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Sequence
The following sequences are available for this feature:
transcript from alignment at Sc0000002:6626034..6635828- Legend: exon Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below. >BlTCONS00008354 ID=BlTCONS00008354|Name=BlTCONS00008354|organism=Branchiostoma lanceolatum|type=transcript|length=9795bp|location=Sequence derived from alignment at Sc0000002:6626034..6635828- (Branchiostoma lanceolatum)
GCTGCGTTATGTTGCGTCCCCCCCACAGGCTGACCTCCGGTTTTGTCGCG
TTCGTAGTAGTGATTGAAGATGGAGGAACCGTACCCAAACCCAGCTAGGT
CCACTACGTCACAGTAGTGAAGGGCGAAGGTGGTGGCTATCAGACCCATG
GTGGGCCACCTACCCTGTGAAAGGAAAGAGGATTAGACTTTACGGTGGGA
CAATTGTATATGCGAGGCCCCCATTCCACTAGACGGCGATCGCGCTGCGC
TCTCACTGGGACCTAAATCGGATTTGTCTAGTCCTTGATTTCATGATTGG
AATATCATACAAAATGGATGGTCTTAATGGAATGGGGGTATAACAGGTAC
ATTTGCATCTAACTTGCCATTTTATACGCATCCGGGCTGTTCCAAGGCTG
TCAAGACCATGATGTGTGCAGCAATCAAGATTGGCTTTGTGTGACCCTTG
ATTTTATAATTGAAATATGATGCAAGATGCATGACTTAAAAGATAACAAA
ACGCACACAACATGAAAAAAAGCATTCTTTATGTATGAAACTCATTGAGC
GATCTGTTAAATCTTTGGTTGCTCAGTGGGCACTCAGTGGTTGCAGCCTC
TAGTGGAAACAGGGCTGTCTCCAGCTTTGGATTTTTTTTTCCAATCCCAG
CCCATATTGTTGATTTTTAGGCTTAGGAAATTCATTTTCATCAGTTTCAT
GGCATGAAGTTCAGATGTTTTGGACAGATATGGTGAAATATTTTTTTCGT
CCCTGGTACAAGAAAATTTCCGTCCTGGGATGGAGGGACGGGTCCTGGAG
ACTGTGGAAAGGTGGTGTAACTGAAGAAAATGCCTACCTGTAGTCTGACA
TGCTCCCGTCCTGCCACACGTAGAACCTGGGGGTTGAGAATCAGGAACTT
TGCAGGAGGGATGTCCAGCTTCTGTGCAACCCACTTCCAAAAGTGACCGG
TAGGTTTAACCTAGATGATAGTAGTTTCCCCAAAGGAATATTGTTAGATG
CTATGCATTTTATTGCAATCCTTATAAATGTAATGATACAGTTAGTAAAT
AACAGTTTAAAAATCAATAACATACTTAAGTTTTTCATTCATACCTTAAC
TTCTGGCATTGTTTTTTGTTTCAATCTTAGGAAGAACTTTCGAAAATCTT
GAGATTTTTGTCAAAGCCTCTTGAGATCTTTTCAAACCATCTTGAGATCC
ACTCAAAGCCCATTGAGATCTTTTTTCAAACTTCAAGTTGACTCTGAGAT
TTATTCCAAGCAATTTAAGAGCGGTTGACTGTCCATCATGTCTGATTAAT
GAATAAGCTTTCTCTACCAACTCTGAACTGTACTCTCTGCCAAGTCTGAC
CTTTGCAGTCATCTTCCTACACATTTCATGCCAATCTATTGCCATAATGA
GTGTTTTTAGATAATACTAGTAACTGAAGACACGGCTGAGACATGTCTCT
GAACACAGAGTCAAAACTCTGTTCAAAGAGTCAAAAAACCTCCATGAAAT
ACTTACTAATAGACTTTTTGTAAATTTCTTGTTTTATTCATCATTATAAT
GATGATTGTAAATTGCTGCATTGTCCTGCCCATGCAACTGTGGACTTGGG
CCAAGCCAATCTCTCCATCCTGGGGGCTGCAGCTTTGGATCTGGGTCAAG
CCGATTTTCCCACCTTAATTGCCAGTCTCCAGTTGCACCATTTTCCCCCT
CACATTCTGTCACTCTACAATATTCAATTTACTGCAGACACACACCAAGA
CAAACAAACATACTGACCAAAAAAACATTTACCTCTATTTTCACTAACAG
AATAAATATTATTTGTCTACAGGATCTCAGTTATTTAATGATACCTTAGT
GAGGATAGCTTGCAGCCAATTCAAGTCGTTGCCCTTGTACATGACGACAA
CGTAGTAGGCACCGGGGTCAAGGTCAGCTTGGTTCAAGGTTGAACTCTCC
GGGTAAAAAATGCGAAAGTCAGTCCGAGACCCCACGTCACTTTCATAACC
TTTGACTGGAGCATCATTCATCCTGCCCAGGAAAATGCAAAATGGTTAGA
CTTAGACATTTCAATCTGGTATGGAATAGGTAGGCAATCATCAGCCTCGT
AAGACTATGAATAGTACAAATTAATGGGAATAACGCATGCTAAATATAGG
TGGGACAGGTGAAAATTTCAACTCAATATTTTTCCTTCAAATTTTGTAGG
TGGATAGAGCTTCAATGTCACAAGGATCATAAAACATTCAAATGTTTGAT
CTAGAACCTTTCCTTCCAGAATTATGAATTTTTGAAATATCATTTTTCTA
CTATTTTTGAAACATCTTAAGTAGCTTGTGGTATGCTTAAAACCTTTTTT
GTGGTTCATTAAGTACACAACATTCCATTTACCATCCATACTTCCCAGAA
TTGTAAACATGTGAGTCCCCACCTGCCATGGAAGTTTCATATTGATTGCG
CCTTTGACATATCATATGTGTTATATGATACTACTGAGTAAAACAATACT
ACCTGAGCTGAATTTTGTGTACACTGTAAAGAGAAGAATTTAAGCGAAAA
CATACCTTATTACTACATCATAAGCATCTATCACCCGCCCGAGTCCCTTC
TCCAGGAGTGCCCCAGAACTGCCCAGAACCAGACATCGTCTGCACCCACT
GTCACTGGGAAATGTTGTAAAAGAACGTTAATGGCTAAGTTGATAATCTA
ACACTAACATAATTCCACCAGGGTACATAAGTCTAGCCACCCTGAAAAGA
TACTTCCAAACAGATCTCCCCAGTATAATGCACTGACTCAATGTTGAAGA
TTACATTAAGGTTAGAATTCGTAATGCTGAATATAATGTTAAATAGCAGA
ACTTAAGTTGGCTTCTATTTGTCAGTTGTGAAACACAAACATTTGCAGTG
TCTGTAAAGTTAGATAGGAGTTGGCTATAAATATCAATCATTAATCATTA
AAGAAGAAGGAATGCAATATTTACCTTTTTATAATTGGTTGCCCATTGTT
TGGGAGAAGGTTTAGCAGTGTGTCTAATCTTAACACTGTCAAAATAAACA
ATACAGATGACTGTCATAAAAATTAATATCAAATGATACATGTATATTTT
AGCAGTATGTCTCATTTGAAAATCTTTCTGAAAGCAATTAAAAGTAGTTG
GGCAGATAGTGTATCTGTCAGCATAAATTTTACGAGGGATGTAATGAAAA
TTGAGATCTAGAAGTACCGGTATACTGTATTGAAGAATGATATCATATAA
TATCATATCATATCACCTTTATGTAACCTGTGCAAGTGACCACCTCTACG
CAAAGACAACCTGGCCAATGTGACTACTTTTTGGTACAGGTCCCTTAGAG
TTTCCCATTGACACATAATAGCATTAAATCCTTGCTAAAGTGACCACTTA
TCAATTGGTCCACAGAGTCCTTCTTCCGTAACTAATTGGTTACTAAGCTT
GACTACAATGATATAGGCTGAAGCAGTGCTTACAGTCTTCGCTAGAGAAA
TCAAATGGCAGTTCATCACTGGAGTTCCCCAGCACTCCCCATTCTCTGTA
GGCCTTAGTGATGAACATGTGCATGTCACGGTCAAAGCTGTGAGGACAAA
TAAAGTCAGTCGAGAGTGAACACTGGATGTTCAAATAACCTGGATAGAAG
TGTGGAGACATGTTATTACTTTCGCCAAGAAGGCTATGTTTTTGGCAGCA
TTGCGTGTATTGATGTGTGTAGGTAAGTAAGGAAGTATGTCAAGGTCATC
ATCGACTACAATGGCCGAACATCTTCATCATCGTGAATTTGTGTGGATGA
ACAGCATACTTCAAGAAGGTCTGGATAGATTGTTTTTATATTTGGTATGT
GGGTATTGTCTTGGAAATAACATTAGTTTTTGGGGCCCCCCCTAGCTGCT
TGTTACGGTACTGCAGTGGACATGGTTGTGAGTTTTGAGTTGTAAGTTAG
CTCTTGTTGATAATGAGACAGACACATTAGGTGAGTCAGCTCCATTTGAA
TCAGCAGCTAATGTATAAAACAGACAAGTTAAAATGTGCATGTTGTATAG
TTTGTGACCTGTTTTATCTAAAAGGTTGAATACATCTTGATTTTGTCACA
GGTTATATGTACATTGCTTCCTTGTTACAGGTCATTCAGGTTTTGCCTAA
ATCTACTGATTAACATTTCCAAAGGTGGTAACGTTAAATTCAGTACTGTT
GGATCTTAGTAACTTTATAACAAATGTGCATAATTGTAACAGCTGCAGCA
CAATAGGATAGATCCAGTCATATCCATAGCATAATTATAATGATATGGAA
GAATTGAACATCATATATTACATAGACATACCTTGGCATAAATTCTCTGA
ACTTCTTCTGTACAAAGCCTTTGATACAGGATCCTGGGGAGTGTGCTCCA
GTCCTGGATTGTGGTAACAAAAGAAATCAACAAAGCCTGTCATAAAAGCA
ATATCAATAATTATGCATTATCATTTTGGTAGATGTATGAAAGTATTACA
TGATGTTATAATCATTAATCATACATGATTTTTGAGAGAAAATCAGATCT
ACCATCTATTAACATAAATCCGCCATGACCGCCAGGGTATAATTCAGCCA
CCTTGAAAAGATACGTCCAAACAGATCTCCAACCCAACGTCCTCCAGTAT
AATGCACACCTGTAAATCTAAACTGTGCATTATACCCGGGTGGTACTACA
CTAGAAATCTCTCAAACTCACAGTTTTCAAAGTGGAAGATTTATGTAACC
CGGTGGATTAATGTTAATGGCGGTTACCTTGACATATATTTCCCACCTGT
TGCTATCTGCAGCTGATTTTGTAGGGCCCTTTGCCTCCTTCTCAACTGTC
AATAGTACAGACTCTGAAAAAATCACACACAGTTGTCAATTTCTAACCTT
AAGAAAAAACTTGGCAAAGGAGTTACTTGTGCCTTTAACTAACAAAACCC
CATAAAAGCTTCAACCCTGAAACAGTGTCAGGAAAATGTGTAAATAATTC
AATGAGTCGATTCCCCATTACCGAGAGGGTGTTTGTTGCCTTTTGTTCAG
ACATTTGCAAAACCTTTGTAACAATCTAAGGGAGATAAGTGACTGTTTAG
AACAATTTCCAACATTCATTTGATGTTTTAAATAGTTTCTGCTGTGTTCC
AACATGTTAGACAAATTTCTAACATTACACATGTTATTTGTATCATTTTC
GAAACTGTTGGAAAATAGGTTGATCATTTGTTCCTATATGTTCCAACATT
ATAACAACATGGTATAACTGGGTCAGTGGGATGGGAACAGGGCAATTCAC
ACATCCCTTCAAAGTATAGGGGATTAGGCCTGGGTGCCATGCATAGACAC
CTAAATACAAAGGTCCAGACGTGAAATCTAAAAATATACAGAGGCAGACA
ATAGAGTGCGATTAGCACCTACTTTTATGGGGGCAATAACCCAAATCTAC
CATTTGAAAAATGATGCAAATTGTTCCAACATGTTCAAACAGTGAAACAA
TCTCATAAATGTTTGAAAATTGTTCTAAATAAAGAGATATTTGTGCAATT
ACTTTCCAAATAGTTCCAACATATATTTCTAAGTTCAAACATGTTAAAAC
TTTCATTCTTGATTGTTTGAACAATTTAGAACATTTTGACTGGAATAGTC
TTTTACCTAAAATTGTTTGAACTCACTAGCACTATTATCTGAAAACCCTC
TCGGTGACATGGAATTGACTCTATCAGCCGAGGGTACATAATTCCACCAC
CCTGAAAAGATACATCCAAACAGATCCCCAACCCAACCTCTCCCAGTACA
ATAATGCACTCCTGTATATCTACATGTAAACTGTATACACCCGGGGGTGC
TGCACTGGAGAGCTCTCCAATCCACCGTTTTTAAGGTCTATGTAACCCGG
CGGATCAATGTTTATGGAAGTTACCTGTGTTATTTAGAAGGGGAGTATCC
ACAGCCTTGACAGTACTTTCAACCATAGATTGCACTGGGCGGCCGGTGTC
TTTCAACTTTATTCTATCTCTTCTGTGGCGACGAAATGTTGAGTCACAGA
AAAGCCAAAAAATCCCAAGTCCGACAACAAGAAGCAACAGTTTCAGACAT
TTGACCTTTACCCCATGCATGGCCATGTCCCTTCAGTTGAGAAGTGTTAA
AGTAAAGAAGTCATGTTGGTCCGATTTTCTGATGGGATGACAAGGGAGAA
TGTTACTTGTCAATTATGTGGTACAAACAAATGATAATCAATCTTGTCCT
TCAATTAAATGAAAATAAAAAAGGGAAGAAAATCATTACATGATAAAAGT
CAATAACATATTGGTTTGAATATTATTACTGAATAAACATTTTTGACTAA
AATGTATCTGTGACACAACAATATCTGAAATAAAGACAGATTTATCAATC
AATCAATCAATCAATCAATTATATAGCTGATTGACCATTTAACCTGTCAA
CTGATTGAAGTTGACGTTATTCAGTTATCTTATACATGTAATATATAACC
GAATCTAACCACCACATTCACTCCACCATCATGGCACAACTGAAAACATA
ACCTTCTTGGCGAAGGTAATAACTTATAATGAAACTCACTTATCTTGCCA
TCGTGAGCGTTTAACTTTAACTTTGACAGAATAGAAACCCTTGTACCTTG
TCTTTTTACCCCCAATAAGTCACTTTGTCTTATTTGATTACAGTCTAGGC
CCAGATACATTATAAGATATGGGGTCAAATTCAAAAGAAAAGGGGGTGGG
GGGTATAATGTTACTACTGTGCTTAAATCTTTTGAAAACAACAATTTAGC
ACAACAGACATCTTGCAGTTACAGACATATGTTAGGCCATTATGAATTAC
GCAACGTTATCGCGTTCAAAGTATGCAAAACAAGAGTTCTACGACCTCAT
ACCTTCGCCAAATGATCTTTAATAACCTTTATGACTGACGTATAGGCAGT
GTTTCTCATCAATTATGAATCATACCAGTTGGTCGTTTTCACCCAAATAA
CATAAGTTGTCCAAAGTAGGACTATGAGCTAAACAAAGAAGGCTATGCTA
ACATTTATCATCAATTATGCAAATAAGCTCCTTATTAGCATAATTTGATT
CAATGGTGTTCACATTCACACTACTTCCAAATGCCACAAGTATGAAATTG
CCGTCATTAACTAGTATGGAATTATAGTAGTTTGACATTAATGATACAAA
TAAGTCTACATTTGCATATTTTCTATCTATCAACATTCCTTTCTTCCTCA
GTTACAAATTCGCATATTTGAATAGTCATATCATGGAACACAGCGGGTTT
TTGAATTGCCTCTTTAATTATGCAAATTAGAATCTGATTTGCATCATTAT
CATCCAATCAAACAAAGCACCACGTAAGTTATAGAGTTATAGTATTTCTC
ATTAATTATGCAAATTAGGTCTTCATTTGCATAGTTGATATTTATTACTA
TTTCTCTCTTCCTCGGTCATGTCACATGTTTCAGAGTCCTATCATGGAAT
TTGGAGGATGTATCAATTTTCATCATTAGTTATGCAAATTAGATACTGAT
TTGCATAATAAGTATTAAATCATGTAAATCATCACTCAAGCTATCCACTT
AGCAAAAAGCATGACCATCCATCAAGCCCTTCTTGAGTTATTCCCTTTCA
CAGTCTGAAGCAAAACCTGCTCCTGCAGTCCCAGAAAATGCCGCTAGGGT
GTCCAAACCGATACCTTTTACTCTCTTTCCAAAGAGCTATCTACCACTCA
AAAGTCGGTTCCATAGCATATCCAAAACATGAGATATCAAAACAGGAATT
TCCGCTGCAGTACTATAACAAGCCGCTAGGGGGCCCAAAATCTAATCATT
TTCAGGTCTCACCAAGACCTACCAACATACCAAATATCAAGACAACCCAT
CCAGGCATTCTTGAGTTATGCTGGTCTTCTTATACATACAAACGCTACCC
TATGCATAACCTTCTCGGCGAAGGTAACTACTTGCACAGTGCCTTGAGGA
ACAGTGCAATTTCACAAGATCAAGATCTAAAAGTCAGTGAGAAGCCAATT
TGTGCCAGCCAACACGTTTTAGGTGACACGGTAAAACCCCCTGGCCCAAT
GGGAATATCTCCTTACTACACCAGTAACACTTCCCCTACACGAGTAACAC
ATTCCAGCTGGTACCCTGAGCTAGTAGTATATACAGACTCATACAATGTA
ACACATTTTTACACTTTTCTCGTTAATTATGCAAAGTACTTCGCCCAAAA
TCTAATCATCTTGAGATTTCCCACATACACATCAACACACTAAATATGAC
AACAATCCATCCAGGCGTTCTTGACTTATTCTGTTCACTAACAGACACAC
AGACAAGCAGCAAAACATAGACTTCTCGGCGAAGTCAATAACACCGAAGC
AAGGTCTTATGTTTACCTCCAAGTTGACTTCCTTGCAGAAAGCGTCCTGG
GTTACCGTCAGCCATTGTATTTGATTTCTACCGTCATAGTACCATGATAT
TTCTGTAACGTCTGGTGTGTCGCTGACGTCTATGTAAGCTCTAATACCGC
TATCGATCGTCTACAAGCGTGAAACGAACACCTGTTCCTGTTGATCGGAC
CCAGAATGGCGGCGAGTGTAACGTTACCCCTACCGGTGTGTACACTTAAT
TGACTATGGGCGTGGGAGCTTCCTGTCACTCACCTGGAGTCACTGAACTT
TAACCCCTTTGTGTGTATAGGACGAAGGCAATTGTTTGTCCAAGAGGCCG
CCGCTAGACCTCGTTTTCACCTGATTCGTAAGGCGCCTGCTGGGGATTCC
ACACCGAAGTCAAGACTGCGCATTTGATCTAACCCATAAATTTTAAAGGA
GTTGGACTAAAAATGTTGGAGGATAGTTATCAGTTATAACTATATATTCT
GTGTACTTCAGAAAAAAACTGTTGCGAGAATTTTCGACCTGTTTCTACAC
ACATGTAAGTTACTGTTGCAGTGTGTGTACCTATGTGTATGTGTGTGTGT
GTGTGAGTGTGTTTGTGTGTGTGTGTGCGTATGTGTGTGTGTTTGTGTGT
GTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGCGTGTGTGTGT
GCGACTGTGTGACTGTGTGTATGTGTGCGTGTGCGTGTGCGTGTGCGTGT
GCGTGTGTGTGTGTGTGTGCGCGCGCAAAGAGTGCTGAATTCATTTCTAT
TTTGTCTCCATCAAGAGTCGACATAGGTTGGAGAAAAAATACACTTACAG
ACTATATGAAAACTAATCTTTGCTTTATACAGCTTTTTCTTTATCAGTCG
AATTAAGTATAACGTTAAAGCTTGAATTGCGAAGAATATATACGTGGTAC
AGTATGTATAAAAAGAACATACCAATCTCATTTTGTCAAGTTATTTTCAA
TATAACGTTAACCTGAATCATTCATGTAGTCTAATAATCCACATAATCTT
TATAGATCTAAGAAACTCTAAGATGATTAAAACTAAAAAATTGATTTTTG
ACTTAAAATTACGTGTATGAGATAGTACTAAGTATGTTCAATACTAAGCA
GTAATCTCGTTTTGCCTATGTGACATTATCCCTATAAACTCCAGTTAAAT
CGTGACTTATAATTCCTTCATCCAGCAGCCGTATAAGATAGTCCTTTTCT
GCGGTTGTATTATGTGTTGACGTCTTTAGACCTCCAGTTTTGTAGCGCTC
GTAGTAGTGGTTGAAGATGTTGGAACCGTACCCAAACCCGGCTAGGTCCA
CCACGTCACAGTAGTGAAGGGCGAAGGTGGTGGCTATCAGACCCA
Gene-mRNA-Prot
The following exon feature(s) are a part of this transcript:
| Feature Name | Unique Name | Species | Type |
|---|
| BlTCONS00008354-exon-Sc0000002-1564993656:6635731..6635828 | BlTCONS00008354-exon-Sc0000002-1564993656:6635731..6635828 | Branchiostoma lanceolatum | exon |
| BlTCONS00008354-exon-Sc0000002-1564993656:6626034..6626083 | BlTCONS00008354-exon-Sc0000002-1564993656:6626034..6626083 | Branchiostoma lanceolatum | exon |
Position
The following features are aligned
| Aligned Feature | Feature Type | Alignment Location |
|---|
| Sc0000002 | genome | Sc0000002:6626034..6635828 - |
Properties
| Property Name | Value |
|---|
| GeneID | BlCUFF004178 |
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