XLOC_004674 (gene) - C. hemisphaerica

Overview
NameXLOC_004674
Unique NameXLOC_004674
Typegene
OrganismClytia hemisphaerica (Jellyfish)

Sequence
The following sequences are available for this feature:

gene from alignment at sc0000084:464392..488962-

Legend: gene
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>XLOC_004674 ID=XLOC_004674|Name=XLOC_004674|organism=Clytia hemisphaerica|type=gene|length=24571bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000084:464392..488962- (Clytia hemisphaerica)
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TCTAATTCGATTTACAAAAGGCATTGGATTTTCATCAAATTAGGAAGCGT ATCGAATAGTAGAGCGTCGAATATGAGAGTTTCTTGTTGACGGTTAATTT CAATATTATCAAATAATAGAAGCGTATTGAACAGTAGAACGTCGTTTAGG AGAGTTTCTTGTTGACGGTGACTGCCAATATTATCAAAAAATTGAGTGTA TCAAATAGTAGAATGTCGAATAATGGAACGCAACTGTATCATTGTTAATC TGTTTTCACTATTTCATTTTTAGGCCGACAATAGTGATAGCAATTGGTGT CTTTCTCATTCAGTATGTGATGGCCACTAAACTATTTCTCTTTGATAAAA TGACCCTTCAAGTTGATAACAGGTAACATCATAGTTTTGAAATCAAGATT CTCCTACTCTCAGGTACCTAATAAGGGTCCCCCCCCCCGCTAATTAATTT TTCGATTAAATTTTCCACCCAGGACATTCATAATCCAGCTCCCTCCCCGC TTATTCTAAAGCCCCCGTTTATTAGGTACCTGAAAGTATTCCAGAAAGAC TCTATTTACTATTATAAGAACAATTTAATAAAACCAGTGTGGCTCAAAAA ACACCAAAAAGATCACTTTATGAACAACATTGAGCCCGTAAAAATAGGAC AGGAAGAGTAAAAAACGCCTCAAGTTTGCTCTAGAAATGAGAAAAATTTG AAGGACCAAGAAAAAAACAGAATAAGAGGAGGCCAGCCTCCACAAAATTT TTTTAGTTCTTGTAAGAAGAATGTCCTTTTTGCTCACATGTTGAAATTCA TGTCAAAGAGAAATTCAATGACCCCTGTAAATCATCAAAAAACAGGACAT ATTTTTTCCGCTATAAGGTATATCATTCTTGACTTACTGACCTCATGAAA TGATAGAAGCCCTTTACTTTTCCATACAGCCGCTAAAGGTCAAAGCGTCC AGCTGAACAAAAAACAAACTCAAATCGTTCAAAAACTGATGAAGAAACAA TGAAAAAACTTTCTCTTTACTTATATGTAAACTTTTGTCGAAAATTGATC ATTCGGCCCTAAAGTTATTAGTAGCACCCTCGCTTTAACTCGTCGAATAT TGCGACAGCGAATTCAAATCTTTTACAATCTATGAACTGTTTGTTCACAA GTGTTCATATCAACCACCAAAGGGGTTACGGACATTTTTTACTGTTTCTG GAAGAGGACTCAAATGGCACAACACCTCCAACTCGTCATAAAACTTTTAA ATAAACGTTGCGTTTCAGTTGGTACTGAATCAGTATTTAATTCTATTGCC TCGCCAAAACAAAGCTTCCGATGCTAATTTTTATCATTTATCACTACTCA GTATTTTCGATTCTTCCTATTCGCCAAAATTATTGTCACCTTTGACCTTG ATATGATATCAAAGTGATATTAAAACAACCCACTGACTCCGGACTGCTGC CTTTTCCTATCCTTAATTTTCGTTTAAAAGAAAGAATCTTAGGAAGGAAT AATATTTCATCATTTCGCCTCCCATTGAGCAGAGGCTCGAAAAACCCGAG TTACGAAAATCCGAGTTACAACGACAAATATTCATCATTTTGTAACTCGA GAAAGCTAATTATGTTTATCCATTTAACTCGAATTTTCTTCAGGTTTTAG TTTTCGAGTTACGCAACTCGAAAAAAAAATACTAAAAAAAATTCATTACA TGACTGTAGTAAATAACTTTTTCGAGTTAAAAAAGCCCCTATATGACGTC ATTATTTGAGACTTATGACGTCACATTTGTCGTGATTCCGGTTTTTGCAA CTTCGGTCTCTGAGTCACCTTTCACATGTGTAACCATGCATACTTCTTCC TTAACAATGAAGATGGGGCTCTAATTGCTAGAAAATAAATGCGTTTAGAA AACAACACTCGCACTTTAATGCCTCGAATTTTTAAAGGATTGAAATGTAA AGATTTAGAAGCAAAAAAAGAAAACAGAGAAAACTGAGAATTTGAGGCTG AAATCACTGCAAAAAATAAGAACACCCGAGCCTGAACTAAAATGTCGCCT ATTCTTACGAGAAAAATGTATCCCACACACGTTTTTTATAAGAACAAACT ATGTAAGAACATAACGCTTGTTGGAATCTCGACTCCCGATTTCTTAGAAA ATTGCCCAAAAATCCTCACCAAAAGGTGAAATTAAGAACATCTTAAGAAC ATTTTTAGACTTGAATCTCAAAAAGTTAAGAACATCCAAAATGTTTGAAG CCTTCGGATGTTTTTATAAAAAAAACGTGTATCAGGCATGGTTTATAACA GAACAATCGTTTAATTAAACCCATCTTTTCTTCTTCCATTCTAGACGTGT GTACCATATCATCTCATATTCGATGTTTTATTTCAACATCTTCCTTGGTT TGGTGTCTTGTTTACTTCGCATCATCTTCGGCATGCTTTTTGGTATCATC TTTTTGCAACGTTTACAAAAAAGCACTTTACCAAGAGCGGCTGAACTTAT TGATCCAGGTAGGCACTCTATTTTCTGTCCTGAATATTCTATTAAAGGTT TTATTTTTACATAAGTTTCCCAGACACATATTTCATTATCTATTAAAAAA AATTCCATTCGTGCCCAGCTGGCACACAACATTGATCAACGCTTATCTCA TGTCCTAAACGGGCGGGGCAATCGGGGGAGGCTTTTATTTGAGGGGGGGG GGCATGTATTGAAAAATCTTTCCTTCAGGGAGGGGCATTTATAATTTTTT GGATTTTAGGAGGGGCATTTCTTCAAGGGTTGAGGGCTGTTTAAAAGAAG GGGGCGTTTTTTTTCGAAGAAATACGGTAATTTGAGTATAATTGTGTGTG AGGAAGTCGAGGGTTTCTTTTCTACGTAACTGAAATGCACTCAAAAAACT TCAGCAATTTTACAAAAAAGATGACATGGATTTGACTAAATTACCCAAAA TTGTGTCCTACAAGGGGGTAATCTTTCTACAGTTATTCTCAATTTCTCTA TCACGTCGTTTTTATCTACAATATTCACTGAAAGTGAATTTATCCGAAAG ACTTTCATCATTATAACAAGGGGAAGATGAGATTGATGTCTCTGTCGACG AGTCAGGGATGGGAAATGGCTATTCCTGACAACGTTTTCTCAACGTTCGT ATAACGTTATTTGTGAATGTTATGAACGTTAGGTGGACGACATAAAGACG TTGTGTGCCAGTCGTGATGGATGATCGGAATTTTCAAATGACTCATTAAA AATTTCATATCGGAATCAATGTATTGGAAATGAAATTCCTCTGTTCCAAA AAGGAACTGAGTCAAAACCCACGGACTTTTTCCCTTTCCGGTAATTTGCG GTCTGGCAAACTGATGATAATAATGGCTAGCGGTTTTTTGCAGTTTTTTT GAATATTAAAGCGTAAACAGGATAAAAGTAATGTTTTTCGACCACTGATT TACCAAATTAGTAAAAAAAAAATGAAAAACGTTAAATTTGCGGTTTTTGT TTATCCCACTCAAAGAAGACATGGTTTCCATGCTGTCATGGTTTCTACAT TGTAGCAAAAAAAAGAGTGCAATTTAGCGAATAAAGTATTTCATCACCCT TTTTTTTATAAGAACATCCAAAATTTTTGAAGCCTTAGGATTTTTTTGAG CTTAAAGCCTAAAAATGTTCTTAACATGTTCTTAACATTTTGGCCATCGA AACCTTATGTTCTCATTTAGTTTGTTCTTATAAAAAACGTGTATTCTTTA TTTCAGGTTATTCTGCATATTTGGGTTACATTCTGTTGGAGCATCAACAT GCAAATCCAGTCATTCAATGTTTCACCAGACTTCTCATGGAAAGTGTTCG CAAAGAAATCAACAATGAACAAAGTAGTGACCCCCAAAATTGTAAGTTAA CAACTGTCACGTTGTTCATCTCCTACCATTTTGCTTGTACACGTTTTTTT TTTAAGAAACACACTTTTAAGAAACATGAGGCTCAGAATGCCTAAAAACT AAGAAACATCTAAGAAACATGCTGAGGCTGAGAATTAGAAAATAACATTT TTTAATTCGGTTTTTTTAAGAACCTTCCAATCAAAAGAATCATGAGGTTG ATTATGCCAAAAAATTTAGAAACATGTTAGAAACATTTAAGGCTCAAAAG GCCGATTTCTTAAGAAACATTGAGGCTGCGTGGTGAAACTAGTTTCTTAA AAAAGAAAAACGTTTACAGCATTCTCAAAAAATAGAAACTACTTTTTCCC CTTTCAGCGCCACATGATTTGATTTGACAATAATGCCTCTCTCTTTCTCT CTCTTTCCTTTTTCAGAAATTAAATTTTCACGATTCAATCAAAAAAAATT GGCTCAAAAAATACAATAATAGCTTTTTTGCTTGGTAAAACTTACAGCTG GACATAATAGCCTCTCGGCTCTGCATCATTCGTTGTCCTACGAGGAAATT AAAACAGCAAACTGGTTCTGCCTGGCCTAATTCCTAGTCAACATGAAGAT TTGCTTCACCCTGACAGATTGTTTGTAGCTTTCTAGGCAGATCCCGTCTA AATGTAAAAGATACTGATAATTGCTAATTACTGCTGACGGGGAGATTGTT TGTTTTTACAGATGAGAACTTTATCCGGAAACCCAGGGCAGTTCTTTCTA TTAATCACAGACGGAAACCCGAGGTTGTCTGTGCTAATCGGCTCAGGAAG TTAAACTCACGAACACAAGTTAGCCACCGAGGAATTCCAATAATTTGATT AATCCGATTAACATTTCTTCAGGAAAAGGATATAATATATGTCGTACGTT GGTTAGATTCGCATCCCGTCGGCTTAACCAACTCCTACACACAAATGCTA ATGAAAGTTGTTATCAAGGAAAATCAAATACTATCCTAAATTCAGTCAAA TAAAGGAAAAATATCTCTGGTTAAATCTAATTTACTAAACAATTTTGTCA CTTGCCCATAACTATTATGAAACATTTCTTCAGCCTTAAGAGTTCATCAG ACAGTTTTCCAATATCGAGGATGTGAAATCCCCAGATATTCCTCAAATTC AAATCAGAGGATTTGAGCAATTCCTTTCATTTTAGTAAAAATTGGATTTA TGGCGCTTTGAAAATTGACTTATTAGACTTAAAGCTTAAAGCTTAAAACT TAAAGCCTTTAGGAATCAATTCTTATGGAAAGTGTTCGCAAAGAAATCAC TTTTGGTTTTATTGAAAATAATTGTTCACTTTAGCCTAGTTAGCTAGAAA TAATGGCTCGAAACCACTTTTTTAAACCACTCATATATTTATAACCATCT TCTAAGCATATAACCTCATCATGAAATTGAATAATTTTCTTATTGCTTTA TTTCAAATTGCGTTAGCATTAGCATCTTCAAATCGAATGTTTTCTTCTAC TATGGCAAAGTTTTTAAATCGTCGTTTTTTTTTCATTTTCCAGACTTCGG GACAACAAAGAGAGGGTTAATGCCAGCTGGATTTCTGGACACAACCGATA TGTCGGACATTAAACGCGAAATCCGAAGAAAGAAACGGATTCTTATCCGA TGGCATCTTTACATAACTTTATCATTAAACCCGACCCTTTTAAAGTTCCG ATTCCGTAATGCAGTCAAAAGGCGGAAATTCAATTTAGATTTTTTCAATC GTTTGAATCCGTCTCTGTACTGGCCTGAAGAGGAGGCTAAAAAGGAAGAC GAAAAAGAGGCCGGGGACCAGTCTGTTGTTGTTGTAGAGGATGAGAACCA AATGTCTGGAAATTTTTATGTCGGCGATCAGAAAGTAGATGTCCGTTACC GTAGAACTGGAACCGTCTTGGAAGTCATTTATTCTTTGAAAGACGCCCAA CAACAAAAGAAACGTTCCTTCCATCACGCAGTTCCTGAAGATTTGGATCA CACTTCTGAAAAAGTGCTACAATATTATGGAGATAATACAAACGATGTTG ATTATTCGGGAGATAATACAGAAGAGAATGGTAATAATATTGAGTTGGTT AATTATCGACGGTTGAGTAGTAGGCTTCATCGTGAGGAGATAAAAGAAAG TAAAGTTGATGATTTGGGAGATAATGGAAGTGAAAATGATGGAGATAATA TCGTGGTTAGTGAAACGAAAATATTGATTGATGATGATGTAATTGAGACA TTCGATGTTGGAGATAAAAAGCAAGAACAAATTATAAACAATGAAAATTC TATAAAAACGGAAGAGTGGAAAAACCCTTCACAGAAAATAGAGGACGCTA AAAATGTTAAACATGGTATCACAAATGAAACTTTCAGCGCTAAGGAATAA GACTTCTTAGCTAAAGGTAATAATAATATGATTATGGATCAGTAAGAGTT AACTTACACGATTTTGATTTATATTCAACCACTTTCAATAATCTGCTAGG CGAACTTAACCGACATTTGGTGGAGGTGAATGAGAAATAGTTATATTAAG TATATTTTCAGTTTAAGTTTGATTTATGCCGCCCATTTCCTCTCACACCA AACCCGAAAGACGATTTTAAC
Gene-mRNA-Prot
The following transcript feature(s) are a part of this gene:
Feature NameUnique NameSpeciesType
TCONS_00008331TCONS_00008331Clytia hemisphaericatranscript
TCONS_00008330TCONS_00008330Clytia hemisphaericatranscript
The following polypeptide feature(s) derives from this gene:
Feature NameUnique NameSpeciesType
TCONS_00008330-proteinTCONS_00008330-proteinClytia hemisphaericapolypeptide
Position
The following features are aligned
Aligned FeatureFeature TypeAlignment Location
sc0000084supercontigsc0000084:464392..488962 -
Expression

Hover the mouse over a column in the graph to view expression values in transcripts per million (tpm).
Sort Descending | Sort Ascending | Only Non-Zero Values | Tile/Chart | Reset | Show/Hide Values

Values :
    GrOo_1	 GrOo_2	 FGOo_1	 FGOo_2	 EG_1	 EG_2	 P1_1	 P1_2	 P2_1	 P2_2	 P3_1	 P3_2	 PoPr_1	 PoPr_2	 St_1	 St_2	 GO_1	 GO_2	 PH_1	 PH_2	 BMF_1	 BMF_2	 MMF_1	 MMF_2	 M_1	 M_2	 GEC_1	 GEC_2	 GEN_1	 GEN_2
0.59 0.52 0.25 0.13 4 2.73 3.92 4.13 1.79 1.93 2.55 1.54 9.5 9.43 3.95 6.81 3.51 5.58 11.66 11.77 6.32 7.19 3.24 5.31 8.81 9.89 1.82 1.18 23.57 19.16