TCONS_00016947 (transcript) - C. hemisphaerica

Overview
NameTCONS_00016947
Unique NameTCONS_00016947
Typetranscript
OrganismClytia hemisphaerica (Jellyfish)
Sequence length968

Sequence
The following sequences are available for this feature:

transcript sequence

>TCONS_00016947 ID=TCONS_00016947|Name=TCONS_00016947|organism=Clytia hemisphaerica|type=transcript|length=968bp
TGTGCGAACGACAGGTTGTCTGTCCAGGGGATAACgatgaaagaaagaaa
gacgGAATTTGCGAGGACAAGACTCCTAATTTTTGCAAGAGAAAAGTCAC
ACCAGGCAATGGTCGTAAAGAATGCCGACAAAAAGATACGAAAGAACAAA
TGACACGTGATTGCAAGAAGACATGCCGTTTTTGCGAGCcttGTATGAAT
TACCACAGAGATTGTCCAGGTTACGCGTCCGTCAGTTATGGTTATTGCAC
TGATGATAAGTACAGTGCTTGGATGGAATGGAAATGTGCTAGATCATGTG
GTTATTGTAACAAAAATCAAACGAAACCGATGGGCGACGACTGTTACGAT
CTTTCCGACAAATGTCCCGATTATGCCGATCATTTTGATGACGATTATTG
CAATCATCCGAAATACGCCAAGTGGATGTCGCAAGCATGCAAAGAAAGTT
GCTTATATTGCAAAGATTGTACTGACAAAAGTCCTTATTGCGAGACGTTA
AAAAAGAACGGCTTGTGCGTCGCAAAGAATCGACAAGTCTATTCCTGGAT
GGTAATGGAATGCTCCAAATCGTGTGGTTATTGTTTCGAAAAATCTGTTT
TCCAAAAAGACATTACAAAAGTGACGGGACAAAGACCATAGTGCCTGTAT
GTGTATGCAATGGAGGGATGAACGATGCGTATATCTCCGGTGACACAAAT
GTCGTTTCGACGCCCATCTAACGTTCACGAGGTCCATTTGACGTATATTC
AACGTTCAATTGAAGTCCACAGCCATTGAATGGTTTTACCTGAAAGAAGA
ACATTTgaatttgttaaaaattgacgtttttacTACTGGTATTAATAGAA
TTAACGTTCGACCGATACCATCTGACGGATAAATGGCTCGTTAACGAAAC
TCAAATGAAACCATTGCTTGGTTGTAAAAATCATCATCTACTGTAAATGA
AACAAATAATGGACGGAT
Run BLAST on NCBI

transcript from alignment at sc0000255:96948..116441+

Legend: exon
Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.
>TCONS_00016947 ID=TCONS_00016947|Name=TCONS_00016947|organism=Clytia hemisphaerica|type=transcript|length=19494bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000255:96948..116441+ (Clytia hemisphaerica)
TGTGCGAACGACAGGTTGTCTGTCCAGGGGATAACgatgaaagaaagaaa gacgGTTAGTCACAACTTTTTAACCCTTTTAACGATTGCTATTTTCTTGC TAGGTTCTTGGAATTCCTTTTAATTTTAGTTCAGTTTAGCTTTCAAACTC GGAGCCTCAAAGATTCTGGTAGAAAGCAATATCAGTACTTTATCCATGGT AGATAATACGTtgtcaaaaagtgagcaaaatataACGTCAAAGTTTCAGA ATACCACTGAAAATTGCTGGGAAAATAGGTAACCCTTTCCCCCAGCAGAC GACCTCCCAACGACTTTTCACCGTTCTTTTAACAACGGCACTAGGGGAAA GAGTGGGAGGGGGAGTTCAAATCATACTCTTGTATCACCATTTAAGTTCA GGATTGTACCACAATACAATTATAATCACAGTTATAAATACCTCTAAGTT AATCTAAGTTAAAACTACTTATATGTTGATTTGTCTTCTGTACGTAGCAC ATTCACTGTACCCGGAAAAAACGGGGCATAATTTTATATGTGCTTAAGAA TTCCATATACAAANTTTTCTCTTTTGCAGACAACTTGTGGCAAGGGATTC AAAGTTCAACGCCGTTTTTGCATCACTCCCGAATCTTTGAATGGGCATCC ACCAAATTGTGGTGCGGACAAAGAGAGAATGCAAATCATAATGTGCGAAC GACAGGTTGTCTGTCCAGGGGATAACgatgaaagaaagaaagacgGTTAG TCACAACTTTTAAACCCTTTTAACGATTGCTATTTTCTTGCTAGGTTCTT GGAATTCCTTTTAATTTTAGTTCAGTTTAGCTTTCAAACTCGGAGCCTCA AAGATTCTGGTAGAAAGCAATATCAGTACTTTATCCATGGTAGATAATAC GTtgtcaaaaagtgagcaaaatataACGTCAAAGTTTCAGAATACCACTG AAAATTGCTGGGAAAATAGGTAACCCTTTCCCCCAGCAGACGACCTCCCA ACGACTTTTCACCGTTCTTTTAACAACGGCACTAGGGGAAAGAGTGGGAG GGGGAGTTCAAATCATACTCTTGTATCACCATTTAAGTTCAGGATTGTAC CACAATACAATTATAATCACAGTTATAAATACCTCTAAGTTAATCTAAGT TAAAACTACTTATATGTTGATTTGTCTTCTGTACGTAGCACATTCACTGT ACCCGGAAAAAACGGGGCATAATTTTATATGTGCTTAAGAATTCCATAta caaattgtttttttctagGAATTTGCGAGGACAAGACTCCTAATTTTTGC AAGAGAAAAGTCACACCAGGCAATGGTCGTAAAGAATGCCGACAAAAAGA TACGAAAGAACAAATGACACGTGATTGCAAGAAGACATGCCGTTTTTGCG AGCGTgagtctgtctgtctgtctgtctgtctgtctgtctgtctgtctgtc tgcgCTTTTGTAATATCACACCATAACACAACCAAAACTGCAACATTGTc tccgtgtattccaggctttatctacgttactgattgacgccagagaatac taTCTAGCGCTATCACTAAGCATTGAAAATGCTGGTAATACACACGGAAC GAGGTTGCCaaaactgtttaacaatttCTATCCGTTTATGACATGTCCCG AGGATTGAGAATCTGTCGGTATAATATCAAATAGCAATTGTGGATCGACA CAAAAAGCGTTCAAAGGGTGCAAGAATTGTCTTCAAATTTGAGAAACATC CAAATCATGGATATGGACTATGGATATCGTGCATTCTTTCTTTGCGCATC ATATTTAACTAGATCTAGAGcgataaattttactttcaatacaGCGTTTG TCTGAAAGCCACGTCGGTCACACTTCATTTCCTATCCAATAATTTCTCTC TAGCCATCTGCcttaaactgattttttttattttcagcttGTATGAATTA CCACAGAGATTGTCCAGGTTACGCGTCCGTCAGTTATGGTTATTGCACTG ATGATAAGTACAGTGCTTGGATGGAATGGAAATGTGCTAGATCATGTGGT TATTGTAACCAAAGTGAGTTAAANNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNTAACTTCTGATAAAAGAGAATCATGTTGAA CCTTTCATCTCTTACCATAACCACGGTCAGAGATAAGCAAGTACTTCCCA TAAAACACGGTCAGTATTACATGCATGAGAGatcaacaatgatagaaatC AATTTGATTTTCCTCTTAACtaatatatttaaatattttgactaaaagtt cataatttttctttaacttcTGATAAAACAGAATCATGTTGAACCTTTCA TCTCTTACCATAACCACGGTCAGAGATAAGCAAGTACTTCCCATAAAACA CGGTCAGTATTATATGCATGAGAGATCAACAANNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNtgatttttcatgg aaattcactgcactgtaagggtccgattttagaagccaaattttgggccg aacgtatggtcgatttcagatcgagtgccccccccgggggcaatgcttaa gttttttttaagatttgagcatggatatgcttataagagtTATGGCTATC AATAAAAAGTCGTAAAGTGTGTATTATCAACTTCAATACTTATTTCACCC GACCAAAATTTGCCACAACTTTTTTTCTAGTTCTGTTAGTGTTTATTTCG AAATATTAATCTAGTGCACTGTAACGTACAAATTCCCAATTATAGATACG ATTTCTCAATATgaggaaaaaatccaaaaaaatttaaatccctTTTTTGG CAATGTCTATAGTTGATAAAGAATTTACTGATTACCCGAGTTaggaaaat aaaattcttaCTGTTAATATATGCTGACGgtttaaatctttaatttacAT GCGGTATTTTTTAGAGTGGCGGGACAAAGACCATAGTGCCTGTATGTGTA TGTGATGGAGGGATGAACAATGCGTATATCTCAGGTGACACAAATGTCGT TTCGACGCCCATCTAACGTTCACGAGGTCCATTGACGTATATTCAACGTT CATTTGACGTCCAcagtagtctagcaagctacacgtttttttttttataa gaacgtcaaaaattttcgaagccttcggatgttcttagttttttggattt gaagcctaaaaatgttcttaaaatgttcttaNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNacattttgatgtaatttcttaagaaaatg catgtttttaagtctccaaagccttagaatgttcttagaatgttcttaaa tttttgggcctcgaagccttatgttcttatatagtttgttcttataaaaa aaagaacgtgtagacgactaatttatacatatagtagaaataaagcaaaa agtaatgaatggaacaattttagtcgtctagaaacctttgtgcactaact ccaaacaaaaaaaaaagagtcaattaatatcgcaattaaaattttttcct gctcaaaataattcttgagaaaaaaaaatatgtgtggatttgtgtattga aagtttttcatttgagttgatttcgttttgagagtttgttNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNtccagtcgtttatacaaactaaatcccgtattattattat tattattattattattagtattggtattattagtattacacgcattataa acgactccagtctacgtCCACAGCCATTGAATGGTTTTACCTGAAAGAAG AACATTTGAATTTGTTAAAGATTGACGTTTTTACTACTGGTATTAATAGA ATTAACGTTCGACTAATACTATCTGATGGATAAATGGCTCGTTAACGAAA CTCAAATGAAACCATTGCTTGGTTGTAAAAATCATCATCTACTGTAAATG AAACAAATAATGGACGGATATTGCCTTGTTTACTTAAATAGGCAGCAACG CTCATTGCAGGACGGCACTACATAGACCAAGCACGGCATTGTAGAGTTAA ATATATCCTTCATCAGAGAAAGACAACAGTTATATTCCGTAATCCTTCTC CTGATTTAATTCATTAATCTGCAAATTTACCGTCAATCTTGTGCCGTCTC TCACATCGAAAGGAGGCAAGGCAGAAAGTCGACTGTCTAAACTAGGTCTG TCTcccgctaattcgaactcgaacgggaatGTTATTCGTTCGAGTTACAA AGAGAAAATACTTTATAGAAGGTACTAAATGGGGCTGGAAACaagatcga attatagaaagattcgcaTAAAAGAAGCTCGAATAAGCGAATGTTTGTAT ATCAACTGTCAGTCATCCCCGATTAGTGGCGCCACTTACTTTTAACATGT GAAATATTTCAttctgtttttttataagtGAACAATTCAAAGGTACCCAT TACAACTACGATAAACCAGTGTACAACGTGGATGCGAACGGCCACGGTCA TTTTATAGCACTAATGTGGCCgacaacaaaatattttggtgtGGGAATAT CTTATGATTACGATATCGAATGTACCTACACTGTAGCTCGTTTCGATGGT GTTCCAAACgaaaatgatttttacaaaaGCAGCTACAGAATCCCGAAACC TAAAGAAAGTAAGTTCCAACCCAGCTTGGCACACAacgctgtttcaacgt tcatctaacgttatatggacgttgtgaacattagatgacgttgaaacaac gttttgcaCCAGCTGGGAAACTACATTTTGCAATAAACACGAACAGAGTG CTAAAGACCCCCGGCCCTAAAAATTACNGCTACATTTTGCAATAAACACG AACAGAGTGCTAAAGACCCGGCCctaaaaattactaaaaatacAAGTAAC TTGGCTTACAAATATTGCCCTGAAACTAATTATGGACTGTGAAGGCAACC ATAAGcacctaaaaaaaaattttttgttatcCCGACATTAACATTATCAA AGTCGAGCGTAAAAAGTCAATCTTGGTTAAATCCATCAGCGAAATTATAA AGTTTGATATCCTAATAATCCTGAAAATCCTTAGCAACTCCACCTCTGAA AATTGGagttgtttataaaaaatatgtacagGCATAAATCTTCATATCCA GCGCTAAACTCGACAAATTTTCATCGGCCATCCAaataaagttttatttc atactCTAACTTAAATTAACACAATGATCTCAGACTTgtcttaaaagaaa agaaaaattggaagctTAGCGAAAATTGGAAAGCTGAATAAATGATATAC CGTTTAGTTGATCTCTATATTTTAATTCATGTCAGCCATTTCGTCAGCCT TTGGTGATCTTTCAGCTTACCAAGATCGAAAATATAatcagttttttatt ttaatctttcatctttttcatccTTAAATAAAATGACAGAGTTAAAAAAA GGCATCTGGAATTAGGACAACAATACGGTAgttttctcttattttcacAA GGTTTTCCAACTTTCCCTTTGTTAATGATATAATTAAATATCatctttaa tttattttatttttcagaggtGACTGTGACAGAGGCTTATTTGACACCGA AGAAGCAACCACCACCAGTCGTCTACTTTTTATACATCCCCAGTGAAGGC GGATGGACAGAATGGATTGACGTCTCAACTTGTAGTGTAAGTGGTAGCCA ATAAGAATTTTAACAACGCTGATTAAAGGCCAGTGTAAAGACCAGTGtcc ggtatcggaattgcaattgtttcaattgttttaaaagtttgttttggaca cgtgattttaattgttctctttaatgacacgtggtttgcgcaatgttata ttttactacttttatatccctttaacgttagatggacgttgaaataacgt tagGTGTCAGCTAGGCAACCAACTTCCTTTCTCTTTTGCAGACAACTTGT GGCAAGGGATTCAAAGTTCAACGCCGTTTTTGCATCACTCCCGAATCTTT GAATGGGCATCCACCAAATTGTGGTGCAGACAAAGAGAGAATGCAAATCA TCATGTGCCAACGACAGGTTGTCTGTCCAGGGGATAACgatgaaagaaag aaagacgGTTAGTCACAACTTTTTAACCCTTTTAACGATTGCTATTTTCT TGCTAGGTTCTTGGAATTCCTTTTAATTTTAGTTCAGTTTAGCTTTCAAA CTCGGAGCCTCAAAGATTCTGGTAGAAAGCAATATCAGTACTTTATCCAT GGTAGATAATACGTtgtcaaaaagtgagcaaaatataACGTCAAAGTTTC AGAATACCACTGAAAATTGCTGGGAAAATAGGTAACCCTTTCCCCCAGCA GACGACCTCCCAACGACTTTTCACCGTTCTTTTAACAACGGCACTAGGGG AAAGAGTGGGAGGGGGAGTTCAAATCATACTCTTGTATCACCATTTAAGT TCAGGATTGTACCACAATACAATTATAATCACAGTTATAAATACCTCTAA GTTAATCTAAGTTAAAACTACTTATATGTTGATTTGTCTTCTGTACGTAG CACATTCACTGTACCCGGAAAAAACGGGGCATAATTTTATATGTGCTTAA GAATTCCATAtacaaattgtttttttctagGAATTTGCGAGGACAAGACT CCTAATTTTTGCAAGAGAAAAGTCACACCAGGCAATGGTCGNGATTAGGA CAACAATACGGTAGTTTCTCTCTTATTTTCACAAGGTTTTCCAACTTTCC CTTTGTTAATGATATAATTAAATATCatctttaatttattttatttttca gaggtGACTGTGACAGAGGCTTATTTGACACCGAAGAAGCAACCACCACC AGTCGTCTACTTTTTATACATCCCCAGTGAAGGCGGATGGACAGAATGGA TTGACGTCTCAACTTGTAGTGTAAGTGGTAGCCAATAAGAATTTTAACAA CGCTGATTAAAGGCCAGTGTAAAGACCAGTGtccggtatcggaattgcaa ttgtttcaattgttttaaaagtttgttttggacacgtgattttaattgtt ctctttaatgacacgtggtttgcgcaatgttatattttactacttttata tccctttaacgttagatggacgttgaaataacgttagGTGTCAGCTAGGC AACCAACTTCCTTTCTCTTTTGCAGACAACTTGTGGCAAGGGATTCAAAG TTCAACGCCGTTTTTGCATCACTCCCGAATCTTTGAATGGGCATCCACCA AATTGTGGTGCAGACAAAGAGAGAATGCAAATCATCATGTGCGAACGACA GGTTGTCTGTCCAGGGGATAACgatgaaagaaagaaagacgGTTAGTCAC AACTTTTTAACCCTTTTAACGATTGCTATTTTCTTGCTAGGTTCTTGGAA TTCCTTTTAATTTTAGTTCAGTTTAGCTTTCAAACTCGGAGCCTCAAAGA TTCTGGTAGAAAGCAATATCAGTACTTTATCCATGGTAGATAATACGTtg tcaaaaagtgagcaaaatataACGTCAAAGTTTCAGAATACCACTGAAAA TTGCTGGGAAAATAGGTAACCCTTTCCCCCAGCAGACGACCTCCCAACGA CTTTTCACCGTTCTTTTAACAACGGCACTAGGGGAAAGAGTGGGAGGGGG AGTTCAAATCATACTCTTGTATCACCATTTAAGTTCAGGATTGTACCACA ATACAATTATAATCACAGTTATAAATACCTCTAAGTTAATCTAAGTTAAA ACTACTTATATGTTGATTTGTCTTCTGTACGTAGCACATTCACTGTACCC GGAAAAAACGGGGCATAATTTTATATGTGCTTAAGAATTCCATAtacaaa ttgtttttttctagGAATTTGCGAGGACAAGACTCCTAATTTTTGCAAGA GAAAAGTCACACCAGGCAATGGTCGTAAAGAATGCCGACAAAAAGATACG AAAGAACAAATGACACGTGATTGCAAGAAGACATGCCGTTTTTGCGAGCG Tgagtctgtctgtctgtctgtctgtctgtctgtctgtctgtctgtctgcg CTTTTGTAATATCACACCATAACACAACCAAAACTGCAACATTGTctccg tgtattccaggctttatctacgttactgattgacgccagagaatactaTC TAGCGCTATCACTAAGCATTGAAAATGCTGGTAATACACACGGAACGAGG TTGCCaaaactgtttaacaatttCTATCCGTTTATGACATGTCCCGAGGA TTGAGAATCTGTCGGTATAATATCAAATAGCAATTGTGAATCGACACAAA AAGCGTTCAAAGGGTGCAAGAATTGTCTTCAAATTTGAGAAACATCCAAA TCATGGATATGGACTATGGATATCGTGCATTCTTTCTTTGCGCATCATAT TTAACTAGATCTAGAGcgataaattttactttcaatacaGCGTTTGTCTG AAAGCCACGTCGGTCACACTTCATTTCCTATCCAATAATTTCTCTCTAGC CATCTGCcttaaactgattttttttattttcagcttGTATGAATTACCAC AGAGATTGTCCAGGTTACGCGTCCGTCAGTTATGGTTATTGCACTGATGA TAAGTACAGTGCTTGGATGGAATGGAAATGTGCTAGATCATGTGGTTATT GTAACAAAAGTGAGTTAAAAAACACCCCAGTGTCACAGCATCCGGTCGTA CTCACACCCCACTACAAATTTTGCCCTCGTagttggttgattttttttag atttcgatagaacttttttgggaaaaaggGATAAACTATTAGGCTTGACG AGCTTATGTAACTTAGCAAAACTAAATATACAATCAtgatcgaaatatat tgagaattccggttattttaacgttttcaagatttaaagtttcGGCGAAA AAGTCgtttttgggctatctctttaatctaatcaaatatttcaatttggg atgggttggcagacttacaggctatattctcagccttattggactttttt tgaatttttggatcctaagtcttaagtctagctttaaaactctacccttc gaacctactttagagcacttacaaatcgattgtgttttcaaaacttcctg gggaatttcccttttttcttaaATATTATGACCTNtttttttgaattttt ggatcctaagtcttaagtctagctttaaaactctacccttcgaacctact ttagagcacttacaaatcgattgtgttttcaaaacttcctggggaatttc ccttttttctcaaatattatgaccttgattgtaccaTCATggaaaaaaca ttcgattatgACGAGACGATTCCTGATGCAAACTGAATGTTTTCTTTCAT ATTTGGCGAGAATTATAAGTAACTTTGGGACAAACTTACCTACGAAAATA AGGAGTAATAAATTTCTGAGccttaaagcgattttaagaaaGTAAGAAAC AAGGCATAGTGACTCAAGAGAATGATTTCATCAAAGTGAGCAGATATCAT GTAATGTTAAgatttttatttgaataaatAAGCCCAGCGGTACTTAAACT TGAAGAAAAAGACGCAGTCATAAATTCAAAGGTCCCTTCTAACAGTATAA AATTTCAGTCTTTTAAAAAAGCTTTCCCGATTATAGATCAAACGAAACCG ATGGGCGACGACTGTTACGATCTTTCCGACAAATGTCCCGATTATGCCGA TCATTTTGATGACGATTATTGCAATCATCCGAAATACGCCAAGTGGATGT CGCAAGCATGCAAAGAAAGTTGCTTATATTGCAAAGGTAAAACACTTATT AAGTCTTTGAAAAAGCCACGTACTACAGACCCAGTGAGACCCCCTGCCCG TccgaaaaatatataaaaaaatcgtCCTTTAGTAAAGAATATAACCTGAA GTTTTATCACGTACCAGTCCCAAAAGAAATACTGGTCAAGTCCTTTCTTa ggggaactaattttgacgaacagcaaaaatcctaaaaagttgtaaattta tcaaggaacttattttggtgaggtagtatgttttttaaattcaaatttgc caaagttagttctcgccaaaaatAAGTTCCCTCTTGAGATAATCAAAAGT AGCATTCTATCACTGACCACCTTTAGAGAAAGATAGATTAACTTAGATAT CAAAGGACTGACAGCTGCAAGTAGGAATTCAAGTTATCTgggaaatttct agcatctaatggtatttttgtcacGATCCTATGTCCAATATATTTTTGTG GGAAAATTTACCTGGTAGATTGTTTACTTATTAGATTGTACTGNTGTCAC GATCCTCAGTCCAATATACCTTTTTGTGGGAAAATTCACCTGGTAGATTG TTTACTTATTAGATTGTACTGACAAAAGTCCTTATTGCGAGACGTTAAAA AAGAACGGCTTGTGCGTCGCAAAGAATCGACAAGTCTATTCCTGGATGGT AATGGAATGCTCCAAATCGTGTGGTTATTGTTTCGAAAAATCTGTTTTCC AAAAAGACATTACAAAGTCAGTAACTACCTTTTATATTCAAAAGTTTCCT CACATTTTAAAGGctacaactttttttataaggcaTAAGGTAAATTTTTG TGAGGACTCATTTTgcaagaaaatacattttttgagCCTCGAATAAGCTT AAATGTTATGCCTATGATGTGATAATGTACTTAACATTTTAAGCATGCTT TTTTTTGTACTTCAgataattaaaaatattttgaaatttcgtaAAATGAA GGACAGCATACATATGCTTAGGCAatgcttaatttttttttaagatttga gcctggatatgcttataagagtTATGGCTATCAATAAAAAGTGTAAAGTG TGTATTATCAACTTCAATACTTATTTCACCCGACCAAATTTTACCACAAC TTTTTTCTACTTCTTTTAACGGTTATTTCAAAACATTAATCTAGTGCACT GTAACGTACAAATTCCCAATTATAGATACGATTTCTCAATATGaagtaaa aatccaaaaaaatttaaatttcttttttggcaATGTCTATAGTTGATAAA GAATTTACTGATTGCCCGAGTTaggaaaataaaattcttaCTGTTAATAT ATGCTGatattttaaatctttaatttgCATGCGGTATTTTTTTAGAGTGA CGGGACAAAGACCATAGTGCCTGTATGTGTATGCAATGGAGGGATGAACG ATGCGTATATCTCCGGTGACACAAATGTCGTTTCGACGCCCATCTAACGT TCACGAGGTCCATTTGACGTATATTCAACGTTCAATTGAAGTCCACAGCC ATTGAATGGTTTTACCTGAAAGAAGAACATTTgaatttgttaaaaattga cgtttttacTACTGGTATTAATAGAATTAACGTTCGACCGATACCATCTG ACGGATAAATGGCTCGTTAACGAAACTCAAATGAAACCATTGCTTGGTTG TAAAAATCATCATCTACTGTAAATGAAACAAATAATGGACGGAT
Gene-mRNA-Prot
This transcript is a part of the following gene feature(s):
Feature NameUnique NameSpeciesType
XLOC_009492XLOC_009492Clytia hemisphaericagene
The following exon feature(s) are a part of this transcript:
Feature NameUnique NameSpeciesType
TCONS_00016947-exon-sc0000255-1491911889:96948..97001TCONS_00016947-exon-sc0000255-1491911889:96948..97001Clytia hemisphaericaexon
TCONS_00016947-exon-sc0000255-1510915933:96948..97001TCONS_00016947-exon-sc0000255-1510915933:96948..97001Clytia hemisphaericaexon
TCONS_00016947-exon-sc0000255-1575043694:96948..97001TCONS_00016947-exon-sc0000255-1575043694:96948..97001Clytia hemisphaericaexon
TCONS_00016947-exon-sc0000255-1491911889:98216..98350TCONS_00016947-exon-sc0000255-1491911889:98216..98350Clytia hemisphaericaexon
TCONS_00016947-exon-sc0000255-1510915933:98216..98350TCONS_00016947-exon-sc0000255-1510915933:98216..98350Clytia hemisphaericaexon
TCONS_00016947-exon-sc0000255-1575043694:98216..98350TCONS_00016947-exon-sc0000255-1575043694:98216..98350Clytia hemisphaericaexon
TCONS_00016947-exon-sc0000255-1491911889:113481..113606TCONS_00016947-exon-sc0000255-1491911889:113481..113606Clytia hemisphaericaexon
TCONS_00016947-exon-sc0000255-1510915933:113481..113606TCONS_00016947-exon-sc0000255-1510915933:113481..113606Clytia hemisphaericaexon
TCONS_00016947-exon-sc0000255-1575043694:113481..113606TCONS_00016947-exon-sc0000255-1575043694:113481..113606Clytia hemisphaericaexon
TCONS_00016947-exon-sc0000255-1491911889:114584..114733TCONS_00016947-exon-sc0000255-1491911889:114584..114733Clytia hemisphaericaexon
TCONS_00016947-exon-sc0000255-1510915933:114584..114733TCONS_00016947-exon-sc0000255-1510915933:114584..114733Clytia hemisphaericaexon
TCONS_00016947-exon-sc0000255-1575043694:114584..114733TCONS_00016947-exon-sc0000255-1575043694:114584..114733Clytia hemisphaericaexon
TCONS_00016947-exon-sc0000255-1491911889:115310..115463TCONS_00016947-exon-sc0000255-1491911889:115310..115463Clytia hemisphaericaexon
TCONS_00016947-exon-sc0000255-1510915933:115310..115463TCONS_00016947-exon-sc0000255-1510915933:115310..115463Clytia hemisphaericaexon
TCONS_00016947-exon-sc0000255-1575043694:115310..115463TCONS_00016947-exon-sc0000255-1575043694:115310..115463Clytia hemisphaericaexon
TCONS_00016947-exon-sc0000255-1491911889:116093..116441TCONS_00016947-exon-sc0000255-1491911889:116093..116441Clytia hemisphaericaexon
TCONS_00016947-exon-sc0000255-1510915933:116093..116441TCONS_00016947-exon-sc0000255-1510915933:116093..116441Clytia hemisphaericaexon
TCONS_00016947-exon-sc0000255-1575043694:116093..116441TCONS_00016947-exon-sc0000255-1575043694:116093..116441Clytia hemisphaericaexon
Position
The following features are aligned
Aligned FeatureFeature TypeAlignment Location
sc0000255supercontigsc0000255:96948..116441 +
Expression

Hover the mouse over a column in the graph to view expression values in transcripts per million (tpm).
Sort Descending | Sort Ascending | Only Non-Zero Values | Tile/Chart | Reset | Show/Hide Values

Values :
    GrOo_1	 GrOo_2	 FGOo_1	 FGOo_2	 EG_1	 EG_2	 P1_1	 P1_2	 P2_1	 P2_2	 P3_1	 P3_2	 PoPr_1	 PoPr_2	 St_1	 St_2	 GO_1	 GO_2	 PH_1	 PH_2	 BMF_1	 BMF_2	 MMF_1	 MMF_2	 M_1	 M_2	 GEC_1	 GEC_2	 GEN_1	 GEN_2
0 0 0 0 0 0 0 0.10071 0 0.143017 0.27227 0 0.303119 0.755479 0.2927 0.527104 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0
Blast
The following BLAST results are available for this feature:
BLAST of TCONS_00016947 vs. Swiss-Prot (Human)
Analysis Date: 2017-10-03 (blastx Clytia hemisphaerica v1.0 mRNA vs SwissProt (Homo sapiens))
Total hits: 0
Match NameE-valueIdentityDescription
back to top