|
|
Sequence
The following sequences are available for this feature:
protein sequence of transcript:BL76335_cuf0 >transcript:BL76335_cuf0-protein ID=transcript:BL76335_cuf0-protein|Name=transcript:BL76335_cuf0|organism=Branchiostoma lanceolatum|type=polypeptide|length=164bp
LRSQLRSQLRSQLRSQLRSQLRSQLRSQLRSQLRSQLRSQLRSQLRSQLR
SQLRSQLRSQLRSQLRSQLRSQLRSQLRSQLRSQLRSQLRSQLRSQLRSQ
LRSQLRSQLRSQLRSQLRSQLRSQLRSQLRSQLRSQLRSQLRSQLRGPVK
VPVKGRPGGPMDRK Run BLAST on NCBI mRNA from alignment at xpSc0040787:541..1978+ Legend: five_prime_UTRexonpolypeptideCDSthree_prime_UTR Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below. >transcript:BL76335_cuf0 ID=transcript:BL76335_cuf0|Name=transcript:BL76335_cuf0|organism=Branchiostoma lanceolatum|type=mRNA|length=1438bp|location=Sequence derived from alignment at xpSc0040787:541..1978+ (Branchiostoma lanceolatum)
GTTAAGGTCCCAGTTAAGGTCCCAGTTAAGGTCTCAGTTAAGGTCCCAGT
TAAGGTCCCAGTTAAGGTCCCAGTTAAGGTCCCAGTTAAGGTCCCAGTTA
AGGTCCCAGTTAAGGTCCCAGTTAAGGTCCCAGTTAAGGTCCCAGTTAAG
GTCCCAGTTAAGGTCCCAGTTAAGGTCCCAGTTAAGGTCCCAGTTAAGGT
CCCAGTTAAGGTCCCAGTTAAGGTCCCAGTTAAGGTCCCAGTTAAGGTCC
CAGTTAAGGTCCCAGTTAAGGTCCCAGTTAAGGTCCCAGTTAAGGTCCCA
GTTAAGGTCCCAGTTAAGGTCCCAGTTAAGGTCCCAGTTAAGGTCCCAGT
TAAGGTCCCAGTTAAGGTCCCAGTTAAGGTCCCAGTTAAGGTCCCAGTTA
AGGTCCCAGTTAAGGTCCCAGTTAAGGTCCCAGTTAAGAGGCCCAGTTAA
GGTCCCAGTTAAAGGCCGGCCTGGCGGTCCCATGGATCGCAAATAATGAG
AATTTAATTGATACAGGGTGGCAGGCCTCTGGTCAGCCCAGACCCTGCCA
GAGGGTGGGCCTCCCGGTGCGCGGGGAGCGACTGCAGGCCTAATTTGTTA
ATCGTGCGTGAAATCACCATGCTAGTGTAAACAGTTCTACCGAGAGGGTG
CTGGTAAAGCTATGACTGCACACTAGAAGAAAATGTCTGGCTCTCTGTAT
ACAACAGTGAAATGACTACACTGTGATAATTGGGTAAGACCGCATGTGTC
ACAAATCGCATATCTATATCGTATAACAGTCATTTATTACCGACAACCCC
TGTATCGTGTACCAGCTGGCAAGCAAGTGCACAAACTTATAGTTGTATCC
TCATTCAGAATTTATTTCGATGAATATAGAAAGGACCAAAAACAGCCTAG
TACCACACGCACGGATACGTAATGTCAATCGAAGATTGCTGTGAGGACGT
CCCTCGCAAGACATACCGCGTACCGACCTGCTCGCAAATTTCGCTCCGCC
CGCCCGCCATCTTGGTTGTGCAAGGGGATTGGTACCACAGGCAAACGCAA
CGGTATCACGCTGAAGAACATCTTCTGGTAGTTGGCTAAATTATATGAAC
AACGGTGGGTTTATTTACTGAAATTATTTGTATCAAATATTTAGCGACGG
TTTTTGCCCGTTGTGCCGTATATAAAGAAGAATTAAAAAAAGATATATGG
TCCCTCTTGTTTTTTGTTGGTGGGGTCACTTAGGGGTCAAGTTGTTGTTT
TTCCTTGACAAGCTCAGTTGGGCTCTGTCGGGTTGAGAGACTTTTAGAAA
ACAACAATATCCTGTTCCCCAAATATTCCCCGATGATGACATTTTCGATG
GATTGAGGATGATTTTTGACCAAATCTCCAAACTATGAAAAGGCTGTTGT
AAATGTGGAGAATTCGATTCTTCTAAACTGTTCCTGGC Coding sequence (CDS) from alignment at xpSc0040787:541..1978+ >transcript:BL76335_cuf0 ID=transcript:BL76335_cuf0|Name=transcript:BL76335_cuf0|organism=Branchiostoma lanceolatum|type=CDS|length=495bp|location=Sequence derived from alignment at xpSc0040787:541..1978+ (Branchiostoma lanceolatum)
TTAAGGTCCCAGTTAAGGTCCCAGTTAAGGTCTCAGTTAAGGTCCCAGTT
AAGGTCCCAGTTAAGGTCCCAGTTAAGGTCCCAGTTAAGGTCCCAGTTAA
GGTCCCAGTTAAGGTCCCAGTTAAGGTCCCAGTTAAGGTCCCAGTTAAGG
TCCCAGTTAAGGTCCCAGTTAAGGTCCCAGTTAAGGTCCCAGTTAAGGTC
CCAGTTAAGGTCCCAGTTAAGGTCCCAGTTAAGGTCCCAGTTAAGGTCCC
AGTTAAGGTCCCAGTTAAGGTCCCAGTTAAGGTCCCAGTTAAGGTCCCAG
TTAAGGTCCCAGTTAAGGTCCCAGTTAAGGTCCCAGTTAAGGTCCCAGTT
AAGGTCCCAGTTAAGGTCCCAGTTAAGGTCCCAGTTAAGGTCCCAGTTAA
GGTCCCAGTTAAGGTCCCAGTTAAGGTCCCAGTTAAGAGGCCCAGTTAAG
GTCCCAGTTAAAGGCCGGCCTGGCGGTCCCATGGATCGCAAATAA
Gene-mRNA-Prot
This mRNA is a part of the following gene feature(s):
The following exon feature(s) are a part of this mRNA:
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
Position
The following features are aligned
| Aligned Feature | Feature Type | Alignment Location |
|---|
| xpSc0040787 | genome | xpSc0040787:541..1978 + |
Properties
| Property Name | Value |
|---|
| Transcript id | BL76335_cuf0 |
| Biotype | protein_coding |
|
