XLOC_008166 (gene) - C. hemisphaerica

Overview
NameXLOC_008166
Unique NameXLOC_008166
Typegene
OrganismClytia hemisphaerica (Jellyfish)

Sequence
The following sequences are available for this feature:

gene from alignment at sc0000190:149848..156151-

Legend: gene
Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.
>XLOC_008166 ID=XLOC_008166|Name=XLOC_008166|organism=Clytia hemisphaerica|type=gene|length=6304bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000190:149848..156151- (Clytia hemisphaerica)
GTTTGAACCTGCACATGGTTTGCTTTTGTTTTATTTTTGTGGGTACAACA TCCGTTGTGGCACAATTGAAGACGTTAAAAAAAACTATACCTTAATTCCA TTAATTTTCGCGCGCCTTTTATTTTTGCGCCTCTAATTTTCACGCCTCTA ATTTTCACGCCTCTAATTTCATGCCTTTAATTTTCACGCAACTTGTATAA AAGGATATTTTGCGCACCCTTTAATAGGCCTATTTTGGAACCTTGGATGT TAATTGATACCTTTTTGGTGGGATCATTTTAAACTTATGATTTCAAAGTT AACTTTAGAATGCCGTGCTCGAACTCAATGATTTTCTTGATAGTTTTGAC TGGATAAAGTTTATATTCTATGCCAGGAATTCTTTTAAAAAGAAGAAACA CAATATAAGATACAGAGGAACAAGGGGGAACCTGATGCTATAACTATAAG GTTTCCTTCCTAATAACGGAAAGGGTCAAAGAATTTTAAAAACAAAACTG TTTTTTAATTGTTGTTATTTTTACTGAATAGTTAAAATTTTATTTTTAGG GGGTTAAAACTGAATACATAATTATAGGGGTCTAGAAAATAATTTGAAAT AGAGTAGAGCTGGGAAAAAACTAAAATAAATATGACGCTTGATCATGCTG GCCGAATGAAGGAATTCTTATTGGATAACAAAAAAGGTATACTTTCAAGT AAAAGCTTTTTGACCCACTGTTTTTTTACTTTCAGAAAAGTTTAAATTTT TAAACATTTTAACGTTAAGTTTACAAACTTGTTACTTGTGCCCACGAACA ATTTGCAATGGAATATTCAATTATAATAATATGACATTTTGTGCTCATTA CTTATAGTAAATCTTCAAAATACTTACAATAAACAACAATAGACATTTTG GATTACTGTACATCTGAACATTAAAGAATTAATTTTTTTCTTTCCTCTAG TTTCCAATGTTTCCTTTGGTACAACATTATCAAGAGAACTTTTACCACTA AAAACACCACACACTAAGGCTGGTAATGAAATGTGTTTGCGTGGTGTACC CAATCTTGGACCAGGGTCTTATAAAAATGATGAGGTAAAGAAAATCAGTT TATTGTTTGATTTTTGAATGAGATAATTCTACTATTAGTTAAGCCATTTT TACAACTCCGCTTATTGTTACTTAAGTGATGTATTGGACAAAACTTGAAG AGTCCGGAAAATGTTTATTATCGCATAAATCTAAGTTGTTGCAGTAGTGC ATACCATAAATAATTATTTTTTGAAATCTATGAAACCATTTTAATTGCAG AAGAAGCATGATTATACCCAAACACAAAAACTTTGTTTTTAGGGCTGTTC TGGGCTGTTATGGTCCTAGTTTATCGTATTTTCTTTTTCTTATTCACAGA CCAGCTCATTCATTCACGAATTAGAATTAAAACCAACTTGCAAAAAAGGT TATTCACTTGGTGCCAGAACAGCCCAACGCTTTCTTGAATTCAGGGTAAG CATTTATCTTATTATGATTAGATTAATTCAACTGATACACCAATAGCTTT TCCTAGGTCATAGTTGGAATTTACTACAAGTCCATAATTTTACGCTCAAA CATTTTAAACATGGTAACTTGAGATCTAAGATCCAATTATCTAGTAGTTC AGTTTTAAAGAAATTATCCAAAAATGCTATTCTTTACTAAATTTGTTGAC CACTTTCTAATCTCACCTAACTAAATCGGTCAAAAAAAGATGCTCGAAAG TGGTTTTTAGTAAAAAAAAAAACAACCGGGAAAGTGAGAAGTGAGGATTC AAAATTACTCGCAAACCAAAAAAGTGAGAGTGGGATGTAAATTCGGCCTG CATTTCTAGGTTCCATTACTGTGTTATTTCCATCTTCATTTATAGGAAGA CTTTCCGGGACCTCCATCGTTTCAAGAGATCATTTCAAAACCACGTGAAT TTACTGCGGATAAAAAACCTTTCAGATCTGGATCGTCAAGATTCCCATTA ATAAAACTTGAAAGTTTACCAGGGTTAGTTTCTACTTTTAACCATTTATA TCTCGGATAGTCAACATCAGGATCTACTAAACCTTGTCAGACAGGTTTTT TGCTTAATCGGATCTTTTGTTATCCCATGACAATGACAATTCTTGGATCA GTTTTTAAAGAATAGGGGATTTGAATGAGCTAAGTAAGGACTCTTTTCAG CAAGACAAAAAATCTCAGTTTTTACTGATATTAAAAAGGCCTCGTTAGTA CTCCTTATAACGATAGGGAAAGCCACGATGACGTTTCGCTTCGGTGCGGG CCGATGAACCTTTCTATCTGATTACTGCGTATAAATATATTTGTCGTTTC AAAACAAAAGGGTAGTACCAAAACTTGGTGTTTCTTAGAGTTATGGCTTT CACCAAACTAATTCGTTGAACTAATTTGTCAAAACTTTCATGTAATTTTT GTTTTTTTCCTTTCCAGCCCGGGTACTTATGAACATAATGTTGGTCGAAA TCGTAAAGTTCAATTTCATGGATCCTTCGGTGGACCACAAACACTACGCA CATCCATTCAAACTATCTGCTCTTCTGATGTCACTAAAACACCTGTAAGT GCGACATTGGGAAAGCCTTTTAATGTAAAGTTTTAGTGTTTAATTCGGCT TGACATAAACATAATGATATAATGTTGACTTATTGTCTTGAAGTTGGAAT ATTTCAAACAAACGAAAGGTTTGACACAGAAAATTACATATTAACCTCGT ACTAAAAGCTTTGATATCTACCTATTACGAGAATTCCCCGGGGAGGCGAC TAGGTTTGCGAGATGGTTTGTGCCGCCCGACTTAGGGCCCAAAGACAAAC CATCTCGAGGGACTGAAATAAAGGAAAAGCCGGAATTTTCATAAATTATA TGACCGTTATTGTGACTACTTTGCTTGGAATTTAGGCACTTAGGCTTTTG AGGGTCAAGAAATTGGTTTTAGCTAATTTTACAATCCTTAAGGGGACTAG AATTAGATTTTGTGATTTTTACGACCCTTAGTGGGATTTTGAATATCGAA AAAAGTTACTTTTAAAGGCGGCAAATACCCGTACCCTTCTTTTGTCTAAG TGACCCACCAGGGAGGGTTTCAAATGCATAAACTTTCGCAAAAAAAGGAC AAAATTCCCGAAAATCTCAAAAGTTTGAACGCCTAAAGTATTGGATACAG CAATGTTAAGTTTAATTCTTATTTTTTAGTGTTGTCGATGCTCTACTGAC CCTGTTGGTGACTATTACATGAACAAAAACAACGTTTCAATGTGTCGTGG TTGCAAAGAAGACGCCCCTTCCAACCTGACCGATAAAAATAAAAGGTAAC ATCGAAATTCGTATACCTTTTCAACCGTAGCCACCAATTGCCGCGCGGGT ATTTTGTTGTCCGTTTTACCACCTTAAACCGTCCCAGTCTTTTTTTCGCA TTTATAGACAATAGAAAAAAGTGTAATAAAAGGATTGGATCGAGTTAAGG GTGGTAAAACGGACAAAAATAAGCCCGCGCGGCAATTGACGGCTACGGTC GAAAAGGTGTATTGATCTATTATGAATACCTTTGTACGCAAATAAAAAAT AGGCAATTATTTTTTTTCAATGGCCTTGAAATTGACATATCAAGAAGTTC AAAATAAATCACTGTGCTCATTGCTTTAACAAACCGGCTGTTTGAAACTA AGGGAACTTTACTATTTCAACGAAATTTTTCTATCGTGTTACAGTAGTTA TATTTCTCGTTATGGCGTCTCTTTATTGAATATATTTGTTTCAGATTAGA GAGATGAATTCTTTTTTTATAAAAACCGGTAAATTTTTGTTGAGGCTTGC TTGACTGTTCTTATCTTTTTGGAACCTCGATCCTCGCATTGTTCTTTTCT TGTTCTTATTTTAGTGCAAAGTCGAGGCGTTTTAGGCACGATTTTATACA CGATTTTAAAAATATTTTGTCCCATTACGTGAAATTCATTTCAGGCTCTT TTTTTTAAGTTGTTCCTATTTTTCGACGATTTTGAGCCTCATTGTTCTTA TAAATTGATTGTACGTGTAAAAAAAGAGTGTATTCGGGGAACGAAAGATG ACACTTAATCAGCTAATGAAAAATATCGCTCATGGTACTTTAATCGGATT AAATTTCGCGAGATTAAATTTCGCGAGCGAAAAAAATCGCGAAATTTTCT GGATTTAATTTCGCGAGTCAAAGTTTTGAAAAATTTCGCGTGGATTTAAT TTCGCGAATAAGCCTGAAAACAGCTGAAAATAGCCTTTTTTTGCCACAAA TGGAGACTTTGGACTGGTTTCTCAACTGAAAATGCAATTTTAAAGATTTT GTGGTGGATTTAATTTCGCGAGTCAGGAATCTCACGCGTTTTCGCGAGTT TTAATTTCGCGAAAATGGCAAAAATTAGCGAAATCGCGAAATTTAATCTC GTGAAAGTTAATCCGATTAAAGTAAACTAAATCAATGTTTTTCTTTAGGC AAAAAAAAATACACGCCTTTTTTTTTATAAGAATAGTGTACTTTGGATGA GTGTCAAGTATTCTTAATAAAGTGCCAAAATTGAGAGTGAAATATTCTTA ACGTACATGTTTTTTTTTATAAGCATAACGCTTATAAGCATCTGAAGGCT CAGATTTGCAGAATTCCTAAGCATAACATGAGCATATGTCAGCCTAAAAT ATTTTTCAAGTGGTCATTTTTATCTGTTTTTGTTTCATTTTTATCTGGTT TGGTAGAGGTTAAGTAAAAAATAAGACATTCCACGGCTAGCTACATTGCA CTGCTCCCAAAATCTGAACAAATTTTTTACAAAATATCTGAAATTTCACT AAAAAACTTGGCTCGGGGTGAATCATAAGCATAATTCTTAAGCATGTAAT AAGCATAAACTATGCCTGGATGCTTTGAGAACTTAAGCATACACAAGCCT GACCAAGGGGCATACACTTGCTTATAAAAAAAAAAACATGTATTTTTACT TTTTTAGACTTGACTTTTTTACAAACATGAGAAATGATTAATTTGAGAGT TTTGGACTTTTGAGTGAACATTTGGGTTAAAATTACATTTCTTCCTCAAA GCTTCCTTCTATTTATCTCTAACAAAGGAAGCAGTTTTTTCTGTTAACCA AATACAAAATTACTGTATTCTTATCAATTTCTGTGAAATTCACCCTAGAG GGTATTCTTAGGGTATTCTTACGATTTGGCCGATTTTTACCCTGATACTC TTATAGCTTGTTAAAGTGTGTAATCCTATTTAGTAACAATAGTAATCCTG TTTTGTTTTTTTTAGATTTTGGAGTGGGTTTTTTAAAGTACGCGATTGTA CTGGTATACATTCACACGAAGGGACAAGCGCCAAATTAAGAGTAAGTGCA CCTTTCCATAAAATATTTGCTCAATTTTCATAGAAAAAACCTAATAGTTT AATCAGATTAGTTGTTGTGAGATTCAGTTTTGCGAATTTTTGCCTTTTTT GCGAAAATGAAACTAGCGAAATCACGTGATTTGCGCAGATAAATTCAAAT AATTTTGCGAAATTAAACCTTGCAAAAATTAATCTGATTAAAGTGTATCA TTCCCCCTTCTGGACATCTTCTATATTTCCACAGACTCTTGAGCTATTCT TTCCTGAAAACGATGTCAAAAATCAATAGTTTAAGCCTCCTTTAAAAGCA TATTCACTGAGCTTTTACGACACGTGATTTATCCATCCATCCCTGGTGCA TACGCCCAAAATGATATTATGATCAACTTTTCGACCAATCATGAGAAAAT TATCAAATTGAATACGACGAGTAGTATACTTTGCCTAAAAGAAAATTATT CGTTATTAAACCTACGGCATCATTACTCGAACAATCATTGCGTTGTCTTG TTACAGAGTCCTATACAGAGTAGTTAAAATTCAACCTTCGACATGGTTAC TTATTCAAAGTTTGTTCTTTTTTTAGCTGAAAACTGACAAAGACATCAAG AAACAACGCATGCGTGAATCCTACTTCAGTTTATACTATTAACCACAAAC ATTTTATGAAAAACCATTCACATTTTTATTTTTTTCCAAAAAGATCTATT TTCTATCATATTTTTAAAATATTTTTGTATTATTGTATCTTTTGGTTTTG AATGGTCCCGGGGGTACCCGACCTGCTGCTGTAAATGTCTGCAAAGTTGA ACCAAACGGTGCACTTTTTTGGTAGAATATTGAATCTAGACTAAGATATA ACGTCTTAAACCATACAATGGACCGAGATAACAAAAGAAAACATCTGAGA GCCG
Gene-mRNA-Prot
The following transcript feature(s) are a part of this gene:
Feature NameUnique NameSpeciesType
TCONS_00014592TCONS_00014592Clytia hemisphaericatranscript
The following polypeptide feature(s) derives from this gene:
Feature NameUnique NameSpeciesType
TCONS_00014592-proteinTCONS_00014592-proteinClytia hemisphaericapolypeptide
Position
The following features are aligned
Aligned FeatureFeature TypeAlignment Location
sc0000190supercontigsc0000190:149848..156151 -
Expression

Hover the mouse over a column in the graph to view expression values in transcripts per million (tpm).
Sort Descending | Sort Ascending | Only Non-Zero Values | Tile/Chart | Reset | Show/Hide Values

Values :
    GrOo_1	 GrOo_2	 FGOo_1	 FGOo_2	 EG_1	 EG_2	 P1_1	 P1_2	 P2_1	 P2_2	 P3_1	 P3_2	 PoPr_1	 PoPr_2	 St_1	 St_2	 GO_1	 GO_2	 PH_1	 PH_2	 BMF_1	 BMF_2	 MMF_1	 MMF_2	 M_1	 M_2	 GEC_1	 GEC_2	 GEN_1	 GEN_2
34.71 31.42 20.25 19.52 112.47 88.65 55.74 61.34 32.01 43.33 32.26 27.73 6.85 6.15 4.96 5.51 3.88 6.06 14.23 11.08 5.07 4.71 14.93 14.1 67.88 45.72 35.48 43.26 12.44 12.59