XLOC_016230 (gene) - C. hemisphaerica

Overview
NameXLOC_016230
Unique NameXLOC_016230
Typegene
OrganismClytia hemisphaerica (Jellyfish)

Sequence
The following sequences are available for this feature:

gene from alignment at sc0000693:136598..162450-

Legend: gene
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TATTGGAATAATTATTTGACATTGTCTTACCATGTTTTACTTAGACCCAG CCCCCTTCTGGTAGATATGTGTATACGTCAAAATCAACGACTGAGGTGGC CAAGTTTTCTACGTTCTAAAACACGGTTGACCAAAAAATTCTATTTTTCG AAATGAGTTGATATACAGTGGTGGCAACGATATTTTAAATTGTATCACTG TGGCAGTTCGTAAACCACTGGATGTTTTGTTATGCAAAAAAATAAAATAT AAAATAGGCATCGGTCGGTCGGTGATATTAATAGTCACCAATAATAAGTT GAGATGATTATATAAGCAGCAATTTTGATCAACCTTGGTTCGTTACTTAG GTTAGTTCACCGGGAACGATCGCGTATATCTTATATAAAACACCAGATAG AGCTATTCTGTCTTTCTCAAGCGACTACAGCCGAAGCAAATAATGCATCT AGCCGGGGTCCACTTAAAGCTTTTTGTTAGAATGAATGGCACTGATAAGT GGCCCAACATAATCAAAAAATTCAAGATGGCGATATCCATCAGAAAGAAA AGTTCAGTCAGAAGTTGACTCTAGTCTAATAATACATATTCCTATTTGTT GAGCAGACCACAATTCGGCAATTTGTTCAATAAGAACAAATAATTAACAT GGCTGGATACGAGGGGAAGAAATAATGGTCTTGATTGATCAAATTGCCGG CACCGAATCTGTGGTCTATATGTAAAGAAGGAAGTCAGGACAGGGACAGA GTAGATCATCCATCTAGTGTTTTAATATATGAGATATCCAACCTCGCCCC GTGTATTCCAGGTTTTATTTACGTTACTGATAGACGCCAGAAAATATTAT CTAGCGCTATCAGTAAGTAATAAAAAAGCTGATAATACGCAGGGAACGAG GCTGGTAAGATATCTATATTAACGATCTAGGTATACTTACTAGATCTAGG CATTATAGCCAGTTTACTTTCATGAAACTTACTTATAGCTTGAAAGCTGA AAGGTATAGTAAAGTGACTAACGGTCATATTTGTAATTCAATAAAAGTCT TTGTTTGCAAACTAAACTTGATTTATAGCAAGAAGTATCAATTACAAGGA CCACAGGATACCGTTTTTAAAGTCTTCATAATGTTCAATCTCATAAATTC CCTACCCTCCAGGGGCCTTGCGGGATTTGATCAATGTTTCGATGTTTCGA TTGATATGAAGATCAAAGAAAACTTGATAAGCTTATAACCGCCCGACAGA ACTACCCCCAGGGACCGTCCGGGATTTAATTTACTATTCGGTTGATGTAA ACAAAATAATAAAATCATAAACTTAATTTCAAAATCAAGATAATTTATGA TTAAATTCATTAAAAATTGAATTGAAATTATTGAAAAAGGTGGGACTGTG TTTTAGTTTAATTGCAAAAGGATATTAAGGATATTGTGTTTGTTTAAGCT TTTGTTCTGGATAAGCTTAGATAAGTATTACATTTGATAATATATAAGCC TTGTGACTATGTTTTTGAGTAGGATGACACAATTGATGATATTGTACTTC TGTACTAATGGCAATTTTGTTAATTGTACAACTTTCTCTAGTTGTGTTCT TTAGTTTTATTTGGCACTCGTTAAAGGTGGTGGTGGTGATGTTTCAGTTG AACTTGTCTCTCTCTAATTCAATGTTCAAGGGAACGAGACTTGGAGAAAG ATTTGAATAACATTAACCTGAGATCAGATTGTTTTCTGCCCACCACGCTA AAGCTCTAAAAGGATAGGTGAAAACATAACAATCTGACGAATATACAGTT TCGATTTCGGAAGGACCGCGCTCGTTTCAGGCCTGGGAATGACAAAAAAG TTGTGTGATTGTGTTTGAGAATAAGGCACCATACTGTATCAGGAAAATTT GGTTTTTGACTTTCCCGCGCACAACAAGACTCTTGTTGTAGAATTTTTCG AGGGAGGATTATTTTCTTCTATTTTCTTTACCGTGTGCGTAAGAAAGTTA TGCGACAAGCTGTTATGGTATTAGGTTAAATGCCAGATACTATTTTGTAT TACTTTTTAGCCGAGGGGACCAATACTTCAGCTGGATTATAAAAAGATTC TAATAGTGGAGGTTCGAATTGTCAGTATTAGGAGTAGGATAGCGTGGTTT GACTTTTCTTCGATCACAGAACTTGCTAAATTGGCTTTTTTTTGTATTTA TTGTGGGGTATTTTCGCTGATTTACTGTATCTGAACTTTTCAATTTCTGA TCAAGAGTGCGAAATCATTGGTTCACCTCGATTTTGCAGAAAGACTCCAT TATCTAAATCTACCAAGCACTCCAAAAAAATCTATATCGTACCCGATAAA AAAAATTAACCTACATATTCATGCCCCCCAGCGGCCGATTTTTTTGAGGG GCGCTGAAATACAAAGGGCGCTACAAGACGCCTTTGATTACTAATTTCAG CGCCCCTGTGCTTTTTTACACCTTAGAATTGGCAGCTTTCGGCCAAAAAG AGAGAAAATACCCAAAAAATTCTGTGCTCGCTTCGTTCGCGTAATTTTAC GAAGATATTTTTTTTTCATAGAGGGTGCTAAAATTAAAATTTTCTAAGAT TGCCTCCCCAGTTTGCCCGATCCACCACACTGCTCCAATTCTCTTATGGG GTTGTTCCACCGGGCCTGAAATTTAATCTTAATTTCTTTTTCTAACTTAA TTGAAGTCTTGAAATTCTTCCTCCACTCGAAATTTAATCATTGTAAGACA ATATATACCAAGACACATGGTATCATAATAGTAAAGTAATTAAGGGCCAT TAAATCTCCCAAATGCTTTTCCTTTGCAACTTTTAATATCTTTCCTTTTC AAAATAAATATTTTTCTCGTTTTGTATCTGTTACGGAAATCCTATGGCAC TGAAAGCAGGTTTCATTTCAGATTGGATAGTTTAGATTTCTCGTTTTGAA GAATGATACTATATGGTACATGGTGAAACATCAATGTTTTTCTCGGCATC TTCCATGACACAGTTTTCCAGTTTTGAACAATTCTTAACTACATTTCATT TTGTATTAAAATTGGAACATTAAGAGCTCTATATACTGGTATGTTTTACC TTGCAAAGAAGTCAGTGATCCTTATTTTCGATTTACACGTTTTTTTTTAT TAGAACCCAGTTTATAAGAACATTGAGGCTGAAATTAGTCGAAAAATTAA GAACATCGTAAGACCATGTCCAGCCTCAATTTGGAAAAAAATGACAAGAA ACTACAATTTTTCCTCTTTTCAAGCAGTTTTAACAGAACTTAGGCATGGA TTTTCTATAATCGAGAGTCAAATATTGTCCAAATTTTATCAATTTTAAGT GTTCTTTATTTTGCACGATATTGTCGATTTAAAGAAGTCTGAAAAATTAA GAACGGCTTTAAGAACATTTCAGGCTGAAAATTGCTGAAAAAATAAGCAC ATCCAGGCTCAGCGAAATTTTAGGTGTTCTAATAAAAAAAACGTGTAGTT TCGGCAAATAGTTTTGAACAGAAACTATCACCTTTCTCATTAACCTTTAC GAAACTTTCGTTTTTCGAATTTGTAGAAGTTCAATGGAAAACATTGAAGT CCGTCGCGGATTCGTTGTATATTTTATGTTTCGTAGCAACAATCACGNAC GTGTAGTTTTGGCAAATAGTTTTGAACAGAAACTATCACCTTTCTCATTA ACCTTTACGAAACTTTCGTTTTTCGAATTTGTAGAAGTTCAATGGAAAAC ATTGAAGTCCGTCGCGGATTCGTTGTATATTTTATGTTTCGTAGCAACAA TCACGTAATGGTGCAATTTTGACAGGAAATATTCCATAAATAAAGTTCCC CTTTTCCGGGAATACTCATCAATATTTATAGTTTCCATAGAAACTAAGAC AAAAAATACAAGTCTAGATTACAAATCTAAAATTTGCTAAGTTTGCTAAT TTGAATTTATCACATCTTATCAACAACATTTTGAAATTAGTTTAAGGTAA TTAACATAAATTAAGTATCATTATTTCAATTATCAATTATTTCAAATGTG CTAAAAAGAGGTAGAACTATATCTAAAAAACGTGGTTCATCTCATTTAAA AATAGGACATTTAACACCAAAGATCTAATTATGAAACAAGGTGTTACGTA AAACTTCATTTCTCCAATTAAATGGTTAACTAATTAGCAATCATGTTAAA TTAACCAAATAGTTGTTGCTAGTAAGGTTTGTTATTGTAATCTTTTTTTA CAGGTTGTTTACTCGTGTAGGGAATGGTTTAAGGTTTGAATCTTGATATC TTGATTTCAGATCTACGAGATAAGAGTTGCTACATCGTTTTGAAATTTTA TTCCAAATTTGCCAGCAATTGCCACGTGCTGCACTCAATAATGTTGTTTT CAATTTTAAAATTAATGGAATTTTTTTTAAAGATCATAATCTTTAAAGTT TGATTTGTGGATTTTCAAAGCTTAGTGGGGAATCCCTGACGTTTTTAGGC GAGAGATTTTATTCCCTAAATAACTATTTTATTACAGACTACATTAACTG CTCGGTCATGGGTGGTAACCAATTTAAAGTTTTCCAAAACGTGCAGATAT TTCAGGGGTTTTAATGTAAATCCATCTCGTCCATTTGGCGCAAAATGTCA AAAAACAACGGGTCTAAAAAGATGAAATTAGCCTAATATTCTCTCAAAGG ACCAACAAAACTGTTCGAATTAAGAAAGCAGTAGAGTAAACGGGTTCGAG TGGCAGAGGTTTCATTATAGGAGTTTGTTATGAATTCTTCATAATGACAA CAACTTTATTCAACCACTTTCATTTTCGTTTCAGATAATGAACTATTTAA ATGGTACACCCTACAACAACACCCTCAGCCCACCCCTCTCCGCCCTACAA TATGACGCAATCGAAATCACCGCATCGCTGTTAATCCAGGAAATATTCCT TGGTCTTATCTCAATTCTGGGTGTGATTGGCAACTGTATGGTTTGCTACA CCGTGGTGAAGCGTGCACAAGTCAAACACTCTACTTGGTATTTCCTATGT TGTCTCTCCATCTCGGATGCGTTTGTCTGTTTAGTAAACATCCCTATCCT CATGTATGCAACTTATGATGAAAGCGTCATTGACAACGGTACGTTTCTTT GTCAATTCAATGGATTCTGTTTAGTGTGTTTCTTTTTGGTATCCGTGCTA ACATTATCTGGAATCAGTTTACACAAATATTATTACATACGAAGACCATT ACATTTGAGAGCTTCTACTAAATCGTTACGAATTATTGGTTTTATATGGT TTGTATCTATCGGTATTGCCCTGGGACCTCTGGTCGGATGGAGCCAATAT TCTCACGTACACGGACATAAACAGTGTGTTCCAGCTTCAATAAGACCTGC GACAAACATTGATTTTTCGTATCTCGGCGTGCTATTATTAGTTGGATTTT TTATCCCTTTGATATCAATGGTATATTGCTACACAGCTATATTTATTGAA ACTTTATCACATCACAAGCGATTAAATAGCACTTCGATACGTGGCGATAC GACGTTTGACCGACGCAAACGGGCCGCCGGTCGCACGGGGCGACGTGGTA GCATGACGTATGATTGGGGTATCCTGAAAACAGTTTTTATTGTAGTTACG ACTTTTATTNCCGCACGGGGCGACGTGGTAGCGTGACGTATGACTGGGGT ATCCTGAAAACAGTTTTTATTGTAGTTACGACTTTTATTGTCTGCTGGGC GCCGTTTGTTGTTTATATATGTTACAATTTCACACAAAATTTAACGCCCT CTATGACATTATCACAAGTGGCGTTTATGCTGGCGTACGCCCAATCGATA TTAAATCCAGTGATCTATGCGTTACGTCATGATCTATTCCGAACGCAATT TAAAAGTGTGATTTGTTGCATAAAGTATATGAACGTTGATATTCGAAGTG AGCGTAGCGGGTCCGGGTCCCATCCGGGGTCACTGTTTCTCGTCGACGGC ATGAGCCGTAGCACAAGCAGTTCGTCATCATCATCCGATTCAACGCTTGT TTTTTACCAACGAAAAGACTCTACGTTTTCACGGAAGCCGAATTCATACG CACCAAAGTTGGACAGTATAACAGAACGGTCTATGCCAGCTTTACCCTCA TACGATAATGAAGTATTTCAACTAAATGCAGAATAATTTATTTTATAATG TTTTTAGTTTTAAATGGATCCACAATTTTTTGTAGTAAACGAGACACTAC AAAGTTCTTGCGATGTTCGATGAATAGGTTGTCATTTTATTATTTCAGCG AAATGTTTTATAGTAAATGATCAAACTGTTATAAGAGACTCCTCAAGCGG TTTGCGTGATGTTGTGATAGGGAATTTTTTGTAGCGTGATTACATGATTT GGAATTATCTTTTTTCGTGATTGCGTGATCAGAGGTCAAAACGTGATCGT GATTTGAAAAAATGTTGAGATGTTGTGATATGTGATTTGGACTTTTTTTC AAAGGGATGCGTGATCATCCAAATGTTTTGCTGATTTTCGTGACCGTGAT TGAAGACAAAAAATGCGTGATACCATGATCAGAATTACCGCTGGGGGAGG GCTCATATTAATATTTTATAGTAATCTCACAAAATAAGAATACGTAGATA TGATTTTACCAAAAAAAAAAAGCATTATAATTGATTGTAAGACCAGTTTT ATTGGTATAATATCTACATTACCACGATGTAACATAGTATATTATATGAT AAATTATACAGACGAAAAAATCTATAAACCGAAAGTGTCGAGAAAAAAAA AAGAATTTAAAAGAAAATTTTAGAAAAAAAGTTCTTTATAAAACACAAAA AAT
Gene-mRNA-Prot
The following transcript feature(s) are a part of this gene:
Feature NameUnique NameSpeciesType
TCONS_00028616TCONS_00028616Clytia hemisphaericatranscript
TCONS_00028615TCONS_00028615Clytia hemisphaericatranscript
The following polypeptide feature(s) derives from this gene:
Feature NameUnique NameSpeciesType
Seven transmembrane proteinTCONS_00028616-proteinClytia hemisphaericapolypeptide
Position
The following features are aligned
Aligned FeatureFeature TypeAlignment Location
sc0000693supercontigsc0000693:136598..162450 -
Expression

Hover the mouse over a column in the graph to view expression values in transcripts per million (tpm).
Sort Descending | Sort Ascending | Only Non-Zero Values | Tile/Chart | Reset | Show/Hide Values

Values :
    GrOo_1	 GrOo_2	 FGOo_1	 FGOo_2	 EG_1	 EG_2	 P1_1	 P1_2	 P2_1	 P2_2	 P3_1	 P3_2	 PoPr_1	 PoPr_2	 St_1	 St_2	 GO_1	 GO_2	 PH_1	 PH_2	 BMF_1	 BMF_2	 MMF_1	 MMF_2	 M_1	 M_2	 GEC_1	 GEC_2	 GEN_1	 GEN_2
0.58 0.48 0.39 0.31 11.39 7.51 10.72 10.33 9.89 11.86 18.63 12.03 50.45 63.21 5.89 7.25 2.39 4.27 93.39 89.43 2.54 2.52 4.45 4.66 65.49 73.21 2.33 1.85 1.33 2.19