XLOC_010522 (gene) - C. hemisphaerica

Overview
NameXLOC_010522
Unique NameXLOC_010522
Typegene
OrganismClytia hemisphaerica (Jellyfish)

Sequence
The following sequences are available for this feature:

gene from alignment at sc0000306:51264..60301-

Legend: gene
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>XLOC_010522 ID=XLOC_010522|Name=XLOC_010522|organism=Clytia hemisphaerica|type=gene|length=9038bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000306:51264..60301- (Clytia hemisphaerica)
CGGCTATTAGGTTCCCGAGAGTATGCCTATTTACATATATAGAGTGATTT TGAAGTTTAAAAAAATTGTAATATTGTAAAATTGTATTTTTTTAGAATAA GTTTTATTATAGTAGTTTATTCGAATCCAGTTTCTCATCAAAAGAAGCTT ACAATCATTTACCGTCATTGAGGATTTGAGAGGAGGTCATTTGAGAGAAA AATGGTTTCGACAATGAATTCAGCAGTACTGTTAATGGTCATTATGCTGT GTTTTGATATTGGTAAGTTTTAGATTTTTTAGCTCGAACTTATTTGCTAA CCCCTTTCTCACAGACTCAGTAGATTTTTGGGATTTTTTCAGCCAGTGGG GGTAATAAAATTAACGGACTGAAACTCGATGGGGATTTGAATTCTATTGT TTTCGAGTCAGCAAATTCAATGGGGATGGAAAAAATAGCACAACATTTGC AGCGAGGATTTGTACGGACTAAAACTGGAGGATAATTTTCCACCGGGGAC GATATTTTGGACAATTTTCCCAGTGAGAAGGGGGTGTACTGCGTTAGTCT TATCACTAGTTAAGGTTGTTTAACATAGGGAAGGCGTGCAAATCTCTTTT AATTAGATTAATTTTCACGAGATTTAATTTATTTCACAAAGCGAAAAAAT CGCGAAAGTCATTAATTCCACGCGATTTCGCGAGTTTTACTTTTGCGAAA AAGACAAAAATCTGCGAAAACGCGAAAAATTAATCCGATCATAGTAAACT AAAATACTAAAAGAATTATATTATTTAGTCTTGCTCCAAATAAGAAACTC ACTGTAACTCTAACCCTAATTGACATAAACTTCAGCTCGCGTGAGGCCTC TTCCATTCAAATTTCATCTCAAATTTCAAAAGTTAAATCCAAAAAACAAA CATTACAATCGGTAGATTTCTTTCAAGTGTTTCAGCTTAGAGATATTTTC 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ATGCGAGATTGAATTCATGGCCCCCGGCGTGCGAATCGAATTGAGGGGGC CAAAAAATATGTCGCCCACCATGGTTGGGCGACGAAGAACATTTTCGACT TTTTACCCTCATTTCACCCCTCTAAACGGTATATATAAGATTTTTTAAAG TAAAAAAAAAATTACTTTGCAAATTATTCCGGTGACGGGGGCCATGGAAT TCTTAGGTTTTTGGCAAAACTATTTTAATCGCACTGATTTCTTCTTTCAG ATACATCGGTTGTTACAACAAATGGTTGAATACAAGTCAAAATCAAGTGA CCTTAATTGAAGGTGGTGAAGTTGATCAATGCTAAGAGATGAAGAATTTA AAATTTCTCATTTTAAAATACCTTTCAACGGATTCGTGCTCCTAATTACA TGTGGTTTTGTAGAGGACTACGATTCAGTTACGCTTCGCCTTATTCCCAA CACTTAGGCATAGTTTTTTTATTTTGAACTGTAAATAGATTATCATTTAA AAGGTTTTTCAGGCGCTATAGGGATTGAACGGGCACCGGGAAATAGCCAT TTTAATTTTCTTCAAGCTTTTTATCTTGCATTCAAACAGATTTTGATACC TACTCCAATAAGAACTTTTAACCTGATTTTTTACATTTTATCTTTAACCT AAAATTGGTTAACTCCTTGCAAGGAAATTACACTTGATAATTATGGGTAA TCAGAAGGTATATTAGTACAAATAATGGAGAAAACATACTCCACATTGCC CGATGATGGGAAAAGAATCTCTCGAAACGTAGCCAAACGTAAATCTCGTG ATCCAAGCCACGATAAACTTCCAATATGAATATCACTGGGTTGATAAACG CAAACTTATTTAGATTAACTCCTTGTTTGTTTAAGTAAACCAAAGGAACT AATGTTTACGGGAAATGATTTTCGCTTTATTCGCGGTTTATTTTTTGGCA AAACCGTCAAAATTAAAACCCACTAATTACCAATCTGGCCATTCTTCATG AAAAAAAATTGAACAATCCCTAGGAAAATGAAAGAAGTGTGTCCAAATTA TGGCAAAACCGTAAAAATTAATTCCCGCAAAATGCGACTTTTTGGAATTT CTTTTAGACCGCGAAAATTAGTTCCCGCTAAATTCAGAAAAGCTCCCTTC CCTTTGAGGTAGAAGGCATCCCAAGAATGTAAATAACAAAATTTTGGTAT ATTCTGATTTGTTTTTATTGAAATTATATAAATTGTAAATAGTTTTTGAT TTTTGCCCCCGCAACGAGCGTAGCGAGTGAGGAGGCCTTCATAGCTTCAC GCAAGGATATTGGACAGGAATCTCGAATTTTTGCGCGCGNTATGACGTGC CGTTTGTTTCAAAATTATTTATTGCGGTTAAAACGGAATGGCCATTTTCG CTTGTTAAAAGTCATATTTTTCGCTTGTTAAAAGTCAT
Gene-mRNA-Prot
The following transcript feature(s) are a part of this gene:
Feature NameUnique NameSpeciesType
TCONS_00018791TCONS_00018791Clytia hemisphaericatranscript
The following polypeptide feature(s) derives from this gene:
Feature NameUnique NameSpeciesType
TCONS_00018791-proteinTCONS_00018791-proteinClytia hemisphaericapolypeptide
Position
The following features are aligned
Aligned FeatureFeature TypeAlignment Location
sc0000306supercontigsc0000306:51264..60301 -
Orthologs
The following orthologs are found for this feature:
Ortholog NameDescriptionOrganism
LIPGPREDICTED: endothelial lipase isoform X1 Homo Sapiens
PNLIPpancreatic triacylglycerol lipase precursor Homo Sapiens
LPLlipoprotein lipase precursor Homo Sapiens
PNLIPRP1inactive pancreatic lipase-related protein 1 precursor Homo Sapiens
PNLIPRP3pancreatic lipase-related protein 3 precursor Homo Sapiens
PNLIPRP2pancreatic lipase-related protein 2 precursor Homo Sapiens
Expression

Hover the mouse over a column in the graph to view expression values in transcripts per million (tpm).
Sort Descending | Sort Ascending | Only Non-Zero Values | Tile/Chart | Reset | Show/Hide Values

Values :
    GrOo_1	 GrOo_2	 FGOo_1	 FGOo_2	 EG_1	 EG_2	 P1_1	 P1_2	 P2_1	 P2_2	 P3_1	 P3_2	 PoPr_1	 PoPr_2	 St_1	 St_2	 GO_1	 GO_2	 PH_1	 PH_2	 BMF_1	 BMF_2	 MMF_1	 MMF_2	 M_1	 M_2	 GEC_1	 GEC_2	 GEN_1	 GEN_2
0.27 0.2 0.45 0.62 0.25 0.31 1.89 2.06 2.1 2.72 1.93 1.79 8.62 9.29 3.49 4.04 1.55 2.09 5.95 6.16 8.46 9.64 3.22 4.98 2.06 1.68 0.74 1.35 6.59 9.35