XLOC_015250 (gene) - C. hemisphaerica

Overview
NameXLOC_015250
Unique NameXLOC_015250
Typegene
OrganismClytia hemisphaerica (Jellyfish)

Sequence
The following sequences are available for this feature:

gene from alignment at sc0000607:86022..94438-

Legend: gene
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>XLOC_015250 ID=XLOC_015250|Name=XLOC_015250|organism=Clytia hemisphaerica|type=gene|length=8417bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000607:86022..94438- (Clytia hemisphaerica)
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AAAAAGACATATCAGGGCCGAAAAATATCTTTCAACACACCATGCTAGTA TTGAATTCTCTATGTGTTTTTCTTTGGTAATCGCTCAAAGGGGGGGAGAG GGGAGGTCAGTTAAAAAAGCGTTTCGTTTAAGCTCACAGTTAATTTTCTC TTTCGCCTGGAGCTATTATTGTGATTTTTCTTCAATTTTGCTCTCGTGGA CCCATCATTTACTATACTTCTGCCGATCTTCCAGATGAGATGGAGTTTTT ATAAGAAACTTTAATTATTGTCATTTCATGAAGTAATAAAAATGACGCGT TCTTTATAAAAAGCAACAAAACTGGTTTATTACTGGATAGCGACTAACCA AATCAAATAAGGGCTTGTGAAACCTCCATCTCGTCCCCGATCTTCCAGAG TTTTCTATGTTGAATAGAGTAATGGTAAAAACATCGTTTTCAATTCACTT AAAGCCAATGAAGAAAAACGTTTGATTCGTGCTGGATTACGTGACATCGA GGCTGTAGCACCATGCATTCGATTTGTAGAGTATTCTGATGGTGATCCTA ATTGTCCAAACACGCATGTGCAAGTATTTAAAGGGCTGGGGTAAGATAAT TATTTCACGCTGGTTGTGCACTCGACTCTCTCTAATTCGATATTATTCTA AGGGCCAAAAGTTTTCTTTGCATTAGAGAAAGATTCGAGGTACATATAGT ATTTTAAACCACTGAGAGAACTAATGTTTTAGTTTGAATCATAGAAAAAT TCGAATAACAGAGGTTCGAATTAGAGAGAGTTGGCAGTAGCTTCGTTTTC AATTGATTTCTATAAATTCTCACTAGAATAATGGAGCAAAGCTTTTGGCA ATATTTGCTTCTGGTCTTATAATCACGATTATTTGTCCTAGTAAAAACTG GCAGAAACTTGAAACTTGTAATACCACATCATTCAGTTGCTAGGGGAAAA CGTATGCTCAACTGTTGTGTATAAAATTAGTAGGCTTTCAACTTCTAAAT TTTGATAAGACACTGCTTGTATAACAGGCCCGGTGGGATCTCCAACTTAC TGAAAATTTGCCCAAAATTTCGTCCCCCCCCCCCCCCCCCCNGCTCAACT GTTGTGTATGAAATTAGTAGGCTTTCAACTTCTAAATTTTGATAAGACAC TCTTGTATAACAGGCCCGGTGGGACCTCCAACTCACTGAAAATTTGCCCA AAATTTCGTCACCCCTTGGAAAAGAGACGCAACGATTTCAGCCCCATTTG GAAATTGACTTTGACTTCATCCTCACTCAAATATCACTGGATTTTTTGAG CTGGGATTTCGATTGAAAATTTCGTACCGACTGTTGGAAAAAGCTCCACC GAGGATTTTAGACCGGGGTGTACTATAGAATTATAAATGTCATTAGAAAT GACTTCTGCTTTTTATAAACTTGATTAAAAATCACGTGTTTTGTTAATAG TTGTTGGTCACTAATTGGAAGAACTGCTTCTGGCAAAGCGCAAAAATTGG CATTGGATTACTATTGTATTACTGAAGACAAAGGTACCAATAAAAAACGT CTTCTATATTATTGTATCATTCTCTTGAAAAGCTCATTTATGAAAACTCT ATAGATATTTTAAAAGTTATCTTCCAGTAAAAAAATTACTGTACATATGA TCAGTGCGTAAGCACGGAACTCTGAGTGATATACTTTTCTTAGTTTTCTA ATTATGGAAGATAACTTTTAAAATATTGATACATGGCTCTGTGGGTTTTA ACTATTAGCACTCTTATGACATTGATTTACCACACTTGTTTTGAATTCTA TAGATATACATTTAATTTTGTAAGTAACCAGGTTGCTAAGGCTCGAGGGC TCGAATTTGCCAAATTTGTTTCACTATGTCGTAAACTAAAACTAAACTCT TTTTGAATCTAATCATGGTACTCTTGTCTCCCGAATAGATCGGGTCCGAA TAAGCAGGGGGGGGGTAGGAAAATCTTCTAAATTCTAATAAGCAGGGGAT GGAATAAGGGGGGGGGGGGGTAATTTGAAGACAGAATTTTTAATTTTTAA CTGATGTCAATTTCAGCAACAAAAAAGAAATTTTAGCAAATAAGGACAAG AAGGAAAATTTTAACAAGTTTAAGGTCTATCTACACTGTAATAAAATATT GAATCATTTATCAAATAAGGAAACGTTGTGATCATTCGAATTTAATTAGC GGGGGATGGTCTTAATAAGAGCGGGGGGATATGGGACTTTTTTTCAACAA TTAGCGGGGGGACGTCTATTCGGGAGATAAGAGTAAACGATAGCAAAATT TTCAGAAAATGAGCTACAATCGGCGCCAAAATATTTGGCAAAAAAGGGGA ATTCCCTCAAAACTTTAAAACCGCAAATGACTTTTAAGTACTTTGAAGCA CAGTTCAGAAGTAGAGTTTTAACTCTGAGTTTTAACATTAGACTTAAGAC TAGGCCTTAGGATCTCAGGATCTAAAAGCTCAAACATCTTCCAATAAAGC AGAGAATATAGCCTGGAAGCCACTTAACCCCTCCTAAATCGAAAAATCCG ATGAAGCAAAGGGATAATACTGAAACTGCAATTCTCGCTTCAACCTTTAA ATTCTGAAAAAGGTTAAAATACCCAAAATTGCCAATATATTTCGGTCCTG ATTGTAGAATGCTAAGCAACCGCAAGAATTCAAAATCAGAGTTGGTTTTT AATAAAATGTGTATCGATACTTAAAGATTTCCAGGCTGCAATGATGGAAC CTAGCTATAGGTTTTTGAGTATTTTAAGAATAACTCTACAATTTCTTTTT TATCAGGTGTGATTATGCATGAGTTTCTTCACGTTCTCGGTTTTTATCAT GAACAAGCCAGACCTGACCGAGATGAATATATTCGTATCTTTTGGGATCG ACTTTCTGATGGTAAGAAAAACTCTGCTTTACAGCGCTATGGAAGGCTCC TTTTCCGACATAATGCCTTTTTATAAGTTGTCATAAAGCATTAATTCGAC AAGAAGGCCTTGATTAACAGAACTTTGTTAAAGATTACTTGGTTCAAAAT TCTCCTTCCAATCCACTTTGACTTCACCTCAGTCTTGAACTGAATGTCGA CCACACAACGTTATATGAACGTGAAAATAAAATGTACGATATTTTACCTG GATAGCCTAGCAATAGGACTTTTGGATAGTCTTTTGAATGTTTTCACGGG GTCCACGACCAGCTGGCTCGGCTATCTATGAACTGAATGGAACATTGGAA GGAGCTGGGTTTCGAACCACCGAAACCCTGTTTGGAGACGCTAATACCTT TGACCACTTGACCATGGCTCCTTAAAAGAACGTTCTTGGCAGGGTTTTAG CAGATTATTATGGATGAAATATATGCTTTGCTCAAGTATTCAGTATTTTC TCTGTTTATCTACCATAGGAGCAGNCAAATAACATTTACAATATTTTACC TGGATAGCCTAGCAATAGGACTTTTGGATAGTCTTTTGAATGTTTTCACG GGGTCCACGACCAGCTGGCTTGGCTATCTATGAACTGAATGGAACATTGG AAGGAGCGGGGTTTCGAACCACCGAAACCCTGTTTTGAGACGCTAATACC TTTGACCACTTGACCATGGCTCCTTAAAAGAACGTTCTTAGCAGGGTTTT AGCAGATTATTATGGATGAAATATATGCTTTGCTCAAGTATTCAGTATTT TCTCTGTTTATCTACCATAGGAGCAGAACCGCAATTCAGGAAAACAGAAC GAACAGATGATCTCGGTGTTGCATATGATCCTGTCTCCATTATGCATTAC CCAAAGTAGGTATTTTCATTAAAAAAAATTAAAAAATCCCTTTTGATGCC CTGTTCAAGTAATATACACATAGCTCTGTATCTATAACAGACCCGATCGG TGGCATCTAGATCTCTCACCGTTTCATTCAACTAAGTCTTTTGGGTCTAG GTTTGTTTCTTGGCCTATTGGGCCCATCTGGTGGTCCATCTTGGTCTTGT TGGTGGAAGTTTAGACTTGGCAGTGCCAAAATTTTGAAGAAAAAAAAAAC ATTTTTAGATTATGAATGGTGATGCAGAAGATATAATCACGTTTTTTTTA CTCTTAGTACGGCTTATGCGAAAGAGTATGGAGCAATAACCATGGAATGG AAAGCCAATCCTAAACAAGTGCTCGGTGGAGATAAACTATCTTCCAAGGA TATCCTACAACTGAATCGTCTTTATTGCGATGGTGGCAAAGTCGTGACGA CAACAAAGAAGCCGAACCCGACAACGACAACTCAAACACCAGTAACAACG ACGACAACAACAAAAAAGCCAACCACGACCACTATCCCCATAACGACCAC AACAACCTCGACAACTCCAACGACAACCACGAAAACTCTAACGACGACAA CGACAACGACAACGACAACGACACAAAAGCCGACAACGACGAAAAAACCG AAGACCACAAAACAATCGACCACTACAACTATTACAACTGAAACACCAAC GACAACCAAAAAGACGACTCCGATAACAACAAAACCAACTAAGAAAGGTA ACGCTCGCATATAGTACCAAAAAGTTTTATTTCTAGGTAAATATAAGATT GAAAATTTATACGAAAATGAAGAGTTAAACATCTGTGTCTCTGTGCACTA AATAGCATGCAATATGNATACGAAAATGAAGAATTTGTGTCTCTTTGCAC TAAAAATAACATGCAATATGATTGAATCATTAGGTTTGATAGGGTTATAA AATTCTTCATCTTTTTCTGCGGCAGACCGTTCTCATCATCGATGCATTTT TTGTTTACAAGGCTGCTGAGACTGTTTAAATAGATCTATAAACTGGTTTA AAAACATCATTGTTCTAACGAAATACCTTACGTTATACGGTCATTCGTAA AGTAAACGAACTTAATTAAACATATTTAATTTGATTTGCAAAAACTTTTG AATGCTGGTTTGAAGAAATTTTCAGGAACATTGGGAGGTAATTAGCAGCT TTCTTTAATAAGTCAAAAACTTAACCGGGGGAGGCAAACTAAGTTTATAT TACTGAAGAAGGGGGACATAGATTCCAAAAGATTTTCTTGTTGTGCTTTT TTAGTTTGTGGTGACTATTACGGGTTGTCATGCATGAACGCCAGACCTGG AAGATGCTCACAATGGATGAAAAACCGTTGTCCAAGATCCTGCAACGTGT GCACTGGACCTTTGAGTGAGACCTGCATGAATCTTCACAATAATTGGAGC AATGAGTATTGTCAAACTATGGCTGATAAGGGTAGATGTCAATCGAGCAA TTATTGGACGCGTTATCAAATGAAAACACAATGTACGAAGACATGCTGTC AGAGGAATGAATTATATACCTTCAGAGGTCAGAGAGGGTAAAATATTTAT GATATTTATTATCTATTATANGAATGAATTATATACCTTCAGAGGTCAGA GAGGGTAAAATATTTATGCTATTTATTATCTATTATAGTACAATATTTTG CAACTAATATATTTATTTATACACCCCCTTCTCACAAACCCAGTGGGATT TTTTCAGCCAGCGGGGG
Gene-mRNA-Prot
The following transcript feature(s) are a part of this gene:
Feature NameUnique NameSpeciesType
TCONS_00027133TCONS_00027133Clytia hemisphaericatranscript
The following polypeptide feature(s) derives from this gene:
Feature NameUnique NameSpeciesType
TCONS_00027133-proteinTCONS_00027133-proteinClytia hemisphaericapolypeptide
Position
The following features are aligned
Aligned FeatureFeature TypeAlignment Location
sc0000607supercontigsc0000607:86022..94438 -
Expression

Hover the mouse over a column in the graph to view expression values in transcripts per million (tpm).
Sort Descending | Sort Ascending | Only Non-Zero Values | Tile/Chart | Reset | Show/Hide Values

Values :
    GrOo_1	 GrOo_2	 FGOo_1	 FGOo_2	 EG_1	 EG_2	 P1_1	 P1_2	 P2_1	 P2_2	 P3_1	 P3_2	 PoPr_1	 PoPr_2	 St_1	 St_2	 GO_1	 GO_2	 PH_1	 PH_2	 BMF_1	 BMF_2	 MMF_1	 MMF_2	 M_1	 M_2	 GEC_1	 GEC_2	 GEN_1	 GEN_2
0.04 0.06 0 0 1.68 1.35 1.34 1.2 0.45 0.36 0.25 0.46 7.82 1.06 5.94 29.35 15.02 16.25 0.22 0.11 0.06 0.26 0.09 0.19 0 0 0.25 0.39 0.09 0.02