XLOC_008333 (gene) - C. hemisphaerica

Overview
NameXLOC_008333
Unique NameXLOC_008333
Typegene
OrganismClytia hemisphaerica (Jellyfish)

Sequence
The following sequences are available for this feature:

gene from alignment at sc0000200:356209..366234-

Legend: gene
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>XLOC_008333 ID=XLOC_008333|Name=XLOC_008333|organism=Clytia hemisphaerica|type=gene|length=10026bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000200:356209..366234- (Clytia hemisphaerica)
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CTAGTCCCGTAAGAATCCCATATTATACGAACCAAAACTCCCTGACACTT GCTTCTACTTGCTTGGCGAAAATAAAATGTAGTGTTGCCGGAATGCGGGT GAAGGAAAAAAGCTCTCATGCGACCGGCCGGCAAAATTTTTTTTTGCTTT TTTTGGATAACTTTTGATCATTGAAATAGTACCTTAAAGATAACTTATGT ACAAACAGTATGAGGTAAGCCCTGAATACTAATGTATCAATTACTAACGA ACAAAACTTTATCTACAAGCGGGAATATCTAACTAAATGACGTTTGATAG CTTGAACGGTCAACTTGATTTTCTTTATGGTGAACCATATAGATGAACCC ATATTCTGCGACCGGGTCAGAAAATTTCTTTTTCATCTTGCTGGTTTCTG GAAACACTACTTTTTTTTATTTTCTCTTTATCGTAATAATTTTTACTAAA AGCTCAAATTTTTTTTTTATCATCTTCTAGTCATATCTGGTCATATTGTG AATAGTTCAAAAATTCTTTTATTTTCTTTACTTTTAGAAATTTGACATCG ATGTTGGTTATGAAAGGTTTTTGGGACCTGAAATCTTCTTCCATCCCGAG GTAACATATTACAACTTCAAGAAAAAAAGGGAAATTTCTGCTCTTGATTC TGTACAATTTTTAGAGAATATTTTAATCATCTATAAAAAAATGTTAAAAC TCGATGTTATATTTTATTGTTTTTCAGTTTTCCAACCCCGATTTCTCCAC ATCCATTTCTGAGACTGTTGATTCAGCCATTCAAAACTGTCCCATCGATG TTAGAAGAGGTCTATACAAGGTAAGTGGATTTGATTCTCTATATTTTCAA ACTAAATAAGGAATATCTATCATTTTATTTCATTCTTCTAAGCCTTGCCT CTCTTTCATTGCCGTTTCGATTCCTTGAATATTGTAATCTTGGAATTTCT TTTTGGTTCTTTTTTCCTAAAACAAACATTTTCACTTTCACTTTCAGAAC GTTGTTTTGTCTGGTGGATCTACCATGTTCCGTGATTTCGGTCGTCGCTT GCAGAGAGATTTGAAGAGGGTTGTTGACCAACGTTTGAAAGCCAGTGAAG AAATCAGTGGTGGCAGAATCAAGGTAAAATAGAATCCTCCAATTGAAATT ACAATGTCTAATATGATGAATGTATTTCTGAAGAGGTCACTAAACTCTGT CCTCTAGATTAAAGACAGGAGATTATTTTGTAAAAGCAAAATATAACACC AAAGGGAATTCCGCTGCTTAAGCTACCGTTTTGAGTCAAATTTTAACGTA AATTGCTGTTGCTGTGAAGTTGTCTAGTCTTTTCTTAGAGTGAGCCCCTA GATAGATCCTTTCTACTCCAGATAAGTATCAGATCAGAGCTTAAAGGAGA TATTGCTAACCTGTAATAAAAGGATCCAAGCTTTGTAAACTCATAGGATA TTTTGACAAACATCAATTATGTATTATGTATTGAATGACATTGATAATTT TCTGTGTTCTATTTCTACAGCCAAAGCCAATTGATTGTGCTGTTATCACT CATTCTATGCAAAGATATGCTGTCTGGTTCGGTGGAAGTATGTTGGCATC AACTGTAAGTTTTCAAAGTTCTTTGAAATCCTCTTTTTTTGATTTTTTAG CGTATGTAAGGCTAAATATAAATTCGTTCTAAATTTTGATGTGAGCTAGA GGTTTTCTAATAACATAATTTACTTTGTTCGTATGGTTGACAATATAGTG GAAACAGCTACTATTTTTATTTAAGTCTGAAAAAGATTCTTGTATAGTCT CAATCGATCGTTTCTCTGTTCCTTTTAGCCTGAATTCTATCAAGTATGCC ACACTAAAGCTCAATACGACGAATATGGTCCAAGTATCGCCCGACACAAC CCTGTCTTCGGTACAATGTCCTAAATTTAAAGATTCAAAATCACACAGAG GAGAGAGAATTTTTGTTATTTGAAAAGCCCAAAATTGTGAACATATAAAA TGTATAGATGGTTGCATTTTTTATCGTTATATTTTTTTTCCGAAATTTAA TTTATGGCATATAGCAGCGGACTGGGAGAAGCATGCAGTTTTAAAGGAAA CATCTACCAAAAAATTAATTATTTTCATAGACATAAATTAATAATAATAA TGATGATGATGGACCATTCGATTCAAGATTGTTTGATCTTAGATGGACAC CTTTTTGCCGCAGTGATGGGAATTTGTGAAAAGGTTTTTTTTTGTACGTT TAGGTTGTTATTTTCATCTTATCAAAAATTTGGTTCTTCTTTCCTAGGTA GTTTTATTATTAAAATGATGTTTTTTTGTTTTCATCGAGTTTTTTTTAAT GATTTCTTTACACGATTTTCACTTTTATTTTTTTGTTCAATGACTTTTTG TATTGAAATGTTCTAATGGGTCAGTT
Gene-mRNA-Prot
The following transcript feature(s) are a part of this gene:
Feature NameUnique NameSpeciesType
TCONS_00014904TCONS_00014904Clytia hemisphaericatranscript
The following polypeptide feature(s) derives from this gene:
Feature NameUnique NameSpeciesType
TCONS_00014904-proteinTCONS_00014904-proteinClytia hemisphaericapolypeptide
Position
The following features are aligned
Aligned FeatureFeature TypeAlignment Location
sc0000200supercontigsc0000200:356209..366234 -
Orthologs
The following orthologs are found for this feature:
Ortholog NameDescriptionOrganism
ACTR3Bactin-related protein 3B isoform 1 Homo Sapiens
ACTR3actin-related protein 3 isoform 1 Homo Sapiens
Expression

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Sort Descending | Sort Ascending | Only Non-Zero Values | Tile/Chart | Reset | Show/Hide Values

Values :
    GrOo_1	 GrOo_2	 FGOo_1	 FGOo_2	 EG_1	 EG_2	 P1_1	 P1_2	 P2_1	 P2_2	 P3_1	 P3_2	 PoPr_1	 PoPr_2	 St_1	 St_2	 GO_1	 GO_2	 PH_1	 PH_2	 BMF_1	 BMF_2	 MMF_1	 MMF_2	 M_1	 M_2	 GEC_1	 GEC_2	 GEN_1	 GEN_2
448.23 485.1 334.63 307.34 236.07 180.86 320.62 353.16 401.37 410.35 334.8 328.23 300.48 288.4 382.08 412.05 391.59 370.57 352.77 369.35 354.43 349 290.58 286.53 229.57 239.17 396.27 334.39 383.67 344.19