XLOC_012584 (gene) - C. hemisphaerica

Overview
NameXLOC_012584
Unique NameXLOC_012584
Typegene
OrganismClytia hemisphaerica (Jellyfish)

Sequence
The following sequences are available for this feature:

gene from alignment at sc0000417:251092..263472-

Legend: gene
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>XLOC_012584 ID=XLOC_012584|Name=XLOC_012584|organism=Clytia hemisphaerica|type=gene|length=12381bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000417:251092..263472- (Clytia hemisphaerica)
CTTCGATTTCGCAAGCACGTTTTGAACTTTGGATAGAAGTATTCTACATT GTTATTTATTTTGTGGATCGGAGGGTGTTTTTGTTTATCTTTCGACTTTA TTTAGCAAGGTAAGTATACATGTGATGTCTTGATTCTTGTTATAATAATG TTTTTTACCATTTTGTTACATTGCAACTATAATATATTGTACGACTGTTT TTAAATTTAACAGGTTAACAGGGTGCCCGATAACTTAATTTTTAAAGACT TCGGATGTTCTTAGCTTGTTGAATTTTAAGCCTAAAAATGTTTATATGTT TAGTTCTAAACATGGTCTTATTTTCACCTTTTTGTGACATTTGTTACCCA TTCTCCTAAGAAATCGGTATTTCCCGATGTCAATGAATCATTGTAGACTA TAAGAATTAGGGATTGTGTTTGTCTATATGATAATCCGCTATCTTGATAT ATTTTACTGTAATTTGATGTTTCTAAAGCGTTTCTTGCACGAATGATCAA ATATTTTGTCAAATTAAAACCGCAATTTTTCTCTGTCTTATTAGACTGTG TACTATGCAATACATATGCATCGCTTAATATTTCTTGCTAGTGGATTAGG AAGTGTTTTGATGTTGGATGCGCACTGCTCTTGTTTTGAATATTGAATTT CTCCGTATATACATATCGCATGCGCACTGAGGTTTTGATGAAACATTACA GAATTTCAAAACCTAAGACAATCAGCTGTGTTTTAAAAACATTCTTTTAT TTTAAATCTCTATTGATAAACTTCTTTTGTTAAAATTTTTTTATTATGTT TAATAACCCTATTAAAAAGCGAATTCCCGGTGGGGGTCACTAGCGGCCGC GCATAGTAGTGTCTATAGACCAAGAGTAAGGCCTGAAAGCTTGAAGCTGT CTATTAGCGAGTTTATGTATTTGCACTTTTGATGACGGTAAAGTGACTGA 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GAAAACCGCTTTTATATCAAAACAAAAGAAAAAAATTTGGTTTGTGGGAA GGTACTGGATAACCATACAAACTATACAGAAGAACTCGGAAAAATTTATG TTCCACGTGCGTGTTCGAGTTATGGAGACTCGAGTTACCTCTATGACTCA AATGTCTCCTTAACTCGAACAAGTTTTCGCGTCCTTTCAGTTAAAATTGT TTTATATAAACCTTACTACGTAACTCAAATTTTCCATAACTGGAACAAAT TTGTGTTCCATTATTCGTCTTCGAGTTATGGAGACAGTATTCCGATTTCA AGACAAAAGTTTCATTTTTTAATTGGGTTAATGATAGATTTGTGGGGGTG GTGTGTATTGAACAATGAGCCCGAATAATAAAAACAAATTTAAAACATAA GAATAACGCTGAGCCTAAAATGGCTGAATTTTAAGCGAATCAAATGTTAA ATCAGTAAAAATAGACCTAGACACTTTAGTTTTGCCCTAGAAATAAGAAC AAGATTAGAACAACACTCTTAAGCTCAAAGAACTGCCGAACGTCATCAAA AATTTACTGTGTTTCTTATACAAAAAAAAGATTATATATAATTTCACTTT TAGTTGAGCCAATAATTCGACACGCATTTGATAATGTTTTCTTAAGAGAA AAACCGCACACAAGCTCTATATAATTGCTTGAGTTTTAATCTAAACATGT GGCGGGAGAGGGCTCTCGCTTTATAAACAATCTTGGCAAAACATTTTACT ATATACCTCGTCCTCGAAATTACACTGAAAATTTGACAAAATTGGAGAAA TGTATTTTATTTTATTAATTTATTGGAAGTTAATTTAAGTTAAGTTAATA ATACCATCGTGAGGAAATTTTAATTTTTTTACTAATATTTTTGTCATTCT GTCATTAAAAATTTTAGTTTTGATAATTTTTTTAATATGTTTTACAATTA CCGTAATATACCAATTTTTGTAAATAATTTATGGTCAATGAACCGAAACC GCACGTCTTATGGGCTTTGAAGGGACATAAAAGTAATGACAAAATTTGTA AACAAACCGTATGCAGCGGACTACAAAATCAAAACAAATGTCACATGCCA AAATAAAAAATAAAAACAAATATGGCTGATTTTGATTCTTTCAATTGTTT TACAAGTTTGTTTTGGACACGTGATTTTAATTGTTCTCTTTAATGACACG CGGTTCGCGCAATGTTTACATTTTACTACTTTTATGTCCCTTTATAAGAA ATTTTTCATCCGACACGTTAAAGCTCTGAAGGTGGGGAAAATTTTCTACA TCTGGAAGGTTTAGATTACGGAACTTAGCAAGACAAGGCGATTTTGCAGC GGGAGGCCTAAAACCCAGCCCTCGTTTTCGGGTAATGGACGGTCTAACCG AAATATTTTTAGGTTTAAGCCCAAGGGTAATCGAACCCGACTGTCGTCGC CACATCACAGGACAACTACTAAACCTCTCCGATGGGAGATTGGCTCGCTC CTTTAGAGCTTCAGTGTAGGTGGGCGCCAATCCGCATTCGGAATATTAGA TAAAGTTGATGCGATTGAATCTTTCACAAATTACAGTTGTCACCAGTGCG GTATATGTGCGAATAAGCTCTTTTGCGCTGGTGGAAATCACGCTTAAGGA AAGTAGTTCAGGCCAAGTACACTTTTCACTATACCATTCAGTAATTCAAT TTGTATATAAATTAATTTGACATTTTATAACTTATATAAACAACGACTCG GGTATTATAATGTTTCTTATATTTGTTTTTAATAAATTTCGGGTATTATG GGTTAATTCTGCTTGATTCCAAGGGGTGAATCACTCAAAAGAAAAGTCGG AAGTTCTTTCTAATTGGCGGATTTTTTGGGTTTTTTTCGTGCCTTTAACT TTTCAAGAAAAAAAAAACCGAGTTAAAAAAC
Gene-mRNA-Prot
The following transcript feature(s) are a part of this gene:
Feature NameUnique NameSpeciesType
TCONS_00022437TCONS_00022437Clytia hemisphaericatranscript
TCONS_00022436TCONS_00022436Clytia hemisphaericatranscript
The following polypeptide feature(s) derives from this gene:
Feature NameUnique NameSpeciesType
TCONS_00022436-proteinTCONS_00022436-proteinClytia hemisphaericapolypeptide
Position
The following features are aligned
Aligned FeatureFeature TypeAlignment Location
sc0000417supercontigsc0000417:251092..263472 -
Orthologs
The following orthologs are found for this feature:
Ortholog NameDescriptionOrganism
AWAT2acyl-CoA wax alcohol acyltransferase 2 Homo Sapiens
MOGAT2PREDICTED: 2-acylglycerol O-acyltransferase 2 isoform X1 Homo Sapiens
MOGAT32-acylglycerol O-acyltransferase 3 isoform a Homo Sapiens
MOGAT12-acylglycerol O-acyltransferase 1 Homo Sapiens
DGAT2diacylglycerol O-acyltransferase 2 isoform 1 Homo Sapiens
DGAT2L6diacylglycerol O-acyltransferase 2-like protein 6 Homo Sapiens
Expression

Hover the mouse over a column in the graph to view expression values in transcripts per million (tpm).
Sort Descending | Sort Ascending | Only Non-Zero Values | Tile/Chart | Reset | Show/Hide Values

Values :
    GrOo_1	 GrOo_2	 FGOo_1	 FGOo_2	 EG_1	 EG_2	 P1_1	 P1_2	 P2_1	 P2_2	 P3_1	 P3_2	 PoPr_1	 PoPr_2	 St_1	 St_2	 GO_1	 GO_2	 PH_1	 PH_2	 BMF_1	 BMF_2	 MMF_1	 MMF_2	 M_1	 M_2	 GEC_1	 GEC_2	 GEN_1	 GEN_2
1.48 0.5 1.12 2.19 1.18 1.46 4.49 5.29 5.83 8.74 49.84 6.25 15.83 4.31 6.74 10.85 2.23 4.56 8.93 4.95 6.69 2.8 1.7 6.7 6.84 6.26 6.78 8.68 31.28 19.57