transcript:BL81685_cuf0 (mRNA) - B. lanceolatum

Overview
Nametranscript:BL81685_cuf0
Unique Nametranscript:BL81685_cuf0
TypemRNA
OrganismBranchiostoma lanceolatum (Amphioxus)



Sequence
The following sequences are available for this feature:

protein sequence of transcript:BL81685_cuf0

>transcript:BL81685_cuf0-protein ID=transcript:BL81685_cuf0-protein|Name=transcript:BL81685_cuf0|organism=Branchiostoma lanceolatum|type=polypeptide|length=138bp
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Run BLAST on NCBI

mRNA from alignment at Sc0000352:42735..81720+

Legend: exonfive_prime_UTRpolypeptideCDSthree_prime_UTR
Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.
>transcript:BL81685_cuf0 ID=transcript:BL81685_cuf0|Name=transcript:BL81685_cuf0|organism=Branchiostoma lanceolatum|type=mRNA|length=38986bp|location=Sequence derived from alignment at Sc0000352:42735..81720+ (Branchiostoma lanceolatum)
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CTAAAAACACGTGCCTGCAAATGAAGCCCTGATTGTCAATATTAACTACA ATCGTAGGACAAGATATTAGGCCGTTATATCTTCCTTTTTGCCCCTCCCG TGTCAGTAGATCGACGTTAAATGGCTACTTTGCATTGCACGGTGGTCAAA TTCGTGCTCAGAAACTCCCATGTCCGCTGTTCCACGATGTTCGAAATGAC GTAATCGAATCCGAACGCGCGTTCGATTCGGGGTCACCTGCGGTCATTGG AAGTTCTTACTGTAAATCTGCGCGGCCGGGCCCCTTTCCCCAATTCAGGA AAAAAATTGCGTTCGTCGCAAATATTACCTGTTTTCCGGAGAGTATATCC ATACTGACACTTTGTTGAGGACATCTAACATGTAACGAAGCAACTGGCGT CATTTTTTGTGGCATTGAATATTAGAAGGATTGTTTACGGCGGTGCTAAT TATCCCCTCCCCCTATTCGTACGGCATGACATGCGTTCAAACATCGTAAA GGTACGGCTCCAAGAAACATCCACCTTACCTCATTAACGATTCAAAATGA CCGTAATGGTTTTCCCGAGGTTTGTGTTTTTGGGATTTTTGAAAAATGTC CTTGATTTTGAATTATGGGTGATTCAGTGCGAAAAATGTCAAAAAATGCC TTTTTTTCACAGATTTGTCGATAATCACAATACTTAGAATAAGAAATTTA AAAGTCCCAAAAACACAAAGTTTTGTTTTGTTCCTGGTCGACGAAAAATA TGAAGATAAGAGATATTCATTGACATTTAAAGCCAGGCCTTTGCGATGTG TGCATGAAATAACCGTCTCCCTAAAACCTGAAAATAATCGTGTTTGGGAG CAAAATATAGAAAAATCAGCCATTCAGCTAAAATTGACGACATTCAAACT TTGCAAAATCGCTAATTTCATTTTATTTTTACAAAATTTTCCCGTCCCTA 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ATAGGGGAGTCATACTTTTATATCTCACCCATACTATGGTTGAAACATGT TGTTTTTGGTCATGTCCATTTGTTTAAGTGGATGTAGTGTTAGACTGGTC CATATTGTGTGGAGGTAACACTGGAAGAGTCCATTCCTGCATGGAGGGAC TAATTGTTTTTAAACTCAATTTTTTTTGGTGTGTGTGTGTTTGTATTTTA TTTGGCAAAGCTGTTTGATGTGTGGGGAAACAATGTACTGGGGGGGGGGG GGCTCCCGGTCACTCTCGCTAGGTCTTGTTGGCGATTTTCTGAACACCGA GTGGCATTGGCCGGAGAGTTCCCTTGCAGGGCGTGTGCGGGTTTTCGGCT GACTCGCGCTCAGTGTTTTGCTGACTCTACTCCGGGTCGGCGGGCGCAGG GCAGCGTTGGTCGGAGATTGTCATGTGTGGTGGGTGTTTCAATGGAAAAC AGTGTACACATACGGACTTTTCGGTCATTTGTGCTCGTGGTTTGTTGCGT TCTCCATCGTGCAAACTTTGAGTAGCACCGACCGGAGGGTCCGAGTGTGT GACGTGTTTTAATTACGGTGAAACGGCACCGTGTGTATGTGACGAGCTGT GACACAAAACCTTAGGAATGTGTCGGTTGTGTGTTCATATTAGGCGGTGG ACATCCAAATGGAGTTCAACTTACTCCGACAACAGATAGAAAGGCTGCAG GGCAGGTCCATTGAAGGCATCAAAGACGAGATCCTGCAGCTGGCAGCCCG GCCTCTTCCAGCCTTCGATCAAAATCGGGCGGTGTCTCTGTTGCAGACGC TGGCGAGCCAGGCACGGATGCAAGCGCACCCAAAGGCGGAGGAGTTCCGC TACAGCCTACAACAAGTGCGGCCCCTGGCCCACCTCCCCCGATTTAAGGA CATTTTGCAGGATGTTTTGGGACCCCCAATCCCGAAACAGATAAATAAAA 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Coding sequence (CDS) from alignment at Sc0000352:42735..81720+

>transcript:BL81685_cuf0 ID=transcript:BL81685_cuf0|Name=transcript:BL81685_cuf0|organism=Branchiostoma lanceolatum|type=CDS|length=834bp|location=Sequence derived from alignment at Sc0000352:42735..81720+ (Branchiostoma lanceolatum)
ATGGGAATTTCTATCTGTGCGGCCACCATTCCTGGCTTTGCTGGGCCCGC
GGTGGTCGGAATACTCACAAAACATGCGGCGGTGGACATCCAAATGGAGT
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CGGCCTCTTCCAGCCTTCGATCAAAATCGGGCGGTGTCTCTGTTGCAGAC
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Gene-mRNA-Prot
This mRNA is a part of the following gene feature(s):
Feature NameUnique NameSpeciesType
gene:BL81685gene:BL81685Branchiostoma lanceolatumgene
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
Feature NameUnique NameSpeciesType
transcript:BL81685_cuf0transcript:BL81685_cuf0-proteinBranchiostoma lanceolatumpolypeptide
The following exon feature(s) are a part of this mRNA:
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BL81685_cuf0-E4BL81685_cuf0-E4-1564476830-445395Branchiostoma lanceolatumexon
Position
The following features are aligned
Aligned FeatureFeature TypeAlignment Location
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Properties
Property NameValue
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Biotypeprotein_coding