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Sequence
The following sequences are available for this feature:
mRNA from alignment at Sc0000049:1205403..1215105+ Legend: exonpolypeptideCDS Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below. >BlTCONS00062109 ID=BlTCONS00062109|Name=BlTCONS00062109|organism=Branchiostoma lanceolatum|type=mRNA|length=9703bp|location=Sequence derived from alignment at Sc0000049:1205403..1215105+ (Branchiostoma lanceolatum)
AGGCGTCATAGTTCATAGTTAACCAACGCATCTTGTCCGACAAGTTTTCC
TTAGTTGACAGCCAAGTTACACGTTGTCAGCAGTGCACCATATTCTCCCA
CATTATGGCAGGTAAGGCGTTAATTTATACACTTTACTGTGTACAACTGT
TGAAAGGTTGGTTTTTCTCCACTATTGTGGCTTGAATCTTACAAAAAATC
AAGCTCAATGTGATTTGCAGGAACTGCCATACTAGTATCAGAGCCAGTAC
AGCACGCAATCTAGTGGGTGTGGCACTAAGAATGCCATTAACAAAGAAGC
CTTACTGATTAAAACGCACTATACCTATGGCCGGCATGGATCATTGATTG
AAGCAGGCCTGCCATGACTCAGCCTAATGCAGTTATGTGCCCATTTTAGT
AGAGAAGCACAGGAGCATGCTTGGATAAGGGACAGACCAGGAAGCCTTTC
CTTAGTCTATCACTTCTACCTTGTGCGCGGGCTAGGTTTACATTGGTGCA
CTTGTACTAATAAGGCCATATCTCGATCACCTGCATCCCCCACACCCACC
CACACACGTAGAAATAGCAAAAAGATTACTCAATTGATCCATTCAATCAT
CCATCCATTCGTTCGTTTGGCATGCAGTCAACGGCAATTATTGGCATCAT
TATCATAACTGGGTGGGCCGACTACTCTCTCTTCGTAGCCAGGGGCTGAA
TTGCGGGGAGCTTACAATTGCCAGGGCTAAAAATCAACGGTCTGGAAAAG
TTGACATTCGGCGCTATCTGGGGAGACCTCAACATGACAGTAATTGCCCA
AGGTGCGGCCATAGTATTGTAGGAAAGGGCCGCTACCAGAACCATCAGAT
TTTAAGTCAACAACCTTAACCACAAGACCGCCTTCACCGCTTGAAAATTA
TCTGAGACTATATCATGAAAAGTGCTACGTACCTGGTACTTCACTACATC
CGATATCGTAATCTTAGTGTCATACCTGTACGTGTAACCTCGTCTACAGG
TCTGAAGGCACTGATTGACGGGAAGAACGAGAAGGGGTTTGCCTGCTTCA
AGGCTAACGACATAAAGGGTGTGGCTAACCTGTTCACGGAGGACGCCAAG
CTCATGCCACCAGGATCGGACACTGCACATGGCCGTGAAGGTGAGGATAT
AGCCGAATTATGGATCATATGGCTATTGCGATTTGAATCAAATCATATTG
GGAAAACTATGATTAGAGACCAGAAAATCGCCCCCTCTCTGTATCTCTTT
CTCTCTATATATTTGTATACAGGTGTGTATGTATGTATGTGTTAGCGTGT
GTGTATTTTTGTGTTTGTTTGTTTGTGTATGTAGTGCACGTGTGTGTGGG
GGGGAGCAATCTCATCTTTTTAGCCATTTATTCATTCATCTTAAAACACA
TGGGTAGTCTCTTTAGCCAAACAAAGACTGATTTCCAAGAGAGCCCATAG
AGGTACAGATAATAGAGAAATGTAATCACATAAAATAATGATCAGACGTA
AGAATACATACAGATACAAAATCAACGTGTCAAACAATAACACTGGAATC
ATTAAACAACAACAAACAAATGATCTTGAGAGGTCAAATTCCATAATATG
AACATAAGGAAATGATAATACAGAGCAGTAACATAGGAGTAATATATCAT
GTAATAAAATCAAACTTAATGAGCAAAAGTAACCAAACAAATATAATGGG
TTGTCAGTTGATGGTCAATAGGCGGTTAGTATGCTGATTTTAGTCTCTCT
TTAAAAATGTTGAGGTTTGGTGCTTGTTTAACATTCGGTTTGAGTGCGTT
GTAGGTTACGGTCGCTCTATATGCAAATGTGCGTTGATCTACATTTGATG
TGTAGCTGGGTCTGTGTAGTAGGTGTGATTGTTCAGTGTGGTAATTATGG
ATTTGGTTATTATAACTGAATGTGTTGAGTAGATAGCTGGGGGCTAATCC
ATGCTCATCGCCAAAAAGCACTTTGAGTATAATAAATTACCAAACTGTAT
TGACTGCAGGCGTAGAGAAGGCGATATCTGGTTATCGGGCGGCTCATGGT
GTGACGACTTTGAAGTTGAAATCAGAGGAAGTTGGACCAATGGGCAGTGA
CTTCACTTACGACCGAGGCACCTACACTGCAAAAGCAGAGGACGGCACCG
TGGCCGACACCGGCAAGTAAGTCAACATGTTTACGGCGTGTGTGTGCGTG
TATGTGTGTGCGTGTGAACAGCATAACTCGAGAAGTCGTCAATGAACCTT
TAAATATTTGGTATGTTGGTAGGGTTTGCAGGAGGAAATAATAAAAAAAG
AAGACCAACAAAGTGATATGTTATTCATGCAAATTAGGACCGAATTTGCA
TAATCAATGAAGAACATTTATATTTCAATCGTGCCTAATATCAGGAACTA
TCATACTCAGTACGTACGTAACTTTCTTTGAGAGGAATATAAATAATGCA
AATTATGACCTTACTTGCATAATCAATTAGAAAACTGTTTCATACGTTTG
TGGTAAATGATAACATATACGTATAAGTGACACATGAAGGTTAGATAAAG
GTGAAAGGGAAAGCTTTCTGGGTTTAATGACACAGTATTTTGCTATAAAA
AGCGTGTTGTTTCTCCAGGCTAAATGCTCTATAAAACTGCTTACGTGCTG
AGTCTAGCTCGCTCCGAACATTTCAGTGCATATCATTTTCTATTTTGAAT
CGTTCTGACGCTACACAAAAAGCGACCAAACCTGAATAACTTGTGCCTTT
CACCTCATCTTACCTATTGCAAATGTCTGCAGTGTCTCTAATGTACTAGC
AACATGCTGAAATTGTAGTCATGTTAAGAATATAACTTCAAACATTTTNN
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GTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTGTATGTGTGTGCGTGT
GAACAGCATAACTCGAGAAGTCGTCAATGAACCTTTAAATATTTGGTATG
TTGGTAGGGTTTGCAGGAGGAAATAATAAAATTGAGAAGACCAACATAGT
GATATGTTATTTATGCAAATTAGGACCGAATTTGCATAATTCATGAAGAA
CATTTATATTTCAATCGTGCCTAATATCAGGAACTATCATACTCAGTACG
TACGTAACTTTCTTTGAGAGGAATATAAATAATGCAAATTATGACCTTAC
TTGCATAATCAATTAGAAAACTGTTTCATACGTTTGTGGTAAATGATAAC
ATATACGTATAAGTGACACATGAAGGTTAGATAAAGGTGAAAGGGAAAGC
TTTCTGGGTTTAATGACACAGTATTTTGCTATAAAAAGCGTGTTGTTTCT
CCAGGCTAAATGCTCTATAAAACTGCTTACGTGCTGAGTCTAGCTCGCTC
CGAACATTTCAGTGCATATCATTTTCTATTTTGAATCGTTCTGACGCTAC
ACAAAAAGCGACCAAACCTGAATAACTTGTGCCTTTCACCTCATCTTACC
TATTGCAAATGTCTGCAGTGTCTCTAATGTACTAGCAACATGCTGAAATT
GTAGTCATGTTAAGAATATAACTTCAAACATTTTCTTTACATTTTACAGG
TACGTTATCATNCTTCAAACATTTTTCTTTACATTTTACAGGTACGTTAT
CATCTATAAGAAAGTTGGTGGAGACTGGTTAATCTACATTGACATCTTCA
ACACAAACAAAGCCTGAGGATTCTAGATCTACATTCACAAAAAAGGAAGA
GCGGCAGAGAGCTGGACGCGAAAAATGAGTCACATAGAATAGAGCAGCAT
TGGCTTTTCCGAGTCTGGCTTTAACCTCAATTATCAATATTGACTGGTCT
TGCTGAAATGAATTAGCCCGGCACCCATCCTATTCTAGTCCCGGTTCGCT
CCTCTGATCGCTTCCGAATTCCCTTGCCAGCGATCAGAAGAGCTATCCAA
AGCTAGAAAAAGATACATGTAGATACCAGACTATGATATACAATAAATGG
CGATCAATTAAGTTTCCGATTCTGGCTTGATTTTTACTGACATGTAATGC
CTAGCTAGCCCCACAACACGTTTTGCTAGTAGACAAAGCTTGCAGTAACA
TCAAAGTAATATCCTATTGGTATTCTGTGTTTGCTGGCTTTTGTAAACAC
CTCGCTGTTGCATAGTGACATTCACTTCGACCTTGTTGAAAAGCGGCCCG
TGTGGCTGAACAAGCATTCGAAAGAAAATAAAGGCTTTGACTTGACTTGA
CTT Coding sequence (CDS) from alignment at Sc0000049:1205403..1215105+ >BlTCONS00062109 ID=BlTCONS00062109|Name=BlTCONS00062109|organism=Branchiostoma lanceolatum|type=CDS|length=381bp|location=Sequence derived from alignment at Sc0000049:1205403..1215105+ (Branchiostoma lanceolatum)
ATGGCAGGTCTGAAGGCACTGATTGACGGGAAGAACGAGAAGGGGTTTGC
CTGCTTCAAGGCTAACGACATAAAGGGTGTGGCTAACCTGTTCACGGAGG
ACGCCAAGCTCATGCCACCAGGATCGGACACTGCACATGGCCGTGAAGGC
GTAGAGAAGGCGATATCTGGTTATCGGGCGGCTCATGGTGTGACGACTTT
GAAGTTGAAATCAGAGGAAGTTGGACCAATGGGCAGTGACTTCACTTACG
ACCGAGGCACCTACACTGCAAAAGCAGAGGACGGCACCGTGGCCGACACC
GGCAAGTACGTTATCATCTATAAGAAAGTTGGTGGAGACTGGTTAATCTA
CATTGACATCTTCAACACAAACAAAGCCTGA
Gene-mRNA-Prot
The following polypeptide feature(s) derives from this mRNA:
The following exon feature(s) are a part of this mRNA:
| Feature Name | Unique Name | Species | Type |
|---|
| BlTCONS00062109-exon-Sc0000049-1564993656:1205403..1205513 | BlTCONS00062109-exon-Sc0000049-1564993656:1205403..1205513 | Branchiostoma lanceolatum | exon |
| BlTCONS00062109-exon-Sc0000049-1564993656:1206402..1206542 | BlTCONS00062109-exon-Sc0000049-1564993656:1206402..1206542 | Branchiostoma lanceolatum | exon |
| BlTCONS00062109-exon-Sc0000049-1564993656:1207412..1207568 | BlTCONS00062109-exon-Sc0000049-1564993656:1207412..1207568 | Branchiostoma lanceolatum | exon |
| BlTCONS00062109-exon-Sc0000049-1564993656:1214494..1215105 | BlTCONS00062109-exon-Sc0000049-1564993656:1214494..1215105 | Branchiostoma lanceolatum | exon |
Position
The following features are aligned
| Aligned Feature | Feature Type | Alignment Location |
|---|
| Sc0000049 | genome | Sc0000049:1205403..1215105 + |
Properties
| Property Name | Value |
|---|
| GeneID | BlCUFF030609 |
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