TCONS_00014680 (transcript) - C. hemisphaerica

Overview


Name	TCONS_00014680
Unique Name	TCONS_00014680
Type	transcript
Organism	Clytia hemisphaerica (Jellyfish)
Sequence length	4874

Sequence

The following sequences are available for this feature:

transcript sequence
transcript from alignment at sc0000197:177385..199339+

transcript sequence

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transcript from alignment at sc0000197:177385..199339+

Legend: exon

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>TCONS_00014680 ID=TCONS_00014680|Name=TCONS_00014680|organism=Clytia hemisphaerica|type=transcript|length=21955bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000197:177385..199339+ (Clytia hemisphaerica)
GGAAAAAGGGAAATGAAGATAATATGattatgtaaaaaaatattgctttt
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ACTATGCCTTATCTTTAACTTGGCCTAAACCCTCGACGGTTTATCCAATC
CAGGAATATTTGATTCGTTGGGGAAAAATGGAACCATGGTTCTTCCCTAA
TACTTCATGGGTTTTCAAGGGCAAAGAGTTTGGGATTTCATCATCTGCGG
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GGTGG

Gene-mRNA-Prot

This transcript is a part of the following gene feature(s):


Feature Name	Unique Name	Species	Type
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The following exon feature(s) are a part of this transcript:

Position

The following features are aligned


Aligned Feature	Feature Type	Alignment Location
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Expression

Values :

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Blast

[Close]

BLAST of TCONS_00014680 vs. Swiss-Prot (Human)
Match: FGFR3 (Fibroblast growth factor receptor 3 OS=Homo sapiens GN=FGFR3 PE=1 SV=1)

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Query: 3035 WEIDPKAITLDVKIGEGAFGTVYSATIDAIVIAKSNYGKQAGGVAGFNTENNPKVAVKLLKDGAQQEEFADFKEEITLMKSIGYHKNIVNMIGCSTVRQPMCLLVEFMEHGDLLNFLRKRRSKLCTGLTTTEGSKSFMYTQQFHDTLQDINSIGEESVNSGAPIYDDSPNSDEVLTPDDLLSFAWQVCAGMEFLTSNNMVHRDLAARNVLIGANKVCKVSDFGLTRTVGDSQIYTSQKSRKLPIKWMSVEAIFDQEFTMYSDVWAYGVLLFEIVTLGGTPYPSVNNRELLRMLKSGYRMDKPENCADPMYDIMLHCWNEDPLERPTFTELHDHLEQIMSQSA 4060
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Sbjct:  465 WELSRARLTLGKPLGEGCFGQVVMA--EAIGIDKDRAAKPV------------TVAVKMLKDDATDKDLSDLVSEMEMMKMIGKHKNIINLLGACTQGGPLYVLVEYAAKGNLREFLRARRPP---GLDYS---------------------------------FDTCKPPEEQLTFKDLVSCAYQVARGMEYLASQKCIHRDLAARNVLVTEDNVMKIADFGLARDVHNLDYYKKTTNGRLPVKWMAPEALFDRVYTHQSDVWSFGVLLWEIFTLGGSPYPGIPVEELFKLLKEGHRMDKPANCTHDLYMIMRECWHAAPSQRPTFKQLVEDLDRVLTVTS 756

The following BLAST results are available for this feature:

BLAST of TCONS_00014680 vs. Swiss-Prot (Human)

BLAST of TCONS_00014680 vs. Swiss-Prot (Human)
Analysis Date: 2017-10-03 (blastx Clytia hemisphaerica v1.0 mRNA vs SwissProt (Homo sapiens))
Total hits: 1


Match Name	E-value	Identity	Description
FGFR3	9.955e-68	39.47	Fibroblast growth factor receptor 3 OS=Homo sapien...	[more]

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TCONS_00014680 (transcript) - C. hemisphaerica