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The following sequences are available for this feature:
transcript sequence >TCONS_00015220 ID=TCONS_00015220|Name=TCONS_00015220|organism=Clytia hemisphaerica|type=transcript|length=3380bp TTGAAAACCTCAATGTGTATTATAAACGACACactctttattgaaaagaa agttgtaagaaaagaaaaaagaggaaggagatttttttttaacaaactcT GTATGCGGAAGCGAAAGACGTAGAGGGACATAAGTGTATCATCAATTTGG AAAAACAATATTAACAAATACAAAACCACTGAACAACCTTAcaacaacaa gaagaagaaTTCAGAGAAGATTTACAACAACCAAACTCCATCACGGCTAC TCCAAGGAAAATCAATTGGATCCAACCATATATCATTATTGAATGGCTGC TGTTCCCTTAGCATTAAAGatacCAGAATCAATTTCTACAAACTCAACAA ACGGCTCAATAAATAAAGACCGAGCTCCTAAGCTACATCGTCCCTACAGT CTCTCTGACAGTGAGGACGAAAAAGCTGAGAAGAAAAGTGAAGTTCCGCC TACTAGTCTATTAAGTGTAGTTTCTACGCTATCCACAAAAGACGCAATGA ATCTCATATATACGAACACATTTCAAAAATCACCGCTCGCCGCATTCCCG TACGAGAGCAGCTACAATGGCGCACCAGACACGCTTTTCCGTGGAATGCC TTCATTATCCAATGGTATCGGGCGTTCACCGCCTCCATTAGAAAAAATGC GACGCGAAAAGGCCGCAGGGGAAGACTCCGTTTTCGCCAATTCTCCAGAC CCTCGTTCGCCTTTCGCAAGAGTATTTGATTATAATTGGAGTAATTCGGT CACCGATCGTAAACCGTTGTATGAAAACGGAAGTTTACCAACGTCAACTT CTTACGATGCTCTTCTTAAAGCGAACTATGAGAAAATGAGATTTTCTGTT CCCTTCAGAGACTCACCACCTATATCCTCCGCCGTGGGTGAAATCAATCC TCCGTCACGCTCACCAACTAAAGCACGCATGAAATACACACCCATGAGGG AGAACATTTTCAGCGATTCCCTTGCAACGACTAGCGGAGGAGTGGCAAAA TCACCCACCATGTTCTTTTCACGTGGCTCAACAGAGGATCGCAAACCGTA CCGCCGAGAAACAGACTTAGTTCGGAGCATGAATCTACACAGCGCTGCGG CTAGTCAATACGATTTGGACCACAACCCATTGAAGATTATCCAGAGCCCA AGCTACCAGGTTAAGCAACGACATCTTAGTGAATCGCTCCCTGATAAACG ATCAAGTGTAAGTAGTGCCTTCTCTGTCATAAGGCCCCATTTCCAGCGCA TGTATGAGAGGGAGAGCGGTTATAACAGTGACCCTTCTGAGAAAGGGAAA AAACTCTTCAAACCTTACGAAACATTTGAGAAAAGTAAAATCTACGCACG ACGACATTCGGAAAATTACAGACCAGCTTTAAACGGGAACAATGGTGCAG ATATTGACAAAGAAATTGGGGTCAGTAGATTACACGTTTCAGATGAAGCA AGCAAAGAAGCTTTACAAGCTTTCGACGCGCATGTGCAGAAAATGATGGC TGAGAAATCAAGATTACAAGGACCGGCACCCATCGGGTCACCAAAACTGG CCTCAATGAGCCGGCCTAAAGAACCGATGGCGATTCAATGTTCAACTATT GATAGCAGTATGCCGCAAACGTCGACGACATTAACGAATGTCGCCGATTT GTCACACGGCGTCGGTGGTTTGCTGGGATTGACGCGAATCGCGAATGAAC ATTTGGGACAAGCCATTGCGAAGGAAAAGAAACGCTCAAAAAaCAACAAC TGTTTACATTTATGGCAATTCTTACGCACTGTACTCgaagaagaaaaaga caaaccGAATCGGTGTATCGAATGGACAAATCGGGAAAGAGGCGAATTCC GATTAATCAAAACAGCCGTTATTGCGGACCTTTGGGGACAATCTAAAAAT CGAAAATGTATGACGTATGAGAAGATGGCGCGTGCTATGCGTTATTacta taaaatgaaaatcttggaGAAAGTACCTCACAAGAGACTACATTTCCGGT TCGGTGAAAAAATGTTGGCCCGCGTACTGGACCCTAATACAATTAAGCCG TTTCGGCGTATGAGCACCGGGGACCAACATATGCGACCGGCAAATGGAAC TAATGGCTATTATTCAGGACCACCGCCTCCGCTGCAAATGTTACGTCGTG GTTCGATTGATGGATTGAATTCGCCTGGAGTTATCTCCTCTTATCAGGGT GGCCGCCTTGGAAGTCAAAGTGATTGTCCACCCACGCCCATGACTCCATT ATCGCCTTGCACACCAATGACACCTTTAACGCCCTGCACACCGGGCGTAA ACCGAACACCCGTTATTATGTCTCGTTCAACCAATGTTTTCTTCCCGCCA GATTCTCCATTACCCAAACTCGAAAACTACGAATCAAAATCACCGCCAAG AAACGGGCGTCAAAATTCACCACCCACCACCTATCTTCAGCAGCAACGAT TACCCCAACAAAGTCAGCCAATCAAAGACGAATTTAACAGAAATTTACCA ATAAAAGAGGAGTATAACAGAAATCAGCCAATCACTGAGGAGTATAACAG AAATCAGCCAATCAAAGAGGAGTTTAATAAAAATCACCCAATCAAGGAAG AGGATGATAGACTGTCAGAATCAACGGCAACGACCACTTCTAAAGATGGC GTCGCTTCGGACAATTCTATTAATGCAGACGAAGAGTCGGATAGTGAACT TATCGTTGATATGGACTAATTTGTATAGAAATTGTGCTAACATTGTAGAT AATGAAAAGGCCTAATTAAGCGTAAATCTATAACTTTGGGACAAGTTCgt gtttttacaagctctttttgATTTGGTTAAGTGGTTAACCTCTAATAAAT CAATtctattactttttctaaagaacgcgggCGGCAGCTCTAtaacttca aatgaccaatgagtgaagtatcttgtaataAATTCAACTCTTTCCATAAC TCTTAGGTGGCGAGATGTTAAGgacaaaatttcttttaagaGTTTAAGGT TGCCATAAAATTCGAAATAGCAAGAATCGTAAAAGTAAAGTAACAATTTT TTGAATCCGCTAAAGTGGATAGTGGTAGCAAAGGAGTGTAAAGTATTTAG AAATATTGGATTTTTTAGTGTGGGCgcaatttatttttttaccgGCGTTG TATATAGTATATGTNGATAGTGGTAGCAAAGGAGTATAAAGTATTTAGAA ATATTGGATTTTTTAGTGTGGGCgcaatttatttttttaccgGCGTTGTA TATAGTATATGTTATATAATGTTATATCAGTTGAAGGTTTtaatgtgaat tattttttatccCCAATTTATTATTTCAGTTAAAGAAAgttctttttaaa gaattcaACTTGCACATTACATAGTTAAGA Run BLAST on NCBI transcript from alignment at sc0000205:139400..185551- Legend: exon Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below. >TCONS_00015220 ID=TCONS_00015220|Name=TCONS_00015220|organism=Clytia hemisphaerica|type=transcript|length=46152bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000205:139400..185551- (Clytia hemisphaerica) TTGAAAACCTCAATGTGTATTATAAACGACACACTCTTTATTGAAAAGAA
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TTAATCGATAGAACTTACTAACGGTTTTTTCGAGGTCTGAAATTCAAATG
TCTGATGCTACCAACGGATTCAGCGTGAAAAGTAGTTAAAGAAAATGGGG
TTATTTGTTTCGACCATCTGGTGCCGAAAAATGGCATTTTTCCGATGACG
TCAGCATTTTCCTGGGAGCATTTTTTGGAAAAACCATTCTCACCGCTGGA
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GTTCTTAACATGTTCTTATTTTGACCATTTTGTGAATATTTTTTACCATT
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AGTTTGTTCTTATATAAAAAAACTTTTCAATTGTATTTCTCTACAAAGGA
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TCTTGAACATTTTATTACGTTTTCACCCTTCTTTTTAAACCCTATTCCCG
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ATGGCACCGTTGTACGTGTAAGTTTCAACACTGTAATGGCTTCTTTTTCG
GGCACTACTTTCAAAAAAAAACTTTGATCAAAGATGGCGGATATAGCTTC
TATAGTCCCTTTTTATATTATCCCTTTTAAACAGTCAAGAACACCATTAA
TAAATTATTTTATATTCCATCAGCAATGGACATTTTTGTCGATTTTCGGC
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TGAAATAAAACTAACGTAACTTTGGATTGATTCATAATTTTGAACGAAAG
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GCCGGTAAAAATGTCCTTAATTTCTGGGTTTTTTTATAAAAATGATCACC
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TTCGATTGCACTCCATCTTAGAGTATTTTTCTTGCAGTTTGAACACTGAC
CTTGTCACTTACAATTTATATAAGAACTATTTTTTAATGTCCTTGCTCTA
TTGATTTCCAACACGGGAGCAGCCATACTAACTGAATTTAGATTCAGTCT
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GAGAGCTCTAAAGAGCCTTTCAGATTTAATTAGAACGTACCCGGGAATAG
CGTCGGGATTATTCCTTGGGGGTACTTAGGTAAAGCGACCGTAGTGCAGT
GGTAAAACATCCGGCTATGGTGCGCAAGGTTGTGGGCTCAACTCCCAGCT
GGGTCATACCAATGATTCCCAAAATGGTATTTGATGCCTCTCTGCTTGAT
GCTCAGCAATTAAGAGAAGGATCAAGGGAGAGTGGAGCAATCCAGGGAGA
AATAAGAGTGGTGCCATCTATCGAAAGATCAGCCTTTGGGTCGCCTCCGA
CTGCGGTCGCAGACTTACTTACTTAGGCAAAATGGGTAACGGGCAAGCGC
GCGAGTCAACTTTCAAATGAATATTTTCCCGCTGAAAATGCAAATCAGCG
AATATTTTTGAGATATTAACCAAGCTGGCTGTTCATAAAAAAAAATTTTT
TTTATAAAAAACATCTATATACTTATTGACGCGTCAGATCCAACAACTCT
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TCCGCTGAAAATGAAAATAGCGAATATTTTTAGATAATAATTGCTCGTAA
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GAGATCGACGGGAGAGTTTCGAAGAAACTTTATCAAGAAGACTGGCAAAC
TCTACCGGCTGTAAACTCTTCTTGGCAAAAAGCCCGTTTGCGAATTTCTT
CGACTTTGGGCTTATTTCTTAGATAGTGATTTATCTTATAGTCTACAGTC
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GGCATGGTTCTTATTGAACTAAAGTTTTGATAAAGATTCGTATCTGACCT
CCAGATCGTGGCATTTTTTTTTTGAGTAATACTGGACTTTGAATTTAGCT
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AATACACCTTTTCGACCGTTGCCACTAATTGACGCGCGGGCATTTTTTGT
CCGTTTACTACCCTTAAATCGTCCCAGGCTTTTTTTCGCACCTATAGATA
CTAGAAAAATATGTAAAAAAGGATTGTATCAAGTTTAGGGGTATAATTAA
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CTTCTTAAAACTTTTTTTCTGCGATCCTGCTCAGTGGTCTGAAGGCATTC
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AGAGTACCTTCTGAGGGAAAGTGAGATTTTATGGAATTTTCTGCCAGGAA
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TGCCAATCGCGACTTAACATTTTATTCGGGCGGGGTAAAAAACAGGGTTC
CTTAGGTCGTGGTGCTTCTAGGTCCCGCCCTACCGGTACCAGACTGAGAA
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TGAGAGAATACCTTATCGGCCAAAACTTAGTCGGCCCTAAGTGACTAAAT
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TAAATTTTGACGAGGTGACTAAAATTAGGGCCGACTAATAATTAAGACCG
ACTGCTCCTAAGTTTTGGCCGATAAGGTATACCCTACACATTTATTTTAT
ACAAGCAACCAGGTTGGTAAGGCTCGAGTACTCAAATTAGCCAATTTTTT
CTTCACTATCTCGCGTAAAGTAAAAGTCTTTAGATGACCTAACCATTATG
GCAGACCATACAATAAATATGATATAATATCATGGATGGTCAAAGCAATT
TTTTCAGAAAATGAGCTAGAATGCTAAGCAACCACCCCAGCCCTGACCCA
AAAATTGGAAGTGCTTATAAAAAAATAAGTAGTATACATATATGTATAGT
TTATATATTGTATTCATCTGGCTGGCTCATCATGGCCCCCGGCGTGCGAA
TCGAATTGAGGGGGCCAAAAAAATATGTCGCCCACCATGGTTAGGCGACG
AAGAAAATTTATTTTCACCCTTATTCCACCCCTCTAAACGGTATATATAA
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GGTATATATAAGATTTTTAAAAGTAAAAAAAAATTACTTTGCAAAATATT
GGGGGGGGGGCATGCTCATGGGGAAGAGGATGTTCTTTAGATACCTGATA
ATTCATTCGTTTCGAAGTTGTCGAACAATCAAATCTTTTTTGAAATCCCC
TGTAAATGTCTTTTCACCTAAACCTTTTTCTAAGGTGCTGAAAATGGAAT
TTGACAACTTTTTTTTCAACTTTCATATTCTGTCTTTCTTTTTACAAGCT
TCGCTAATTGCTTCTTCGGTTTTAAGATAAAATCCTGTTTCTCAACTTTG
GAAAGCAAAAACGATTGCTTAAATTTTAGCGGCATTCTATTCTCTTATTT
AAATGAGGTTAGTTGAAGTGGGACAAAGAGAACAAAACCACCGATGGCAC
TAAATTATGCAAAAAAACAACAAAAAAACAGATAGGGAAAAAAGGGGGAA
ATAGCTTTTTCTTTATTAAGGACAAATAGGGCGCTAATCCGTGTGTACTT
TTTTTTTGTAAGAACCAGTAAAAATTTTTTCTGAGGCTCGGCTGTTCTTA
TTTTTTTGGCACTTCGAGCCTCAAATTGTTCTTATCCTGTTCTTATTTAG
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ACCCCTAAATTACTTGAAATTGAGTAAATTCAGGTTCAGCATTGTTCTTA
AATTGTTCTTATTTTTTGGCGACTTTGAGCCTCGTTGTTCTTATAAAATT
GTTCTTATGTCAGTGATACAGGTCTTTCTATTAAAAAAGAAGCGCATGAA
AACCCGCTTGAACATAATTTACTTATTCATAATTTCTGTGCCTTTTCCCT
TATGGATTTCCTAATTTTCCACCCGAGCTTTGTGTGAAACAGGTATGTAC
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TTGCAATAAAAATCGCTTTTTAAATCGGTCACAGATTACAGTTTCTTCGC
AAGAGTTTGAAATAGTTCACGTGTTTTTGTGTTAAAAATCAAAGTAGCTC
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ATTTAAGTGTTCTTATAAAAAAATAACATGAAAGCCACGGAAGATGTACA
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CCATTTACTTTTTACACAATTCTATAACACTCCTTCGTAGTGGTTTTACT
GATCCAGGCTAAATCCAGGCTAAATACTCTCCCCGGTGGAGTTTTCCTCT
CGGAAACACGGAAGTGTCAAAAGAGACCGCTTTTTCGGAAGTTTCCCTTT
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TGGGGATAAAAACTCTTATTGAAATGTCAATGGGGATAGAAATTCTATTG
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TGTAAGAAGTTTAAGAAATATTTATTTAGAAAGAAAATAATACATTGAAT
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AGATTGTTTATATGAGAATATTTTACACATATTCAATGTACTAACTTTAA
AGCGTTTGGATTTTATATGATTTCACTGAAAACTGCCCAAAACTGTTGAA
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TGTATTTGAGATTATTTATTGGAAAAAAATACATTTTAGTTTGTCAATTT
CGACATTTTCATATATTATGGGCATTGCAACCTTCATGGCAAAACTGTCT
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ACTCTTCATATTGACCTTGTATTTAGAATGTAGACTCACTGGAAGCATCA
AAATAGGTTGATAAAAAAATAACTCCAATAAACATCCGGATTCAATTTTT
CAATTTTTCGGTACAGTGCGATAAGCATTTCCCTTTTTTGACCGGGGCGA
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TTTTACTGTTCTTTATATAAAAAAAAACTGTACCCCGGTGAAGATTTACC
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GTCGTATTTTTCGAAACCTGTGATATATTTGAATTTCAATCTGACGGGTT
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CAAAAATCAATAAATTGAAGGATAAAATTTTTTTTTATTGTTTTGGATAG
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Gene-mRNA-Prot
This transcript is a part of the following gene feature(s):
The following exon feature(s) are a part of this transcript:
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| TCONS_00015220-exon-sc0000205-1491911889:151588..151625 | TCONS_00015220-exon-sc0000205-1491911889:151588..151625 | Clytia hemisphaerica | exon |
| TCONS_00015220-exon-sc0000205-1491911889:141382..142804 | TCONS_00015220-exon-sc0000205-1491911889:141382..142804 | Clytia hemisphaerica | exon |
| TCONS_00015220-exon-sc0000205-1491911889:139400..141037 | TCONS_00015220-exon-sc0000205-1491911889:139400..141037 | Clytia hemisphaerica | exon |
Position
The following features are aligned
| Aligned Feature | Feature Type | Alignment Location |
| sc0000205 | supercontig | sc0000205:139400..185551 - |
Blast
BLAST of TCONS_00015220 vs. Swiss-Prot (Human)
Match: EHF (ETS homologous factor OS=Homo sapiens GN=EHF PE=2 SV=1) HSP 1 Score: 92.8189 bits (229), Expect = 4.497e-20 Identity = 44/97 (45.36%), Postives = 62/97 (63.92%), Query Frame = 2
Query: 1718 AKEKKRSKNNNCLHLWQFLRTVLEEEKDKPNRCIEWTNRERGEFRLIKTAVIADLWGQSKNRKCMTYEKMARAMRYYYKMKILEKVPHKRLHFRFGE 2008
AK + N HLW+F+R +L P I+W +R G FR +K+ +A LWG+ KN MTYEK++RAMRYYYK +ILE+V +RL ++FG+
Sbjct: 195 AKCHTKKHNPRGTHLWEFIRDILLNPDKNPG-LIKWEDRSEGVFRFLKSEAVAQLWGKKKNNSSMTYEKLSRAMRYYYKREILERVDGRRLVYKFGK 290
The following BLAST results are available for this feature:
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