TCONS_00010161 (transcript) - C. hemisphaerica

Overview
NameTCONS_00010161
Unique NameTCONS_00010161
Typetranscript
OrganismClytia hemisphaerica (Jellyfish)
Sequence length12083

Sequence
The following sequences are available for this feature:

transcript sequence

>TCONS_00010161 ID=TCONS_00010161|Name=TCONS_00010161|organism=Clytia hemisphaerica|type=transcript|length=12083bp
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TTCCGAAGTAACTTCTCTTCCGATTTGAATTTCGTCTTTTGTTAGGACGA
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TCAAAGTTAACAATAAAGGTTTCCCCTTTCTTCTTCGAGAGCTCTGAATA
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TTGAGATTCACCGTCACTCGATTTGACGTGTACTTTGGTATCACCAGATA
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GTTGCTTCAGGTGTTGGAATGCCCTCGCTTTGtttggttgttgttgttat
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CGAAGTGATTTTGGATACTTCTTCGTCAAGAACCGACACATATTCGTTAA
GTGCCGATACATTATCCTCGAGAACCGAGTCTTTTTCGTCGAGAACCGAT
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GCAACTTCTCTCTCTcagataaaaatttcaggaTTATGTCTCTTTTACGT
AGGGATGTCGAGTCTTTTTGTGGTGAAGACTTTGAAGAAGTAGTTATCGT
TGTCTTGTTGTCAATTAAGGTTGGTGAAGGGTTCGAAACATCGATTGGAG
TGGTCTTCATTGTTGAGGATATCGTGTGTGTTGTAGAAATGGTCGTCGCG
ATTGAAACAAGTTTAGCTGGCTTTGCAGTAAGATGTAAGGGCTGTGACTG
AGCTTCTATCGTCGTTGTGTTTGACGTTGCGATGTTTTTTGGAGTGGAAG
ATGCAATGACAGTTGAAATCATTTTTAGCTGATCCGCTGTCAAACTCAAA
GGCTGTGTTGTTGTAGGTGGTGTCGCTTGGGTGTGAATTAAAGTCGGAAA
GATGGTATTATTGATGGTCACTGGTGGCACAACCCTGATTTGTTTtgcac
tcaaaaacaaaggttGGGTGTAAGTGACCAGTGCTGTTGGACACGTGGTC
TTGAAATAGACAGGTGCAGTATGCGCATGCGTTGTAGGGGCAAAAATCGT
AGAGTTTGTTGTCACTTTTGTCGTCAGCATATTCAATTGTTCAGCAGTAA
GTACCAAAGGTGTTGTAGGTGCAAAACTGCTCGCCGTTTGAGACTGGGAT
GTTGTTAGTGTCTTTGAAACAGGAAGTGACGTCACTGGCCGTGTTACCAA
TGTCATAGAAATCGGTGGCGTGGTAGCGTCCAGAGGCGGATCGCTCGACA
GTGTATATGGCTGTTGATTGTTTGGCGTGGACGTAAGTTGCTGACTCAGG
TTAGCGGTGGTTGTTGTTGCGACAGAGGTGCTTGAATTGACTTGATCTGA
CAACATTGGtggtgatcttttgacattgtcGGG

transcript from alignment at sc0000103:73437..85868+

Legend: exon
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>TCONS_00010161 ID=TCONS_00010161|Name=TCONS_00010161|organism=Clytia hemisphaerica|type=transcript|length=12432bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000103:73437..85868+ (Clytia hemisphaerica)
CAGAACGGCTCTTATTtcataaacaaaaatttgttcatcTAAAGTTTTAC AAAATGGAAAAACAGAAATAAAATTACCTGgagatttttcatcttcaagC TTCTGACTTTGCatcatttcaaaaatatttgatcGATCCAAACCACTCAA GTATCTACTTTCATCCACCATTCTCAAACGATCAGGAAACAATGGAAAAC TTTCgtgttcaaaatttttcaaatttccatctCCACAATTGTGCAAATTG AAAACCAAATCTATCGGACATGGACGGTTTCGTTTCTTCCGCTCAGCGTG CAAAAGTTTGGTGAAATGTGAAGTGTGATTGAACTTAGGTAACGAGGGTT GTCTCAGTGCGTTAGATTTGATCTGTCTGTGAACGAGCCTTGCTGGTTTG TCAGTATCTGTCTTTACAGCTAACGGAAAAGTACCATGTAGCAAATTGAG GCTCGATTTGTTATTAAAGTTTTTGTCAAAGTCGATGAAATTGAACTTCG AATCCAGTTCTGTTTTAGAGTCTCGATCGTATCGTAAAATGTTTCGGTCC ATACATAAACCGTCTTTGACAATCGATTCACTTGAAGAAGTTTTCTTAAA TTTAGAAGGCGAATCTGGCGAAGGTCTTTCACGTAGTATATACTTGGTGG CGGTGAGTTCCGGATTGTTTCTGTCGGGTTCCGATATACGGTATTGACGA GAGTGAAGTGTGCGGGTGGTCGTTGAATCGGGGATGATATTGTTGCTTTG TGATGGATTATAAATATTGAAGAGTTGGAAAATGTTTGGGTAATTTTCAG CGGTGAGTTCGGAGTTTGTGCAATGTCCATCATTCGTTAAGGAATCCAGG GAAACCATATTACACGATGCTGGTAAGGACTGGTCCAACCTTCCAGTTAT ATCATTAACACCAGGAAATGTTTCCATTTGAAAAACCACTATAAGCTTCT GTGAGATGTTAGGATTGTGTAtcatttgataatattttttgtattgtatt tttctctAAATGTAACATGTAACATGTGTAATATGCATTATAAGGTAACA TGTCAGGGATATCAGGAATACCAAGGCTTTTCGAATATATTTCGTGTGAC CAGGCATATAATGAAAATATACAAAGTGTGACGTGTATATTATTTCCGTA AACTTACGCTGACTGCCGTTTATTTACGCGAAAGTTTTGTTTTACGATCG TCGCTCAAAATCTTTTTCGCGAGTTCACTCATCCGTCGTTTCCTTGACTC CACCGTCGAAGAGTTCGAAAAGTTATGATGGTTACTTGCCCCAGGCTTTT GAGCATTATCATCGTCTATTACCATAGTAACCTTTGATCTCTCTTTATCA TTCGACCCAGTCCATTTAAAGTTTTGTGTTCTGTTCTTCACAATATTTGC CGAAGCTGTAGAAGTAGCTTTGTCTCGTTTGCTCGAAATTCCGTTCAATG TTCTATCTTTGGAGATCTCTGCCATCATTTCTTTATACATGTCACCCACT CTCTTGGTCTTGGTACCAGATTTTTTGATGGTAAGGCTCTCCGACGGAGT CTTGTCTGCTAAGGTGTGTTTCCTTTTAAGGGATCTGTTAGTCTCCTCCA CATTGATTCTTTCTTTCTCAGGTGGGAACAACTTTTTACGGAGAGGAATC CCAGTGGATTTGGAATTGTTTACGGAAATTTCTGTCAACATCTCCTCACA CATATCAAAGACGTTTTGATTCTCGCGTTTCTTTTTCGCATCATTTTTGG CAGGGCTGAACAGCTTCCTTGATAAAGGCGCCACGTCTATCCCTTCCTCG TCTGAGCTGCCCTCTGTTGTATCAGCAGCGTCGGCAGTCGATTCTTTAAG GTCATTTTTAAGCATTACCTTGGCTTTGCTACGGATTTGTTGTAGCGAGC TCTTCGCAATTGACTTCGACTTCGATAACAAATCACGAGATTTAACTTCT TCGCTATTCATTTGTTTACTATGATTCGACTTTATAGATGAAGCCTGTCG AAGTTCGTTTTCGTGATGAAAATCCAAAGATTTACGAACTTTCGAAGATT TATCAGTTGTCGTCGTACTTTCTTGATAATTTGAAGTTTTCGGATATTTA ACGGACAGTTTGTTTTCGGTTATGAAATCAAGAGATTTGCGAGCATTTAT TTGTTTTCTATCCGTCAATTTATGAGATGGTAGATTTTGCGAACATTTTT TCTCATTTACGAAGTTGAGAGATTTACGAGCTTTCGCGAGGGTCATTTCT ACAGGTATACAAGGAGCTTCCCCCGGTTTCATTCGAACTTTTACCGTGTT AAAgtgttttcgaaattttgattctTCTTGCTTTTCCAATAGATCGACAT GTTTCGAAAAAGGAGGTAGTTTCTTACGAGTTTTATCGTGTTTTTTAGTT ACGAGAAGTGGTTGACTAGATTTCGAGCTTTCTTTCGATATCGCAGACCT CGATTTGCAAGCTACTGAGTTCGAATTCGATTTTCCTGTAGATTGTTGGT TGTTActtgtaaatagagcttttcgaGCTTTCGATACCTCACTTGGTTCG ATATGCAAAGATTTGCGAGGATCCAAACTTTCTGCTTCTTGGTGTTTCGT TTGGAACGAAGATTTTTGAGCACTTTTACAGTCTTGCCTCAACGCATTAT CTGCCGTAAAATCTAACGGTTTACGAGCTGCTAATTTCGAGTCTTTATTT TTCGCTTTGAAAATCGGTTTGCTGATAATATCAATTTTCGCTGCATCGTt cgaaagtttcttttttgtgaGAGTTTTTCGAGGTTTCGTCTTTTCAGTTC CTTTCGTTTTCAGCCGGAATTTATCTTCTTCGAGGCGTTCTAATTGACAT CCGATATTCTCTAAATATGACATGATCAGCGGACGACGAATGGCGAATTG CGTTGAATCTGCGGATTGTTGGCGAGACGCTTTTTCAGTTTTCGTTGAGG GTTTCATGTTCATTTGCGACGAGAGACGTTTGGGTTCCATGAAAAGATTA TGCGCgcttctttttgtttctttcgtcGTAACCTTGGGTGGAGGTTGGCT TGTTATCTCTTTAACATGTTTCGAAGCCACGCCTGTTGTAAGTCGAAGTT TTTGCTGCAAAGATAGAGGTTTCTTTGTTGTGATACTGGAGCTATTACTT TCCGTTGGTGCCACCGTAGAAGTTCTCTTGGTCTTTGTTGTGATACTGGA GCTATTACTTTCCGTTGGTGCCACTGTAGAAGTTCTCTTGGTCTTTGTTG TGATACTGGAGCTATTACTTTCCGTTGGTGCCACTGTAGAAGTTCTCTTG GTCTTTGTTGTGATACTGGAGCTATTACTTTCCGTTGGTGCCACTGTAGA AGTTCTCTTGGTCTTTGTTGTGATACTGGAGCTATTACTTTCCGTTGGTG CCACTGTAGAAGTTCTCTTGGTCTTTGTTGTGATACTGGAGCTATTACTT TCCGTTGGTGCCACTGTAGAAGTTCTCTTGGTCTTTGTTGCACCTTTCAC GAGAGGGATTCGGTCATCTTGTTGCTTTCTTTGACGTTGTACCATGGAGT GGTTTATATCTTGAAATTGATTTTCTACGGCGTTTTGAGTGGAAGTCTCA TTCCGGAGGTTGGGATTAGTATCGTCAACGTTCAGTTTCCATGGTGATTT GGATGGTACAATTTGATTGGATAACGGAACTAACCCACGTTCAATCATTG ATGGAGAGAAAGTATTTTGAACAATACATTCGGAAGAAGGTTTTGCGATT GAAATGATGGGTTCTCCATCTAGCGCGCAGGAGGTTTTGTTACTCGATGC 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Gene-mRNA-Prot
This transcript is a part of the following gene feature(s):
Feature NameUnique NameSpeciesType
XLOC_005704XLOC_005704Clytia hemisphaericagene
The following exon feature(s) are a part of this transcript:
Feature NameUnique NameSpeciesType
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Position
The following features are aligned
Aligned FeatureFeature TypeAlignment Location
sc0000103supercontigsc0000103:73437..85868 +
Expression

Hover the mouse over a column in the graph to view expression values in transcripts per million (tpm).
Sort Descending | Sort Ascending | Only Non-Zero Values | Tile/Chart | Reset | Show/Hide Values

Values :
    GrOo_1	 GrOo_2	 FGOo_1	 FGOo_2	 EG_1	 EG_2	 P1_1	 P1_2	 P2_1	 P2_2	 P3_1	 P3_2	 PoPr_1	 PoPr_2	 St_1	 St_2	 GO_1	 GO_2	 PH_1	 PH_2	 BMF_1	 BMF_2	 MMF_1	 MMF_2	 M_1	 M_2	 GEC_1	 GEC_2	 GEN_1	 GEN_2
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Blast
The following BLAST results are available for this feature:
BLAST of TCONS_00010161 vs. Swiss-Prot (Human)
Analysis Date: 2017-10-03 (blastx Clytia hemisphaerica v1.0 mRNA vs SwissProt (Homo sapiens))
Total hits: 0
Match NameE-valueIdentityDescription
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