|
|
Sequence
The following sequences are available for this feature:
protein sequence of transcript:BL83746_cuf0 >transcript:BL83746_cuf0-protein ID=transcript:BL83746_cuf0-protein|Name=transcript:BL83746_cuf0|organism=Branchiostoma lanceolatum|type=polypeptide|length=295bp
GVVGRGKEQMVEEQQKQREKPLPMEEAEEHPHLNQSRSTVTEKRPKGVPR
SLLRNDRCPACFGDNLCEEFEDGMIELGSVVTSGKVVTYSGTWDKVKLTV
TQCASEERLEQFEKFVCRNLSKNATSCDPGEVLLKQDLKELLQARHLKKS
LEVLHPNTSSLAATTCVSKPLLKMLQKTFDENGNKRLNRLEQAHLYSALH
TCPHLALLKAFPRKKLPFPAFLGACGNLVAMETTGKPLPVYLKVKVSWQV
RANLSLQLLQMLDDFQNKDPDWLLMAGDVSMENFTVSPDGQLIXA Run BLAST on NCBI mRNA from alignment at Sc0000031:208839..215048+ Legend: five_prime_UTRexonpolypeptideCDSthree_prime_UTR Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below. >transcript:BL83746_cuf0 ID=transcript:BL83746_cuf0|Name=transcript:BL83746_cuf0|organism=Branchiostoma lanceolatum|type=mRNA|length=6210bp|location=Sequence derived from alignment at Sc0000031:208839..215048+ (Branchiostoma lanceolatum)
GGGGCGTTGTGGGGAGGGGGAAGGAACAGATGGTGGAAGAGCAACAGAAA
CAGAGGGAGAAACCGCTTCCCATGGAGGAGGCTGAAGAACACCCACATCT
GAACCAGTCAAGGTCAACGGTTACGGAGAAGAGACCCAAGGGCGTTCCTC
GTTCCTTGTTGCGTAATGACAGGTGCCCGGCGTGTTTCGGAGATAACCTC
TGCGAGGAGTTTGAAGATGGCATGATCGAGCTAGGGTCAGTGGTCACCAG
CGGGAAGGTCGTGACCTACTCTGGAACCTGGGACAAGGTCAAGTTGACCG
TTACCCAGTGTGCATCAGAGGAACGCCTGGAGCAGTTCGAAAAGTTTGTC
TGTCGGAACCTGAGTAAGAACGCGACCTCGTGTGACCCCGGGGAGGTGCT
CCTGAAGCAGGACCTGAAGGAACTGCTACAGGCGAGACATCTCAAGAAAT
CACTCGAGGTCTTACATCCCAACACATCTTCTCTAGCTGCGACCACCTGC
GTGTCCAAACCGCTCCTCAAGATGCTGCAGAAGACGTTTGATGAGAACGG
CAACAAGCGGCTGAACCGGTTGGAACAGGCGCACCTGTACTCTGCCCTGC
ACACCTGCCCACACCTCGCACTGCTCAAGGCCTTCCCAAGGAAAAAACTC
CCCTTCCCAGCGTTCCTCGGGGCCTGCGGGAACCTCGTCGCCATGGAGAC
CACGGGGAAGCCGCTCCCGGTGTACCTCAAGGTCAAGGTCTCCTGGCAGG
TCAGAGCCAACCTATCGCTGCAGCTCTTACAGATGCTGGACGACTTCCAG
AACAAGGATCCTGATTGGCTGCTGATGGCTGGTGACGTGAGTATGGAAAA
CTTCACCGTCTCGCCTGACGGACAGTTGATCNTCGCCTGACGGACAGCTG
ATCCTCTCCGACCTTGCCGCCATGACGATCATCAGCAAACACGACCTTGA
CAGGAACTCCACCGTGAAGCGGGCGAGCGTGTGTAACGAGGCCTGCTTTA
AGAGGTTCGTTCACAACCTGCTGGCGCGACCTGAGACCAGCTGTCGCCAG
GCGGGTCGCTACAGCCAGCTCATGTACGCGCACGCCTGCCAGAGGATTCT
GGGATGCTGGCAGACGGACAGGTCGGGGCAAGGTCGCGTGACGCTGTCCT
CCTCCAAGGACACGGCGTGCGAGCACGGCCGGGGGCTGCTGCACGGGCCG
CCGCGGGGCGCGAAGAGGGAGCTGGAGAACCTCCTGACCGACTGCGTGGA
GGAAACACGGCCTGATGGGAGAACAACGGCGCTCAAACAGATCAAAGTCT
TACTGGCAGCATAGAACTGTTAGGGGGTAGAGACAGCATAGGATAGAAAT
TCTGGAGTTGAGACTTCTAATACGAACAGTTCTGGAGTAGAAACTACGTA
CTATAGGACAGCTCTAGAGTCTTAATAGGACAGCTCTAGAGACTACAATG
GGACAGCTCTAGTCTAGAGACTACCAAAGGAAAGCTCTAGAGGCTACCAT
AGAACAGCTCTGCACTTGAAGCTGAGGTCTGAGATATATCTGCACTTGTC
TGAAACTACCAGAGCAATCTTAGACTGTCCAACTGGAATCTAGCCTCTAC
CAGGCTCCGCGGGATGGCTGAAAAAATAGTAGAAATTGGCCGTAATAGAG
TGAATAGTGTGCCAAGGGAGTTAGCTACGGAGAGAGGACAGTCCGTGGAT
GGCAGATATACCCTCTCTCCAGATTGGACCCTCTCTCCGTAGCTAATTCC
CTTTATTTGCCGATTCCTACTATTTTCCCAGCCATCTCGCGGAGCCTGGT
AGAGGCTACTGGAATCTACCTAGCTGGATGTTGTTTTTCCTGCACACTTG
CCTGCGGTGCCTTACACACTGATGTTTTCATGTACAGTAGCCATTTTCTG
TCAGAGTGTTTATGACTGAATCATGCAATGCTGCTATCTTCTGGATAGGA
CAGAAAAATTGTAACATTCGATATTGAGCACCCTTCTTTAGTTGCTTTGA
AAGCAGAGGGAATTTCAGAAAGAAGATGTAACATCTACTAAAATAATTCC
ACTGCGGTACATAATTCTTCCAACCTGAAAAGATTCGTCCAAACAGATCT
TCAACCCAACGTCCCCCAGTATAATGCACTCCTGTATATCTAAACTGTAC
ATACCTGGGGGATGTTGCACTAGAGATCTCTCAAAGTTACCCACTGTTTT
TCAAAGTGGCGGATTTATGTAAACCGGCAGATCATCTATTTTGAAACCTA
GTGTTCAACGCATCTACTGCACCATATGTGACCATTCTTCAGAAGTGAAT
AAAAGGTGTTGTACTTACACTGAAGTCCTCATTGTTGATATGTATATGAA
AGGTGTTGTACTTACACTGAAGTCTTCATGGTTGATATGTATATGTAAGG
TGTTGTACTTACACTGAAGTCTTCATGGTTGATATGTATATGTAAGGTGT
TGTACTTACACTGAAGTCTTCATGGTTGATATGTATATGTAAGGTGTTGT
ACTTACACTGAAGTCTTCATGGTTGATATGTATATGTAAGGTGTTGTACT
TACACTGAAGTCTTCATGGTTGATATGTATATGTAAGGTGTTGTACTTAC
ACTGAAGTCTTCATGGTTGATATGTATATGTAAGGTGTTGTACTTACACT
GAAGTCTTCATGGTTGATATGTATATGTAAGGTGTTGTACTTACACTGAA
GTCTTCATGGTTGATATGTATATGTAAGGTGTTGTACTTACACTGAAGTC
TTCATGGTTGATATGTATATGTAAGGTGTTGTACTTACACTGAAGTCTTC
ATGGTTGATATGTATATGTAAGGTGTTGTACTTACACTGAAGTCTTCATG
GTTGATATGTATATGTAAGGTGTTGTACTTACACTGAAGTCTTCATGGTT
GATATGTATATGTAAGGTGTTGTACTTACACTGAAGTCTTCATGGTTGAT
ATGTATATGTAAGGTGTTGTACTTACACTGAAGTCTTCATGGTTGATATG
TATATGTAAGGTGTTGTACTTACACTGAAGTCTTCATGGTTGATATGTAT
ATGTAAGGTGTTGTACTTACACTGAAGTCTTCATGGTTGATATGTATATG
TAAGGTGTTGTACTTACACTGAAGTCTTCATGGTTGATATGTATATGTAA
GGTGTTGTACTTACACTGAAGTCTTCATGGTTGATATGTATATGTAAGGT
GTTGTACTTACACTGAAGTCTTCATGGTTGATATGTATATGTAAGGTGTT
GTACTTACACTGAAGTCTTCATGGTTGATATGTATATGTAAGGTGTTGTA
CTTACACTGAAGTCTTCATGGTTGATATGTATATGTAAGGTGTTGTACTT
ACACTGAAGTCTTCATGGTTGATATGTATATGTAAGGTGTTGTACTTACA
CTGAAGTCTTCATGGTTGATATGTATATGTAAGGTGTTGTACTTACACTG
AAGTCTTCATGGTTGATATGTATATGTAAGGTGTTGTACTTACACTGAAG
TCTTCATGGTTGATATGTATATGTAAGGTGTTGTACTTACACTGAAGTCT
TCATGGTTGATATGTATATGTAAGGTGTTGTACTTACACTGAAGTCTTCA
TGGTTGATATGTATATGTAAGGTGTTGTACTTACACTGAAGTCTTCATGG
TTGATATGTATATGTAAGGTGTTGTACTTACACTGAAGTCTTCATGGTTG
ATATGTATATGTAAGGTGTTGTACTTACACTGAAGTCTTCATGGTTGATA
TGTATATGTAAGGTGTTGTACTTACACTGAAGTCTTCATGGTTGATATGT
ATATGTAAGGTGTTGTACTTACACTGAAGTCTTCATGGTTGATATGTATA
TGTAAGGTGTTGTACTTACACTGAAGTCTTCATGGTTGATATGTATATGT
AAGGTGTTGTACTTACACTGAAGTCTTCATGGTTGATATGTATATGTAAG
GTGTTGTACTTACACTGAAGTCTTCATGGTTGATATGTATATGTAAGGTG
TTGTACTTACACTGAAGTCTTCATGGTTGATATGTATATGTAAGGTGTTG
TACTTACACTGAAGTCTTCATGGTTGATATGTATATGTAAGGTGTTGTAC
TTACACTGAAGTCTTCATGGTTGATATGTATATGTAAGGTGTTGTACTTA
CACTGAAGTCTTCATGGTTGATATGTATATGTAAGGTGTTGTACTTACAC
TGAAGTCTTCATGGTTGATATGTATATGTAAGGTGTTGTACTTACACTGA
AGTCTTCATGGTTGATATGTATATGTAAGGTGTTGTACTTACACTGAAGT
CTTCATGGTTGATATGTATATGTAAGGTGTTGTACTTACACTGAAGTCTT
CATGGTTGATATGTATATGTAAGGTGTTGTACTTACACTGAAGTCTTCAT
GGTTGATATGTATATGTAAGGTGTTGTACTTACACTGAAGTCTTCATGGT
TGATATGTATATGTAAGGTGTTGTACTTACACTGAAGTCTTCATGGTTGA
TATGTATATGTAAGGTGTTGTACTTACACTGAAGTCTTCATGGTTGATAT
GTATATGTAAGGTGTTGTACTTACACTGAAGTCTTCATGGTTGATATGTA
TATGTAAGGTGTTGTACTTACACTGAAGTCTTCATGGTTGATATGTATAT
GTAAGGTGTTGTACTTACACTGAAGTCTTCATGGTTGATATGTATATGTA
AGGTGTTGTACTTACACTGAAGTCTTCATGGTTGATATGTATATGTAAGG
TGTTGTACTTACACTGAAGTCTTCATGGTTGATATGTATATGTAAGGTGT
TGTACTTACACTGAAGTCTTCATGGTTGATATGTATATGTAAGGTGTTGT
ACTTACACTGAAGTCTTCATGGTTGATATGTATATGTAAGGTGTTGTACT
TACACTGAAGTCTTCATGGTTGATATGTATATGTAAGGTGTTGTACTTAC
ACTGAAGTCTTCATGGTTGATATGTATATGTAAGGTGTTGTACTTACACT
GAAGTCTTCATGGTTGATATGTATATGTAAGGTGTTGTACTTACACTGAA
GTCTTCATGGTTGATATGTATATGTAAGGTGTTGTACTTACACTGAAGTC
TTCATGGTTGATATGTATATGTAAGGTGTTGTACTTACACTGAAGTCTTC
ATGGTTGATATGTATATGTAAGGTGTTGTACTTACACTGAAGTCTTCATG
GTTGATATGTATATGTAAGGTGTTGTACTTACACTGAAGTCTTCATGGTT
GATATGTATATGTAAGGTGTTGTACTTACACTGAAGTCTTCATGGTTGAT
ATGTATATGTAAGGTGTTGTACTTACACTGAAGTCTTCATGGTTGATATG
TATATGTAAGGTGTTGTACTTACACTGAAGTCTTCATGGTTGATATGTAT
ATGTAAGGTGTTGTACTTACACTGAAGTCTTCATGGTTGATATGTATATG
TAAGGTGTTGTACTTACACTGAAGTCTTCATGGTTGATATGTATATGTAA
GGTGTTGTACTTACACTGAAGTCTTCATGGTTGATATGTATATGTAAGGT
GTTGTACTTACACTGAAGTCTTCATGGTTGATATGTATATGTAAGGTGTT
GTACTTACACTGAAGTCTTCATGGTTGATATGTATATGTAAGGTGTTGTA
CTTACACTGAAGTCTTCATGGTTGATATGTATATGTAAGGTGTTGTACTT
ACACTGAAGTCTTCATGGTTGATATGTATATGTAAGGTGTTGTACTTACA
CTGAAGTCTTCATGGTTGATATGTATATGTAAGGTGTTGTACTTACACTG
AAGTCTTCATGGTTGATATGTATATGTAAGGTGTTGTACTTACACTGAAG
TCTTCATGGTTGATATGTATATGTAAGGTGTTGTACTTACACTGAAGTCT
TCATGGTTGATATGTATATGTAAGGTGTTGTACTTACACTGAAGTCTTCA
TGGTTGATATGTATATGTAAGGTGTTGTACTTACACTGAAGTCCTCATGG
TTGATATGTATGGCGAAGGGCTGCCCCGCCTCCTCTGTAGGCAGAATGGT
ACAGTCCCCCAGGGGGATCACTCCCTGCAGCACATATAAGGGGTGTGAAA
TCGCATTAGCAGCTGAGCTAATCTGTGAGACAGGCGAGGAGTCGGGTTAC
ATTGGGGTGAGGTTGCCTAAGTGGTCAGCTATGCCGGGTGGGATGGTAGC
GACAGCTGAC Coding sequence (CDS) from alignment at Sc0000031:208839..215048+ >transcript:BL83746_cuf0 ID=transcript:BL83746_cuf0|Name=transcript:BL83746_cuf0|organism=Branchiostoma lanceolatum|type=CDS|length=888bp|location=Sequence derived from alignment at Sc0000031:208839..215048+ (Branchiostoma lanceolatum)
GGCGTTGTGGGGAGGGGGAAGGAACAGATGGTGGAAGAGCAACAGAAACA
GAGGGAGAAACCGCTTCCCATGGAGGAGGCTGAAGAACACCCACATCTGA
ACCAGTCAAGGTCAACGGTTACGGAGAAGAGACCCAAGGGCGTTCCTCGT
TCCTTGTTGCGTAATGACAGGTGCCCGGCGTGTTTCGGAGATAACCTCTG
CGAGGAGTTTGAAGATGGCATGATCGAGCTAGGGTCAGTGGTCACCAGCG
GGAAGGTCGTGACCTACTCTGGAACCTGGGACAAGGTCAAGTTGACCGTT
ACCCAGTGTGCATCAGAGGAACGCCTGGAGCAGTTCGAAAAGTTTGTCTG
TCGGAACCTGAGTAAGAACGCGACCTCGTGTGACCCCGGGGAGGTGCTCC
TGAAGCAGGACCTGAAGGAACTGCTACAGGCGAGACATCTCAAGAAATCA
CTCGAGGTCTTACATCCCAACACATCTTCTCTAGCTGCGACCACCTGCGT
GTCCAAACCGCTCCTCAAGATGCTGCAGAAGACGTTTGATGAGAACGGCA
ACAAGCGGCTGAACCGGTTGGAACAGGCGCACCTGTACTCTGCCCTGCAC
ACCTGCCCACACCTCGCACTGCTCAAGGCCTTCCCAAGGAAAAAACTCCC
CTTCCCAGCGTTCCTCGGGGCCTGCGGGAACCTCGTCGCCATGGAGACCA
CGGGGAAGCCGCTCCCGGTGTACCTCAAGGTCAAGGTCTCCTGGCAGGTC
AGAGCCAACCTATCGCTGCAGCTCTTACAGATGCTGGACGACTTCCAGAA
CAAGGATCCTGATTGGCTGCTGATGGCTGGTGACGTGAGTATGGAAAACT
TCACCGTCTCGCCTGACGGACAGTTGATCNTCGCCTGA
Gene-mRNA-Prot
This mRNA is a part of the following gene feature(s):
The following exon feature(s) are a part of this mRNA:
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
Position
The following features are aligned
| Aligned Feature | Feature Type | Alignment Location |
|---|
| Sc0000031 | genome | Sc0000031:208839..215048 + |
Properties
| Property Name | Value |
|---|
| Transcript id | BL83746_cuf0 |
| Biotype | protein_coding |
|
