Blg01647.3 (mRNA) - B. lanceolatum

Overview
NameBlg01647.3
Unique NameBlg01647.3
TypemRNA
OrganismBranchiostoma lanceolatum (Amphioxus)



Sequence
The following sequences are available for this feature:

mRNA from alignment at Sc0000168:597772..622916-

Legend: exonCDSpolypeptide
Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.
>Blg01647.3 ID=Blg01647.3|Name=Blg01647.3|organism=Branchiostoma lanceolatum|type=mRNA|length=25145bp|location=Sequence derived from alignment at Sc0000168:597772..622916- (Branchiostoma lanceolatum)
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AGATGGGAATGGTTTTATTACTTATGGTAAGTGCCAAATATTTGTTTATT TCGNTTTTATTACCTATGGTAAGTGCCAAATATTTGTTTATTTCGCATAG CTTGTAAACGTCTTTCGAGCTTAACGTACCAATTTTGTACAAGGTTTGAT CCACTCACGCCAGGATGGACACCTACTCTTTTCAATTAATGTTGTGGGAT TTGAACAAATTGATCGAAGTGCGGCTCTCCGCAAACACGGAACCCACGGC TTTATATCCCAATGAAAAGGATGTCCCTGACTAAAGCTAGGTACTCATTT TACCTGATTTGAGTGTAGAAATAGGTGTAAAGTGCCTTTCCCAAGGGCAC AGCACTGGGGCCTCCCAAATTTGAACCGAGAACCTACTTGTAAGTCAAGA ACCCAAACAACAATACCACTGTTCCAAGTGTTGTATTCACTATGTAAGTT TGAGGCTAGAAAAGTTATCCTTTCAGTACTACAATTCTATAAAAGAATTG GGGTTTTTTCAGTTTCACAGTACTAGTAAATATTCATATGTTTAAAACCA GGAAAAGAATGAAAGTAGCAAAGAACAAAGACATTCTTGTGACTAAAGTC CTGAATTCTTTGCCTCAACTTTAGATGAGTTTGAAGCTTTTTCCAAAGTC CATCCGGAGTATGCAGGCCTGTTTAAGACCTACCAGGACCTGAAGCATGA AGAAGAACTGACACGTGTTGAAGAAGAGATAGAAAATGTTGAAGAGGATA GCCCTGAGTTGGAAGTATTGGGGAGTCCAGTGGAAGGCAAGAAAGAAGCT TGACATGTATCATAGTTAGTGGCTTACTGGGAAAATGTTTTGTCCCTCAG ATATTGCCACACTGTGGTTAAACCTTATGCATTAAAGGATCCTGGAAAGC AATAAGCTGCTAGTTGAGCAGCCAGGGATGAATACAATATACAATACAAC CTTCACTATTACTGGTCATTTTTCAGATTTCTATTCCATAAAAGAATTGA AGCAGTGAGAAAGTAAAACAGATCCTTCTTTTTGTAAAGGCTCTCTCTAC ATTTATCTGTACATTGCAGTTTGTACTACATGATATTTTCTTGCTTTGCA TGCTGTTTAAGGTTATGTGCAGTGCATATACATAAAGTAAATCCTAGTCT TTTAGTCCGGATGGCAGAAGAAGAAGATATATGTACATGTACATCGAGTT ACTATATGAAAAATGACTGACTAAATTGCTACTGCTGCTATTGTTGTTCA ACAGGACTTTTTGTTCTTCTTTAAATGACTGTCCCAATGTTACCTTACAA CAGTTTAACTATCAAAAGTTATTTATAGTTAACGTAAACTGCAACCAAAG TTGAGTTGAAATAAATGTAGTTAGTGGGACTACTAGCCCAATAAGACTTC TACCATTGCCATTATTCACTACAATAAGAGATAATGCATAAGCCTGCCAC ATAACAATGCAAGTTAGCCTCTACAATATTGAATCAGTTAGTAATACGCA ACTTTCACAATATAAGCAGGAATAATAAATCTTTTGATATTAAACTGGAG CAACTTGCTTAAAATTATGGGATAGAATAGAATGAATACATATTTTGCTT AAGAAGTCCTTTTTTTAGAATACAATGTACATGATGATGAGGATAAACAT GCATGTATTAGGCTCATTTTGGGAGGGCAGACCACTATCAGAAAGCCTTA AGTTTTATTATTAAAGTAATTCTGCTTGATTAGCTGTTCCGCTTATGATT TTGCCGAGAGAAACAGTGTAAATGTTCTTGGCAGAGGACAAATACAGGAA TGAGCTTTCACTCTCATTACATTGTTGTGACCAAACGAGGAGGAAACGTG CCAGTATGTAAGCTGCTCATTATCAGATGGATGATGATGCAACAAGTCTG TCTAGTTTGTTTTAACCTTTTCCCTGCTGTCTTACTCTGTAACCGATGGG GAATAGGATGCCAAACAGCTACTCAGTGTGCTAACGGTAAAAGAAAAGAT TTCTATGTTGTTTTTGATATGCTGCTTTTTGCAAAGATATGCAGTAACCT TTTCCTTGAAGTTGCGATTTTGCATTGCAGAACCTTTGGTAATATATATT TCATTGAAATGTGTTTGATGAAATGTATGCAAAGGTTGCTTTAAGGGGCA ATTGGTGGCTAATATTTTGGCTGGTATTCATTGTATCCAAAGTAGGGTAC TTAAATGTTAAAGAGTGTGCAAGATGCTTGCCATATACTGACATCTACAG TAGCTTCATATCATAAGCTTTGGTGGCAGCCACTTGTGTTATTATCGTTG GTGCTATACGCCTTAGCAATGTTGACAACCAACACTTATGCATGCTTATG TTTGCAGCCGTCAAGCCATATACAGCGCCTGCAATGTTTTTTATTTCATT TGTTGCACGTTATGGTCTTTACTTTAGAGGGTGTTATCATTATGGATTGA TCACAACACTGATAATCAGGGTGAAAACTTGTTTTAGAAACACCACACTT TAGTAATGCACTCACTTTGTTGCATATTTAGTTCAATGTTTTTATATAAG ATGTGATTGTATATATGCATGTAATGTACTTTTGTACTTTTATTATGTAT ATAATGAGTTTCTAAGCTTAGGTAATTTTAATTAGCAAGCCACATACAAT GAACATGGTTGTGTAATATATTTTTAAATGGATGCATTGTACTGCTAAGA ATATATTTCATATCTGGGTTAATCGGAGTTAAGTTTGAGGACTAAGGTAT TATGAATTGCACTATTTCATACACAGCATATTGTATTAATTTTTTAAAAG TTAACTTGTATTTACAGCAATTTTCATGGTTTCTAGATGTTTGTCGCTGA 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Coding sequence (CDS) from alignment at Sc0000168:597772..622916-

>Blg01647.3 ID=Blg01647.3|Name=Blg01647.3|organism=Branchiostoma lanceolatum|type=CDS|length=912bp|location=Sequence derived from alignment at Sc0000168:597772..622916- (Branchiostoma lanceolatum)
ATGCCTGTACAGCCAGTAGCCCTCAAATACCCAAACAAACTGGACACGTT
TACATGGACGTGGCAGGGGCCTGGAGGATTGAAGATCCTTTGGTATACAT
TATGTCAGTTCCACAACAGGCTGGAAGTGGAGTTTCTGCCCGTCTATCAT
CCAAGTGAAGAGGAGAAAAAAAATGCTAGGCTATATGCAGCCAACGTACG
AGCTAAGATTGCAGCTGTCCTGAATATCCCCACCACTGACCACACGTTTG
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GCAGGATTGGTTGAGTTCCAGAAGCTCCGGGAAAAGCTGGGCCTTAAACT
GGAGGACATGCGCCAACTACTGAAGCAGTACAGCAATATTGCTGAGAAGG
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TGGAAGGATTGACTTCAGGGAGTATGTCATTGGCCTGTCTGTGGTGTCCC
AACCTGCTAACACAGAGGAAACCTTACAGATGGCTTTTAAGATGTTTGAC
ACAGAGGGCAATGGTAAGATCACAGAAGACAGCCTGGCAGCAATTCTGCG
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TTGACAAAGATGGGAATGGTTTTATTACTTATGATGAGTTTGAAGCTTTT
TCCAAAGTCCATCCGGAGTATGCAGGCCTGTTTAAGACCTACCAGGACCT
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Gene-mRNA-Prot
The following exon feature(s) are a part of this mRNA:
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Blg01647.3-exon-Sc0000168-1570713199:622255..622313Blg01647.3-exon-Sc0000168-1570713199:622255..622313Branchiostoma lanceolatumexon
Blg01647.3-exon-Sc0000168-1570713199:621781..621815Blg01647.3-exon-Sc0000168-1570713199:621781..621815Branchiostoma lanceolatumexon
Blg01647.3-exon-Sc0000168-1570713199:621134..621188Blg01647.3-exon-Sc0000168-1570713199:621134..621188Branchiostoma lanceolatumexon
Blg01647.3-exon-Sc0000168-1570713199:620763..620845Blg01647.3-exon-Sc0000168-1570713199:620763..620845Branchiostoma lanceolatumexon
Blg01647.3-exon-Sc0000168-1570713199:620353..620478Blg01647.3-exon-Sc0000168-1570713199:620353..620478Branchiostoma lanceolatumexon
Blg01647.3-exon-Sc0000168-1570713199:618803..618953Blg01647.3-exon-Sc0000168-1570713199:618803..618953Branchiostoma lanceolatumexon
Blg01647.3-exon-Sc0000168-1570713199:601612..601710Blg01647.3-exon-Sc0000168-1570713199:601612..601710Branchiostoma lanceolatumexon
Blg01647.3-exon-Sc0000168-1570713199:601041..601182Blg01647.3-exon-Sc0000168-1570713199:601041..601182Branchiostoma lanceolatumexon
Blg01647.3-exon-Sc0000168-1570713199:597772..600442Blg01647.3-exon-Sc0000168-1570713199:597772..600442Branchiostoma lanceolatumexon
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
Feature NameUnique NameSpeciesType
Blg01647.3Blg01647.3-proteinBranchiostoma lanceolatumpolypeptide
Position
The following features are aligned
Aligned FeatureFeature TypeAlignment Location
Sc0000168genomeSc0000168:597772..622916 -
Properties
Property NameValue
GeneIDBlg01647