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transcript sequence >TCONS_00021207 ID=TCONS_00021207|Name=TCONS_00021207|organism=Clytia hemisphaerica|type=transcript|length=9203bp
TCTAAAACATGAGGCTCggatttttctaaatttgttcTAGAATTTATGCT
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GCTTTGTCGTCAGTCTGTTTAAAGTTTTGGACAAAGCTTTGTCGTCAGTC
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TCAGTCAAGTCAAGCTTTCAGTTTAAGTAAAAGAGTTTTGTCGTCAGTCA
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AAAAGAGTTTTGTCGTCAGTCAAGTCAAGCTTTCAGTTTAAGTAAAAGAG
TTT transcript from alignment at sc0000379:259598..269028- Legend: exon Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below. >TCONS_00021207 ID=TCONS_00021207|Name=TCONS_00021207|organism=Clytia hemisphaerica|type=transcript|length=9431bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000379:259598..269028- (Clytia hemisphaerica)
TCTAAAACATGAGGCTCGGATTTTTCTAAATTTGTTCTAGAATTTATGCT
TAAAGCCTCGTGTTCTCATAAAAACTGTTCCTATAAAAATGAAGGCGATT
TTCTTAAACGGAAAAATTGAAGTATTATCAGCATCAGTTAGTATAAAATG
AAAATTTTTGAATATCTAAACCTATACAAAATATTGCTACAAATACACTT
TGCCGATACAAAATTTGTTTTCAATCATTCCAAGTTATATATCATAGTCA
TATAATATAAAAATGGTGTATCTCGTATAGATTCAATCACATAGAAAATA
TTTGTCGTTAGCCAAAAAAAGTTCCACCGTTAGAAACTAATGTCTTGGTC
GTCATTTCGTCAGTCTTTTTAAAGTTTTGTCGTCAGTCAATTTCGTCAAA
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TGTTTGAAGTTTTGGACAAAGTTTTTTCGTCAGTCTGTTTGAAGTTTTGG
ACAAAGCTTTGTCGTCAGTCTGTTTAAAGTTTTGGACAAAGCTTTGTCGT
CAGTCGGTTTAAAGTTTTGGTCAGAGCTTTGTCGTAAGTCTGTTTAAAGT
TTTGGTCTGAGCTTTGTCGTCAGTCTGTTTAAAGTTTTGGTCAAAGTTTT
TTCGTTAGTCTGTTTGAAGTTTTGGACAAAGCTTTGTCGTCAGTCTGTTT
AAAGTTTTGGACAAAGCTTTGTCGTCAGTCTGTTTAAAGTTTTGGACAAA
GCTTTGTCGTCAGTCTGTTTAAAGTTTTGGACAAAGCTTTGTCGTCAGTC
TGTTTAAAGTTTTGGTCAGAGCTTTGTCGTCAGTCTGTTTAAAGTTTTGG
TCTGAGCTTTGTCGTCAGTCTGTTTAAAGTTTTGGTCAAAGTTTTTTCGT
CAGTCTGTTTGAAGTTTTGGACAAAGCTTTGCCGTCAGTCTGTTTAAAGT
TTTGGTCAAAGTTTTTTCGTCAGTCTGTTTGAAGTTTTGGACAAAGCTTT
GTCGTCAGTCTGTTTAAAGTTTTGGACAAAGCTTTGTCGTCAGTCTGTTT
AAAGTTTTGGTCAGAGCTTTGTCGTCAGTCTGTTTAAAGTTTTGGACAAA
GCTTTGTCGTCAGTCTGTTTAAAGTTTTGGACAAAGCTTTGTCGTCAGTC
TGTTTAAAGTTTTGGTCAGAGCTTTGTCGTCAGTCAATTAGAAGGTTTGG
TCAGGGTTTTATCGTCAGTCATTTTGAAGTTTTGGAAAAAGTTTTTTGGT
CAGTCTGTTTGAATTTTTTATCAATAATTTTTTAGTGTGTCAATTTTGTA
CTTTTGATCGAAGTTTAATCGTCAGTCAATTTGAAGTTTTGGTCAAAGTT
TTGCCGTCTGTCTGTTTGTTTGAAGTTTTGGTCGTCAGTCAAGTTTAAGT
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GTCGTCTGTAAATTTGAAGTTTTGGTCAGAGTTTTGTCGTCGGTCAATTT
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GTCGTCAGTCAAGTTGAAGTCTTGGTCAGAGTTTTGTCGTCATTCAAGTT
GAAGTCTTGGTCAGAGTTTTGTCGTCAATATATTTTAAGTTATTTAGTGA
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CAGTCGATGCCAAAGCTTTCTTGCCAGTTAAGTCAAGTTTAAGTCAATGT
CAGAAATTTTGTCGTCAGTGAAGTCAAGTTCAGTCAATGTTAATACTGTA
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GTCAGTGAAGTTAAATTTCAGTCATTGACAGAAGTTTGCTTTCTGTCAAG
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AGCAAATCAAGTCAAGTCAATTTTCATTCAATGTAAAAAATGTTTTTGCA
TCAGTCAAGTCAAGTAAGTAAGTCAATATAAATTCTCAATGTCTTAGTCA
ATGACAGGAATTCATCGTCGGGTGACGGCTAGTTTCACTCAATATAATAG
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ATCAGTCAGTTCAGGTCAGGTCAGGTCAGCTCAGAGGTCTCATTTAATGT
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AAATTTTGTCGTACTAAAGTTTAAGTTCATGTAAAATAGTTTTGTCATCA
GTCAAGTCGAGTTTAGTCAAGTCGAGTTTCAGTCAATGAAAAAGACTTTT
GTCGTCAGTCAAGTCAAGTTTAGTCAGAGTAATGGACTTTTTTCATCAGT
CAAGTCAAGTCAAGTCAGGTCAGGTCAGAAGTCTCATTTAATGTAAGAGT
TTTTTATTGTCAACCAATTCATTGTTAGAAATTTTGTCGTGATAAAGTAT
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TAAAAGAATATTCTCGTCAGTCAAGTCGAGTTCAGTCAATTCGAGTTTCA
GTCAATGTAAAATAGTTTTGTCGTCAGTCAAGTCAAGCTTTCACTTAACG
TAATAGAGTTTTGTCGTCAGTCAAGTCAAGCTTAGTCAGATTAAGGGAGT
TTTGTCATCAGTCAAGTCAAGTCAAGTCAAGTCAGTCTCATTTAATGTAA
AGGTTTTTTCTTGTCAACCAATTCATTGTTAGAAATTTTGTCGTAATAAA
GTTTAATTTCATGTAAAATAGTTTTGTCGTCTGTCAAGTCGAGTTTAGTC
AAAGTAAAAGAATATTGTCGTCAGTCAAGTCGAGTTCAGTCAATTCGAGT
TTCAGTCAATGTAAAATAGTTTTGTCGTCAGTCAAGTCAAGCTCTCACTT
AATGTAATAGAGTTTTGTCGTCAGTCAAGTCAAGCTTAGTCAGAGTAAGG
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TTCTTGTCAACCAATTCATTGTTAGAAATTTTGTCGTAATAAAGTTTAAG
TTCATGTAAAATAGTTTTGTCGTCTGTCAAGATGTTTATTTGATGTAAGA
TTTGAATATCAAGTTTCAGTCAGTGGCAGACTCTTTACTGGCAGTCAAAT
CAAGTTTCAGTCATAGTCAATTTCAAATAGTTTTGTCATCGGTCAAGTCA
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TTGTCATCGGTCAAGTCAAGCTTAGGATTTTGTCGTCAGTCAAGTCAAGT
TTCAGTCAATGTCAAATAGTTTTGTCGTCGGTCAAGTCAAGCTTAGTCAA
TGTAAACGATATTTTCGTCAGACAAGTCAAGTTTAAGTCAATGTCAAATA
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GTCAGACAAGTCAAGTTTAAGTCAATGTCAAATAGTTTTGTCAAGTTTCA
GTCAACGTCAAATAGTTTTGTCGTAAGTCAAGTTTCAGTTAATGTAAAAG
AGCTTTGTCGTCAGTCAAATCAAGTTTCAATCAATATAAAAGTTTTTTGT
TGTCAGTCAAGTCAAGTCAAGTTTCAGTTAAAATCCGGGTCATAATATTT
GAGAAAAAAAGGAAAATTCCCATGAAATCTTATAGTCACAAACAATTTCG
AAGCGCTCTGGAAGGGTAGAGTTTTAACATTAGACTTAAGACCTTAGGTA
GGATCTGAGGATCCAAAAGTACAAGAATGGTCCAATAGCGCTTAGAATAT
ATCCTGGAAGTCTATAAACTCCTCCCGAATTGAAATATTCGATTAAATTT
AACAAATAGCCCAAAAGCGACTTTCTCGCCCGAACTTTAAATTTAGTAAA
CAAGGTAATACCGAAATTCTCAATATATTTTGACCGAGAGTGTAGAGTAA
AAGAGTTTTGTCGTCAGTAAGTTTGAAATTGTTTAATCATCAGTCAAGCC
AAGTTTAGTCAATTTCAAATAGTTTTTTCAAAATTCAGTCAAGTCAAGTT
TTCAGTTAATGTAAAAGAGTCTATTCGTCAGTCAAGTCAAGCTTTCAGTT
AAAGTAAAAGAGTTTTGTCGTCAGTCAATTCAAGTTTCAGTCAATGTCAA
ATAGTTTTCTCGTCGGTCAAGTCAAGCTTAGTCAATGTAAACTACTTTTT
TCGTCAGACAAGTAAAGTTTCAGTTATTGTAAAAGAGTTTTGTCATCAGT
CAAGTCGAGTTTCAGTCAAGTCAAGTTTTCAGTTAATGTAAAAGAGTCTT
GTCGTCAGTCAAGCCAAGTTAAGTTTCAGTCAGAGTGGGAGAGTTTTGTC
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AGTTTTGTCGTAAGTCAAGTTTCAGTTAATGTAAAAGAGCTTTGTCGTCA
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AGTTTCAATCAATATAAATGAGTCTTGTCGTCAGTCAAGTCAAGTTTTCA
GTTAAAGTAAAATAGTTTTGTCGTCAGTCAAGTCAAGTTTTTAGTCAATG
TAAAATAGTTTTTTCGTCAGTCAAGTCAAGTTTTCAGTCAATGTCAAATA
GTTTTGTCGTCGGTCAAGTCAAGCTTAGTCAATGTAAACGACTTTTTTCG
TCAGACAAGTCAAGTTTCAGTTATTGTAAAAGAGTTTTGTCATCAGTCAA
GTCGAATTTCAGTTAATGTAAAAGAGTTTTGTCGTCAGTCAAGTCAAGTT
TTCAGTTAATGTCAAATAGTTTTGTCGTCAGACAAGTCAAGTTTCAGTCA
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TCGTCAGTCAAGTCAAACTTCAGTCAAAGTAAAATAATTTTGTCGTCAGT
CAAGTCAGGTTTCAGTCAAAGTAAAGCAGTTTTGTCGTCAGTCAAGTCAA
ACTTCAGTCAAAGTAAAATAATTTTGTCGTCAGTCAAGTCAGGTTTCAGT
CAAAGTAAAGCAGTTTTGTTGTCAGTCAAGTCAAGTTTCAGTCAATGTCA
AATAGTTTTTTCGTCAATCAAGTCAAGTTTCAGTCAAAAGTAAAAGAGTT
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TCAATTTTTCAGTCAATGTAAAATAGTTTTGTCGTCGGTCAAGTCAAGCT
TAGTCAATGTAAACGACTTTTTTCGTCAGACAAGTCAAGTTTCAGTTAAA
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GTTTTGTCGTCAGTCAAGTCAAGTTTTCAGTCAATGTAAAATGGTTTTTT
CGTCAGTCAAGTCAAGTTTTCAGTCAATGTCAAATAGTTTTGTCATCGGT
CAAGTCAAGCTTAGTCAATGTAAACGACTTTTTTCGTCAGACAAGTCAAG
TTTCAGTTAAAGTAAAAGAGTTTTGTCGTCAGTCAAGTCAAGCTTTCAGT
TTAAGTAAAAGAGTTTTGTCGTCAGTCAAGTCAAGCTTTCAGTTTAAGTA
AAAGAGTTTTGTCGTCAGTCAAGTCAAGCTTTCAGTTTAAGTAAAAGAGT
TTTGTCGTCAGTCAAGTCAAGCTTTCAGTTTAAGTAAAAGAGTTTTGTCG
TCAGTCAAGTCAAGCTTTCAGTTTAAGTAAAAGAGTTTTGTCGTCAGTCA
AGTCAAGCTTTCAGTTTAAGTAAAAGAGTTT
Gene-mRNA-Prot
This transcript is a part of the following gene feature(s):
The following exon feature(s) are a part of this transcript:
| Feature Name | Unique Name | Species | Type |
|---|
| TCONS_00021207-exon-sc0000379-1575043694:264867..269028 | TCONS_00021207-exon-sc0000379-1575043694:264867..269028 | Clytia hemisphaerica | exon |
| TCONS_00021207-exon-sc0000379-1575043694:259598..264638 | TCONS_00021207-exon-sc0000379-1575043694:259598..264638 | Clytia hemisphaerica | exon |
| TCONS_00021207-exon-sc0000379-1510915933:264867..269028 | TCONS_00021207-exon-sc0000379-1510915933:264867..269028 | Clytia hemisphaerica | exon |
| TCONS_00021207-exon-sc0000379-1510915933:259598..264638 | TCONS_00021207-exon-sc0000379-1510915933:259598..264638 | Clytia hemisphaerica | exon |
| TCONS_00021207-exon-sc0000379-1491911889:264867..269028 | TCONS_00021207-exon-sc0000379-1491911889:264867..269028 | Clytia hemisphaerica | exon |
| TCONS_00021207-exon-sc0000379-1491911889:259598..264638 | TCONS_00021207-exon-sc0000379-1491911889:259598..264638 | Clytia hemisphaerica | exon |
Position
The following features are aligned
| Aligned Feature | Feature Type | Alignment Location |
|---|
| sc0000379 | supercontig | sc0000379:259598..269028 - |
Blast
The following BLAST results are available for this feature:
|
