XLOC_007355 (gene) - C. hemisphaerica

Overview
NameXLOC_007355
Unique NameXLOC_007355
Typegene
OrganismClytia hemisphaerica (Jellyfish)

Sequence
The following sequences are available for this feature:

gene from alignment at sc0000162:472705..498461-

Legend: gene
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>XLOC_007355 ID=XLOC_007355|Name=XLOC_007355|organism=Clytia hemisphaerica|type=gene|length=25757bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000162:472705..498461- (Clytia hemisphaerica)
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TATACAAATTATCGTCAAAATGAGAGATTTAATTTATACTACTTAAGCTA GACTGGCAGTTTTAGATAACCTTTGATAAAGTTTTGATAAGATTTCTTAA AATGGAATTTTCTTGATAAGAAAGTCGTAAAAACTTGAACAAAACTGGCT ATTTTTAAAAAAAAGATAAAAAGTTGAAAAAGGTGTAAAACCCACCAAGT AAATTTTTCACACCCAAATCGAATCAAACGTTCTTTGAAAGCAGCAAGTG ATGCGATTAATTCACACTATTTTTATTGAAAATTTATGAAAATAAGATAT TTTTATAACAAAAGAAGTTGAAAAATAACAAAAGAAAAAAGGTACAATGA AGTTTAAAATAATATTTTCCTTTCATTATTTTTTGGTAGGTATAATTATT AGTGACCTTTAATTAACTGATAGCGTGTTTTAAAAAGCTTTGTTTTGATG AGAGCACGAAATTTGTATGAGTTGAGTATAAATTGTTTCTCTGTGAAAAC GAATTAAAAACAGCCAGGGGAAAGGTTTCGACACGAAAATTGCCTTCTTG TAGCATTTATTATATGAGTTTTTCTTTACCCTTCGCCACATTTAATACCG CACTTATTAACCTCAATATTCTTTCAAGACAAAAAATTCTCGAATAAAGA AAGACAGCCTACCCGAATTTCAAATAGAGGAAGGAGAAATTCTTTATAAA GATCCCCTTAACAATGATTTTTTACCCCTACCCCCATTTCTTTAAATTCC TTGCTCTTTTCTCTATTTCTGTTGAACTTTGGTTGTTTTTTTAGAAAAAA TATGCCGAGCCGAGAAGAATCAGTCGCGTGCTTTTATCATACGATTTAAT CAGCCTCATTTCCACGGCTGGCAGCATTTTGGACACATTTCAATACTTCA AAAGTGAAAACAAAGGTATTTTTGTTAATCTCTATGTTTGTTGTGAACTC CACGAGGGGGTAGCGGTATCTCAATTAACACTTGTACTGATGTTTGTAAA CTTTCACTGATTAACGTCAAGAACTCGTGGTAATACCTGACAAACAACTT CGGATGAAATAGCCTTCTAATTACCATCTACTTTGTAAGTTTAAAGATTT TGATCTCTTATCAGGGACTTATTATTTAGTGCGTGGATGATATGCTAAGT GTTTGTTTATTAAAGAAATTGGCCTCTGGCTCTTCATCTCATCACATCTC CATAACATTGACTGATTTTTATCTCCGCTATACTTGTCATTTTTGATTAA ACTTTCAGATTATAAAATGAGTAAACCCATCCTTCAAAATTTTTATTTGA AAGCTTTCATCATACGTCAAGGCGTCAATGCTTATGAACTAAAAGCGTTT AATTACTCTGCTTATTACTCACTTAAATTTTTCATAAAAGCACAAAACAA TAGAGACAAAAGTATAAATTTTCAAGAAAAGTCAGAATTTCAATCTATAT TAATTTTTTGAAATTTAGATGATTTTGTTACACAAAAAATTAGTTTTTTT GAATCGAGTATTAAAATATTATCTTAGACTAATCATATGTTTAGCACTTA AAACCATGAACAAATAATTCATTCTCGAATACTGCCGATTTAGAAAGAAA GCCTATGATTTATTGCTCTAAGTCTATCACTCTTTTTTCTTTTAGAAAAA AATTCTTTTCAACGATTTTATTACTTTTCCACCCGTCAAAAACCTGCTTT ATTAAATCAAAGATTGGGGTTGTTTTAGAGTATGACCCGTAGTCATTGTC AAAAGAAAAATGGAAAGTACTTAAAAGTACCTGAAATATTCCTTTCATTA ACCTCAGCCCTAAATCCCTAACTTAACTAAAAGGAAATTACCTTTGCCCA CTAGAATGGGACACGAAACCCCTTATCATAAGTATTCAGGAAAATAGAAA TTGGGACAAAACACTTCCATGATAAAGTCATAATCTGTAGAAATTCAAAC TGATACGGATATTTTGCACTCTAAAGTTTAACCCTTACTTCTTTTGACGA AAATTCCCCCCTCGTTATCTATGATAACGGTTAGTTGTGGGGTCGAAAAG ATTTAGATATTTTTGAAAGGCCTGTTTCTATAAGAGGGTAGTTAGTATTA GTGGGATTATTAGATTTGATTCCCTCAGAATGTTGTGTTTAAAAGATCTC TTTAAGAAAAACAAGTGTTCTAAATCACCCCCTTCAAGTGGTTTAAGATG AGATAACGCCTTGACTTTATTTTACTCACTGAACAAAAGAACGTGTTCCT TCTATTGTTCCCTAAACCCCAGGACGACATTTTAATTAGTACTTAATGTG GGTCATGAATTGAAAAAGAAAATGAGGAAAAACAACATTTTCATTCTTCC TAATGTCTCTATGCTTACATTTTTAAAGCCTTTAAACACTTATACCTTGC ACTTTATTTAATAGAAAAAGGGTCCCTTTTTATTGCATATTGAATTTTTG ATAAATATAGGAGTTGTTTTATGAAAAAAAAACGTATCCAACTTTTCTTC ATTTTCTTTTGCTCCCTTTGTTCGATAAGTATCTTTTCAAAAGATCCTAA TCATAAAAATCCCTAAAAGGAAGAAGACAGGGAACAGTGAATTGTCTTTA GAATTTCTTTTTCCCATTTTGTGTGCAATGAAATTAACCGGACTTTAAAT GCAATGAAAAAGAATTAAGCAAAAAATATTGTTTTGAATGAATTGTTTGT TTTAGCGCACTTATTGAGATTTGTTGTGCTTACTCATCAACTGTTTGGGT ATTTGTGGAGACATCTCACAAAGACGTTCATAGTCTCTCGACAGCAACGA GCACAGGAAGAAATCGACCCTTAAAGTTGTGCAAGGTATTAAATTTTTTA TTCTAGTTACACTGTGCTTCGCTGTAAGCGTTTGGCCTACCTTTTAATCA TGGCATATTAAAAAAGCGTTAACAAAACTCAAGCTTTTCTTTATTCTTCT TTTATAAGTTTCCTTTTTTCGGCTTAATTTGTTTTGATTTTGCCCAAGTC TTCGAAGGTAACATATGTTACACATTTCTTTATTATTCTTTCAATTTTTC TTTTTATTATTTTCTGTTATTTTTTTGTGTTTCGTTCGTTTAAGTACCAC AGTTTCCTTTTAAAGTTCCTTAAGCTAGTGATCATGTACAAAAGCTAAAC TATTTCTTAGACTAATTAATTCTACAGCCATCTGATTGGTTTAGAAGTTC GATTCGTCTCGCCTTTAGTAAAGGCTTGTGGCGCCAACTGAACCATCGTA ATTACAATTCTTGACATATGTATTATTCGTGCAATTCTATTGAATGAGAA AAGAAAAGAGCTCAACTAAAATGATGGAGCGAATAGAGATTGTGATTGAA GAGCTTCTGGAAAAAAAGTCATCTTTTAAAACTCACCGATTGTTTGTTTA AAGAAAATTTAGTCAGTCTAGGTCGTTACATTTTGGAAGTGGTCTTTTTG TAATGAGAGCGCTCGCTTCACATAGGTTGAGATGGATCATGATTGGTATA AGCGAAACAATTAAAACCGATGATTGTTCTACTATTAAATCACATGACGT TTTAAACACAATAGTTTTGTCATAAATGCATATCTATTGTTTAGAGATGC CAGTAAAAGAAAAGAGGACATTCTTTTCTCTCTCCATCTATTCTTTAGCC CGAACTAAATATTCCTTCATATCAACGCGCGTATCTTCGTTAAGCTGTTA GTTTCGCGAAATAAGTCGGTCGTTTGGATGCATTTCCGTTCTTTGATCCT GCAGTGTATACTCGGGATGCCTGGCTACTGATAACATGTCAAATCTTTCT TAGTCTGGGGTGCTCCAAACCAAAATAGTGTATATGTCAGTGGATTTCTC GATAGCGTTCATTTTTTCAATAAATAGATCTTGTTTGATTGTTTTTGATC GTGATGATGGACAAAAGATCTTTAATAACTTTTTTTTATCTTCAATCTTA TATCAGCTTTACTTTTTATAATGAATGTTTCTTTTAGAGATTGGCATCAA GAACAGATATTTTATCAACTCAAACACACACAGACAGAGATAGCGAAAAA AAAGTTATAAAACATGGAGAATACAGATCACAGTCGATGGTTTCATCCTT CAATGTATTTATATCAAGACAGTAGTGCAGCATTGGCCGCCAACACAAAC CCAAGTGCTTTATCACAACCGTACGGCAATGATGGAAGTGCCGGTGAACA TTATTATAACCATACACCGGTCAACCCTGGGAGCGGTGGCGGACACACAA ACGATATATCACGTCCTTTGAATGGTCACTCATCTTTCTTATGTCATCCC GTTTCACCACACTCGCCTCCTACAAATACCTCTGAAAATATCGGCAGTTG TTCGTCACGGCTTTATCTACCGCCTAACTCTTGTCGAAGTGCACAGGGTG TTCATTCCAATACTTCATACAACCAATCGTCCATGTGGTCGCATATGACT TCAGTCGGATCACTCAGTCTACCGCAATTTTCATCCGCCCACAACCACAG TTCACACAACACTAAAGAATCACCAATAACTTCAGCCCTGGATAACTCAC CGATCTATAACGCAGATGACCCGAAATTGAAATTACAGAACAGTTTACAG AACTATCCATCATTTCCACCTCATTTATACCCACAGTACGGTGGCAGTGA ATATTCGAGTGTTGGAGCGACCGCTTTTGATATGTTGACCGGTTTCCCGA AATGTCGACCCATTAGCCGATCAAATTCTGGTAAGTCTTGTTAAATTGAA TAAAAGTTTTTGTTTTTATATGGTGTCTGAATAAACTTTACATGTTTCAC TTAAACCCTACAAATTGAGATTTTAACAATAGTGAGCATTAGTATCATCT TAACAGATGCCTTTTACGCGGGAGTTTTGTTTGTAACAACTAGAAAAGGA TTAGATGAGAAAATGAAAATCGTGAGGAATGTTTCAGAAACTTCAGATTG AATTTGTGTACCTTTTGTTTTATAAATTAGCACTCATCAACAGTTTTAAT TGTTCCAACTAAAAGCTCAAGAAATGTGATTAAGCCAATTACACTTACTG AACATCATTTAACATCTTGAGAGAAAAGGACACCGCTAATAACTATCACA ATCTTATTCTTTAATTCCTTCCGTTAAAATCGTTTTCCGTTAAAATTCTC CCTCTTTTCAAGACAATTGATGACAAGATGTTGGTTTGGGGTCATTATAT CCTAACTAGCCCTCATCTGAATGTGGTTGCGATGATAAACAAAAAACCGA CGATTGTAACTGCCTAATCTTCATTAATCTTTATTATACTGATTACCGTA AGCTCTTTCAGGTGGACTTGCTGAAAAGCAAATCCCGTTATTTCCGGACA GTTTCGGACATCAGTATTTGAAATTCACGGAAATTTCACTACTGCCCTTC TTTAAGAGAGAACATTTTTACTAAATTAATTGGCCGGTAGGAGAATCCCA GCTATGACTAATTTCCACTATACAACCTTCTCTGCTGGAAATTTATTTAC TCCAATATTTCTCTTTGCATCCCTGAGGAGCTCTTTGAAGACTCTTTTTC AATCAATTTTTTCAAGCCTTTTTTTGTATCGATACTAACTAATAGGTTTT TAAGTTTTACTCTATTTTTGAAATACTTTTCTATAGCTTTATTTTTCCCA AGAAATGAAAGTATTTTTTGCTTGCTAATCGATAGATAAACTTTTCAATG TCCCATGAAAGGAATTTCATTATTTTGAAAATAGGGTATTTATTTCTTTT CTAAAAGTGTGAAATTCCTCAAATAATATCAGATTTTAAAGATTTCTTAA GTAAAACAACAAATTGGTCATAATCTTTGGGGTGCAATGACTTATTCTCC CTGTGAATCCCCATTTTACAAAATAAGAAAAAGAAAACTTTCAATAATAT CAATATACATCCAAAATCCATGATTATTCAAGAACATGATGATTAAAGTT ATCCCAAACTTTTGAGGGGGCCTTTGAGTTAATTTTTTTACACTGTCAAG GCTTACAATAATATTACGCATAACTAACTCCGTCCTATATTAGGTTAAAT CTATGATAGGAAATGATAAATTTTATCATTGACTAAAGAGGAATATCATT TCCTGTATAATACAAGCAAAGTTACTTCTCACCGTTAGTCGTTCGAGGTG TCACTTTTATCATTACACAATTTTTCCTTACAATTAAAGGCTGAAGTTAT TGGTTAGCATCATTTATCTTTATACAATCTTTTTCTGCGGATATATTCTT GACTTTCATCTGTAAGAAGAACCGTGTGTCTTACTGACTCTTAATCTTTA TTTTTGTGACTTTTTCAGCGGAAGGTCGGGAATGTATGAATTGCGGCGCT ACGACGACGCCATTATGGAGGAGAGACACACGTGGTCATTATCTATGCAA CGCATGTGGTCTTTATCACAAAATGAACGGCGCTAATCGACCTCTCATCA AACCCAAGCGAAGATTGGTAAGTAAAGTAGGTGCATTTTGTTTTTAGGCT CTTTTTTATTCACTTGATTTTATTGCTTTTGTTCTGGTTCACTTGAACGT GGATGTGAAATAAACATTTTATAAGAATTTAGGAATTATCGGTTTCGAAT TCAAGAGATGACTTCTACTTTAATTCTAATCTATTTTTCTGAATTTCACG AAATTTCTTTTATTTTCCTTCGTTCAGTCACAAGCACGGCGGACGGGAAT TATTTGTTCGAATTGTAAAACATCACAAACGACACTATGGAGGAGAAATG GAAACGGAGAGCCAGTCTGTAATGCATGCGGTTTATACTATAAGTTACAC AAGGTATAAAATTTTAAAGATTTTATCGCATTTTTTTGTCTGTTACAAAG AGAAAAACCTTCAAAAATCGACTTTGACCAATAAAAGGGGTTTTTAGTTT TGCTACAATGAAGAAATACTTTAAATTGAAAAAATAACATTCCGAGATAT TTAATTATGATAAGCAAGAGTTTTTGTTTGACTTTTATGACGTTGGGTTT TCCTCCTGTACGCGCCATTTTCGTTTTTCGGCGCGCCTTTTTGTAATGCC ATATGTCAGTTATATAGCAGATAAGAACATGTCCTTTCCTCGTCTATTTT TGTTTCCATGAAAATGTAAAAAAATTCTAAATTATACATTATAACCCATC AAAAGTCTGTGAGTTTGGAACCAAAATTTTCCCCTCTCCCAAGAATCACC CTTAACTTTTATTTAATGACGTCATCCTCCAGTTACTAATGGCGACATTG ATTGTTATCTGTCTCCAGACCTCTTACAATCCAACTTTTTTCTCGACATT TTCTTGATTTAATCACCTTTTTAGATCAACCGTCCTTTAACGATGAAAAA AGATGGCATCCAAACACGTAACAGAAAATCCTCCGGCAAAATGAAAAAGT CAAAGAAAGAAAATTCAATTTATTCAGACGCCGCCGTTCACCACCATCAG TTATCGTACGCGGGCGGTATACACCCTCAAACAATGCTCCCCGATAGTTT ATATTCCACCACCCCTGGTAATCACATGAACAATACAGAAATTCGAACTG TCTGTTAATTAACATTGATATTTTTTAATTTTCTTCAATTAGCGAAAAAT GTTTGATTTATTTAAAGATTTATATATCCTTTACAGAAAGTATTATATGG GGAATGGGGGATCGGGCTGGGAGGGCTATAATATTTTAACATGAGTTTAA CTGAGGA
Gene-mRNA-Prot
The following transcript feature(s) are a part of this gene:
Feature NameUnique NameSpeciesType
TCONS_00013174TCONS_00013174Clytia hemisphaericatranscript
TCONS_00013173TCONS_00013173Clytia hemisphaericatranscript
TCONS_00013172TCONS_00013172Clytia hemisphaericatranscript
TCONS_00013171TCONS_00013171Clytia hemisphaericatranscript
The following polypeptide feature(s) derives from this gene:
Feature NameUnique NameSpeciesType
TCONS_00013174-proteinTCONS_00013174-proteinClytia hemisphaericapolypeptide
Position
The following features are aligned
Aligned FeatureFeature TypeAlignment Location
sc0000162supercontigsc0000162:472705..498461 -
Expression

Hover the mouse over a column in the graph to view expression values in transcripts per million (tpm).
Sort Descending | Sort Ascending | Only Non-Zero Values | Tile/Chart | Reset | Show/Hide Values

Values :
    GrOo_1	 GrOo_2	 FGOo_1	 FGOo_2	 EG_1	 EG_2	 P1_1	 P1_2	 P2_1	 P2_2	 P3_1	 P3_2	 PoPr_1	 PoPr_2	 St_1	 St_2	 GO_1	 GO_2	 PH_1	 PH_2	 BMF_1	 BMF_2	 MMF_1	 MMF_2	 M_1	 M_2	 GEC_1	 GEC_2	 GEN_1	 GEN_2
3.99 3.26 1.49 1.33 17.53 12.84 20.14 20.51 9.35 12.05 10.02 8.28 7.22 7.9 4.62 6.03 12.68 12.28 7.45 8.31 10.37 10.67 11.19 12.93 14.71 12.69 3.78 4.25 7.69 8.66