TCONS_00021038 (transcript) - C. hemisphaerica

Overview
NameTCONS_00021038
Unique NameTCONS_00021038
Typetranscript
OrganismClytia hemisphaerica (Jellyfish)
Sequence length4284

Sequence
The following sequences are available for this feature:

transcript sequence

>TCONS_00021038 ID=TCONS_00021038|Name=TCONS_00021038|organism=Clytia hemisphaerica|type=transcript|length=4284bp
GaaaattttaacagtttttatttCCATTTAGGTTAACTTCTACCTCGTCA
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transcript from alignment at sc0000377:130795..149964+

Legend: exon
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>TCONS_00021038 ID=TCONS_00021038|Name=TCONS_00021038|organism=Clytia hemisphaerica|type=transcript|length=19170bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000377:130795..149964+ (Clytia hemisphaerica)
GaaaattttaacagtttttatttCCATTTAGGTTAACTTCTACCTCGTCA
AATCATACTATTAGAAATCGTCATGAATTCCAACAAATTGCAGATCCAAA
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ATCGCGCAATCTGATTGGTGCGGCTTTGAACAAAAGAAGTGACGTCGAGA
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CTATGAAAAGCTAACAGACGTTCAAAGTTTTATATATATCTTTGCTGGGT
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AGAGTTGAAGTGAagcagagagagagagagaatatATACACGAGAATTTG
GTTTTGTTGTGAGGGTTGTGAGCATGTAGTTATACATGTATTATATGAAA
GGTCNGAGAGAATATATACACGAAAATTTGGTTTTGTTGTGAGCATGTAG
TTATACATGTATTATATGAGAGGTCGATATtacattttgtgcttgttgtt
GTTctgcattttattttcataaaatatactGATAGATCCTCTAGCTACTT
GATATTAAGCTTTTGGTAAAATGATACGATATGGATTGTATGTTTTGAGT
GTATGTATGTGTATACATgtaattttatttcaaacaaagataatacaaat
ttcaattttttgcactGCAAAACACTGACATAATCCTAGTCAAGTCAACA
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AGAGAGAGAAGAAAAATACATGATATCAATTTGTTATACGGATGCTTCAT
AGAGTTTGAAAATTATAATCACACAAAATGGATAGATATAATTGAACAAT
TAGATGgcttttttgatgttgtttaTGATGGCTCGTCAACTGAAAGTCAT
CATTTTGTTCTGTGTTTTGTTTTGTGGATAGCCGCTGAGAATTGGTTACT
GTTACTTAGGGAGAACTAGctataaagaaagaaatttcaaaagttgaTGA
TTTTATAAAAGTTTGCAAACTCAACACGGTAAATCACTTACCGAGAAATT
GAACAAGCCTTGAAACGATTTCAACGATTGAAAGAAACCAGAAAGGAACA
TACCAGCTAAGGGTTGAATTTTCTATTACATTTGTTGTTATAGGGTATGG
TTTTGTTGTGGCTTCGCTTTTCGCTCCCTGCCGCCTGCCGCCGTCTGGCC
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tttggaaagttctaAAATGGTAGAAGAAGCTCTGTAAATAAAAATTAGAC
TCTTTTACGTGTTGTGTCGTTCACCACGTTGAGTTGAATTGGTTGGTTAT
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ATCAACGTCATACTTTGAAGTTCTGTTTATCCTCTCAGTTAGTATATTTT
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AACATATGATTATGAATGAAGGGTAGTGTTTTATAGGTAGTAGAACCTAG
AGGTGccttgtttttcatttgtttcatacTTCAATTGGTAATTTTAGTGA
TTGCTAAAGTATTTGGAGAAGCATTTGCTCTCTGACTGGATGAGGTGCTC
TGCATTGTGGTGGTGGCGCACAAAcaatttttagtaaaaaaaccATTCCT
TTCATCTTTTAGtgaatagaaaaagaaagtagcATTACATGAATCAAAAT
GACAGAAATGGTTATCATGCCAACAGATGAACGTATCCCACCGATGGGAT
CAGAAGCTGCAGATACACACTTCAATGAAACTGCTGCATACGATCCTAAA
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TTACGAACATTGGAAGGACAGCTTACCAGATCTATTAGATGACACAGAag
gatataaattattttacgAATTTCTAGAGCAAGATAAAAGTATCACGTTA
TTTGAATGTTGGTATTGCTGCAATCAATATCGTAACTTGCCACCAACTAG
AACTAGTGCCAAAGACATTTATCATAGATTTGTAAAGAAAAAGGACCCAC
ATATTCCAATTTCTGAtcaagcaagaaataatttggtATTGAGGATAAAG
GCTAACGATATTACAGAAAAAATTTATGAGGAAATTGAAAAGGAAGTTTA
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TGACAAGCATGACCAGTATCAACCTCAATCAAGATCAGAGTAAGTATACC
TTGTTTAATAAACAATTTTTGGAAGGTTCAAGGCTCCAATTACATCCATT
AGAGTTTCTTCTCATTGATATAAAGTCAGGAGGAATCAGAGAAATTGTAA
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TTGCTTTTATACAGATCTAATAGCTTTTCACGACGGTGCCTGAGGATGTA
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ATAAGGACAGTAatgtttttaaggttttttaagaattcttttaaactggc
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ACCTTGCATTCCGGTGTAATACAGCCCTTAAAGTCGCCTGTCACTACCCT
GTTATACTATTTATCATTTGATGTTATGTTgctgtttctctttttttaat
gaatttttttttcttcccctctatgttatgtttttctttcttttcactca
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Gene-mRNA-Prot
This transcript is a part of the following gene feature(s):
Feature NameUnique NameSpeciesType
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The following exon feature(s) are a part of this transcript:
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Position
The following features are aligned
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Expression

Hover the mouse over a column in the graph to view expression values in transcripts per million (tpm).
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Values : 
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Blast
The following BLAST results are available for this feature:
BLAST of TCONS_00021038 vs. Swiss-Prot (Human)
Analysis Date: 2017-10-03 (blastx Clytia hemisphaerica v1.0 mRNA vs SwissProt (Homo sapiens))
Total hits: 0
Match NameE-valueIdentityDescription
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