XLOC_034716 (gene) - C. hemisphaerica

Overview
NameXLOC_034716
Unique NameXLOC_034716
Typegene
OrganismClytia hemisphaerica (Jellyfish)

Sequence
The following sequences are available for this feature:

gene from alignment at scaffold_250:146477..154183-

Legend: gene
Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.
>XLOC_034716 ID=XLOC_034716|Name=XLOC_034716|organism=Clytia hemisphaerica|type=gene|length=7707bp|location=Sequence derived from alignment at scaffold_250:146477..154183- (Clytia hemisphaerica)
GAACTCCGATTTCATCCTTTGCAAGCATTTTTAGGGCGGCATTTACTTTC
CCTTGCATCATAAGGTTTGAAAAGGCTTTGCACTGTCGGTTGTCGGTTTA
CGTTTTGATTCCACAAGCTTTTTCTGTATGTTTTCCCTTCAATGAGAAGG
TCTGTGAAGTTTCCTTTTTTCCACCAATCTAACCTTGTTTCTAGTTTAGC
TGAGTGGTCTCTAGCTTTACTGTCCTTAGATGGCTTCTGTAGCAATAAAG
CTGCTAAAATCATGAACACTTTCATAGCTATACAATGTAAATTGTCTTTG
GAGTTGTAAATTTCAAGCCAACGTGTCAATTCAGTTATAAATTCCTTGCC
GGCTTTCCCTGTTGGAAGTTTGAATAAATTCTTTCTCCATCGAACGATGA
TCTCATAGGTATCATTGACTGATTTGAACTCATTAACATTTACGGTGTTT
ACGGTCTGGTATGGTTTGTAATGTTTGCTCTGGTAAATGACTCTAAATTC
GGTTCGAAAACAACATCCTCTCTAACTAGCTCCAGTTCATCTGCTTCCAA
TAAAATGTTCAAAACGGTTTCTTCACTATTTATACTATTAACAGTCACTT
TATCTACATGTCTTGGGATAGGTATGGGTTCATTATTTACATTATTTACA
TTTTGGTTGGTGGGGTTTTGTCTGGTTTTGATGACGGTTGTTTGATATTT
ACAGAAAGTTCTCTTGTTTGTGTTTACGTTTTTGTATTTACAGTTTGTAT
ACATGGTGAATTGATAATATGCGAGTTGCGAGTTGGTCATGCGAGTTGCG
AGTTGCAAGTTGCGAGTTACGAGTTACGAGTTGCTATTTTAAGTAAATAA
AAGTGCGAGTTGCGAGTTGAAAATTTCACGTTAAGACATCANNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNGACTTTAGTCATGTTTAGACTCAGACAGCAGGTCCTAATTT
CAGCCCTGAATTTAGTTGCTGTTAATTATGAGCTTTTTGTTCTTTATTTT
TAGAGAAGTTGTTAGCTAGAATAAAACAAATCTCAGGCTTATTATTTTCC
AATGGCAATTTGAAGAGTAGCTGATTGACTACTATGTCTTATATAACCAG
CCCCACCAGACAGCCCATGCAGTAATGTCAACCGAGTAANNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNGAAAGATGTGCAACACTGGCGAAC
TGAAGAATGAATTTATCAGATGAGATTTAACGTAGCATCAACCAATTTAT
GGAATAAACTTCATTTTCGTTGAATTGAGTTACTAGTGTATATGTATAAA
AGTTGCGAAGCGATCGAGGCAGGTCACTAAATTCGCAAGTTGCAAGCAAA
AAGAAAGAAAGTATTGAATGAGCCCGATGAGTTCTTTTTTCTAACGTTAT
AGGGGTCTCACCAAACAAAAATGATTTATACCTTATTACATGAGTCTAAG
TATGGAATTTAACGGCCTTGAAATTAACATGAAATTTCTAAATTCGCGCT
AAATTCAACTCTGTTAATTACACGTCTCCTAATACTCATGCAAGGTAAGT
AAAAAATATTCGAAGAAAATTTTAAAATCGCGTCTNTCTCCTAATACTCA
TGTAAGGTAAGTAAAAAATATTCGAAGAAAATTTTAAAATCGCGTCTTTT
GTTCGGGAAAGCTTTTCCACCTAAACCTAAAAAGTAAATCATTTTTAATT
TTGGTTTTTATTTTGACTCATTTTACTTCCGGTTTTAAATTCCTTGTGTT
CGAAAATCGAACTTTCGAATTTTTCGAATTTCGAATGTTTCAATAAAAAC
AAACATTCGAATCCCCCTTGCCATAAATAGTTTTTTATTTGTTAGAACTC
CAGGGTAGACAGACTTTCCTCAGTAAATGATTGGTGACTCGGCGATGATA
GTATTCATGGTTTCGAAGATTTTTACATGTAAATGTTGATATCAAATCTA
GTCTTTATTTTAGAGTCCCTTGCATACAACCAAAACCCAATCAAAACAAA
AGAATCCTCGGGGTCAAGCACTATCCGGTTTAAACACCAGTCGGTCTATT
GAGACAGGGATGTGAAATACTGAGGAATTTAATATTTAATATAACCATAC
CCTACGGTGGCCTACAAGGGCAAAAATCTTACTTTCTTTTTTTTGGGGGA
ATCTTTGTTTTTTTGGGGGAATCTTTGTTTTTTGGGGAATTTTTCTTTTT
TTCGGGGAATCTTTGTTTTTTTGGGGGAATCTTTTTTTTTGGGGGGGGGG
GAATGTTTTTTTGAGTGTAAATACTGTATGAAACTAACGTAATTATGATT
TAAAACCATGGTGTATTATTCGAATACCTTAAGGGAACTATTTTTTGCGG
GAACTAATTTTTGCGGTTTGCAGTTTTGCGATTTTTTGCTGGAACCTAAT
TTTGCGGATTTCTCACTCACTTGAAAGAAAATTAGAGCCTCGTGAATTAT
TCGACCCTGTTTAACGCATTGAAAAATTTTGCGTTTGGCCCAAATCCACA
AAAACCACAAAATTCAGTCTCGCAAAAACTAGTTCCCTTAAGATATTATT
TGCTTCTCTGTTTTCCCATTCCTGTCTTCCAATTGTGGATGAGAATTTTG
CTTGTCCTCCCTGAAGATGTCATGTCAATCCCCACTTTCTTCATTTTCCG
CAATTTAAACTCCCTTAAGTAGACTCTTTGCTGGTTGAAGTGGTGCATCT
GCGTTGTATCCATTGAGTTTAAAGCCCGAAGGGCTAGAGGAGAATCTTTA
ACCTTTCTTTGGCNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNTCACTTGGGTAAGGCATCAGGTTACGCACACAAAGTT
ATACAAGGACATAAAAAGTAAAGCCAAGTTCAGTTGTAGGTATACACAGA
TTATCATCTTATAATACTTTATTATTCAATCCATATATAAGTCCATTTCA
TTTTATGGATATAAATGTCATTAAAACTCCCACTTCTAAAGAAGGCAACT
TCCAATTCATCCAACCAGATCGATGAACACAATTGGCATTCAGCCATTGA
GTGCTAGCTGACATCAGTACCNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNTGTTTTCCACCAGC
CTTGCATAACTTTTGATCTAGAAAAGGTATGGACTTTAAATTTGGCACAA
ATGTCCTCTGTCATAAAAGGAGTTCATAGAAAAAAATTTGGGTTGATGAC
GTCATCATAAAGGTGATGACGTCATCACAAAGTTTCACAATTATCGCTCG
CCAATGAAAAAGTACTATTCAATAAAATAGCAATTAAAGTTGAACAAATG
GAGATTTTTCCATTCTGTTTCGAATTTCTAAAAGCCAAAAAGAATACCTT
TAACATATTTGCCGGTTTTTAATATACTCTATTAAAATCGAGGCTTAAAA
TCTATGCAGAAAATGAGTAAATTTTTTCAAAAAACCAGCAGTTTTTGAAA
ATTTTTAAAATATTTTTGAAAATTTATCATTGATACCTAAAACCTGTCAA
AATTTGAAGTCAATTGGATGCCTGGATCAAAAGTTATGCTAAATTTAATA
TTTTGGGATCTTACCGCTGGTTTTAGCTGGATTTTATGATATGCCTGCAC
AAAAAAGTCATAAAACCTGATCTGGTCGGTGTATAATTGTAAAATTTGGT
ATACATGCTGCTACTAGGATTATATTAAAAGTCAAAAACTTTCAAAGTGT
TAAACAAAATTTTCAGTGAGCTATTAGCAAAAGGGTGCCAGCCTGGTGGA
AAACACCCCCCCCTGATAAAAATAGGGTTAATAACAATGCAATGACTTCT
TTTTCGAAATGACAAAAAAACACCCATTCAGCAGACGCTTGATGATGGTA
TAAAAAAAATATTTCTTTACCATCAAAATATACAATATTTCTGCAAAATA
AAGACAATAATCAAACTGCAAAAATGAGAAGTTCATGTAACTAAGAAAGT
ACGAAAACAAAATTTCATTTCAACTCTCGATTTTAATTTTCAACCCGCAC
TTTTGATTTTTCAACTCGCGATTTTAATTTGCAACTCGCGATTTTAATGT
GCAACTCGCATTTTTAATTTTTCAACTCGCGATTTTAATTTGCAACTCGC
ACTTTTGATGTTTCAACTCGCGATTTTAATTTGCAACTCGCACTTTTAAT
TTTTCAACTCGCGATTTTAATTTGCAACTCGCTCTTTTGATTTTTCAACT
CGCGATTTTAATTTGCAACTCGCACTTTTGATTTTTCAACTCGCGATTTT
AATTTGCAACTCGCGATTTTAATCTGCAACTCGTGATTNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNGCTTGTTAGGATTAGGCTTTCAAGAGTCAAGAGATTG
GATTTAGCTGTTTTTACGACCCTTCTTTAGTGATTTACAACCCTGATTGG
TCCTTTATTTCTACTTATGCCAAAATGTCGCCAAAATTTTTTCAACTCGC
AACTCGCACTTTTATTTGGTTAAAATAGCAACTCGTAACTCGCAACTCAC
ATATTTGATAGCAACTCGCAACTCGTAGGACCAACTCGCAACTCGTATGT
TAAAAATCCACGTATACATGTGGGTTTCAAGTTCATTCTTCGTTTGAAAA
CGCTCGC
Gene-mRNA-Prot
The following transcript feature(s) are a part of this gene:
Feature NameUnique NameSpeciesType
TCONS_00055108TCONS_00055108Clytia hemisphaericatranscript
Position
The following features are aligned
Aligned FeatureFeature TypeAlignment Location
scaffold_250supercontigscaffold_250:146477..154183 -
Expression

Hover the mouse over a column in the graph to view expression values in transcripts per million (tpm).
Sort Descending | Sort Ascending | Only Non-Zero Values | Tile/Chart | Reset | Show/Hide Values

Values : 
    GrOo_1	 GrOo_2	 FGOo_1	 FGOo_2	 EG_1	 EG_2	 P1_1	 P1_2	 P2_1	 P2_2	 P3_1	 P3_2	 PoPr_1	 PoPr_2	 St_1	 St_2	 GO_1	 GO_2	 PH_1	 PH_2	 BMF_1	 BMF_2	 MMF_1	 MMF_2	 M_1	 M_2	 GEC_1	 GEC_2	 GEN_1	 GEN_2
0.3	0.24	0.14	0.2	0.49	0.19	0.94	0.37	0.21	0.95	0.74	0.85	0.12	0.55	0.69	0.41	0.69	0.8	0.78	0.88	0.41	0.26	0.49	0.76	0	0	0.83	0.36	0.14	0.14