transcript:BL81483_cuf1 (mRNA) - B. lanceolatum

Overview
Nametranscript:BL81483_cuf1
Unique Nametranscript:BL81483_cuf1
TypemRNA
OrganismBranchiostoma lanceolatum (Amphioxus)



Sequence
The following sequences are available for this feature:

protein sequence of transcript:BL81483_cuf1

>transcript:BL81483_cuf1-protein ID=transcript:BL81483_cuf1-protein|Name=transcript:BL81483_cuf1|organism=Branchiostoma lanceolatum|type=polypeptide|length=110bp
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LSQLPPPRPA
Run BLAST on NCBI

mRNA from alignment at Sc0000006:6330917..6388576-

Legend: five_prime_UTRexonpolypeptideCDSthree_prime_UTR
Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.
>transcript:BL81483_cuf1 ID=transcript:BL81483_cuf1|Name=transcript:BL81483_cuf1|organism=Branchiostoma lanceolatum|type=mRNA|length=57660bp|location=Sequence derived from alignment at Sc0000006:6330917..6388576- (Branchiostoma lanceolatum)
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CCAAAAGGGCAGTTATACTCCAGGTATACATGTACAGAAGCTGGTGTGTT ACACTATATGACGGTCATGCCGGCTGTACTGTTAGGCCACACCAATTTAT TTTCTTGGTTAACGGAATAGAAATGAAAAATATAAAAAATGCTAGATTGG AAAAACAACATGAAAACAGAAGAATGTTTTTACTTTGGTGCACACAATTT TGGGGAGTGAACAGGGTCAGGTGCAAGTTTTCACCCCAGCCTTCTGTTTT AATGATTTTTTTTTGCTAAAGTTAAAAATAAAAATCCGTTAACCAAGAAA TTAAATTGGTGTGGCCTTACTGAAACTGGTGAGTTACACCGAGGAGTGGT TATGCTGGCTTGCATGAATGCATGAACACCTGTCCCAGCCAGCCTGGTCA CCAGCGGGAAACATACATGATTACTCCACAGACGGGCGTTATTGGGCTCT GCAGCCGTGCAGCACGTAATATAGGCGCCGGTTCAGGGGGCACGCTTCTG TAATGGCCGCCCACGTTTTATTGGCGCTGATCAGAATAATATAACACGCA TTTCACAGACCCAACGTGGGACAACTCTCGTTCATCTATTGTCATTTCAT GAGCTAGGTATATAAAACAGATGGGTCACTGGGTCTGGAGCTGTTGTACA TGTCTTGTATGCATAGTATTGATCTATTCATACTGTCTCATCTTTTTCTG CATTGGCCTCTTTATATCTTTAATTTGGTAAGATCTAACGCAAACATTTT TCACAAGCCACAATGTATCATATTTGTACGTGTAAGTTGATGTGCTAATG TTATGCCAAAGCTGGGGTATATTCTTTTAGATTAGAAGCAGGATCTAAAC AGACGTGACCCAAATAGTTGAAACTCCTGAGGCCTTAAGCTTATTCCAGT CCATTTATTGATCATTTTGGCCACACCAATTTTATTTGTTGATTCTCTGA 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Coding sequence (CDS) from alignment at Sc0000006:6330917..6388576-

>transcript:BL81483_cuf1 ID=transcript:BL81483_cuf1|Name=transcript:BL81483_cuf1|organism=Branchiostoma lanceolatum|type=CDS|length=1320bp|location=Sequence derived from alignment at Sc0000006:6330917..6388576- (Branchiostoma lanceolatum)
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GGATCGCCGGCCGACTACAGTCGCCAGATCCATGTGGGGGATGTGATCCT
GGAAGTGGATGGCAGACCGGTCCATGGGCTCTCCAAAGATGAAGTTCTAA
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TCGCCCGGCCATGGCGGGCTGGGTGAAAGTTGTGAAGCTGGAGCGGCCGG
GAGGGACCGGGATTTACGGCTTCTCGGTCATCGGAGGGCCGGGAACCGAG
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TCGCCAGATCCATGTGGGGGATGTGATCCTGGAAGTGGATGGCAGACCGG
TCCATGGGCTCTCCAAAGATGAAGTTCTAAACCTGGTACAGAATTCCAAT
GAAGATGTTGTCTTGGCGTTACGAGAGGACCCTGATGTAAGAGACAAGGC
TGAGGAACTCCTGTCCCAGCTGCCCCCCCCTCGCCCGGCCATGGCGGGCT
GGGTGAAAGTTGTGAAGCTGGAGCGGCCGGGAGGGACCGGGATTTACGGC
TTCTCGGTCATCGGAGGGCCGGGAACCGAGGTGCCGCTGTGCATCGGCGC
CGTGATAGAGGGATCGCCGGCCGACTACAGTCGCCAGATCCATGTGGGGG
ATGTGATCCTGGAAGTGGATGGCAGACCGGTCCATGGGCTCTCCAAAGAT
GAAGTTCTAAACCTGGTACAGAATTCCAATGAAGATGTTGTCTTGGCGTT
ACGAGAGGACCCTGATGTAAGAGACAAGGCTGAGGAACTCCTGTCCCAGC
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Gene-mRNA-Prot
This mRNA is a part of the following gene feature(s):
Feature NameUnique NameSpeciesType
gene:BL81483gene:BL81483Branchiostoma lanceolatumgene
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
Feature NameUnique NameSpeciesType
transcript:BL81483_cuf1transcript:BL81483_cuf1-proteinBranchiostoma lanceolatumpolypeptide
The following exon feature(s) are a part of this mRNA:
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BL81483_cuf1-E3BL81483_cuf1-E3-1564476830-71740Branchiostoma lanceolatumexon
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Position
The following features are aligned
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Properties
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Biotypeprotein_coding