TCONS_00008603 (transcript) - C. hemisphaerica

Overview
NameTCONS_00008603
Unique NameTCONS_00008603
Typetranscript
OrganismClytia hemisphaerica (Jellyfish)
Sequence length1060

Sequence
The following sequences are available for this feature:

transcript sequence

>TCONS_00008603 ID=TCONS_00008603|Name=TCONS_00008603|organism=Clytia hemisphaerica|type=transcript|length=1060bp
CTCCACGCTACCGAAATAAACAAATGGTGGCAAATCGAATCAGATTTCGC
TGATGGCTGACAGGCTGGTCTTTTtatgtattttctcctttttctctTTA
ATTCCAAGTGTAAGCAATGGCTACCCTTTCAAATTCAAACAGCTTCAACG
TTACTGACTATCCAACAGAGGAACATCTTGAAGAAGCCAGAGGCACATTG
AAACCACCAGGAATTTTATCAAATAACTACAACAAACAAGGCTTAAAGAA
AGTTGAGAGGACATTCGTTCCATCAAAAACGACATCAGGACTAAGAGAAA
GTAACAATTTCATGCATCAAACAAACTACCAACCTTCCATACCATCAGAT
GAAAAACAATCCACCACTTATTTTGACATCACCACTAAGCACAATTCGAC
GAGTGCTTACGATCGTGTTCATCACATGACTGAAGGCTACAATCAAAAGT
TGCATCGTGACGATCGTCTACACGCAAAACAACACGGTTTGAGTTTACAC
AAAGAGgAATCTCAACGAAGAGTACCAGTAACAAGTAACGCACAGTATGG
TGCGCCAAATCGATTATTATTGGAATCGCACTCCAAAGAACATGGTCACA
TCGAGATTTGTAAACAGGATTTTAATCGAAGATGTGGGATCAATTTCAAA
TGAGTGAGtttctttgttgattttgtttttatggCAATGGCATTATTTAG
ACTGGATTCTGGAACCAACTTTCTCATTGAAGAGAGTTCTTACAATTATA
ACTTTTACAAGCATAGAATAAAGTCGACATATGGGTTGGcactgaatatt
ttcaaaaaacacaacattttgcaATTGCAATAAAGCTGTGATGAAACCTG
GCATAAACGTTTTGAtaattggttgattgattgttCGTGCGCTTCATTAT
TTTTCTTGAGGGATGTCATTTTAAATGGAGTACCTTCAAATACCACACTT
CGTCGTTCACATAACTTAATgctcaatctcaaaattagtaccttacaaaa
tttaaattttactgTGGTGTTCACCTTTGTATTTGAGATTCGTCATTTGT
CATACAGAAG
Run BLAST on NCBI

transcript from alignment at sc0000086:169063..185761-

Legend: exon
Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.
>TCONS_00008603 ID=TCONS_00008603|Name=TCONS_00008603|organism=Clytia hemisphaerica|type=transcript|length=16699bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000086:169063..185761- (Clytia hemisphaerica)
CTCCACGCTACCGAAATAAACAAATGGTGGCAAATCGAATCAGATTTCGC
TGATGGCTGACAGGCTGGTCTTTTTATGTATTTTCTCCTTTTTCTCTTTA
ATTCCAAGTGTAAGCAATGGCTACCCTTTCAAATTCAAACAGCTTCAACG
TTACTGACTATCCAACAGAGGAACATCTTGAAGAAGCCAGAGGCACATTG
AAACCACCAGGAATTTTATCAAATGTGAGTATTGGATCATAGTTTTATTG
TGGTTTCATTGTTTATTAGCTATCCAGTATTTTTGGCAGTTTTGTATACC
AAAGTTTTGGATTAAAAGCACTCAATAGTCAGTCACAAACGTGTTGATAT
TAAATAAACTCGCTTAAGGGGTCACTCACATATCGATTTTTCCTGGCAAC
TAACGTCATTGTGACGCTATCTGAAGAACCCCCCCACCCCCCCNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNTTACAATATGCATGATACAG
TAATTATGCATGGCTCTATCATTGTTTTTATGGCTGGACTACATAATTAT
TCAACAGGACGTCCTCTTTGAAAAAAGGTCTATACGGCCCATCTATTTTT
TATTGCGGTATCTCTGTTTTTATGATGATTAGGCAGGCAGTATAGACCTA
ACTGTTCATACAAAAATTACGGGAAACACATATTTGGACTTTGTACCCTA
TGCTGCAATCAAGCACTTATAAGCCAAAGTCCTGCAAATGCGGGACAAAA
ATCAGTTTTTTGAAGTTTGCAAAAAAACGCCACATAGAAGATCTTTCAAA
TTCAGTATGTGAATAGAGCAGTAAAAAATACAACTTTTCTATTTTTCCTT
TCTTTTGCAAAAGTTCTAGGAATGAAAACAAAGGGATAATGATAATTGAA
TACTATCTATTGATGACCCGCGGTACTATCGTAAAGCTAGAATCGCTTCG
CATACTCTTCGCTTGAGAAAATGATTGACAGATTGAAGTTTGTCAACCGC
GCAGGAGTTCGCGGAGCGTTCTCGGCTCAATCCTCGGACCGCGCTAAAAA
TGGTAGACTGAGCTGTGATAGATCATTTCGATGGAAGTTGTTGGAATGNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNGATGTTTGTAAGTGCACTTTATAGTTTTGATTCCCGTTGA
AGAATCATATTCTGGTTTTCATGTTATTAGATGCTGCTTTAGAGCTTTAG
GTCTACACTGTTAGGGAGATAATAACATATTCCCACAAACGTAACGGAAG
GGTATTGGATATCATCTCTGTTGTTATATTTTATGCGTTTGAATTAAGAT
GGCAGGTGTAGCAAAGGATGGAATACAAAATGTTACAGGTTTGAAAATCG
ATATTCTGTTGAAATTTCTTAGCGTCATAGGCTCTGACCACCCCACCCCC
TCGCGTCACAATGACGTTAGTTGCAGGAAACATCGATATGTGAGTGACCC
CTAAACATGTTTGTCTTTTTATTTATCCCAAACATTATTGTTTTATCTTA
GGGGTCACTCACATATAAAAAAATTCACTCCATTAAGAATTAGTGAATTA
GTGAATAAGCCTTGGAGAGCTGAGGCCATTGTTTTTTCAGAGCAACAGAA
AAAACATAAACATAAACAAAAGTCAAGAAGAAAACGAATACCGGGTAGAG
GCTGCTGATCCCGGGGCCTAGGCCAAAGGTAGCCCAACCCACCTNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNAC
ACCTGGAGCATCCTAGAACAGCTTGTACCAAATTTTAACTATGCTGAAAA
CAAAGGTGGCATCTTCAGTTACGATAACCAGAGACTGGGTAGAAAATGTC
ATCTAAAAGAGGTGAACATAAAGCAAAAAAACATATGGAGAGACTCCCTG
TCAGAAGAAGGTCCCAGACTATTTAATGCCCTCCCACAATCCATCCGTAA
CCTCAAAAACTGCTCCAAAACTAGTTTTANNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNTGATTCAAATAG
CATCAAAGTCATGGTCCATCATCGGATTTCTCAAATTGGATGATTGTTGA
GACGAACAAAGAAGCCTTCAAAAAGTATCAAAAAAAGTAAAGTATCATAT
CGATTTTTCCTGCAACTAACGTCATTGTGACGCTATCTGAAGAACCCCCC
CACCCCCTTTCTTAGCCAGTTGCGGCCTGGCATAATTTTCTTGTTGGTGC
AAACTATGAAAATTGGTGCCCTTGGTATTTTTGTCCTTATTTGCGCCCTC
CATCATTAAGTGAAAATATTAAACTGTAAGAGCAGTGACTGATTGAAAGT
AACGCCCCTTATCTTTGAAATGGAAATTTTATACCTAGTAAGTCGATTTA
GTCTATATTTTTTGCTTTCTAAAATTGTTATCAGAAAAATTACTTTACTC
TCCATTAAATTTTGGCGCAGCAGGCAAAAAATTTTGGTGTAAGAAAGGTC
AAACAGCTTAAAAGATCTTCTAAAATGGAGGAAGTTCGTCAGTATAAGAC
CACAAAAACCACAGCTAGAATCAACAAGTTTTGATTATTTTGGCAATCTC
TCATTTTGGGGGTGAGCATTTGTAACTAGGGGAAAGTGAGCAATAAATTT
GATTCGAATCGGGTTTGCTAAATAATGTTAAATTTCTCTTCTTGCAACAA
AACTTAGATGTCGAATGAAACAACAGCCGCCATCTTGGATTTCCATCAGA
ACTGACTTTCGTATCCGTCAATTAAACATTTCTAGCAGGCCGCGGAAGAG
CACTCTCATACGCCCAATTCATAAGGGCGGCACATTTTCTTTAACCCCTG
GTGGATACACAACACTTGTCTTACTTCTGATTCAATATTATAGAAGTGTT
GAAAAAATTCAAGAGAAAGGATGCAAGAGGGTAAAATAAAGCGCAGCAGA
CGAAAAAAATTAACATTGTACTCATAGAAGGCGCTATAAACGTGCCAAAG
GGCGCCGAATTGCCCAAAACATCAACAAAATTTTGGCGCCCCCTTGAAAA
GCTCTTTTGGCGCCCCTCCTAGATCTTTCTGGGTGGTGCACTGCACACCC
TGCACCCCCTGACAGGCCGCCACTGTACTTAGCGTCATTTACATAAATAT
ACCAAAAATCGATGAAAGTAATTTTTCTTCTCTATTACAGATATTGATAT
TCCAGCCACATTGATTTTTGTGCTTCGTTTCGCATGGTTTAAAACAAGTG
GTTTTGACTTATGACTTTTACATTTGTTTGTCCCCAAACAAACGGCTCGT
TGTTTTGTCATATTTATGTAGACGGTCTGTCAGCGCGGCCCTTGTATATC
AAAATACGGCCCATCTATTTTTTATTGCGGTATCTCTGTTTTTATGATTA
GGGAGATAATAACATATTCCTACAAACGTAACGGNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNCCACCCCCCCCACCCCCTTGCGTCACAATGAGGTTA
GTTGCAGGAAACATCAATATGTGAGTGACCCCTTATGTGTTCTTCAACAA
TAATTTATGTAATTGCAATTTTTGTCAGTCAGGTTCAGCATATACGTGTT
TCTTCCAAACAACTAAAACAATCCAGGGGTAAAAGTGTAGAAGGAACACA
GATTATTTTTAAAGTTGAAGAATAAATCTTTTGGCATTAGGCGGTAATCA
AAAATATGTTGCGTTCGGGTTGTCTGACCGACTGTTTATTTACAAGAAAA
CCCGATTTGGAAAGTCGGTAAAATCGTCGGGTTTTTTTAGGCGCTGTTCG
CAGGTTCGGATCTTTCCCATAATGGCGGGCACGGCGAATGGAGCATTTCT
TTGAATCATTATTTTTTGTTTACTTAACCCACATTGAGTTCCGTTCAAGT
TTTTTCATGTACCCTTATTGAAATTTTCATGTCAAAATTCAGCAACGCGG
TAGGGCCAATACCCTGGGGGCCAAAAATAAGGGTCACTTTAAGGTTAACA
CATGCACGCGCACATTTAGTTTAGCAAATTAAAGATGGAGGCATAAGATA
GACCTTTTTTTAAAGAGGCAGCCATGTTGAATAATTATGTACTCCAGCAT
AGAAACAATGATACAGCCTTGCATAATTACTGTATCATGCATATTTTAAA
AATTATGCATGGCTGTATCATTTTTTTTTCTGGATACATAACCGACCGAC
CGACCGACCGACGAAGATGTCTTAGGACCCAAATGGAACATATTTTTGAT
TGCCGTATTTATGATGAAGTCTACAATCGCAAATAACTTCTTTTGTTTGC
GTCATTTTTAAGTAAAGAAAGTCGGCAAAATAAAATGTTGCAAAAATGTA
TTTTCAAATTATGAGTCCAGGAATTGAAAATACATTACAGTAAGGGATTC
TCGACAAAAAACTTTCAAATTTTTTATCGGCATTGGGCTGATAAGGGGGT
GGGGGTCCAACTACATACCAATAAAAAAACAAGTATTGGGACTAAAATCT
TTTCAGCCAATTTCTTTCTGATTTCGTCCACAAACTCCACTGAAAGCATA
CGATTTAACTTGCTTTCACCTTTGTGCACAAATTCGCAACTTTAAAAGTA
TAATATACAGTTTTGAATTAGCTTAGATAAAAAAACTATTTTTTCATTGG
GCAGCCTGCTACTGTTTCATTCTGCTTCATTGCGTCTTTTTAACTTTCAT
TTTGACTACCAATATCAATGCGGGTATGAACAAACTCAATGTTGGTGCAA
ATAGACAAAAATTAAACGATGACATTATGGGAAGGAGGGATCAACGCAAT
GACACACATGATTGGAGAAAATTGTGTTCTCGAAGATGTAAAAGTTGGTT
TTGAAAAATTTTAGCCGATAAGAGCAAGGGGGGAATGGGTCTGAAGCTTA
TTGGCCCAATGCAATGTCGATAAAAAATTTGAAATATTTTGTCGAAGACC
CCTAAACGATTCGCTGTTTTGGTGTTTATATATGTAGACATTCCGTAACC
ACGTTCCTTGGATTTAACAATTAACCCCCTCTTTTTTTATGACTAGGGGT
GATAATAACACATTCCTGAACCTAGTAGAAGGAAAGCGTTGGATATTATC
TCCATTATATTTTGAAATTGAATTCTTGTGTGATCAATCAATCAGTCACA
CTAGGAAATCAAGGATCCAGAAATAACAGCATATGGCATCTGGCATATGT
TTGAAACAACAAGAGAAAGTTACCTGAATCAAGTTGAAGATCCCATGACT
AAGTAAAAATCAAAAGCTTATTGAAACAAAATGACCAATTACTAACGTGC
AGCATCCAGCTTACAAACCAACCAAAATTTGTTATTCAATTCCTGAGATA
GCACCTCGATTGTAAGACCTTGATTACACACTAAATTAAAAATAATTCTG
CACATGTAAATGGGTTGGTGTATGAGCTCCCGTAAAATTTCCGGGAAGTA
GCCTATCCAGTGGTGCAGTTCTCACCCGTAGATCTTTTTCTTGGAAAGTT
GCTCTTCAAATTAGTTTTTTAGGTTGGCTTGGTTCAAATCTTTTCATCTA
TGGCTTAACATTTAGATAATTTTTCATAGTTTAATCTAGTGTTAATTTTA
TTAAAAAGCGCTGGTTTATTTTTTCATAAATCCCTTTAGAAGTTTTGCGG
CGCATTTTTTTGCTCACAAGTCAAGTAGTTGATAAAGCGCTTCTGCATCA
TTAATCTTTGAAAAATAGATGGGATTAGATAAAAATCTGACAATTCTTGC
TACTTCGAAAATCATCTGTTCAAAAATGAACATCAGAAGACTTTTGTGAA
ATTTGCTTCGGGTGGAGTCCTTCACCCATCAAAACCATAATGTTGCTCTT
TTTCATTAAAAAAAAGAAGTCATTATATACGTAGTAAAGCAAAATAAACC
AAATAATTTAGATTTTTAAGCTCTCAAACAGTACAATCTTTGATTGGTAA
TTTAAATTAGAGAGACAAGTAGTATCTTTTGTTGGAAGTTTTTTATTCGT
CTAGTTTTTAGATGATAACAATCCTCTAAGCCTATTTTAAATTTTTTTAA
TTCATTTTTAAAATACATTCTAATCATATTTTTCTGTCTTAGAACTACAA
CAAACAAGGCTTAAAGAAAGTTGAGGTATGTCCTTTTGTTTTCTGTTTTT
AAAGCCTTTACATATTGAAAAATCTGATTTACTCAGAATTTTTTCCATTT
GAGGTCTCGACAGCTTTGGCTATTGAAAGTCAAGTTTGGTCCATGAAAAA
CAAGTTTGTCTTCTCAAAGACGCCTTTTCATAAATTGATTTGAGTACAAC
GACTGCCTCGTTTTGAACCATTTCCATGGTGATTATGAGTCTTCAAGTGT
AACTTTATGAAATGGACAGAAATGGAGAAAACTTATGAACTCCTCTGAGA
ATCAATTAACATACACAGCCAAGTAAGGCTTCAGCCCTGAAATAGACCAG
TTTTTTTCACTATCCCGTAAAGGACCAAATAAGCATAAATAGGGTATAAT
ATCAGGGATGGTTAAAAGCAAATTTTCAGAAAATGAGCTAGAATGCTAAG
CAACCCTAGCCCTGACCCAAAAATTGGAGTTACTTATAAAAAAAGTGTAG
CAAGATTTAAAAATGAGGTAACCGAACACGTTTTATATCCCTTTGGAATT
TTTTGATTTGTCTTCGATTAACAACACTTTTAACTTTTATTCTATTTTAT
TCTATAGAGGACATTCGTTCCATCAAAAACGACATCAGGACTAAGAGAAA
GTAACAATTTCATGCATCAAACAAACTACCAACCTTCCATACCATCAGAT
GAAAAACAATCCACCACTTATTTTGACATCACCACTAAGGTAGGTTAAAA
TCTCTTTATTTCGATTCTGGTTAGTATATTCATCTGGTGTCTGTCGGCGG
AGCCAGGAGTGCAGGGGAGTGAGGGAGTCTATTTCTTTTTCCATTGCGCT
AGACCTGGGATGTTGAATGCTGAGGTGGAGTGCCACACCTACTCTCAGCT
CCCAGTAACTTACTGGAAATTGAAAATTGATACAAACATATATATCAATA
AAAAAAACCGTACATCCTGTGCCCAAGTTCAGGAGTTGCCATAAAGCCAT
TATGGTAATAACCGGGAGGGCACATTGCTATACATTGGATCATAAACATA
TATAAATATTTCAAAATCAATCTGATGACAAATTTAAATGTCAGGGAGGG
CTAAATGGTTGTGTGTCTATTTTCTGACTGAGACTTTTAAGCTTAATTAG
ACTACTAAAATTAAGGCGTAGTGGTGTTGTGGTTTCGCACTTGACTCCTG
TCTTGGAGCTCCGAGTTCGAGCTAAGAACTAGCGGTGTTTGGACAGCGCT
TTGCATTCCTACTTGGATAAAGGAGGAATTCCAACTTTATAAGGAGTGGG
ACCATTTGAGTTTCAAGCCCGAAGGGCTAAACTTTAACTATTCTCAGGCA
AGAGAAATTGAAGCCACTTACTTCACATCCAAAACGCATCATTACGACGG
ATTGTATTTAGCGGTTCCTTTGTTTTGGAGGACTACATTTTTTGAAATCT
AGCGATAGATCCTGATTAAGCTTCGATCCTGCGTTTGTGTAAAAACTATG
CGTGGGCGTTCTTGATGGGAAATCAGTGGTTTCATTTCCCATCCAGGAGT
CTCGCCTCTAGCCCTTCGGGCTTGAAACTCGATAAGTGGAACCCATTTTC
CATGGGGAGGGCTCGTACCATTATATCATCACTGAAATTAAATTTTGTTA
TATTTCACAATTTTAGCACAATTCGACGAGTGCTTACGATCGTGTTCATC
ACATGACTGAAGGCTACAATCAAAAGTTGCATCGTGACGATCGTCTACAC
GCAAAACAACACGGTTTGAGTTTACACAAAGAGGTATGAAAAGTAATATT
ATTTTTGTTGTGTGGATTCCTTATATTTAAAATTTAGTTTTTGAAGGGTA
ACACAACTCATGAATAGCAGGATTTCAGGGAAATATTGTCTCGTATTGAA
TTAAGTTTTGGCGGGAACCTTCTCGGTTTATTTGTAGAGGCAGTTTAAAA
ATGCTGTTCAAAAAAGTTCCATGTAAATTTATCACCAATCTCCTCAAGGG
AGCCGTAAAGGGTTGATAATCGTCCTACCTTGCTTGGTATGAAAAAGCTG
AAGAAGCTTACACGTTTTTTATAAGAGCAAACTATATAAGAACATAAGGC
TTCGATGGCCGAAATGTTAAGAACAAGTTAAGAACATTTTAAGGCTTTGC
CGACTCTAAAACAGCCGGTTTCTTAGAAAAATAGGCAAAAATAGGCAAAA
ATTGGTGAAAATAAGAAAATGCTAAGAACATCCGAAGGCTTTAAAAATTT
TGGATGTTCTTATAAAAAAACTTGTATCAGTCTAGTGTTTTTAAATATGA
TATCTGTATAGGAAGGTGATGTCGGTTTTTTTTTGTTTTTTGTAGGAATC
TCAACGAAGAGTACCAGTAACAAGTAACGCACAGTATGGTGCGCCAAATC
GATTATTATTGGAATCGCACTCCAAAGAACATGGTCACATCGAGATTTGT
AAACAGGATTTTAATCGAAGATGTGGGATCAATTTCAAATGAGTGAGTTT
CTTTGTTGATTTTGTTTTTATGGCAATGGCATTATTTAGACTGGATTCTG
GAACCAACTTTCTCATTGAAGAGAGTTCTTACAATTATAACTTTTACAAG
CATAGAATAAAGTCGACATATGGGTTGGCACTGAATATTTTCAAAAAACA
CAACATTTTGCAATTGCAATAAAGCTGTGATGAAACCTGGCATAAACGTT
TTGATAATTGGTTGATTGATTGTTCGTGCGCTTCATTATTTTTCTTGAGG
GATGTCATTTTAAATGGAGTACCTTCAAATACCACACTTCGTCGTTCACA
TAACTTAATGCTCAATCTCAAAATTAGTACCTTACAAAATTTAAATTTTA
CTGTGGTGTTCACCTTTGTATTTGAGATTCGTCATTTGTCATACAGAAG
Gene-mRNA-Prot
This transcript is a part of the following gene feature(s):
Feature NameUnique NameSpeciesType
XLOC_004811XLOC_004811Clytia hemisphaericagene
The following exon feature(s) are a part of this transcript:
Feature NameUnique NameSpeciesType
TCONS_00008603-exon-sc0000086-1575043694:185538..185761TCONS_00008603-exon-sc0000086-1575043694:185538..185761Clytia hemisphaericaexon
TCONS_00008603-exon-sc0000086-1575043694:171937..171969TCONS_00008603-exon-sc0000086-1575043694:171937..171969Clytia hemisphaericaexon
TCONS_00008603-exon-sc0000086-1575043694:171223..171354TCONS_00008603-exon-sc0000086-1575043694:171223..171354Clytia hemisphaericaexon
TCONS_00008603-exon-sc0000086-1575043694:170179..170295TCONS_00008603-exon-sc0000086-1575043694:170179..170295Clytia hemisphaericaexon
TCONS_00008603-exon-sc0000086-1575043694:169063..169616TCONS_00008603-exon-sc0000086-1575043694:169063..169616Clytia hemisphaericaexon
TCONS_00008603-exon-sc0000086-1510915933:185538..185761TCONS_00008603-exon-sc0000086-1510915933:185538..185761Clytia hemisphaericaexon
TCONS_00008603-exon-sc0000086-1510915933:171937..171969TCONS_00008603-exon-sc0000086-1510915933:171937..171969Clytia hemisphaericaexon
TCONS_00008603-exon-sc0000086-1510915933:171223..171354TCONS_00008603-exon-sc0000086-1510915933:171223..171354Clytia hemisphaericaexon
TCONS_00008603-exon-sc0000086-1510915933:170179..170295TCONS_00008603-exon-sc0000086-1510915933:170179..170295Clytia hemisphaericaexon
TCONS_00008603-exon-sc0000086-1510915933:169063..169616TCONS_00008603-exon-sc0000086-1510915933:169063..169616Clytia hemisphaericaexon
TCONS_00008603-exon-sc0000086-1491911889:185538..185761TCONS_00008603-exon-sc0000086-1491911889:185538..185761Clytia hemisphaericaexon
TCONS_00008603-exon-sc0000086-1491911889:171937..171969TCONS_00008603-exon-sc0000086-1491911889:171937..171969Clytia hemisphaericaexon
TCONS_00008603-exon-sc0000086-1491911889:171223..171354TCONS_00008603-exon-sc0000086-1491911889:171223..171354Clytia hemisphaericaexon
TCONS_00008603-exon-sc0000086-1491911889:170179..170295TCONS_00008603-exon-sc0000086-1491911889:170179..170295Clytia hemisphaericaexon
TCONS_00008603-exon-sc0000086-1491911889:169063..169616TCONS_00008603-exon-sc0000086-1491911889:169063..169616Clytia hemisphaericaexon
Position
The following features are aligned
Aligned FeatureFeature TypeAlignment Location
sc0000086supercontigsc0000086:169063..185761 -
Expression

Hover the mouse over a column in the graph to view expression values in transcripts per million (tpm).
Sort Descending | Sort Ascending | Only Non-Zero Values | Tile/Chart | Reset | Show/Hide Values

Values : 
    GrOo_1	 GrOo_2	 FGOo_1	 FGOo_2	 EG_1	 EG_2	 P1_1	 P1_2	 P2_1	 P2_2	 P3_1	 P3_2	 PoPr_1	 PoPr_2	 St_1	 St_2	 GO_1	 GO_2	 PH_1	 PH_2	 BMF_1	 BMF_2	 MMF_1	 MMF_2	 M_1	 M_2	 GEC_1	 GEC_2	 GEN_1	 GEN_2
11.8973	10.7384	14.8047	14.6858	78.1663	47.8246	37.8638	37.8527	18.3218	16.6856	17.6863	22.3094	1.93655	2.48589	3.79411	5.5419	3.28262	5.23987	4.33012	2.44363	8.15291	6.25604	7.19236	7.09891	9.53379	15.5393	10.9945	8.99779	4.63265	3.48865
Blast
The following BLAST results are available for this feature:
BLAST of TCONS_00008603 vs. Swiss-Prot (Human)
Analysis Date: 2017-10-03 (blastx Clytia hemisphaerica v1.0 mRNA vs SwissProt (Homo sapiens))
Total hits: 0
Match NameE-valueIdentityDescription
back to top