XLOC_019166 (gene) - C. hemisphaerica

Overview
NameXLOC_019166
Unique NameXLOC_019166
Typegene
OrganismClytia hemisphaerica (Jellyfish)

Sequence
The following sequences are available for this feature:

gene from alignment at sc0001021:22777..43852-

Legend: gene
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>XLOC_019166 ID=XLOC_019166|Name=XLOC_019166|organism=Clytia hemisphaerica|type=gene|length=21076bp|location=Sequence derived from alignment at sc0001021:22777..43852- (Clytia hemisphaerica)
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ATCACACCCTCAAATCTGGGAAGTTTACGAAAGGTCATCAACGACACAAC TTTAGATGTCTTTTATTACACAAGTCCTTTTTATCGTGAAGAGGTAATCA AGATAGTATATTCTTTCTGTATTTCGTCAATAGACTTTTGAAGATATTTT GTTTAGACACGGTCGCTATGGTTGAACATTAGTCCATAAGGAAACTACAC GCTTTTTTTTATAATATCATTGATATTCTTAACTTTTTGGGGAAAATCAT CGTAAAATATTCTTACAGCATTCTTAGGTTAGGATCCTAATTCGGACTAA ATTTAACATTTAGTACATACCTCTCAAGCATAAAATGGCATTTTTGTGAA GTAGTGGACCTTACTTGAGGGTAATTGGCAATTCAGAATTGAAAATGCTC TAAAAATGGCATTCTTAGCTTGAGTAGCCAACTTCCATGATGGTGATATT CTTAGCATTATTCTTAATTTTTTGCCATGTTCATCATGGACATTCTTATA AAAAGTGTATTCTTATAACAAAATAAGCGTGTGACCCGAAAGAAAAATCT CAAAACGTTAGGAAAAGGGGAATTACAAAAAGAGTAAAATAACAACAAGT CGACCGCGTGGGTTTGAAAAGTATATTTCAAGCCTTTGAACGAAGGAGAT TCTGCTAGGTGGGCGAAGGTGTGAAATGTACTTTTCACGCCCGGCTGGAT CACTCATTAGTGAGTTTATGTATTTGCACTTGTGAGGACGGTAAAGTAAC TGAAGCGATTTGGAAAAACCCGCAGTTTTGACCGGGAAATCGAGGACGGT AAAAGTGCTGATTTACCGTCGCCCTCAGCTGGTCAGGATGTAGTCAAACT AGAACCTTACCGTCTCCGTCGCAGAAAAACACACATACATAAACTCGGTA TCATTTCCTGTGCAGCGGTGTGCGGTTAAACAAAACACACTGTATTATTC AATATAAAGAAAACGGGATCGGATTGATGTCGAATCATAACGTTTGGTAG GGTTTCTATGGAACCCTGAAAACCTTGAACCCCTGTAAAATGAATCTTGA AAACTATGAATATATTATTATTTTTGTAAAATTTTGAAAGCTTCCTGTAA ACTTTGAAAAGCACCGTTACTAATAGCATGTGCTTGTCTTGTTTTGACTC CGCTCATTACATCATTTTTATTACACCATTCTTTCCACCTACTAAAATGC TGCAGCTGCAAAATGCCATAGAAAAGTATAAAAGGAAATTAATCTTACCT ATAATCATTTTAATACATTTTAAGGCCAAAAACGTTGAAAGTTTTGAAAA TGTCATACCAAGTTGCTCGCAATATATATGTGAAGAAATTCAAAGAATTT CTGTCCAACTATCTTCTTTCAGGAGATTTGGGTGGCAGAGCAGCATATGC ATTTCGTCCTTATTAGGACTCGTCAGCACTGCATACTGCACCCTGGCTAG GCAGATCGAATTGCCTATNTAATCTTCAAAAATTTTATTACACCATTCTT TCCACCTTACTAAAACGCTGCAACTGCAAAATGCCATAGAAAAGTACAAA AGGAAATTCATCCTACCGTTAATCAAATAAGTATCGGAAATCAATGAAAA ATACATTGCACGTCCACAAAAACTTAAAAATCCTCTATATTTGAAGGCCA AAAACATTGAAAGTTTTGAAAATGTCATACCAAGCTGCTCGCAATATATA TTTATATAGTATACACCTATATAAGCTCTAAACGTCGCAAAGGGCTTTAG CCAAGTTTACCTGGATGGAATGAGAATATCAATGCAATGACTTCAGAGAT TTGACGTCAATGCTACCTGGTAAACTATGGGTTAATCTAAGGTTTGATGG TTTAATAGGTGCTTTGGTGTAATTAAATTAAGTTTTACTTTTGAACTTTT TCGCAGATCATCCAAGCATTGCGCCGTGAGATGAACGCAGTTTATTTGAA ATTCATTGAGCGTAATCCGTCATTTGAGAAGCGGAACGGCAAAGTGTCAA TAATTGCGCATTCACTGGGTAGTGTGATCATTCATGATGTCTTGACGCTG TGGAATTCGTACCTTATGAAGGAAAAGAAGAAGATTGCTGACACCAATGT TGCTTCTCACAGCCACGAAAGGTATTTATTATAACACTTTCATGGCTTGG GTCTCTTTTATTTATGAATTTGAGAGGAATATAAAGAAAAAGGGTTTCCC GGCAATCACAACAGTGAATTTGACTCTAACTACTCTCTAATAATACTCGA CTCTGGATAAACATTGAATGAAACCGTGGATATCTCCACTGTGGTATGAA AATCTTTTGGTGGCACGTGATGGTTTTTCCAGTTGAAGAGTGAAAATTTC TGGTGTCAATATTCAATTTCTTATACATAGCATGTTTTTGCATCTTTCTC GCAATTACAAACCTCATAACGTTGTATAATTAGTAATTTGAATCTCAGAG GGGAACTGATGTATTTGATGTGTATTTTGATGAGAAATGCAAATAAGATG CTATGAAGAATCATTTTAATGGTGGAAGGAGGGTGAACAATATAGTCATT ACTGCGGACAAGGCTAGAACATGAGAAATCGGAAAAAACAGTCAATTGTT AATCTAGTGTCTGTAATAATTCCATGATTTTAACTTGATAATATCCTTGT TCTAATTCAGAGCAGTTTCATGGCTTTGGGGATGGGGTCGTGAAAAGCAG AAAGCACCGAGCTCCATATCCTTGTGTTCTGAAGATGAATTGCATGCTCA ACTTCACGAACTTCGAATGAAGATGGCCAAAATTGAAATGAAAATAGCAG TGGGCTATAGAGACCTTTTTTTTCAAAATTAAGTTTGCATAATTTTTTTT GGTTGGTTGGGACCCAAATAACATAAATCTAAGATATTTTTGGATATTTC CAAAAAATGGCGGTTCTCCGCCCTTTTTTATGCCCAAAATGGGCCATTTT CAGGCCATTTTGCTTGGAAAAAAATTCTAAAACCTGCTGTGTTGGTGCTA CAACCATCAAATTAGGCTCAAAATGA
Gene-mRNA-Prot
The following transcript feature(s) are a part of this gene:
Feature NameUnique NameSpeciesType
TCONS_00033099TCONS_00033099Clytia hemisphaericatranscript
TCONS_00033098TCONS_00033098Clytia hemisphaericatranscript
The following polypeptide feature(s) derives from this gene:
Feature NameUnique NameSpeciesType
TCONS_00033098-proteinTCONS_00033098-proteinClytia hemisphaericapolypeptide
Position
The following features are aligned
Aligned FeatureFeature TypeAlignment Location
sc0001021supercontigsc0001021:22777..43852 -
Expression

Hover the mouse over a column in the graph to view expression values in transcripts per million (tpm).
Sort Descending | Sort Ascending | Only Non-Zero Values | Tile/Chart | Reset | Show/Hide Values

Values :
    GrOo_1	 GrOo_2	 FGOo_1	 FGOo_2	 EG_1	 EG_2	 P1_1	 P1_2	 P2_1	 P2_2	 P3_1	 P3_2	 PoPr_1	 PoPr_2	 St_1	 St_2	 GO_1	 GO_2	 PH_1	 PH_2	 BMF_1	 BMF_2	 MMF_1	 MMF_2	 M_1	 M_2	 GEC_1	 GEC_2	 GEN_1	 GEN_2
24.23 21.32 21.67 19.59 15.18 11.05 14.13 16.39 20.98 21.75 25.41 29.35 32.2 32.37 19.22 24.3 22.68 26.91 14.18 18.07 17.98 17.75 25.09 27.16 55.15 47.74 16.84 13.99 23.51 21.67