TCONS_00013874 (transcript) - C. hemisphaerica

Overview


Name	TCONS_00013874
Unique Name	TCONS_00013874
Type	transcript
Organism	Clytia hemisphaerica (Jellyfish)
Sequence length	1851

Sequence

The following sequences are available for this feature:

transcript sequence
transcript from alignment at sc0000174:191660..209190-

transcript sequence

>TCONS_00013874 ID=TCONS_00013874|Name=TCONS_00013874|organism=Clytia hemisphaerica|type=transcript|length=1851bp
ttttttcttacgaGCCTTCGTTGGTGGAAACATATCAAGTTTTCAAGGAT
GTACTAAAAAGCCAAAGGAAAGCCTTAAGATTAATTGACAGCGAAAGAAA
TATTGTCAGCTTGATCTCCAGACTACTGTGAAGATCTCTTCGAAAGAAGT
CAACAATTTTCTATTGAAGTTTATTGTGGGTGAGCAGAACTATTGGAGCA
CAGAGTATGgactttttatcaaatatggTTCAACGTAACGCAGAAGCAGT
CAATCATATCATCAAACCTGCCGGTACCGCAAAAATTATGTCTTCAGCAG
ATGATATCTCGTCATGGTACGAAGCCGTTCAACTTTACGAAGTCAATCGA
ATCGATGAAGCTATTGAGAAATTCAAATCAGTCAAACAAAATGCAAGAAT
GCTATTGAATACCGGATGTTGTTATTTGAGAAAGAATGATCTTCAAACTG
CAGGAGAGtcaTTTGGTCAAGCTGTGAAAAATGATCCGCATCAGGCTTTG
GGATTTTTTATGCTTGGACTAACACAATACTTTCAGAATAAGTTGGAAGA
TGCactcaaaagttttgaaaaatccctTACATTACTACGAGGAAATAAAT
TTGTGGATTATCGACAACTtggtttcaaatttcaattataTGCTTGCGAG
ATCTTGACAAATATTGCTGGAACACACCTGAGACTGAACGACTTAGCGAA
GGCACAAGAAGTGATCCAACAAGCGTACGAACAAAGAGCTGACAAAAAAC
ACGAGCGAATCATAAACGATGTTGACCGTCTGAAGAGCAAGCGACCAAAA
CTTGATTTGTTTTACCCACCAAAAAGTGAAGTGTTCCGTCCAGCCAAAGC
ACTCGTCGCAAATGTAGAAAAGAAAGATTATCTTGGGGCTTCTAAAGTTA
TTTCTACAGATAGCGAGGAAGACTGTTATGCATGTTTCTCTGGAATTAAA
GATAAAGTCATCGAACAAAAGAAAGCCGAGCAAAACTcaccaaaacaaaa
taaaaaacttatcACCAAGATTGAAGCAATGCCTGAACCAGCTAAAAAGA
AGTCACCAGAAACAAAAAAGCGTGTGTCAGCCATTCCCAAAGGAGTATTA
CCACAGTTAAGCATTGATCAACCTGATGGTCCATCGCAACAAAGATCCAT
GTCTGTAGGTGCAAGACCCAATAAACCCTTACCGGTGCTGATAGCACCAA
AGAAAGAATTGCCAAAGTTAGAACCAGCAGTTGAAACAAAGATAGAAGAA
AAAATCACAGCTACCGTTGAAAAGACAGTTGAATCTACCCCAGCATCGTC
AGCTTTGGCAACTTCAGATGATATCGAGCTTGAAATTCAATACAATTTCA
TCAGCAAAGTTCGATTACCGAAAGGATTTACCATAGCTGatcttcaaaat
attgctaGCCAACAAAAAGTACCAACGCATCTCGAATTCAGGCTGCAAGA
TGTTCTTGGACGTCAATCACAATTGACCGAAGATGGAATCAAATCCCTGG
AGCAGCAAAAAATACATTGCTACCCTACTACATCATAACATGATAACATC
AAATTGTAGTTGGATAACATGAAAGTAATTTATTTTATATCACTTTGTCT
TAtttatttgcaaaaatatatcttaacttaaaaatatttttaagcctttt
tgttctgtattttaaagtttttcgttttttagagaaaaataatactatct
tttgtaACTTTAGATTTAGAGAGGGATCAATGTCTTTgagattttgtaaa
atatttttatgtattaGATATGATGATGCTACCTTGTAAATATATCTTGT
TATGGCTTTAAATGTAATAGCAGAATAAATAATACCTGAATTTGAACAAT
A

Run BLAST on NCBI

transcript from alignment at sc0000174:191660..209190-

Legend: exon

Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.

>TCONS_00013874 ID=TCONS_00013874|Name=TCONS_00013874|organism=Clytia hemisphaerica|type=transcript|length=17531bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000174:191660..209190- (Clytia hemisphaerica)
TTTTTTCTTACGAGCCTTCGTTGGTGGAAACATATCAAGTTTTCAAGGAT
GTACTAAAAAGCCAAAGGAAAGCCTTAAGGTAAGTCCATACCTTTCGTAA
GCTTTCTCCTGGCTAAGGAGGAAACAGCGATACGGTACATGGTTTAATCT
TTCTGACCAGTTACCAGTTCCCTAAATTATATACCTCTGACTCGGTCGTT
TTAACGCCGGCCCTAATTTAACGCCGGCCCTTATTACGCCAAGAGCCTAA
AATAACGCCAATAAGGACCAGTGTAAGGACCGGTGTGGATTTTTACCGTT
GCTAATCAATATTTTATCAGGTTATCTTTTTTCTATCAGATTCAAAAAAT
TCATGATTCTATTTTCATTGGCTTACTACGCTCTTTTGAGATTTTTTTAC
AAGAGCTTCTGCAGAGGCTGCAATTTGACTAAGGCACTTATCCAGGTGCC
TTAAGCTAAGGCTACACTGATAGTTTTTTCAGGCGGCTGCAATGCAATTG
TTGCATTGCAGCCGCCTGAAAATTGTTGCTGTCTAGCCATCTAAAAAAAG
GAGCCAGGAAAAACGTCATAAAAACATTCGAATTACAAACATTCGAATTA
CAAAACATTCGAATTATAAAACATGGTCCAACGTTCGAATGACGTAACAA
GATTGGAATGTCAGATACATCGTCAAAAAAATTGCAGATTCTTCTGCAAC
AAAATCAGTTCAAACTGATTTTGTTGCAGACACTTGCAATTTGTTCTGNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNTATTTTTAT
TGCGTTGCAGAGCAATTGCAGAAAAAATTGACGTGCTACATTTTGCAATT
TCTCGCGCGCTTGCAACGCAACGCTAATTGCATTGCAGCCGCCCGAAAAA
ACTATCAGTGTAGCCTTAGCTTTGATGAAATGATTTCAAAGTAGCTTGAT
CCGGACAACCTGCTATTAATATTCTTCTAGTATTTTAAGTTTTAAGTACA
ATGTTAGATGAAACAATGAATTCGTCTTGGAGAACTTTTCCTTTTTCGTT
TTCGACTTGAGTCATTTTTGTATAAACCTAAAAAAGAAAGCCAAATTTCT
ATAGAAAAAAACTTGAAATTGTTTTGCAGCGTCATTGTAACTATATTCCA
ATCCTCTACCCGCCTTATTTTTTCATAGATTAATTGACAGCGAAAGAAAT
ATTGTCAGCTTGATCTCCAGACTACTGTGAAGATCTCTTCGAAAGAAGTC
AACAATTTTCTATTGAAGTTTATTGTGGGTGAGCAGAACTATTGGAGCAC
AGAGTATGGACTTTTTATCAAATATGGTTCAACGTAACGCAGAAGCAGTA
AGACTTTAAAATATTTTTCATTATTCATCAATTTTCATTTAAAAAAGCCC
CTTTCAAGTTTTCGAATCCATTTCAGACATTCTGATGAAAAGCTTTTATT
TAGTATCAGTATTCTAAATAGCGACGAGGTCACTTTGTTGAATATGTGAT
AATTTTCGGCTTTCGGTGATATGTTGAATGTTGATAATTTTGGCTTTCTC
GCAACAAAATTTTGTTCGGGACAGTTTCTTTCAACTTCCGTTAGTTTCTG
CATCAGGACCTTATAACTAGGTTGATAAAACAAGGTATACTCAAGGTATA
ATTAATGACAGAAAGGGTTTCTTTTTTGTTTTTTTTCTCTCCATAAAAAC
TCTGGGAACTTTCTTTTGTAACCGCTGTTGAAATGCCTGGCTCATTGAAA
AGTGAAAGATGAGAATGTGCTTTTCTAATACTCCTTCTCACAGATCCAGT
AGGATTTTTTCAGCATGTAAGGTCAAAAACAACAGACTGAAACCCGATGG
GGATTGATGTTTTTTTATGGCGTTGGATTTGAATTCCATTGTTTTTGAGC
CGCAGAAACTTTATATAGTGAAGATGGAAAAAATAACACAATATTTTGCA
GCGAGGATTTGCTTATCTGATTATTTTCAGCATGGGCAAAAATTTGAGTG
TTATTTTCCACTAGGGGTGATATTTCAATTATTCCCCTGGGAAGGGGTCC
CAGGATTTCAGACAAATACTTAAAANGTTCCAAGAGAAAGGGATGTTTCT
TTAGGATTTCAGACAAATAATTAAAGGTTGCTTAAAGAAACCATTTCCTA
AAACCAAAGCAAATTTTATGAATAATTTTCATAAGCCCTTAAAAAAGACT
AAATTTTATTTACAGCGGTCAAAAACCTATTATATCCTATAGAATAGCAT
TTCACGGTGCCTTGAAAATGCAAAAAGTGAAAAATTTGCTTCGTTAACCA
ACAGGGGGTAGGAAGCAATTTTTCAATATTGTCACCCGTCACTTTAACAT
ATCAGCTTATATTTTTGATTTTCGCGGTATACGACTTTTTGTCGATAATG
CAACTTTGGTTTCCAAGAAAATTGCGCTACAAAAAAGATTTTTGATTACG
TTGGACCTATCACATCTTGTGACGTCATTTTGTCATATACCACGCACGGC
CTACTTAACTTAACCAAACAAAAATAACAGTTTAGAAGTACCCTCTCTTC
ATTCAGTCTTTTCATTGTTTCACTACTCCTCCAACGCCGAAAGAGTAGTA
TTTGCACAGCAACAGCAACACAGCAGCAAATTTTTCCCCTGGAGGGTGAC
CTTATGTGGAGCCTTGTGACTCTTTGGGCCTAAAATTGTTCTAATCATGT
TCTTATTTCTACAATCGTGGACATAACTGCTGTCCAACTACTCATTTCCC
CATGCTGAGTCCCCCCTCCCCCACTTTCAATATCGGAGGGATGAAATTTG
CAAGTTCCACCGACTCCATATCAACATTGAAGATGGGGGGGGAGTGGACA
AATAGTTCTGTCCAGGATTGTAGGGAAAAACTGAGGTAACTTGAGGTAAT
TAAAGTTTGATACCTTATTTTTACTCATTTTTACTCATTAGACGCTTTAT
ATATTTAACCTTTCCAGCGCGCAACATTTTTTGAAAAATATGAAAATTTC
CGCTTTTTTTTTTATTTGAATTTTGAATCTGGCATAAAATCTTGTAACTT
GAGAGTTAGACAATGGTTTTGGTACCATAAAGCATTCGGTTTACGTTTAA
ATCATTGATGTTTAAATCAAGTGGTCAGGAGCTATAGTTTTAAGTCTGGG
ACTTGGTATTTTGCCAAATTTGAAACGTGCATACACGTATCTTGGGTTTG
GAGGGTTAATGAGATATTTTTAGTACTTGAAAAAACTTCTAATATGCATA
CAAACATGATTTTCAATCATTTTGGGCAGTTTTGATTAATTAAGAAATAG
ACACTTTTGAGTCTTGTTGTTCTTATAGAATACACGTTGTTTTTTTGTTT
TTTCAAGAAACTAGTTTTACCAAGCAGCCTCAATGTTTCTTAAGAAATCG
ACCTTTTGATCCTTAAATGTTTCTTACATGTTTCTAAACTTTGTCAAGCT
TAAAGGACGCATGTCGATAATACAATAGTCTAATTGACTAATCTACGGTA
CTTTCCTATCTTGCCTATCTTCTATTGATTTTCTGACTTTCTCAAGTGTT
TCTAACTGTTGTGTATGTATATTTCTGGAACCTTGATTGGAAGGTTCTTA
AAAAAAAACGAATTAAAAAGTGCTATTTTCTCATTCTCAGCCTCAGCATG
TTTCTTAGATGTTTCTTAGTTTTTAGGCATTCTGAGCCTCATGTTTCTTA
AAAGTGTCTTTCTTAAAAAAAAAAAAACGTGTAGTTCTTATGAAAATCAT
TGAGCAAAATGATTGAATTTTGTTTTTGTACAATTTTTGTACCTTTATTT
CTAATATATAAAACCGTACACAAAACAGCACGCCTCCCACCTACATCAAA
CTCTTCGACAAAGCTAAAATTTTGAAGTGTTTCGACAATAAAATACTTAT
GACTGTTTTGGTCCATTTGGCCTGAGTACCTTCTGGTGGTCAGTAAATTG
TACTTCGTTTGGACTTTTACTGCAAAATGTTATCACAAACATTCAGTCAC
AGCAACGATCGCAAAAAACGCCTACGGAACAAAACTGTCATTCTAATCGG
ATTTTCTGATTTTGATTTTCAAATGAAAGATTAGTCATGTGTTTTATCTC
ACTTTGTGACAAGAAAGATTTGGTAATTTCTGATATTATTTGATCATTAA
AAGGCGTTTATTTCTCCGACCGAGACCACGGAAAGCACTTCTTAGCGTTA
GTATACATCCACTTGAATATAACCTGAGATTAGATCGTGATTGTTTTCTG
CCCACCACGCTAAAGCTCTGAAGAGATGGGTGAAAACAAACAATTTGACG
AACATACAATCTCATTTTCTAACCAATAAGATATACAATCTTAGATTTAA
GACACCCACAGAAAGTAGGATGGGGCTTGAAAATGACTTCGTTATCTTCT
CCTGATAATGAAAAATAGTTTACTTTTGTACTTTCGAATCTTTCATTTTC
AAAAGTCATCATACTTGATAGCTCACTTAGAACCGTTTCTACGCGCAAGT
ATTCAAGTTTACCAGGCTCAAATTACGCAAAACATCCGAATACATCATAA
TAAAAAAAATTTTAAGTTGGAAAGCAATGGTGTTAGAAAACGCCATCAAT
TACAAGTAAGAGATTTCCTGATCAAATTCAGAAATATTGCAGATTCTGTT
GTATTTTGTTAGATGCCGTGCTTTGGCTAAAAGTAATAAGTGTGCCGAGG
CTTGATAGGAAATGCTACCTAGGTCACGTGACATTGCAATAGAATTTAAG
TGCTTGACCAATAAGAAGCTTTCGAAAACAATAGCAGCAATATTTTTTGC
AATATACCGTTTTTTTTTGCTTTGAAGANAACAATAGCAGCAATATTTTT
TGCAATATACCGTGTTTTTTTGCTTTGAAGTGCTTAAAGCACGGCATCTA
GCCCTTCGGGCTTTACAGAAATCTGTGATTTTGTCCCCGGGAACGGAGAA
CTTTTCCGGTACAAGGATCCTATTATTGACACAGCGGACTAGTTTAAAAA
TTTACAGGGTTCAAAATTCATCGAAGCTAATTTTTTCATTTGCCTTCTAG
CAAAAGCGAAGCAATACCCCTACAAGCAGTATTTTTGGGGTCGAGGAAAA
TTGTCTCCCTACGTTAAATGCATTAAATCAATAACTGTTATTTGCATATG
TAGAAAGTTTTGCGACATACAGTGCATTATATAATGCCTCATAACAAGTT
CTTCAAGGAATAGATTATATATCTCACTGTCAGCAAATCTTAAGTATTTA
TTGTGTTACACGTGGGTAAGTAAAAGTTTCGATTTCTCCCACTGTCTGAA
AGTTATAAGGGGAATTTTCATGCTAAAAGCAATGTAAACAAACAAATGAC
AGTTATAATCCCTCCCATAAACAATTTCTTCAAATAAATTAAATTCTTTT
TGACTAAAATGGTGAAACTATTTTTTCTTGATTTTTAAGTATTCCATACA
CTGTTTCGATTTCATCCAGTGATCATCTGGATGTTAGAAATTCCTGTACG
GAGAGCACTTAGGCAATGTATTGCGAGTGCTGATCCCTCTGGGGAGTACT
AGGGTTGCGAGCTGACGGGGGTGCCGCCCGACTTTCGACCCTCGGACTCT
TACCGGGACTGAAAAGGAGAAAACAAAGGAAAATTTTGTGAATTTTCTGA
CCCTTAGCNTTGGACCCTTACCGGGACTGAAAAGGAGAAAATAAAGGAAA
ATTTTGTGAATTTTCCGACCCTTATTGGGACAAATTTGACCGATTTTGAC
CAAATTTCGATCTTTCCGGGTTTAAAAAGTTGAAATTTTCCTATTTCTCT
GAACCTTAATGGGACTGAAATTTGATTTTTCTGATATTTCCGACCCTTAG
TGGGACTTTGGAAATACAAAAAAGGTACCCCCTTAAGGGCGGTACATACC
GTACCCTCGATTTGCCTAAGTACCGGGCTGGTCTTTACGAGCGCTACCAA
AGGGTACATTTTTAAATCTTTCTAAAAGGCTATAAAAGAAGCAAATTGTT
CCATGAAAAGGTAACTTAAAATCACAAAAATTGATTTTAGGAACTTTAAA
GAAAATTAAAAAAAATTTATGAAGGTTTCCGAAAAACTGCCAAAGATCTT
CTCATTATAGCTCGATGGTTACAGCTTGAGCATCCAGCCTTAAATCTTGA
AGGGGACTGTGGTAGAATTCAAATTTGCTCCGGTTGGATTTCTATTGGTA
CTTTTAAGGTATGTCACAACCCTATTTCTCAGGGAACAGATATGGATGAC
AAATTAATTTCATCATACCTTTTTGCGTTTCACTGAATCTTATCTAGTGT
AAAAGTTTAGCTGAAAGAGATTGTATTTCAAAACCATCCCTACTGAATTT
CCTTGACCTGAGAACAATAGAATTTCCATCGGGATTTCAATAGAAATCTT
TATCTCCACCAGAGCTGTGGCAGGGGTGTTTGACCCTAATGTTCCAGAAC
CTGTCTGAAAAAATTGACTGAATATGACTCCACTACTGTATCGTACTAAT
TCAAACCCTATCCAGAAAAACATCGCAATTACACGATTTTTTTTATAAGA
ATGTCCATGATGAAAATGGCCAAAAATTTAAGAATAATGCTAAGAATATC
ACCATCATGGAATTTGGCTACTGAAGCTAAGAATGCCATTTTTAGAGCAT
TTTCAATTATAAATGTCAATTACCCCCAAGAGGCTATCTCCTCCATAAAA
ATGCCATTTTATGCTTGAGACGTATGTACTAAATAAATGTTACATCTACA
ATCGGTGACGAAATACTTGGCACAAAAAGGAAATCCACCGGGGTGTTTTA
AAACCACAATTGATTTGCAAGTGCTCTAAAGTAGGTTGGAAGGGTAGAGT
TTTAACTCTGACTTAGGACCTTGAAATCTGAGGATCCAAAAGTTCAAAGA
TGGTCCAGTAGGGCTTAAAATATAGCCTAGAAACCAATAAATCCCTCCCA
GACCGAAATAATCGTTTAAATCAAGTTGAAGGCCCGAAATTGACATTCTC
GCTCGAACTTCGATTTTCGAAAAATGGTAAATTAGCCAAAAGTGCCAATA
TGTTATGGCACTGATTGTAGTTTGAATTAGGATCCTGACCTAAGAATGCT
GTAAGAATATTTTAGGATGATTTTCCCAAAAAAGTTAAGATATCCATAAT
CCATAATCCATAATGAAATGGATTTACACCATTATTATTAAAAAAGGCGT
GTATGACGTTTGTTGTTTCGACAAATCAAACTCGTGCAAAACTTGCCAAC
TAGTGGGTTGTTTCTTTATAGAAATAAAAGTTATAAACCCCATCATAATA
CCAACACAAGCTTTTAATGAAGATGTAAAAATGTGTACGCAGACTTATTA
ACCTCATAATTATTCAGTCTCGACTAAACATAAACCTTAAGATGAGAATT
TCAAATTGCTGACACCATGGTGCCGACACGTATACGAATTATGTATGACA
ACAAAGAAAGAGTTAATGAAAACGAAGAGACACGTGTAAAGGCTTTTTTG
TGGAGATTGAACTGACAGCAGTGTTCTGACAACCATGGGTAATGACGTCA
TCTATTTAGACANTGGAGATTGAACTGACAGCAGTGTTCTGACAACCATG
GGCAATGACGTCATCTATTTAGACAAAACTTTAAGTAAATAAAGATTGAA
ATTCAAAGAAATAGAGTACAAAAAATTACCCTTTGCAATTGTACAAACAA
TCATTTGTAATACGAAGCACTTTCAGATGCAGAGAGAAAAATCAGACACA
CGCTATTGTCTCCAAAGTCATACGTGTGACACTATTGTAATAGGGACGTT
AATAAGACGACTTATGAATGTCTTAGAATTTGCTCAAATGATCAAATGAC
AAAAATAATACTCTTTCCGTTAAATTTCCACTGAACTTATACACCCACGC
TTTAAGCTAAGACAAAATCGTCACCCATTTTTGCCAAGCTATTGTTTTCA
AAATGGGGCACATGGGTATATAAAAGAAAGAAATGATTTTGAAAAAGTAG
TTATAATTCGATCTTATTTACTATCAATCCTTATGAGTTGAAACAGCTTG
TTTGGTCCAGGCTTGGTCGATATTCTTTAATTGTTGTTGCTTGTTGAACT
GGCTGGCTGGCTTCTCTTCGGGCTGGCTTCTCTTCGTCTGTATCAGCACT
ATTCGTTTTAGTTATACAGTAACAGAAGCACACCTGCTACCTTACTTATA
GGTATAGGCTTTGCCATATCGCTCATATCATTCCCAATAATTTGTGTAGG
GCTCCTATAGGGCTAAAGGAAGCTAATTTTCAGATTCTTGAAATTATAGC
TGAAGAAAATCGAAGTGGCTTTTTAGTAAGTTATCGATTGCTTTAAAAAA
TGACATGTAACTAGCAAGAAACGCAATTATGATTTATTGGAGCAGTATGC
GTCAAGTTATCGGTGAGACATTGTAACAGTTAGTATAAGCTTGTTATTTG
ATGACGTAATGAGTTTTGATTGATCAGTTTTGTTGTAACTTCAACCAAGT
CAAATTTCTTTTCCTAATCGGTATGATTTTTTGTAAGAACATCTATGAAA
CACACCAAACTGCTGATACTCTTAAACTTAACCGACAATGGTTGACTCTT
TAAGCTCTTGAAATTCGAATAAAACTTTACTTTAGTTTCATTCCACCCTC
AGTGACCTGGTAGGAATTCTTTAGCTAGTGGAGATAAATTAGGGTGATTC
AAAAACACCGAATGGCTTTCAAATTTTATCACTTTATCTAACATTTCAGC
AGGGCTTTCAATTGAACCCAAAGAAGAGTTTAAGATTTTGACGCGCTTTT
TCAATATATAATAATGTTTGATTTTTCTCGTATCGCTCTTTTTCGACCTT
TGTCCAGTCAGTGTCCACGCAAGGGTAGTTCTTTATACTAAACCCCATTT
TAATCTTGAAGATTTTGGATTTGCTTGTTCTTAAAAAGAAAAGACAGACG
ATATTTTTCATCACGGAATTCTTTATCAGTTAAAATACCACAAAGATGAT
TTGCCCTAGCGTCTTGCTTAATTACTTTAACTTCGCACGATAAATTAATT
AAGCTAATGATGACATCATAAACAAAAACTTTGTTTGAAAAATTAAACAT
ATTTTGGCAGTATATAATTTTTTTTTTGTTACGTAATCTTTACAACTACT
ATTTGCTGGCGACTTATTCTACGAATTTCATGCTGTTTATCGGGAAAATG
TATGAGTCTATCACAGTTTGATTGGCCGTGAATTTTGAGTCAATTTAATG
TTCGTCATTTTGGCAAAAAAACTACGCATGAGCAGTACACAATTTCTGCT
GTATGTAAACATATAAAACGACTGAAGAATTTTGAAAAAATTACTCATTT
TGTATATCCTCGAATGGCAAGTAGGTCATTGATGAAATATTTTTTTGGAT
ATTTTGATGAAGAAATTCTTTACATATAATTTACTGTGCTTGCTTTAAAG
ATTAGGTTACTGAGATCTGAGTCAACAAAAATCAACGATAAAAACCTTCG
TTTTGGTAGATTTATATTTTAGTATGAAGTAAGCTTTTTTTGCATATTGG
TTAAAGTTAAAGTAAAATGCAAACATAGAAAGTTTTTGTGGTGATTTAGC
TTGAGCAGGTATAGAGTTTTAAGCCTACAAAATATTTGATTGACATTTAC
AAAAAATGCTTTTAGAAAAAAAATTAGGATGAAATTAAAGGCTTCAAAAG
TGATCAGTCAACATTACAGAAAATGAAAGAGTGCAAATTTTACTAGTCCA
CTAGCAAACTTTAGTAAAAGCCCAAAAAAAAGTTGATTCTATCAAGCTTT
GGAGGCGACACTTCGAAGATAAAGTCTGCAGAACCAAAATTTGAATATTG
CTAGACCGAGTATTTGTTATATAAGAAAGTTATCTTGTTTTGACAACTAA
CCGAAGTAAATATTTTGGCAGAAAAATTAGATTAGATTTCGACACATTAA
ATTCCCTCTTGACTCTTGACTTTCTGAGAGGCAGATATTGGTTAAGAAAA
ACAACATATCTTTTTACCACGGTTACATTCTTAGGGAGTACTCTACGGGG
GTGTAGCAAAATAATCCGAGGGGAAATGACATCATCGAATAGGGGTATAA
AAGATTCAAAATTAGATTTTTAAGGGCATAGGAAACATAGACATAGGAAG
TCAGCACAGCAAGGAGCGTGTTAGAAGGAAGATTTGCATACCTTAATGTA
GGCCCTAAACCCTAAAATATTTTACCCTAAATTTAGTGCCATTTTTCATT
GGAGATTAAGAATAAAACAGCTGCCAATTACCGATATGTTTATGATGGCT
TTTCACTAAGATAAGGAGCAGTAGTAATCCTCTGTCACAATGGTTAATTG
TAATACAGTGATGAAATACTTTGATACAATTTTTCATGCAAAAACTACTA
GAAACATAAATCTATAAAGCTTGAGGGGCAAGATATCGTGCTTCAGCTGA
AAAGTGTGCCATGGTTAGGTAGGAAATCCTACTTAGGTCATGTGACATTA
CAATATAATTTTAGCGCTTGACTAATCAGAACATTTGCGGGTTTTCAAAA
ACAATAGCAATAATATTCTTTCCGATATTCAATTCTTTTTGCCTGTGATG
GCTTAAAGCAAGTTATTTACCCCTTCGGATCTGTGACCAGAAAGAAGAAG
ATGCCAGAATTGATGGGTCATAGTAGATTATCTGTAGCTGTAATAGATGG
CAACGGAACCTATTTCAAATAAATGTCTGTAATCTACCAGTTAGTTCTGA
AACTCTATAATTATCGCTTCACTCAATTTAGTTACACAAATAATTGTAAA
GGGTTTTGAAATAACCAAAAATTACAAAAATAATCAAAAATATTGTTGAG
AAAAATATTTTACAAATATGAAGGGTGACGCAATACGATTTCTTCACAAC
TATGCTGAACGTAACCAAATCTTGGTAAGTTAGCCTCAGTTTCGATCGAG
TGTATGATTTTAAAAGTCTTTTCGGCTGCACATAGGCGTAGCGAGATACC
CTGCAAAGTTTATGAGGGAGTTCAGACGTTTATGACATATTCATTATCTT
TTGATAAAACAAAGACAATAATTTTAAAGTGTCGTAAAAACCGCTCTCAT
CCATAAATTTTGCAGGGTATCTCGCTACCCCTATGCCGCACATACACGTT
TTTGTATAAGAAGAAAGTATATAAGAACATGAGGCTTCGATGACCTAAGT
ATTAAAAACAAGTTACAAACATTTTGAGGCTTTGCGGACCCTAAAACACC
TATTTTCTTAGGAAAATGGACGCAATCACTCACACAATGCTGAAAACAAG
AACATGCTAAGAAAATTTTTAGGCTTAGAACTCGAAAAGGTAGCATCCGA
AGGCTTCAAAAATGTTTGGATGTTCTTATATAAAAAACGTGTATGGGTCG
TTTTCAGATGAGGTTGTTCCGGGATGAGACAAGTAGGTTTTAACACCTGG
CGTCGGGGGCACTCAAAAAAAATGACCTACCCTACTTGCGGCCCTTAGAA
GGTCTTTTTTCTAAGCTTCCCAAGTCCACTGTAAGGGTCAAAATGAGCAA
GGATGAAATAAGTGTACTTTATGGGTGTAAAATTCTGAAATCTGACCGAT
AAAATGGTCAAAGAAATTTTTTTAAATGCACCGTACGGGTTGATTTTTCG
CCCAAATTTTCAATCAAGTTCCCCCTACCCCGGAGTTGGAGGATTAGGTG
TAAGGATTAGATCTGTTGGAGGTAATTAAATGGTATTTATCGCTTATTGT
TAATGCTAGATTTATCGTCTGAGATGGCATTGTTGACCTTTTGATTTATC
TTTAAAAAGTTTTAAGTTTCTAATTAAAAGGCAATTTCATCTGGAAAAAC
TTAATCGGGTTTTTTATGATCATTTTATTGCATTTTTGCCACTTGCTGTG
AAGTTTATAAAAAGACCTATTTAAAACAATTTTTATTACCTCTCTGTGAA
TATGGTATTGTTCGATTACTTTTGACAATTAACTTTTTTGACAATAAAAT
CTATTTTATAATTTTGACATTTCTTTTGGTTTATGATAATAATAGCTTTA
AAGATAAAAAAGCAAAAAGGAATTGATGATAACTTTTTAGTACAAATCTG
TGATAAAAATCAATTCTGATATAAAAACTGCTACGTATGAATGACAGTGT
TTTTTTAAACGAATTTGATGTTGCAGAGATGTTTGGTTATCAAAAATTGC
AAAACTTGTTTTCAAATATATTATTCGTCAATCTTTAGAATTGAAAATTT
TAACTTTATTTGCGCAGAATTTACAAAAGTTATGATATTTCCAAAAATAT
GAGTCAACGATTAAATGTTCATTTTTTACATAACTTTGATTGTAACTTTG
ATAAACTAATGTTTGCATTTTCGAGAGGAGAGTAATAAAATTTTGATTTG
GAAATTAAAACTCTCGACGAAATTGTATACTTTCAAAAACAAATAAATAC
ATAATATTCTAAGTGAATAATTTTGAGATTGAAATAATTGAATTTAATTG
GTTTTGATGGGTTTTATTTGTATTAAAATCCAATTTTCTCAAAGTGTTAG
GGTGTAAAATTACAGGATCCAATTTCCAGACTACTGTCTATGGCGACCTG
ATTTCGGCATATTGTAAGGGGTCAATTTTTCCGTACATCTGTAAATTAAT
ACCAGATTCTCATTAATGTTTCGTATTACTCCATTTCAGGTCAATCATAT
CATCAAACCTGCCGGTACCGCAAAAATTATGTCTTCAGCAGATGATATCT
CGTCATGGTACGAAGCCGTTCAACTTTACGAAGTCAATCGAATCGATGAA
GCTATTGAGAAATTCAAATCAGTCAAACAAAATGCAAGAATGCTATTGAA
TACCGGATGTTGTTATTTGAGAAAGAATGATCTTCAAACTGCAGGAGAGG
TACATACACATATAATTAAAATTAATTACGGCTAATATTAATTCAAATGC
TTGTTATTGAGTAATTGAGTAATACTGTTAATGCAGTGTTTGGTTCTTAA
TGATCCTATTTACAATATTTGAAGATAATGAGGTTTGATCCTTCACAAGA
AACTTTTTAAGATCTAGGTCCAGAAAAAGCGTGGCTATACCTTTGTCAAT
CATTTTTTTATAGTTTCCAACCCCTTCATTTTTTAAACGAAAGAAATTTG
AGGTCATTATTGATATTACCATATCTTTTCAATCTAAATTGAATTTTTTA
TTTTAGTCATTTGGTCAAGCTGTGAAAAATGATCCGCATCAGGCTTTGGG
ATTTTTTATGCTTGGACTAACACAATACTTTCAGAATAAGTAAGTAATAA
TTTAATTTTGACTTCTATTAGTATTAGGCACTACGCACCGAGTTGTTTAT
CCTAGCCTAGCAATGGTGAGATATCTTTTTTCCAGAATATATTAACCACT
TCTCTTTTACACCTTCCTACACGATTTTATAAGAATATCCAAAATTGTTG
AAGCCTTCGGATGCTCTTAACTTTTAAGTTTTGAACCTAAAAACGTTCTT
AATATGTTCTTATCATTTTGTGAGTATTGTTGTCTTTCTACGAGATCGGG
TGTTTTAAAGTTCCTCAAGCCAGAAATTGATCTTAATTTGTTCTTAATGT
TTTTGCCATTCAAGCCTTATGGGCTTATGTTCTGATATAGTCTGTTCTTA
TACAAAACGTATACACTTCTTTACTCAACGGTACTAAGAGAAAAACTGAG
AGCTTTAGGTTTTCACAGCAAGCTTGTAGATCTGGTTAAGAAATTAAACG
AATATTTGCCAACGATTTTATGCCTGGATATTGAGATCTATAAAAATAAT
TCATCAGGAATATAAATTATTTCTGGAGAAGGAAAAAATACGAGATATAA
AGTAAATTACGATGAATTTTATTCTAGGTTGGAAGATGCACTCAAAAGTT
TTGAAAAATCCCTTACATTACTACGAGGAAATAAATTTGTGGATTATCGA
CAACTTGGTTTCAAATTTCAATTATATGCTTGCGAGGTAAGATGATACTT
TATATCCAAAAGAATTAAGGNCATCAGGCTTTGGGATTTTTTATGCTTGG
ACTAACACAATACTTTCAGAATAAGTAAGTAATAATTTAATTTTGACTTC
TATTAGTATTAGGCACTACGCACCGAGTTGTTTATCCTAGCCTAGCAATG
GTGAGATATCTTTTTTCCAGAATATATTAACCACTTCTCTTTTACACCTT
CCTACACGATTTTATAAGAATATCCAAAATTGTTGAAGCCTTCGGATGCT
CTTAACTTTTAAGTTTTGAACCTAAAAACGTTCTTAATATGTTCTTATCA
TTTTGTGAGTATTGTTGTCTTTCTACGAGATCGGGTGTTTTAAAGTTCCT
CAAGCCAGAAATTGATCTTAATTTGTTCTTAATGTTTTTGCCATTCAAGC
CTTATGGGCTTATGTTCTGATATAGTCTGTTCTTATACAAAACGTATACA
CTTCTTTACTCAACGGTACTAAGAGAAAAACTGAGAGCTTTAGGTTTTCA
CAGCAAGCTTGTAGATCTGGTTAAGAAATTAAACGAATATTTGCCAACGA
TTTTATGCCTGGATATTGAGATCTATAAAAATAATTCATCAGGAATATAA
ATTATTTCTGGAGAAGGAAAAAATACGAGATATAAAGTAAATTACGATGA
ATTTTATTCTAGGTTGGAAGATGCACTCAAAAGTTTTGAAAAATCCCTTA
CATTACTACGAGGAAATAAATTTGTGGATTATCGACAACTTGGTTTCAAA
TTTCAATTATATGCTTGCGAGGTAAGATGATACTTTATATCCGAAAGAAT
TAAGGCACTTTACTACGAAAAACAAATAACCCTTTAAAGGTTGGATCAGT
AGTAGGAAAGCTTCTAAAATATAAACAAACTTTGCACGATCAAGAAAAAA
CTGAAAAAGGTTGGAGAGATCATTGTCCGGGGGTACAAGAGTTAACCTTT
AGGCTTTAACCTAACCGTAACCTTTGCCTAATCCCCCCCCCCCCCTGATC
ATTGCCGTGAGATACTTAGTATTAGTACTAAACTTTTTCCATTTCAGAAC
CATCTTCACATAAAATTACAATCTTTCCTTCCTTGTAATTAACAAAATAA
TGAAACAACCCTGTGTCACATACCCAGTGGGACCCCTGCCCACTGGAAAA
ATAATAATTTGGTTAAATTTCGGTCCAATTGACTTTGTTTTCATCTCGAT
TCTAAATTCCATGTTCAAAAACTGCGCACTCCAAAACCATCCCCACTGGA
TTTTTAGCCCTGGGAGCAAAATAATTTCTGTCCCCTCTGGGATTTCGATA
GAAATTTTCACTGCAAATGTGGGAAGAAGTTCCACCGGGGCTGTGAGACA
GGGGGTAATGATAGAAACTGAATCATCCTGTTGCATTGGAACATCGATGA
TTGGAATTTTCTGTAACTGGAACTTAAATTCTTTACTTATCGTTTTCAGA
TCTTGACAAATATTGCTGGAACACACCTGAGACTGAACGACTTAGCGAAG
GCACAAGAAGTGATCCAACAAGCGTACGAACAAAGAGCTGACAAAAAACA
CGAGCGAATCATAAACGATGTTGACCGTCTGAAGGTAAACAAGGGTAGCA
GTTGATGATTATTCTTAACGTGTTCATAAAATGTTCTTATGGGATCGAGA
TTTAGGAATCGATCGTCATTCCTCTCGCTTTTAAATCTTATTCTTGAATG
TCTGTGATAATCTTTTTTCATGGTAATCAATTATGAAAACATGAAATCTA
ACATCAATATAACATGTTTATGTTCCTTTTACAGAGCAAGCGACCAAAAC
TTGATTTGTTTTACCCACCAAAAAGTGAAGTGTTCCGTCCAGCCAAAGCA
CTCGTCGCAAATGTAGAAAAGAAAGATTATCTTGGGGCTTCTAAAGTTAT
TTCTACAGATAGCGAGGAAGACTGTTATGCATGTTTCTCTGGAATTAAAG
ATAAAGTCATCGAACAAAAGGTTTGTTTTGCTAGGATCTTCGGGGAAGAC
TTTGAGGGTGCAATCTCTTTAACCTATAACGTTTTCAGCATTTTTTAAAC
GATTTAAATCGATTTAGATCAAAGATCCTTAGGTTCTGCTCCAATAAGCA
GCAAAGTAGCATCGAGTCAGATTATCCTCAATTTACATTTCATCTAACTT
TTGGGCCAAACGTAGTTATTTTTCATACTACTTTTCAAATGATAATACCA
AAAAATTTTCTTAACACGCGTATTTCTTTCTTTCAAATCTATAGAAAGCC
GAGCAAAACTCACCAAAACAAAATAAAAAACTTATCACCAAGATTGAAGC
AATGCCTGAACCAGCTAAAAAGAAGTCACCAGAAACAAAAAAGCGTGTGT
CAGCCATTCCCAAAGGAGTATTACCACAGTTAAGCATTGATCAACCTGAT
GGTCCATCGCAACAAAGATCCATGTCTGTAGGTGCAAGACCCAATAAACC
CTTACCGGTGCTGATAGCACCAAAGAAAGAATTGCCAAAGTTAGAACCAG
CAGTTGAAACAAAGATAGAAGAAAAAATCACAGCTACCGTTGAAAAGACA
GTTGAATCTACCCCAGCATCGTCAGCTTTGGCAACTTCAGATGATATCGA
GCTTGAAATTCAATACAATTTCATCAGCAAAGTTCGATTACCGAAAGGAT
TTACCATAGCTGATCTTCAAAATATTGCTAGCCAACAAAAAGTACCAACG
CATCTCGAATTCAGGTAGATATACTAAATCTTTAACTCTCACGACTATTA
AGGCTTCTTCTTTAGCTGACAACAACGCTATATAGAGATATGAGATATGA
AATGCTAGGTAATTCGATCTGCCTAGCCAGGGTGTAGTATGCAGTGCTGA
CGTGTCCTAATAAGGACGAAATGCATATGCTGCTCTGCCACCCAAATTCC
TGAAAGAAGATAGCTGGACAGAAACTCTTTAAATTTCTTCACATATATAT
ACAACACTATCATTATCAAAGAGATGATATAGCCTAAGAAGACTTCCCGA
TTACTATTCAAGTAGATAGAACCTAACCCCGATTTAACTTTCTTGATGTC
ATTGACTATGATTTTCAAATGCTCTATTATCTTTGGAACATTATCTTATT
GATATTTTTACTTGATTTCAGGCTGCAAGATGTTCTTGGACGTCAATCAC
AATTGACCGAAGATGGAATCAAATCCCTGGAGCAGCAAAAAATACATTGC
TACCCTACTACATCATAACATGATAACATCAAATTGTAGTTGGATAACAT
GAAAGTAATTTATTTTATATCACTTTGTCTTATTTATTTGCAAAAATATA
TCTTAACTTAAAAATATTTTTAAGCCTTTTTGTTCTGTATTTTAAAGTTT
TTCGTTTTTTAGAGAAAAATAATACTATCTTTTGTAACTTTAGATTTAGA
GAGGGATCAATGTCTTTGAGATTTTGTAAAATATTTTTATGTATTAGATA
TGATGATGCTACCTTGTAAATATATCTTGTTATGGCTTTAAATGTAATAG
CAGAATAAATAATACCTGAATTTGAACAATA

Gene-mRNA-Prot

This transcript is a part of the following gene feature(s):


Feature Name	Unique Name	Species	Type
XLOC_007747	XLOC_007747	Clytia hemisphaerica	gene

The following exon feature(s) are a part of this transcript:

Position

The following features are aligned


Aligned Feature	Feature Type	Alignment Location
sc0000174	supercontig	sc0000174:191660..209190 -

Expression

Values :

    GrOo_1	 GrOo_2	 FGOo_1	 FGOo_2	 EG_1	 EG_2	 P1_1	 P1_2	 P2_1	 P2_2	 P3_1	 P3_2	 PoPr_1	 PoPr_2	 St_1	 St_2	 GO_1	 GO_2	 PH_1	 PH_2	 BMF_1	 BMF_2	 MMF_1	 MMF_2	 M_1	 M_2	 GEC_1	 GEC_2	 GEN_1	 GEN_2
1.70992	0	0	1.11512	2.23534e-08	0	2.75402e-06	0	11.2474	0.1382	13.6826	1.5299	1.1895e-09	1.44072	0	1.15436	0	1.1969	4.43189	3.48292	0	1.47175	0	1.08726	8.41137e-08	0	49.3065	35.5857	0	0

Blast

[Close]

BLAST of TCONS_00013874 vs. Swiss-Prot (Human)
Match: NCF2 (Neutrophil cytosol factor 2 OS=Homo sapiens GN=NCF2 PE=1 SV=2)

HSP 1 Score: 119.013 bits (297), Expect = 3.143e-28
Identity = 70/230 (30.43%), Postives = 129/230 (56.09%), Query Frame = 3

Query:  288 MSSADDISSWYEAVQLYEVNRIDEAIEKFKSVKQ-NARMLLNTGCCYLRKNDLQTAGESFGQAVKNDPHQALGFFMLGLTQYFQNKLEDALKSFEKSLTLLRGNKFVDYRQLGFKFQLYACEILTNIAGTHLRLNDLAKAQEVIQQAYEQRADKKHERIINDVDRLKSKRPKLDLFYP---PKSEVFRPAKALVANVEKKDYLGASKVISTDSEEDCYACFSGIKDKVIE 965
            MS  + IS W E V   +      A++ F +V+  ++R+  N GC Y    ++  A ++F +++  D H A+ +F  G+  Y   K + A+K  +++L  LRGN+ +DY+ LG +F+L+ACE+L NIA  + +  +  KA+E +  A   +++ +H +I    D+      K  L+ P   P  ++FRP +  VA + KKDYLG + V+++  ++D ++ F+ ++ +  E
Sbjct:    1 MSLVEAISLWNEGVLAADKKDWKGALDAFSAVQDPHSRICFNIGCMYTILKNMTEAEKAFTRSINRDKHLAVAYFQRGMLYYQTEKYDLAIKDLKEALIQLRGNQLIDYKILGLQFKLFACEVLYNIAFMYAKKEEWKKAEEQLALATSMKSEPRHSKI----DKAMECVWKQKLYEPVVIPVGKLFRPNERQVAQLAKKDYLGKATVVASVVDQDSFSGFAPLQPQAAE 226

The following BLAST results are available for this feature:

BLAST of TCONS_00013874 vs. Swiss-Prot (Human)

BLAST of TCONS_00013874 vs. Swiss-Prot (Human)
Analysis Date: 2017-10-03 (blastx Clytia hemisphaerica v1.0 mRNA vs SwissProt (Homo sapiens))
Total hits: 1


Match Name	E-value	Identity	Description
NCF2	3.143e-28	30.43	Neutrophil cytosol factor 2 OS=Homo sapiens GN=NCF...	[more]

You are here

TCONS_00013874 (transcript) - C. hemisphaerica