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Sequence
The following sequences are available for this feature:
gene from alignment at sc0000406:186854..198407+ Legend: gene Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below. >XLOC_012427 ID=XLOC_012427|Name=XLOC_012427|organism=Clytia hemisphaerica|type=gene|length=11554bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000406:186854..198407+ (Clytia hemisphaerica)
TTTCAGAAAAGTAGAATTAAATAGAAAGAGTTTACAACAAAAAATGAGGC
ATTCTTGCCTCCTGTTACTTTTATTTGTTGTTTCAACAAATTGCCGATAC
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tcatctgatgttaatcattaggtaggtccattcagcatgttgcttgtttt
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agcaaaaagattttgttggctcaaaaaacgcatgtttatctataagaatc
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taatagatcgtcactatttgtgttctgaatgattgtttaatggtcacgct
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TCTTAGCTCATCCGTctgtttgtttaatttttacaatTGATTACCGAAAT
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gtttttctgGATGATTTGATTTGTTCGTCCATCCTGAGTGCtcttttatc
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ttttacccccactgtttaggatattgatttttcgaagtatcgaaccccct
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TATTTTGAACCAAATATTATTCTCTTTTTAACCTTCTTGTATTTTATCTG
TTTATCAGATGTTGCGTTTCATGTTGGTGGAAAATCTCCTGTGAAATATT
TGGTTTTACAAGTTCATTACCTCAATGTTGACAGCTTCAAAGGTATTTAT
TCTTCATATATGACCTGAATGGCAAGGCTCAAAATCTATTACAGAGAGAG
TTTTCTTTAGCCATACTTCTTATAAGGAAAAAACACgctgttataatttt
ttttgcatgtgATTACATAATTTTTCAGGTAGCAGTGGTACATGCTAAAT
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GGTATTAACTAATAGTGTTTTATGATTTTAGATGGAAAGACTAAAGATCA
TTCTGGTTTGATTTACACCACAACTACACAGAAGTATGTATTACCGCCAT
TACTCAGTGCTTTATTTTGCGTGAACAGTCCTTGATAATTCCtgcacaaa
ataattttttattgttatttcgAATGAAGTCATGTGCCAACTTTTAAGTA
ACAAAATCTAAATTGCTGGCTGTGATTGATGACAATTTTTAGATATCTTA
GGATCTTTGCAGAGGTGAGACATATATTATCATACAGCTTAAATTGTTCA
GTTTGTAAATTCTTTCGATGGCTTTGAAACTCTTTTCTTTTATGTTCATT
TTTCAGGCCATCATATTTTGCTGGTATCTACCTGCTTGCTGCTGGATGGC
CACCTATTCCACCGCATAAAGACAGTGAGTGATTTTCATTTGCATGAATT
tcttttcgaaaactttttgtgaGCCATAACTAATTTCCAAACAAGAGGTC
TATGAATCAATGGTAATTTTTGTCTAGAATCAATTTGCATCTCAGATCTT
TAATGGATCTAAAAAAAGAGTTTTCAATAACAATAGATACATTTTCCTGG
AATGCATGATCAAGccgttgaatttctttttataatttcaGAATTTCATA
TGGATATGGAGTGTGGTTATAAAAGTTCCAAACAGATGAAGATTTATCCT
TTCAGGTTTCGTGTACATGCTCATAAGCTAGGTGAGTTCTTATGCGATGT
GAATTTAATCAATTAAATAACTTTTAATGATGACTAAAGTTCATTCACAT
TAAGTGTGCACTAATCTTTGTATGGTTTGCCGTTTTCCAACCAATGCTCC
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agaaaaaatgaactttctaTTCTTTGCAGATATTTAATTTTTGGAACATC
CTGATCTCAGCTATACAGTTATCTTTCCCAAGAAGTTGCATCAAAGATCG
AAAAACCTCGTTTCTTGCTGTTTAAGTCCAAACGGGAGATGAATTCCTTA
AATTGGTTGAAATAGAACTATTGCTGCAATTGCAAAACAAAGTTATGAAT
TTAATTAACTTCTTTTCCATTTCAATCATTGAGAATGATAGTACATTTTT
TCTACTTTAGGTGCTGTTATCACTGCCTATCGCGTACGAAATGGCAAATA
CACACTCATTGGGCGAGGAGATCCTCAAAGACCGCAGGTGATGCTTTGTT
ACTTCAACAACAAATCGTTTTAAACATATCAGTAATGTTTCGTTTATATC
TTCATTTACATTATGTAACCTATTACCTTACCAGCGAAGAATTTGCTCGG
TGATAAAATTAGTATTAACGAAATTATTGCCAATGAGGTTGTAAAGCCCA
TTATTTGTAAAGTCATATATCGCCTCTTGAGTGCTCTATGGTCCTTGTTC
CTACTTAACATATTCAATCCAAAACTAGTGAGGTGTGACTGCCAAACGCG
TCCAATAATTCTTAGttgcattgaaaaaaacatgaaataaggtaaaaaag
ttcttaaatgCTTGAGGTACATTCTATGGCGAAAAAGCACCTGTGTTAAC
TTACAATTACAATCTGACATTAAAAAGCTGttatttattattataattTC
AGGCATTTTACAAAGTGGACAATGATTTGGACATTAAAGATGGAGATGAT
GTGGTATGGAGGAATTTCTTTTCATAGAATCTTGCAGAaaacttgcctcg
ttttgaaactattgccatggtgattaactcccagcggattttattgaaac
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TTCTATAAGATTCTATTTGAACTGTGATTTATGATTCTTCCTTCTGACTA
TGTTCCCcaagaaaatagatttttgaaaatgccacTAATGAGTTTTGTAT
CCaatgttttatattttgtatttcAGATTGATCGACGTCAAGGGATACTG
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GTACTTTTAACTCGACGTCCAGGGATACTGTCACTAATATTGGGTAACAc
tcatttgtaaaatttttccCCCATAGTTTCAGAAGGATATCAATCTACAT
TGcattattatattatttgaaTCAGCTTATTGTTATTAATGCcatatttt
tctcattttcttctCCACTTTAGTGCCACACACAAAGATGAAATGTGTAA
TTTCTACATTATGATGTTCTACAAGGCAGATTATGGTGATCAAAACCCAG
GGTGCATGCAGACCACGGATTCATTCAGTTACCCGGACGATTCTGACGTC
ACTCTCGCTGAAATGGAACGCAAAGGATCTATGTATCTTCATGGTATGTT
CTAtggaaagttttttctttacaatgATTTTCTGGCGGATTTCTGATTTT
AACTGACGTATTTGTTACTAAGATCAATCAGCTGAAACctaccaaatcaa
ataagagcttgtaaaaactccatctcgtcccagaTCAATCCATAGATAGG
TGAAATCAAAATTGAGAGACAACTTGCATTAGGCTCTTGTCATAAGTTTT
ACTGCTAATGTTAAACATTTTGATGATTATTTTTAAGATGATAAACCTAT
ATAATAACATACTCCTTCCATTCTACAAAATGCAACCAGGGTTAAGAGCT
TCTACCGTGGGACTGAAATATTTAGCTTCtgtatattttgttttgaattt
tcatttcataCCATTTGGAATATTCATTTCAGAAAAACGGTTTAAACAGA
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TAAACTGTAAAATAATAACCTATTTAAAAATTTAAGCCTTTGTTTGTTCG
TGTTTTCTTGGTATCTTTATTGTGTGCACTTATTTTTGATAGAATGCACT
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ttctttttgtaaacaatcccactatattgcaaatcgagctgacaatatat
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ATGGTCATTTCCAGTCCCATATATTTACAATTCCTTTGCAAATGTTCGTC
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AGAACTTCTTCCATTTCAGAACATTCATTCAAAGAGGTTGATGGTTGGCC
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ACAAGGATCATGTGATCATTTTCCATCGTGGTGGACGAAAGTGGGATCAA
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AACGTAACTTAATTTGAATTATCCAAAAACaaccaacaacaaaaacaact
ttttctcCTAAACTTCAAAGTATGTTATTACGTTAAGCCCTACCGGGTCT
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AAACAAGTTGGCGTCAGCTCTTCAGGAACCAATTTCTGATGACACATTAG
TGTGGTTGGATCGCCACACTGGTGAATTCGTCAAATCCATGGGTGCTCAT
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AAATAAGGGTTGGACGACTTCGAATCTACCTGTTGGAagcttgtctgtac
acaaacccaatatctacggcttatttcaaaattcattgccgtagaggcgA
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ATCGGAATTAAATGAGGGCTGGGTTAAAAATGGAAGAGATTGAGCTTTTG
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TCGGAAATCATCTGAAAGATATTTTGATTGCGTGCTTAATTCTACGGTGA
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CCACACGGCATCACGTTGGACCAATCGGGAAACATCTGGTTAACTGATGT
CGGAGCCCACCAGGTACAATTCATTTTTGCGAACTTATCATCATAAACAA
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TAATAcaattcataatatgcaccactggagagtcttctgagaacttttaa
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ATGCACCAtgaattcaaaattatttccattgttttattTCGCAGGTGTTC
AAGTTATCACCAGAAGGGAAAGTATTGTTGGTGGTCGGTGAACGGTTTGT
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CTTCATTCTATTATTGACCTTCTATTCTCAATTGAACTTGAGGAAAGCAA
GGTATTTCGACAACATTTCATATCAGAATCAATGCCAGCTGGATGGATAC
CATCTTTTTGATGATCTTCTAAATCCAACATCTTTATCTGGATGCTtcat
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GACAACCCTTCATTGTTCTTGGTTTCGAACATGATGTTTTAGTCAATTTG
TTAAGTCAATTCTGTTCTCTCAATTCTCAGCATTGTAAATCTGTTTGCAC
CAATTTGTTTCTCTTTCCAGGTATTGTAATCAACGAGTTGTGAAGTTCGA
TAAAACTGGCTCCAAAATGCTGATGGAAATATCGCCCAAATCAATCAGTG
AGTTTTTCTTCTTTGCATCCTGGTTAGAGAGTATAGATACTAATATATGT
CATTTTAATCATTCGTTAGGTAACTAAGTTAACATACACAAAGCAAACCT
TCTATTAAGGCGGGGTAATATAGTGAGGCTCAATTTTGACTTTCATCCAG
GAGGTCGAGATCCCAATTCGACAGGTATTTGACATCTTCCTGTGACATCG
TACCCAAATCGTTGTGGCGTAGCTTCAGTCATAAATCTACTGATAGCGAA
TCAAGTTTTTCAATGCTTACTCTTTAGGTCATTTGAATCCACCTTCCATG
CGGATCGTACACAGTTTGGCTTTCGATGAAGAAAACAATCGCCTGTACGT
CGCTGATCGAGAAAATAATCGAGTCCTGGTTTTCAACTCCCAAGATGGTG
ACTACGTTTGGCAGATTGCATTTAAAGAAGCAGTATACGCTGTAGCTGTC
AATAAGAAAGGTGCAAATATAAATCTTCAGTTATTCAAAACTACCATAAG
AACTCTCTACTTACATTcaccgttcgttcgttcgttcgttcgttcgttcg
ttcgtttacTCAAAAGAGATACGCTGAAACTTAAAGTAACCTGTAAAACT
TAGAGATCCTTATCACAGCTGAATGAAGAATCTTTTCGTGTTTTTAGATA
ATGTCCTGCACGCTGTAACGACTAATTATGTAGACCCAAAGAAGACATCA
GGATACACTTACCATTTGAAATCCAAATCATTTATCACAACTTGGAAGCC
TCCTGctgtaagattttttcaaattagttATGAAAAGAGATTTGATCGTA
TCTTATAGTTTTAtctttaatttaatgtttctatCTTCCCTTTCAGGGCT
TCGGACGTCCTCATGATTTGGCAGTCAGCAAGGATGATAATGAAATTTAC
GTTTCAGAGATTGGACCTAACAGAGTGATTAAGTTTGCTTCCAAACAAGC
CCAGAAGACTAGACCATAATGGAATCCAGGAGTAGAGGGAGAGGCTGGAA
GAGACAATGCAAGTTCGGTTTTCGATTGGAATATATTTATGGGTAGATTA
ATGCATTTGGGATTCTCAACATTAGGCTTGTCGGCTGACGTAACAAATGA
CCATGGTTATTTGAAATTCGGCTGCCGGCAAAATTGCACTAAGTTTTCTA
TCTGCAACTAATATTTTGGGTGTGTAACTTTGTAATGGGTATCTTATGTT
TGTGGGTGGGTCATTATTACCCCTTTTTATTGACTCTTatgtttgaaatc
aattttcagatttttagttttttttcagcatttttgacctttttttgcaT
TACTGGCAGATTTTTAGTATCCATTTATTTTAGTATTTATTTCTTAAGAT
AAAATCGATCGTTCATAATAGTTATGATTACGTCATCAAGAATTCCAAAA
GAAATATTTGTGTAGAACAGCCATGGATCCTAAAAAGATTAAGTTCCTTT
TGTTCCTTTTCTGCTGTCGAATTCAATCAGATATAACCGaaggctagaga
ggaatctttaacctttcctaGACAAGTAAAATTGATGCTTTGGATGTGCG
TCTGACTTCTTTCCTTTGTTTTCCTTCATACTTTTGTTTCGAATTCTGAT
GATGAGTGTCACGCATATAAGATACGACCCTCGCCCTCGTCTATATCTTG
ATGGTTGAACTGCACTAAAGGCATAACACTAACAGTTAAATCTCTTTAAA
GCCTTTCACCAGATAATATTATAACCAACCAGAATTTGTAAATATTAATT
GGGCATtattatttttagtaacagaaaTATATGGAGAAAATAACTTGACT
TTTC
Gene-mRNA-Prot
The following transcript feature(s) are a part of this gene:
The following polypeptide feature(s) derives from this gene:
Position
The following features are aligned
| Aligned Feature | Feature Type | Alignment Location |
|---|
| sc0000406 | supercontig | sc0000406:186854..198407 + |
Orthologs
The following orthologs are found for this feature:
| Ortholog Name | Description | Organism |
|---|
| PAM | PREDICTED: peptidyl-glycine alpha-amidating monooxygenase isoform X5 | Homo Sapiens |
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