XLOC_031142 (gene) - C. hemisphaerica

Overview
NameXLOC_031142
Unique NameXLOC_031142
Typegene
OrganismClytia hemisphaerica (Jellyfish)

Sequence
The following sequences are available for this feature:

gene from alignment at scaffold_15:466986..487991-

Legend: gene
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>XLOC_031142 ID=XLOC_031142|Name=XLOC_031142|organism=Clytia hemisphaerica|type=gene|length=21006bp|location=Sequence derived from alignment at scaffold_15:466986..487991- (Clytia hemisphaerica)
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AATGGGTGGAACAATTGTTGTCATTAGTGGCTTCATCTTGAAAAAGATGT TTTGTTCTGCACCTAAAGTACTGAATTAAATAACAGAAGAACTTTCGTAC GATGCTTTTTTGATGGGTTTTTAAGATATTTAAGGACACGTTTTTTTTTG ACTGTACCAAAATGAAGATTCAGGGTAGGCCTTCTTTAAGTTGATATTAA AGACCCTGCTTGGAAAATACCGAGTTGAGATAAATATAGTCTGAAAGGAG TAAGATAGATCTTTCCAATCCTCTTTTTTGAAAATTGTAGCTTTAACATA CCTTGAGATATGATCATCCAAAGTCGGAGTAATTAAGGATTAGAAAAAAT CATCTCCATTTTTGGACTTTTTGATCCCTCCTTATTTTTCACCTGAAAAC TTGAAGTTTTGGTGTCAAAAACTACATTACCGGATTTGCTATTGATCGGA CTTTCTGAATCTAATATCCCAATGCCAAAATAAGGAGTAGAAAGGGATTA TTTTGATCATTTTTTGGTTTTGGGTGGTAATCCAATTTGGAGCTAAAAGA TCCTTGAGAGGCCTGAAAAAATCGGTTAAGAACTCATTTCCTACTCATAA GGCATTGCAGAATCGATATCCGAAACAAAACTTTGTAAAATCGGAGTAGT TTATGATCTAAAAGTCATCCAATATTTCTCATGATCATTTTGATCAAAAC TCACTCCTGTCGTAATTTTAGTTACTCCAAACATGGTTTTAAGAAAGTAT AGGGTTCCTGGAGTATGTTAGACCAATCAGAAATTAAAAATATAAAGCTA GGAGTAAAATATGATCGAAAACTCAAAATGACTTTTTGATCTTTATCCAC TCCGAATTTTCAAATTTTGGTTGAGTCAGGCTATTAGTCACACCAAAACA CACCAGATTTAAAGATTTCAGGTAATTTTGATCATTTTCATCCGACTTAC TCCAAATTTTCTATTTTCGAAGCTTCAAAATCATCGATTTTGGTACAGTC AAAAAAAAACATGTCCTTAAGTTCTCGAAAGTACAGTATAGACTCGCACT TATTCGAACTTATATTCAAATCTTTTTTATAATGTGAACTTATTTCCAGT CCCTGTCAAATAGAAACCGTCTATATACTTTCTATGATTCGAATCTCTCT GTAATTTGAACAAATATGATTACCTGTTTCGAGTTCGAATTAGCAAGTGT CAGCTGTAAATCATTGCTGAAGAGCGGACAAAATCCGGTTTCTGAATTAT CTTTTCGACGATGTGACTGTGTCGAAATTATGAAGAAAACAGGCAAGCAA TACAAGAATCAATAAAACAAGTTATGTTGGTTTATATTGAGCCTAACGAC TGAGTTTTTGGCACGGGCTGTTTTAATTAAAAAATTTATTCAATATTAGA TAAACACCTTTTTGTTTGTTTTTATTTATCGTTATTTCATTGTATTAAGT TTAATGAAAAATATATGATGAATCAAAAATGAAGCTAATGTATAACGTAC AAAAAAAATTATTCAAATTGATAAAACCATTAGTCAAGTATCCTAGTATC TGGTTACACTTCTGTATCAGTGACCCAGTCAGATGCGCCCCGTTGGATAA CCAAGTGAAAATAAATGCCAAAAATAATCCGATAGGATAATGAATTAACT CGGTCAAAATTTAATTGAGATTCTTTATCCCTATCAGAAGTGAGTAATTT ATGGTCTTGTCCTGGTCAACAATCATATCAATTAGGTCAATCTGGTCAAA GTCGAAAAAAACAACATTTTAATGAACTCTAGGAAAACCTGCCGAAATCA AACTCGCTAACCCTATCAGTGAAAGAGTTAAAAGCTCTCAACCAAGTGAG TTTTTGATAACTCAAATTTAAACCCGATGAAAATTAATTTTCATATAGTC AGCCCGATTTTTAAACTTCACCATGTTACTCACTGAGAAAGGGGTGTATG CTTGATAAATCATGATCAAAAAATAATGAAGCATCCGAACATTCTCACCA ACTGCCTTCTCCCTTTCTCATTTGACTAATTTCGACAGATTTTGCATCAA AAGCATTTTCTTGTCAAGATTATTTTACTACTACTTATTTTAAGCCTTGT TGAAACATGTTTAAACGTTTAGATCCTTAGTAGATCCTAAGGTCCAAATT CTTAAGTCAATACTCAGAGTAATTCTTTTCCACCCTAAGAAAAAGATGTT TAAAATGTTGTTTGGATTCCCTTTTTTCCTAAATAATTGTAGAATATATT ATAGGACTTTTTTACGACGGCTCTTATTAGCTACTTCTTTGTGACAAACT AAGTTAAACTAGAGCTGGGTTTAAAATATGGAAAAAATTGAGCTTTTTCG TAATAAGGACCGGCGTAAAAGGAGCCAAATTAGGGCCGGCGTAAAAAGGG CTGATAAGGTATTCAATTGGATTTATCTAAAATTCAACTATCATTTGTCA CATATCCAGCAAGTTTATCGATTAAATCATTCTGACTGATAATGTTTCTT CTACGGTGAAAGTTTTTTCGAATTTGTCTTTCCAAGGATCGTGTGGCTTG GTCCAGCAGCTTGCACTTCCCATTACACATTTGAAGGCAATGAAATTTAT CTTTCGGTGATTTCATGTTTTCATTTTGTAAACACTGTAACCTGTTTATC TTACAATCTTGGCATGATAATACTGCTTGTCGCTTGGCAACCATAATGAC GTCATTTAAGCGCGAATTTCGATAAGGTTGAGCATGAATATAAACTGCGA GAATAGTAAATAGAACCCCGAGTTGAAAAATTATATTTTTTGTTACTTCC TTCTCAAATGATATCATCTCGTCCCTCTTGACTGTATAAGACTCTTGTAG ATTTAGAAGTTGAAGACAGTATTTCACGCTCTTAATTTATGTAAAATGAG AGCTATTTCTCTGAAAAATCATCTCCTTTATATATAGCATCCAATTTAGA CCTTAT
Gene-mRNA-Prot
The following transcript feature(s) are a part of this gene:
Feature NameUnique NameSpeciesType
TCONS_00049032TCONS_00049032Clytia hemisphaericatranscript
TCONS_00049029TCONS_00049029Clytia hemisphaericatranscript
TCONS_00049028TCONS_00049028Clytia hemisphaericatranscript
The following polypeptide feature(s) derives from this gene:
Feature NameUnique NameSpeciesType
TCONS_00049032-proteinTCONS_00049032-proteinClytia hemisphaericapolypeptide
Position
The following features are aligned
Aligned FeatureFeature TypeAlignment Location
scaffold_15supercontigscaffold_15:466986..487991 -
Expression

Hover the mouse over a column in the graph to view expression values in transcripts per million (tpm).
Sort Descending | Sort Ascending | Only Non-Zero Values | Tile/Chart | Reset | Show/Hide Values

Values :
    GrOo_1	 GrOo_2	 FGOo_1	 FGOo_2	 EG_1	 EG_2	 P1_1	 P1_2	 P2_1	 P2_2	 P3_1	 P3_2	 PoPr_1	 PoPr_2	 St_1	 St_2	 GO_1	 GO_2	 PH_1	 PH_2	 BMF_1	 BMF_2	 MMF_1	 MMF_2	 M_1	 M_2	 GEC_1	 GEC_2	 GEN_1	 GEN_2
0.11 0.06 0.09 0.01 0.09 0.38 0.1 0.09 0.05 0.1 0.12 0.12 1.04 0.87 1.53 1.18 4.06 5.44 0.58 1.13 22.29 18.85 1.04 2.04 0.97 2.13 1.04 0.88 0.08 0.41