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Sequence
The following sequences are available for this feature:
transcript sequence >TCONS_00017441 ID=TCONS_00017441|Name=TCONS_00017441|organism=Clytia hemisphaerica|type=transcript|length=605bp
CGATCTCTTTTCTCTTACTAATAATTGTTTATGTAGTCGTTAGCAATGTC
CGTCTATCGAACTATGTTTTTCTAGTGTTTTTTTCCTCATATCATCTGAG
ATGAAGCAGAGTGACTatgacactttttgaaaatgaatttacTGGTTTGA
GTTGAtcttgaaaatgattttcgtaaATGAGGAATGGAGATAGCGAACTT
GGTTTGGATTAGAAGATTGTAATATGTAATCAGTACGTAAGTCATGTAAG
CTGACACTGGCTTCTTCAATGTCAATGAAACTGTCACATGATTCTTCTGG
TAGATCAAAAGGAGTGCGAGCATGATTCAGACTGGTAACATAGATAGTTT
TGTTGGGTGTTCCATCGAATCTTGTTTGGATTTGAAGTTCAGAATCATTC
ATGTATGGCACAGACGGAGAAGCAGGTTTTGAAAACTCATGGTCATTTGA
ATGCATCAGGAAACAGAATCAAAATATTTGGTCTCTTTTTAAAATGAACA
AGTAAATTTAAtctgtttaatttttatttctttgcaatggtattttggtt
ttgaaaaaagtttttttaatctgaaaaatgaaaagaaataagCTGCTAAG
Aggta Run BLAST on NCBI transcript from alignment at sc0000267:171632..180464- Legend: exon Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below. >TCONS_00017441 ID=TCONS_00017441|Name=TCONS_00017441|organism=Clytia hemisphaerica|type=transcript|length=8833bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000267:171632..180464- (Clytia hemisphaerica)
CGATCTCTTTTCTCTTACTAATAATTGTTTATGTAGTCGTTAGCAATGTC
CGTCTATCGAACTATGTTTTTCTAGTGTTTTTTTCCTCATATCATCTGAG
ATGAAGCAGAGTGACTATGACACTTTTTGAAAATGAATTTACTGGTTTGA
GTTGATCTTGAAAATGATTTTCGTAAATGAGGAATGGAGATAGCGAACTT
GGTTTGGATTAGAAGATTGTAATATGTAATCAGTACGTAAGTCATGTAAG
TTTATCTTTTAGCCTCTCTTTGTTGCTATAGGAACAGAATAGCAAGTTTT
TATTGACCCATTTACTGGTTATTTTCAAATCAAGGTTTTGGAAATTTCAC
AAATTATGAAAAATAAAGATAGATTAGATTAGATTAAGGCATCATGTTAA
TGAAAAAAATGTAGACATTTTGGCAATTCGCCAAATAAAGCTTTTGATCA
ACAAAACAACCATCCTTGGGCGATAGGGCAACAAATGGAATACTTTAAGA
GATTAATTTTCCATGAAAATATGCTCATTATTCGTCATTACTCAATTTCG
CAAAATTGCATTAAAATTGGCGAAGAGGTCCATACAAACGAGGCAGTGCC
TTTGTGTGGAGACTTGTTCGATTTTTTTAGTCAAAGCACTTGTTATACAT
TTTTGGAAAGCTAAGGGGCAGGGGAATCATAATAACATAGGTTCCAATTT
TTTTCGGACACTTTGGTGTGTTTTTCGGACAAATATGACAGCGTCATGCA
AGGGTCAAAATTTAATGAAAATTTTAGCTTGAGAAAAAAAATTGGAACCT
ACGTTATTTAGATTCTCCTACCCCTTATTAGCTTTCCAAAAATGTATAAC
AAGTGCTTTGATTAAAAATGTCGAGCGATTTTACAAATTTCCCCCTGCTA
TTATAAAAGTTGGCCCAAGATCTAAACTTAAAAGTTACAGATGATTTTGT
CTAATAATCTAATGCAAAATTTAAGGTATTACGGAATGTCTCTAAATGAA
TTTTATTCCCTTTTTTCGTCATTAAAATTGATACAGTTAGCAATCAATTA
TACTATTTTCGTGGGTCATCTGGTATTTGAAATATGAAAATATAATTTTC
TATCCACACATGGTGGGGGGGGATGGACGAACATTTTCAGAGGGTAATCC
AAGAAAAAATCTTCCAAGGATTAAAAAGTTATTCTAAAATTTCCACGGGG
TAAAAGAATGAATTCAGTTCGTCCACCCTCACTTCAAGAATCTTTCCAAA
AAGGGTGTTTTTTGCAAAATTTCGCCATTTCCCATGGGGTATCGACACAT
TTTCAATATTTTTTTTTTGACTTGGAAAAGGTTCGTCCACCCCCTGTATG
GTTTTTTAATGGAACAACCGAATATGAGGCTTTAGAATAGTAAGGGAGGA
TAGTGAGAGAAAGTGTGATTTATATGTTATAATCGTAAGTGGGATCATTA
TATTCTATGTATTTTTACATCATTCAAAATATTCATCGAAAATAATAATT
AATGAATAAAAAGAAGTTAGTCAGTCAAATAATTTTAATTAGTCAAAATT
TCTACCTTATTTGGCTACAAAATTTCAGTTTCCAAGTTAAAAGAGCTTTA
CGAAAATCTGAATTCACTTGAAGCATGGTAGATAGAGAACCAAAAATTAA
TGTCCTGTTTTAGCACTTCACCAAATTGTGAAAAATAGATGATTTCGAGA
AAATTGCATAAAAATTGATTGAATTTGAAGGTCAGAAAGCATTACATCTA
GAAAAAAAATTACAAAACAAATTAGGTACTAGAAATTATCATGATGATCT
AAAACAGTCTTTCAAAAAAAAGCCAAAATTTTATGCAAATTTGGTGGCAT
TCTTTCGCTGCGTATTTCACGCATAAAATACAAATTGTTCAAAAGGCTTG
AATGAATCTTAATTAAGAATTTAGTCATTAATTAAATTAATCACAATGTA
ATAATCAGGAGCTTTAAAAATATTCTTTACAAAAAAAAGCGAAGTCATGA
CATGATTTCATCAATGACCAATCAAAAACTAGTAAAAACAATTTAAGAAA
AGCTTTCAATTATAGTCGAATGAAAATAAGCTTGGGAGTACAATATTTCT
TTTTTAGTTACTGTAATAATATATAAAACAATCTTTAAAAAACAAATGAT
AAAAAAATATGGTTTGGATACCAGAAATCTTTAAAGATGAATAAAATTTC
AATAAAAAAGTTTACCCTGATATTTTTTCAGTTTTTAGACAGTAGAAAAT
AATAAAATCATACTTAAATGACCATTTTGCCTGAGACATTTGTTACAGTT
TGAAAAACCCGGCGAATGTTTTGAAATCTTAAAGATAACATAAAGTATTG
AGAAAAAAAGTCGGGGAGTTATCTGGCAATATAGTCTAAAGTACAATTCT
AAAACAAAGCTACTTATAGCAAGGTCAAAATAAAAAACATACTTAAAAAT
TAAGCATAAAATTATATAAAAATGATAAAAAATCAAGACAGAATAATCAT
TTCAAAAAATGTCCCAAGCAAGCAAAAGATCATAGACTAGGAGCTTAACT
GGTTAGTTTCTATGTCTGCCAGCGTCTGCTGGACATTTGCAGAGTCAGCG
AAAATAACATTACTATCAATTTGAAGAGCAGTCGAGTCTGACTGATTCAT
TTGTGGTAAATTACTCAAAAAATTACTTGTTGAATGTACGTTAAGGTCAT
TTGTGACCAGCTGATTAGCTAGATTCTCTTTAAAGCCTACCTTATTTGAG
GCAATGGCGTCATTTATTGAAGGCGGGTTCCATTGTGGCTGCATGGATGC
TGTAACTGTGTTTTGGAAACTAGTAATGGGCATTTGGTGAGAAGACGATG
ATGCGATTTGATCATACGAGGGTGACAAAAGCTGTTGGGCGGCAGGCTGC
TGAAATTGTTGCAATTGTATCGAATTTGGTATATTGGTTTGCATGCTTGT
GACAATGTTTGCAAAACTATCCGGCATGTTTTTGGTGAATCCATTGTTTA
AAGGTAGCTGGGATGATGAATCTTGAACTAATGGTGGCGGGAAATTCAGT
GATTGGTGCTGTTGTGGTGTGGTTGCTATGGAATTAGCAATTTGGTCTAT
AATACTTACTGGTGTGTCTGGGGCTGATGAAGTAATTTGCATTATTTGCT
GCTGCTGCTGCTGTTGTTGTTGCTGCTGCTGCTGCTGCTGCTGCTGTTGT
TGTTGCTGTTGTTGTTGTTGCTGTTGTTGCTGCTGCTGTTGTTGTTGTTG
TTGTTGTTGTTGTTGTTGTTGTTGCTGAGCCTTTTGTTGCTGAAGTAGAT
ACTGTTGGTGTTGCTGTTCACTCATGTTGGCCATTGAAGTGGCAAGGGAA
GTTTGGATTTGTTGTAGAGACATTCCCATACTACTAAGCGGGTTCTGTTG
CATTTGTGCTATGCTTTGTTGATTAGATTGCGGTATGGGAAACTGCATAG
AGTAGGTTGGTTTGACTATGTTCATCGGTTCAACTTGTTGTTGATTGGCC
AGTTGGGCAGAATTTGGTCCTGTGCTCATCTCGATTTGCTTTTTCAATGA
TTGCATGATATTAGTCAAAGTGACCAGTTGGTGCTGCAAAGATGCTGAAT
TATTAGCGGTTTCAGTTGTATTACAGTTGATTGTAGGGATGGTGACTGGA
GCGGTGAGTGGGGCAGGTGGTGTTGACGTTTCCATTTTTTGAACGACTGG
AGAACTTTGGAGAGGCGATGAAGGAACTGAATTGTTTGGAGTGTGTTGTT
GTTGGTGGTTGATTAGTAAGGTGTTGACTGATTGCACTTGAGGGGTAGTG
ATATTGCTAGGTTGCATACAACTGGTAGCAGGTACAGGATTGCCAATGGT
AGGAGCAATAGAGAGGAGTGGTGTAACAGCAGTTTGACTGTTAAACATAC
TTTGAGATTGTATTGAGATTTGTTGTTGGGGCAGGGGTGTCGGACAATTC
TGAATGAAGGCTTGTTCTTGCTTTATTGAGGGATGATTCTGCATGGAAAC
AACTTGTGCTATTTGATTTATCGGTGAATTGCTGGGTAGTGAACTTTTGA
TCTGATGAACTTGCACTGGCTGATTTACAGCTGGATAACTGACCATTNTG
GAAACAACTTGTGCTATTTGATTTATCGGTGAATTGCTGGGTAGTGAACT
TTTGATCTGATGAACTTGCACTGGCTGATTTACAGTTTGATAACTGACCA
TCAGGTTATTTGCTGGTGTAGGTGCTGCAATAGGGACTGTTGTTTGAAGT
GTTGGCTGCATAGCATTATAAATCTGTGTAGAAATTTGTGGCTGAGAATT
TTGAAACAATGTTGGTAAGATCGAAACATTTGCATTAGGCAAAGCGGGTT
TTGGCAATCCTTGGACAACCTTTGTCGAAGGTAGGCATAAGGGTACACTT
GAGGATGGAGCTATGACAGCAACACTCTTCAATGAACTACCAGATGATGG
CATTGTCATTAAATTTGCGACTGGTGAATTTGGTATAGTCTGGGTTCTGA
GAAGCGTTTTCAGATTTGGTGCAATGTTTAGCAAGGAATTGGGATTGTGT
GGGTGAGCAGATTTGACGACAGCTGGTGATTGAACAGGTTGTCTTTGTGG
TGATGGTTTTGGAGTAGAAACAATTTTACGAACAGGACTTTGAACTTCTG
TTTTAATATCAAGATTCTCAGGTGAAGAAGAAAGGTCGGCTGTTTCTCCA
TTGCAAATCTTTTTCAGATAGCTTTTGATTTGTGTGCAATTTTGACATCT
TTCAGCAGCCTTCGTTATGTAAGTGAATAGGAATGGTTCGCTACATCGAG
GTTCTTTATCAGAGCCAACACGGATCTCGACATGGATGACAGCATTTTCT
TTAAGAAGTGTATCTTTGTAAGGTGGTATTCTCACGACACATGCATTCTA
AAGATACAATTATGTAATTGTTTTTGTTGATCATGTCAAAACATTGTTTT
TTTTATTTTCTTAAAAACTGATCCAATTTAATAAAAGCCAACTATATGAT
ATTACGCAATGCTGTACTGCATAAATTAAGTTGCGATTGTGTAAAACAAC
CGGTACAGAGCAAAGATAGAAAACAAGCTTAGAAATTGATTCTTACAAGA
TTCGATTTAGTTTTATCGATGTCAGCATAAACTTCCCAGCTATTACCTGG
AAAGGAACAGAGAGAATTAAATGAATTAAAATACTTCAGTCCAAAGCTAT
CTACTTTTTTCAATTATACTGCCTAAACATCTTTCAGTTAAATAAGTTGA
GTGTTTCGATATCACTTTTATCCAAAAAAGCTGGTTTCGTAAGATAGCTT
TTTATGGCATTTATATGTCAACAACATCAAATAGTTGTGAAATTTTGTGA
GTATTATCTGAGTTCTCAAAGAAATGTTCCACAAAAAATTCTGGAAACTA
TTCACATACTTATCTGTTAGTTCAAGAAAGATACTTAAAAGGGGTATCCA
GACAAATAAGAGTCCTGACAGTCCTAAGCAAAACCTTTGAAATTATACAT
TTTTGTGCTGAACTATAGAATTTCAACATGAGGTATATGTAAGTTAAAAA
ACTAAGATTTCAAATCATTATCTTGTACACAATCTTATACTTTGATAATC
TTTCCCAGGATTATTAAAGTAATCTTTGGTCTGGAATTCCCTCTTTAACC
AGTATTCTTGATATGCGTAAGTCAAGATGACGTCATATTTTTTAACGGAA
GCACCCAAAAAAGCCGGTTTTTGACCTCCGAAAAATGACTTACGCATATC
AAGTATATCCTTTTAAAATCTGAAAAGTTTACATACCATCATCCTCTCTG
GAGAAGAAACGCACTTTGAAACCAGATGCAAATTTCTTGCCAATAAATCC
TAGTTCATCACCTCCTTCTGCATACGATTCTGTTTTACTGATCCACCAAA
TTTCTGGGTTTCCAGATGGTGCAGCTAAACAAAAACATAAGGATGTCAAT
TTAAAAATGAAAAGCTAAAAAAACACGAGAAAGTTCTCTGGTATAATAGA
ATGCTCTTTGACCTTGCCCATGTTTTCTGAAATAGATAAACTATTTGATT
TAAGCTGTCAATCAACCTGAGAGCCTAAAACATTCAAGCGGCAAAATCAT
TAAGAATCTTAAAGAAAAACCGAAAAAGACTTACTGCACAAAAAAGATCT
TGAAAAGCTTGTGATAACATAATTTGGATGTAGATTGGTGCAAGGAATCT
TTGCCCGAAAAGCTAACTTGGCTTCCTTTTTCTTGGACTTCCACGAAGCA
GGTTCAATGCCTCTTTTCCTCAATTCACGGTCAGCTTCGAAGTTTCTTAT
CCTTCTGATACTCAATTGGTCGAATCTAAAGGAAAACAATTAAAATTGTT
GGCAGCTTAGACAGCTTGAATAATTTTGTTTTGTATCATACCATAACTTT
GAGTAATGCCTTTTGTAATTTTAAATTTTATTACGGAACTACAAAAATAG
CCTAGAGTTCCAAGGCAAACTTAAAATCAGTAAATATAAAAAAATCTTTT
AAGCGCTGAAAACACTATATTGACATTAGCTGTGTGCCCTAGCCTATATG
GGCTTAGTTAACTAGGCTAATACAAAAATAGAGAAAACTGAGAATAACTT
TTAGAGAAAACAAATTCTTACACAGCAACCATTTCATCTTTGTTGTCAGT
AGGTGTAATGGTCATTTCAATTGCAGGAGTCTTGTATTGATCATCGAGAC
ATATTTCTTCACAAGTGGTCTTACTTGAGCCAGGTCCTGTTGCAGCATGA
AGATGCGGCTCAAGATCACTTGTAACAACAAACACCTGAAGCTTGACAGG
TCCAACATACCCAACAATCTAAAAATATGTTGGATTCTAATTGAGAGAAT
GATTTTATTCTAACAAACATAATAGACACTTTAAAAATTTACTGTTGAAT
GATCTCTTAAAAAAAATAGAAAATCTAACTATAAAATTTTAACAAAACAT
TAAGAAAACTAACCTTGACTGAAGGAAAGCCTGTTTCTGAAGCCCCGTGT
ATAGGCCCTTTGCATCCCTCACTTTCATAACGAGCCCTGTATGTCTGGAA
AGTTAAAGAATCTTTCATTAAAATCATGCAGGTTAATCTTAAAAAGGCAA
ACCAAATTGAATCTTATACTTCCCAATGCATGTACCATCAAAAACTAGAA
AAGAGTCCAAAAACCAACAAAAGCTTTCAATTCAGAGAAATAAAAGCTAG
AGACTATCAATTTATGAGCAGTATAAAATCCAATTTGTTAAACCTAAGAT
AAGAAGTTTTTCTTGGAACGTACAAAAATGGAAGAAACATGATATTTCTT
CATCAATTTTTATCTTGTTCAAGAATTACAAATAAAAAGTTCATGCCTTG
CATTATAAAATAAAAAAATTTACTCATAATACAATGAATTTTAAAAAGCA
ATATAATGTGCCTGGAAAAATCTAGCTGATTTGATTTAATTTGTTGCATT
AGATTGGTGAACTGATACCTTATTAGTACTAGTAATCGTATGGTTTGGAG
TACAATTAACAATTAATCACGAGTAACAAAGGAGAAAATCGTAATTTGCA
CGATTCCATGAGTGATTAATCGTTAATTGCACGACAAAACATACGATTGC
GAGGTAATCGTCAGTAAATAATCATTAGTAAATCATAGTTTTTTTAGAAA
TAGGGAAAATTTTCTAAGGGGACAAAAGTGTCCCCCCGGCGAAGAGTGCA
AAAAATGGTAATAGTGCAATTAACGATTAATCGCACCCTCTAAACCAATC
AGATTCAAGTAATTTTGCACGGCTGACGATTAAGGGAAGAAATTTTTGGG
ATGAGCTGGAGTTTTTACAAGATACTTCACTAATTAGTCATTTAAAGTGA
TAGAGATGACGTGTTCTTTAGAATAAGTAATGAGATTCTTTTATTACATC
TTAATGACCAACCAAATCAACTAAGAGCTTGTAAAAACTCCAGCTTGTCT
CAAATTTTTGCGGAATTTAATTTCGCAGATTTGGCAAAAAACCAGGAAAT
TAAATTCTGCAAAAATTTCTTCCCACAAAATATTTTTGTCTGAAGGTAGT
TTTATTGCTTTACTAGTTTTAGTGTAGCTATAAGGGCCAATGCTTGAGTG
AAATATCTAAGTTTCTTAGAAGAAAGATTTACTAAACTTAGAAAATTAAG
AAAATACAAAGGACAAAAATAAAATAAATTTACAGTTTCAGGCTCTTCTA
TGATTTCTATCCGCGGAGGATCTAATGTTAAAAGATCAATTGATGGTTCT
TTAGGGCTAAGCGGTGCTTCAAATTCAAAAATTGATTTTTTCGTATCCAC
AGTTTTCATCAACTCATTCAGTTCTTGGTGAGGAGATACATTTGTTGATT
TCTGCATTCTGTGATAAGGTTCATATTGATCCCTCTTTTGATTGCGCAAA
TCTTGATCATATGAAAGCGCTGCCATAAATGAGTGATGATAGGTTTCAGA
GCCATCTTTCATTGGTTTTCCAGGTAAGCTGACACTGGCTTCTTCAATGT
CAATGAAACTGTCACATGATTCTTCTGGTAGATCAAAAGGAGTGCGAGCA
TGATTCAGACTGGTAACATAGATAGTTTTGTTGGGTGTTCCATCGAATCT
TGTTTGGATTTGAAGTTCAGAATCATTCATGTATGGCACAGACGGAGAAG
CAGGTTTTGAAAACTCATGGTCATTTGAATGCATCAGGAAACAGAATCAA
AATATTTGGTCTCTTTTTAAAATGAACAAGTAAATTTAATCTGTTTAATT
TTTATTTCTTTGCAATGGTATTTTGGTTTTGAAAAAAGTTTTTTTAATCT
GAAAAATGAAAAGAAATAAGCTGCTAAGAGGTA
Gene-mRNA-Prot
This transcript is a part of the following gene feature(s):
The following exon feature(s) are a part of this transcript:
| Feature Name | Unique Name | Species | Type |
|---|
| TCONS_00017441-exon-sc0000267-1575043694:180220..180464 | TCONS_00017441-exon-sc0000267-1575043694:180220..180464 | Clytia hemisphaerica | exon |
| TCONS_00017441-exon-sc0000267-1575043694:171632..171991 | TCONS_00017441-exon-sc0000267-1575043694:171632..171991 | Clytia hemisphaerica | exon |
| TCONS_00017441-exon-sc0000267-1510915933:180220..180464 | TCONS_00017441-exon-sc0000267-1510915933:180220..180464 | Clytia hemisphaerica | exon |
| TCONS_00017441-exon-sc0000267-1510915933:171632..171991 | TCONS_00017441-exon-sc0000267-1510915933:171632..171991 | Clytia hemisphaerica | exon |
| TCONS_00017441-exon-sc0000267-1491911889:180220..180464 | TCONS_00017441-exon-sc0000267-1491911889:180220..180464 | Clytia hemisphaerica | exon |
| TCONS_00017441-exon-sc0000267-1491911889:171632..171991 | TCONS_00017441-exon-sc0000267-1491911889:171632..171991 | Clytia hemisphaerica | exon |
Position
The following features are aligned
| Aligned Feature | Feature Type | Alignment Location |
|---|
| sc0000267 | supercontig | sc0000267:171632..180464 - |
Blast
The following BLAST results are available for this feature:
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