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Sequence
The following sequences are available for this feature:
transcript sequence >TCONS_00018782 ID=TCONS_00018782|Name=TCONS_00018782|organism=Clytia hemisphaerica|type=transcript|length=4358bp GCTTGCTGCAGGAAGATTTTTGCATAAGATTGTGGAGATAAATTCAATTA CGGCAATAAATTGTACAACTCGTGTATTTTTATGAAGATATGACACTTTA GTTGGTGGACAAGTTGTTGAtggttgtttttgttgatttttttcaaattt tcgtttaACCATGGCTTtgattctttgtttgtttttattgtcaTCTATCA CAGATGTCGCCCTGGCGAAAATCCACATTATCCCTGCTACAAACGAAAac gaccaatcagattgcagccCACTACCGAAACCATACCGAGTTTTCCAAGA AATGCTTGATGGTGACGTCATTCAAGATGGCGATACGATCCATTTAGAAT GTAATACTATGGATCAATTCTTTGTTCCTGATACAttgaaaatcaaacat aaatCGTTAACAATTAAGATGGTAAATCATCAAGACACTGAACAAACCTT GAACACTATTACAGGACTTGATTGTCTTAATAACAAACCATTATTCGAAT TTATTGGTAACAAGAGCACCGATCACAgagaaataaaatttattgGAATA AGATTTGATAACGTaacattgtttcaaaacatttcgCATAATGTTGAATT GAACTTTGAAAATTGCATATTCACAGGATCTCGAAATCTATTTGAATCAA TAAAGAAAGCTAATGGTTTGACACCGCACAATAATTCTACATTAAAATTT GAGAATGCCACCGTTACAGACCATACACAAGATGTTTTCTCACAAATTTC ATTCACCCAAAACACAGTCAATGCATCAGAAGACACCAAaagccaaaaca aaaacaaggTGAAACTAAATGATGAAGCAgttgaatcaaaacaaataagC ATTTCAATGCAGAATTCAAACATTGACGTTGAAAATACTATCCTGATCAA ATTTGGCAATCCTCATTCCTTGGTTTTAAGTCTCCAAGACAGCACAATCA ACTCTGGAACCATACAAAGCTTAGATTCAAACATCAGTCTATATTTCAAG AATGTCTCTTGGAATGGAGCACCTGGAAATACAACTTACCAAGAACTAAT ATCAGTCGAACATTCAAATATTATATTTGAAGATATATCAATCGAAGGAC AATACAATGATACAGATTTCCTGAAATGCCATTATTGCAatatcaaaaca tcaaaaatcaGCTTCAGTAAAGATTCAATCATAAGACGAGGTTTTCATTT GAATCACGCCAAAGGTTCATTTGAAAACATCCACATCAATAATGCTGAAA TCAAGGATACATTCCTCAACTCGACCCATAGTAACTTAACATTCAAGAAT CAGATTATTGTCAAGTCAAGCATCTTTGGCAAACCGTTATTTGTTTTTAA CTTGACCAACACTATTGATATAAACCAAATAATCATCTTAAAAAGCACAT TAAAGCAACAAATCTTAACAAGCATGGATAACTCGAAAACAAACATCAAA GATATTGAAATTGGCCAAAGCCTTTGTGAATACGAAATGTTCCGAACAGC TTTAAATGGAGAAATTCATATTGATAATATAAATGTCCAATCAAGTCGCT TCCATCAAGCATTTTTAGCATATGGGAGTAATTTAGAGACATTAGCAACA TCTGGAATAATAGCTGTATCCAGAGCTAGATTCAAGGATAACCAGCTCTG GTCAACGTTCTTCGGTGGTGTTGATTCACCAGGAATCATGTTAAAGAATG CAATCCTGTTGAATAACACTGCTGAGAATCTATGGCACTCCAGACGCAGC AATACCACTGTTCAGAATCTCACCATCATTGGCAATGATTTTGTTTCTGG ATTCATCTTCTTTGCATCTGATGTCTTCGTCAATGGTATAACGTATCGTG AGAATCTTGCACGCAGTCACGGTAAAGCCCTCATATACGAGAGTACGTGT AACACACAGAAACGTTTCATAGATAttcgaaattttgatatttcagttAT AGACCATGACGAATATGACGTTAAAAGCGCTATTATGGATTTAGAAATTA ACTCAGAGTTTCACCTCAATATGGAGAATAATACAATCGATATTGAAGAA ATGAAACATTCTAAAATCTCAGTTCTGCATCTTAAGTTCCCCACAAAGAA CCCGAATGTGCTCTCCATAAAGCATGAAAACCCAGCTATTAAAGTTATCT GTCCTCCAAGCTATAATCCAACAAGCTCACCCAAAACACGTGAGCAATTC TATTCGAATCAAGTGGATTGTTTACCATGCCCACGTGGGTCGTACACTTT AGCACGTGGTTCACATGTGATCGATTACGTCAATACGACAGATTTTGATG TGATTCTTTGGGATAATGATGGCCGAAAGTTGGTTATTCAGAACTCACCA ATCATTGGAGAATGCATTGATTGTCCACCTGGTGCTAATTGCACTTACGG AATCAAAAGCCAAGGAAACTATTTTGGCCAAGTGGCGACTCCCACTGAAT CACCAAACACAAACAACAACATCACTGTCGAGTTTATGCCATGTCCACCA GCTTATTGTTGTTCAAACCAGGGCCAAAGATGTGAAAGTATCACAACGTG TAATCATCATAGAGAAGGCACATTGTGTGGATCTTGTATGCATGGATATT ATGAAAGTTACTTCTCTCCCAAATGCATCGACAACAAAATATGCACACCG GAGAATCAACAAAAGTTCTGGGTTATCTACATCTTTACCGCGTTTCTTAT CACAATCGTTATCTTTGCTACTAAAGATGTGGTCTTGATTTTAATCGCCA TTATGTTGTATATACAAAAACGTTGGGTGAAAGTTAAACGTAAACTTTCT CGAGATGGTATAAGACATTTCCCTAAACACGCATCATGTATTATGTATCA CAACCAACGGGTCGTTAATAATTGCTTATTATCAGAAGAAAAACCACGAA GATTTATTTTCTCTGCAGTTTTACAAATCACGTTATCATTCTTCCAAATT GTCAGCTTATTGACCTTAAGGAACCACGCAGAAGAAAATAAAACACTGAC CCGAATAATTGACTTGTTTAATTTACAGATCGCAGTAAAGGAAGCTGAAG AGATATGTCCTTTCCAATCCATCAACATTATATGGATTAGTTTCATCAAG AACCTCTTAATCATTGCAACAATGCTCTCCTTCTTGTTCATTTTCGCATG TTGTTTTGCAGGAATCACTTATTTCAAATGTAAGACCAAGATAAAGAAAA CATCTTCCATTTCCAAAAAACCCATTGATGAAGAATCAAAACCGAACACA ATAAAAAAAGTCGCACAAAACCAATTGAAGACCATTCTAGATCTATCAGT AATTGATCGAATCCTTTTATGCAGTATCAAAATCCTCATGTTTGGTTACA AAAACATATCTCTTTTCACCATCGTTTCATTGCATTGTGTGGAGGTTCAT GGTGATCAAGTCCTTTACATTTCTGGTGAAATCGAATGCTACCAAATGTG GCAATGGTTCGTCGTTGTCCTCCTCGTCATCTGGATCGTACCATTTCCAA CAGCTTTGGTACTATCCTATCGATTATATGATGCTGGGTTTGTGAACCGA TTCTGGTTCATTGTTTGCCTCTTATTCCCACCACTTGCATTTGTATTAAC GTATTTTTATCGCAAAACTAAAAGTCGATTATTGGAGGAACGCCAGGGTT TGCATTTAGCATTGTATGACGTTTTTGAGGCACCTTACAGAGTTATTGAG ACACACAGTACTGGTGATGATAGCAAACAACGGACGTTATATTGGTGGAC TGCTNCAGAGTTATTGAGACTCACAGTACTGGTGATGATAGCAAACAACG GACGTTGTATTGGTGGACTGCGTGGCGGCTTTACGAACGATTATTCATTG CTATGTTAGTGACATTCATCATAGAGCCGTTATTCAGAATGTGCGTCGTT GCACCAGTAATGGCGTTTCTGTCCATATTCCATTATCAGATCAAACCATA TAAAGAGACTATGACTTTATTATCGTTACTCGATATTTCGTCGTATGTTT TCTTGACGTTTTACGTCGTTGATAACATGTTCCGATCGTTTGCATACACG TTCGATTTACCGTTGCAGAATCCAATTGATCGTGGTTTGAAACTTTTGGG CGTTTTTGAGGCGTTATTGACGCCATTGACTgtgatttgtttgtttttcg tGACTTTGTTACTTGAAGCTTTGTATGAAGTCTCGAAAACATTGTCTAAA AAATCTGAATGATACAATACATAGCACTGATGTATATATTTTCGTATGTA ATCATTCGACGACCTGATAAATCAGATATTACCCTATTTTATAGGATTCT TGTTTTTAGTACATGGTATCTTTCTACGTCGCTGCAGTAATCAACATTTT TATGGCTG Run BLAST on NCBI protein sequence of TCONS_00018782-protein >TCONS_00018782-protein ID=TCONS_00018782-protein|Name=TCONS_00018782-protein|organism=Clytia hemisphaerica|type=polypeptide|length=1232bp
MALILCLFLLSSITDVALAKIHIIPATNENDQSDCSPLPKPYRVFQEMLD GDVIQDGDTIHLECNTMDQFFVPDTLKIKHKSLTIKMVNHQDTEQTLNTI TGLDCLNNKPLFEFIGNKSTDHREIKFIGIRFDNVTLFQNISHNVELNFE NCIFTGSRNLFESIKKANGLTPHNNSTLKFENATVTDHTQDVFSQISFTQ NTVNASEDTKSQNKNKVKLNDEAVESKQISISMQNSNIDVENTILIKFGN PHSLVLSLQDSTINSGTIQSLDSNISLYFKNVSWNGAPGNTTYQELISVE HSNIIFEDISIEGQYNDTDFLKCHYCNIKTSKISFSKDSIIRRGFHLNHA KGSFENIHINNAEIKDTFLNSTHSNLTFKNQIIVKSSIFGKPLFVFNLTN TIDINQIIILKSTLKQQILTSMDNSKTNIKDIEIGQSLCEYEMFRTALNG EIHIDNINVQSSRFHQAFLAYGSNLETLATSGIIAVSRARFKDNQLWSTF FGGVDSPGIMLKNAILLNNTAENLWHSRRSNTTVQNLTIIGNDFVSGFIF FASDVFVNGITYRENLARSHGKALIYESTCNTQKRFIDIRNFDISVIDHD EYDVKSAIMDLEINSEFHLNMENNTIDIEEMKHSKISVLHLKFPTKNPNV LSIKHENPAIKVICPPSYNPTSSPKTREQFYSNQVDCLPCPRGSYTLARG SHVIDYVNTTDFDVILWDNDGRKLVIQNSPIIGECIDCPPGANCTYGIKS QGNYFGQVATPTESPNTNNNITVEFMPCPPAYCCSNQGQRCESITTCNHH REGTLCGSCMHGYYESYFSPKCIDNKICTPENQQKFWVIYIFTAFLITIV IFATKDVVLILIAIMLYIQKRWVKVKRKLSRDGIRHFPKHASCIMYHNQR VVNNCLLSEEKPRRFIFSAVLQITLSFFQIVSLLTLRNHAEENKTLTRII DLFNLQIAVKEAEEICPFQSINIIWISFIKNLLIIATMLSFLFIFACCFA GITYFKCKTKIKKTSSISKKPIDEESKPNTIKKVAQNQLKTILDLSVIDR ILLCSIKILMFGYKNISLFTIVSLHCVEVHGDQVLYISGEIECYQMWQWF VVVLLVIWIVPFPTALVLSYRLYDAGFVNRFWFIVCLLFPPLAFVLTYFY RKTKSRLLEERQGLHLALYDVFEAPYRVIETHSTGDDSKQRTLYWWTAXE LLRLTVLVMIANNGRCIGGLRGGFTNDYSLLC Run BLAST on NCBI transcript from alignment at sc0000306:215775..226568+ Legend: exonfive_prime_UTRCDSthree_prime_UTR Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below. >TCONS_00018782 ID=TCONS_00018782|Name=TCONS_00018782|organism=Clytia hemisphaerica|type=transcript|length=10794bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000306:215775..226568+ (Clytia hemisphaerica) GCTTGCTGCAGGAAGATTTTTGCATAAGATTGTGGAGATAAATTCAATTA
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TGATGATAGCAAACAACGGACGTTATATTGGTGGACTGCTNCAGAGTTAT
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GGACTGCGTGGCGGCTTTACGAACGATTATTCATTGCTATGTTAGTGACA
TTCATCATAGAGCCGTTATTCAGAATGTGCGTCGTTGCACCAGTAATGGC
GTTTCTGTCCATATTCCATTATCAGATCAAACCATATAAAGAGACTATGA
CTTTATTATCGTTACTCGATATTTCGTCGTATGTTTTCTTGACGTTTTAC
GTCGTTGATAACATGTTCCGATCGTTTGCATACACGTTCGATTTACCGTT
GCAGAATCCAATTGATCGTGGTTTGAAACTTTTGGGCGTTTTTGAGGCGT
TATTGACGCCATTGACTgtgatttgtttgtttttcgtGACTTTGTTACTT
GAAGCTTTGTATGAAGTCTCGAAAACATTGTCTAAAAAATCTGAATGATA
CAATACATAGCACTGATGTATATATTTTCGTATGTAATCATTCGACGACC
TGATAAATCAGATATTACCCTATTTTATAGGATTCTTGTTTTTAGTACAT
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The following exon feature(s) are a part of this transcript:
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| TCONS_00018782-exon-sc0000306-1575043694:215775..215977 | TCONS_00018782-exon-sc0000306-1575043694:215775..215977 | Clytia hemisphaerica | exon |
| TCONS_00018782-exon-sc0000306-1491911889:220448..222643 | TCONS_00018782-exon-sc0000306-1491911889:220448..222643 | Clytia hemisphaerica | exon |
| TCONS_00018782-exon-sc0000306-1510915933:220448..222643 | TCONS_00018782-exon-sc0000306-1510915933:220448..222643 | Clytia hemisphaerica | exon |
| TCONS_00018782-exon-sc0000306-1575043694:220448..222643 | TCONS_00018782-exon-sc0000306-1575043694:220448..222643 | Clytia hemisphaerica | exon |
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| TCONS_00018782-exon-sc0000306-1510915933:223224..223418 | TCONS_00018782-exon-sc0000306-1510915933:223224..223418 | Clytia hemisphaerica | exon |
| TCONS_00018782-exon-sc0000306-1575043694:223224..223418 | TCONS_00018782-exon-sc0000306-1575043694:223224..223418 | Clytia hemisphaerica | exon |
| TCONS_00018782-exon-sc0000306-1491911889:224032..224117 | TCONS_00018782-exon-sc0000306-1491911889:224032..224117 | Clytia hemisphaerica | exon |
| TCONS_00018782-exon-sc0000306-1510915933:224032..224117 | TCONS_00018782-exon-sc0000306-1510915933:224032..224117 | Clytia hemisphaerica | exon |
| TCONS_00018782-exon-sc0000306-1575043694:224032..224117 | TCONS_00018782-exon-sc0000306-1575043694:224032..224117 | Clytia hemisphaerica | exon |
| TCONS_00018782-exon-sc0000306-1491911889:224891..226568 | TCONS_00018782-exon-sc0000306-1491911889:224891..226568 | Clytia hemisphaerica | exon |
| TCONS_00018782-exon-sc0000306-1510915933:224891..226568 | TCONS_00018782-exon-sc0000306-1510915933:224891..226568 | Clytia hemisphaerica | exon |
| TCONS_00018782-exon-sc0000306-1575043694:224891..226568 | TCONS_00018782-exon-sc0000306-1575043694:224891..226568 | Clytia hemisphaerica | exon |
The following polypeptide feature(s) derives from this transcript:
Position
The following features are aligned
| Aligned Feature | Feature Type | Alignment Location |
| sc0000306 | supercontig | sc0000306:215775..226568 + |
Blast
The following BLAST results are available for this feature:
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