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Sequence
The following sequences are available for this feature:
mRNA from alignment at Sc0000050:57..12675- Legend: exonpolypeptideCDS Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below. >BlTCONS00062982 ID=BlTCONS00062982|Name=BlTCONS00062982|organism=Branchiostoma lanceolatum|type=mRNA|length=12619bp|location=Sequence derived from alignment at Sc0000050:57..12675- (Branchiostoma lanceolatum)
CTTCTATTGCTTGTTAACAAATCAAGCGTGAACAACAACAGGTTAGTTCC
TCTTTTTATCGTTTCTAGAGCAAAATTCGTCATCTAAGTCCAAGTGTATT
TAGCGTGTAAGCAGTAGTGAGTCACCAATGTCTTTATCATCAAGATTGTC
AATAAAATTGGAAGTGGACTTGAAGTATTCACGAGGTTTATACCCCCAAA
ACTACTTTCATTTTGGCAGCTTCTTGCCAACATCGCCACGCCATTTAGAA
TGTTGACAGTTTTCCTATTAGAAATGTCCAAACAACTGTCATGACCTAAT
AGCGCAGGAACTTAGAGTGTGCGCAAAAATTAAAAACTCCCTAGTTCTTG
TTCTCTACCCTTCTATAATCTTACCAAATTGCCCAGGTGTATATGTGTTG
GGGGGGGGGAGGGTTTAAGAAATTTCTGCATAATATGTCACCCTCTTCAA
ATTTCAGGTTCGTTGGAAGTGAACGCGTTGCGAAAGAAGTTTAAGTCGGT
ATATCATACAGCCAGGTGTTTTGGGATTAGGAGTATGGGTAACATCACAG
GGCATCGCCAACCTTCCATGAACGCAGCGGTTGGCTTCGTCATTTTTGTC
TTGCTGACTGCGTGCATATCGGCAGAAAAAACAGGAACAGAACAAAAAAC
AGGTATGTAACTCAACCATCTCCTGTATTACAGTATGTTGTTGGATCAAA
CATTGCCTTAATATTAGCAGGGAAGCGAAAGTGGATAGTATAATTTCCCT
ACACTGTAACCCGGAATTAAATGTTTAACCTACAAGTGTCTTTGACATTG
TTAATTTTGCTCATGCCTAAATTCAAAACTTACCTTAAAACGTATAATAT
AGAAGACGATTGGGACATGGGAAGGGAACACATAGCAACTAGCAACTTTA
ACAGCAATTCAACACCGAACAAGAGTTCCACAACCTCATATCTCCATGAA
CAATTCTATTCATGCAAATGACTTACACATTTGCATAATATATGCTTGGT
CATAAACTCTAACTTACACATGTTGCAATATTGGCAGTCCTATAATTTTC
CAATTAGATGAATTATGGTGTTTTTGCATTAATTATGCAAACTAGGAATT
CATTTGTATAATTAGTATCTGTTGATGCTCCACTTTCCATAAACTACATT
ACGTTACATGTATTTGAGTGTGATAATGGAAAACACTGCAAATATAGATT
TTCCTCATTAGCTATGCAAATTAAGTCCCAATTAGCATAATTTGCACTTC
ATTGTTTATATCTCTATCTAAGCTACCTGCATACTAAATATCATGGAAAT
CCGTTGTTCCTTTGTTCAGTTATTCTCCTTAGAAGATTTTCACAAAAACG
CCCCTGCAGTTCCAGAGGAAGCTGCTAGGAGGCCCAAACCTACACCACTT
TTTTATTACATTACAAGCTATCTGCCACCCAAAAATAAAGACCACAGCAC
GTCCAGGTCTAAAGATACAAAAATTGAAGTTCTGCTGCAGTACCAAGGTC
ACATACCAGGGGCCAAAATCGACCTTGAACTTTGGCTTCACAACACCTGC
CCACATACCAAATATCATTGTAATCCATCAAGAGGTTCTTGAGTTATGCT
GACTACAGTAGTGCGGAAACACAAACAGACAAACAAACAAACACACACAC
AGACACACCCAAAACTATATCTCCATTTTTCATGGAGATAATAAAGACTT
GGCACCAATGTCTGACACAAAACAATGTTTATAGTCCTACAGGAATGCTT
CGACGTTGTAGTGTACAAAATGAGCGCTGACTGGAAAAGCCTGGGCTACG
TCCTGGGGCTTTCACACAACCACATTGAAGGGATTGGCAGTCTTCTCGAC
CCCGACACGTGCTGCCGGGCAGTCCTGGACAAGTGGCGCGAAATCAGAGG
GAAAGAAGCAACAAAAGCCAACCTTATAAAGGCTATCAGAAGTATCCATC
GCGAGGATGTCGCAGAACGTCTTGAAGGTACATTTCGCAATACTAGCGTG
AGTAGCGTCACAGAAATGTAGCTCTCACTCAGAATGTACAAATCTACAAC
ATTTGCAAACCTCTGTAAAATCGCAATTAGTGCCCAATGTATCTACAACT
AGAGTTCCACGAACACGCTNATTCATGCAAATGACTTACACATTTGCATA
ATATATGCTTGGTCATAAACTCTAACTTACACATGTTGCAATATTGGCAG
TCCTATAATTTTCCAATTAGATGAATTATGGTGTTTTTGCATTAATTATG
CAAACTAGGAATTCATTTGTATAATTAGTATCTGTTGATGCTCCACTTTC
CATAAACTACATTACGTTACATGTATTTGAGTCTGATAATGGAAAACACT
GCAAATATAGATTTTCCTCATTAGCTATGCAAATTAAGTCCCAATTAGCA
TAATTTGCACTTCATTGTTTATATCTCTATCTAAGCTACCTGCATACTAA
ATATCATGGAAATCCGTTGTTCCTTTGTTCAGTTATTCTCCTTAGAAGAT
TTTCACAAAAACGCCCCTGCAGTTCCAGAGGAAGCTGCTAGGGGGCCCAA
ACCTACACCACTTCTTTATTACATCACAAGCTATCTGCCACCCAAAAATC
AAGACCACAGCACGTCCAGGTCAAAAGATACAAAAATTGAAGTTCTGCTG
CAGTACCAAGGTCACATACCAGGGGGCCCAAAATCGACCTTGANNNNNNN
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NNNNNAAAGATACAAAAATTGAAGTTCTGCTGCAGTACCAAGGTCACATA
CCAGGGGCCAAAATCGACCTTGAACTTTGGCTTCACAACACCTGCCCACA
TACCAAATATCATTGTAATCCATCAAGAGGTTCTTGAGTTATGCTGACTA
CAGTAGTGCGGAAACACAAACAGACAAACAAACAAACACACACACAGACA
CACCCAAAACTATATCTCCATTTTTCATGGAGATAATAAAGACTTGGCAC
CAATGTCTGACACAAAACAATGTTTATAGTCCTACAGGAATGCTTCGACG
TTGTAGTGTACAAAATGAGCGCTGACTGGAAAAGCCTGGGCTACGTCCTG
GGGCTTTCACACAACCACATTGAAGGGATTGGCAGTCTTCTCGACCCCGA
CACGTGCTGCCGGGCAGTCCTGGAGAAGTGGCGCGAAATCAGAGGGAAAG
AAGCAACAAAAGCCAACCTTATAAAGGCTATCAGAAGTATCCATCGCGAG
GATGTCGCAGAACGTCTTGAAGGTACATTTCGCAATACTAGCGTGAGTAG
CGTCACAGAAATGTAGCTCTCACTCAGAATGTACAAATCTACAACATTTG
CAAACCTCTGTAAAATCGCAATTAGTGCCCAATGTATCTACAACTAGAGT
TCCACGAACACGCTATCTTCGCCAAATAATCAAGGCTTATTATGGAGAGT
GATTAATATTTACATGCTTATCACCCCCTACAAATTTGATCATACACCAT
ACCGTTTAGAAGTTCCGGAGTGGGAGAATGAGTCCAGTCTAGATAGGGGT
AAAAATCATTTGGTGGTACAGGACTAGTATATGTGTCTAGTGTGTTGATA
TATGTTATAACTGGTCATGAAAAAAATTTGATGATGAAATGCATGGTACA
GTCAATATATATGAATAGAATGAATCTTTATTCCATATTATACACATTTT
GAAAGACAATAGTACATGTGACTTTTCCATACCTAGCAGTGGTGCAGTTT
TGATGCAGTGTACTCTCCAAGCAGAGGAGTGGGTCCGGCTGGTTTTTGAC
GTGTTTTAAGCGTTTTTGTCAGGTATCGCCAACCGTGTGTTGCACAAAAA
TGCCTAGCTAAGGCCACAGCAAGTAATTTTTTGCGATGACATCAGCGCGC
TCATTAATTTTTGCCTGATTTAAAGAAGAAAGAAATTTCATTGCCCTCCG
ACGGTGGTCAACATGCCAAAATATGTGGTAATCGTTGACAGTTTACCCTG
TGTAGTTCCTGCCTATGATGGTATGACAAGCTGTTTTCTGCATTTTTTCT
AGCAAGGACATTATATAGATAATGGGGGGGGGGGGGTTCTAGTTAATTGA
GCTGTATACACAAGGTGTTTCATCGCATATGAATACCCAGTGTAGTTGCT
CAGCAGATGATGGTACAACAAGCTCTTTTCTGCATTTGTTGTAGTTTATT
GAGTCTCACTGTAACCTTATCTTCTAGTTCCGTAATAGGAAACACAACAT
GATTTGGAAGAACGTACTAACGAAATACTAAATTGTCTATCTTGTTTGTG
TTTCAAATAAGGGTGGCTGTAGAATGTTATATTGTTTGCTGTAGTGGTAG
CTAGATGCTTGCCAAATGTAAAATCTCTGTCTTCTATTATACAAAAGAGT
CTCCACGACCGTTGACTGTGTTTACTTTTAGCTGAACCACCAGCTCTTGT
CCTGACAACTTTGATCGGCGTACTCGTCCTTGTTGGTGTCGTTTTGCCGT
GGACGTGTATGAAAAGGATCAAAGCGGCAGGTAAAAAAAGGCGCTGTTAC
GTATTTTCCAATTTAATGCAACGTTAACGATGCCATCAATATTTCTCAAG
AAATACGAAATTTTATAATCCAGCATCTACCATTCACTGTTTTCAATGCA
TGCCCGAGGAAAGTTTCTGTCCATACGTTAATTCTAAGTTTATCACAATG
GCGATAACTCTAGAACTGTATGTAACGTTATGTGACAGTTATTATGATAA
GTTATTTGCCGTAAGCAAAGAGTCAATGCATTGTTCAGTTCACATCAAAG
TACAAGATCTGTGACGATACGAATGTTAGTTTGGCATTTTCCTAACAGTT
TTTCATCACTTACAGCCTCTCAGCCTGAAAATGGCTCACCAAAGAAGCGG
GAAGACAAGTACTCGTTAGTGGAGCCACTTGTGAGAGAAATTGTAGACCA
GGGTTTTCCCAGAGGTATGGGTAGAGTGAAATATATTCTTATGTTTCCCC
CATACTATATATGGGCAATACATATTGTTTTTGTTATATTTCACTCACCG
TACCAGAGGTATGGGTAGAGTGAAATATATTGTTTCTGTGCATTATGTTT
CGCCTACGAAACATATTGTTATGTTTCGCACACGAAACATATTGTTTTTG
TCAGGTTTCTTCTCCACCTGTCATTATGTTGAGCCCATAGGTATGGGCTT
AACATATTGTTTTGGTCATGTTCTTCTCCTCCTCCTGCCAAATCTTTAAA
TGGATTCAACTTTGCCATTTTGAACCAAGAGAATTGAAATTTGGCATGGA
GGTAAAGACAGCAGATACCCCAGGCGTTTTATTTATCATTTTTTTTAAAC
AGGCCTCAAAATGATTTTTATGGAGTTTGTTGGGGGCATCTTTAGGCAAG
AATTGCATTTTGGGCTCCTGTGCCCTGGTATTACAAGCAAATGACCTGAG
ATTCGGTACAAGGTTTGACACAGATGGCACAAAGTAATCATAGTGTTTTG
TTGACAAATTCATATGAAGCCTTAAGCCCAGTAAAATGATTCAGAAATGT
TGTGCATAGGTTGAAGCTTAATTCTTACTCACATTTTTGAGTATCGGAAT
AACACTTTAACCCGTACTATTAGAACCCAGGCATAATCGATGCCGCAGGA
GGTGTTCCGCAGACATTCACACAGTCTCTGCAAAAAATCTCGCAAGCCTT
TGCAATTTAATTGCTAACTACTAGTATACGGAAGGCATGGGGAGGGAGAT
TGGCAAAGTATGTTGTATTTGCTCTCGCAAATGTTGCCTTTTTAGTCAAT
ATTTCGATTTGCCCAGGTGTTATTTTGGAACAGTCTATTTCTGCAAAGGG
AGGATTATGGGCGAAACATGCTGTATTTGCTCTGGAGCAAATGACGGCCT
TTCTAGTTTTTAAACTTATATTTATCAGGTACCGATCCAGAAGATGGACA
GTCCTTCGACGTTTCCACCATCATCCCCCGGTTTAAAGTAGGACCACAAG
GCTGCACTGTTCGAGACAGTGGAGCTACACTGGAGTTTCCCGAAGGATGT
GTTACAGAGAGGCGTTTAATCTCTGTCGAGGTATATTCTTCTGTATATAT
CTTCTTTCAAGTCCATTTAGCTATGGTACACTGCTCACACTTTAGCAGTA
GCATTCAATTTTTCCTGATCATAGTTAAATGGATTTGTCTAATAATATAC
CATACCGCTATCACGATCACTCTTCAATACACATAGCTTGAAGCCGTGCC
AGTTAACGACGACATTCGGACCAACTTCACGGCCATGTCCGCCGTCCTGA
CTGTGAAGAAGGACTTCCCACAGCGGTTCCTACGGCCGGTCACCGTCAGG
CTACCCTGGGTCTGGGCCC Coding sequence (CDS) from alignment at Sc0000050:57..12675- >BlTCONS00062982 ID=BlTCONS00062982|Name=BlTCONS00062982|organism=Branchiostoma lanceolatum|type=CDS|length=843bp|location=Sequence derived from alignment at Sc0000050:57..12675- (Branchiostoma lanceolatum)
ATGGGTAACATCACAGGGCATCGCCAACCTTCCATGAACGCAGCGGTTGG
CTTCGTCATTTTTGTCTTGCTGACTGCGTGCATATCGGCAGAAAAAACAG
GAACAGAACAAAAAACAGTCCTACAGGAATGCTTCGACGTTGTAGTGTAC
AAAATGAGCGCTGACTGGAAAAGCCTGGGCTACGTCCTGGGGCTTTCACA
CAACCACATTGAAGGGATTGGCAGTCTTCTCGACCCCGACACGTGCTGCC
GGGCAGTCCTGGAGAAGTGGCGCGAAATCAGAGGGAAAGAAGCAACAAAA
GCCAACCTTATAAAGGCTATCAGAAGTATCCATCGCGAGGATGTCGCAGA
ACGTCTTGAAGCTGAACCACCAGCTCTTGTCCTGACAACTTTGATCGGCG
TACTCGTCCTTGTTGGTGTCGTTTTGCCGTGGACGTGTATGAAAAGGATC
AAAGCGGCAGCCTCTCAGCCTGAAAATGGCTCACCAAAGAAGCGGGAAGA
CAAGTACTCGTTAGTGGAGCCACTTGTGAGAGAAATTGTAGACCAGGGTT
TTCCCAGAGGTACCGATCCAGAAGATGGACAGTCCTTCGACGTTTCCACC
ATCATCCCCCGGTTTAAAGTAGGACCACAAGGCTGCACTGTTCGAGACAG
TGGAGCTACACTGGAGTTTCCCGAAGGATGTGTTACAGAGAGGCGTTTAA
TCTCTGTCGAGCTTGAAGCCGTGCCAGTTAACGACGACATTCGGACCAAC
TTCACGGCCATGTCCGCCGTCCTGACTGTGAAGAAGGACTTCCCACAGCG
GTTCCTACGGCCGGTCACCGTCAGGCTACCCTGGGTCTGGGCC
Gene-mRNA-Prot
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
The following exon feature(s) are a part of this mRNA:
| Feature Name | Unique Name | Species | Type |
|---|
| BlTCONS00062982-exon-Sc0000050-1564993656:12635..12675 | BlTCONS00062982-exon-Sc0000050-1564993656:12635..12675 | Branchiostoma lanceolatum | exon |
| BlTCONS00062982-exon-Sc0000050-1564993656:12024..12218 | BlTCONS00062982-exon-Sc0000050-1564993656:12024..12218 | Branchiostoma lanceolatum | exon |
| BlTCONS00062982-exon-Sc0000050-1564993656:3154..3396 | BlTCONS00062982-exon-Sc0000050-1564993656:3154..3396 | Branchiostoma lanceolatum | exon |
| BlTCONS00062982-exon-Sc0000050-1564993656:1896..1994 | BlTCONS00062982-exon-Sc0000050-1564993656:1896..1994 | Branchiostoma lanceolatum | exon |
| BlTCONS00062982-exon-Sc0000050-1564993656:1462..1560 | BlTCONS00062982-exon-Sc0000050-1564993656:1462..1560 | Branchiostoma lanceolatum | exon |
| BlTCONS00062982-exon-Sc0000050-1564993656:346..497 | BlTCONS00062982-exon-Sc0000050-1564993656:346..497 | Branchiostoma lanceolatum | exon |
| BlTCONS00062982-exon-Sc0000050-1564993656:57..189 | BlTCONS00062982-exon-Sc0000050-1564993656:57..189 | Branchiostoma lanceolatum | exon |
Position
The following features are aligned
| Aligned Feature | Feature Type | Alignment Location |
|---|
| Sc0000050 | genome | Sc0000050:57..12675 - |
Properties
| Property Name | Value |
|---|
| GeneID | BlCUFF030898 |
|
