XLOC_016744 (gene) - C. hemisphaerica

Overview
NameXLOC_016744
Unique NameXLOC_016744
Typegene
OrganismClytia hemisphaerica (Jellyfish)

Sequence
The following sequences are available for this feature:

gene from alignment at sc0000744:37273..46452-

Legend: gene
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>XLOC_016744 ID=XLOC_016744|Name=XLOC_016744|organism=Clytia hemisphaerica|type=gene|length=9180bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000744:37273..46452- (Clytia hemisphaerica)
AACTAACCCCAGGTATGCAGCAGGGCCGCGAAAGGACAGAAGAAATAATC TTCTTTCAAAATACAGCTACTCATTTTGCCTTGGAAAGGACAATAAAAGA CATAAATCTTCCTTAGTTCAAAATACATGTCCTTGAGAAGGACAAAAGAA AATAATAATGTATAAATGTAAGTAGTCTTCAAAAAATACTTTAAATGTAA GAAAATTTCGCGATTTTCCTGAAATGTCTGCAACAATAAAAGAGAATTAA GCGCTATACCTCTTCTTGGAACTCTTCTTCATCGTCATCGTCGTCACTTG CTGTATTATTATTATTGTCTTCATGTTCTGTGTTATTAGCATCATTTGGA CCTGTCTCATTCTCATCTACTGTTGCTCTCTCTAGCAAGCCAAGAATGGC TTTATGATCTTTGCGGACATGGCGGTACAATGTATCATATTTAATGAATT TACGAAAACAATCTTCAACAGGACACAAGCAAGTAAAGTTTTTATCTATT CCATGGATAAGATTTAAATGACTTAAAAGACCCTTCAATGAAGTGCTTAA GAAGTGCTTGCATAGTTCACATTGCCACATCTGTATCTTGATGATGTAAA ATAAAACCTGCTCTGAATTGAAGAGTTTTTATCTATGTCCTGCAAACATT TTTTCATTCACATAATATACAAGTCTCTGGAAATTATAACTGGAGTTAAA AATCTCGATACTTACACCTCGTACCAATACAGTGACACCAACATCGATTG GAACAATAACATAATAATTTATGACAGCACAGCGGCATAAGTATTCGTTC TGCCTGTCTGCTGGCCAGATTTTACAGTCCAAAAACGCTGCCCTGTTTGA ATCAAAGCTCCGGCTGCCATTATGATCGAATAGTCTCCTTCCTAGAGGAT TTTCGTATTTTCCGCAAATATCTAAACCATGTGAAATCGAAAGAACGAAG 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CTTAATTGATATATATCCCTGTTTGGAACGAATAAAACCTAATGGCAAAC CAACGAAGGTATCTATTTTTCTTTTATCATAACGTACCACTCTCATCTCA AGTCTTAAGTCAAACCTTAGGATAAGTGAAATCTTTTCTAGTTTACTCTC GAGTACATAATGGGGCTGCAACAAAATGTCGTGGATGGAAAAATCTAGAA AAAACAGGCTGGTACATAAAAATAAAAGGAATTTTCCACAAAAAAAATTT CCGTCTTAAAAGAACCTGAAAGAATACAGATCCTTCATTGAAATGCGCTC ATGGCTTTAGTGAGCTTAGTACGCCTTACTACTTTCTACTCACATTTAGG GTGTATTTTTGGCAAAGCTTCAGAAACGATTGAGAAACGTCAAACCGGTC AAAAATCCACAAGGCAAAATTCCTCAACGCTCCAAGCTCTACAAGAAAGA GAATGGTCAACTTGACTCGGACAAAATAGACGAACGAAAAAATCAGCAAC ATCAACAGCAGCAACAAAACCACAAAACCACAAATTTACGAACACAAGTA CCTGCACAAAAGTCACTCAATTTTGAAGATAATGACGAAGATCTCTTTCA ACAGGTACAAAATATTGCCCAGATCACCCAGACCAACTCAGATGCATTAG ATAGATATTCTGTGTACTTGGATCGAGAATTGGAAAGCTCAAAACCGGAT GACGAAACACTGACCCGTTATTGTGATTTACTGTTTGAGTCCCGCAGAGA AACGATCTTGGGAGTAAATTATGAGCGACGGATGGCGCTGATAAAATCAA ATCATAAAGTTTTAGTGCAGCAACCGATGCAGGTAGGGTTTCCTAATAGA TTTAATAATTACTCCCAATTCAAGAATTAAAGTTTTACTTTATACAATTT AGCATGAAACGATTTTTGAAAATTTGTAAATTATTCCTGGACTATTCTTC CTATCATACACAAACAGCAGGTATGCTTTCAGGAGTCAACTAGAGACGAT TCCTTTCCAAGAAATGAGCGAGTCTGAAATTCATTAAGACATAAAAAAAT AATTTACCACATAGTATTCAATCCAATGTCATCCATTTTATTTTCAGTTA ATCAGAGAGGTGGGGCGCATTCTTCATCAAGAAACAAAAATGTTTACACA AGAGGTCATCAAAAGGCTCTCAGTACTAACCGATTCGCTCCTCCCCTACG TATATACGAAGTTCAACACCAACAAATCGCTAATCGAAACATTGCATAAT CCAAACTTCAATATTTCATGTAAGTATTTCTGACTTTGTTGCTTTGTCAC CGTGAACTGAGTTTTAAAGGGTATTTCTGAAAACTTAAGGGTCTTATTCG AAAATTAGTTCTGCCTCCTTGCTTTTTGTTAATGAATTTATTTTGATTAT TTCTAGGGACCAAGCTGGTATCTATCCTTTCCGTCATCGATGTTCTATTT GATGGGAAGAAAAAGAAGAAATCTATCGTTCAACTGATCCATGTAAGTAT ATTTTCAATTCCGTCACAAAACATTTTTATCGAAATTATGCATAGGGAAA GAACACTATACTAACGAAAACAGTGTATGGAAAATATTTACATTAATTCT TCTCTGATCATACCTGTTTGCTCATGCTCTCCGAATAGGATGTTTCCGAT AGGATGGTGAATGAGTGCTTTGACCTTTTTGCGTATACGTTCATAAAATG CCTTGATGATATATACTATTCTATTATCTGTCGTATCCATTTTTACAGGA CGAGGATGACCCCAACATTAAACGAAAACTACTGTTGCCAGAGTTACCGG GCCTCATGGTTGAAGTAAAAACCGGCAAAGCTTTTGTAATGTATGGGGCA GAAATACTCCGGACCGTTGATCAATTACCGATGGGGCTGCTTTGTTTCTA CGCTCTATTTTACGTACTGAACGTGGACTACCCCAACGAATGTGCTACGT TTCTCAGTATCCTCCAAAGACTAATTTTCAAAGACATAAGGTGCATCGAT TCGCACTGCGACAAAGTTGAAAATCGTCTGGAGGAATTACGGACCTTTTT ACCTTATGACTTTATAATTTAATCAACACTTGTTTTGTGTTTACTTTTTA TCTTACTTTTTATCTTACTTTTTCATGCCGCCTTCAATTTTCAAAATCAT CGGAATACTCTGGAATACTCTCTTCCGTTATTTTCTTGTGGAGGTATTTT GTGCATTTTACTGAATTTTGCTTTGTGAGTTGTGCCATGTCTTCGAAAGG AAAGTGATAGGTTTTATAATTCTAATTAAAATAAAGTTGTACAGTCTAGA ATGAATTTTCAAAATGATCTGTTGATTTTATTTTTATCTTATTGTGTACA TAATAGTAGGCTATTATTAAAAGAACTATCAATGTGAGCGCCGCGAAGTG CTCCATGGTATCATAATCAAATGTCTCAGTTTACCTTTTTTTATAGCAAC CAATTGTCAACAGGGTATTCCCCTGAATTTTTGCATAATCTTAATCCGAG AAAAAACATCTTAAAATCGATCTGATTTAT
Gene-mRNA-Prot
The following transcript feature(s) are a part of this gene:
Feature NameUnique NameSpeciesType
TCONS_00029361TCONS_00029361Clytia hemisphaericatranscript
TCONS_00029360TCONS_00029360Clytia hemisphaericatranscript
TCONS_00029359TCONS_00029359Clytia hemisphaericatranscript
The following polypeptide feature(s) derives from this gene:
Feature NameUnique NameSpeciesType
TCONS_00029360-proteinTCONS_00029360-proteinClytia hemisphaericapolypeptide
Position
The following features are aligned
Aligned FeatureFeature TypeAlignment Location
sc0000744supercontigsc0000744:37273..46452 -
Expression

Hover the mouse over a column in the graph to view expression values in transcripts per million (tpm).
Sort Descending | Sort Ascending | Only Non-Zero Values | Tile/Chart | Reset | Show/Hide Values

Values :
    GrOo_1	 GrOo_2	 FGOo_1	 FGOo_2	 EG_1	 EG_2	 P1_1	 P1_2	 P2_1	 P2_2	 P3_1	 P3_2	 PoPr_1	 PoPr_2	 St_1	 St_2	 GO_1	 GO_2	 PH_1	 PH_2	 BMF_1	 BMF_2	 MMF_1	 MMF_2	 M_1	 M_2	 GEC_1	 GEC_2	 GEN_1	 GEN_2
0.53 0.48 0.38 0.41 6.6 5.49 4.2 4.88 5.46 3.96 4.99 5.25 5.28 4.51 0.75 0.66 1.49 1.66 0.7 0.94 1.66 1.87 0.47 1 11.79 9.58 0.61 0.47 0.55 0.48