TCONS_00013901 (transcript) - C. hemisphaerica

Overview
NameTCONS_00013901
Unique NameTCONS_00013901
Typetranscript
OrganismClytia hemisphaerica (Jellyfish)
Sequence length2322

Sequence
The following sequences are available for this feature:

transcript sequence

>TCONS_00013901 ID=TCONS_00013901|Name=TCONS_00013901|organism=Clytia hemisphaerica|type=transcript|length=2322bp
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Run BLAST on NCBI

transcript from alignment at sc0000174:548225..569184-

Legend: exon
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>TCONS_00013901 ID=TCONS_00013901|Name=TCONS_00013901|organism=Clytia hemisphaerica|type=transcript|length=20960bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000174:548225..569184- (Clytia hemisphaerica)
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TAATGTCTTCTACGGAAAGATCCCGGTTTTTGCCAGTAGTGGCAAATTTT ATACAACTTTTGTCTAGCTTAAATTTGCCACTGCTGGCTAAAACCGGGGT ATTCTCGTAGAAAACATTACGTCATGAATATCAATCTCAAAGCTCGATCA TAATCAAAACGCATAAATTAGGTATAAATTATCAAATCCCATATATGCAT AATAAATGACTCAACATCAACCATTGCATTGCAGATATTCATTGACGTCA TTGCCTAGCGGAGGCCGAGGATAATTTGGAGGCTAATATATGCAGATTAC CGTCTTTAATCATGCAAAAAACATAGTTAGTCATAATTTATTACGGTCGT TAAATGCATAACAATGCGATGAAGTAAAGTTGACGTAATGTTTTCTAGTT GCTTCCTCAAGGGAAAAAGTTGACATAGATATATTACCTTTATTAATTCA ATCAAAAATCACGACTATTATTATAACGGTTTAAAAAATCCATACAATGG TTACCATGGCAACAATACAATCGTAGGATGAAGTCTTCAAGCAAGTGAGA CTATTTCTAGAAAGATGACAACAGGTTAAAGGAATGCAATGAGCGTAGGT TTTTTTTGAAAGAATCAAACAATTGACGGACGGAATTGAAATTGTCTATT AAGAAAGCCCAACCAACGCGATGAAATATATAAAGCGAGGCATTTTGATT TCGTCAAATATATCAGTTGTCATACCGTAAAGCATGGAAACATTTTGATA ATAAGATAAGACCTATTGTAAAGTTCATATAAATACACACGGCTTTCTTT GTATTATTAACAACGAGGACAAGACATTATAAAAATACCTTGTGCATTTT GAATGCGATCATAAAACTTTTCATACTCTCATTACAACTGATAGAGTTCG AATAATTGTACAAAGTGCAGATATACAACACGTTTTTTGATAAAATCACA TATGTTAAGTTTGAAGAAGACATTATCAAATTTTTCTTTGAATCAAGATA AGAAGATGAGTCCTTCTGTTGTTTTGGAAACTCCAGTAAGTGTTGCAAAC AGTTTTCAAGCTGACACACAACTTTCTTTTTAACGTTCATAAATCATTCT ATGAACGTTTGGAATCTTAGCTGGACGTTCAAACAACGTTGCGTGGTAGT TGGTTCATGAACGGAATTGAAATTCAACTAAAAACTCGATGCAAAAAGTT GGGCAACTTTATCGAAAGCAAAGATATACAAAGTGTAGATCAACCTATAT CTTTAAGCCTTCTTTCTTCGACATTGCAAGAACTATAAAAGGAATGGGAT ATAAAAAATCAAGAAAATTGAGCCAAGCTATTCAAACCAAAACTTTAACC ATTCCAATTCTTTGTATTTTTTCCTTACAGGTGATGGAGAACAAACCGTT CTTGATTCGCGATCCGATGCTAATGGAAGACGCCATCTTCATGAAAGAAC AAGATGACGATGATTTCAGCACCGACTCCTGGGAACGAATCTCAAACGAA GAATTAGATGATTTCGTGCAAATCTCCAACACAATAAGCAGTCCACCGAC GTCTCCAGCTACTTCCACTGAAAGTATTGGTAATGGCTTCAATGGTGGTT TATTGGGAGGATCTACAGATTCGGAAGACACTTTCAAAGCATTGAGCCAA CTTGATGACGATCCACCAATACTGGTAAGATATAATGACACGTTAAAGCA ACGTTTATCTAACGTTCATGACATCCATATTTTGTTAGATTGAACGTTAA ACCAAAGAAGAGCCTAGAGCTAGTACAAGTATACACTCTTTCTTTTATAA GAACTATTTTAAANCGTTAAACCAAAGAAGAGCCTGAAGCTAGTACAAGT ATACACTCTTTCTTTTATAAGAACTATTTTAAAGGACAATGAGGTTCAAA GTGCCAAAAATAAGAACAGCCAAGCCTAATAAAAACTTTACTGGTTCTTA TAAAAAAAGAGTGTATCATGCAAACGATCATGCACGAGAGAAAATTGTCT TAACTTTAGACTTCCAGATTGATTTACTGATAAACTAATTTTATAAGTCT TTCTCTGAGGGTAGAAGATTGATTGAAAAGATAAAAAGCACCCTAATCAA ACATACATAAGGGTTTATCAGTGGGAACATTTGACGTCAAAGCTGCACTC TCTAAAATGACTAGTTCTTACCAAAATTTTCAAGAACTATCGTCATAAAG TGACAAGCTTAAAAATTTTCGGACCAAGTTAACAATCAGAGAGATAAAAA CATTTTATTTGCATGCAAGCTATTACTCTTCAAAACAAATTTTTGTGTAC TTTTTTGACAAATGTTTAATAAAATGTAAACAAACATGGTAGATAGGAGT AGTTGGGAAGCAATTTTAATCCTGCCTGTGACGTCAATCAGAGGAAATCA TTGCAACATAGTGTTTATTTTTTACGAGGGAGGATGAAAATGGAGAATGG TTAAAGTTGCAACAGATAAAATTCTTTTCATCATCCGCCCCCTACATAAA GATTAAGGTACACACAAAAGTGTATGCAAAAAATTCTCTAAAATCACTTT TCATCAAATATGGTGTTTGTTGCGAAACGCTAAAATGATTTCAATAGGCT TACGTCAGCAAATTGCAGAAGCTAATATATAATACACGTAGAGCGGTAGA AATGGTATTATTTAATAAACGACCAATAACCACAAAGCATATAACACAGT GATAGGAGGAAGAAAGAAACTCTGATTGATCATTTGAAAAACACATAAAA GAGGGAAGTCTTCATAAGTGAAAAACAAACTTTTCTCAAATCAAGAAAAG AGGAAGAATTCAGTTTATTCGTTGGTGTGTGAATAGGACGACAGAAAGAT GAGTCCTTCTCATTTATTTCAGATCAAAATGGAATCAGAGCAATCACCAT TAAGTATGTCGACCTTCAGCATGTCATCATCACCACCATCATTCTTGGAT ACTGCGCCGTCTCCATTGATGAACTCAACCAAACAACAACAGCAACAACA ACAAAATCCACTAAATGATACACCAGAAACACGAGCCATGAAGCGGGAGC GTAACCGTTTGGCTGCACGCAGATGTCGACAGAAACAAAAAGATCGAATT GATTATCTCGAAAAGGTAAAAGTCTTTTCTGACTTTTTTTAAAGAAAATT GTTAAGTTTCCATCGTTTATGGGTGTGGCTTATGAATCCAAATATAAACT GCAAGGGTGGAGGTCGTCTAAATTTGAGAGCATTCGATACATTTCAATTA ATCCTTAAAACACTTAGTAAATAAGTCTGCGACCGCAGTGTCGCAATCCA CACGAAGGTAGGGTAAGCCACTCTTTTTTTCTAGATTACTCCACTTATTA ATTGACGCCCATTATATGGGTGCTAAGTGACAAAACACTCGTTGACACTG ACTTTTCCAACGACAATCCATTTCAATTTTTCCATCTCTAATTTTGTTAT AGGATGTCAAACAAATCGAAACGGACAATTTCAAAGTTGAGAACGAAATC AAATTGTTACGGCAACAATTGAACGAATTACAAAGTGCTTTAATTAACCA CGACTGTATGTTAAAGCACGGTCTAACGCCAAGACAACATTACTATTCAG TCAAATTCTGAGCATAAGACCAGAAGAAGATGGCGGACGAATGGCGAATA AGCGCTTATGCCTATCAACAGTTGCTAAGGAACACACTTTTTCCAAAAGA TGACAAACGTCATTGCAATATGGTAGCGTAATTATGCGAACCGTTGCCAT GGAGATCGTAAACAAAAACAACAAGATGATGGGGGTGCTAAGTGACAAAT TACTCGAATTATGCGAAGAATAATTTTTCCGTATTACAAATATGACCAAC TTCATGGATGAATGTTACCCATGAGGAAGTAAGCCTTTGGTCCACCCACA TGGTTTTAATATCGATGGGTTCTTATTACCACAGAAACATGAATATTCAC CTATAGCTTGGCTTTTACATGGAAATAAGACGCAAACAAACGCTTTAAAA CTTATCTTTTCACTAAACGTAACGAACTTAGTGAATTAAAGAAAAAAGAT AAATTTTCACATACTTTGGCTTGGTAGTATGAATGTTGATCTTTTGATGG TCCGCAAAGCACCATATTCTAGTCAACGCCACGCCACGCCACGGGCGTTC ACATCAACTGCCCAATCCACGAGAAGGAGATATCATAATAACATGACATC ATTATTGAGTGATGATTCATAAATACACATAAACAAAAGACTGAAAAATA AATAGTACAAATATTTTAATATTTCCACATCCAGTTTGTAAATATTAAAA CTTTTTTTTNACTGAAAAATAAATAGTACAAATATTTTAATATTTCCACA TCCAGTTTGTAAATAATAAAACTTTTTTTTTTAAAGAAATTGTATAAAAT AGTATTTTAGTTGTCAAGATTTGTATGTCAATAATTCAAAGTAAAACAAA AAAAAATCACAGTCAAATTTTGTTCGAAATTTGTCAATGTTAACAAAAAT ATGCCTCTGCTCTGACCCTCAAGTTAATATGAGTTTTTTCTAATCAAAAT TTAAAAACTCTATAATTTATTGAAATTTGAGGAAATGTCCTGCATTGGTA AAGACTAGAGATTAGCAACAGCTCTTACGTTGTCACTGAGATAGTTTTGA TATGAAAAATTACAATTATTCGAACAAAATATTTCTAGGTAGGATAATAA CTTTCTATACGATATTTTTTATGTAAGAGAAGAAAATAATAAATATAATA TTTGGAATTTATTTATGTATATTTTGAAAGGTGAAAGAAAGAAGAAAGCA TAAAGTAAAT
Gene-mRNA-Prot
This transcript is a part of the following gene feature(s):
Feature NameUnique NameSpeciesType
XLOC_007757XLOC_007757Clytia hemisphaericagene
The following exon feature(s) are a part of this transcript:
Feature NameUnique NameSpeciesType
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Position
The following features are aligned
Aligned FeatureFeature TypeAlignment Location
sc0000174supercontigsc0000174:548225..569184 -
Expression

Hover the mouse over a column in the graph to view expression values in transcripts per million (tpm).
Sort Descending | Sort Ascending | Only Non-Zero Values | Tile/Chart | Reset | Show/Hide Values

Values :
    GrOo_1	 GrOo_2	 FGOo_1	 FGOo_2	 EG_1	 EG_2	 P1_1	 P1_2	 P2_1	 P2_2	 P3_1	 P3_2	 PoPr_1	 PoPr_2	 St_1	 St_2	 GO_1	 GO_2	 PH_1	 PH_2	 BMF_1	 BMF_2	 MMF_1	 MMF_2	 M_1	 M_2	 GEC_1	 GEC_2	 GEN_1	 GEN_2
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Blast
The following BLAST results are available for this feature:
BLAST of TCONS_00013901 vs. Swiss-Prot (Human)
Analysis Date: 2017-10-03 (blastx Clytia hemisphaerica v1.0 mRNA vs SwissProt (Homo sapiens))
Total hits: 0
Match NameE-valueIdentityDescription
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