transcript:BL95120_evm1 (mRNA) - B. lanceolatum

Overview
Nametranscript:BL95120_evm1
Unique Nametranscript:BL95120_evm1
TypemRNA
OrganismBranchiostoma lanceolatum (Amphioxus)



Sequence
The following sequences are available for this feature:

protein sequence of transcript:BL95120_evm1

>transcript:BL95120_evm1-protein ID=transcript:BL95120_evm1-protein|Name=transcript:BL95120_evm1|organism=Branchiostoma lanceolatum|type=polypeptide|length=507bp
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RCRNMAP
Run BLAST on NCBI

mRNA from alignment at Sc0000006:412662..458320+

Legend: polypeptideexonCDS
Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.
>transcript:BL95120_evm1 ID=transcript:BL95120_evm1|Name=transcript:BL95120_evm1|organism=Branchiostoma lanceolatum|type=mRNA|length=45659bp|location=Sequence derived from alignment at Sc0000006:412662..458320+ (Branchiostoma lanceolatum)
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GTCAAGTTTGTACATTCAGTTTTAGACAATTAGTACAAAACCTGCCTCAA GAGTCACTGCTAGCCTCCTGTGCAGACTTTCTGGGAGGCTGGCTCTTTCG ACTAATTTGCGTTTTTTTCCTGATCGCTCGCCTTTACTTATATTGCCACA CTTAATCGGCACGTCAACCCAGTAGCCGAGGAACGTAATGGGAACAAATG TAATAAAGATAGATAAAAAAACTTCCGATCGCAGTCTGCAACGGAGGCTA CTATACTGTCTTGATTTTCTTTCAAGAAAATGGAAAAGGCGTAGTACGAA GAAGGCGTAGTAAGAATATTATCATTTTGAAACAACCCCAAAATATGATT TTCTTCTTTTTTAGCTGCTCGAGACAACAAGGGCACCGAGTTCATCCTGA CCTTTCCGGAAAACTTCCAGAGGGACCTGAACAAGCCCAAACTGTTCATC ACCACCCAGTCCTTGGGCGGGGCCAGCGTCACCATCTCACTCCCTTCTAA CGGCTTCACCACCGGGGTGCAGGCGACTTATGGCGGGGTAAGTGATAACT GTTAGGTATACTCTGTTTGAATAGCTTGATTTATTTAGCCACACTATTCA GTCACTCGAACCTCCCATTGTATGATGCATATGTCGACTGTCGCGAATAG CCTTTCCTTCTCATTGATTCATTAGTTCATTGGACAGCACATGTGCCTTC TGCTCTTTAATGGGGGAACGGTGGGCTTGTGGTTAGGGTTGTTGACTCAG AACCCGAAGGTACTGAGTACGAATCCCTGGCATGTCCCAATGCTGTGCCC TTGGGAGAGGCACTTTACGTCAATTTCCTCACTCGACTCAGCTCACCTAC ATGTAGCTTCGGCTCGGACGTCCCTTGGATTTTGGATAAGACGTTAAAAT AACAACAGTGTTCTTGGCAACAATGACTGGATTGCAAATTTGATAACGTG 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AAGGTGAATATCTCAAGACTTACAGTTGTACATTATTACTGCATTAATGG CATGTTTGTACATTTGTACTGACCCTTCTGAAATAAGTTTTAACTGTAAT TTCCAACACAAAAAATGGATTTACCCAAATTTTCTGACTGTACTGACCCT TTTAGTGCCAAAGCAAGTTTTCTTGCTGTTTCAGCCGCACTGGGTATATG TTTTTTCAGGATTGCTAGCCCTTCCCCTTTAATGTGTTCTACTTCTAGGC ACCTCCTCGAAAACAGGACCCCCATTTTCCACCCTTCCTGATCCAGCCCC AACTGAGATGCTCTAACCCTGGATTGTACAGGATCTCCCAGTTAGCAGCT AATCGGAACCAGGAGCTCAACTTTTACAGATTCGGTCTGTTTACTTGCAA TGACGGTTGTCTCCCTTTTTTTCCAGCTCAGAGGCAAACGACTTGGCCCT GAGGTTAGCAAGAACATACACAGGAAACTACGATGTTGTTGTGATGGACA AGTAAGTAGTACGGTGTTTTGTTTTTAAGGCATCTCTTACATACTTAGTT ATTGTGATAATTGATTTCCACACCATGTTGCTCGTGGCACTCTCGTCAGA GAGCGGTGAAAACATTTATCTCACTAGATTGCACTAAATTGAAATTTTGT GAAAATTAAAAAAAAATTGCCATTGCCGAAATGGTGCAGATGTGTGCAAA ATGCTGCAATAACTATAAGTTATAACTGTTGTTTTGATAAATCATAGTGA GTAATTGTACATTGGTTGTTGATTCAGTGACAACACTGCGATTTCCAATA AAGTCATCTTGTATCTGATTTGTAGCAGAAACAGAGCATGTGACATCCTG GGCGTGGCCATTTTGTTTGTAGAGGTCATGTATTTTAATCGTGCATCGTA CATCAGTGTGACCGCAAGGGAAAATTTGCAAAGTTGGCCCAATTTCCTAG 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Coding sequence (CDS) from alignment at Sc0000006:412662..458320+

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CCCACCGACGTGTTGGGGACGGAGTACTACGTCCCCTGCACAACTATCGT
CCGGGCTTGGAATGAAGAGGGCCTTGTTGACATTCCGTCTGAGTTCGGAG
TCGCCGGTGTCCAGGACGGGACGACCGTCACCATTGTCCCCAGTCAAGCC
GTGACGTTCGACGGACAAAACTACGCCGCAGGACAGGCGTTCTCTGTGGG
GTTGAACCGATTTGAAACACTCCAGGTCCAGGCGACTGAGGACCTGACCG
GCTCAAAGATCACGGCTACCCAGCCTGTGGCCGTGCTGAGTGGAAACATG
TTCGCTTACTGTATGCCAATGGGCGAGCGACAGCGGGGCACCGGAGACCA
CCTGGTACAGATGATCCCACCTGTGGACACCTGGGGAGAGGAGTTCGTCA
CCGTGCCGCTGTCCAGGCACAGAGGCGGCGACCTCTTCCGCGTCGATGTC
ACCAATGAGAACGCCAAGACTCTGAACGCTGGGGAATTCTGGGAGATTGA
TATCCCATCTGACGAGTACAGACACGTGACCACCAGCGAGCCCGTCTTGT
TGGTGCAGTACAGTAAGGCCGGCTCTGCTGACAACACGGCAACTGACCCG
TTCATGATGATCATCCCTTCTGTAGCGCAGTTCGAGGCAGAGTACACGTT
TTCTACGGTTGATCTTCTTTATGACCCCTCTAGAACAACTCATCACATCA
ACGTAGTCACCAGCTCGGCTGACATAGCTGGTCTCCGATTGGATGGACAG
CCGTTGCCAAGCGACACCGTCTGGCATGACGTACCTGGGACCAGATACGC
CGCCGCGCAGTTGACTGTCTCTAGAGGCACCCACACAGTCCGCCACATGT
CTCCCATCGTGACGACTGGGCTGTTCAGTTATGGATTCACTAATCTGGAG
TCGTACGGCTATCCCGGTGGTCTCCGGCTGGCCCGGATCGCCGCCTTGTG
CAGCACCACCGCCCCCGTCCCCGCCGACCGTGTGGACAACGACTGTGACG
GACGTGTGGACGAGGAGCTGCTGAACGGCATTGATGATGACGGCGACGGG
CTGATCGACGAGGATCTGGCCATCGGAAACTGCGCTGACCACCGGCGCCA
GTACGAGACGTGCTTGCTGCAGCGCTGCAGGAACATGGCCCCTTGAATGG
CGCGCCTACTCCTGCCCCTGTTGGTTCTAGCTGCTGTTTTCGGCTGCAAT
CTTGCTGCTCGAGACAACAAGGGCACCGAGTTCATCCTGACCTTTCCGGA
AAACTTCCAGAGGGACCTGAACAAGCCCAAACTGTTCATCACCACCCAGT
CCTTGGGCGGGGCCAGCGTCACCATCTCACTCCCTTCTAACGGCTTCACC
ACCGGGGTGCAGGCGACTTATGGCGGGGTGACACAGGTTGACTTGGACCG
TGCTGCCACAGAGCTTCGCGGCAGTCAGAAGAGCGACAAGGCGGTTCACA
TCACGTCCGATGTGGAGATCGTGGTGTACGGGGTGTTCGCCGAGAGAGCC
TCGTCTGACGCCTACCTGGCCCTCCCCACCGACGTGTTGGGGACGGAGTA
CTACGTCCCCTGCACAACTATCGTCCGGGCTTGGAATGAAGAGGGCCTTG
TTGACATTCCGTCTGAGTTCGGAGTCGCCGGTGTCCAGGACGGGACGACC
GTCACCATTGTCCCCAGTCAAGCCGTGACGTTCGACGGACAAAACTACGC
CGCAGGACAGGCGTTCTCTGTGGGGTTGAACCGATTTGAAACACTCCAGG
TCCAGGCGACTGAGGACCTGACCGGCTCAAAGATCACGGCTACCCAGCCT
GTGGCCGTGCTGAGTGGAAACATGTTCGCTTACTGTATGCCAATGGGCGA
GCGACAGCGGGGCACCGGAGACCACCTGGTACAGATGATCCCACCTGTGG
ACACCTGGGGAGAGGAGTTCGTCACCGTGCCGCTGTCCAGGCACAGAGGC
GGCGACCTCTTCCGCGTCGATGTCACCAATGAGAACGCCAAGACTCTGAA
CGCTGGGGAATTCTGGGAGATTGATATCCCATCTGACGAGTACAGACACG
TGACCACCAGCGAGCCCGTCTTGTTGGTGCAGTACAGTAAGGCCGGCTCT
GCTGACAACACGGCAACTGACCCGTTCATGATGATCATCCCTTCTGTAGC
GCAGTTCGAGGCAGAGTACACGTTTTCTACGGTTGATCTTCTTTATGACC
CCTCTAGAACAACTCATCACATCAACGTAGTCACCAGCTCGGCTGACATA
GCTGGTCTCCGATTGGATGGACAGCCGTTGCCAAGCGACACCGTCTGGCA
TGACGTACCTGGGACCAGATACGCCGCCGCGCAGTTGACTGTCTCTAGAG
GCACCCACACAGTCCGCCACATGTCTCCCATCGTGACGACTGGGCTGTTC
AGTTATGGATTCACTAATCTGGAGTCGTACGGCTATCCCGGTGGTCTCCG
GCTGGCCCGGATCGCCGCCTTGTGCAGCACCACCGCCCCCGTCCCCGCCG
ACCGTGTGGACAACGACTGTGACGGACGTGTGGACGAGGAGCTGCTGAAC
GGCATTGATGATGACGGCGACGGGCTGATCGACGAGGATCTGGCCATCGG
AAACTGCGCTGACCACCGGCGCCAGTACGAGACGTGCTTGCTGCAGCGCT
GCAGGAACATGGCCCCTTGAATGGCGCGCCTACTCCTGCCCCTGTTGGTT
CTAGCTGCTGTTTTCGGCTGCAATCTTGCTGCTCGAGACAACAAGGGCAC
CGAGTTCATCCTGACCTTTCCGGAAAACTTCCAGAGGGACCTGAACAAGC
CCAAACTGTTCATCACCACCCAGTCCTTGGGCGGGGCCAGCGTCACCATC
TCACTCCCTTCTAACGGCTTCACCACCGGGGTGCAGGCGACTTATGGCGG
GGTGACACAGGTTGACTTGGACCGTGCTGCCACAGAGCTTCGCGGCAGTC
AGAAGAGCGACAAGGCGGTTCACATCACGTCCGATGTGGAGATCGTGGTG
TACGGGGTGTTCGCCGAGAGAGCCTCGTCTGACGCCTACCTGGCCCTCCC
CACCGACGTGTTGGGGACGGAGTACTACGTCCCCTGCACAACTATCGTCC
GGGCTTGGAATGAAGAGGGCCTTGTTGACATTCCGTCTGAGTTCGGAGTC
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GACGTTCGACGGACAAAACTACGCCGCAGGACAGGCGTTCTCTGTGGGGT
TGAACCGATTTGAAACACTCCAGGTCCAGGCGACTGAGGACCTGACCGGC
TCAAAGATCACGGCTACCCAGCCTGTGGCCGTGCTGAGTGGAAACATGTT
CGCTTACTGTATGCCAATGGGCGAGCGACAGCGGGGCACCGGAGACCACC
TGGTACAGATGATCCCACCTGTGGACACCTGGGGAGAGGAGTTCGTCACC
GTGCCGCTGTCCAGGCACAGAGGCGGCGACCTCTTCCGCGTCGATGTCAC
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TCCCATCTGACGAGTACAGACACGTGACCACCAGCGAGCCCGTCTTGTTG
GTGCAGTACAGTAAGGCCGGCTCTGCTGACAACACGGCAACTGACCCGTT
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CTACGGTTGATCTTCTTTATGACCCCTCTAGAACAACTCATCACATCAAC
GTAGTCACCAGCTCGGCTGACATAGCTGGTCTCCGATTGGATGGACAGCC
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CCCATCGTGACGACTGGGCTGTTCAGTTATGGATTCACTAATCTGGAGTC
GTACGGCTATCCCGGTGGTCTCCGGCTGGCCCGGATCGCCGCCTTGTGCA
GCACCACCGCCCCCGTCCCCGCCGACCGTGTGGACAACGACTGTGACGGA
CGTGTGGACGAGGAGCTGCTGAACGGCATTGATGATGACGGCGACGGGCT
GATCGACGAGGATCTGGCCATCGGAAACTGCGCTGACCACCGGCGCCAGT
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CGCCTACTCCTGCCCCTGTTGGTTCTAGCTGCTGTTTTCGGCTGCAATCT
TGCTGCTCGAGACAACAAGGGCACCGAGTTCATCCTGACCTTTCCGGAAA
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TTGGGCGGGGCCAGCGTCACCATCTCACTCCCTTCTAACGGCTTCACCAC
CGGGGTGCAGGCGACTTATGGCGGGGTGACACAGGTTGACTTGGACCGTG
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ACGTCCCCTGCACAACTATCGTCCGGGCTTGGAATGAAGAGGGCCTTGTT
GACATTCCGTCTGAGTTCGGAGTCGCCGGTGTCCAGGACGGGACGACCGT
CACCATTGTCCCCAGTCAAGCCGTGACGTTCGACGGACAAAACTACGCCG
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This mRNA is a part of the following gene feature(s):
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The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
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