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transcript sequence >TCONS_00015058 ID=TCONS_00015058|Name=TCONS_00015058|organism=Clytia hemisphaerica|type=transcript|length=1767bp
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TATGTAAAAGATTTAGG Run BLAST on NCBI transcript from alignment at sc0000203:251631..265989- Legend: exon Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below. >TCONS_00015058 ID=TCONS_00015058|Name=TCONS_00015058|organism=Clytia hemisphaerica|type=transcript|length=14359bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000203:251631..265989- (Clytia hemisphaerica)
CGCAGGAAAGAATTGCTTGGAAAGATTTTTTAAAAGGTGGCGGTTTTTTA
TACAGTGAAATGGATGCTTTTTTGTCTAACGTCAATCAAATTGTAAGGTT
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TGTTTTTGTTGCCTAGTTAACACTTGGTGCAGATAACTTGTCTAAAAGGA
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GTCGGTAGTAAAATCTCAGACATATATGAGCAGTAAAAGGATTTTTACGT
ACAATTTTTTATGTACCACCACCCAGACTCTTGGAAGAGGTATTTTACTA
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GTCACGTGAGTGGTTGGTATTTTACAGACCAGACCATGTTTTACCAGAAA
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GATGGCGAAATAAATAACATGGTTTGGGCTGTGTGTTTGATTTTCCCAGC
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GAGACTTTTAGTTGAGATAGAATACAATTTAGATAGTCAGGCAGACAAAT
TTTCCTGCACCACATACTAAAAAGTCTTTTGATAGGCTATTCTAACCTGT
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GATAACACTTTCTGGAGCCAACTTAACCAATATATTTTTCTCGAATTTGA
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GTTTACACGTTTTTTTTATAAAAACATCCAAATTTTTGAAGCCTAAAAAT
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TGTTCTTAATTTTTTCTTAACATTTTGGTCATATCGAAGCCTTTTGTTCT
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TTTTACTGACAATGTTCTTATCATTAAAAGGACCTATTTTTGAACATACT
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GAATTCGTTTGATCTCTCGCACTTGTCATTCTACTGAGGAGACTTTTGAT
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GCTCGTGAAACTACGTGATCAGAAGTCATGACTTCTATTGAAAGTTCTAT
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TGACGGATATTGGTGTCAGAAAAAGATAAATTGCTTTTCCACGCAAATAC
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TTTACATGCCACATACTAGCATTTTTTCTTCCCAGAATCTAAGTCTATGA
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TTTTCTTCTCACATCAAAAGTAGTTGTAATTTTTTTCTCTTATTAAAGAG
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TGTTTGNCCTTGGTAATAAAGTTGTGGCCGACCGTGGGGGTGGAAAATCT
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AGTTGAATGCGTGCATAAATAGATGCCATCTTTCTTGGGGATGGACATGG
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AAGTAAATTTTCAAAGACGTTGAATTGCACAAAAGAGACACCTTTTTCAT
AAGGATGCCGTTTTGTTTTGCTTGTAGTCTAGGTTGTTAACGTTTTATTA
CTAAACCTTCATTTTGACATTCGTGGCTTTTTTCGCGGTTAAGGATTAGA
GCTACGATGGGCGGAAGTTGATAATGCTTTAATACTTCCGTTACGCAACT
GCAGTTTTGAAACTTGTGGTTGGAAAGATCTTTTGTGTGCTCTTGTTTTC
GATTATGATAGTTTCAGTAAATAATGATTAATTAATTAAGAGTTTAATTA
TGATGACTTTATTGGACATTTCCAGAGAGTTATTTTAGAAACTGAACACA
TGTAGTAATAACGGCAGACGACGGCTGATCTTTACTTTCACGCAAAAATG
GGGAAAATCTATAACATTTTTCATCATTCTGATTCTAAGTTTTTGTTATT
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AGCTTGTTTTAAATAATGGTCAATTTATGGAGACTGTAATGTTACTCTTG
GGTACCTAATATTCGGGGAGGGGGGTTGGAAAATTTTCGAAAAATTAATT
AGCGGGGTGGACGGCTATTAGAAACCCGAGAGTGGTAGTTTTCATGACAC
AATGTTACTGAATTGACACACACAAAACATAATATCTTAATCAAAACATC
AAAGGAAAGGTTTAATGACTTTGACATTTTCGACGTAATACAGCNATATC
TTAATCAAAACATCAAACGAAAGGTTTAATGACTTTGACATTTTCGACGT
AATACAGCTTGTCTTTTTGACAGATGAGATGCTGTAATGTTCAAATAAAA
TGCCGTAACATCTGCCTTTTCATGTTTGTTCACGTATACGGTTTGAATAC
ATAAGTCACCTGTCATTTATGAGAAATCATATAATTTGAATGTTGTTTTA
TACATATGTGAGGTGCCATTTAAGATGACATTGTTTATTTGATTGTCAAC
CTTGAAGGGTGGCTTACTTACCACTCTAACTTTATTTGTTGCGAATAAGT
TTATATGATTGTGACTTTTTTTAGAAACGTTCAACCTGCTTTTACCTCTA
GTTTAACCAACGGATAGCGATTTTCTCAAAGCTTTTAGTATAAACTCAAG
GCTTTAGCCTCTCCACTTTCACTTTAGTATCCCTGGATTTCAATCATTTT
ATAAATATAAATATTCTTCTCGTTTTAGAAAATCAAAGATTGTTTGGATT
TTAACTTGAAAAAGATGCGTAAGAAAAGCGTCAGTTGCGTCAATTTACGC
CGGAGATTCGACAGCAAGAACAATTCGTGTCATAATAACACCAATCAAAA
ATACGACAAAGTAAATAGCGAAATATTTATATGTACAAAGAAAATTGATG
ATGGAATTTTACCGTTGTTAGAGAGTGCTGGCTCCTTATCTAGCTTTAAT
AGTTTCACACCTGCAACGGAAGAAAGCTTTTTATTGGAGAGCTCGGATGA
GGCGCCAAATACGAATAAATCATCGGATTATGAGAACTGTAACAAACGTC
GAACCAGGGGTAAAATAAGATGTCTAAAACACCGTCCGCACTCATTATCT
TTATCCGAACGGAATTTGACAACCCGATTACAAGAGAACGTTAAACCCGA
TTCGGAATCAAGCAAAGACAATAATTCATCTTTATGCAAATCGAAAACAA
ATCTTACAAAGTGTTCGCATAATACTGAAGATGCGCATTGTTGTGGGCAG
CAAAAACACAAGAAATCTTTGAAATCGAACGAATTGATAGACTCGCCTAC
CCAAGAGAATAATAACAATAATGATACCATTAACGAAGAAGCACAGATTT
CTTTCAGTAAAGAACAACGCAGACGTTTAAAACAGAAAATGAGACAGCGA
CAGAAGTTTCAGGATAAATCGGTTTTCCTTGGTCTTTTTTAAACGCGTGC
CTATTCTACATCTATTGCAGATCGTTTTATTTTTTATATATACGCAGTTC
TTTGGTTTCATACATTTTCTTTTTGATAACATACGATGGTGAATTTTAAT
CCGCCACAGAACACGACGTACGTTTTACCCCGTTTATATATCATGATATT
TTCTTTTGATGCTATATAATAGTTGTTATATAAAATCTTTGACTCGAAGC
TTAGAACCAAATATCATTTTACCAAAGTCTCTTCTGTCGATTGGTTAAAT
CTCGAAATTTCCTTTCTTTTCGATTATATTCATACGTTTTCGTGTCCTCA
AATTCTAATTCTACTGATTGAGAAGACTCATTATCGTACAACAGCATAAA
ATTTCTAACCCCCTTGAATTATGTTGTTTATTCGCAATTGTTAACTCAAG
ATTATGTCATCTTTCCTGTATGAAATACACGTTTTTTTTTATAAGAGCAT
CCAAAAATTTTGTTTAAACTCTTCGGATCTTTTTCAGTTTTAAGCCAAAA
AATATTCTTAACATGTTCTTATTTTCACCATTTTGTGACCATTTTTACCC
ATTTTCCTAAGAAATCGGGTGTTTTCGAGTCCGTAAAGCCTTAAAATGTT
CTTAACTTGTTCTTAACATTTTTGCGACCGAAGCCTTTTTTCATATACGG
TTTGTTCTTATTTAAAAAAAAAAACGTGTACCTAAAATACCTGGATAATA
TTTCCTTTTCGAGATGAGAAGAATGACTTGTTTTGACTTACCCAAATTTC
AATTTATAGGCTATACATATTTTATATTTTTTACCTGCTTTATTAAGAAG
TGTTTTTACCTCGAGATTTGAAATATTTATGTTTGATTATACGTTATATA
TTATTTTTTTTGGAAAATTTCTTTTGACACTAAAACTTTCATGATTGAAT
TCTCTAGCCAATTCATATACAATTACAAAATTTCGAAAGGCTTATATACT
TTTAAACTGATAGCCTTTGTACATGATTTTATTAAGATTGCTTATGTAAA
AGATTTAGG
Gene-mRNA-Prot
This transcript is a part of the following gene feature(s):
The following exon feature(s) are a part of this transcript:
| Feature Name | Unique Name | Species | Type |
|---|
| TCONS_00015058-exon-sc0000203-1575043694:265954..265989 | TCONS_00015058-exon-sc0000203-1575043694:265954..265989 | Clytia hemisphaerica | exon |
| TCONS_00015058-exon-sc0000203-1575043694:251631..253361 | TCONS_00015058-exon-sc0000203-1575043694:251631..253361 | Clytia hemisphaerica | exon |
| TCONS_00015058-exon-sc0000203-1510915933:265954..265989 | TCONS_00015058-exon-sc0000203-1510915933:265954..265989 | Clytia hemisphaerica | exon |
| TCONS_00015058-exon-sc0000203-1510915933:251631..253361 | TCONS_00015058-exon-sc0000203-1510915933:251631..253361 | Clytia hemisphaerica | exon |
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Position
The following features are aligned
| Aligned Feature | Feature Type | Alignment Location |
|---|
| sc0000203 | supercontig | sc0000203:251631..265989 - |
Blast
The following BLAST results are available for this feature:
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