XLOC_008314 (gene) - C. hemisphaerica

Overview
NameXLOC_008314
Unique NameXLOC_008314
Typegene
OrganismClytia hemisphaerica (Jellyfish)

Sequence
The following sequences are available for this feature:

gene from alignment at sc0000200:29491..39549+

Legend: gene
Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.
>XLOC_008314 ID=XLOC_008314|Name=XLOC_008314|organism=Clytia hemisphaerica|type=gene|length=10059bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000200:29491..39549+ (Clytia hemisphaerica)
TTGCTAAAATGAGAGGTGACTTTCAATAGATAGGATTAGTAGATGGACAA AAAGATAGAAAGCTGACGTGTGCTTAATCAGCATGACTTTGCAAACCCAC GCAAGGGTGGTAAATCGAAACAAAACGGGGCGGGGGAGTATCTTTTCTCG attgttttgaaaaggccatAGCAAAGTTTTATAGAAATTGCTGGAACAAT CGAGTCTCGTGGATTTCAAAAGAACCTCGGAAAATGTAAACACTGAGCTG TGCAAATTTCATCACTTGCATCCCAGAAAAATCACTGCTGAAACACGTCA GGTTCTCTAACAAATTTTTTATCTCAATTTGAACTTCAACTCGTAAAAAT CTCacagaaacaaaatggctgaaccAGTGTAAGTATActtcatttatttc tttttatgttGACCATCTGATCTGTCTTAAAATTACCTCGGATTGATTTT GCCCCCAggaggttttttttttcgagtgtCTCCCATTCGTATTTGCAAAA TTGACTGTTTTATTGAACAAGTCCTCTAGTCCTCTCCTGTCATCCTTTCT GTACCCAGATAAGCTCAATCAAATATAGCCTTGGAAGcccaaattttaag aaaaaataaaaattacatcAAAGTTCTAATAGAGCTTGCGCTTGGTTCAG ATAGATTAGTCTGATACAGAATGTTTGAAACAGTCTCTGTTTGTGAatcc ttgttgacagactatttgaactttggaaacccaagGAGACACGCATAAAC AACCATAAGAACTCTTTAACAAgctctaaaaactttaaaaaataattaaa accaCAACAAAACATATATAAAGCCATTTATGTATTTAAACTTcaagcca acagccattttgtttataaatgaatctatgttttcattttcatttatttt cccttttttctgccAAGTTAGCTTTTcccatactctcgggtacctaatag ccgggggggttggaataagcggggggttggaaaaaatctcaaaaatttat aagcgggggggggttggaataaaactGTCCTGGGTGGAACATCTTGATTT TAGAAAGTGATGATTCGCGAGCGTGGTCTGCTTCCACGAAGGTCCGAATT ATGAAATCAGgttaaaaaatcaggaaatcatggataaactggtttttggT TCACTTTCCGCTGGCGCGCCGCGCTCgctattttgatttgaaaaacttgt aaaaactgAGCGCGCAGAGGTTGACAAACAATTTTTAGAGATCCgccttt caaaaacattttcccaaaaattaataagcggggggttggaataagaatgt cctgggtggaaaattttcgaaaaattaattagcggggggacggctattaa gtacccgagagtaaattATTGCAACCGTATTAAAATTATCGGcgggtaca aaatgcataaaacataatgcatgttgcataatgcataatccataatattt gaaaaatgtcaattttagaggctataataaggagaatttgagagataata ctttcaacaaaacaaatataccattttctaccagaaaataaaaggtagaa agctgtaaatttgaattttggatgatgaggAAAATCAATgttgccatttt gattttcatagttgtattttacggaacgtagtatagtgtagaaaaaaaac gaaaatatcTCATCTgtatataccgggtgacccacgaaaaagttcagacg tttcctgacgtcttgaggccgaaaaaatgtcccaaagtgcttggagtttt gatatttagaaagtagatatcctaacttaaaatttgagctatcacttttt aaatttgaccaacNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN NNNNNNNNNtgcttatgagcttttaaagtcaaaattcactttgcggaaag tgtaaaaaacacgtaaaaaaggggtatcaaatttggtatttttagacgtt tttgatatacagtttctgaaaaaaatctatgaaagcgccaatttttataa aaactattcttgttttaaacaaaaactactttcaaatgtgtttttattaa ttattaatgtcataaaactcgttaaataagtcaatttgtaagtgattttc taattgattgcatgaatttaatacctcttttttacgtgttttttacactt ttagaaaagtgaattttgactttaaaagctcataagtacaagtagagaac aagttggtcaaatttaaagaCGTctggaaacgtctgaactttttcgtggg tcacccggtacttttcttactcgaaaacgtaaattttatagcaagattct gggttttctcagagatcttttcgaacaattgctaataaatttcaacgggt tttccctcttacaaatcattaaccatgtgaatgctttttgttagataagc caatataaattaaagagcttcatgcaAAAGCtagttcaaagaaaataaac tttgaATCTAaggaatctttttacattcgaatgtttatgtgtttaccttt tttttgagaaagaagaagggggaaacccttctgatctgttgcatcttctt attatttatgctgacggagaaccctttgttgttatgattcgaatgttttc tctttcgttcggattccAAAAGTAAGtatcatgtctggggaaatcatttg attggaatgtttacttctaaagaggttttcgcggttttagcctctacaaa ggagagttttagaaaatattaaatcgttctgtaaattacacaatactatt atgcattatgcaatatgcattatgttttatgcattatgttttatgcatta tgtACCCGTCGTTAAGATTATCCAAATGCGCACAAAAGTACTACTGCTTA ATATTACACCCAAAATATCAAATTACTGCTATTTTCAGTTTCAAATGATA TTTGATTGCGTTTAATTCAATTCCATGGTTTTTGTCGTTTGATTTCATTC CCGTATTGTCTGTATTTAAAATTGCTTGATTAACATTGTCCTCAGTTGAT CAAGATTTAGACAAATCAAAAGCTAAAACGTGCTATGTATCAGACGCTgt gaaaatgcaaaaatttgccTGACTGATTTAATCaaatactgtaagttggt ctaatgttgacatatatccctcttctaatttagACACCCTTCTTTGGGAT AGGAATAAAAGGAAGATGGTCCAACAAAATAGCAATgtaaatggcaaatt ttttgcttgtggcGCTATTTTATACCCTTTCTTACcatataaatttaaat tttttggtattaAATGGTTTGTGAACCACCATTGTAGTTAGTGCAATGCA GGttcgaaagatttttaaaataggGGTGATGAAATATAAatggggggatc agacccctctgcacacccctctgcacactatgaaaAGATTTTTCCCTCTA TGATTGCTAATGACcttcctatctttaaagaagggtggtcgaaattagaa gagggatgtcgacattagttAGACCAACTCATGGTATAACCCAGAATTCT GACTTTTGATTGCGATTGTTTCTACATCACAAAAAATTAAAGCAACTAAG TCATTCAAAACATTTAAGGGAggcaaaaattattcaaaattttcaaatta actgACTTTGGGAAGTATGccaaaactaaactaaaatacaGGAGAAGCCA GAAAAAGCTGAAAAGGAAGCTGAAATAGTGggtattcttttaaaaaatct ttcgcgAAAGGGGACATATCTCATAAAGACAAGGCAGTGTACGTTTTTAA AGCCAAAAAGGGCAATTATTAAgttgtttttctccaaaaagacTGTTTTT AGCATTATGATAGTGATTTTAGGAGGGGCAATACACAACAGTCCATTACA TAACTAATTACTGCACACTTCAGTAGATGCAAGTAAAACCTGCAGAAAAT TATAAATTACCtaagttttgttcaaatttgCAGGCTATTCAATAATATGG AGCAGATAATTTTCAGCCTGAATGGTTGGAGTGATTTTAATATGCTGAAC TGAATCAATCAGTTTTCCAAAATGACTATTGTTTGCGCGGGAGTGTTGAC TTTCCCATCTAATGTGGGAGAGTTGATAGCTCTATGTTATCTCAGACATG CAAAAAGCTTCTGAAATTATCATGCAGCCAAATTTACTGTACTATATTGA TATCTCCTGTGAGTATAAACATTAATGACATAATTAATGACAAAACTTTG AAATGCCAGCCAGACAATTTTGTACCataaaaacgctttttttacaacGC ATGATAAATCACAGATTTATTTGGATATACAtataatagaaatcaaatat atttttagatttttttcttctctttctccaTTTGCTTCATTACACTAGCA AGATTTTGGTTTTGGTAACCTCTGGCTGAAAGGGAAAAAACCCTCACATC AAGAAATGCCTTCTGTTGCCTCtgccaaaatcagtttcattggtGATGAA TTTAATTTCAAGAGTTCGAGTTTTCTCTTGTCGAACGACAGTTTTGATTC GGTATTTGGAATGTTGGTTTTGGTTGATGTAATGATGACTTTGTTCTGGT TTGCGATGTTATAAACAAGATTTTGAGTGACTTTGATAGATTGTTGAAAA TCCAGATCACACATCTCGGTGACATTGATTATTCCCAAGCCACCCATCTT GACAGGCAGAGAAAGAAGCTGTCTCTCGTGATCTTTACAGGTTCTTCCTT CACATAGAGCGGGATAAAATGGTGTGGGATGACATTTTCTAAAGGTTTCA GCTCTTCTTTGATGTTTGGGATGGTTCGGTTGACATGGTTGAACTTATGT TTGAACCCAGCTGTGATTTGGATGTTGGTATCTTTAAATATGAATTTAGC TAGTTCATATTTGTCCGGTTTTACAACGAGCCAGGATTTTGATCCTTTTG GGAAGTATCCGAGGTATGGTATTGTAccataaaatgatttttttaccata aaacctcAGCAACAACAAACATTCCTGTGAAAGttttatttgaaacaaaa aatttgtaAGTCATCAACATCAATCAATGAGGTTGATTTGAGTTCTAAAA TAAtgtttgaatttctttatttcagTGGAGATATTGCATTGATCGGCTTG GCCGTTATGGGTCAAAACATCATTTTGAACATGAATGACCATGGTTACAC TGTGAGTACTCTTTTGTTTCaagtctttttctttgttttaataTGAATCG ATTTATAACATAAGATTTGCAAGACctttacaagattttttttcttcctg tttGGTCACTTTCTCTTCTTAAACTGACCTAATTGTGTATCAACCTGTAT CAACTCCTCTTGCCAATGCTGGTATTGATAATTATTTCTGCTACATAGGT TGTTGCATTCAACAGGACTGTTTCAAAAGTTGAAGAATTTCTTGCTAATG AAGCCAAAGGTGAGCTATTTTTATTAGCTGTAATTTTATGATTCTTTATA CTGGCGGCTTAAATATATAGGCATGTATTGTTAGTCCTATATTTAAAATA TCGAAATGTGATTGTCACTGCACTTAAAAAACATGAATCCTCTGCAATGT ATAATATACTCTGGTCATGCAAACTTATCAAAACATTGCTTCGTTAGggt taaaagctcaaaattcaGCACATAAACCTGACTTGAACTAAACTGACATC CtcatgaatttttctcttttgctTAGGAACAAAGATTGTTGGTGCAACCT CCATGGAAGATATGATCGCCAAATTGAAGAGACCACGACGTGTGATGCTG TTGGTGAAAGCTGGAGCTGCAGTCGATGCTTTCATTGATAAATTGATCCC TCTCATGGAAAAAGGGGACATCATCATTGATGGTGGAAACTCGGAATACA AAGACACAAATGTGAGTATATcctttttgaaatgaaattatacGTGCTTA GTGATTAGATATGCCAAATACAACTATTGAAGACCTGATCTCTCACCATG CAAAATAAAGTCAACATTTTGTCACTTACCTTCTTAAAATGATGTCAATG AACTATTTTTCCCTTTATTTCAGAGACGTTGCAGAGACTTAAAAAGCAAA GGTATTCACTACGTTGGAAGTGGTGTTTCCGGTGGAGAAGAGGGTGCACG CTATGGTCCCTCACTTATGCCTGGTGGTGCACCAGAAGCTTGGCCACACA TCAAACCCATCTTCCAGGCTATTTCAGCTAAGAGTGGAGATGAACCCTGC TGTGATTGGGTATGTATTTTCACAAAGTTAGTTTTCTTAGATTCTTATTT GTGTTGCTGGTTTCTGATCTGCATGTGATCTGATGTTTATAAATTCTTAG ATTAGGAAGAATTCCCTATGGAAGGGAGGTGAAGATAAATCttcttaatt ttcaaattttatggtGCTATTTTGGAACTGAATAGACCAATAACAAAAAG TGATCCAAAATTCCTCCTTTTCTCCTTATGAATATTCATTTTCTAGAGTT TTGTTGATTTGAAAAGTGAGTTTTCTTTTTGTAACAGGTCGGTGATGAAG GAGCTGGTCACTTCGTCAAAATGGTTCACAATGGTATTGAATACGGAGAC ATGCAAGTCATATGTGAAGCTTATGATCTCATGAAGAATTGCCTTGGCAT GACCCCTGATGAAATTGGAAAGGTAAAACAGCAAAATTATTTATAATATG ATATTCTTCCTTCAGAGATAACTTAGTGTGGGAGtccttttggacctacc tcgttCTATTTTAACATTACTATTTATTGTGAGAGTATCTTTCcaataaa taaaacattattTGACTTCTCAGATTTAGTATTTACTTTTCTATAATTTC TTCAACAGGTCATGGAAGGCTGGAACAAGACGGAATTAGATTCTTACCTT ATAGAAATCTCTGCAAATATTTTACAATTCAAAGATGAGAAGGGTGAACC TTTGGTCGAGAAAATCCGAGATACTGCTGGACAGGTATAAACTCTCAGTC TCCTTCGTTTTCatctcaaattcaaattcaggcGTTTGTATCATTCGGGT TAACCACTTAATTATTTGGTTGTCTAAAATTCTGTTTTCTATTAAAACTT ATAGTGGTAGATTTTATGAACAGCTAGTTCCACGACAGAAGATAaacatt gttttctttttttctctttacagAAAGGAACAGGAAAATGGACAGCTATC AACGCTTTAGACTTTGGTATCCCCGTCACCCTCATTGGTAAGTTTAAAAT GTTTATGGAattctaaatattttcttcgcTACAGTCTAGCTCTTTAAGTA AAGTTTAGTTTAAAGTTAAAACTTTAGCCAAAAGCTTTTTACCTCAGTGG TCATAATATAGATATTTATGCTCTCAAAACTTTCTATTATCTTGGACTGc atcaaaatttaataataGCCTTTTTTGTTAAGAAAGTCGACCATTTTCAT AATCTTCATTATTTCGATTTTCAGCTGAGTCAGTATTCGCTCGATGCTTG TCAGCCATCAAGAACGACCGTGTTGAAGCCAGTAAAAGTTTGAAAGGGCC TGAAAATACAAAATACGAAGGCGATAAAGCGGCATTCATCGAGGATATTA GACAGGTGAGTGGaggaaatatatttttctttatcacATTCACAAAAGTA TATCTAATTCAAACCAGATCTCCAGGTCTAGAACTATCATGACCTTCAAt aatgttttgctttgtaaacATCTAGTCGTCTCAACATGATGTGTTTTTGG TAGCCTAGGAAATGCCTGAATACGTTTCAAGAGATGCTTGAGTAAGAAGA ATTACTTGAAAAGATATCACACTCTTTTATGAATGATGACATTCCTTTAA ATATGTTTTTTGTTTTAGGCTTTGTATGCTTCGAAGATTGTTTCATACGC ACAAGGTTTTATGTTGATGAAAGAAGCTGCTAAAGAATTCAAATGGAACT TGAACTACGGAAGTATCGCCCTCATGTGGAGAGGTGGTTGCATCATTAGA AGGTGATTTTTCTTACGCAATTTTTTGTGTCAAGAAATAGCGCATATATC TGCCACCTTTTTTACAGCAAGAATTGCGTTCCCTTGTTCCTTCGCACATT TAGATCGTGACAATTTTCTTTCTTAACATGTGATTGATTTTAGTCCTAGC CTATTTCCCTCCAAATGTATTCTCTTTCTTCAAAAGGCCTGTTCTTTAAA ACAGTcgtgttttttgtttattcactTTGAATTATCCATGGTGTAAGTCA TAAAAACTAACGATGATAATACAAAAAACAcggtttttattgcaaaatat TGTTTTCGTAGCTCCCCATATATTCTACTATTTTTTTCAGTCGCTTCTTG GGCAACATTCGTGATGCTTTCGAAAAGAACTCCAACTTGACAAGTTTGTT ATTGGACGACTTCTTTAGAGATGCTGTTCACAAATGCCAGGTAAAGAATT ACTCATCTACACCCATACTTTTCTGTAAATAGACCCGACATCGACGAAAA TTTCAACATTGATTGCATGCATACGCGAGagacactctggtacagagcaC ACCCATACCATACCCTTTAAAATTCAGTCTCAATTATCTTGgactttttt acagggaaaagAAGAAAGGCTACTTAGAAAAAGTTGTTTCCCTCACAAGA ATGATCAACAATATCTCCGATGTTCTCCCGTAGCCCTAGCTCCAGAAAAC TTTGTTTCCCTTTGCTTGATCTTTGCTCCAAATCTAGTGTATCCTTAATC CAGGGATAGGATATTTCTTGTTAAATCGACGTTGGTGTATTTGGTAAATT AAAATTATCATTTCCGCTTTTTCAGGTGTCATGGAGAAAAGTTGTATCTC AAGCTATCTTGTTGGGAGTACCAACACCTTGTTTCAGTTCGGCCCTTGCT TTCTATGACGGATTCCGATCTGAGCGTGTTCCTGCTAATTTGATCCAGGT ACGTGTCTTCCTTAAGATGTAAATTAATGGTTCAATGGTTTAATCCGAAC AAAAATATATCCCCTTTTACAGTCAGAACTTTCTCAAATTTAAATTCCTA ACTTGGAACccaattgaaaacaaaaagataatCAGTCAAATTTATTAAAT GTCTCAGTTATCCACAAAACCCTTACCCttgctttttactttttactttc atGTCACCAGATATCAAACCCTAAAATATTgccaaagaaaaaatgaaaaa tggactTCTGAGCGCAATAGTTCTCTTCTCTATGATTTTTCTGAGACCGC TTTTTGTCCTCTTCAATAAACTGTATcttaaaagatattttgtacAAGAT CGGTTTAGAGGTCCTCGTGTGCCTGGACCTTTACTGGACCTGGACTGATT CATTATAATAAAGTTttataaaattcaattttcgattttactCCTGTTTC TTTTAGGCTCAACGTGATTACTTCGGAGCACATACTTATGAGTTATTGGA GAACCCTGGAAAATTCCACCACACAAACTGGACTGGTACAGGTGGCCGTG TTTCATCTACCACCTATGAcgcttaaaaaatatttttctaatataTTCTG ATATATTCTGATAGCCATTATTTTGTGCACCATTCATTATCGAAGGTATT TGACTCAAtacttgattgattgattgattgattgattgattgattgattg attgattgattgattgattgattgattgattgattgattgattgattgat tgatagtAATGTGTGTTGAGTCGTATGTCTTCTGATGCTGTTTAGAAAAA CTATACTGATTATAATTCGATTCACGGGGGTAACTGCCGCATaatttttt accaatttttgtatttatttatttccaattttgttctttcagtcaatttt tttttgtgaagataattattttttagatttGTTTGTATNTTTTGTTCTTT CAGTCAATCTTTTTTTGTgaagataattattttttagatttgtttgtata ttttgaaATGACAAATAAAATACAATGAAGGAATAATCCAAATTCCACAA AGGCAAATT
Gene-mRNA-Prot
The following transcript feature(s) are a part of this gene:
Feature NameUnique NameSpeciesType
TCONS_00014844TCONS_00014844Clytia hemisphaericatranscript
The following polypeptide feature(s) derives from this gene:
Feature NameUnique NameSpeciesType
TCONS_00014844-proteinTCONS_00014844-proteinClytia hemisphaericapolypeptide
Position
The following features are aligned
Aligned FeatureFeature TypeAlignment Location
sc0000200supercontigsc0000200:29491..39549 +
Orthologs
The following orthologs are found for this feature:
Ortholog NameDescriptionOrganism
PGD6-phosphogluconate dehydrogenase, decarboxylating isoform 1 Homo Sapiens
Expression

Hover the mouse over a column in the graph to view expression values in transcripts per million (tpm).
Sort Descending | Sort Ascending | Only Non-Zero Values | Tile/Chart | Reset | Show/Hide Values

Values :
    GrOo_1	 GrOo_2	 FGOo_1	 FGOo_2	 EG_1	 EG_2	 P1_1	 P1_2	 P2_1	 P2_2	 P3_1	 P3_2	 PoPr_1	 PoPr_2	 St_1	 St_2	 GO_1	 GO_2	 PH_1	 PH_2	 BMF_1	 BMF_2	 MMF_1	 MMF_2	 M_1	 M_2	 GEC_1	 GEC_2	 GEN_1	 GEN_2
307.61 314.94 353.07 355.57 142.08 99.34 154.61 161.57 171.1 182.88 215.24 169.02 308.29 302.58 138.47 149.76 371.92 369.58 462.08 356.3 456.2 446.3 321.15 306.04 299.42 337.7 181.63 201.83 205.83 157.14