTCAAGGAGGAAACCT TCGAATTCTGgtgtttgttttttaatattCTTCCATCTTCTTTTAAACGA GGCTCTTATAGAAAACATGTGTATGATTCGATCTCGAATGTTGAGTTCGC TAGTTTTGGATTTATGACTTTGTAGTTCTAAATGCGCATAACGTACTGGA ATACACCCTTATTTCActcattttgaaaacaaaactaatgCTAATCTTTC TATGACCCAATTCGGTCactaatttttcaaagaattaaCCTTTGTAGTCT TTTGTCAGTGCATTTAGTGATTATTAGTTTAAATTTGTGTTGGTAGCTTA ATTTCTTTTCggtttaatgatttttttaaagaaactatAGATGATTTATT ATACTTTTTAATTACCTAAATTaccaaattttttataaaattatcataTA TATTATACgtgtaaatcaaaaaatttattatCAAATTATTATAGTATATG GTGCTTccggaaaatttaaatattaggattattttttttcggacacgcTG CGCAATGTGTCTGTAGAAAATACAGAAATAGAATTGATATTAAATATCGT TCATGTAATTCAAGCGATGGCTCTTATATCGATgaaactaccttaaggga actaattttggcgggaactaattttggcggatttggtgaatttagacgaa attctccaaaattagttcctgccaaaattaaattttttgtttccttgcct aaataacccctgaaattcatcaaaattgctcaaaataaggcaaaatagaa cagatttacgctgccattcgccaaaattagttcccgccaaaattaaaaat tttaggatatttgctgcctgccaaaattagttcaggccaaaaaagttccc ttaaggtatattcCGTTTTTCGCAGACGCACTTTATATCAGAGAGCTAAG AGAGTGTCAAAAATTATTATTACTATTGTACAAAGGATAAGATTTTCAAC ACTTGTTGGTTTATAAATTAtatggaatttaattttgcaaaaaaaataga tttttatgGTATAGATTTTATTaggaaaatattaaatttttacttcataG AGAAAGAAGAACCTATATGGTATTCATTAAATTATTTACTGTCCCAATTT TTCTTCATTGTTTATCCATCTTTggacaagatcttttttcggaCAGTACC TGATAACTGTTGTGGTCAGTGTTGTAGGAAACGAATTAAAATGTTTTCCT AACAGCTGTTATACAtttgtaatagaccttttcataaattacgtcatgaa catcacttgcctcgtattcaaacaatttccatggtgatcatatcccttga gacattaaatgatttttttaagaataggaagtagtt Run BLAST on NCBI transcript from alignment at sc0000408:185434..189119+ Legend: exon Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below. >TCONS_00022224 ID=TCONS_00022224|Name=TCONS_00022224|organism=Clytia hemisphaerica|type=transcript|length=3686bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000408:185434..189119+ (Clytia hemisphaerica) TTATGCCGACCATTACTTGAAGCCAAATTAATGACTTTGGGAATTTGATA
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gacattaaatgatttttttaagaataggaagtagtt
Gene-mRNA-Prot
This transcript is a part of the following gene feature(s):
The following exon feature(s) are a part of this transcript:
| Feature Name | Unique Name | Species | Type |
| TCONS_00022224-exon-sc0000408-1491911889:185434..189119 | TCONS_00022224-exon-sc0000408-1491911889:185434..189119 | Clytia hemisphaerica | exon |
| TCONS_00022224-exon-sc0000408-1510915933:185434..189119 | TCONS_00022224-exon-sc0000408-1510915933:185434..189119 | Clytia hemisphaerica | exon |
| TCONS_00022224-exon-sc0000408-1575043694:185434..189119 | TCONS_00022224-exon-sc0000408-1575043694:185434..189119 | Clytia hemisphaerica | exon |
Position
The following features are aligned
| Aligned Feature | Feature Type | Alignment Location |
| sc0000408 | supercontig | sc0000408:185434..189119 + |
Blast
The following BLAST results are available for this feature:
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