TCONS_00021113 (transcript) - C. hemisphaerica

Overview


Name	TCONS_00021113
Unique Name	TCONS_00021113
Type	transcript
Organism	Clytia hemisphaerica (Jellyfish)
Sequence length	3684

Sequence

The following sequences are available for this feature:

transcript sequence
transcript from alignment at sc0000378:20715..40806-

transcript sequence

>TCONS_00021113 ID=TCONS_00021113|Name=TCONS_00021113|organism=Clytia hemisphaerica|type=transcript|length=3684bp
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ACAGACATCATTAAAGCGTAATGCTATGGAGCTTTCAACCTTGTACAAGT
TTGGTCTTCTATTTGTACTGACGGCATCAATTTGTAACTTGGTTTCTGCA
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ATCATTTTGGTGACGCTTGGATTGACCAACAGGCTGTTGACTTAACTCCA
CAAGGGGAAGTTTCAACGGACGAGTGTGGCAAATCACTGACATGTTATAA
ACAACCAAAATCTTGTACTTCAAGTCTTGATTGTCATGTTCTTGTTCAAC
ATAAATTTGATTCTGACACAAAAACTATTCATGTGACATTGGCAACTAAT
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GGTAGGAGCAAAAGGAGTCGTTTGTGTGTACAATGGCTCCTTAGTTCAAT
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TGTTTGTCAATTTACTCGACCGATAGCTGCTCCAAGTGGAAGTGAAAATT
TAATGTACGATGCAAGTGAACCTTTATACATGCTTCATGCTCACGCAACT
TATGCAAATAACAAATTGACTTATCATTTTGGTGACGCTTGGATTGACCA
ACAGGCTGTTGACTTAACTCCACAAGGGGAAGTTTCAACGGACGAGTGTG
GCAAATCACTGACATGTTATAAACAACCAAAATCGTGTACTTCAAGTCTT
GATTGTCATGTTCTTGTTCAACATAAATTTGATTCCGACACAAAAACCAT
TCATGTGACATTGGCAACTAATTCCAGTAATGGTTGGATCGGATGGGCGC
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GTTCCAAGTGGAAGtgaaaatttaatgtatgatgcAAGTGAACCTTTATA
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GAAGTTTCAACGGACGAGTGTGGCAAATCACTGACATGTTATAAACAACC
AAAATCGTGTACTTCAAGTCTTGATTGTCATGTTCTTGTTCAACATAAAT
TTGATTCCGACACAAAAACCATTCATGTGACATTGGCAACTAATTCCAGT
AATGGTTGGATCGGATGGGCGCAAAATAACAAGTTTGACAAAATGGTAGG
AGCGAAAGGAGTCGTTTGTGTGTACAATGGTTCCTTAGTTCaattgcaaa
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ACGATGCAAGTGAACCTTTATACATGCTTCATGCTCACGCAACTTATGCC
AATAACAAATTGACTTATCATTATGGTGACGCTTGGATTGATCAACAGGC
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CTGATTGCAAAGACGATTCAAATTGCGACGCAGTGGTAGAATTCCAGTAC
GACGAGCCTCGTCAAATGATGGTCTTCACTTTACAAACAAGACACGCTTG
GGTTGCCAGTGCTCAAAGACCTCAAGCTGGAGGTGCTAAAATGATTAACA
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caaaagaaaagaaaatcaccGGTAAACCGGCTTGGTTCCCTCTTCATCAA
GGTTTGATGATGTCATGTGTTGTTGTTTTCTTCATCGCTTTCATCGTCAT
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TGGGATTAATTGCTATCATTCTTGGCTTAATTCAGGTAACAACAGAGCTC
TTTAATATCAtgtacatttttttcaagtctTAACAGagtgtgtcacagac
ccactgggacgcCAGCCCTActagaaaatttgac

Run BLAST on NCBI

transcript from alignment at sc0000378:20715..40806-

Legend: exon

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>TCONS_00021113 ID=TCONS_00021113|Name=TCONS_00021113|organism=Clytia hemisphaerica|type=transcript|length=20092bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000378:20715..40806- (Clytia hemisphaerica)
AACAAACTGATGTATCACGCTTAACTACCCATCGATTCACGTGAGTAATT
TTTCAGTTTTTGTTTATATAAGTCAAGCGATCTCTTAATTTCTTGTAGAC
ACAAATCACAAAAGCTTTAAGCGATTCTTGATTTTATAGGAAAGGTTTCA
TTATCATAGCTCTTTGCTTGTTGAATTAGCCTTTAGACCAAAGTTGCGCC
AAATTTTTTATCAAAGTCAAAGATATTAACTTGTTTGGAAAATACACAAC
AAAAATTCCTGATATTTCGTGATCTTACTTTAAAACTAAAAAACTTGCCT
TCGTTATGCTTTTCTTGTCCTTTAATAATAGATCTTACAAAAAAGTTCAT
CACGGAGGTTTCCGTGTTTTCATTTGCATTCTACTATCAATGTTTGACTA
TTTCATTACACACACTACTGTTTTATATATTGTGTAGGAGTTTTATGATG
TAACTTTTTTGGATCAAGATGGATCAATGTTAATATTAACTGATAAGTTG
ATTTTAGTTTCCTGGTATCTTTGCTAGCTTATCTGGTAAGTGTTTTTGTA
ACTGTTCTTATGAAACGGTATGTTTAGAAGGTATGTTTAATCCGATAGAG
GCATTGGAGTATTGGTAGCAAAGGGTAGCAAATCTACACGTTCATGTTTT
TTCGGGAACCTATTTCGAAAAATACATGATTCGGTTTCGGGAACTTGCCA
CACCCAAATGCAATTCTAATATTAAGTCTTGCGTTTGGAATGAACTTTGA
ATTCTATGATAATAATCTATCACACACACTTCAAGTTTCGGCTTGAAAGT
CAATATAAGTCATACTTCGTTCGAGATAAATTACATTTTGTCACATCTTG
ACAAAACTAACAAATACACGCTTTATTTATAAGAATAGTTTACTTTGGAT
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GATCAATTTGAGAATTTTTTTTAAGTGAACAATTGGGTTAAAATTACATT
TCTTCCTCAAATCTTCAATTTATCTCTAACAAAGGAAGCAAAATGACTGT
ATTCTTATCAAATTCTGTAAAATTCACCCTAGAGGGTATTCTTACGATTT
GGCCAATTTTCACCCTGATATTCTTATAAAAAAAGCGTGTACATAGTTAA
ATCTAGTAAATCAAACAAAAAGGACATATTTTATTTATTTTCAACTTTAA
TCCTATTAATGATACCTTTGACATACAAATTCGTTTTTGAGATGCCATCT
TGATAAGAAATGCTATCCCTCTTTTATTAAGGAACTACTTGCTAATTTTA
TGTAAGGTAACATGAAACTTTGTTGTCACTATCATAGCATTTGATGTTGT
ATATATCTTACAAGGGGTGTTTCAAATTTTCAAATTAAACTAAGAATCTT
TGTAGATATAATATTTCTTTTTAGAATTCTAATCTTACATTTGACGTCTG
CAGGAGATTTCCCATTCAGATTATGGAAGTTTTACTTTTATTGTGAGATT
ATGGATATAATCATTTTTAACTTGTAACATTTAAGTCTTTGTCAATTAAT
ACAGGGTTAATATAGGGCTATATTTCATATTAGGTACGACCTTTAGGGTT
TAATTTTTAGATATATGATGACCTTACTAAAGGTGATATAGCACAGCGGA
TGTAATATGTAATTTTATTGTTTATTAAAATAAAAAGGTCCACCCATCAA
AAATCAGTTTCTTTTTCCCTTTCAGAATGATTTATGCATGTATACCTTAT
TGAAAAATCTTACGAGAGCTATTTGGATGCTTAACAGTTTTTGCTATAAA
TATTTTCTTCCAAAAAGCTTCTCCCCTTTCCTGCTAACTAATGCTTAAAT
AAATAGCACAAGATTTGAAAAATAAATATTAAAAGACATTAAAATGGTTC
ACTTGAAAGAAATTATTTGATAAAGAGCTTGTCTTGTCGAAGTACAAGTT
TGCCAAGTTTCCGAAGGGAAAGTTTCAGATTTATATAATTTGAAGTTCAT
GGGGTTCATGGTCTGATTAAAGCTATTTTTCATACCTTTCGACAGATTTG
ATTTGACAGACATCATTAAAGCGTAATGCTATGGAGCTTTCAACCTTGTA
CAAGTTTGGTCTTCTATTTGTACTGACGGCATCAATTTGTAACTTGGTTT
CTGCAAATGAGGTATTGTATGGATATTTTTACTTTTACAACTCACGCAAA
CTCATTTTGTTATCAAGGCTATCCTATCCGACACATGTCACTGTTTCGCT
GTTACTTTCGTTTAAAAGTCGTTATTTTGACGATTTACTGACGTTCAATG
TCAATTAGGAATGTAACTTGTGATACCCCTGTTCCATTAAACCGATGAGA
AGTTTTCAGTTTTCCATTATTTACAGCTGAAAACCAAGTATCAATCCAAT
TCCTGATATTATGCACCATTGCAATGTCTTCCAAGGACCAAATAGCTGAT
TGATTGTAAGTGACGTATTGACAGATTTTACGTCACTTGCGACCAGTCAG
TTGTTGGGCTATGATGTAATGTTAGAAGACATTGCAGTGGTGCATATCAT
GAATTGATAACAATTTTAACATCATTTTTTGATTGATGTTTATAGTGAAT
AGATTTCCACCAGGTCTGTGTCATTGGGGGCTGTCTCTTAGTTATTTTTT
GCCTAAAAATGAGCGTAAATTAGTTAATTTTCAGCGAGAAATACTTCTGG
CGAATAATGAGATAGAGGTGTTGATAGACTTAATAAACATTATCCAAAGC
TTACTTAATTAATTTCCGATAATTTCTACAGGAGATCGCGACAGACGAAT
GTGGTAAATCATTAACATGTTATAAACAACCTGATGATTGTACTAATAGT
TCAAATTGTGATATGTTGGTCTTGTGGAAGGAGATAAATGATGGAGCTTC
TATTGAAGTGACATTGGCGTCTACAAGTGGCTACATCGGATGGGCGCAAA
ATCCAGAATTTAACAAAATGGTAATTGTAATTGATCATTTCTTTTGTATA
GATTTATTAAGTCTTCGCATTGGATGCCGTAAGTTGGTCTAATGTCGACA
TCCCTCGTTTGATTCCGACATCCTTCTTTAGACCTGGGAATAATAAAAGG
TCGGAATCACTAATTGCTAATAAACGGTCAGAGAAAAAACATCTTTTATT
CAATCAGTGATTCTGACTGTTCTTTATAGGAAATAAATAGGGTGTCAGAA
TTACACGAGGGATGAGGGATAAATTAGACCAACTTACGGTACCAAAATCA
CTGTCACTATTAGTTTTTGCAAATTTCTAAATTAAATTATGAAATACATT
ATCATTAGAGCCTGTTAGAATTTGAAGTAATTTGGATTAATCGCTCAAAA
GTTTTTGTGATTTTACGATTTTTGCTGGGTTTTGTGACCGATGTTGAAAT
AAAATCCGACCTAGTGGTTATTTTGACTCGAAATTTGTAGACGTATGTAT
TTTAAGATTGTATTGAAAGTCAGAGAGTTTCGCCCCCTTTGAGTTAATGG
TTATAAATTCAATGTATCCAATCTTTTCTTTTTTGCAGGAGAATGCTAAA
GGAGTTGTATGCTACAACAATGGTACACATGTTCAATTGAAGAGTTTTCA
TACCACCTCAAATTCAGGCCCAACCCTCAAACAACTCCCTAATGGATACA
TTTTGAACAGTACTTATATAAATAACCAAAACAGTATTATTTGTAAATTC
ACTCGAACTGCAACAGTGCCAAGTGGAAGTGAGAATTTAATGTATGAGAT
TACAAATGGACTTCATCAATTATACACTCATGGCATTGTGCAAGGTGGAA
TAATTCAATATCATAAATATGGTGATGCCAACCGTTTCATTAGTAAAACC
AAAATTGATCTCACCCCTACAGTACAAGTATGATCAACTTCCTGTGATTT
CATTTTTTTTGGTGTCAAGGAATTGCAAATTTTTCTTCATGTCAATGGAT
TTTAATGGAACCTTCAATTAATCTTCTTCATTCAATTTCCTAAAGCAATC
GCTAGAACATTTTGAAATTCTGTTCAAATTTCTTCAAAGGAGCGATGGCC
AAGCGGTCAAAGGCGTCAGCGTCTGAAACTAGGGATTCGCAGCTCGAATC
CCCGCTCCTTCCAATGTTCTGTTCATAGATAGCCGGCTGGCCGTGGACCC
CGTAAAAACAATCGAGAGACTGCCTAAAATTCCTAGATTACTGGGCTATC
CACGTAAAATATTGACTCTATCCATCTATCTATCAATCTATCTATCTATA
AATTTATCTAAATGTTTATCATTCCAGGAAGTTTCAACGGACGAGTGTGG
CAAATCACTGACATGTTATAAACAACCAAAATCTTGTACTTCAAGTCTTG
ATTGTCATGTTCTTGTTCAACATAAATTTGATTCCGACAAAAAAACCATC
CATGTGACATTGGCAACTAATTCCAGTAATGGTTGGGTAGGATGGGCACA
AAATAACAAATTTGACAAAATGGTAATGTTTTAATCCCTTTAATGAAATG
ATATAATCTTTAAATTAATGGCTCTGGTTAGGGCTTTATTTCAAAACAAG
AAGCCCGTTGGGCGTGAAGGCCCAGCGAAAAGTAACGTGTTGAAAACGAG
CGTGCAAAACAGCAAATGTATGACCCTGTTGACATGGATCAAAGTAAAGA
CAGGAAAAATCTTTTCAAAATGTCTTATTGGTTAGACGCAAGAAATTTTA
TTGATGGTCTCCTAACCAACCGGGTCTACAGGCACAGGTTGGTTGAATAC
TCTTTGGTACCTAATAGCTGGGGGCTTTGGAATAGGCGGGGGGAGGTTGG
AAAAAAATCTCAAAACTTAATAAGCGGGGGGGGGGGGGGNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
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NNNNNGGGGGGGGGGGTTGGAATAAAAATGTCCTAGGTGGAAAATGTCCA
ATAAATTATGCGCGCTCATAGAAAAATATAAAAAACCCGAGAATATATAT
ATAGTGAGTGGGCGCTTTTTAACCAATTAGGTGCACTCACATATGCAGGG
AGAAATATCCCTGCAGGCATGTTAGTTGGATCAGACCGTAAACTAAAAAA
ATAATCTTTAAAAAACTAGACGGTGAAATAGTTTATGGTCTGCATATCCA
GGCTAATAAAATTCATGTGGTTAATGTGAGTTAACAGTTAATGTGACAGA
TCCAGAAATGACCATTTTCACTGTTTATGCGTTCCAACCATGAAAAATGT
TTCAATCTAGTTCAAATTTTACCCATGAGCTGCATTTTAGTGTCCATTAA
CAGATTCCAGTATCAGTTTATACTTGAAATAATTCTGGCTCGAGTTTGAA
AAATCAAGCCACCAATCGTCAAACGAGACAGATCCAGAAATAACCATTTT
CACGCGTAGCATCATGGAAAAAGTTCCAATCTTATTCCAATTTACACATG
AGCTCCATTTTAGTGTCCATTACCAAATTCCAGAATCAGTTTACTTGAAA
TAATTATGTGTTGAGTTTGAAAATCATACCGTGAAGTCNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNGTCGGGTAAC
TTGCATCAGTGGAGGCAAACATGCATAGCCCTCAAATGAATGACCAATAA
AAGCAGCAAAATTTCAAAACAAATGAACTACGCAGATCCACTCGCAGCTC
TATTCTACCATTTTTATTTTTATTTAACTTCATTTGAGGGCTATGCATGT
TTGCCTCCACCGATGCAAGTTACCCGACTTCACGGTACCACGTACATGTT
AACAGTGACAGATCCAGAAGTGACTATTTTCTTGTGTAGCATCAAGGAAA
AAGTTCCAAACTTATTCAATTTTACACATCAGATGCATTTCAGTTTATTT
ATTTCTATATCAGAAGCCATTATTTCCTAAAAATAAAGTCTTTTTGAAAA
CAAGAAACTTAACCAGACGATCTCAATCGAACGGAATCGACGATCGAACC
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GCAATCGAATCTCAATCGAATATTACCGCAATTTTCAGATTCGATTGATA
TTCGATTGCGTTCGANNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
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GTCGATTCTGTTCGATTGAGATCGTCTGGACTTAAAATGAAAGTGATTTA
AGGTAGAATTTTCACTCATAAAAGTTTATGAAAACTTGAGCAAAGACTAT
GAGATATGGCAGAATGTTGAAAAAGGTTTATAAAGAAAAATCATTACAAA
ATGTCTTTGGTTTGAAAGTCTCTTGACCACTAAAGCAAAGAAAATGTTCA
AGAAAGTATAAATCAACCTCCTCACTTCGACCGCCATCTTGTTTTGTTTT
GAAAATTGTTTTGAAGGACCGCGGAATCAGAAAATATATCTTTTATAGCC
AGTATCCAACTTTAGCAAGCTTTTCCCTCTCCAGACGGCAAAATTAAAAA
GTGTGTTACTGGTTTTAAGCGCCGTTTCTACCAAAACGGACGGACAGACA
ACGGAAGGACGGAAAGTTGCAAATGAAAGGCCCTATCGCTAGCGCTGGGC
CAAAAATGTTTAATAGCTATAAATCCTTTCGTGTTTCAGGTAGGAGCAAA
AGGAGTCGTTTGTGTGTACAATGGTTCCTTAGTTCAATTGCAAAGTTTCA
AAACAGATTCTAACACACGTCCAACTTTTATTCCAATGGCAAAAGGATAC
ACTTTACAAAGTGCTCACAAAACAAGTAAAAACAGTATTGTTTGTCAATT
TACTCGACCAGTAGCTGTTCCAAGTGGAAGTGAAAATTTAATGTATGATG
CAAGTGAACCTTTATACATGCTTCATGCTCACGCAACTTATGCCAATAAC
AAATTGACTTATCATTTTGGTGACGCTTGGATTGACCAACAGGCTGTTGA
CTTAACTCCACAAGGGGTAAGTTATTCGATTAGTTTTGATCTAGATAGGA
TCTAGTAAAAAGAATAACAAAGACTTTTTCTTTAACGTAAAATTACTCAG
ACAAGACGATGTAAGGATTTTCCACAGTAAACAGGGTTGTAAAACGAAGT
TTTCAGATGTACACACTATTTCTCTTGTAACTGTCATTTATTAATTGTTG
CTTGGTATATCTGCTGCTACATCAATTTCCATTCTTATCATTCCAGGAAG
TTTCAACGGACGAGTGTGGCAAATCACTGACATGTTATAAACAACCAAAA
TCTTGTACTTCAAGTCTTGATTGTCATGTTCTTGTTCAACATAAATTTGA
TTCTGACACAAAAACTATTCATGTGACATTGGCAACTAATTCTAGTAATG
GTTGGGTCGGATGGGCGCAAAATAACAAATTTGACAAAATGGTAATGGTT
ATAAACACTTTTATGGAATTGTATAATCTTTAAATTCTTGACTCTTGTTA
GTTTCTCAAAATGTTTGGAAATGTCTAAATCCTTTCATCTTTCAGGTAGG
AGCAAAAGGAGTCGTTTGTGTGTACAATGGCTCCTTAGTTCAATTGCAAA
GTTTCAAAACAGATTCTAACACACGTCCAACTTTTATTCCATTGGCAAAA
GGATACACTTTACAAAGTGCTCACAAAACAAGTAAAAACAGTATTGTTTG
TCAATTTACTCGACCGATAGCTGCTCCAAGTGGAAGTGAAAATTTAATGT
ACGATGCAAGTGAACCTTTATACATGCTTCATGCTCACGCAACTTATGCA
AATAACAAATTGACTTATCATTTTGGTGACGCTTGGATTGACCAACAGGC
TGTTGACTTAACTCCACAAGGGGTAAGTTATTCGATTAGTTTTGATCTAG
ATAGGGTCTAGTAAAAAAAACAACAAAGACTTTTTCTTTAATGTAAAATT
ACTCAGACAAGACGATATAAGGATTTACCGCAGTAAACAGGGTTGTAAAA
AGAAGTTTTCAGATGTACACACTATTTCTCTTGTAACTCTCATTTATTAA
TTGTTGCTTTTATCTGCTGACACATCAATTTCCATTCTTATCATTTCAGG
AAGTTTCAATTGACGAGTGTGGCAAATCACTGACTTGTTATAAACACCCA
AAATCTTGTACTTCAAGTCTTGATTGTCATGTTCTTGTTCAACATAAATT
TGATTCTGACACAAAAACTATTCATGTGACATTGGCAACTAATTCCAGTA
ATGGTTGGGTCGGATGGGCGCAAAATAACAAATTTGACAAAATGGTAATG
TTATAAACACTTTTATGGAATTGTATAATCTTTAAATTCTTGACTCTTGT
TAGTTTCTCAAAATGTTTGGAATCTCTAAATCCTTTCACCTTTCAGGTAG
GAGCGAAAGGAGTCGTTTGTGTGTACAATGGCTCCTTAGTTCAATTGCAA
AGTTTCAAAACAAATTCTAACACACGTCCAACTTTTATTCCATTGGCAAA
AGGATACACTTTACAAAGTGCTCACAAAACAAGTAAAAACAGTATTGTTT
GTCAATTTACTCGATCGGTAGCTGTTCCAAGTGGAAGTGAAAATTTAATG
TATGATGCAAGTGAACCTTTATACATGCTTCATGCTCACGCAACTTATGC
CAATAACAAATTGACTTATCATTTTGGTGACGCTTGGATTGACCAACAGG
CTGTTGACTTAACTCCACAAGGGGTAAGTTATTCGATTAGTTTTTATCTA
AATGGGATTTAGTAAAAAAAAACAAAGGACTTTTTTAGGTAAAATTACTC
AGACAAAACGATATAAGAGGATTTTCCGCAGTAAACAGGGTTGTAAAAAG
AAGTTTTCAAATGGTGCACACATAATTTCTATTGTAACTCTCATTTATTA
GTTTTTGCTTGGTTAATCTGTTGCCATATCAATTTCCATTCTTATCATTC
CAGGAAGTTTCAACGGACGAGTGTGGCAAATCACTGACATGTTATAAACA
ACCAAAATCGTGTACTTCAAGTCTTGATTGTCATGTTCTTGTTCAACATA
AATTTGATTCCGACACAAAAACCATTCATGTGACATTGGCAACTAATTCC
AGTAATGGTTGGATCGGATGGGCGCAAAATAACAAGTTTGACAAAATGGT
AATGTTTTAAAAAACACTTTTGTAGAATGGTATAACTTTTCACTTGGGCA
CAAAATAACCAATTTCACAAAATGGTATTGTTTTAATCCCTTTTCCTGTG
AAATGATATAATCTTTAAATTATTGGCTCTGGTTAGGGCTTTGTTCTATA
ATTTCTCAAAAAGTTTTGAATAGCTAAACCTTTCATCTTTCAGGTAGGAG
CGAAAGGAGTCGTTTGTGTGTACAATGGTTCCTTAGTTCAATTGCAAAGT
TTCAAAACAGATTCTAACACACGTCCAACTTTTATTCCAATGGCAAAAGG
ATACACTTTACAAAGTGCTCACAAAACAAGTAAAAACAGTATTGTTTGTC
AATTTACTCGACCAGTAGCTGTTCCAAGTGGAAGTGAAAATTTAATGTAT
GATGCAAGTGAACCTTTATACATGCTTCATGCTCACGCAACTTATGCCAA
TAACAAATTGACTTATCATTTTGGTGACGCTTGGATTGACCAACAGGCTG
TTGACTTAACTCCACAAGGGGTAAGTTATTCGATTAGTTTTTATCTAAAT
GGGATTTAGTAAAAAAAAACAAAGGACTTTTTTAGGTAAAATTACTCAGA
CAAAACGATATAAGAGGATTTTCCGCAGTAAACAGGGTTGTAAAAAGAAG
TTTTCAAATGGTGCACACATAATTTCTATTGTAACTCTCATTTATTAGTT
TTTGCTTGGTTAATCTGTTGCCATATCAATTTCCATTCTTATCATTCCAG
GAAGTTTCAACGGACGAGTGTGGCAAATCACTGACATGTTATAAACAACC
AAAATCGTGTACTTCAAGTCTTGATTGTCATGTTCTTGTTCAACATAAAT
TTGATTCCGACACAAAAACCATTCATGTGACATTGGCAACTAATTCCAGT
AATGGTTGGATCGGATGGGCGCAAAATAACAAGTTTGACAAAATGGTAAT
GTTTTAAAAAACACTTTTGTAGAATGGTATAACTTTTCACTTGGGCACAA
AATAACCAATTTCACAAAATGGTANGATAAGATTTAGTAAAAAAAACAAA
GGACTTTTTTAGGTAAAATTACTCAGGCATGACGATATAAGAGGATTTTC
CGCTGTAAACAGGGTTGTAAAAAGAAGTTTTCAGATGTACACACTATTTC
TATTTTAACTCTCATTTATTAATTTTTGCTTGGTAAATCTAATGCCACAT
TAATTTCCATTCTTATCATTCCAGGAAGTTTCAATTGACGACTGTGGCAA
ATCACTGACATGTTATAAACAACCAAAATCTTGTACTTCAAGTGTTGATT
GTCATATTCTTGTTCAACATAAATTTGATTCCGACACAAAAACCATTCAT
GTGACATTGGCAACTAATTCCAGTAATGGTTGGGTCGGATGGGCACAAAA
TAACAAATTTGACAAAATGGTAATGTTTTAAACACTTTTATGGAATTGTA
TAATATTTAACTTGGGCACAAAATAACTAATTCACAAAATGGTATTGTTT
TAATCCCTTTTATGAAATGATATAATCTTTAAATTAATGGCTCTGGTTAG
GGCTTTGTTTTATAATATTTCAAAAAATGTTTAATAGCTATAAATCCTTT
CATCTTTCAGGTAGGAGCAAAAGGAGTCGTTTGTGTGTACAATGGCTCCT
TAGTTCAATTGCAAAGTTTCAAAACAGACTCTAACACACGTCCAACTTTT
ATTCCATTGGCAAAAGGATACACTTTACAAAGTGCTCACAAAACAAGTAA
AAACAGTATTGTTTGTCAATTTACTCGACCAGTAGCTGTTCCAAGTGGAA
GTGAAAATTTAATGTATGATGCAAGTGAACCTTTATACATGCTTCATGCT
CACGCAACTTATGCCAATAACAAATTGACTTATCATTTTGGTGACGCTTG
GATTGACCAACAGGCTGTTGACTTAACTCCACAAGGGGTAAGTTATTCGA
TTAGTTTTTATCTAAATGGGATTTAGTAAAAAAAAACAAAGGACTTTTTT
AGGTAAAATTACTCAGACAAAACGATATAAGAGGATTTTCCGCAGTAAAC
AGGGTTGTAAAAAGAAGTTTTCAAATGGTGCACACATAATTTCTATTGTA
ACTCTCATTTATTAGTTTTTGCTTGGTTAATCTGTTGCCATATCAATTTC
CATTCTTATCATTCCAGGAAGTTTCAACGGACGAGTGTGGCAAATCACTG
ACATGTTATAAACAACCAAAATCGTGTACTTCAAGTCTTGATTGTCATGT
TCTTGTTCAACATAAATTTGATTCCGACACAAAAACCATTCATGTGACAT
TGGCAACTAATTCCAGTAATGGTTGGATCGGATGGGCGCAAAATAACAAG
TTTGACAAAATGGTAATGTTTTAAAAAACACTTTTGTAGAATGGTATAAC
TTTTCACTTGGGCACAAAATAACCAATTTCACAAAATGGTATTGTTTTAA
TCCCTTTTCCTGTGAAATGATATAATCTTTAAATTATTGGCTCTGGTTAG
GGCTTTGTTCTATAATTTCTCAAAAAGTTTTGAATAGCTAAACCTTTCAT
CTTTCAGGTAGGAGCGAAAGGAGTCGTTTGTGTGTACAATGGTTCCTTAG
TTCAATTGCAAAGTTTCAAAACAGATTCTAACACACGTCCAACTTTTATT
CCAATGGCAAAAGGATACACTTTACAAAGTGCTCACAAAACAAGTAAAAA
CAGTATTGTTTGTCAATTTACTCGACCAGTAGCTGTTCCAAGTGGAAGTG
AAAATTTAATGTATGATGCAAGTGAACCTTTATACATGCTTCATGCTCAC
GCAACTTATGCCAATAACAAATTGACTTATCATTTTGGTGACGCTTGGAT
TGACCAACAGGCTGTTGACTTAACTCCACAAGGGGTAAGTTATTCGATTA
GTTTTTATCTAAATGGGATTTAGTAAAAAAAAACAAAGGACTTTTTTAGG
TAAAATTACTCAGACAAAACGATATAAGAGGATTTTCCGCAGTAAACAGG
GTTGTAAAAAGAAGTTTTCAAATGGTGCACACATAATTTCTATTGTAACT
CTCATTTATTAGTTTTTGCTTGGTTAATCTGTTGCCATATCAATTTCCAT
TCTTATCATTCCAGGAAGTTTCAACGGACGAGTGTGGCAAATCACTGACA
TGTTATAAACAACCAAAATCGTGTACTTCAAGTCTTGATTGTCATGTTCT
TGTTCAACATAAATTTGATTCCGACACAAAAACCATTCATGTGACATTGG
CAACTAATTCCAGTAATGGTTGGATCGGATGGGCGCAAAATAACAAGTTT
GACAAAATGGTAATGTTTTAAAAAACACTTTTGTAGAATGGTATAACTTT
TCACTTGGGCACAAAATAACCAATTTCACAAAATGGTATTGTTTTAATCC
CTTTTCCTGTGAAATGATATAATCTTTAAATTATTGGCTCTGGTTAGGGC
TTTGTTCTATAATTTCTCAAAAAGTTTTGAATAGCTAAACCTTTCATCTT
TCAGGTAGGAGCGAAAGGAGTCGTTTGTGTGTACAATGGTTCCTTAGTTC
AATTGCAAAGTTTCAAAACAGATTCTAACACACGTCCAACTTTTATTCCA
ATGGCAAAAGGATACACTTTACAAAGTGCTCACAAAACAAGTAAAAACAG
TATTGTTTGTCAATTTACTCGACCAGTAGCTGTTCCAAGTGGAAGTGAAA
ATTTAATGTACGATGCAAGTGAACCTTTATACATGCTTCATGCTCACGCA
ACTTATGCCAATAACAAATTGACTTATCATTATGGTGACGCTTGGATTGA
TCAACAGGCTGTTGACTTAACTCCGACAAAAGCAAGTCAGGTGAGATTTA
TTTCATTGTAAGCTTCATGAATCAAATTCTTTCAAGCAAAACAAGTATGA
TATTACTGTTTAAAAATAATTTACGTGAAAGGTTTTGTTGTGATTCTACT
CTTCAGCGTAAAATTAGTCCTTAGTATACTTTTACTCTCCTTCTCACTGA
CCCGTTGGGATTTTTTCAGCTAGTCGGGGTAAAAACAATGGACTGAAATA
GGATGGGGATTATTATTCCCATATTTTTTATTGCCAGGGATTTAAATTCG
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TTAATGGGGACAAAAGACAATTTTCTACCGGGGACGATATTTAGGCCAAT
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GGAAAATTTAGAAAATCAAGCATTCCATACACTAAGATTTTATCATGATC
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TTAATAATTTCATACTTGCAATGAAAGTTAACTAATTGTTAGGAGAGTAC
TCACATTGCACTTTTGTAAACACTAAAATTACTTTATAAGCAGGCTATAT
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GAAATGTTTAACTCCATACTTTTAATAGACTAGCAAGCGTCTGTCTTTCC
TTGGACATAGGAACGCGGGAATAGTGCTTAAGAGTTCTTGTAAAAAATAG
AAATTGCTGCAGGAGAGTAGTTTGGAAAGACAGTGAGCATATAGACATAG
TAATGAGCCCATTGCAAGCTTGAACTGCAGCGAAATACCGGGTGCGCCAC
AGAAAAGTTTCTCTCTTTGAAACTGATTTTCTCGAAATCTAAAAACTTTT
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AATTTTTTATTTTAAAATTGGTAGTTGCAATAGGCTTTACATGATTAAGA
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TGGCTTTTTTCGACGGAGTTCTTTCTTTTATTGAAATTCAACCTTTTTTT
ATACAACAAAAGGTCATTTAGGCAGCTAATTATCATTTTTAATGACTGAA
ACGAAAATACTGATGCATCATGTAATTTTGCTTCTGTCTAATTTGATAGG
TCGATTTTTAACGTTATTGAGCACTTTCAGAAAGTAACATTTTTATTCAA
TTGAGCATAACTTTCAATCTAATGAACCGAATTTAATAAATGACCCATCA
AAATTTAAGTTTATCTTTCTTCTTTCCAATGGAATAGGATGGTTCTTTTA
AACATTTTAGGTTTCGAAATAATTAGTTTTAAAGAGAGAAACTTTTTTGT
GGCGCGCCCGGTACAACGATGGGTTTACTAGTCTATACTTTTAATTACAC
GGTACCGAAAATTTAACACTTTTGTATCATTTCTGTTTCTATTCTTTACC
TCTTTAGTCTCGTATCGCTATTCCGTCTGATTGCAAAGACGATTCAAATT
GCGACGCAGTGGTAGAATTCCAGTACGACGAGCCTCGTCAAATGATGGTC
TTCACTTTACAAACAAGACACGCTTGGGTTGCCAGTGCTCAAAGACCTCA
AGCTGGAGGTGCTAAAATGGTAAAGAAAATAGTATTAATAGCCTGATGTA
ATTGTCATCGATGTTTCATTCTATTGTTAAGTCAGCCTTTCAGGGCTAAA
TTTTAATGTTCGATTAAATCTAAGTTTAAGGTATTTAAGTCCAGATATAA
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TTATGTTTTAGATTAACATCAAAGGTCAATATTGTGTGAAAGACGGAGGT
TTTGGTAGTTTGGATGGAAGCAAACTGAATGGAAACGGTGCACCTGAGTT
TTCTAGTGGTGCTGTAAGTAGATTTACAATTATATAATAACTGCTTATTC
TATGAAAATGAAGATCTTCAGCCATTGTAGAGCACATTCTTTTATTATAA
CTGCGGAATATAACTGAAAAATTTTAAATTTCAGGTGGTGGATGTGACGT
TGAAATCAACAAAAACTGAGAACGGTGTCACGACTTGTATGTAAGTAACG
GAAATTATTCCCCCCAAACCTGTGACGGTTGCTTTTAAAGCAGGACTGGA
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TTGAAGATGAGAAAAAACCTTAGGATCACGGGTTGAAACAAATACATGAA
GGGTGGGATTTTACAGCCGCCCGTCATGCAAGGCACAATCAATCCTTAAG
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ATGGTTGTGGCTTTCGGAAAATCTGGATCAGGTAATGCTCACCGGAAGAT
CTTAAATGTCCAGCCAGCGCCTATCCAACGTTCCAATCATTTTAGATAAA
CGTTGAAATAACGATGATACCGGGGATAGGTTGTTTTGTTCGAAGTAGAA
ATCGGAAAATATTTGCATTCTACTTTTACTCAGCTAATCGAATAGAAATT
CGCCTATCTCAAATATCATAACTTTCATATAGTATTCATTCGCCCCTGNG
TTCGAAGTAGAAATTCGAAAATATTTGCATTCTACTTTTACTCAGCTAAT
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TTTTGCACCAGTAAACCAAATGTTTTCTTCTCGACTAACAATGCTTTGTA
TTTTACAATTTACAGGCAATAGAATAAGTCGACATGGACTTGGTGATTAT
GCAACAACTGCTGCTTTTGACTTGCTGAAAGCTTCTGGTGAAATTATCAC
CACTACTGGACGAATGCTGCAAGACAAAGAAGTAGCTCACGGTATAGTGC
GGGGAATATGATACAAAATATACACCAGTATTCAGTATTTATCTTTTGAA
ATCAGTAAAAAACAACTGCGCGAACTTACCGTCAGGGAAATTTTGAAAGT
AACTTTTATCGTTCGTTGTACATTTTCCATCCGTAACTTTTGAGTGAGAG
GGCAAGGTAGATCTTTCGCCTTAACTTTCGTTTGCTTCAGTTTGCTTTCA
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GGATCAATAAAATTCGATGGACAAAAATCCGAAGGNTTTTGATAAAAGTT
CAGAGAGTAAAGAGTCCAGATATTTTATTGGATCGACAAAATTCGATGGA
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GGTTTTGGCAGTATTATGGTCGACCGTAACTGTAACAAATGTTTCTATTC
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GCATTTTCATGGCTCGTTACATGAAGCAAGCTACAAAAGAAAAGAAAATC
ACCGGTAAACCGGCTTGGTTCCCTGTGAGTGATTTTTAAGCGTTTGAAAC
GGGGGAGGGGTTAAGCTTAAAGCTGTAATGTTAGCATTGTTAGCAGCTGT
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CCTAAACTCGCTTTAAACTCGTCCCGATATTAGTAATATGATAAATTAAA
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AACATAAAAAAGTTTGAATCGCACCTTACGATGGGAAACCTCACCCATGA
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CAGAGCTCTTTAATATCATGTACATTTTTTTCAAGTCTTAACAGAGTGTG
TCACAGACCCACTGGGACGCCAGCCCTACTAGAAAATTTGAC

Gene-mRNA-Prot

This transcript is a part of the following gene feature(s):


Feature Name	Unique Name	Species	Type
XLOC_011831	XLOC_011831	Clytia hemisphaerica	gene

The following exon feature(s) are a part of this transcript:

Position

The following features are aligned


Aligned Feature	Feature Type	Alignment Location
sc0000378	supercontig	sc0000378:20715..40806 -

Expression

Values :

    GrOo_1	 GrOo_2	 FGOo_1	 FGOo_2	 EG_1	 EG_2	 P1_1	 P1_2	 P2_1	 P2_2	 P3_1	 P3_2	 PoPr_1	 PoPr_2	 St_1	 St_2	 GO_1	 GO_2	 PH_1	 PH_2	 BMF_1	 BMF_2	 MMF_1	 MMF_2	 M_1	 M_2	 GEC_1	 GEC_2	 GEN_1	 GEN_2
0	0	0	0	0	0	0	0	0.238465	0.0302128	0	0.00484568	0	0	0	0	0.0285609	0	0	0.0812175	0	0.0104791	0	0	0	0	0	0	0	0.0155371

Blast

The following BLAST results are available for this feature:

BLAST of TCONS_00021113 vs. Swiss-Prot (Human)

BLAST of TCONS_00021113 vs. Swiss-Prot (Human)
Analysis Date: 2017-10-03 (blastx Clytia hemisphaerica v1.0 mRNA vs SwissProt (Homo sapiens))
Total hits: 0


Match Name	E-value	Identity	Description

You are here

TCONS_00021113 (transcript) - C. hemisphaerica