XLOC_022842 (gene) - C. hemisphaerica

Overview
NameXLOC_022842
Unique NameXLOC_022842
Typegene
OrganismClytia hemisphaerica (Jellyfish)

Sequence
The following sequences are available for this feature:

gene from alignment at sc0001799:32966..39987-

Legend: gene
Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.
>XLOC_022842 ID=XLOC_022842|Name=XLOC_022842|organism=Clytia hemisphaerica|type=gene|length=7022bp|location=Sequence derived from alignment at sc0001799:32966..39987- (Clytia hemisphaerica)
AATGGCTCGATGACGAATGCCAAAATCTTCAGTAAGAAATCCCTTGAAAA TTATGAAATATAGATTTCTTATTATTTTCCTTAGACTGGTTATTGGTACG GGTGTTTTTCTGCGCCAACTTTACCACGTAACATTTCTAACGCGAAATAT ATACTTTGGTTTACACTTCAATACATAATCCCTTTCCTCGTAAGAACATT GGCATCGTTAAATGTTTAGTTTTCACTGAAATTTTAGTTTTCTCACAAGA AAGTCTCTTAAATCCCATTAACATATCCGCTAAATTTTGGAACCAACCTG CATTCTCTGAAACCCAAAAGAAGTCATCAAGTTTCTTTCTGTAGGAGATT CAATTGACCGGAGCCTGCTTCATTTTCAATGATATTAGATCGTTGACATT GCAAAGAACTTAAGATAAAATGGAAGTCGTGAAGTCAAATATTCCTACAT TCGTCCCAATGACTAAATTGACGATACAGTGGAGTCTCCATAACTCGAAC ACGTACGGGGAGATTGGTTAATAAGGTATCCGCTGGCACTCGACGATGTT TTAACGTTCATCTGACGTTATATGGACGTTGTGTTGTGAACACTAGATGA ACCTTGAAAAAATATTGTGTGCTGGGATTTTTAACCAGGAAATTTGTTCG AGTTAAGGAGACTTCCGAGTTGTAAGACTAGCCACTGCTGTATTTATCTT TCTTAGNGAAAATTTGTTCGAGTTAAGAAGACTTCCGAGTTGTAAGACTA GCCACCGCTGTATTTATCTTTCTTAGGGGGAAGGAACAAACGTGCGGGAA AAGGGAACGGGGGGTCTACGTAATAACATCATCATATATCATTTAATGAA AAAAATACGGCTGTCCTCCTACTGCCAAAAGTGAAATCGCATTCTATTGA TTTTCACACCAGTGCTAGAGATTAGATGATTTAATACCCTTAGTATGTCA AGCTTCACATGATATCTTAAGCCTTCTATTTTGTACGCTAATACCATAAT AAAATGCCTTCCTTTTTGTTCTGTATTATGCATGCGTGGTTTAATACCTC ATATGTATTTGTTTCTATGTGGTGTTTTTTTTTTCAATGCAAAAAAAAGA AGTCGATGATCCCTCCTTCTATAATAACCACTTCCTTTTCCTGCTTTAGC ACTGCGAGATTCTTTTTGAGCTGCTCAGATTGTGCCCAATATCAGCTTCG TTCCCACTATGACATTCCGTCTAGTTACTATTTAGTTTGTTAATTTTCCA TACTGCTCATAAGGATTTCCCACCGGGTTTCCCACCCTCCGACTTGTTAT CTTTTTCCATCCCGTATACTTTTTTGTGATAAGAATGCTTGTCTGTACAC AGACCCAGTATCTACATCTAATTTAAAAACTCATTATTGTAGAGAAACGT GAGATACACTCTGGTACAGAGTACAAGAGTGCTTACAGCATATACCCTAA AATTAAGATGAATGCTAAATTGAGAAGACTTTCAATACTATGTGTGTTTT CGAAAAAAATATATTAGATGTACATGGAGTCTTCATAACTCGAACACCCA CGAAAAAAGCAAATCTGTTCAACTTTTTTCGAGTTATAGAGACTGGTTTA TAAAGCGTTTTTCACTAAAGGGACCGGGGAGCTTATTCGAATCAAGGAGA CATTTGAGTTATCGAGGTTCGAGTTACGAAGACTCAACTGTTAGAAGTAT TACTTAGACTCGTTTTGAATTTAATTTCGCCACTATGTTTCATGTGTAGT TGAAGATTGTATTAAAACTACCTCAGCTAAATTTGACATTTAGAAATTGT TTCCCTTATAGAGTCTACATCTTGAAACATTAATTACCGAAATATGCCAA CCTGAGGCGGTATGCTGACTGTTTCATTAAACCCAATTTCCTTTGACTTG TAAATTCAATTAAATGTCCAACGTAATCATTTTTGTTTCATAATTTTTCT CATAGGTCGCTAAGAGAATTGTCGATCGAGGGAAATTTCATTCGTGCTTT ACCGAAAGGTTTTTTGAAATTAAACCTTACCTATTTTCAATGCTCATCCA ATTTCCTGCACAAAGCATTTTGGAGAGAAACATGCCCTTCTCTAATCCAG GTGAGATCTGTCTGTCTACTTTGTCTGGCCTGGTCGCATCTTAAAAAACT AGTAAACAATACAACTAGAGGATCAAACGTTACTAACTTTTCCTGATCAA AGCACATTTCAAAGTTACAAAATATTTCTACAGTATCACAGTTTAGCTGT TGGAGTGGAGGAATAGCTGTTTTATACTAAGATATCGTTTCTTTTTCGCC CGGCGCACTTTTCCCGGACCTTAAACCATTCTCTAGATCGCTTTAGCCGG CCCTCTTAGCTTACAACCCTTAACGCTCTTAATCAGTCTTATCTCCCTCT CTTATCTACCCGTCCCCGATGTCAATTTTCAAGCCGATAAAAGGAAGGAA ACCTAAAGTCAAGAATTTTTACTTTTTTTCGCGGCTTCACCTCTCTTATT TTATGCGTATCTAGATCATTAATCGAATATTTTAATGTCACGAGAAAGTC ATTTTTCGCATGACAAAGATTGTGGGTAAACGATAACGCTACAGNTCATT AATCGAATATTTTAATGTCACGAGAAAGTCATTTTTCGCATGACAAAGAT TGTGGGCAAACGATAACGCTACAGAATGCGTACCGCAACTTTCTGATAGT CATGAATGTGGGCAATCGTTCACACACCGCAATTTTTCTGGTATTTTAAG TTAATATGTATTTTTCTTTTGATGAGGTAGCTGGATAAGCCCCCGAGTAT TAATATCAAAAAATAGATGGAAATTTATCAGGGATACGACTGTTTAAACT GGTTTAAAGAAGCTTTCAAATATAGAAAAGGCTATTACAAGATTTATTGA TTCATTTTCTATAAAGGCTAACAATTACATGTATTTTGACATTGATTCTA TTTAGTTGAAATTTTTATATCTCTATTGCCTATTACCAAAAAAAATACTT TTTTTGTATGAAAACATATGTAAAATGCCCCACTATTTTGCTGTCTATTT TTATGTATTTAAATAGAGTCTAAAAGATATTATGATGTCATGGAGTAATG ACGTTCTAAACCTTCTTCGTGCCCTTAAAAGGGAAATTAAAACCAAATCA GATATTTTTTGACCGTGTCACTTGACACCCTTACGCCCTAACTAGGTTTT TGGCCTTTTTAGGGATCCGCTCAATCAATTTGTGATCGAAAAAATACTCG CCTCTGTGTTACACCACTATTGAACCTCTTGTTGATCCCCGAAAATTTTC AGAAGAAACGTTAGATTTTTTTCATTTTGACAATGCGTACAACTTTTACT CCTTGAATAAACGTTTTTGTAAAATTTTGATAAATTCAAACGCCGCGCTC TGTGTGGCTACTGTGAGTATGCCCCAATTCATGGAAATAACGGATCGCTG AAAGTTGAATTTTGAGAATTATAGTTAAAAAATGATTTTGATACTGCTTC GTAAATAATACTTAATATTAATATTTCAGGCATATTGATAATCCAGTTTT TATTTTTTTGTCGGTTCCGGGATTTTCAGAAAGGATGTATAATTTCAAAC GAATCAACTTTTTCGCATCTCTTAGCACATATTTTGATCGTGAGATACAA TTTTTTCGGTCATGAATTTTGTTTTCAAACATTCAAGGAAACCACAACAT ATACCAACATTTCAGAGATTAAATTTTTTGTGTCTTCATGATTTTCTGAT CCTCGATAAGATTAACACGTATTAAATTAATACGCATGCGTTCGAAAATG TAGAATTCGGTTTCGGACTAAAATGTAATCCAACTTTGTCCGAAATTTAA GTTAGTTGGTCTTTCTTGAACGTTTGCCGTTAGCTAGTACGCGGGGTCGT TTAAAGCACCATTGATTTTTTGGGCAAGATAGGCTTCAAAGAACGTTAAT AAATGCTTGTATCTTGAAATTGAATATTTGATTAAAGCCTTGAAACTGGC ACTCAGTACCTAGCACACTCAGTTTATAGTTTTTTCAGTTTGACCCTCTC ATAAATGGCCAAGGTTTTGTCGGTATTTGAACTTTTTCAAAGCGCCATAT ATCGTACGTGCAAAAAGAATTTGCTTTTTTATGTTTTCGTTATCTTGATT AAATCATACCAAAATATCTGTGACCGCAATCTTTGCTGTCTCCCTTCTTC CTTCACACCCCTGTAAACCTGTAACCCCATATTCTCCCGCCACCCACCAT CTTTACTCATCATGATCGTAAATTCTCGTTAGTGGCTTGATTAAATTTTT ATTTCGACGCGCAATTTTGATGGCTAGCTACTGACTTTCACGTGGTATTT ATATACCGGGAATTTATCTCGTGTTCACAAAAATAAATAAGCAGTTAAAA GAATTGGCTACAATTTGGAGCGCTTAGAGTTTTTTGTCAAGTGTGCTAAG CCACACGCTACTTAACTAGACTATAATCTGTTAATATCATCTTCCCTCCG GTGTAGCCTATGAAATAGTGTCTATTATAAGTATTTTTGGTCAATTTCTG ACCGTATTAGGGTCCTTCGGGCCTAAATTGTGACTCTCGATTCCAACCCT GACCCTAACTGAACACAGTACAAACAATCTGAACGCAGATTTGAGATCTG GCGATGCTTTCAAATATTCTAAAAAATGTCGTGTCATGATTTTATAACCA GTTAAAAATTAAGTGTCCACATACTATTGAGTAAAAGATGCCACAATTAT TGACTCTTTGACACTCATTTTGCCGTAAAAAGTTACTATGCGATCAGAGT CAAAGGGACCCGAAAGCTCCTTTTAATTTTTTGCAGCATTCCAATATTCT TCTACAAAATCTTTATGCTACTGATATTTTTCTGAAGCAATTCAAAGCAT AATTCACTCGGTGGTTTTACCTTATTACCTTTAGACATTGGAAGAAATGT GTGTGAATGTGCTTTTGAATAATGGTATTGAGAAAGAAACGTCACTTGAG GGATTGATACGGAAACCTTTTCAGTAAGTCATCGTTGTCATTTTTTTTAA TCTTAAGAGCAAGAATCGATATCTATCTATTATCTCGAATAACTTCCTAT AAATCGAATCTCTCTGTTGATTCGAGCGGATTAAGTTTCTCCCGCTCAAG CTCGAATTTATCAACCGTACACTTTTTTATTGAATGTCAATAATTTAGAA ATAAAGCTAATGCACTCATAAACAACGCTCTACTATCCGATACGCTCCCT TATTCAATGTATTCAATGAAAATTTCCCTCGAACGTTGAACACAAAATGA TTGTCAACTGTAAAAGTTATCTTGGTGTGACCGTCTTAGATAAAAAAACT GCATGAAAATCTAACATCTGGCTTTGACTAAAAATGCCTTAGTATTCGTA TTCAAACAATCCACTANAAAACGAAGGTCTGGCTTTGACTTAAAATGCTT TAGCATTCGTATTCAAACAATCCACTCAAGTTCGATACAAACCTACAAGA GAATGACGCATAGGTCATAATCAAATTAATTGGATATAGAGACCCAAGAT GTTTCTTTTTGACGATGAAAACACCAGTTGTGTTTTCCTCTTTTTCCCTA TCATGTCGCGGCCGTGAAACATGGGGGAAAATTCAACCTACTCCTATTTT GTAGAATGGATTAGAAACCCAGCTGATGCATGTTAAATGAATTTTTCATT TTTATTTTTCTTTACAAAGAGTCATCATATATTCCTTATTTTTTTTAATA TCATTAAACGTTATTAATTAAGATGATTAAGAAAAAGGTACAAAATTAGC ATCTAGTTGCCATAGCAGCCGAAAAGGATTTAAAACCTTTGGATTTGTAT GGCAGGAGATTAAATTCCTCAATCCTGATCTCCTTTCATCCAAGCCACAG GAGGTCTTTGCATATTTTTACTTGGATGTATGACGAATCTATTTCTATTA CAATTTGAGAGATTCACTACCGTCAACTCGTGATTTTTAGAAATTTTATC TCTTGGATTTTGTAAAAAAACATTCGGCAGTTAAACAATGCGTTGAAATC CAGAACTGACGGTCGATTTAATACTTCCCCAAATTCAGTTGCGAAAAATT AGTGAATCTCTAAATCTTCCATAGTTTCTCCCCTGATTAATACGAAAATC CAACTAAAAACCGTCTTGAAACTGAAAACTACAGGATCGAGGCTATTCCC AACCTCAATTTTACTTTTGTTGCCATTTTTAGGTTTCCAAATAAAAGGAA AATTCCAAATAATATCAAAGCACGCTTGTAATATAAGGTTGAAACGTGTT AATAAAATTTTGAAGAAAGCCTTTGGTAGCTGGAAAGAGGTGCTTCCTCA CAGTTTTTACATATAGAACCAGCACGATATGATAGCTTTCGAAATCACAC ACTCAGTCAACTAAGTCATACTGTGTTTACCTAACGAAAAGAACAGTTTT CTCTCTCACTCAATCACACCTTTTTCCCTTCTCTTCTTTTGCTACCAGCA GATCATTGCGTTGTGACTATTGCAATTCTCGCATACCACTGGGCGGCCTC TATACCATTAAACCGGTCGCCGAAATATTTGGCGCCAAAAATATGCCCAT TTTGTTTTATTTATGTTCGACGACTTGTCGTAAACAACTTTTGGTTTCTA CGCATATACCACGGTTCGATGAGGATGGAGCAGCTCTGGAAAACTTTCCA ATGGACTAAAAGAAACTATGTAGAATGAATATAACGATTATAATTTGACA TTTGAATTTGTATCAAACTATTCAACCAGCCGTACATTTATTCTCCAGTC AAATCAACTAATAAACTGCCTCAATGGATATGTTTTAACGGATTTCCAGG TAGCTGGTCTTCCCAGAAATATTTTTTTGTCCATTCTATAACTGCTACCA GTATGTGAATTTGTGAGGACCTTTCTCGGTAGAACCCTATCGGTCCTCGT CACGACACGAAATATGAAAAGAAGGCCACGAATGAATACAAAAACACAGA AATAACATGTGCGTCGAACTGG
Gene-mRNA-Prot
The following transcript feature(s) are a part of this gene:
Feature NameUnique NameSpeciesType
TCONS_00038213TCONS_00038213Clytia hemisphaericatranscript
TCONS_00038212TCONS_00038212Clytia hemisphaericatranscript
The following polypeptide feature(s) derives from this gene:
Feature NameUnique NameSpeciesType
TCONS_00038212-proteinTCONS_00038212-proteinClytia hemisphaericapolypeptide
Position
The following features are aligned
Aligned FeatureFeature TypeAlignment Location
sc0001799supercontigsc0001799:32966..39987 -
Expression

Hover the mouse over a column in the graph to view expression values in transcripts per million (tpm).
Sort Descending | Sort Ascending | Only Non-Zero Values | Tile/Chart | Reset | Show/Hide Values

Values :
    GrOo_1	 GrOo_2	 FGOo_1	 FGOo_2	 EG_1	 EG_2	 P1_1	 P1_2	 P2_1	 P2_2	 P3_1	 P3_2	 PoPr_1	 PoPr_2	 St_1	 St_2	 GO_1	 GO_2	 PH_1	 PH_2	 BMF_1	 BMF_2	 MMF_1	 MMF_2	 M_1	 M_2	 GEC_1	 GEC_2	 GEN_1	 GEN_2
1.2 1.77 1.04 1.03 30.52 19.52 9.38 8.39 5.85 8.73 12.83 5.33 0.75 1.39 1.19 1.43 2.05 2.38 2.51 1.14 1.73 2.55 2 2.44 9.35 7.13 4.28 3.36 1.73 1.46