XLOC_007024 (gene) - C. hemisphaerica

Overview
NameXLOC_007024
Unique NameXLOC_007024
Typegene
OrganismClytia hemisphaerica (Jellyfish)

Sequence
The following sequences are available for this feature:

gene from alignment at sc0000145:73460..84453+

Legend: gene
Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.
>XLOC_007024 ID=XLOC_007024|Name=XLOC_007024|organism=Clytia hemisphaerica|type=gene|length=10994bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000145:73460..84453+ (Clytia hemisphaerica)
attttcttcatttttagaacattttgcATGTTTTTAATAGATAAGGGTGT AAGTGAGATTATCTTTGAAATTTCAGATCTTTtatcatttattttgaaat caaatttcaTCACATAATCAAATTTTTTAGTTGTAAATTTACTAGTAAGA TTTTGGACTTGAAAACACTAGTAGTAAGATGATAGTTGAGCTCAGCAGGT TAGCTCTAAATGTTATAATAAAAGGACTTGTTAAGTGAtagaacattttt attttaatgtcatCTGTTTTTTATGCTGGtcttctaggaaagaaaatatt aaaggAAAATGGCAAGAGCTGCAAGGGCGATAACAAAAGATATTCAAAGC TACATAAAAAAATATAGCCGATATCACCAGTCTGTTCTGAGTATTGAACA GTTCACTCATTTTGGTaggtttatttttttctgtagGACATTTCAATGTT GTCATCTTTCATAATTTAAATGCATTTTGATGGCGCAGATAGCTAGCTGG ATTTGGCTTTTTATCAGATTTTGCAGTGCGTTCtgcattttttaatattt tttagagttgacattttcttttatgttttgccggttttaaaatttatatt tttatgtaTGTTGTGGTAGTAACAACCTTTCTGCCTTATATTGACCATGT GCAATTACAGTCAAATTACTGTACTATAATAAAATAGGTGATAGATTGCG ATAGTTGCTTGGGAGATAACGCGACAGCCTCTATACGGTCagctgctcta acttgggactatctgacaaaacatgggacattaattcggccaccatttca ccaaccctccaaagtcatttgatttgagtaaaTGAagggcgtattaaaaa atacacgatttctcatTCGCACCATAAGTAGGCTTTTGAAtcgaaatata aaaataatccgtagtggaacacacgctgcgagtgtctgtgcactctaaga ggaacgaagaagtaccgtgagtggtcctaaatccgacagccttgcctaaa tccgatggggtctttcaaagatacaaactaaaataaaaacaaacctttcg ctgtgacacaacgaagataccaaagtgtcaactaaactaagagatttgat tatttctacaactcacacttttttgatcccattaattgacatcttgacat taaagtcatcttgttagatgttctGTTcagagagttcttgcaatagctTA TTGTttaacttggagagggaatgtttgtaaacatagaattttttttcgta gcagttatttggggggtcggatttaggcagggctgtcagatttaggacca ctcacggtataattgataaacttggtggagtggagaaaatacaggccaga tatcaaccagtaccatgtttcaaccaatcgtcctAAGTTAGAGCAAGTTG ACtgtaacaaattactccacatacattactttcccccagccaataaaaac gtgataaatttttgttgttattattataaaacatcagttattcaataggc cgttgtgttctccaaaacaactaaaTGGCTTTTTAAACAACTTAACCACC GCCAAACTTACTGACGTGGAATGTTCGGTGTTGaatgacaaaaaatttca cCACCACACCATCCAAACATTAGACTTCAAACTGAGGAGTGATGGCCAAG TGATCAAAGGtgtcagcgtctcaaaccagggattcaaggttcgaatcccc gctccttccaatgtacGGTTCAGCTCATAGATAtccgagccggctggccg tggaccccgtgaaaacaatccaaagactgtctaaaagtcctagatgaCTG GGCTATCCACATAAAATATtgactctatctatctataatCAGTCTGGTGC ACATAAAACGTTAAAGAAAAAAGTCCACTGTTTGTCTGGTGTCAAGAGCA TAATATATATCACAGGACATTTTTGTCCGTtgtgttctttattttttaga aatccTATCCAAGAAACGTAAACTTTTCTGTATGACAACCCTGTCGACGC ACCGGATAGTTCGGTGCCGAAAAGTATTCCTCAGCCACCACACCGGAAAC CTTTTGTCCGGTGTTGATTGGACACCAgacaaaatttgtttaaaaaataa tgcGCACCGGACGCACCTGAATCAGTCCGATGTTGAGATGTTGTTGATGT CCGGTGTTAAAAACTATCCTCCTCCAACACCAGACTTTGTGTGTCTGGTG TTCGTAAAGtctggtgcgtcggcagggttgTTCTGTATGTTGCaacataa ttatttaaaaaaatcattacacAAATTGACATGacataatttttgaatta agtTATGATTAAAATCATGTACCAatcttatttaatttttaaagagtAAC CCTGGTAATCTTTTTGTGTCTGCTCCAAGCAGCTCTAAGAAAAGTTTTCT GGTTGTTTCTACTGTAGgtataaaaatctaaaattttgaatgactAACTT TTGCTTGATCAGGAAGTAGATGTTCATGGATTTCCTTAGTTAAAAAGGAT GAAATGAAAACAGACATCTCTAatttattttcctttctttttttcgcttc aaattttttctgcatTATTTCTTCCTGGTAGAATCTtggaatttttactt ttttttgctttaggTAAAACGGCATCTGTCAAAGAATCCTTCTCATTTTT ACGATTTGAAGTTCCAATCAGGCTGGCCCATATCATGCAAGAAATTAACC ATTTACCAAAGGTTTTACTCCAAACCCCTTCTGTAGAACTGGTCAAAAGC TGGTAAGTTTGCATTTCAATACATCATTATATATAGGGCATCTTttgtta aaattatttttgttgacATTCAAAGTGGACCAAGACCGTACTCTGTTATT TCtgcataagcctaaaaaagctaacatTGCTGTTAAGTGTTATTTGGTTT TACAAAtgtttgaaagtaaaattttgttATGAGGGTGCTTAGGCTGAAAT ACTCAAATCACAATGTTTTCTAATTCCAATTATTCTCATTCAATTACACA GGTATGTTCAAAGTTTTGTTGACttgatggattttctaaatgATGACTTT AGTGAAGATGACATTGAAAGGTAtgctttttgtcaaaaaatattcatgac TATATGATTTTCTTTCATCGTTTGCTGGTTTTCAGAATGAAATGATAATA TTAGAGGAAAATTTATATTACTTTTATTCTGTTCTATTCAGATTCACAGA TACATTATACACTATCAAACAACGTCACGATAAAACAGTTGAAACTATGG CTCAGGTATCTATTTACAACTATTAAATCATGCTTTATTAAATTAAAGGT TAGCTAGATGGAAGTTGCTGGACTTGACTTTATAAAAGCTTGAATTACAT GCTAAATGTTACATGCTTAATATTTACAGAAATATACAAATATAGGTCTT TGTCTCCTCCCCTGTCCATTTTTAACCACATCAAGAGtgtcaaatttctt taaattgaCCATAAAGTTTCAAATTGCATAGTAATGAAATTCATTTCCTa ttggaaatatatttttgaatttatttctttttcagggTGTAATAGAACTC AAAAGTGCGcaaaataaattcatcattgatcctaaaatgcaatattttct gggtaataattttttcaaaatgtttgacctCCTATAAATTTTGCATACAA AATTTCTAGGTATATATATTCTCTTTGcagacattttttggaaaaatgat gTGAGAATTATAAAACGAGAAACATAAATCAGATTATAGCCTATCAGACA TGAAATGCTTTTGTATTCTGTGGTTATGTATACATTAATGTATTTCCTTT ACGggttttttaaagtttcaagaaaatatCATGCTTATATTTCTAACTTC TCAGTTTCCACTCATACCTTTTTAAAACTTTCCATTCTAGATCGTTTTTA TATGAACAGAATTGGAATTCGTCTTCTAATGACAAATCACAGTGAGTGCC ATgctgttttctttgttttgaaatttgaaacagCCCCTCTCTCTTGTCCA AAATCCAGGGTTTCTCACAATGtggtttttttggaaatctattTCTTATT GCTGTTACTAGTAAAAGTAATTTATTGTGTCAGTTTTTAAGACTGAAATA GGCTTATGTCTTTTTGGAATCTGATATTAGCTGCTaatttgatattgttg tgaTGTCTGCAAAACTGTTGAAATTTTATATGCACCCTCAAATAAAagag ttttttgttttgtttatgtttttcaacttttttggaaaccAGACATCAGA CATTCACAGTATGAAATCTGTAATCTCCAACTGTGTCGGCTGAAAACTTG TGTGAACAAATTTTGCTCCTGGCGAGGgacttttgttttatttgaaaagc tttttaaaaaacaaaaactttttatgctaaaaaaaaaaacaaattcttcG CCAaattctaaattaaaaaaatcatgcTTTTTAACCAGTTATTCAAAAGT TTGAATTCAAACAGTTTAAAGTTTCAAAGTAATGCAAATGAAATGTCGGA TCTCGAATTATACACAATGATTTTTCAGGCTTTCAGCCATATACTTTTGC CCAACTTTTACcgtatttttggaaatttataaATTTGTCCTTTTGATTCC ACATTATATTCCCTATATTTTCAGTTGCACTCTTTGGCAAACATCCACCT AGCAGTGGGAAATTTATTGGTGTGTTCGAACCGAATTGTCGGatcaaaaa agttttagaaGGTACGATTGTATTCATTTTCTACTCGAACTTATTCTTAT ATTTTTGAAACTGGACATTTATTTCCTCCAACGTATTTTTTAAAGGATGA GCAGAAGCTCacataaaagtatttttattttctgcctttcattttgaaat tattatctTCTGCTTCAATGTTCTTCCCCTGAGAAAATCATCATGTTTCG TTTGAAAGTATTCTTTTCGTGAGCAATAAATTATCACATAATTACCgtga aatattgcaaaaattcgATGAATTATATTTTCTTACTGATTAATTGCCTC TTAAagatttattttcatgtttttaattgGTCTGTTCTGTAATATTACTT GATTAGCCTCTCATTCTTCGACTTTTTAGATGCGGTTGCAGGGGCTAGTG ACTTATGTGCAAGAACTTATTTTGATTCACCCATGGTCAAGATAAACGAG CATGGTTAGTAAACGAGCAAAAGATTGCATGAATTACTTCCTCAATTTTA ATCAAACATTAAAAAGTTTTATACAGTTGAATTCCAATAACTGTAAGTCC TACTGAACAGAGAGTTATTATAGATTTAACTCACAAAGTGTTGAACTTTT TCTTGGTGTACCTGATTTATAAGGGAACTACCGTAGGTTGGTTTAATGTT GACCTCCTTCATCTAATTCCGATACCTTTCTGGGGGAAAATAGTTGGTAT CGCCGACGGTCAGAGATGAAAACATCTTTTTCTAATCAGTGATTCCGACT TTCTttagaagggtgtcggaattataTGAGGGAAGTccacattagaccaa cttacgataGATTATGTAAACTTTTCGAAAAGGAGTACCTCTTTCAACAA CATCGTgaccaatatttttcttttggtttAGGAGTAAGGGAAGGAGAAGA TGAAGTGATCGCAGCTTACGTTCCCTCCCATCTTCATTTTATGCTCTTCG AACTTTTAAAGGTACGTCTTATTATGTTTCGTTAAATACTTGTACGCaaa gatattgaaaaaatacacgGTGCTCCAAACTCGAAGAGCTTGAAAATTCA TCGTTGGTTGTATTTTGCACTATGCTGCTTCTGTTATCATCATTTACCCA ACGAGGATATACTTCATTGTTAGTTTAGCTGTTCATGTTGATGCTTGTTA AATAAAAATCTCGAATCTAAATTCAAATGTTGATTCAAGTGAGAGTGGAA GGAAGCTCCATTTGGTGTTTATTTTGCTGCAAATTTATGGTACAACAAAT CCAGAATTACATCAATCAATGTGTCAGCCTTTTCTTTAACAGCTTGTGAA AAGATCTCACTGAATTATTGCCAATTTTGTCTCTTTCACTTGTTAAATTA TCTATCCCTTATTCCAATCTTTCATAGAACGCGATGCGGGCAACAGTAGA GAAGCACGAAGCAAAAGACGAGATACCTGACATAAATATTGATATTGTGA AAGGAAACGAAGATTTAACGATACGAATAAGTGATTTAGGAGGTGGTATT TGTCGAAACAAGATCAAAGATTTGTTCACGTATCACTATAGTACGGCACC GGAGCCTGACCAACTCGAAGGGATGGCCCCATTGGTACGTCCTTTAATTT GTAGACTAAGAGCCTTACAcgatttttaataagaacaaacaatataagaa cataaggctttgatggccaaagcacaagttaagaaaataagaacatttta agaacatttttagatctaaaactcaaaaagttaagaacatcccaaggctt caaaagttttggatgtagttattaaaaaaaacctgtTGAAGGCAATGCTC AGTTTTTACCTACTTATTTTGTCACACTTTTAACCGTGGGTCTACTAATT TATGTGCTTATCTCCTTTGTTGAAACTGCCTACCCTGTTGAAGATTTTCG TATCGTTACTCAAGGATTTCACTTTGTTTATGTGGACTCGTTAGATTAAT AACAAGGCCGGCTAAATCAGTgcactcttaggttccaaataaacgggggg gggggggccggggggggggggggcgggggggggggggccggggggggggg gggcgggggggggggggccggggggggggggggcgggggggggggggccg gggggggggggggcgggggggggggggccggggggggggggggcgggggg gggggggccggggggggggggggcgactcgcggggggcctaattgccggg gggctaattgccggggggttggaagataataagaaaaaaaaaaggtaaat aagaagaaatataggctaaaattaggctatttagagcaacattaggggcc ttctctttgacagctgaataTATTCTTAAAggttaataaacggggggtcc taacaaggtccgggggggttgaaaaattaacaagcaggggggTCGTTTAT TAGGAACCTAAGAGTACGGATTATTGTGCCTGGCgaatgaaatctttttt ctgCGTCTTGAGACCTCCCCCCCTTGAGGTCCAAATCATGACCTCTGATT ACGTGAAAGAAAGTTAAAGTtcttttttaaacattcttaCTTATAAATTG CGCCTTTGGTTGTTGTGTGAAAGTATTGATGGTGAAAGTATTGATGGTGA ATGTTTTGCGTTGCGTTGTTGTTTACCCTTTTAATGGATTGATTCTATTC ATTCAGACTCATTCACCATTGCATTGCTATAAACTAACTAACTGAtgatg gaattttgaaaaattaaataatttataACCCGGTGACCGCGAtttatgtt ttttcttgtcTCGTGCGAAGTGTTCATTTTCCCTTGTTTATGAATATTTT CCCCTCGGATAtctcattttttctttatccgtttttcttctgtttttcct TAGATAATTATTTTCACTAGTAAAATCTCTCTCTTCGAGAATTCAGTAAA TATACTGGGAAGCCTTGGGATAGAATTTTCCTTGCCCTTCTCTTTTTGCT GAAAATGagagcttttgaattttgatttattcCAACTATTAGTAAGATAA TAATCCAAATCCCGTGTCGGACACTTTTCTTAAAACACATCGAGGATAAT TCTGCACTTAAAAAGTAACCATGCATTCAGTGttcattttggccatcgaa gccttatgttctcatataaaaacgtgtattcgttttcttattataaaaat tttagACTGGAATTTTGGCCAGACCTTTTCTTATAAGAAGTTCCAATGTT TTTcaagccttcggatgctcttaactttttgagttatttgagttattttc gacatttttggagtatttttatccattttcctaagaaatcaggtgtttta gtgTCCACGAAgccttgttcttaacttgttcctaacattttggccatcga attTTAAAAGCTTTAGGCTAAAATTTTGGCCTGATGTCGTATCTAAAcgt gaaaatgttgaaaaaataaattcagtCGAGGTTGATCTTatatttactgg ttcttataaaaagcataCACAAAGTAAAACAATTGTTTTGTGTTTTCTTA CCTATATTCCTgcatttctttttctctttcttgtaCAGGCTGGATATGGG TACGGTCTACCTCTATCGAAACTATACGCCAAATATTTCGGTGGAGATAT CCATATATCATCATTAGAGGGGCTGGGTTCGGACACGTTCGTCTATCTGA AGGTAAAGTACTCCAAATCATTTAAACATTTTGATTCGTTTATTCTTCAC TTCCCTGTTAAGTTGTTCTCCTTATATTAATCAAGTAAGATTTCCGATTT GTTAGAGGTCTTCCTCAGATTTGAAACCGAGGTGTATCAATGAAACGGAA TACCCCAATTCGCTACACCCCCTTAGAGGCCCAAGTTGTCTCACTGCGTC AATATGTGACTAGGTGCTATTGTTGCGTAAGGAACCGTGATGAGAGCGTG ATGATTGTGCGTGACGTCGTGATGAGGGGTGTTGCTTCTTTAGAACTGAT TATGATAGCTTTAGAATGATATGTAATACAGTGGAGTCGaacttctataa ctcgaatacatgtttttttataagcattgtgcttataagcatatctaggc ccATAtatgggaaaaaattttaagcatatgctaagccattttcagaattt gtttgtttttggctAGATTCTCGAAATTTCTATAAAATTCCGCTCAAAGT ATTTTTCAGCTTTGTTAATCTCTCGATCTAAGCATTTCCGAGCcagcttt tggatttttgtatgcttataaaaaaacatgtatctccTTAACTGGGACAA TTTTTTGCTGCCCGTGTGTGTTCGGATTACAGAGACTCTTCTTCAGCAGA ATAAATACGATTATTTTGTCTCCTTTTCTTTCAGGCGTTATCGCAAGATG CTCAAGAAGTCATTCCAATGTACAACAGTTTGGTTGCTAAGGAATATGAA GAGATAGATCAAGAGACAGTGCGCTCTTCACAACGCGAATGGAGTTGTGA TTCATTTTACGATGGACAAATTCGTTCTTATAGTAAGCCTTTCTTAAGGA GCTCTGGCAAGAAGAATGGGAATGGAGGTGTGAACCGTGGTAAATAGAGG CTCATTTTTTTAATATGAAGAAAGCTGGTGGAGTGATACAATCGGCTCTC CCACCCAAGGCTTCGACTTGGGAATCTCATTTCGGCTCGGGAATCTGAGT CCTAAACCACCCATCAATATTGATTTTTGCAAGAACACTGAATTCTTGAA ATGATGGCTGGAATGAACATGTCTGAGGCAGTTTATGTGTTTCTGTTCTA AGTTTTATTGTCGAGATCTGTGGGCActctattgaagaaaaaaaaactaa aatggtaCCGTTGTTGCGTAACCATAAATGTCAGAGAAAGCAGTGTTTtt aatatatataattttttaatgCGAAATCTTCGAAGCAATTATTATTGCAA TTAtcagtttttattgaaatttttttttctcaaagacCGTTGTTCTTTAG TTAGTAAATTATCTTTCAAGTTTTGCATTTTATGAAATGCCTCTTAAAAA TACCTAGAAAAGTATAGCATAGGTtataaaaattgtgaaaaaaacgaaat tttattCTTAGATTTTTATTATATTAATGTACAATGTCATTCATATTCAT TTTGAATTAGgcattttttgaaccattttgtATTTCTAAAGACAGGCTCT CTTACGGAATATTTGCTCTATGGTTCAgtatatataaaacactagattaA GTTTCCTCCACCACTAGCTGAAGCAGAATTATGCATTATCGTTAATGAAG TTTTACTTGCACGCGAAAACAAGTGATTCATACTGTGGTCTACTTTCAGT AATGATGGTGCATTTATTTGTTTCGGCTGTCGTGGCTTGGGGAAGTTTTT TAGTTAGTTATGTTTTCCAATTTTGCGGATTTTTTAGCGTATCTGTTTTT ACTTCAAACTAGTTGAATTGAGTCTTGCCAAGAGCACACTTTACAGTATC ATAAGTTATAAACGTATCATTATTggtcattgaaattttgtttatCTTAA GCGTTGCAAATTGATATCATGATGATTGCTTCTTCACTTACTATCTGATA TGATGAAAacttaaagtttttttgtttgttttttcttgtaaaatataaaa gtgTGATATATTTGTGTTTGTAAAAAAAGTCATTATGATTTTGTGAATAG TATGTAAACCCGTATACCTTTGTTAAATCCTTTTgtgtaaatttcttttt gtcaattttcccccataatagggggggggggtaaacttTAGGATCTGTAA CATCTTTCATGGGACGCAAGtgcatgtgattggttcgaaagtTGATCAAA TTTGAAACTGTTTTGAGGGGACCCGCGATAGGcctggcaaaagtttttat ggccTAAAAACTGACCTTGTATGCAAAACTCCTAACTCCTAAACCCTAAA ATGAGTAagatatttacgatttttaaaGTGCAAAAAATACCATcagatag agcatgaaattctgagcaagtaAGTATACTACAACAATTCTTATACACAA ACACACAAAAAGATTTGGCTATTTAAAGTTCGAAATCCTGTGAAATAGGC TACATTTTTTTCTAACtgacaaaattttggaattgGAGTACAGTATActt tttcgatcagttgctcaGAATTCATGCTCTCTGATGGTATGAATCATTTT CGTTGAGTCAGGTTGAGTTCAACTTTGAAAtttcgtcaattttttattca ttttgggTGTTAGGATTTATCTCTATGACATCCTTTATGCGACGCAAACA TCTAGGAGAGAATCGATTAAGAAATACAATAGAAATAACACGAT
Gene-mRNA-Prot
The following transcript feature(s) are a part of this gene:
Feature NameUnique NameSpeciesType
TCONS_00012495TCONS_00012495Clytia hemisphaericatranscript
The following polypeptide feature(s) derives from this gene:
Feature NameUnique NameSpeciesType
TCONS_00012495-proteinTCONS_00012495-proteinClytia hemisphaericapolypeptide
Position
The following features are aligned
Aligned FeatureFeature TypeAlignment Location
sc0000145supercontigsc0000145:73460..84453 +
Orthologs
The following orthologs are found for this feature:
Ortholog NameDescriptionOrganism
PDK4pyruvate dehydrogenase kinase, isozyme 4 Homo Sapiens
PDK2pyruvate dehydrogenase kinase, isozyme 2 isoform 1 precursor Homo Sapiens
PDK3pyruvate dehydrogenase kinase, isozyme 3 isoform 1 precursor Homo Sapiens
PDK1[Pyruvate dehydrogenase (acetyl-transferring)] kinase isozyme 1, mitochondrial isoform 1 precursor Homo Sapiens
Expression

Hover the mouse over a column in the graph to view expression values in transcripts per million (tpm).
Sort Descending | Sort Ascending | Only Non-Zero Values | Tile/Chart | Reset | Show/Hide Values

Values :
    GrOo_1	 GrOo_2	 FGOo_1	 FGOo_2	 EG_1	 EG_2	 P1_1	 P1_2	 P2_1	 P2_2	 P3_1	 P3_2	 PoPr_1	 PoPr_2	 St_1	 St_2	 GO_1	 GO_2	 PH_1	 PH_2	 BMF_1	 BMF_2	 MMF_1	 MMF_2	 M_1	 M_2	 GEC_1	 GEC_2	 GEN_1	 GEN_2
4.44 4.24 1.47 1.02 53.64 38.48 33.25 35.73 19.6 25.88 21.37 20.09 18.11 11.95 12.46 15.69 38.38 24.58 14.75 21.73 20.52 26.52 16.86 18.78 37.15 31.1 30.03 21.98 12.82 13.25