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Sequence
The following sequences are available for this feature:
transcript from alignment at Sc0000052:578493..584502+ Legend: exon Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below. >BlTCONS00063884 ID=BlTCONS00063884|Name=BlTCONS00063884|organism=Branchiostoma lanceolatum|type=transcript|length=6010bp|location=Sequence derived from alignment at Sc0000052:578493..584502+ (Branchiostoma lanceolatum)
GGAGAAGATGGCAGCCGACATGGGGGTGCCTTTCCTGGGCAAACTGCCGT
TGGACCCCAGAATAGGTCAGGGTTAGGGTTAGCTAGCACACAGACTGTCA
CACAAACAATCATAGTCACACACACTGTCACACAAACAATCAGTCACACA
CACTGTCACACAAACAATCACTCACAAAAACACTGTTGCACGAACACACA
CAGTCACACAAACACACACAGTCACACAAATACACAGTCTCACATACACA
CACACACTGTCACACAAACACACACTGTCACACAAACAATCACTCACAAA
AACACTGTTGCACGAACACACACAGTCACACAAACACACACAGTCACACA
AATACACAGTCTCACATACACACACACACTGTCACACAAACACACACTGT
CACACAAACAGACACTGTCACACACACAGTCACACAAACACACACTGTCA
CACAAACAAACACACACCCATTTGATTTTAAACTTGTTATTTGAAAAAAG
AATCCCAAAAGCTATGTATCATTTTCAGACCCATTTGTTGTTTATTTGAT
GTTTGTTTGTTTGTAGGTGTAGGAAAGTGTCGACTGTTTGTTTATTTGAT
GTTTGTTTGTGTAGGAAAGTGTTGTGATGAGGGAAAGTCGTTTCTGTCGG
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AAGTCTTATGGAAGTCGTACGTTTGTATCATCACAGATCATAACGAAAAG
GGGGGATACAAGACGACTCATTATCTCCATGAAAAATGGAGATATAGTTT
TGGGTGTGTCTGTCTGTTTGGTTGTGTTTCCGCACCACTCCAGTCAGCAT
AACTCAAGAGCCTCTTGATGGATTACGATGATATTTGGTATATGGGCGGG
TGTTGGGAAGCCAAAATTCAAGGTCGATTTTGGGCCCCCTGGTATGTGAC
CTTGATACTGCAGCAGAGCTTCCGTTATTGTATCTTTTGACCTGGACATG
CTATGGTCTTGATTTTTGGGTGACAAATAGCTTGTGATGTAATTAAAAAG
TGGTGTAGGTTTGGGCTCTCTAGCAGCTTGCCCTGGAACTGCAGTGGCAT
TGTTGTGAAAATCTTCTAAGGGGTATAACTGAAGGAAGTAACGACGGATT
TCTATGATATTTCGTATGCAGGTAACTTAGACAGAGATGTACACAAAGTT
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TATACGGCAAGTGGAGCATCAACAGATACCAATTATGCAAATATATTCCT
AATTTGCATAATTATTGCAAAAGTGCCATTATTTATTAAAGAGGAAAATG
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TATTTCGTATGCAGGTAACTTAGACAGAGATGTACACAAAGTTCAAATTA
TGCTAATTGGGATTTAATTTGCATAACTAATGAGGAAAATCTATATTTGC
AGTGTTTTCCATCATAAGACTCAAAAACATGTAACAGATGTGGTATACGG
CAAGTGGAGCATCAACAGATACCAATTATGCAAATATATTCCTAATTTGC
ATAATTATTGCAAAAGTGCCATTATTTATTAAAGAGGAAAATGATAGGAC
TGTCAATATTGCAACATGTGTAAGTTTGATAAAGTGGTTCATGACCAAGT
ATATATTATGTAAATGTGTAAGTCATTTACATAAACAGAATAGTTCATGG
AAAAAGGCAGATTATGCTTTTGACGAGACAAAAGAATATATCAGCAAAGG
CTAAAAACATTTCATGGAGATATGGGGTCGTGGAACTCTTGTTGGGACTG
CAGTCTTCCAACTGCTGCGCCACCTAGCTGTTTGCAGTGGAAGTACATGT
AGCACTGCTCAGTATCGCTATGAGGAAGGTAACAAAAGTAGCACCAGTCA
GTATTGTAAGTAAGGCAACAGAAGGACTACTGAAATATCTGTAGGTTAAT
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TATTCTATAGAACACACATCGATCGTAACAGTCGGATTCTGACGGATTCT
GTTGGATTCTGACGGATTCTAACGTCACGGTCTTTGGACTCGTTGAGTAT
TATGGGCACCAGGCAACCAATTTGAAATGTTGTAAAAACGCTAATCTATG
ATGGACTAGTGTAAAACAAGTCATAACTGGTCTTAGTGGTATATTTAACA
TAATGCAGTATGCTTTACGAAATTAGGTTTAGTCTGCCTTTAAGCATCGA
AGGGCACACTATTTACCGCTGCCAGATAAGTAATGTTAATTTTTTCCCAA
ACGTTTCTTGTGTAACACAAGTCAACTAGGAGTAGCCAAAGTCATTAAAG
GAATATCATTTTGCCTTAATAAGTTGTAGCATATGTTAGCTGCCTTGACT
AATTGGAATTGTGAGGTTGTGTGCTGCTGTTGCATTTTCATTGATTGATT
TTGTTGTCTAAAGGTGCCATTTTCCTGTTCCTTGATCTGCAGGAGTGGAG
GAGTTCTGTTCCTCACACAGCAACAAGGAGAATGTCCTGAACCCAGTGGA
GTAGCAGAAACCAGTCAACAACAGAGATGTAAAACTGGAGCTCTATCCAC
TACAGGAAACCAGTCAACAACAGAGATGTAAAACTGGAGCTTTATCCACT
ACAGGAAACCAGTCAACAACAGAGATGTAAAATAGGTCCTGGGGCCCTAT
CCACTACCGGGTTTCACCTTCCTAAGTTAGATTTTATTCTGCCCTGCCAG
TAGACTGATACTCACCTCCTGGTGTGATGAGAGAAAAATTTAACCAACCA
TGTAGATACAGTATCCATTAGAGCTAGGGCTGTAATACTGGCTGCATGTG
CAGTTTTGCGCACCCAAAATCAGAGCTGTGCCCCTCATTTTTGACTGTGG
GTGCATCAGTGCATCTAGATATTTGGTTTGTGAAATATCTAGATGCACTG
ATATTTCACAAACCAAATATCAGTGCATCTAGATATTTGTGTGGGGCTAT
TTACATGTAAGTAAAGGTACTATTATACAGCAGTTCACTGCATATTCTTG
ACACTTAAATGTTTAAAAAAATTAATGCTAAAACATTTCTTAATTATTAA
TACTTATTAAATTAGCCCTAGAGGAGCAGCAAGGTTTATAATTAAGTTTT
GTTGGCAAGTTCTACTTATATTCACCAAAAAAGCAATTACTCAAACAACT
GGATATGATTTTGGAAACGGTCAGACGTTTCAACTAGCATCCACTACTTT
TCGTCAGTGACTGTGAGCAAGATCAGTTGAACAGCAGGTTTATAACCACG
AACTATGAATTGATATGCAAATAAGGAGAAGACAAATTTTTAGATAGTCC
AATAGAAAGAAAATTAGACAACTCAAGACAAGGTTGAACTGCTGTTCAAC
TGATCTTGCTCACAGTCACTGACGAAAAGTAGTGGATTCTACTTGAAACG
TCTGACCGTTTCCAAAATCATATCCAGTTGTTTGAGTAATTGCTTTTTTG
GTGTATCTTATTACCTGGATGTCTAATCTTCATCGACGGTCTACTTATAT
TGTGCACCCCAAATCTCTGTGCGCCTACATGTAAATGTTAAGGTAGCCTG
ACAGGTGTTTACACAGTCTCTCTCTGGTGGAGGTTTTTGACCCCCTTTGA
CCGGCCGCGAGGAGTGCAATTTAGTCAGGCTAAATTTAAAGGCACCTACA
TTGTCCTGATTAAACAACTCTGCTACAGTTGTCTGAAGTTTGTTGTGTTT
ATTTTCCTGCCCAAAACCCAGGGAACAGTGTAGTCTCTACCAGACTAACC
GCACCGGCTATAGGCTATAGGGAGAACATTTGCCGGGGGACTTTGGCCAT
GGAGGGTAACATTCGCAGGTTGCAATATTGGACCCTATCTCCATACAGTT
GACTCTATTTGTTGACTCTATTTGGCCAATTTGTACTATTTTCCCAGCGA
CCGGCAGAGGCTGGTAGAGTCTAGAACAGGCGGGTTTTGCTACAGAATCG
TTTGGTTTGTGAAAACATATTAGGAGCAAGTTTATTTGTCTGGCTTGCTT
TATTGAATTGAGGGACGTTTTTTCGATATGTCATGGCTGTTGACTGTTTG
AAATCCTCCCTGCACCAGACGGTGCATAGGGTGGTGCCCACCTCCTTTTC
GATAGCCCTTAGGCCACACAACTTTGTGCAATCACTACAGCAGGGGGCTA
GTCCACTGGTAGTGGAGTGTGTTTAACTTCCATACCCTTTCCCAAATGCT
GAGTGCTAGGCAGAGAAACCAGTATGTACCATCTTTAAAGCCTTTGGTAT
GACTTGGTCGGCGATCAAACTCAAGACCTACATTTTGTATCGCATGCATC
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TGACAGGATTTGCAGGTTTAAGATTGAATCATTATAAAACCTTTTGATGA
AATGATGTGATGGCTAACGCGGAATCGTGTACTTCTGCCAATGGTGAGAT
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CAGACTTGTACATGTACTGTAGTACCGGTGGTAGGGGTGTGTGCGGGGAC
TTGTACATGTAGTAGTACCGGTGGTAGGAGTGTGTGCGGGGACTTGTACA
TGTAGTAGTACCGGTGGTAGGGGTGTGTGCGGGGACTTGTACATGTAGTA
GTACCGGTGGTAGGGGTGTGTGCGGGGACTTGTACATGTAGTAGTACCGG
TGGTAGGGGTGTGTGCGGGGACTTGTACATGTAGTAGTACCGGTGGTAGG
GGTGTGTGCGGGGACTTGTACATGTAGTAGTACCGGTGGTAGGGGTGTGT
GCGGGGACTTGTACATGTAGTAGTACCGGTGGTAGGGGTGTGTGCGGGGA
CTTGTACATGTAGTAGTACCGGTGGTAGGGGTGTGTGCGGGGACTTGTAC
ATGTAGTAGTACCGGTGGTAGGGGTGTGTGCGGGGACTTGTACATGTAGT
AGTACCGGTGGTAGGGGTGTGTGCGGGGACTTGTACATGTAGTAGTACCG
GTGGTAGGGGTGTGTGCGGGGACTTGTACATGTAGTAGTACCGGTGGTAG
GGGTGTGTGCGGGGACTTGTACATGTAGTAGTACCGGTGGTAGGGGTGTG
TGCGGGGACTTGTACATGTAGTAGTACCGGTGGTAGGGGTGTGTGCGGGG
ACTTGTACATGTAGTAGTACCGGTGGTAGGGGTGTGTGCGGGGACTTGTA
CATGTAGTAGTACCGGTGGTAGGGGTGTGTGCGGGGACTTGTACATGTAG
TAGTACCGGTGGTAGGGGTGTGTGCGGGGACTTGTACATGTAGTAGTACC
GGTGGTAGGGGTGTGTGCGGGGACTTGTACATGTAGTAGTACCGGTGGTA
GGGGTGTGTGCGGGGACTTGTACATGTAGTAGTACCGGTGGTAGGGGTGT
GTGCGGGGACTTGTACATGTAGTAGTACCGGTGGTAGGGGTGTGTGCGGG
GACTTGTACA
Gene-mRNA-Prot
The following exon feature(s) are a part of this transcript:
| Feature Name | Unique Name | Species | Type |
|---|
| BlTCONS00063884-exon-Sc0000052-1564993656:578493..578557 | BlTCONS00063884-exon-Sc0000052-1564993656:578493..578557 | Branchiostoma lanceolatum | exon |
| BlTCONS00063884-exon-Sc0000052-1564993656:579104..579190 | BlTCONS00063884-exon-Sc0000052-1564993656:579104..579190 | Branchiostoma lanceolatum | exon |
| BlTCONS00063884-exon-Sc0000052-1564993656:581335..584502 | BlTCONS00063884-exon-Sc0000052-1564993656:581335..584502 | Branchiostoma lanceolatum | exon |
Position
The following features are aligned
| Aligned Feature | Feature Type | Alignment Location |
|---|
| Sc0000052 | genome | Sc0000052:578493..584502 + |
Properties
| Property Name | Value |
|---|
| GeneID | BlCUFF031269 |
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