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Sequence
The following sequences are available for this feature:
protein sequence of transcript:BL91440_cuf4 >transcript:BL91440_cuf4-protein ID=transcript:BL91440_cuf4-protein|Name=transcript:BL91440_cuf4|organism=Branchiostoma lanceolatum|type=polypeptide|length=104bp
MGPHVIIVTVLKFINMLRYDTFFFFSFSQMYLDGRQQQTPADGMQRRVSS
GRERPDSSLKICCDTRYKSCQVKAFIYIRSVFIIHMIIFLLQVHAQRYME
IHGN Run BLAST on NCBI mRNA from alignment at Sc0000014:1384134..1392522+ Legend: exonfive_prime_UTRpolypeptideCDSthree_prime_UTR Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below. >transcript:BL91440_cuf4 ID=transcript:BL91440_cuf4|Name=transcript:BL91440_cuf4|organism=Branchiostoma lanceolatum|type=mRNA|length=8389bp|location=Sequence derived from alignment at Sc0000014:1384134..1392522+ (Branchiostoma lanceolatum)
TATAACGTTTTTAAAGTGTGAACGTGTCCAAACCACAGACGTTGTTTACA
AGGAAAGACCGTGGCATATATAGCGGTGTGTGTCTCTCCTTATTTGTACC
GACGTGCTCGTGTGTCCCCACAGAAACCGATGGAAACTAGGTGGGGCTAG
TTCCGGCCCGCCAGCATTCGAACGTTGATTCTGGTTGGACTCACTTGAGA
CTTGGCTGTGTGAGACGCTATTGCATGTAATCGCTGGGTTTCCCATGGCA
GAACAAGTCCGTATTCGTGGGGGCGAGCGTCGTCATTTTTGAGGTGGGGT
CTTTTCCTGCTGATAAGATGGTGGCGGTCCGGGTTAGTCGAGGAGAAAAC
AAACCAACCAACCAACCAACCAACTAACATAGGCGGTTTTGCACCCCTGT
GTGGAGATCACAGTTGGCACAGTCCGGTTCAGTTCGTGCAGCTCAGGCGT
GTGTGCATGGATCCTGCATGAGCGGAGATGTTTCGGATGGATTTTTTTGC
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TGTGTGTAGTAACTGCTGGAATATTGTCGTGGCCGTTTCCGGGTTGTTTC
AAGGAGTTTCGGGAGGAAATGGAGCCCTTCTTTACTTGTTGCGTTTCGGA
GAGACGACAAAATGGCGAGACTGGCGTGGTGAGCAGATGGCGTGGTGAAG
AGACGCGTTCTTACAAGGTAAGACAACAAACTGTTTCCTCGACATAAGGT
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TCTTTACGACAACCTTTACAAATGTCTATTTCTTTCGTATTTGGTTCAAT
ATTTTGCTCTTTATTTTTGCTTAAATAACGTTGCATATATTTGGCTAGTT
GTGTGAAAATTATAGCAAGTATGAGTTGATATTAATAGCAGAAAAACTGC
AAGAAAATTGTCCTTTGTTTGTCTCCACGTGGCCACCACCTGTTGGAATG
TACGTGACGTCACTCCTCAGTTTTCCCGCCAAAACGCGGCGTGGAGGGGA
GAGCGGGGTTTGTGTTTTAGTCTTGCGGATTTAACGACTGTTTCTCATAG
TTTAGAAGAAGAAATTGGCCTTTTTTCTGTGCAATTGCAGCCTCCGGGAA
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GGAAAACTCGTTCTTTACTGGAGGTAAAACAAATTCTGTTTCGTTGATAG
AATTTCTTATGATTTAGTGCCATTTTTCGTAGAAAACAAGGGAGTCGGTA
TTTTTGGAGGGGCCTTTTGATATTGAGCGGCAACTCCAAGAGAGAAAACA
GGCTTTACAAATGTCTATTTTTTAAGTATTTGGTTGAGTATGTCGCTCTT
TAGGTCGCTCTTGGAGGTAGAGCAAATAGAATTCCTTGTAATTTAGTGTC
ATTTTTCGTAGAAAACAAGGGCGTCGGTATTTTTGGCGGGGCCTTTTGAT
ATTGAGCGGCAACTCCAAGAGAAGACAGGCTTTACAAATGTCTATTTCTT
CCCGGTTTTGTTAGGATATTTTCCACTTTATTCCGTGCGTAAATAATGTT
TATATTTATGTAGCGAGTCATGTAGGAATGGTATGAGTTGATATGATATA
TGTGGCAGAAAAAAATGCGACAAAAGTGTGACTTTGTTTTATAATATGTC
CACGTGGCGCGGTCCGGCTGTACCGCCACCTGTATGAACGCGCACGTGGG
TGGCTTTAACTCGGTCAGTTCTTCCCGCCAAAATGTGTCGTGGACAGGAA
AAAACGTATGGCCTTCCATGAGTATTTGAGAGATTTCTTTAAGTTGCTGT
AAGGTTGGGCTTTGAGGTGAAGAAGTTGAGTGCTGTTGCGCTTAAAATTT
AAGTTTAAAGTTGTTAGCAGTGAGAAGTAAAACAATGCTGTTTTTGATGC
ATTTTATGAAGTTATTATGCAAATATGCGAAACAGTGAGTAGATGTCACT
ACTATGAAGATATCAGCATTTTGTTATTTCCATTTTTGGGGGACCTAATA
TTGCTTTGGTTGCCGAGGTACAAGTAATGTGTTCCATAAAGGGGGATTAC
TATTGTTCTAGAAATAGCTGTTAAGATTCTGCTTCGATACATAACATCAC
AAAGGGTAACATTTGAAATGACTTGACAACTGATGATACTTGTTACTTAC
TGTGACCGTTTTATTGCCACAGGGAGGAACATTGAAGAAAACCCGCACTT
AGAAGAGACGTCCCGGTGAGTGTTTCACAATTTCTTTGTCGAGATCATGT
TGATGTTTTCGGTGACACTTATTGTGTACCGTATATTGTTCAATTTCACT
TATCTGGTACCGTATATTGTACAGCAACATTTGGACTATCAACTCCTCGT
ATACATTGACTTGATGTGACGAGAATGTTAAGGAACATTAATATGTTTAA
TGTATACTTGACCTCTATACTTATTTGATATTACATTTGTGTATATTTTG
TGGGAACATCACAATTCAGACTTGTTCCAATCAAGATTGAATTGAATTTT
TTTTCAAAAATTAAATAGTAACAGTGTTTGGTAGTGTTAAGTCAAGGTAG
CAGCACACAGTATTCATCAAGCAGTAATGAAATGGTGCGGCCTAAATCTT
GAACCACATATTAANACATGTTAAAATGTTTTGTGAAAGCCAGCAAGGCA
CAAACTTTACTGTAGGATAGTACGTTTTTATGATATAAATAAGTCTGCTT
TTAGATTGTACGAATGAGATTTGGAATTTTGCCCATTCAGTGTATAAATG
TGCTTCTCTTGAGTACCCTAAGGCCTAACGTTACTATAGTTTCATCCACG
TTGATGTCGGTCACTTTGTAGCCCATAGCCTGGAAACTGTGCTCTGCTAC
CTTGAACATCATTATTGAAACAAGTTTATTGCAAGTTCTTGCTCGTAGGC
TAATTGCAAGTACATGTAATATGAAAGGACGGACAGACAATGGGTAACAA
TATAGCATGTGACTATTCTAGTCTCAATACTAGCTCTATCTTATTTGGGT
TTGACAGTGGAAGACGAAAGATCCCACTTTTTCTGTAATGTGCAGGTTTC
ATGATGTTAAGCGGAGACATAGTTTTCTGTTGGTCTGTAAACATGGAGAA
GTTTGGATGGAATTTGGTGGGCTCTTTAAACAACGCTTTTCTTTCTTGAT
TGTAGAAAGGGAAATAAAATGTGTTTCGTCTTCGTGTTTGACATGAAGTA
TCTACAAGTTCTTTAGAACTCAAAAAGCTATGAATGGATTGATGTGAACT
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TTTGGAGCCCCTGCCAGGGTTTCTCGCTAATGCAGCTGAACTTTGTTTCC
GTACAAAATGTTTGTTCATAGTGCTGTGAACCTAAACCCATGTTCAGGTT
CAGGTTTGGATTTAGATCGAGNGAAATAAAATGTGTTTCGTCTTCGTGTT
TGACATGCAGTATCTACAAGTTCTTTAGAACTCAAAAAGCTATGAATGGA
TTGATGTGAACTTCGTTGTGTGATTCGGTCTTTACCTATTTAAGTCATTA
TCAGATTTTGGAGCCCCTGCCATGGTTTCTCGCTAATGGAGCTGAACTTT
GTTTCCGTACAAAATGTTTGTTTGTTCATAGTGCTGTGTACCTAAACCCA
TGTTCTGGTTCAGGTTTGGATTTAGATCCAGAGGTCCAGGTCTGGACCTG
AACCCATGGCATATGTCTGCTAGAAATGGGTGCTACCTTAGATCAGTAAC
ACATTCTTTTTTATACATTTTATATCATTGCATTGTGCATATTTGTTTGG
CCTACGCATCAATGTACAGGGCTCTAAATACTGTGTGCATGTGTAGCCTC
CATTGCAGGCTTCTCCCACAGCGATTTTTCAACTTATATATATAATTATA
AGGGACTGTGGTGATTAAGAAAGTTTTTCGAGGGCCAGTTGATTTTACCG
CGAGAAGTAATTCACAGTAATGCGAGAAGCAATTCAAAGGTTGCGTTGCA
CAAAGCCCACGTGAAGTGACGCATGCTACAAATTTTCTGAAATATGGCCT
GATGTTTCTTTCAATTGCTGATATCTTCTGTGAATTTAGCTGTTGTTTTA
TTCAAATTGTTGTCTTCAAAGTCATGTTGCAAATTTCTCAAATGTGGCCT
GATTTTTCTTTCTATTGCTGATATCTTCAGTGAATTCAGCTGTCGTAGCT
TAGAGATGTTAGAGGTTTTTTGTATGAAAAAGGCAGACAGTCGCTGAAGT
ACCATCGACCTTTCCTGAAGTACTGTAAGAAGCATTGAAATCTTGGCATT
GTTGGGTCTTTTGGGGAATTCAAGAAGTTGATCGCTATTTATTACACTAA
TGTTTGCCCTGAGTTCAGGCTTCAACGTATGGTAAATTTGACAAGACATT
AGCTGGATTCAAGCATAACAATTTAGTCTCTGATGAATTATGATACCCGC
TTCTGGTGTGGAATGTTCCTTTAATCTGTTAAGAGTGAAACATTGGAAGT
CTAAGAAAATTTGCATGACTATTTGCCTAAAGTAGATTATGTTTCAAAGT
TGAATCACTTAAGCCCTGTTCGCGACAGAAAAAGGAAAACGGTTTGAACC
GTTTCAGCAAACATGAAATGCTCCTCAACGGTTTTGTTCCTTTTTTTTCG
GAACCCTCTCGCGAGGTAGTCTGTTACGGAACCGGTTCACATCGATTGTT
ATGACGTCGTACATGAGGTCATATACGTCACTTGTGCTTTAGTGTGGGAA
AGAGTGAAAGTTCTTAGTAATACCTGTTGATCGGATTTCGGCCACGTTTT
TTAATATAGTAAAATTTTGTAACATCATCAGTGCGCTAGGGGTCGCTATT
GTACCATGCCTTCCTAGATGTCAGAGCAAAAAATTTTCCTAGATGTCAGA
GCAAAAATTTTTATGTGACCAGCGTTTGACCCAAACAAATGATGATAGCT
GGTTCACTGGTGTGACAATGTTGTCGCTGTGTTGCATTTTCTTCAAACTT
TCTCTGGTCTTATTGCAGATGGTCGTCCAACACAGCATTGCTGCCGACTC
CAGCCTGCAGTTAACACCAGTGCAAGGAAGAGTCTCTTCCTGGAAGACGC
GTGTTTAACAGTTAAGTTGTTCATTGTTCTGACCATATCTTCTTGAAATT
TGTGCTTTTTAAAGTTGTATGCAGAAATAGAACTGTTCGTCAACTGAAGT
AATTGGACTTGCTTTTCCAAGTTGACTGTACAGAATTTTTTTTATCAAAG
AGTAAGTGCTGGAATCAACTTTACTCACTACTGCTTTTTTTAAACTTAGA
TTGAATCATTCCTTTGTAAACTAAGGTAGATTATTTTGAGTCTTGCTTAA
CTTAACGGGGGGTCCCATAACTTCAAACGTATATTTTATAAGTTTGACAT
CGCATAGCACCAGTGTCGGTTGACTGAAAAGTGTTGCGTTTTGACGAATG
ATAAATTAGAGTGGCGGTGTTTAAGGATTTTCTGTTGTCGACTTGATTTT
ACATCATCCATGCATGATCTACAATCGGTAAAACCAGAAAAATTTTATGA
ATATAGCGTTCCATATTGTTCCATTCTAATTAGGGTACTACAAATTTGGC
ATACAAATACCTTTGTCTCTCTTTAATTTGTCGGCACAAAGTAAACAGAT
GGAATAATTTTGTGTCAACTAACTTCAGCTTCCCTGTAGTAAATAATTTT
TGACCGTTCGTAAGTCGCCACCGCTGTGACTTGACTTAGCAACTGTTTAC
GCCACTTGTTGCGTTCCAAGCCATGTCAACGTTGACGATCCGTCCTTTGG
TATGCCGCATTGTTACACCGGAAACTGAAATGGTTACATTTGCATTCGGC
ACGGCACCACATGCGACCAGAAAGTATGCGGCAAATCTTGTTTTTCCAGT
GCAAAGTTCTGACATATTTTAAACATCATCAATTGTTTTTAGAGCTTGCT
ATTCATGATTTTCTTTTGAGCAAGCAATGAGAACTCACCATTTACTTTCA
ATAAACTTCGTGTTTCTGATACAGGGTATGGGTTAGGTTAGTAATACATG
TTTGCAACAACAATGCGTTTACATTTTGTACTAAAATGTGGAACCATGTG
CAAGCCTGCCGACGGGAACTTATCAAATGCAAGTTTATCCGACGTGTTTA
AAGCTAGATTAATAAGATTTGCCGTTTTGGAGTCGCACTAGCTAGTACTT
GATTTAGACAGGGAGACCGTGAAATGTCAACACTGTAGCTGCATCACATT
CGAATCGTGGTCAAAGGAATGGCCACGACGTAAAGGGGGGGAGGGCGTTA
AAGCCGCCGTTATTTCGTTATTTAAGACAAGTTTAATCGCGACATAAACT
AACAAGCACTGACATTTCTTGTGTGTTTTGTGGAGCTTTATGCCTCATGT
GTAAAACAGGAAAGTTTGCGTAACGATTGTTTACAGTTCTTTATGTAAGA
GTTGCCATTACGCAATGACCTTGCATTGAACGAAGCCATTGTTTATAGCC
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CAGACGACTGCTATATGCAGGAAGTTGGGTTCTCAGCATTTTTATTCAGC
ACACTAGTGGATAGAAACAAACATGTCTCTCTTCTGCATATCAAGACAAA
GCAAAACTCGTTCAAAGTTATGGTACTGTTGAAGTTATGGGACCCCATGT
TATAATTGTAACCGTTTTAAAATTTATCAATATGTTGAGGTATGACACTT
TTTTCTTCTTTTCATTTAGTCAAATGTATCTAGACGGGCGACAGCAACAG
ACTCCAGCCGATGGGATGCAGAGAAGAGTTTCTTCTGGCCGGGAAAGACC
TGACTCCAGTCTGAAAATTTGCTGCGACACGAGATACAAGTCATGTCAAG
TCAAGGCCTTTATTTACATTCGAAGTGTTTTTATCATTCACATGATAATA
TTTTTATTGCAAGTTCATGCTCAAAGGTACATGGAGATACATGGAAATTG
AAGAAGTTATTTATAAGTCTACTGTGAAAGTTCTATGGTTGACTATGGTT
GGGTTTGACTTCTTTCTTTGAAGGCAGTGGAAAATGAAGTGACCCACGTT
TTTTATCGTAAGTGGGTTGATTGATTCTAGTAGAAAGATGGATTTGTGTA
AATCATTCAAATGGTGAAAGGTAGGAGAATCTATAGAAGCTGTTTTATAT
AATTTGCTTCGTTCGGCATCATATAGAGGACATTAGAAGATAAAACGTAT
TTCATTTTCCACTGCGTTCATTGTACAAAACTAATAGTAAACACATTTTC
TCGTGAGCAGGCAGCTTTTTATATCTAGTGGGTGTGCGCTTATTGTATCT
TACAGCTGACTGTTGGTCCAAATCTTTGTTGGAGATATACGTTTGCCATT
GAGTATTCTGTTTTGACGTTTCTATAAAATGTTAACTTACAGTCATCGAT
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TAGCAATGTACAAAATGCGGTACATGTTTGTCTAGATCGAGATTGTTGAC
GTTCCAGATAAAGAAGTATCCGCTATTGTCAAGTACATGTTTCACATGAT
GGTATTATATAACTGTACAGGTATAATCAAGGAGCAAAGATTGTTTTTCT
AGATTAACTTGATTTTGTGTACCAAGACCGTTAACTTTGTGTAATGTTGA
AGAACTGTTGTGCTAGGATCTTTGCTATTTGTGCTACGAATGCACACGAC
GAACTTTGTAGTAATTTCGAAAGTCAATATTGTTGGGCTAAGCTGATGTT
GTGTAGCGAGACTGTCAACTTTCTGTAATGTTGAAGAACTGTTGTGCTAG
AATCTTTGCTATTTGTGCTACGAATGCACACGACGAACTTTGTAGTAATT
TCGAAAGTATTGTTCTCGATATTGTTGGGCTACGCTGATGTTGTTTACCG
AGACTGTCAACTTTCTGTAAAGTTGAACTGTTGTGCTAGAATCTTTGCTA
TTTGTGCTATGAATGCACACGACGAACTTTGTAGTAATTTCGAAAGTATT
CTCGATATTGTTGGGCTACGCTGATGTTGTTTACCGAGACTGTCAACTTT
CTGTAATGTTGAACTGTTGTGCTAGAATCTTTGCTATTTGTGCTACGAAT
GCACAGGACGAACTTTGTAGTAATTTCGAAAGTATTGTTCTCAATATTGT
TTGGCTAAGCTGATCTTGTGTGGCGAGACCGTCAACTTTGTGTAATGTAG
AAGAACTGTTGTGTTAGAATCTTTGATGTTCGTACTACGAATGCACACAA
CAAACCATGTAGCAATTGAAAAGTATTATTTTTAGCNAC Coding sequence (CDS) from alignment at Sc0000014:1384134..1392522+ >transcript:BL91440_cuf4 ID=transcript:BL91440_cuf4|Name=transcript:BL91440_cuf4|organism=Branchiostoma lanceolatum|type=CDS|length=315bp|location=Sequence derived from alignment at Sc0000014:1384134..1392522+ (Branchiostoma lanceolatum)
ATGGGACCCCATGTTATAATTGTAACCGTTTTAAAATTTATCAATATGTT
GAGGTATGACACTTTTTTCTTCTTTTCATTTAGTCAAATGTATCTAGACG
GGCGACAGCAACAGACTCCAGCCGATGGGATGCAGAGAAGAGTTTCTTCT
GGCCGGGAAAGACCTGACTCCAGTCTGAAAATTTGCTGCGACACGAGATA
CAAGTCATGTCAAGTCAAGGCCTTTATTTACATTCGAAGTGTTTTTATCA
TTCACATGATAATATTTTTATTGCAAGTTCATGCTCAAAGGTACATGGAG
ATACATGGAAATTGA
Gene-mRNA-Prot
This mRNA is a part of the following gene feature(s):
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
The following exon feature(s) are a part of this mRNA:
Position
The following features are aligned
| Aligned Feature | Feature Type | Alignment Location |
|---|
| Sc0000014 | genome | Sc0000014:1384134..1392522 + |
Properties
| Property Name | Value |
|---|
| Transcript id | BL91440_cuf4 |
| Biotype | protein_coding |
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