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Sequence
The following sequences are available for this feature:
transcript sequence >TCONS_00013478 ID=TCONS_00013478|Name=TCONS_00013478|organism=Clytia hemisphaerica|type=transcript|length=1876bp
TCGGTATCGGTCCTTTGGGTATACTCATTAAAATGTTGAATTTAACAACA
ACCGTGACTCCAGATAcaaaccaatttaatatcacatGTAATGGTACCCT
TGTTACACATAACACAACCAATATAACATGCATCCCAAATAATACAAAGG
CCGTCAATTTTCCAATACCTGAATACCAGCCCTCCGTATGGGAGATTGTA
TCGTTATGTTTTATCTCCGTCATTGTGATTTTCGTCAATCTGTTGGTTAT
ACTGGCGTATTTTAATGGAGCTCGAAGATTAAGAACTAAAACCAATTTAT
TTGTTATTAACTTGGCTGTTACAGATACGATGGTTGGATTGATTTCAATA
CCATTCTGGATTTCTTCGTTGCTCAACTTTATCACGAAGAATCATCCGTT
ATACAAATATCTCATCATATTGGATGTTCTCTTTGGAACGACGTCAATCT
TCTCCTTAACCGCCATCAGTTTTGAACGTATGTTCGCTGTCAAATATCCG
ACAACACATCATAATCTCAACGATCCACCGTTTTATTTTATAATCGGAAT
CATTTGGTGTATAGGAATTTTAACAGCTGGTATTCGATACAATTTTCCGA
ATCCTGTTGGTGAGAAATATTACACTCTAGCCGTCCTCATTGTAGCTTTT
CTTCTACCGTTAGTGATCATCGTGTGTTGTTATTTCATGCTTTTTTACAC
GGCACGATCCATGATGGTTGCCAGTAACCAAGAGAACAATTTATCACGTG
ATTTACGTGTAGCTAAGACCATTTCGATTATTATTGGACTTTTTGTCATA
TGCTGGTTACCTTTCTTCACAGTAAACATGTGTTATTATTTTGGTACACC
GTCTTTAAGAACGAAAATGTTGTCTTCCATTGGACTTATATCAGCCACTA
AAGGGATGCATTATTCAAATTCCATGATGAACTTTTTCGTATATGCAGTT
CGTTCACCTGATTTTCGAACGGCTTTTAAAGCTTTATTGTGTAGTCGTTG
TGATAAGAAAGTCCTGCGAGAGCGATTACGGACTTTTTCGAACGCTCATA
TGCTGCTTCCAGGATCTTTACGAGTTCAGAGATTAAAGACTTCAACAACT
TCTGGAGGGTCTGGAGGAAGTCTTACAAACGTTACAACGCTACAAACTAC
CCCTAATCAAAGTTTGGTTAATTTACAGAACAATTCAGGCTCTCTTTCAC
TCTTGAGAAGTGATTCAGGTGCAACCTCCTTATTAAGAAATGGTAAAATA
CCGAACAATAATGATGATAATGTTTTCAATTGAAGATGCACTAAAGattg
atatatatttttctattaAATGGGGTTTCTTACTAACAGATTAACCCATG
GCCTAGGTTCACCCTTACGGGTTGATGTCGGTAACGTGGTGGGTCAAAAT
TGGGGCAAATCGAGAGTTGGAATTCTGGCGCCctgcattaaaaaaaaatc
tttgtaaaagttACTTAACGAGTTGCCCCCTGTTGCCACTTCGCTCCTGG
TTTATctgcaatcatggtcgtaatatttgagaaaaaagggaaattcaccg
ggaaattttgaaaccacaatcgatttgtaggtgctctaaagtaggttgga
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atgcaatgactttctTCAAGCTTTTCCAAACAAAGATTTTAGCTTCCAAC
TTTTTTCCCAAGCAACTCCTGCTTACTCTAACTAACTCTAACTAAATATC
TGATGTGCTATCCACTTATACATAATTGAAACTAAATATATTGAGAACAC
GTTCAGACAATCCtgcttgaaaatttcaaatagcaTCAGCCATTAATTTA
TTTAGGTATGGTTTTTCTATtacaaa Run BLAST on NCBI transcript from alignment at sc0000168:413291..425938+ Legend: exon Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below. >TCONS_00013478 ID=TCONS_00013478|Name=TCONS_00013478|organism=Clytia hemisphaerica|type=transcript|length=12648bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000168:413291..425938+ (Clytia hemisphaerica)
TCGGTATCGGTCCTTTGGCAACAttcgttttatttttatacTCTCTGTTC
ACCCTGTTTATTTACATGTTTTGTTTattatttactttttgtttAAGATG
GTATGATACCGTTTCGATCATATTCAATCTTTTTATTTCTCAGGATGATG
CTTATTTCATGATTCAGAGGATATTTAAAAAGATAATATTTTATGAAGCA
TAGTTCAATCTAAATCCATTCGCAAATTTACTCTTTCTCTCTATTAGAAA
AACAACAGCTATCAGATAATTTGCTTATTTATCGGTGTTTATCTGATGCC
AAAGTTCATCTTTGTATTATTCATCGAAATTTCTCCCGGGCACTTTAGCC
TGGTAACAGTTACAAGCACACCTATTAACACTATCATAAGCTATTATGGG
GCAAAGTTTAATGTTTTTTGAACTAACATTCAAAGATTTGACCCTCCAAA
GTTCGAACCAAATCTCTTCCTTCTATTTACGGTGGGGTTGTTAGATAGTC
GTTTGATATATATTTTAGCTGCTATTATTGAAGTGCTCAGCCTTTTGTTT
TTGCGTTTAATAGTGAATTTTATCATCATTTTGGAACTGTAATTTGACAT
TTCTTAATTTGAGGTTTATTATGGGTTGACGTTTTTCTTTAGCCCCCATC
CCACGCCAAAAACACACGATTTATTAACTAATTTTCCAACACGACGTCAT
GGTGTTTAAAGGAGGAAAGGGGAGTTCACACTTCTTTGCTAcataacaca
tttttttattatttggtCTTCACTTATTATCTTCTTACatattttttgat
ctttttccAGTTTCTTCTTCTGGTTCAACTTTCTtcaattttgttgatat
tttgttCATCGTATAGTTTAAAACAGAAAGCAAATTGATATaaacttttt
cttcattttgatcattttcattcCTTTTACTTTGCTGTTTTGTTCTTGTA
ATTTGGATGAANcgctttttttcttcattttcatcattttcatttctttt
tctttgctgTTTTGTTCTTGTAATTTGGATGAGGAAGAAAAGTGGATTTT
CCTCTGTTAGCCCTAAATCTTCattctttttcatgaaaatagtGAAATAT
TAGTTTTTATGAAGAGGCCCTTCAACTTTGCTTGGAAAAGGGTAGGTATG
GAATCAATTGTAAAGTCTATTCTCATTCTGTTTCGGAGAAATTTGTTGAC
ACTTGCtttgttttaatctttaaagaaggTTTTCGACATTATTCTTACAA
GATATGTATCTTATTGGTATGCTTATAACTTTGCCAGATTCGTATCAGGT
TAGCTTTTAGACCTTAGGAAACTTATTTTGGCTGGATGAGCGTTCGAGTC
AAAAAAAGTCGAAACAACTTACTTTGGCGatctttttaaaatactttcga
gttttttaaagatacttAAACGTTCATTTGATTTGTCAAAtgtgattaaa
ttaaaaaagaatacagtatatggcccccaaaatggagacggcccccaaaa
cggaggtcgtcattaaaatgaggattttttttgatggtttgagacagctt
caaaataacatatttgcctCTGAAGGACATATTTCAACaacagaatttga
taaaaattgcatataactcactctagctcctcggatagtgaaaataagtt
atgaaaatagggtataggaaactttctacacctaatgcctttcagaaaat
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aggtccaCAAGTATTTTGGGGTCCTAGaaccagcattgataaaaccgaaa
attctaaatatgagaaacagcaaaaaatcttggaattccattcctatcat
cttgaaataatagtttataacaaaaaaattaatattacgTATAaattttt
tcgctgaatcagcaaaaacggcaaattctgtcatttttttgcaaaatgtc
ggagaaaaatacctttaaagcttaatatttttagtttcagTTACAGGGCC
GGCGAAACGGGGGTGgccgggggggccatggccccccacttttttgctaa
gaaaaaaaataccaactaaccatggtggcgcctccttagacacttactct
ttggcccctccactttcaaaattgattcgccggccctgagttaagctgtt
tttctaaaactttcacagcatattccatacatgagtggaactattttcaa
aagagatttgttttcagaaacttaattaagacgttgttaaatcaaaattg
tcattttgaaaatttctaaattttcagtttggaatatttaataaaaatca
taaattttacatccatcgggtcgtaaatttaagggaaaacaaaaatatgt
tcatagtttccccccccccccccctttcacCCAtgcctaaaaattttttt
tttttaaaacccccccctttttgggggcccccccccccccccttttacca
ctgggcttaataatttgattttaactacacctacgttttgggggccccaa
acctccgttttgacaaTAAGGGGTACACTGTAAAAATttaatcaaacaaa
tttatgcccaaaaccctctaaatcatatttcaaaactatggtcaagattt
tgtattcatattttaaagatatctcgagaaatcgctaaaatttcaaacct
ccgttttgggggccatcagaaaaaagctacctattatctttaagcgattg
aaatatattgttgaaattgaaaattttgaaaaagaacttccaggaaataa
agtagagatgttaaaggttttcatgcagcaaaaatttttgtaaaatctct
tttcctctagatttgagagaaatttcaaatttgatagacgttttgggggc
cacatacttaGCTTAAATCTTGAAGTCTCCCAGTGGAAGGGACACTACTC
CAAAATGACCCCTCCCCTGAGATGACCGGTGGGTACCATATAATcatata
ctctcgggtacctaatagccgtggggattggaataagcgagggggggggg
ttggaaaaaatctcgaaatttaataagcggggggggggttggaataagaa
tgtcctgggtggaaaattcttgaacaggaggctaatacagcagaatcaGT
ACAAAAgtgggaactttcaaaaacatttttccaaaaattaataagcgggg
gggtggttggaataagaatgtcctgggtggaaaattaattagcggggggg
ggcggctattaggtacccgaaagTACAAGGGTAAAAAGGATAAGATTTTA
AAAGTGCATGATTTCCTTTTATCTAAAATTCTCCGTACCAGACCCGAGAC
TCAACAACAAGATTTACTCAGTGAAATCcgttatttttatgattttctaG
TATCTAGTTGTCAGTTTTCCAAAACCAAAAACCTCTCATCTCTATGAAAG
TTTCTAACGTTCGAGTGagcaaaacttttaaagattAAAAGAGTTTTAAT
GAAATGTATGTACCATCATTTTGTTTAAACTTCCatgatagaaaatctat
tatcaGCTTAAGATTTCAATTAAGTAGCTcatatttctatttttgtgtag
gcttgtttttataagaacttctcTGTTTAAAGTTCATTTCATGCAGTGCG
GCTTTCCTCTTATTTTCTTCAATAGCAGGAGCATGAAATCATTTGTATTA
CGTCTTTGAAGACGCCTgggttattttgaatttttggctTATTTTCAAAC
CGTTTTGTTCAATTATTATAGTAAATTTGAGGTAAAATGCCTGAAAATTT
CTTAAGGTTAGTTTTTCGATTACAGATTTTAATATATGTCAAACCAATGT
TCCCTAACATTTTTAAAAGGATTAACTTGAATCGATATTCACTCACTTGG
CCTATTTTTAATGTTTGTTTAATATTAAACTGATGAAGGAacttttgaga
aatatttttctttatgaaATAATCTCGTGGTGGTTTGACTGATGGTAGTT
GTCTGGTTTTGTCATGAATGAGTCACTGTAAAAGTTTATTAAATTCTTGG
CCTCGGCCTtgcccagctgacacacaacgttttttcaacgttcatctaac
gttaaatggacgttgtgaacattaaattgacgttgaaagaacgttgtgtg
ccagctgggtggcCTTGGTTTTATTGAGAGGGTTCATTGAAGACCCTTCT
TGGGAAAGGACTAGTACATTGGAGTTCGACACCTTAGTTCTGTACCGGGT
TCATGAGttccaaattaaaaaaactacTTTTTGCATACTTGTGCTAAACC
TGAGTGGGTGTTGTTGTTGGTATTTCTTCTTTGTTAATTAACTGTAATAT
TGCCCttatatttttaatttgatattcCAAAATCAATTTCATCGAGCTCA
TGGAGTTACAGTTATGGGTTTTGCAATTTGCATATTATTGTTTTGTTGAT
ATTGTCTTCAAAACTCGTTAGGGGTCCAACTAGATATTTTATCGGTTTCT
TTGtttcaaaaaatccaaaattaaaTTCGTTAAAAGAAAACAAGGTTATC
AAAAGATATCACAAAAATAAGCGTGAAAAGGTTCGAAAAGTGATTGCTAA
AAAACTTTGGTGATACAGGAAGTTTTGAGAAGACAGCAACATCGAAATAA
AccagtcttcaaaaaaaacatcttaaaaTTCAGCTGCGTTTTAATGTTTG
ATGAAAGCCTCAAAAAAGACGTTTGGAAggaaattaattatttttcatat
gTAATgctttttaagccatttttatttctttcgtGTACCTTTTTGTAGGG
GATAATTAGCAATCAAATATATATAGCCCCTTTAAATAGAAACAAAATCT
TtctcgaaatgaaaaaattggtcccataaaacaaaatgaactaATATTTG
TAGAGCTTTGGCTCTTTTTAACATCCCGTTTATTAATGTATACATAATTT
ATTACTAACATAATAAATATGTAATATTACctttttttaccctttttggg
tgctaaaatttttgttttattttacaaTAAAAAGTTGTTATCTCGTTTCC
GCGGTAGTGTTTTAAGGAGATTGTCACCATTTTGAGTGATGTCAATAAAT
AGAAAATGTTTTCTGGGATTTATAACATTTGTGGGATCGAATTGGACAGA
AAATTTCATCATAAGTCTTGTATACTGACGTCTGCAGACAAAAGGTTTGT
TGCAACTTAGTATGACCTACGAGCCCCATGTTTGTAACGAGATCATATCT
TGAGGAGTGGCTGTGGGTTAGATTAAAAGAAACCTTTCTtgcaaaaagtt
gattttttgtgAGTGATGAATCGGCCTGCTCCTTACTTTTCCCGTTACAT
GAGATTTTATCCTGATTCAACCAACTTggtgtttatttttcatttcatcc
gATTTTTCCATCTAGCTATTTAGTGAAATTATTAACGTGACGCTGCCAGA
CTTCATGGGGTAGgattttatttttcgtttttcctaTCAGTAGGATTTCT
TTGAGTTCccgttgttttatttttatacaactgaagtatttttgataaaa
aaagggtCCGAGTAGGTGGTCTTGTACTGTTTTAGGTTGCCCTAAAAACC
CAAAGAATAGAATATCGTTTGAATTAGCTTTCATCCGAATGTTACAGATG
ggtatctgaaaaaaaattgatttcgtCAACATTTCGTAGTTTTACAATGC
ATCGTGATGGATCTTCATGACAttgaaatcaaatattttgagaCCCTGCT
GAAACAAGGTTAGAGCCATGCTGGTCGGGCTCAATTAAAACTTATCGTAT
CGTATTCCACAACTTTGAAGAATTGCACCTGTGAAAAATAATAGCTACCA
CTCGGGAATTTAAGTGTTACGAACGGGCTAGGATTTACCCTTCTTTAACC
ATTACAACTAATAATATAAGTTGTTTATAATTTAGAGAGAATAATATcca
aaaaaaccctaaaaaccGAGCCGACTCCCCTACTGGCGTGTCAGTCtctg
ttcttttaaaaagtcaATATCTGTATCTGTATTGTATCTATCGTTTCAGA
AAACTTGTCAAAACTAATATTTATGTTGAGGTGTTTGATAGAAATTTATC
TCTGAGGTAGcttagttcatttgttttagaAATGTTATATGAGATATAAA
CAGCATTACAAGTCTGTGTATTTTCTGTTAATAATATCGAGTTACTTCtt
tctttatgatatttttgaccctgcaaaattttcttggttttTATTTGATA
TGAATCCATTTTGGTTTGGTATAAAATTCTTATATAACTTGTTTCTTGTC
TTGAAGGATTCTTCCAAAGACCCCATCTTGATCGAGTTTATCCttttttc
tgattggttgattcGTTCTGCTTGATTCAATTCTATTGGTTTATGCATTC
TCAGACTAACAATCTTTTAATGAATTTTAGGCTGTTCATAAGCtgtgatt
tattttctttaattctAATTATCTAtacctttttgaaaataaaggcaGTA
TTAAGTAATTTGGTATTTAGTGATTTTATGACAGAGAAGAAAGCCTTTGA
TTTGTAAAATCTCCGAAACCAAACGCCAGTTGCGACTTTGAAGTAAGAGG
ATTTTCATGGTATGCGTGCGTGTGTCGGCCTGTACATAAGACTTTGTGTA
CGGTATTGCTTTAATAAGATATATACAGGCGGGTACGCACACAAACGGTT
CACTGCGTAAATGGCTTCTGCTTAACTCGCTTATAGTTCTCTTACTTCTC
TTCGGAGTAAGTCGAGCATGTCAATGCATGCACGCATTCTAcattcccag
ctgacacacaacgttgtttcgacgtttatctaacgttcacaacatccata
taacgttagatgaacgttgaaacaacgttgtgtgccagctgggtttgtTT
CTTGTGGGAGGTTCtatttttgatttgttgaaagTTTTCCTCCAAGATTT
GTTTGTTGTTTGGTCGTCTGAAAGCTTGGCTTTTCTTTGGTTTCGTTTGT
TTTTAGATTATACCATTGCTACTTTTCAAGGACACTGACCCAGGAGATGT
ATTAGATTTTActcaaaaagctttttttaataagaacctGTTTCTGATTC
GGGTcaattgttctcattttttggcACTCTTATCTTGCTCTAATATTTAT
GGTAGAACTAAGATATTTTAGGCTTAGTACtgctttttcattgatttttc
ctTTAATTTGCTCTTAAATACTATTCAAGGTTCAGCATTGTTCTCATAAA
AGAACATGTGTAAAGAAGTTTACATATTGGAGAATACTTAGTCGGTTCTC
ATTCCAAAGAAAAATTCTTCAAGGTTTTAATAAGGAAGAGAAAACAAGCT
TAACGGTATTATTCGCGTGTAGAAAATCGCTGAAATCTGACATTTATGAT
TAATAAGAACTGATTTTTTGATTGTTATAGCTTGATAAGAAAATGCCTTG
GCAATTAATTTGAGATTGAAGTTCTCATTGTATGTTTTGATCAAGCTTTC
ATCCAATTAGAATAGAGGTAGCATCAAATTTAtgattttcagcttttttc
ctGTTTGATATGATGTAGTGAGTTTTTACAGAAGTATATTAATTGGCTTA
ATGGTATACATGTAGTATCTATCGATTCGAATGTTCTCAAAACACTGAGA
TAGTtcttaaagcctttggaagatCAGCATTCTCTTTCAACGTGTCTTTG
CCAGGTCAGCGAGTTTTTttcaaacacccctgtctcgttgATCTGGTGAT
CTGGTTGAAGTTTTGAAATCCACCGGGATGGCTACGAATATACGGTTCGG
CGGAACCGGgtgtgagggagtctatccccttttctatttgcgctagacct
gggagatcgaatgctgggGTGGAGCGCCTACACCTACTCtaagctcccag
taacttaccgcttagttcagattacccaatctaagctactcattcgcTGA
GTTAGCAGtaaccggggatcgaacccacaacccttagattctaaggcgaa
tgctctaccgactgagctacccggcctCGAATAGTTAATACCTGTActga
gtttttgtttttgtttgtccCCTCTGAGTGACTTTCACGTTTACCATGAC
GGTAAAATGTCACTACACTGTGCTTCTGTTTTCCCAATATCTTTTCTCAA
ATTGACCCAAGTTTGTCAACTAGTGAAAAggcttttgaatattttatttt
ggtctcataataaaaaattaaatttatagTCAGAGAGAACTACCTCATCC
CTTAACTGGAGAGTGATTGTagtaaaattaattttccttTCAACTGTTTT
AGGTGTTTTATAAAACCCAGGTTTTATTTGATATTTGCAGAAATATTTAC
ACTaaaatttctatttattttggaaatttttgtctGTTAGTTTTCAAACA
ACTTTTTCATTTAGAACGTTTCAGTTttgggattttttattttcatcagg
GCAGATTTTTTCTGTTTGTTTAtcaattttccctttttctggAATAtctg
gaaaaagaaaatattttccaagaatGAAGGTCCCGTTCAACTTTATTAAA
AACCTGCCTCGTTCATTTTTCACTCACTTATTTAGCCAGTAAATTTCTAC
TCGAGTCAGTTgaagcattgagtttcaagcccgaagggctagaggcgagc
ctttaacccttctcaggcaagagaaattgaagccacttatttcccatcca
aaacgcgcatagaaagcgccgtaatcatgacgacagaTTGTATTTAGCGG
TTCGTTTGTTTTAGAGTCGACtaacctttttttaaatctaggtATAGATT
TTATTTAGTTTTAATCCGgaatttgtgtaaaaactacgcgaatgcgttct
ggatgggaaataagtggtttcatttcccatccacgagtctcgcctctagc
ccttcggcctTTAAACTCGATGAGTTGAAGAGGATGGAATGATCATACAT
TAGCAGTCGATTTACGCATCGTTGAGGGAAGTGCAAAGAAAATTTCCATC
TTTGATGCTTATAAACGAATAGATTGTCAAGTTATGTAAgcttaaaaatg
tattttgatTGGTGATTATATACTGGGTGTCCCAACGAGTGTTTGTTACT
GTCGGGGTATACATTCATtgtacattttcatttttacaaaaCTTGATCGT
GAGGCTGTTACAATCTACTCCTCTTCGTTTTATAAATGGCAAATGGCATC
AGAACTTCAAGAATTCTTTAATAAGATATATATTCTTCCCGAGTTTCCTG
AATACCCTCATTTAAGTGGCTCAACGATTTAGCTTCAAGTTAGTGCTCGA
TGTAAAAACTCTCCTGTTCAGGTTATCTGAGTAACAAGACCTTTTTAGTC
TTAAAGTTTGTCCTGTTGTGCTTGTTTTCTTAAAACAGTGATTTGAATGA
CCTTTCAGTTTTGTTGATTGATAAGGTATCTCGTTTTGCGGTCGAATTTG
ATACTTATTAACAGGGAAGTTTGGGGTTTTTTCTTTCACCTAAAGAATTA
CTTTTCAACAACCCTTAAAATATGATACTTTGTTGGAAGGATGatcacag
attttttttctattctggAGAAAATTGAAAAGCTTATGTTAGGGATGTGA
AGTATTTGGAAGTGTTTCGTACTTATAACTTTTCAAGAAACGATTTCTTG
ACCTCGCGGGATTTTTAACCCGCAAAAGCATTGTCTTAATTTCAGACATC
TACAAAACTGCAGGTAGTATAGTGTATAAGAGCATAAattcgttagtgga
tgccagcgaCGTAGTGAAAGTACGGTTGTACAGtaatctctctctaattc
aaagaaACGTCTTTGTCCCAccaagatcgaattagagagaggtaGCTGTA
TTTATTTGGCAATTTTATTCTTAACTGTACCTTTTCTTATTTACAGGGTA
TACTCATTAAAATGTTGAATTTAACAACAACCGTGACTCCAGATAcaaac
caatttaatatcacatGTAATGGTACCCTTGTTACACATAACACAACCAA
TATAACATGCATCCCAAATAATACAAAGGCCGTCAATTTTCCAATACCTG
AATACCAGCCCTCCGTATGGGAGATTGTATCGTTATGTTTTATCTCCGTC
ATTGTGATTTTCGTCAATCTGTTGGTTATACTGGCGTATTTTAATGGAGC
TCGAAGATTAAGAACTAAAACCAATTTATTTGTTATTAACTTGGCTGTTA
CAGATACGATGGTTGGATTGATTTCAATACCATTCTGGATTTCTTCGTTG
CTCAGTAAGtgatgatattcatgacgtaatgttttctgcGGATATTTCCc
agatttttgcatttttgcacCAGTAGTGGCAAATCAAAGCTAGAGAAAAA
TTGTTTAATATTTGTCATTACTGGCAAAACACCTCTgttcaaaagaaaac
attatGTAATGAATGGATCAAATTCCAATTTTAAACTTGTACAGAGTCAC
TTAGCTtacattttcaataataaaaAAGGGTCGAGATCTGCTCTTGGTAC
GAGATAGAGCTACTTTTTGGACATTCTTACCTCATAATTCGTTAAATGCG
ATTTTAGGGATAACACCGTTTATTGAGATACAATGCTTTAGAAACCGGTA
TAAAAAATGCAGCTTGGGAAAAATGTTGCAGACCCGGGTAAATTGCATAC
CACTGCTCCTCTCCCTACACGACTTTGAGTTGTAGATTCAATACTGATTT
TGTAAATCGTCTTCTCTTGCACATAAACCCTTTGGAAAGCATTTTTGAGT
CTACTAGGAAGAATTGAAGTCAGAGTTCTATGTCTatgcactgaccttta
tatattccTGGACCAGGTTACTCAATCCCAGCCAACCTAAAGTCTTTGAT
ccgagtttttttttgaaattggtaccctaatggcggcactactcaatagc
ggtgaaaatgcatcgagagcgctagatctaattttcctcgaatacttttg
atgataatAGTGCCGGTAGACGTAAATTTTTTTGGCTTCTtttcgggtac
caattccaaaacaaactctgatcaaagatggtggatatagcttggtccag
ggatatataaaggttagTGTGTCTATGTCTAAATCAATGCGGCGGCTTCG
GATATTCTACCATTACATCTGGTAAACCCGTCTACCCAGTCTCTACAGGT
TAAAGTATCTCCAATGATAACAATGATAACTCTTTTTTTCCTCATAGACT
TTATCACGAAGAATCATCCGTTATACAAATATCTCATCATATTGGATGTT
CTCTTTGGAACGACGTCAATCTTCTCCTTAACCGCCATCAGTTTTGAACG
TATGTTCGCTGTCAAATATCCGACAACACATCATAATCTCAACGATCCAC
CGTTTTATTTTATAATCGGAATCATTTGGTGTATAGGAATTTTAACAGCT
GGTATTCGATACAATTTTCCGAATCCTGTTGGTGAGAAATATTACACTCT
AGCCGTCCTCATTGTAGCTTTTCTTCTACCGTTAGTGATCATCGTGTGTT
GTTATTTCATGCTTTTTTACACGGCACGATCCATGATGGTTGCCAGTAAC
CAAGAGAACAATTTATCACGTGATTTACGTGTAGCTAAGACCATTTCGAT
TATTATTGGACTTTTTGTCATATGCTGGTTACCTTTCTTCACAGTAAACA
TGTGTTATTATTTTGGTACACCGTCTTTAAGAACGAAAATGTTGTCTTCC
ATTGGACTTATATCAGCCACTAAAGGGATGCATTATTCAAATTCCATGAT
GAACTTTTTCGTATATGCAGTTCGTTCACCTGATTTTCGAACGGCTTTTA
AAGCTTTATTGTGTAGTCGTTGTGATAAGAAAGTCCTGCGAGAGCGATTA
CGGACTTTTTCGAACGCTCATATGCTGCTTCCAGGATCTTTACGAGTTCA
GAGATTAAAGACTTCAACAACTTCTGGAGGGTCTGGAGGAAGTCTTACAA
ACGTTACAACGCTACAAACTACCCCTAATCAAAGTTTGGTTAATTTACAG
AACAATTCAGGCTCTCTTTCACTCTTGAGAAGTGATTCAGGTGCAACCTC
CTTATTAAGAAATGGTAAAATACCGAACAATAATGATGATAATGTTTTCA
ATTGAAGATGCACTAAAGattgatatatatttttctattaAATGGGGTTT
CTTACTAACAGATTAACCCATGGCCTAGGTTCACCCTTACGGGTTGATGT
CGGTAACGTGGTGGGTCAAAATTGGGGCAAATCGAGAGTTGGAATTCTGG
CGCCctgcattaaaaaaaaatctttgtaaaagttACTTAACGAGTTGCCC
CCTGTTGCCACTTCGCTCCTGGTTTATctgcaatcatggtcgtaatattt
gagaaaaaagggaaattcaccgggaaattttgaaaccacaatcgatttgt
aggtgctctaaagtaggttggaagggtagagttttaacataagACTTCAG
ACTTAggcctcttttgacgtcaatgcaatgactttctTCAAGCTTTTCCA
AACAAAGATTTTAGCTTCCAACTTTTTTCCCAAGCAACTCCTGCTTACTC
TAACTAACTCTAACTAAATATCTGATGTGCTATCCACTTATACATAATTG
AAACTAAATATATTGAGAACACGTTCAGACAATCCtgcttgaaaatttca
aatagcaTCAGCCATTAATTTATTTAGGTATGGTTTTTCTATtacaaa
Gene-mRNA-Prot
This transcript is a part of the following gene feature(s):
The following exon feature(s) are a part of this transcript:
| Feature Name | Unique Name | Species | Type |
|---|
| TCONS_00013478-exon-sc0000168-1491911889:413291..413307 | TCONS_00013478-exon-sc0000168-1491911889:413291..413307 | Clytia hemisphaerica | exon |
| TCONS_00013478-exon-sc0000168-1510915933:413291..413307 | TCONS_00013478-exon-sc0000168-1510915933:413291..413307 | Clytia hemisphaerica | exon |
| TCONS_00013478-exon-sc0000168-1575043694:413291..413307 | TCONS_00013478-exon-sc0000168-1575043694:413291..413307 | Clytia hemisphaerica | exon |
| TCONS_00013478-exon-sc0000168-1491911889:423137..423494 | TCONS_00013478-exon-sc0000168-1491911889:423137..423494 | Clytia hemisphaerica | exon |
| TCONS_00013478-exon-sc0000168-1510915933:423137..423494 | TCONS_00013478-exon-sc0000168-1510915933:423137..423494 | Clytia hemisphaerica | exon |
| TCONS_00013478-exon-sc0000168-1575043694:423137..423494 | TCONS_00013478-exon-sc0000168-1575043694:423137..423494 | Clytia hemisphaerica | exon |
| TCONS_00013478-exon-sc0000168-1491911889:424438..425938 | TCONS_00013478-exon-sc0000168-1491911889:424438..425938 | Clytia hemisphaerica | exon |
| TCONS_00013478-exon-sc0000168-1510915933:424438..425938 | TCONS_00013478-exon-sc0000168-1510915933:424438..425938 | Clytia hemisphaerica | exon |
| TCONS_00013478-exon-sc0000168-1575043694:424438..425938 | TCONS_00013478-exon-sc0000168-1575043694:424438..425938 | Clytia hemisphaerica | exon |
Position
The following features are aligned
| Aligned Feature | Feature Type | Alignment Location |
|---|
| sc0000168 | supercontig | sc0000168:413291..425938 + |
Blast
BLAST of TCONS_00013478 vs. Swiss-Prot (Human)
Match: SSR2 (Somatostatin receptor type 2 OS=Homo sapiens GN=SSTR2 PE=1 SV=1) HSP 1 Score: 86.2705 bits (212), Expect = 5.036e-18 Identity = 75/302 (24.83%), Postives = 135/302 (44.70%), Query Frame = 3
Query: 276 RLRTKTNLFVINLAVTDTMVGLISIPFW-ISSLLNFITKNHPLYKYLIILDVLFGTTSIFSLTAISFERMFAVKYPTTHHNLNDP--------PFYFXXXXXXXXXXLTAGIR----------YNFPNPVGEKY--YTLAVLIVAFLLPLVIIVCCYFMLFYTARSMMVASNQENNLSRDLRVAKTISIIIGLFVICWLPFFTVNMC----YYFGTPSLRTKMLSSIGLISATKGMHYSNSMMNFFVYAVRSPDFRTAFKALLC----------SRCDKKVLRERL-RTFSNAHMLLPGSLR 1073
+++T TN++++NLA+ D + ++ +PF + L + + ++ +D + TSIF LT +S +R AV +P P + + ++ ++ AG+R N+P G Y + + I+ FL+PL II CY + +S + + +V + +SI++ +F+ CWLPF+ N+ TP+L+ G+ + Y+NS N +YA S +F+ +F+ +LC R D K + RL T LL G L+
Sbjct: 73 KMKTITNIYILNLAIADELF-MLGLPFLAMQVALVHWPFGKAICRVVMTVDGINQFTSIFCLTVMSIDRYLAVVHPIKSAKWRRPRTAKMITMAVWGVSLLVILPIMIYAGLRSNQWGRSSCTINWPGESGAWYTGFIIYTFILGFLVPLTIICLCYLFIIIKVKSSGIRVGSSKRKKSEKKVTRMVSIVVAVFIFCWLPFYIFNVSSVSMAISPTPALK-------GMFDFVVVLTYANSCANPILYAFLSDNFKKSFQNVLCLVKVSGTDDGERSDSKQDKSRLNETTETQRTLLNGDLQ 366
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