TCONS_00021828 (transcript) - C. hemisphaerica

Overview


Name	TCONS_00021828
Unique Name	TCONS_00021828
Type	transcript
Organism	Clytia hemisphaerica (Jellyfish)
Sequence length	6345

Sequence

The following sequences are available for this feature:

transcript sequence
transcript from alignment at sc0000395:127099..141573-

transcript sequence

>TCONS_00021828 ID=TCONS_00021828|Name=TCONS_00021828|organism=Clytia hemisphaerica|type=transcript|length=6345bp
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TACAAATGTGGTGGAGGATCCTGGACACCAATGGACATCCAATACAATCC
ACCGTTGAGAAAACTAAATCACACTGTCCTTCTTCTAACACCTACCGACT
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GATCGATTCATGTGGTGTATGTTATGGTGGCTCAACAAACAAAACCAAGA
ATTCACTCAAAGATTGCGGTGGCTCATGTGGGAAATTCACCAGTAATACA
ACATGTGGAAATTGTATTCGTGTAGGGGATACACGAAATTATACGGATTG
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CGGGTGGAAAGACAGGGCGTGCTAAGAACCATGGCGAGGATGCTTGTGGC
ATTTGTGGCGGTGATAATACAACATGTGTCGATTGTGCTGGTACACCTAA
TGGTAAGAAGAAGATCGATCTGTGTAAACTATGTCTATTACCTGATGACG
CAAACTTCAATGCTGGATGCTCCAAACTTGGTGATATTGTACCGAATGTG
TTTTATAAAGATCGATTGGCCAGTGCCAAAGCTACTATCTCCAGATCTGG
TCCAATTATATCTGGAAATGCAATCTGTTCGTTCTACCTTGGTGAAGTTT
TCTCGGCCACtcaTAATTCAACAAGTCCCATCGCTAAAAGAGAACTCACG
TTATCAATTGCATCTACTTTGTCGGGTGGTAATCATAATGTCCGGTGTGA
TACACCAACTGGAGGTGATACGAGGACCAACCTTAACACCACCAATGATT
TGATGATCATTGATCCATCAACCATCGCCATCAACAGTGTGTCATCATCC
ATTATCGATTACGCGGCAACTGAAGAAGTGACAGTCACCGGTACAGGATT
TATGGATACTAAACAATTAGCTTGTTTATTTATTCGGGACCAAGGTGGCA
AATCTAAAAGAGAAGGTCCAGTGTTGAAAGCAACTTATGTCAGCTCTACT
CAAGTGACATGTCAATTGAAACCATTACGTAGATCAGTATCTGGCAAATT
AGTTGTCTCATTTGTTGATTCTAAACGTGAAGAATATTTAGATAATAACA
TCACCTTGCATCGATCAGCTAACTTATCCAGTATTAAGAGTGCAACCTTC
TCGACTGATCTTGGTAGTATTTGGATTACATTCCATGGTTTTGTTGGTTT
GAAGAACAAAACAGCATCATGTCAAGATATCTTTCCTCAGAATTATACAA
GTTTCGGTGCAAAAGCTAGGTGTTTTAGCCGTGGTAAGATTTTGGCCATT
CTCTTGATGGGTGATGCTACTATTGGTGTCGGAGCACTACACGTTGATAT
GACTCAATTCGTTGTTAAACCGGCTGATTATACCGTGTATCCTGAGAGTA
CTGGCGTCGTTGATGTGGCCCTACCACCTGGCGCAGCTGCGCCGAAGATC
AAATTGGTCGCTTCTAGACAATTAGGTCGTTGTGACGATATGGTGGTCAA
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TATCTTGGAGCTCATCCAACACTGCAATTACCACAGCCCAAAACAACAGT
TTGACTTCGATAAATCAAGCCCTGTCTGCTTTGCCTGGGGAATCCTCGAT
AATCAAGGTGACAGCATCAGGCATTGGCAACGACTTGATGAATGTTGATC
TTGACGCCACTGTGACCATCAGAAACTTCTTGGGCCTTGAAGGAAATCAA
ACTATCAAAATTCGAAGAGAAAACAAAGATCTGCCAAAATTAGTATTGAA
CAGACAATCCGTAGAGATTAGAGCATCACAAAAACTCATATTGAAAGCTA
AAGCAAAGCTCCCTGGTTGTGGTGGATCTAACAGTGCTCAAATGGATTTC
TTATGGTCTCTAAGCAACGCAGATGGTTCACAGTCTAGTGTAGTTTTAGC
TAAATTGGACGGCCCGAGGCTCATCATCCCTGCACAATCACTAGCCGGTG
GAAGCAGTTATATAGCACGTGTTGATGTTTCCATGGTTACCGATCCCTCC
TTAACAACCTATGATGAAGTTAAAATCACTGTCAAAGAAACCCCTTTGGT
TGCGAGAATTTCCGGACGTCAAACTGTTGGCCAAGCAGGAACCATGAAAC
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TTGAATCAAACTTGGAGCCAGGACAATACAAAGCAACCTTAACTTACCGC
GTTGGTAGTTCTCGTAAAGCAGAATCAGATTTCCAATTCACTGTTGATGC
TGGTTCACCACCAGAGCTTGAACTAACTCAATTTACTGAGCTTCAAAATC
CATCGGAAAGAATGAAAATCTTAGCCAAGACTAAAAGTCAACTTGCTATT
ACTGCAGAACCTGAATGGGTCGTCTCTAATGGTGTTGAAGGTATACGTAA
GGGCGGCAAGAGGCGTAGTTTGTACATAATCGGGGCGGGAACTTTAGACG
AGGATACAACTTATGATGTCACAGTTACCGTTAGCAACAGTGGAGCAACA
TCTGAATCTGTAACCACATTCATAACAAACTCAAGACCAATCGCAGGTGC
AATTTCAATTGAACCAACCAATGGAACAGAATTTTCCACCAAATTTGCTT
TAACTGCATTGGAAACGCATGGTTGGTTCGATCCCGATGGTGATGAGTTG
GTGTATGAATGTGGGGTGATTAAGGACGGTGTTGAAATTCCTTTACGTCA
ATTCCAATCCGATAAATCATTCACTGATATCGTCCTTGAAAAAGGATCAC
AAGAAATGTACATCAAAAGTTGTGATTCTTATGACGCATGCGCGACAGAG
ACGCTGACGTTGACAGTTGACCCTGTGGTTGTGGACGATGCGTTTCGTTC
ATCTGTTGATAATGAACGAATCAAACTTCGTGATATGAAACTCTTCTCTG
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AACAGTCCATCAAGACGTCGAAGGCGTAGAAGTTTGGACAATGGAAACAA
TGCAGTCGATTGTGCGAACTATGATAGTAACACCATCTCCACACAGACTA
GTTCCCTAGAGGATCATTTGACCGCTTATGAGACAGGTCAATATAACTTT
GAACAAGATCCATCCTCAAGAACATTGTATTTGGATTCACTTGCACAATT
TACGACATGTGGTTCCACCATCTTGACTTCAAACAACATCAAAAGGACTT
ACGACGTATTGGTGGAAATAATTGAACCTTTGATCGCCAGAACTCCCACT
CAGATTGAAGCGGGTTTGAAATCATTCGACAACATAATCACAACTGGTGG
TTACGACTCCAACCAGCAAGCTGCCAAACAATCCTATCTCTCATCTGCAA
CTCGGCAAACACAGCGTATGTGTCTTAGCAAACTTCCTGGTGAAGATGCA
GCGATCGCCAAAACAACTTTAGCCACTTTACAATCAATTCAATTGAGCTT
ATCAGCTTCTGAAAGTAATTGGACTAAACTTGGCTGTGATGATTGCACCA
CTAAACCTTCTTATGTGGACTTGAGAGAATTGAAAACACAATTCAGTAAT
GATTATACGTGTGGTGATGAACAATGTTCTGGTGCTTGTGTTGCTTCATT
CCAATATCCAAACGATCTGTATGCATCAAGTTTCAACGATACCATGTTAT
CTCACGTTTTGGACGTCCAGTTATTTGACTCCAGCACCACCAGCGCTGGC
TCGTTAAATGTCACCACTGTCTCTGGTGGAATTGATCTCCATATTCACGT
TACCAAGGAAACTAATAATACTTATAAATGTTTACGCTGGCACAACGATT
CCAGCAGTTGGGTTACGGACGGTGTGGAAACACCCTCGGATGCTTCTTTC
CAAAAGAACTCTTTACCATACGTCTTATGTCGATTGACCACTATGGCACC
TGTTGCTCTATTTGAAGGACCAGAACGTATTGAACCTACAAGCTCAAGCA
TCAGTACCATGGCTTTCTCCTCCAGTATTTCACCATCAGCAAGCCTCAAT
AACTCCATGATGTCAACTGCAGTCGTCCCAACACTCTCGCCACAAAACTA
CCCACGTGCTGTACAATTTTCGTTCCCATTCTCCAACTGTACTGATCAAG
CTGTCAAAACAAGCAAAAGCTCAATTCAGCAACAAATTGCTGACAAACTG
AACATCAGCAAAAATACAATGACCAATTTTACAGTGTCATGCGGTAGTAT
CGTGATCTACTACATTCAAACACACGACAGCAGTATAACCGCCCAGCAAG
CAGTCACCCTCCTGCAAAACGCCATCACTCAAAATAACCTTAATATCACT
GTAGCTGGACAAGTCTTATCTGTTAACCAATCTTCATTGATGGTAACAAT
CCAAACGCCCAATTATGCTATTACAACAACCGCCCCGCCCACGGAAGATA
CAGATGAACTCAGTGGTGGAGCAATAGCTGGTATTGTtattggagttttg
atattcaTCATCATTGTAGCCGTTGTGGTTTATTTCATGTGTTGTAAGAA
AAACACCAGGAAAGATAATCAGATTGAACCCAATGAAAATGACGTCGAAT
TAAGAGGAAAATCGAATCGCGCTTATCAAGGATCGCCGTAAAGATCACTA
TAGCAAATAGATGTCTTAATGTTATTATAACAAGagtgaataaaaaaaca
taaagcCCATGCTTCTATGTTGACGTAGAAGCTATGGATGTTATATATTG
CGGACCAGATATGTatattttgcagaccagatagACAAGGGAAAGTTTTT
GCACCAAACTTGTTGACGATGGAGGTTATTAGACTTCTGAAGAGTGAAAA
CACAAATCCCAGCGAACACGCAACTTTTATCTAACGTCTGCCTAACGTGA
AATGAATgtttaaaaaacgttgtttgcATTCTGAGAATGAAATGATTGCA
CGGGAGAAAAATATTTGGAGCCCACTCACAGGGCTGATGGACTTTTTTAA
CTGatcaaaaaaatgatgaacatttttttaaatatttatttatatataaG
TGCCTTGTCACCAAAGTGCGTGTTGGTAGTATGTAATCGAAGTGAAAAAA
TCTTAAGAGGTCTTTTTCGATGACTGAAATTGAATTATAAAAATTGTACC
TCATGTCCTTACCGAGGCACACGacatcaaaaaaaggtttttttagtata
ttttgggtaaatttttGCCTATGAAGTTTGTTTAACTGCATGTATTATAG
TAATTTGTTGATGATACTAAAAATCTACTTTGTAAATAGTCTTAACGTAA
AAAATAATTactaataaaatcttttgtctgaTGCTTAAAGATCTT

Run BLAST on NCBI

transcript from alignment at sc0000395:127099..141573-

Legend: exon

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>TCONS_00021828 ID=TCONS_00021828|Name=TCONS_00021828|organism=Clytia hemisphaerica|type=transcript|length=14475bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000395:127099..141573- (Clytia hemisphaerica)
TAGGTATTGCTGTTATCTCTGCTAAAAACACTTCATACGGTTCATGGGAA
TACAAATGTGGTGGAGGATCCTGGACACCAATGGACATCCAATACAATCC
ACCGTTGAGAAAACTAAATCACACTGTCCTTCTTCTAACACCTACCGACT
CGATTCGATTCTTACTTCAAAATGAATCTTCGTTCTGGTCTCAGAGAGAG
GCATTTGAGAAAAATATTCNCAATTTCCAGATGTTTTGTAGAACAGATGG
AGAATTTTCAGCTGCCACTCCAGGCAACCACATTCAGGACTTTTTTTAAA
TTCCCTCAGAACAGATAGGAGATTCTTAGACACGTTATTTATAAATATAA
GATATCAGACTATTTTTTCATAAGAACAGATCATATTTTTCCAGCTGGTC
CCAATCTTCAGTAGAACAGACCACTTTTTTCCAGCAGACTTTTTTCTTTA
GTTCGGTAAGAACAGACCCCCATATCCAGCTGGAACGTGCCTTCAGAACA
GATATTTTGAAGTCCTCCTTCGGTGGATGCTTTCGAATATATGTAAAAAT
AGTCTTCAAAACCTCTGTCTCTATAATAAATACCTATATTTTTCTTTTTT
AGGTATTGCTGTTATCTCTGCTAAAAACACTTCATACGGTTCATGGGAAT
ACAAATGTGGTGGAGGATCCTGGACACCAATGGACATCCAATACAATCCA
CCGTTGAGAAAACTAAATCACACTGTCCTTCTTCTAACACCTACCGACTC
GATTCGATTCTTACTTCAAAATGAATCTTCGTTCTGGTCTCAGAGAGAGG
CATTTGAGAAAAATATTCAGTTACAAGTGTTGGCTTGGGATCAAACCGAT
AATCAAACATGTGGTACTTACCTTCATACTGGCTCTGATTGGCCCGCATC
TATGAGTATGAAATGGGCAACAGGTACACTTTCATTTTTACAAGTGAGGA
CAGTGCTAAATTCGAAATTTGCAACTGTATTTTTTTAGTTTAATAAATCA
ATCCTTCAATGCATCTTCAATAAAAGATTAAATAACAGAAGTTGCTTTTG
TTTCATTTTGAAATCTATTTTCTAAACGTTTCGGCCTCAACAGAGTACCA
TCATCAGTAAAAAAATTTGTTGTAATGTATTAGCTATCTACAAAATGTAT
TTTTGGTCAAATTATGAACTCCGACAGATCGAACCCGTCTTGTATACCTC
AAATAAAAAATACAGGATGGGTCTGTCTTCTCTAATTAATGAAAATATTG
GCGAGCACAGGTGAGCAATATATTATTCTTTTTTTTTACCATATTTTAGG
TATGCAGTTACGTAAAGGTTGCGATGGTCGACCAGGTTTCGTTTTGAAGA
TCGACGTTTGTGGAACTTGTGGTGGAGATGGAAAACGTTGCCGAGGGTGT
GATGGTGGTGTCAACTCTGGTGCCAAGATCGGTAAGATTGATTTCTTAAG
ATTTAAGTAATTTAGAGATGTGCTTTGTTTCACTCTCGTAAGACGTCACT
GCTATATAGGAATTTTGAACAGCTACCTTCGTTTACGAGATGTGAGTTGA
TGTAATCCTTTGTGTGTGTTAATGCCTTATGTTTACATCAATTAGTAACT
GTTATAAACTTTCCCAAGGTAGTAAGTCGACCAAAAAATCCCTTGATTGT
AATCGCTTGAAATGATGCTGACCCATATCTCTTCATAACCCTTAAATCTC
TTCCATGGACTTTCTGTTTATGATATTAATCACTGCCCTGACTTCACAAA
ATTAAATGACTCTCAGACGGCACACAACGTTAAAACAACGTCCATGTGAC
ATTCATAACGTCCAAATAACGTTATTTGAACGTTACAAAAACGTTGTGTG
CCATCTGTGCTTTGTTTCTTTTACTTGCAACTTTTTTTTTTGGGTGACCA
TGTCCTGAATAGCAAGAAACTAATTGGCTACAATCACTTTCTTAGATTCA
TGTGGTGTATGTTATGGTGGCTCAACAAACAAAACCAAGAATTCACTCAA
AGATTGCGGTGGCTCATGTGGGAAATTCACCAGTAATACAACATGTGGAA
ATTGTATTCGTGTAGGGGATACACGAAATTATACGGATTGCAACGGTGAT
TGTTTTGGAAGAGCTAAAATCAACAAGTGTGGAATCTGTACGGGTGGAAA
GACAGGGCGTGCTAAGAACCATGGTAATGAATTGTTTGCTATTAGGTTCA
GTACTTTGTAGGGAACTTATTTTTGGCAAGATATTTTTTGGTAAATTTAA
ATTCGTCATATTAAACTTTTGTGAAATGTTTTAATATTTAGCCTTTTCTT
CACGCCAAAATTTGGATTTTTCGTGCAAGTGCGAGTTATGCCAAAATTTG
GAGTTCGAGTTATGGAGTCTCTACTGTAACACATATTTTCAAATAAATTT
CTCTTAGGCGAGGATGCTTGTGGCATTTGTGGCGGTGATAATACAACATG
TGTCGATTGTGCTGGTACACCTAATGGTAAGAAGAAGATCGATCTGTGTA
AACTATGTCTATTACCTGATGACGCAAACTTCAATGCTGGATGCTCCAAA
CTTGGTGATATTGTACCGAATGTGTTTTATAAAGATCGATTGGCCAGTGC
CAAAGCTACTATCTCCAGATCTGGTCCAATTATATCTGGAAATGCAATCT
GTTCGTTCTACCTTGGTGAAGTTTTCTCGGCCACGTGAGTAGATTCAAAA
TCATATTAGATTTAGAAACATAATGGTTTATTATAGTTTTTTTAATTCGA
AGCTATTGCTACATCTATCCCACCTGGCACACAACGTTGTTTTAACGTTT
ATTTAACGTTCACAACGTACAAATAACGTTAGATAAACGCTGAAACAACT
TTGTGTGCCAGCTGGGATTGCCTTTACTTCGAATCCAAATATCTAGAGAT
CGGATATCGACTATAGATCAAATCAAAGTACATGTTTATTTTCGCAGCTG
ATTTATGGCTGGTTTGTATTGCTTTGATTATGAGAATATATTGATCTATT
TTCTTTTTTAGTCATAATTCAACAAGTCCCATCGCTAAAAGAGAACTCAC
GTTATCAATTGCATCTACTTTGTCGGGTGGTAATCATAATGTCCGGTGTG
ATACACCGTAAGTTTCAACTTAATAGTTTTTTCCTCACACTCCTCCACTG
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GCCAATCTTTTCTATTCGTAAGCCCTTGGCATAGCACATATTTAAACATT
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TCCTGATTGTTGTATTCGTTGAAAGACTAACCTCTCACCATTTATTTGCA
CAGTTTTTTTAAACCAAAACAACTTCCAATTCCACTTCCAAGCCACACGT
GTATTAATTTGAGAAGTTCTATTATTAATCCTGAATTATCATAAATATTT
TACTTGGCTCTGGTTTTCATTGAGCACTCTGCAACGTCAATCACAAACAA
TACTTTATCATAATTATCAACATAATAGGCGCTCCTCTTTCTATGTGTCA
TAAAAGAATATCTTTAATTCGTATCTATCTATACTAATATAGAACTGGAG
GTGATACGAGGACCAACCTTAACACCACCAATGATTTGATGATCATTGAT
CCATCAACCATCGCCATCAACAGTGTGTCATCATCCATTATCGATTACGC
GGCAACTGAAGAAGTGACAGTCACCGGTACAGGATTTATGGATACTAAAC
AATTAGCTTGTTTATTTATTCGGGACCAAGGTGGCAAATCTAAAAGAGAA
GGTCCAGTGTTGAAAGCAACTTATGTCAGCTCTACTCAAGTGACATGTCA
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CATCATGTCAAGATATCTTTCCTCAGAATTATACAAGTTTCGGTGCAAAA
GCTAGGTGTTTTAGCCGTGGTAAGATTTTGGCCATTCTCTTGATGGGTGA
TGCTACTATTGGTGTCGGAGCACTACACGTTGATATGACTCAATTCGTTG
TTAAACCGGCTGATTATACCGTGTATCCTGAGAGTACTGGCGTCGTTGAT
GTGGCCCTACCACCTGGCGCAGCTGCGCCGAAGATCAAATTGGTCGCTTC
TAGACAATTAGGTATGTGTTCTAACCAGCCAATCCAGAGTTAAGTTATAG
GTATGGGATCAAGAAAAGTAAAAACTGAAAGTAAACTAGATATCTCTGCT
TATCGAGAGGCCTATCAATCGATGAGTTGAAATAAATTGAATGCACGAAG
GGGAGATAAAGTATACATGTGTCCAACTATATTCACTCATACAGGAGATT
TAGGTAGCAGAGCAGGTGTATGCATTTTGTCCTTATTGGGAGTCATCAGC
ACTGCATACCGTATATATTTCAACTTCGCATGGTGTCTTCTAGACGATTT
AATTGCAAGAATCTTACCAATACGAGCTATTGATATTTAACTGTCTTTTC
ACAGGTCGTTGTGACGATATGGTGGTCAAAGCAAAAAAACGCAAAGGCGG
TGGTCGCAAACTGACCTACACTTGGTCTGTATCTTGGAGCTCATCCAACA
CTGCAATTACCACAGCCCAAAACAACAGTTTGACTTCGATAAATCAAGCC
CTGTCTGCTTTGCCTGGGGAATCCTCGATAATCAAGGTAATTTATGATAA
TTTATGACAAATACCTCTTTCTTTTGGTCGATGCATGTGTAGATATACCG
GATGTGTAAAAAAACGCCCCTTTTTTACAATCTTTGACGTATTTTTTTTA
TATAGTTAAGCTGCTTGAATTTTTTTCTGAGTATTGTACATTGTAAATGT
AATACTATCATGTCTGTGGACCGATTCTGCCGTTGGTCTAACAGTTCTTC
TGAAGACCTCTACAGAATGTGCTGAAAGTATTATTCCCCGTCTATCCGTT
TTTTCATATGCAACTCCAATTTTCGGCTCCGAATTGGGACTGCTTAGCAT
CTTAGCTCATTTGCTGAAAAATTTGTTTTGAGCATCCCTGATATTTTACC
ATATTTGTACGCTTACTATTGGGTTAAGGGTTATCGTTTGTCATGCTTAG
ATTATCTAAGAAGCTTTCTACTTTACGAGATAGTGAAAAAGATCACCTAA
TTTGAGTCCTCGAGCCTTAGCAACCTGGTTGCTTTTAAAAAATGTGTATA
TATCTATTTTTAACTCTCTTCAACAAAAATCATCTCTTAGAAATTGCTGT
CTCTTTCCTTACTGTGCAGGTGACAGCATCAGGCATTGGCAACGACTTGA
TGAATGTTGATCTTGACGCCACTGTGACCATCAGAAACTTCTTGGGCCTT
GAAGGAAATCAAACTATCAAAATTCGAAGAGAAAACAAAGATCTGCCAAA
ATTAGTATTGAACAGACAATCCGTAGAGATTAGAGCATCACAAAAACTCA
TATTGAAAGGTAATTTTAATCACAGCATAAACAGCCAAGGAAACAAGAAT
TTCTGTCTTTTCTTATTTGGATATAAATCATTGCAACGGAATCATATTGA
ATAGTGCTCGATGATAAACAAACAAGATACCAGAGCCAAGTAAAATTGAA
AAGTTTCGTTATGTACTGAATTACTGAAAGAAAACTTTTTAAATTTTTTT
TCGGATATATTTAAATCTTTAATTTGCGGGTCACGGAAAACAAAAAAGAA
ATTTTATCTTCTTGAAAAGAAAGAGAATGCATTGCGCGGGCGAGTCTCGA
GTCTAGCTCTTCGGGCTTAGAAGTTTATGGTGTCTGCCTTCTATTGTCAT
CTACTTCAAAGAGATGAACCCTTTCTGTAGCTATCACTTATTTTTATATA
CTTCTTTTCACTTTCCAAAATACAGCTAAAGCAAAGCTCCCTGGTTGTGG
TGGATCTAACAGTGCTCAAATGGATTTCTTATGGTCTCTAAGCAACGCAG
ATGGTTCACAGTCTAGTGTAGTTTTAGCTAAATTGGACGGCCCGAGGCTC
ATCATCCCTGCACAATCACTAGCCGGTGGAAGCAGTTATATAGCACGTGT
TGATGTTTCCATGGTTACCGATCCCTCCTTAACAACCTATGATGAAGTTA
AAATCACTGTCAAAGAAACCCCTTTGGTTGCGAGAATTTCCGGACGTCAA
ACTGTTGGCCAAGCAGGTATTTCGATTCAACGTTTTATTGAAATGTTTTT
CTGAGAACCTTTATAAAAAGACTTGATACTCTTAGAGAAGATCATTCAAA
ATATTCGCACTTATTGCCGGGGATAAGAAAGTTGATATAGTTGTAGTAAG
TTTGCGACCGCAGCTGGAGGCGACCCGAAGGCTCCTCTTTCGATAGCTAT
CCACCCGAAAGTAGGGGAGGGCATCACTCTTTATTCATTGATTGCTCCAC
TTACTCTTGACCTTTATCTTAATTGCTGAGCATCAAGCAGAGAGGCATCA
AGTACCATTTTTGCAAATTTTTGGTATGACCCGGCTGGGGGTTGAACCCA
AAACCTTACGCACCGTAGCCGGATGCTCTACCACTGCACTACGGTTGATA
TAAAATTCCCATAGCCCGTCATCACAGGTTCAGTCTCAGAGAAAAGTTAA
CTCTGACGACAGTAAGTTTTCCGTTCAGGCTGTACGCTTTCAATCAAAGC
ATGAATTTTAAGAAGATGTATTTTTTTGAAGAATCGTAAAGTATGTGTAA
ATAGCATCAACTTTAAAGTATAAGAAATTCTCATTCTTTCTTACAGGAAC
CATGAAACTTTCAGCTAAAAAATCACGTGACCCCGATGGTGCAAGTTTCG
AAACAACTTCTTACAGTTGGCAGATATTGACGAGAGAAGGAGGTGGTGTA
GTTTTCAATGGAAGTGCAAAAGTTTTATCATTTGAAGGTAATTTGATCTC
GCCTTAAATATGGATACCAAAACCATAAATACTTTTAATTGCCTCATTAT
TGATGATAGACCTTTAAGGAGTAATTTTGTACCTGCATCTAATCAGCCAA
CCTATCTTGTACACACAACGTCAAAATTACGCCCATAACGTCAGAATTAC
GCCCATAACGTCAAAATTACGCCCATAATGTCAGAATTACGCCCATAATG
TTTAATGAAACGTTGTAGCCTGATTGTGAGCCAGCTGAGAAGATGAAAAT
AGAGAAAGTATTCGAAGATCTTTGATGGTGTTCATTTCCATACGAGTGTC
GCGCTATTGTATACAGTAACTCTAAATTTCATTACATATTATTACTTTTT
CCAAATTAAACTTTTAATAATTTCATATTATCAAACAGGACGTGATATTT
CATTCGATGTTGAATCAAACTTGGAGCCAGGACAATACAAAGCAACCTTA
ACTTACCGCGTTGGTAGTTCTCGTAAAGCAGAATCAGATTTCCAATTCAC
TGTTGATGCTGGTTCACCACCAGAGCTTGAACTAACTCAATTTACTGAGC
TTCAAAATCCATCGGAAAGAATGAAAATCTTAGCCAAGACTAAAAGTCAA
CTTGCTATTACTGCAGAACCTGAATGGGTCGTCTCTAATGGTGTTGAAGG
TACNTTGAACTAACTCAATTTACTGAGCTTCAAAATCCATCGGAAAGAAT
GAAAATCTTAGCCAAGACTAAAAGTCAACTTGCTATTACTGCAGAACCGG
AATGGGTTGTCTCTAATGGTGTTGAAGGTATACGTAAGGGCGGCAAGAGG
CGTAGTTTGTACATAATCGGGGCGGGAACTTTAGACGAGGATACAACTTA
TGATGTCACAGTTACCGTTAGCAACAGTGGAGCAACATCTGAATCTGTAA
CCACATTCATAACAAACTCAAGACCAATCGCAGGTACCAAAACAACAACC
CATTTTTCCTAGCACCAATCCAGGACAAACATCTTAGAAATATATATTTG
GAAAAAAAATCAGAAATTCTTAAGGTGTTCTTAACTTCTCTTAGCCTCGT
TCAGCCAAACTTTCATATTTTTCTGAAATTGATATTCAAGACCTAGCCTG
AAATGTGGACCACGTGTTGTTACAGTAGATATCTATATTATCGATTAACA
GTGATGACCTGGCTAACTATAAGATAAGACACGTGCAAACCCAAGTTCTG
AAGCCGGTTCGACGTCATTCTCAACCGAAACAACACTTAAAGTTCAAGAG
GGCTGAACAGCACTTTTAAGCTGCTACCCAGTGGAACGTGAATGCCCGAA
TGGGCGTTGTGAGGGCGCTAGTTGGGTGGTATTGAAGAGAAGCCGAAGAC
GGCGGGATAGACTGGAAGACACATAAAGTTTGTTGAAATAAAAAATGATT
TCACGTTTCTATTTTCTAGGTGCAATTTCAATTGAACCAACCAATGGAAC
AGAATTTTCCACCAAATTTGCTTTAACTGCATTGGAAACGCATGGTTGGT
TCGATCCCGATGGTGATGAGTTGGTGTATGAATGTGGGGTGATTAAGGAC
GGTGTTGAAATTCCTTTACGTCAATTCCAATCCGATAAATCATTCACTGA
TATCGTCCTTGAAAAAGGTATCAAACGTTTCAATTTTTTCAACCATAAAT
TTTAAAGAACTTCTAAGGGCTAATAAGAAAATTCTAAAACACCTGACTTT
TTATAATGCTTAGCTTGCATTTTGAGAAATTTCCAGCAGTTCTGAGTTAC
CTCGATAATTGTTCGAAATTCAATAAGTATCCAAGTTTCTAAAATTTTTT
TAAACTTTTGACTTGTTTTAGCAAGATTTTACATGCCAAACTTCGACTCG
ATTTGATTAAGTTCTGTTCTATATATGATATGAATAATATTATCCAAAAT
GATCTCCATTATTGAAGAATTCTAAAGAAAGATCAGCGAGAAATCATTCT
AAATTCAATAGCATAGACTGAAGTCAAATTTGAAAATTTTTCATGACAGG
ATCACAAGAAATGTACATCAAAAGTTGTGATTCTTATGACGCATGCGCGA
CAGAGACGCTGACGTTGACAGTTGACCCTGTGGTTGTGGACGATGCGTTT
CGTTCATCTGTTGATAATGAACGAATCAAACTTCGTGATATGAAACTCTT
CTCTGAATCATCTGGTAGGTTTTCTTTCTTTTTTTTAGTTGGTTGAGGCT
CGTATAAAACGACTGCATGCCACCTTCTGTTCTAAGTTTCTCTAAATCTT
TTCCAAAAACTCACTATATCTCTACCAACAGCGTCGGATGATAACTCCCA
TCCTTGCGTTCTTAAAAGTTTCCATTTAGCTAGGTTTGGTGTATAAGCGG
TGTATATAAGAAACAGAAATGTTGCATGAGCTTTTTTAAAAGTTTCTATC
TATTTTCATTTCTCTTATCACTAGGTATTGCAAAAACTGGTCTTAAAGTA
TTGCTCAGTAGCTTAAACAGTCCATCAAGACGTCGAAGGCGTAGAAGTTT
GGACAATGGAAACAATGCAGTCGATTGTGCGAACTATGATAGTNCTGGGA
ATTTTTTCAAAAATTAATAAACGGGGGGGTCCTAATAACGTCCGGGGGGT
TGGAAAAAAATCGAAAAATTAACAAGCGGGGGGGCGTTTATTTGGCACCT
TAGTGTATCTCCACCAACAGCGTTGGCTAACTCACATCCTTGTGTTCTTA
AAAGTTTCCATTTAGCTAGGTTTGATGTATAAGCGGTGTATATAAGCAAC
AGAAATGTTGCATGAGCTTTTTTTAAAGTTTCTATCTATTTTCATTTCTC
TTATCACTAGGTATTGCAAAAACTGGTCTTAAAGTATTGCTCAGTAGCTT
AAACAGTCCATCAAGACGTCGAAGGCGTAGAAGTTTGGACAATGGAAACA
ATGCAGTCGATTGTGCGAACTATGATAGTAACACCATCTCCACACAGACT
AGTTCCCTAGAGGATGTGAGTGGAAATTTCTTTCTACCTAAGGGAACTTT
TGTCTATACACAGACCCAGTATCTACGGCTAATTTCAAAATTCATCGCCG
TAGTACTACGAAGCGATAAACGTGAGATATACTCTGGCACAGAGTAAGAA
AACTTCTGCTACTGCTACTGTTGTTTCATCCAATCAAATCTAAAATTGAC
ACAGTCAGAAATAAGATCCTCAGATACACCCGTGTATCACAGACCCGGTG
GAAAAATAGGCCAAAAATTTGTCCCCGATGGAAAAAATACCCTAAAATTT
CAACCCCACTGGGAAATTGCTCAATGATTTTATCCACATTGGAAACTTAA
TGGGAAAAATTGCACTCCAAAACCTTCCCTACTGGAATTTTTTAGCTGGA
AGAAAACAATGGATTTTCTATCCCCATTGGGACTTCGATAGAAATTTTCA
TCCCCAGTGAGCGAAAAAGCTCCACCGGGGCACTGAGACAGGGGTGTTCA
GATTTGAGATGTTTGGTTATTTAGACTTTTTCTCTTAAACTATACTATTT
CACCTTTTTCAGCATTTGACCGCTTATGAGACAGGTCAATATAACTTTGA
ACAAGATCCATCCTCAAGAACATTGTATTTGGATTCACTTGCACAATTTA
CGACATGTGGTTCCACCATCTTGACTTCAAACAACATCAAAAGGACTTAC
GACGTATTGGTGGAAATAATTGAACCTTTGATCGCCAGAACTCCCACTCA
GGTTGGTCCAACTTTGTTAGCTCATTTTTCTATTCGAGCTAAGTTATTAA
AAAAGGACGATGAACCCTGAGATCTACATTCTAAAAACGTTTTTTAAGAA
TAAAGGAGGCATTTTTATTGTTAAAACATCACTTTTTTCTAATCCAGATT
GAAGCGGGTTTGAAATCATTCGACAACATAATCACAACTGGTGGTTACGA
CTCCAACCAGCAAGCTGCCAAACAATCCTATCTCTCATCTGCAACTCGGC
AAACACAGCGTATGTGTCTTAGCAAACTTCCTGGTGAAGATGCAGCGATC
GCCAAAACAACTTTAGCCACTTTACAATCAATTCAATTGAGCTTATCAGC
TTCTGAAAGTAATTGGACTAAACTTGGCTGTGATGATTGCACCACTAAAC
CTTCTTATGTGGACTTGAGAGAATTGAAAACACAATTCAGTAATGATTAT
ACGTGTGGTGATGAACAATGTTCTGGTGCTTGTGTTGCTTCATTCCAAGT
GAGAAATACATCCTTCCTTACAGCTCATATTCATTTGTTAATTTTCAAAG
TCAGTAAGAAATTGACATGAAGTGTTATATTTTAAATTAAGCATAAGCGT
TTTGACAGATGTCATTTTCGGTTCAAATTATTCATAGATAAAAAGCCTTG
TACAGGTTAACAAGAAAAATGTTTCGAGAAATGACTGTCATTTCCCATGT
GTTATAATAGATAATAGATATATTTGATAGATAGAGAATGATTCATTTGT
GTTCTTTCTGTACAAACAAGCACGTAAGCACGACTTCGATACATCAATAT
TGATTTTTAGATAGGCATTGAAAAACATTAAGCCTCTGTTTTAATAAGCA
TTCAATTTTAATGACAGATGTTTTGTCAATTTGTTTAATTTCCACAAAAT
CATCTGCAAATGTCCATTTTAGAGTTTCATGCATGAATAATACTATAAAT
CAATTTTGATTTTCAGTCTTACAATCAAATTTCATCCATTCATCTCTTCA
TTTTAGTATCCAAACGATCTGTATGCATCAAGTTTCAACGATACCATGTT
ATCTCACGTTTTGGACGTCCAGTTATTTGACTCCAGCACCACCAGCGCTG
GCTCGTTAAATGTCACCACTGTCTCTGGTGGAATTGATCTCCATATTCAC
GTTACCAAGGAAACTAATAATACTTATAAAGTAAGTATCTGATTCCTTTT
AACAAAAGTCGAATTTATTTTGTTCATTTTTTATTTGCTGGGTTACTTAT
TTTCACGATTTTCGTAAATTTGGTTATTTTGACGAAAATATGTTTGCATT
TCATGAGGAACATCGAGTGGATGATGCGGACCTACGTAAAAATGAATACA
AAATTTTGAGAATGAATCTTGAGAATAAATGACCACACAAAAATTGATCC
AATGTCTAACTCACTGTCACGTCGCCTTATTTTGGACTGTAATATGTTTG
GTATAGGTTGGGTATCTTATCTGATTTCCCTTTTATTAACTAGTGTTTAC
GCTGGCACAACGATTCCAGCAGTTGGGTTACGGACGGTGTGGAAACACCC
TCGGATGCTTCTTTCCAAAAGAACTCTTTACCATACGTCTTATGTCGATT
GACCACTATGGCACCTGTTGCTCTATTTGAAGGACCAGAACGTATTGAAC
CTACAAGCTGTAAGTTATATTTTCTGTGATTTTAATGACTAGAAACGAAA
ATCATTATTATGGTTAACAACTACAATTATCAACGTCGCAATAAAGACCT
CCGTATCTTTGTTATTAACGAGTTTATGTATTTGCACTTTTGAGGACGGT
AGAGTGACTAAAGTGATTTGTAAAAATCTACAGTTATGACCCGCAAAATT
GAGGACTGTAAAAGTGCTGAGTTACCTTCCTCCTCAGTCATTCGGGATGT
AGACAAATTATAACCTTACCGTCTCCGTCGCTGAAAAACACAATACATAA
ATACAAACGGTACTCCTATAACACATTGTCCTTCATTACTAAGCATCAAA
ATTTACTTCCTATGATATACAACCAATCTCTTCTTTCAGCAAGCATCAGT
ACCATGGCTTTCTCCTCCAGTATTTCACCATCAGCAAGCCTCAATAACTC
CATGATGTCAACTGCAGTCGTCCCAACACTCTCGCCACAAAACTACCCAC
GTGCTGTACAATTTTCGTTCCCATTCTCCAACTGTACTGATCAAGCTGTC
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CAGCAAAAATACAATGACCAATTTTACAGTGTCATGCGGTAGTATCGTGA
TCTACTACATTCAAACACACGACAGCAGTATAACCGCCCAGCAAGCAGTC
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CATTTTTTTAAATATTTATTTATATATAAGTGCCTTGTCACCAAAGTGCG
TGTTGGTAGTATGTAATCGAAGTGAAAAAATCTTAAGAGGTCTTTTTCGA
TGACTGAAATTGAATTATAAAAATTGTACCTCATGTCCTTACCGAGGCAC
ACGACATCAAAAAAAGGTTTTTTTAGTATATTTTGGGTAAATTTTTGCCT
ATGAAGTTTGTTTAACTGCATGTATTATAGTAATTTGTTGATGATACTAA
AAATCTACTTTGTAAATAGTCTTAACGTAAAAAATAATTACTAATAAAAT
CTTTTGTCTGATGCTTAAAGATCTT

Gene-mRNA-Prot

This transcript is a part of the following gene feature(s):


Feature Name	Unique Name	Species	Type
XLOC_012250	XLOC_012250	Clytia hemisphaerica	gene

The following exon feature(s) are a part of this transcript:

Position

The following features are aligned


Aligned Feature	Feature Type	Alignment Location
sc0000395	supercontig	sc0000395:127099..141573 -

Expression

Values :

    GrOo_1	 GrOo_2	 FGOo_1	 FGOo_2	 EG_1	 EG_2	 P1_1	 P1_2	 P2_1	 P2_2	 P3_1	 P3_2	 PoPr_1	 PoPr_2	 St_1	 St_2	 GO_1	 GO_2	 PH_1	 PH_2	 BMF_1	 BMF_2	 MMF_1	 MMF_2	 M_1	 M_2	 GEC_1	 GEC_2	 GEN_1	 GEN_2
1.97147	2.08697	3.81485	4.04593	6.76002	5.37985	6.53141	8.73941	4.48546	3.99191	3.73429	3.57506	4.40784	5.87594	0.213629	0.271027	2.58472	1.85382	3.95782	4.41045	2.94223	3.19957	1.72218	2.69433	7.61578	7.63759	10.1925	7.00032	2.26209	2.50521

Blast

The following BLAST results are available for this feature:

BLAST of TCONS_00021828 vs. Swiss-Prot (Human)

BLAST of TCONS_00021828 vs. Swiss-Prot (Human)
Analysis Date: 2017-10-03 (blastx Clytia hemisphaerica v1.0 mRNA vs SwissProt (Homo sapiens))
Total hits: 0


Match Name	E-value	Identity	Description

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TCONS_00021828 (transcript) - C. hemisphaerica