|
|
Sequence
The following sequences are available for this feature:
gene from alignment at sc0000143:378729..389968+ Legend: gene Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below. >XLOC_006910 ID=XLOC_006910|Name=XLOC_006910|organism=Clytia hemisphaerica|type=gene|length=11240bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000143:378729..389968+ (Clytia hemisphaerica)
AATTTTTGTTCATTTGTGGCAGAATATATCggaatagatattatattttt
ctatttgttCAATcgtttgaaatcgaaagtagaATAATATCTACTTTGCA
TTTTGAATCCCCGATAAACATTCCGAGAATTACGTCAAAAGTCTTTTTAA
CACCGTGAAGGTTCAATATGGCTCTCTAAATTTGCCAGGGCATCAGATAG
AATTAAATAGGCCTACAAAATGAAGGTACTGTTTCCAACATCTTACgctt
ttcaatcaaatttcatgattttcaaCATCTTGGAACCTTTTCCTTCTCAG
ATACGGCTTTTGGTATTGAAAAGATGACTGATTATTTGGATATGAATGGC
TTTGTGATCGTGTGTCATTTGCCTGATTGGTATACTGGATTTGATAGATT
TTGGTTAACTTGTTGTGTATTGTATTAAATATTGAGAAGTTTGCTTTCTC
TCAAGCAAAGCATTTTTGAGGATTGTTGTACCTCTGAAGAGTGGTTTTAG
AAAATTACACTGGATTTGTCACACAATTAAAGTTATCGACTCATTTTCAA
AGGGGGTAAAATTGGAAAGTTTCAGGTTGTACATCGACTTTCATTGCTCC
AAATTTGATCAATTGAACTTATCGAAACGATCGAACTAATCTAACCTACT
TaatttttacaagaaaaactaaggggtcactcacatatcgattcttcacA
CAACTAACATCAAATTGACGCTAACTTGAAAACCCTCCCACCCCCACCTC
TTGAcgtgaaagtttaaaaattatcaaaaatcaatgaaactctaaatttt
ctatttcactttcattgttgtttcgtcagccatctttaattgttctaggg
cttgctcagtttacattttaaataaatgaggtaatttttaaacttttttc
ggaAAGTTGCCAGAATTAATTATCTCTGTAATCATAACCAGGCATAGTTA
attgatataatcgataatcttgagtaatcgataagtaatcgatggattag
atatcgattaactgatagaatcgatagggaatcaatactcaagatttttt
caaagctcgattatttatcgatcaattttgcCATCGATTGTTTACAGATT
ATAAATCAATTATACTTCAATCAAATTAGGATTCCATTAAAAATCGATCg
gctatcgatcacagcttttgatagggtggtcaggccaaaattttcccctc
aaattttgaaaaccaaaccaattttatttgaaagtccttacctttgtgag
aaaaatgaggggtcatttgttaaaattggtcaAGTAGTTCCAAGCAACCA
TGAAATGACCTTTAAAGATGGCGGGTGAATTCTAGTCTTCCGCGTGGCGg
gcgtgaggagttttgctggcgcggtctgaaaatcagCCCGATGATTGTTA
AACTTTTAGCCTATcagctaatgagctggaaatgatagctaaaaacacat
tttaccaatgaaaagctgaaacccttagctttccaacgatatatggtagt
cctgataaaaatttcagaaaagtgctgaaaaatctaaatttcttgtattt
tttggATTTAAAGACAGCCTGTAGATTATCGAAAAGGCTACCAcgtgaca
aactaaagtactatctttcccgcgttttataatTAAAACCGCGAGTATAG
ACtaaaccagctcaatagcgatagCCACttgaaaaatggtggtcaaggtC
GACGGTGGTGCCACAAATTCtgagtcgccattttttcaccttgatgtcta
ataaatggtatatctttttattgaatgTAGGTAATTAgatggggtttttt
tctttgttttctctgataagttctgagtatttaaaaaaaaagaatgaaca
agtttggagttgttaaggataagttatgatggatggaatgttctaatttt
gattttccacTTGTTCCACGctaaaaatcccgacgagtgcgcaccctact
tttgatcgattacatatcgatcaaaaattgattaatcatcgatcaactat
cgattcgcgatacttcattaaataccttatcttggccctttttacgcccg
ACCTTATTAgtgttatttttgggctcgttggtggaataaggccctgcgta
aaaagggccggtaaTGTAGTGAATAGTCGGTTGCGATCGATATATAATCA
ATAACGATACGTGatcgaagataagtaaataattgataagtaatcaatgc
ataaatgataagtaatcaatgcataaatgataagtaatcaatgattgtta
acaatcgatacatgattgataagtaatcaataGGTTGTAatgtagtcgat
atgtgatcgataagtaattgATAGCTTGGTAATAATCGATCGCTGATCGa
tagattttttgaaggtctgattacctatcgattctattggttaatcgata
tctaatccatcgattactctGGATTACTCAAAATTATCAAtcatatcgat
taactacgtcTGGTCATAATCAACAGATAGCGGTAGTTAAAAAACAGACC
CCCTTCGCGTCAATTTGaagttagtcgtgggaagaattgatatgtgagtg
acccgtAATGCAGCCATAGTGTACACGCCCCTAAATTAAGGGGGTTTTGT
TGATTTGGGTTCAAaatctttaggtgggactttcgattttttggatttca
gggGGGGCACAGGATTAGGTGGGACCTGATTTTTTAAGGTGGGACTAAGG
TGGTTTGGTTGTAAAATTGAAACATCTCGTCAACATCAATCAATGATATA
TAACTTTAGTAGTTACCTTTTACTATTGAAACCTAGTGGATAATCTTGTA
CATATGACCTGTATTATACTTGAAAGAAGACTTANNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNCCTAA
ACTCTTGTAATTTCATGGAAGGCAAAAAAGACAGGCAACTTGATTATTGA
CTATTGtttaaattacataaattaagCATTTTAAGGCCATTACTTTGAGC
CCTACAAGAGATGAAACTGAGCTGAGTTTTGCAGCCCCATATTGCTCTTT
TCAATTAGCCAATCAGAAAAGACATTACTTTTCTTGTACCATGTGCAAAA
GatatcaacaaaagaaaccaattTTTCGGGTCAGTGGAATGAGAAGAATG
TTCTGCAACAAAAGTGCTCTAGCGGTGAACCTTAAACGCCAACCATAAAA
TGCTGTGTGGGTTACAgcctaaaattttattttggaaagGTCATGTATGt
tgaaagaaaatgactgattttgcttgaaacacaacatATTGGGTGTAAAC
ATAGCAAAACTAGTGACCCCCTCTTCTACGCATCTGTATGCTTTATGTGT
ACCGGGGGGTACACAGCCAAATATANTGTACGCATCCGTATGCTTTATGT
GTACCCCCCTTTCAGccaaatataataccaataaggtagtgttaatcttt
tttatgaagttaaaaaaatttcttaagtTGCACCTTTTTAGCCGTAGTCA
TAACTATAAAACCTCTTAAAAATAGGTTTGAACGCTAAAAGAACAAAATT
ATTATCACAAATCTAAGTTTACTTATATACTTAAAGccacttgtttcaaa
taaacaccCCGCCTAGAGCATTTTCAGTTGTTGTTTCAATGTTGTTGTTA
TGATTAAAGGACATTTGTTGGGGTTCTGATTACTCTCAGGTGCTTATTCA
AATTCAGAGATTTGTTATCAAGTATTTTTCATTGGACACCTAATTTCAAA
GTCGCGTCTTTACACTCAGCCCtcccttaaaataaggggggaCTTGAATT
TTGGGTTAaggggaaatttttgaaattttcagaaatgaaGGGGGTTAATG
TTTAAGGGGACAAAAGCCaaagtaattttgaatttaagggTAGAGTACTT
CATGTGAATCCAAATCTTTTTTCATACTcttgcaaagttttttttttctt
aaaaatatactTAATATACTGTTTAAGGTGGTAAAATGAGGgtgaaaatc
tgaaaactttCTCTCTCACTCAACCATGGTGGGTGACAAGATTTTGTTGG
CGTCTGTACtaacacactttgtaatacgaAAAGCTCACACACTTAGTAAT
GAAATATAAATTTAaatcatagtgtgcaagggggttccaggtcccacctg
aaaattcaggtcccaccttatcctaaaattcccaccttcagcccagactc
ccagatcccagctaaaaaNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNTAA
ATGCCATAAAAATGATTTCGTAAAAAGCCCTGTAAATTGCTTCACTATAC
ACTTAAAGCAGACAATTGAAGATTTAGATGCAAagtttcaaactttaaaa
tgaagACTGATACGTAAAGAAAATAAACTGGGTTCAGtcctaaaaaatta
aaagtgcaAAATAATGAATATCTTACTGTAATCATGGGTCGATTATATTA
ACATTTATAACAGAGAAGTCGTAACCCTGCTTTTTGTAAATTCCCTGATA
CGAACAGATAAGAAGCTTTATGTGGCTGAAAGAATTATCAATTGACTATG
TTAACCaattctaacttttttttaatattgtaGTGATCAAATGTTTTGAT
CAGCTATGAAAATAAAACCAGACGTCGAGTGTTTTAACTTTCATAATAaa
ctggaaaatgaaaaacccattgccccccccctaaaaaaagTCTTCACATT
TATTGTCTAAACGGttttgaaatcttaaaaaaatctttttgttttggatG
GAAATTTCCCTTTATTATTAAGTGTGTCAGGTGTTATTACAGAGCATGTT
GATTTTTATCACAAAGCATGCCAAGTtctattacaaagtgcgttagtACA
GCCCCCTCTAGATCTGATACTCTTGCCAGGGGCCATGTTTGTAAGAATCA
CATGTTCTAATGATCTAATATTGAAGAAAAATCACATTCTCGAAAGCATA
AAATTAAAGGGGtactttagaaaagaaaaataagatttAAAGGGGGATTA
GGAAATAGGGCACAGTACTAGTTGAATTCCAAATTGAGGGGGGAAATGGA
TAAAGGCTAATTTGCtgtttaagggggggggggctgaaaaaCATGGATTT
AAAAAGTAGTAGCTTAGTTTGATTAGAGAATCTGATTTACAGATATGACA
ATGTTCCAAGATGTTGAATATTAAATTGATTATTTCCTATTTAATTTTTC
TGTCTTTATTAAATTCAACCCTACCTTAATTTTTCACCAAAGTTGCCGTC
CTAGATGCTAAAGGGTCCCTATTCTTGCAAAAAGGCTTTCACATATCAGG
GTTAAAGTAAGATTTTTCATATAATGTATTTTCTCTTTTAGTTGAACATT
GCTTACCCAGCCAATGGCAGTCAAAAACTTGTTGAGATTGACGATGAAAT
CAAGCTTCGTCCATTCTTCGAGAAGCGTATGGCTCAAGAAGTCAGCTTAG
ACTGTCTTGGTGATGAATTTAAGGTAGCTATATTTTTGTTGTGGGAAAAT
GGTTCCAAAAACGTCTTTGTTTGATGAGTCTTGtcaaatttgttcaattt
aaTCTGGAaataaaatgagaaattttgcagatgagttgggagtttttata
agatactttaataattggtaaTTTGGACtaataaagcttttttcacatgt
acgtaaaattttacttaagaccttgaagggtgggaatttccctaagctta
cgtagtgttttaaggccttatgtagagtttgcttacgttcaaaaaatttt
gaacggaaggaaaagtcacgtaagaccctcttaatcaacaaaaactctac
ataatgtcgGAAActcccaaaagacagccttacgaacgattttccgtaaa
gtctaaagtaaaattttacgtgcatgtgaaaaaagcttaaaagcgacgcg
ttctttagaaaaagtaacaattgttttattactggttaagcttttttcac
atgcacgtaaaattttacttcagATAttcatagtttgcagaggggtatga
acccccctaggtttatttcatccccccctatatacccatccccccctttt
gtaatgaaatcttatccccccttTTTNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNTCGAAGGA
AACTTgctttcccacctaccagcaaaattatcaacaagaaagagtatgaa
gtattatagtcacgagccaacaatgacagaatataactagcaatttgtat
ttgattagaaaattgaccaaaatttcctaacccccccttttttatttgat
ccccccctacattcccatcccccctagttttttcggcagatctcggtacc
ccccccctacaaaggccctccagaaagttggcatcccccctattaaaaag
ggggggtgcaaactatgataTTACGGAAAATCGATCGTAAGGCTGTCTGT
Tcggaatttccccgacattatgtagagtttttgttgattaaaaaggtctt
acgtgacttttccttcttttgaacgtaagcaaactctactTAAGGGTTTA
AATAttacgtaagcttagggaactttcaaggtcttaagtaaattttacgt
acatgtgaaaaaagctttaagggCCAACCAAAGCAAATGTATGAGCTTGA
AAAAACTCCAATTCGTCCCAAATTTTGTCCGGTTCTAAAAACTCtttagc
tcttcgggctttataaaggcttggggacacgagacgtttttttcgcgttg
gtgcaatgcaacatgctcgcATCCCCAAGCCTTAAATCTATGAcaataac
atttttttcattttcagggtTACATCGCCAGAATCTCTGGAGGAAACGAC
AAGCAAGGTTTTCCAATGAAACAAGGTGTAATGACTAACGGACGTGTCAA
ATTATTGTTAAAGAAAGGACACAGCTGTTACCGAACTCGACGAGCAGGTG
AACGTAAACGAAAGTCTGTCCGTGGATGTATCGTTGATAGCAACTTGGCT
GTCTTGAACTTCGTTCTCATCAAGAAGGGAGAACAAGAAATCCCAGGATT
GACAGACCGAGTTGTTCCACGCAGATTAGGACCAAAGCGTGTTGGTAAAA
TCCGAAAGTTGTTCAACTTGAGCAAAGAAGATGACGTCACACAATACATC
ATCCGTAAGCCAATCCCAACTCCCGAGGGTAAACCAGAGCCAAAGAAACC
CAAGACCAAAGCTCCAAAAATCCAACGATTAGTCACTCCACAACGTCTTC
AAAGAAAACGCAAAGTCTTAGCTTTGAAACGCGACCGATGCAACAAGGCT
AAACAAGAAGCTGCCGCTTACGCTAAAATGCTGGCTAAAAAGCACAAGGA
AGCCAAAGAGAAACGGCACAAAGAACACATGAAGAGAAGACTTAGTAGTC
TTCGGGAATCCAAGAGCAATTAATTTAGAATGTGAAAATATACaccttca
aaataaaatcatcaCTTTGTTTCTTCTTAAACCCAGAGTAATTGCGTTGT
CCTCTTTGACCAACCgattatacatttttttataaccTCCAATTTTCGTG
CCAGGGTTTAAGTTTCTTTgtagcttttttcacatgtacg
Gene-mRNA-Prot
The following transcript feature(s) are a part of this gene:
The following polypeptide feature(s) derives from this gene:
Position
The following features are aligned
| Aligned Feature | Feature Type | Alignment Location |
|---|
| sc0000143 | supercontig | sc0000143:378729..389968 + |
Orthologs
The following orthologs are found for this feature:
| Ortholog Name | Description | Organism |
|---|
| RPS6 | 40S ribosomal protein S6 | Homo Sapiens |
|
