TCONS_00016590 (transcript) - C. hemisphaerica

Overview
NameTCONS_00016590
Unique NameTCONS_00016590
Typetranscript
OrganismClytia hemisphaerica (Jellyfish)
Sequence length5793

Sequence
The following sequences are available for this feature:

transcript sequence

>TCONS_00016590 ID=TCONS_00016590|Name=TCONS_00016590|organism=Clytia hemisphaerica|type=transcript|length=5793bp
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Run BLAST on NCBI

protein sequence of TCONS_00016590-protein

>TCONS_00016590-protein ID=TCONS_00016590-protein|Name=TCONS_00016590-protein|organism=Clytia hemisphaerica|type=polypeptide|length=1678bp
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YWLTGKDNSEYRIPSEDLAISASKHNFK
Run BLAST on NCBI

transcript from alignment at sc0000243:50953..81391-

Legend: exonfive_prime_UTRCDSthree_prime_UTR
Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.
>TCONS_00016590 ID=TCONS_00016590|Name=TCONS_00016590|organism=Clytia hemisphaerica|type=transcript|length=30439bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000243:50953..81391- (Clytia hemisphaerica)
CCGAACAGTAAAAAAGATTTCAAATCAAAACAAAAACAAAACTGTGATGA AGAAACTTCTGTTTTGAAAATTGGATAGGATTTTTTTTGAAACTGGATAG CAATGTACTTTGCTTGTAAATTAGCATCGCTGTTCATATTAGGTAAGGCT GCTTTTTCTTAAGTTTGCAAATAAAAAAGATTCTAAAGTTTTGATTTTTT ATTTGAGATGCTTTAAATTTTTGTTTCGGGCTGTTCGGGGCAGTCTTTTG GGATTTTCTTCAATTTTTAAAGGAGGAATAATCGAATAATTTGAAATCTT TAGCATTCAAAATCAATAAATTTGCCGCAGAGTTTACCAACTTAGTTAAA AGATTCTCCTTTATGAAGCAACTAAAATTTAACGAGGAAAAGAAGAGTAA AGTTTAGAAAGCTGTGCTATTTATTATGAGCTCTTTTCATTTTGACAAAA GAATAGTAGATTAAAAGATTTTATTTTCTTGGGCTCAGGATTAAGCAATA CGTCAGCATTTGATTACAGCAATCGAAGGGTGATATGGAATCCACGTTTT ACCAATCCACTGACAGATCCAGATTTCAATGATTTTGATAAAAGTGGTTG GAATGTGGTTGCCGGCGGTAGTGGAGAGTATATTCACCACAAGGTATTGA AAATGCTTGGTTTAAAGAACTACAGTGCTGAATTGACACAATCTAAAACA CTTACTTATTGACCTACTGCATTAGTACTATAATACAGTGTGTGTCCGTT TAAAACACGAAACAGAAAATCCTCTAATTACACTTTTTNTTTAACTAAGA TTTCTCGCAAAATTAAGTTTTTCAAAATAAACGGACCAGCCTCTTTCTGT TCTTATAAAGTTATGAATTGATGTTTTTTGCTTCCAATGATGGTACATCA AAGAAAAGCCACTTTGAATAGATTTATAAAAGATTTCAACGACCATTTAG 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GATATTATTGTAGAGAAAGAGAAAGGAGACTTACTTCTAGGCAAGATGTT
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GAAATGTGCACACGTCAGCATCCATACCACGAGGTGGATCATTTAGGACC
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CGTCTCGCATCCCGATCATGTTGGTTATGGATCAAGAGCTGGCGATATGT
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TTCATTGGAGCTTGCATCAATACTGACCACGTGGCCATCTTGAATGAACT
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ATACTGGTGCAAATTGTGAAGTTCCATCTTGTCCAGGATGCATCTTTGGT
GACTGTGTAGCAATCAAAAGTTGCAAATCGACGATGAATTTGAAACATCA
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CATTCTTTTGCACCGGTGGTTGTGGCGGTATGGTTTCACCTGATAATCAT
CACATGTGGGAGAATGGAAAATGCATTCAACAAGACACGTGCTCCTGTGC
TTATGCAAATTGATTATTCGGAAAATATGACGATCGTTGGAAAAGAATCT
TTGATTGCTAAGCGTTATTTGTACCTTGGTGACGACGTTGCACCTTACAA
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TGTTTTATATACCGTCACCTGATTCTGCTTTGATCAGTGTTACGTCGACC
ACCCCGTGCCTTTGACGGGAGATTCTGTTATTTTCGATAAGAATTACGAT
CGCTCCAACTACTCCGGATGAAGAAGGTCTGTTACAGATAGGGTTGCTCT
ATGATGCAACTTATGCCACCATCACCTCCCTTGCTGGAATTATTGACGAT
TCGATGACTTGGAGTACTCGAAATTTTATTGATCGTTTTATGCAGAATTT
AACTTGTATGGAGACTTTTAGAGGTACCATCATGTTTAAACCCAACTATG
CGACTTATGGCTTTGACAATGGTTATTGGAGTGCATACAAAGGCCTCCTT
CAAATGGCACAAGAAGTCATATATTCCAGTAATCCTTCGCAAAAGCCACC
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ACCTTGGGAATGAATGATCATTTCCCTTATAACAACGAAGGAATGTGTAA
TGGTGTTCAAGGACCTACAGTTGCTTTCCCTCCAGTAGCTGATAATACTA
CAGTAATAAGTGATGAAGCTATAGACAATTTTTTCACCCAATTAAAAGAA
ATTAATATCAAGACAATCGTCAACTCTGCTACTGGAGCTGCTTTGAACTA
CATCGTTGCTGAAGCCACAAGGTGTTAGTGGAAACTGTTGATCAAGGCAT
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TGACCCGTTTCCCGAATTTCGTTCGGATGAGATACAGCGATGGATATCAA
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AAGACAAGGCGTTGTTTCAACTCAAAATGCATATTAATACGATGGACCAG
CTCTATGCCAATCTAAAAGCTGAAGAAGACCAAATCGCTACTTTTCCGAT
GTTTATCCAATCATTAATTATAATGGCCAACAAATCGAAGGAGACACCCT
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CGGTGGCTTATGGTTGGCGCAAACTGACGCCGTCTTAAAAGATGCCGATG
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TCGGAAAGCACGTATACAGTACTGAAAAACCTTGGTGGTTATCAATCCAT
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GGTTGACTGGTAAAGATAACTCGGAATATAGAATACCATCAGAAGACCTC
GCCATATCTGCCTCCAAACATAACTTCAAGTAAACGTCGTGGCCTCGGGA
TTACCAACACGTAACGGTGACGACCACGCCGGAGAAATCGCGTCAATGGC
ACTGGCCCTTATGACGACCATTGACGGCGTCGGATACAAAAACATGCCCG
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GGTGTTGTCGGCTTGAAAATGCCGCGTTATTGTTTGTTTGGTGATACAAT
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GCGATATGTACAGATTATGGAATGAAATCTTTCAAATCTGGTCAAGAAGG
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CAAAGACATTGTTGTCAAATTAATCCGGAAAGAAAATATTGAGCTGGACA
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TGATCAGTGTTACGTCGACCACCCCGTGCCTTTGACGGGAGATTCTGTTA
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GATCGTTTTATGCAGAATTTAACTTGTATGGAGACTTTTAGAGGTACCAT
CATGTTTAAACCCAACTATGCGACTTATGGCTTTGACAATGGTTATTGGA
GTGCATACAAAGGCCTCCTTCAAATGGCACAAGAAGTCATATATTCCAGT
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AACAACGAAGGAATGTGTAATGGTGTTCAAGGACCTACAGTTGCTTTCCC
TCCAGTAGCTGATAATACTACAGTAATAAGTGATGAAGCTATAGACAATT
TTTTCACCCAATTAAAAGAAATTAATATCAAGACAATCGTCAACTCTGCT
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GAAACTGTTGATCAAGGCATACCAATGGACTTTGTAACATGTGCCCGTAT
CTTTCAGATCAAATACAGCATGACCCGTTTCCCGAATTTCGTTCGGATGA
GATACAGCGATGGATATCAATATTCCATGATTTGCAACTTTTTGAAATCA
CGGAAATGGGATAATGTGCAAACAGATTTCAAAGTGACAAACTACCTCCT
GATGTTGGGTCCTTCCAATGACGCGCTACTTGATGGGTTTGTGGAACTAT
CACTTGGTGAAGACTATCCTTTAGTCAATTATCGATCCACTGATTCCAAA
TATTCTGATAAGACAAGGCGTTGTTTCAACTCAAAATGCATATTAATACG
ATGGACCAGCTCTATGCCAATCTAAAAGCTGAAGAAGACCAAATCGCTAC
TTTTCCGATGTTTATCCAATCATTAATTATAATGGCCAACAAATCGAAGG
AGACACCCTGGAAGCTATCAAATATTATCTCCAATATGATAACACCGGCC
CCCTTAACGAAAGTACATCCAAAAGCTAACAGCCATCTGGTCAAATTCAG
TAGTGATGCTGTGATCACTTTGAATCGTGGTTACGCTGAATGGCAAGGAT
CAGTGACCTCACCAGCCAGCAATCCGATACAGATTCATTTCGAAGCATTG
ACCAACGCTAGTCTGGCCATTCAAACTGTAAACGCACCACAGTTTGTTGT
GACAACACAAGCCGGGAAATCATTGCATATAATTTTACCTTCACAATGGA
AAGCCACACAATTCGTCAACCGTAAATTCAAAGGACCACTAGAAGTAGAA
ATTTTGGATGCAAATGGAAGACGTGTAACTTCAGGACCAGATTCAATGTT
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ATTGCACTTCCAAATGGCCACTAGCAAATTACCGACGTTTCCCGGATAAA
GAAATTCATCCTTACAAAGCCGGTGGAATTTTAGTTGATTATGATGTTTT
CAATACATATGGTGGTTATTTGACACATCCTTCCTCAAATGAGACACACA
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ATTGTCCCTATCAATGTCACAGGCAACGAATACAAACCTGACCGCATCAT
GTTAGCCTCTCCAGCACCCTCCTCCGTCGAAGCAAACGAACCTTTCACTC
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AATTCTGGTCTGGAAATTATGTGCCAGGTGGCTTACACTCATAAATGGTT
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CGGATACAAAAACATGCCCGGTTCTCAAGTACAGCTTCGTATGGGACTGA
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CCGTGACTACGAGAAAATGGCTGTCGATTGTTTGCGTCCGACCGTCGAAG
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TTGTTTGTCGGAACTCGGTAAGATTTGTCCACATCGCGGTGAATTGATGG
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GAAAGAATCCGCAGCCAGAATACTTTGCCAGCGTCACCATCTATTTCAGT
TTTGCTATCATCATGGTTGAAATGTGCACACGTCAGCATCCATACCACGA
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TTGACCCCGGAAAAACATTGAAACTTATTTTCATTATTGTGGACAGCACC
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CAAGAGCTGGCGATATGTACAGATTATGGAATGAAATCTTTCAAATCTGG
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TACCGAAGCTGGACGAGATGGACGAGTGTGATTATTAGACATTTGTCGAG
GAATGATGTATTTGCAAAACACAGCTATTGGATCACATGGACGTTTGAAG
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TTGGAATGGCAAAGACATTGTTGTCAAATTAATCCGGAAAGAAAATATTG
AGCTGGACAGTCGATTGAGATGGGAAGTGAAAGAAATGAGAGACATCAAA
CATCCAAATCTCTGTCTCTTCATTGGAGCTTGCATCAATACTGACCACGT
GGCCATCTTGAATGAACTTTGTGGTAAAGGCAGTTTGGAAGATATTTTGT
CTAATGATGATATCGATCTTGGATGGGATTTTAGATACTCAATGTTAAAG
GTTTGGTTGCCATGCGACGAACGGAGAATGTACCGGCGGTGATTTCTGTA
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GTAACTGGAAAATGTTCGGATGGAAACAGCGGTTCCGGTCTATGCACCTG
TGAATCAAGTCATACCGGAAGTCGATGTCAAACACACATTGCGGTTATCG
CAGTACCAACCACTTTTGTTGCTATGGCTATCCTTGCTGTTTTATTCTAT
ATTGGTCGCCTCTATTACAAGAAGATTGAATTGAACGCGCAGTTGATGAG
TACTGATTGGATGGTTGAATGGGATACTATAATGATGCGAACTGCTAAAG
ATAAAAGCAGCGCCAAGACTTTGTCCATGATCAGTGTGGTTAGTATGATG
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GACCAATGACTGTGCCACTCCAACATGCTTGAACTGTAAAATTGATCCTT
TCACTAATCAACAAGTATATACTGGTGCAAATTGTGAAGTTCCATCTTGT
CCAGGATGCATCTTTGGTGACTGTGTAGCAATCAAAAGTTGCAAATCGAC
GATGAATTTGAAACATCAAACATCAGAAGCCATGCAGGATGTAAATATGA
CCATTCGCGTCCCGCCCGCATTCTTTTGCACCGGTGGTTGTGGCGGTATG
GTTTCACCTGATAATCATCACATGTGGGAGAATGGAAAATGCATTCAACA
AGACACGTGCTCCTGTGCTTATGCAAATTGATTATTCGGAAAATATGACG
ATCGTTGGAAAAGAATCTTTGATTGCTAAGCGTTATTTGTACCTTGGTGA
CGACGTTGCACCTTACAATATCAGTAAAGACAATGTTTTGAAAGAGGTTC
AAATCACTGGTCAAGATATGTTTTATATACCGTCACCTGATTCTGCTTTG
ATCAGTGTTACGTCGACCACCCCGTGCCTTTGACGGGAGATTCTGTTATT
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TACAGATAGGGTTGCTCTATGATGCAACTTATGCCACCATCACCTCCCTT
GCTGGAATTATTGACGATTCGATGACTTGGAGTACTCGAAATTTTATTGA
TCGTTTTATGCAGAATTTAACTTGTATGGAGACTTTTAGAGGTACCATCA
TGTTTAAACCCAACTATGCGACTTATGGCTTTGACAATGGTTATTGGAGT
GCATACAAAGGCCTCCTTCAAATGGCACAAGAAGTCATATATTCCAGTAA
TCCTTCGCAAAAGCCACCCTTACCAACTACGTAATTTATCACACGCCAAT
GGTTATCAATGGATTGGTACCTTGGGAATGAATGATCATTTCCCTTATAA
CAACGAAGGAATGTGTAATGGTGTTCAAGGACCTACAGTTGCTTTCCCTC
CAGTAGCTGATAATACTACAGTAATAAGTGATGAAGCTATAGACAATTTT
TTCACCCAATTAAAAGAAATTAATATCAAGACAATCGTCAACTCTGCTAC
TGGAGCTGCTTTGAACTACATCGTTGCTGAAGCCACAAGGTGTTAGTGGA
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TGTTGGGTCCTTCCAATGACGCGCTACTTGATGGGTTTGTGGAACTATCA
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TAGACAATTTTTTCACCCAATTAAAAGAAATTAATATCAAGACAATCGTC
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GTGTTAGTGGAAACTGTTGATCAAGGCATACCAATGGACTTTGTAACATG
TGCCCGTATCTTTCAGATCAAATACAGCATGACCCGTTTCCCGAATTTCG
TTCGGATGAGATACAGCGATGGATATCAATATTCCATGATTTGCAACTTT
TTGAAATCACGGAAATGGGATAATGTGCAAACAGATTTCAAAGTGACAAA
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GAAGCATTGACCAACGCTAGTCTGGCCATTCAAACTGTAAACGCACCACA
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GAAGTAGAAATTTTGGATGCAAATGGAAGACGTGTAACTTCAGGACCAGA
TTCAATGTTGGCCAATATCACAATGCAAATAGAAGATGTTTTCGAAAATT
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TGATGTTTTCAATACATATGGTGGTTATTTGACACATCCTTCCTCAAATG
AGACACACATCAAATATCAACATTTTGAAAATCAACCCAATTTTTTCCGA
GGTGTATTGATTGTCCCTATCAATGTCACAGGCAACGAATACAAACCTGA
CCGCATCATGTTAGCCTCTCCAGCACCCTCCTCCGTCGAAGCAAACGAAC
CTTTCACTCTTCAATTGAAAATGGTCAACGCTACAGGTCATACCATTACA
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TAAATGGTTCGAACGTGTCGGTGGCTTATGGTTGGCGCAAACTGACGCCG
TCTTAAAAGATGCCGATGTAGTGACGTCAGTTATCAATGATAAAGTCATT
TTTGCGAGATTCCAAAATGGGCTGACTGCAACCAGATTTACCACTGATGC
CAAATTGTGAACAATCATTTTTCTTTTCGACCGTTTGGACAGCAACGAAT
TTCGGTCACTCGTACATCAGTGGTGTTTTCTTTTCTCAACCCTTCAACAA
CGATCCGGCAAACGAACGACCTATTCTCATCTCACCAAGACATTTTGGTG
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TGGTGGTTATCAATCCATTTGCCGTGGTGAACGTGAAGTCAAAGGTAAAG
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GTTTGTCGGAACTCGGTAAGATTTGTCCACATCGCGGTGAATTGATGGAT
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CGCAGAACGTACTGCTGATATTATTGTAGAGAAAGAGAAAGGAGACTTAC
TTCTAGGCAAGATGTTGCCACCATTGATAGCTGAAGAATTGAAATTGGGA
AAGAATCCGCAGCCAGAATACTTTGCCAGCGTCACCATCTATTTCAGTTT
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TTCCTCAAATGAGACACACATCAAATATCAACATTTTGAAAATCAACCCA
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AGCAAACGAACCTTTCACTCTTCAATTGAAAATGGTCAACGCTACAGGTC
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GCTTACACTCATAAATGGTTCGAACGTGTCGGTGGCTTATGGTTGGCGCA
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ACCACTGATGCCAAATTGTGAACAATCATTTTTCTTTTCGACCGTTTGGA
CAGCAACGAATTTCGGTCACTCGTACATCAGTGGTGTTTTCTTTTCTCAA
CCCTTCAACAACGATCCGGCAAACGAACGACCTATTCTCATCTCACCAAG
ACATTTTGGTGATTGGAGAGCGCCATTATTAGATCACATGACATTTAGAA
TCCCACCTGTAAAAGCTTTAGATGTGTGTTCAGAATCAAGGCCTTTTAAC
TGGCATTTCCATCTTTGAAAATCCACATGTCGGAAAGCACGTATACAGTA
CTGAAAAACCTTGGTGGTTATCAATCCATTTGCCGTGGTGAACGTGAAGT
CAAAGGTAAAGGACGAATGACCACCTATTGGTTGACTGGTAAAGATAACT
CGGAATATAGAATACCATCAGAAGACCTCGCCATATCTGCCTCCAAACAT
AACTTCAAGTAAACGTCGTGGCCTCGGGATTACCAACACGTAACGGTGAC
GACCACGCCGGAGAAATCGCGTCAATGGCACTGGCCCTTATGACGACCAT
TGACGGCGTCGGATACAAAAACATGCCCGGTTCTCAAGTACAGCTTCGTA
TGGGACTGAATACTGGACCCATTGTGGCCGGTGTTGTCGGCTTGAAAATG
CCGCGTTATTGTTTGTTTGGTGATACAATGAATACAGCTTCTCGTATGGA
AAGTGGTGGTTATGTGATTGTGTTGGTTTTGGTCAAATTTGCTCAAACGC
TTCACCTTATCAAGTGGTCGAATTATTGAACGATTTATATTCGATTATGG
ATGATATTATCGAATCTTTCGATTGTTACAAAGTGGAAACTATCGGAGAT
TGCTCAATGCCGTGACTACGAGAAAATGGCTGTCGATTGTTTGCGTCCGA
CCGTCGAAGAAGACGAACTGCCCAATGAAGAAAAACAAGCCTCAATGCTG
ATGCAACTTATCGAACTATGCTGGAACGAAGATCCAAAATGCAGACCAGA
ATTTAAATATTGTTTGTCGGAACTCGGTAAGATTTGTCCACATCGCGGTG
AATTGATGGATAACTTGATCGAATTGATGGAGCAATACACAACTAGCTTA
GAATCTATCGTCGCAGAACGTACTGCTGATATTATTGTAGAGAAAGAGAA
AGGAGACTTACTTCTAGGCAAGATGTTGCCACCATTGATAGCTGAAGAAT
TGAAATTGGGAAAGAATCCGCAGCCAGAATACTTTGCCAGCGTCACCATC
TATTTCAGTTTTGCTATCATCATGGTTGAAATGTGCACACGTCAGCATCC
ATACCACGAGGTGGATCATTTAGGACCAGCTGAAATTGTTCAAATTGTTG
GTAGACTCATTGACCCCGGAAAAACATTGAAACTTATTTTCATTATTGTG
GACAGCACCAGAAATTGCAGCAAGTGGCGTCTCGCATCCCGATCATGTTG
GTTATGGATCAAGAGCTGGCGATATGTACAGATTATGGAATGAAATCTTT
CAAATCTGGTCAAGAAGGTGTTCGTGTTTTTGCACCAGAAAACGGGATCG
GTGTCAGTTTACCGAAGCTGGACGAGATGGACGAGTGTGATTATTAGACA
TTTGTCGAGGAATGATGTATTTGCAAAACACAGCTATTGGATCACATGGA
CGTTTGAAGAGCTCCAATTGTTTGGTCGATAGCAGGTGGACTATCAAACT
TTCTGGTCGTTGGAATGGCAAAGACATTGTTGTCAAATTAATCCGGAAAG
AAAATATTGAGCTGGACAGTCGATTGAGATGGGAAGTGAAAGAAATGAGA
GACATCAAACATCCAAATCTCTGTCTCTTCATTGGAGCTTGCATCAATAC
TGACCACGTGGCCATCTTGAATGAACTTTGTGGTAAAGGCAGTTTGGAAG
ATATTTTGTCTAATGATGATATCGATCTTGGATGGGATTTTAGATACTCA
ATGTTAAAGGTTTGGTTGCCATGCGACGAACGGAGAATGTACCGGCGGTG
ATTTCTGTAAATGCAAGCCAAATTATTATGGGAAAGATTGCTCCCAAAAG
TGTGATTGCGTAACTGGAAAATGTTCGGATGGAAACAGCGGTTCCGGTCT
ATGCACCTGTGAATCAAGTCATACCGGAAGTCGATGTCAAACACACATTG
CGGTTATCGCAGTACCAACCACTTTTGTTGCTATGGCTATCCTTGCTGTT
TTATTCTATATTGGTCGCCTCTATTACAAGAAGATTGAATTGAACGCGCA
GTTGATGAGTACTGATTGGATGGTTGAATGGGATACTATAATGATGCGAA
CTGCTAAAGATAAAAGCAGCGCCAAGACTTTGTCCATGATCAGTGTGGTT
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CCATAACCAAGACCAGGAAATTGTACTTGCCATGAAGCGTACATCAATAC
AGATAATACGACCAATGACTGTGCCACTCCAACATGCTTGAACTGTAAAA
TTGATCCTTTCACTAATCAACAAGTATATACTGGTGCAAATTGTGAAGTT
CCATCTTGTCCAGGATGCATCTTTGGTGACTGTGTAGCAATCAAAAGTTG
CAAATCGACGATGAATTTGAAACATCAAACATCAGAAGCCATGCAGGATG
TAAATATGACCATTCGCGTCCCGCCCGCATTCTTTTGCACCGGTGGTTGT
GGCGGTATGGTTTCACCTGATAATCATCACATGTGGGAGAATGGAAAATG
CATTCAACAAGACACGTGCTCCTGTGCTTATGCAAATTGATTATTCGGAA
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CCTTGGTGACGACGTTGCACCTTACAATATCAGTAAAGACAATGTTTTGA
AAGAGGTTCAAATCACTGGTCAAGATATGTTTTATATACCGTCACCTGAT
TCTGCTTTGATCAGTGTTACGTCGACCACCCCGTGCCTTTGACGGGAGAT
TCTGTTATTTTCGATAAGAATTACGATCGCTCCAACTACTCCGGATGAAG
AAGGTCTGTTACAGATAGGGTTGCTCTATGATGCAACTTATGCCACCATC
ACCTCCCTTGCTGGAATTATTGACGATTCGATGACTTGGAGTACTCGAAA
TTTTATTGATCGTTTTATGCAGAATTTAACTTGTATGGAGACTTTTAGAG
GTACCATCATGTTTAAACCCAACTATGCGACTTATGGCTTTGACAATGGT
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CCCTTATAACAACGAAGGAATGTGTAATGGTGTTCAAGGACCTACAGTTG
CTTTCCCTCCAGTAGCTGATAATACTACAGTAATAAGTGATGAAGCTATA
GACAATTTTTTCACCCAATTAAAAGAAATTAATATCAAGACAATCGTCAA
CTCTGCTACTGGAGCTGCTTTGAACTACATCGTTGCTGAAGCCACAAGGT
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ATTGGTTGACTGGTAAAGATAACTCGGAATATAGAATACCATCAGAAGAC
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AATGAATACAGCTTCTCGTATGGAAAGTGGTGGTTATGTGATTGTGTTGG
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GAATACTTTGCCAGCGTCACCATCTATTTCAGTTTTGCTATCATCATGGT
TGAAATGTGCACACGTCAGCATCCATACCACGAGGTGGATCATTTAGGAC
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AACACAGCTATTGGATCACATGGACGTTTGAAGAGCTCCAATTGTTTGGT
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GGATGGAAACAGCGGTTCCGGTCTATGCACCTGTGAATCAAGTCATACCG
GAAGTCGATGTCAAACACACATTGCGGTTATCGCAGTACCAACCACTTTT
GTTGCTATGGCTATCCTTGCTGTTTTATTCTATATTGGTCGCCTCTATTA
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TGACTGTGTAGCAATCAAAAGTTGCAAATCGACGATGAATTTGAAACATC
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CTTATGCAAATTGATTATTCGGAAAATATGACGATCGTTGGAAAAGAATC
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CCTTACCAACTACGTAATTTATCACACGCCAATGGTTATCAATGGATTGG
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ATGGTGTTCAAGGACCTACAGTTGCTTTCCCTCCAGTAGCTGATAATACT
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GTTGTTTCAACTCAAAATGCATATTAATACGATGGACCAGCTCTATGCCA
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CAAAAGCTAACAGCCATCTGGTCAAATTCAGTAGTGATGCTGTGATCACT
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CGCTACAGGTCATACCATTACAAGTAGCTTCAATTCTGGTCTGGAAATTA
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TGGTTGGCGCAAACTGACGCCGTCTTAAAAGATGCCGATGTAGTGACGTC
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CAACCAGATTTACCACTGATGCCAAATTGTGAACAATCATTTTTCTTTTC
GACCGTTTGGACAGCAACGAATTTCGGTCACTCGTACATCAGTGGTGTTT
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GACATTTAGAATCCCACCTGTAAAAGCTTTAGATGTGTGTTCAGAATCAA
GGCCTTTTAACTGGCATTTCCATCTTTGAAAATCCACATGTCGGAAAGCA
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ACATCGCGGTGAATTGATGGATAACTTGATCGAATTGATGGAGCAATACA
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TACCGGCGGTGATTTCTGTAAATGCAAGCCAAATTATTATGGGAAAGATT
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CGTCACCTGATTCTGCTTTGATCAGTGTTACGTCGACCACCCCGTGCCTT
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AATGATCATTTCCCTTATAACAACGAAGGAATGTGTAATGGTGTTCAAGG
ACCTACAGTTGCTTTCCCTCCAGTAGCTGATAATACTACAGTAATAAGTG
ATGAAGCTATAGACAATTTTTTCACCCAATTAAAAGAAATTAATATCAAG
ACAATCGTCAACTCTGCTACTGGAGCTGCTTTGAACTACATCGTTGCTGA
AGCCACAAGGTGTTAGTGGAAACTGTTGATCAAGGCATACCAATGGACTT
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CGAATTTCGTTCGGATGAGATACAGCGATGGATATCAATATTCCATGATT
TGCAACTTTTTGAAATCACGGAAATGGGATAATGTGCAAACAGATTTCAA
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AGAAGACCAAATCGCTACTTTTCCGATGTTTATCCAATCATTAATTATAA
TGGCCAACAAATCGAAGGAGACACCCTGGAAGCTATCAAATATTATCTCC
AATATGATAACACCGGCCCCCTTAACGAAAGTACATCCAAAAGCTAACAG
CCATCTGGTCAAATTCAGTAGTGATGCTGTGATCACTTTGAATCGTGGTT
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CGCACCACAGTTTGTTGTGACAACACAAGCCGGGAAATCATTGCATATAA
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AGTTGATTATGATGTTTTCAATACATATGGTGGTTATTTGACACATCCTT
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This transcript is a part of the following gene feature(s):
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The following polypeptide feature(s) derives from this transcript:
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The following exon feature(s) are a part of this transcript:
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Position
The following features are aligned
Aligned FeatureFeature TypeAlignment Location
sc0000243supercontigsc0000243:50953..81391 -
Expression

Hover the mouse over a column in the graph to view expression values in transcripts per million (tpm).
Sort Descending | Sort Ascending | Only Non-Zero Values | Tile/Chart | Reset | Show/Hide Values

Values :
    GrOo_1	 GrOo_2	 FGOo_1	 FGOo_2	 EG_1	 EG_2	 P1_1	 P1_2	 P2_1	 P2_2	 P3_1	 P3_2	 PoPr_1	 PoPr_2	 St_1	 St_2	 GO_1	 GO_2	 PH_1	 PH_2	 BMF_1	 BMF_2	 MMF_1	 MMF_2	 M_1	 M_2	 GEC_1	 GEC_2	 GEN_1	 GEN_2
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Annotated Terms
The following terms have been associated with this transcript:
Vocabulary: INTERPRO
TermDefinition
IPR001054A/G_cyclase
IPR000719Prot_kinase_dom
IPR001245Ser-Thr/Tyr_kinase_cat_dom
IPR001828ANF_lig-bd_rcpt
IPR013032EGF-like_CS
IPR000742EGF-like_dom
IPR011009Kinase-like_dom
IPR028082Peripla_BP_I
IPR029787Nucleotide_cyclase
Vocabulary: Biological Process
TermDefinition
GO:0009190cyclic nucleotide biosynthetic process
GO:0035556intracellular signal transduction
GO:0006468protein phosphorylation
Vocabulary: Molecular Function
TermDefinition
GO:0016849phosphorus-oxygen lyase activity
GO:0004672protein kinase activity
GO:0005524ATP binding
GO Annotation
GO Assignments
This transcript is annotated with the following GO terms.
Category Term Accession Term Name
biological_process GO:0009190 cyclic nucleotide biosynthetic process
biological_process GO:0035556 intracellular signal transduction
biological_process GO:0006468 protein phosphorylation
molecular_function GO:0005524 ATP binding
molecular_function GO:0016849 phosphorus-oxygen lyase activity
molecular_function GO:0004672 protein kinase activity
Blast
BLAST of TCONS_00016590 vs. Swiss-Prot (Human)
Match: ANPRA (Atrial natriuretic peptide receptor 1 OS=Homo sapiens GN=NPR1 PE=1 SV=1)

HSP 1 Score: 473.781 bits (1218), Expect = 2.414e-142
Identity = 283/692 (40.90%), Postives = 398/692 (57.51%), Query Frame = 1
Query: 3565 NYYGKDCSQKCDCVTGKCSD---GNSGSGLCTCESSHTGSRC-QTHIA---VIAVPTTFVAMAILAVLFYIGRLYYKKIELNAQLMSTDWMVEWDTI----MMRTAKDKSSAKTLXXXXXXXXXXXXXXXEKVETTVFHNQGRWNGKDIVVKLIRKENIELDSRLRWEVKEMRDIKHPNLCLFIGACINTDHVAILNELCGKGSLEDILSNDDIDLGWDFRYSMLKDICRGMMYLQNTAIGSHGRLKSSNCLVDSRWTIKLSDYGMKSFKSGQEGVRVFAPENGIGVSLPKLDEMDECDYYSLLWTAPEIAASGVSHPDHVGYGSRAGDMYSFAIIMVEMCTRQHPYH-EVDHLGPAEIVQIVGRLIDPGKTLKLIQCRDYEKMAVDCLRPTVEEDELPNEEKQASMLMQLIELCWNEDPKCRPEFKYCLSELGKIC-PHRGELMDNLIELMEQYTTSLESIVAERTADIIVEKEKGDLLLGKMLPPLIAEELKLGKNPQPEYFASVTIYFSDCVGFGQICSNASPYQVVELLNDLYSIMDDIIESFDCYKVETIGDCYVVASGLPTRNGDDHAGEIASMALALMTTIDGVGYKNMPGSQVQLRMGLNTGPIVAGVVGLKMPRYCLFGDTMNTASRMESGGYALKIHMSESTYTVLKNLGGYQSICRGEREVKGKGRMTTYWLTGKDNSEYR 5601
            NY G   SQ+   V+G+  +   G     +  C   +    C Q H++   V+A+  +   + IL V F+I    Y+K++L  +L S  W V W+ +    + R  +   S  TLS         + +   + +  VF     + G  + VK + ++ IEL  ++ +E+K MRD+++ +L  F+GAC +  ++ IL E C +GSL+DIL N+ I L W FRYS+  DI +GM++L N AI SHG LKSSNC+VD R+ +K++DYG++SF       R   PE G  V            Y   LWTAPE+     S P     GS+AGD+YSF II+ E+  R   +H E   L P EI++ V R   P                    RP++    L +  ++  +LMQ    CW EDP+ RP F+     L K    +   ++DNL+  MEQY  +LE +V ERT   + EK K + LL ++LP  +AE+LK G+  Q E F SVTIYFSD VGF  + + ++P QVV LLNDLY+  D +I++FD YKVETIGD Y+V SGLP RNG  HA E+A MALAL+  +     ++ P  Q++LR+G++TGP+ AGVVGLKMPRYCLFGDT+NTASRMES G ALKIH+S  T  VL+  GG++   RG+ E+KGKG++ TYWL G+  S  R
Sbjct:  425 NYNG--TSQELVAVSGRKLNWPLGYPPPDIPKCGFDNEDPACNQDHLSTLEVLALVGSLSLLGILIVSFFI----YRKMQLEKELASELWRVRWEDVEPSSLERHLRSAGSRLTLSGRGSNYGSLLTT---EGQFQVFAKTAYYKGNLVAVKRVNRKRIELTRKVLFELKHMRDVQNEHLTRFVGACTDPPNICILTEYCPRGSLQDILENESITLDWMFRYSLTNDIVKGMLFLHNGAICSHGNLKSSNCVVDGRFVLKITDYGLESF-------RDLDPEQGHTV------------YAKKLWTAPELLRMA-SPPVR---GSQAGDVYSFGIILQEIALRSGVFHVEGLDLSPKEIIERVTRGEQP------------------PFRPSLA---LQSHLEELGLLMQR---CWAEDPQERPPFQQIRLTLRKFNRENSSNILDNLLSRMEQYANNLEELVEERTQAYLEEKRKAEALLYQILPHSVAEQLKRGETVQAEAFDSVTIYFSDIVGFTALSAESTPMQVVTLLNDLYTCFDAVIDNFDVYKVETIGDAYMVVSGLPVRNGRLHACEVARMALALLDAVRSFRIRHRPQEQLRLRIGIHTGPVCAGVVGLKMPRYCLFGDTVNTASRMESNGEALKIHLSSETKAVLEEFGGFELELRGDVEMKGKGKVRTYWLLGERGSSTR 1060          
The following BLAST results are available for this feature:
BLAST of TCONS_00016590 vs. Swiss-Prot (Human)
Analysis Date: 2017-10-03 (blastx Clytia hemisphaerica v1.0 mRNA vs SwissProt (Homo sapiens))
Total hits: 1
Match NameE-valueIdentityDescription
ANPRA2.414e-14240.90Atrial natriuretic peptide receptor 1 OS=Homo sapi... [more]
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