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Sequence
The following sequences are available for this feature:
gene from alignment at Sc0000179:178768..189153+ Legend: gene Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below. >gene:BL96238 ID=gene:BL96238|Name=gene:BL96238|organism=Branchiostoma lanceolatum|type=gene|length=10386bp|location=Sequence derived from alignment at Sc0000179:178768..189153+ (Branchiostoma lanceolatum)
CTCAGCTAATATGTTTAATGTTGTGGATGTTGACTACAGGGACAGACATC
CAGATCCTGTGCCTGAAGCTGGTGGTGTCCCAGGCCTCAGCTACACCCAG
TGCAGCGCTGCTCCTGGCCTCGTGGGTCTCACAACCTTTGTTTAGTAGCC
TGGAGGTTAGTCTGCATGTTCTACTTCTACTTCTATACGTTACTCAACAA
AACCCCGCGAGGGGCATAGCGTTGAGGATAAAGTGACAGGGTNCCAGGGC
ATGCTTGACAGTTTGTACATGTATGTAACATATGAAAGAGTCTAAAAGAT
AATTCAACATTTTATACCCCTAAAAATGATCTCATTTTGGATGTTCTGCC
TACAAATTGTATATGATGGACTTGTTGTGGGGTTTTGACTACAGGGACAG
ACATCCAGATCCTGTGCTTGAAGCTGGTGGTGTCCCAGGCCTCAGCTAAT
ATGTTTAATGTTGTGAATGTTGACTACAGGGACAGACATCCAGATCCTGT
GCCTGAAGCTGGTGGTGTCCCAGGCCTCAGCTAATATGTTTAATGTTGTG
GATGTTGACTACAGGGACAGACATCCAGATCCTGTGCCTGAAGCTGGTGG
TGTCCCAGGCCTCAGCTAATATGTTTAATGTTGTGGATGTTGACTACAGG
GACAGACATCCAGATCCTGTGCCTGAAGCTGNNNNNNNNNNNNNNNNNNN
NNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNNGTGCGGTGGGTATTGCAATCAG
CTTGTGGACTGCCTTGTACATAAGAGTGAGGCGGGCAATGTGTCTGCGTT
GTTGCAGAGTGGCCCATCCTAGGGAGTGTTGTAGTGAGGTGTTACTGGCA
GTGTAGTTGTAATTACCTGTGACAAAACGTGCAGCTTTCCTCTGTACAGA
TTCTATCTTGGTGGCTAGCGTGTTGGACTGAGCATTGTGTAGTGTATGTG
GATCCCAGACTGAGGAAGCATATTCAAGTTTAGGGCGGACTAATGATGTA
TAAGCCTTCTCTCTTACCTCTTTACTTGCCCCCCTTATATTTCTCCTCAC
GAACCCCAGGGTTCTGTTGGCCTTGGTTGTGATATCGTTGATGTGTGCCT
TCCACTTGAGGTTGTGAGTGAGAATGACACCTAGGTAGGGATGTTCGTTG
TTGTGGCTTAGGGGTTCATTGAACATTGTGTACAGGAAATTTGGTGAGCT
TCTGGGCTTGTGGATGTGTAGAATAGAGCATTTTTTCACATTGAATTTCA
ACTGCCAAGTGCTTGACCATTTGCAAAGTTGGTCTAGGTCGCCTTGGAGT
ATGTATTGGTCTTGGTCAGATAGTATGGAGCGGTAAATCAAACAATCATC
TGCGAAGAGCCTCAGCTGTGATGTTATATCCTTGTTGATGTCGTTAATGT
AGATAAGAAATAACAGGGGCCCCAGAACAGTACCCTGCGGGACTCCTGAC
TTGACCTTGACGGGGTNCTGAGGATTTCAGCCTTCCCCTGTCCATCCACG
ACTAGTTCGCCGTGGTCCGACAGGGGGGCCACCCCAGAGGCAGTCTGCTT
CCTACTCTTCACGTATTGCCAAAACTTTTTGGGGTTCTCTAGCGCCTCAT
CTAGGATTTCCTTGAGGTAGTCATTGTGTGCCCTTTTAATTTTATGTTTG
GTTAGTCTACGCATCGTTTTAAAATTTTCCCAGTCCTGTTCTTCCATTGT
GCTTTTGGCCTTCTTGTAGAGTTTCTTCTTCTTCTTGATTAGGCGTTTGA
GTGCCTTGGTCACCCAGGGACAATGGTTTCTGTTTGATAGTTGTTTCTGA
GGTTTATATTTGAGAATTAGCTGTTTAAGACCCTTGACAAAATAGTTCCA
GTTTTCTTCTACTGAGAAGTTAGATGGTTCTCTATCCTTGAATTGTTTCT
CTAATTTATGTAGCCCTTCTGTGAAGGCTACTTTGTCCGTTTTCTTGTAT
ATGTATACTGTACGTGGCTTTTTCTTGTTTGGTTTCACTTTAGTTTTCAT
GCCTACCGTGACTGCATCATGGTCACTTATTCCTGGTAAGATGCCAGTGC
CAAGTCCAGGATGTTTTGCCCACGTGTCGGGGACGACACTACCTGGGACA
GGCCAGAGCTCTGCACTACCTCCAGGAACTTTTCGTTCAGTCCCATCCCA
TATTGGGGTGAGGGTTTGGCTGAAGGCGTATCTGAGCTCCAGCAAATGTC
TGGCATGTTGAAGTCCCCGAATAGTGCAATGTTAGGCGGTGAGGGTTTAT
CAACAATGTTACTCAGAGACGTCCCTAATTCATCCACATACACAAGCCCA
GAGGTAGGAGGTCTATATGCTGACCCCACACATAACGGTCTATATCCTGC
CTGTTGAATCATAGCCCATACAATTTCTGCATTTGTGGAATCCTGAACAG
GTGAAGAGACTAGGGAGGTTCTCACTGCAATGAATACCCCCCCTCCTTGG
CTATTCCAATCCTTTCTGTATATATCGTAGCCTACAGGGAATATCTCAGC
ATCAGTATGAACGGAGTCTAAATGTGACTCGTTGCCACATATGATGTCTG
GATTTTCTGTGGCTACTAGTGCCCTGAATTGTGCATTTTTGTCTACACCC
CGCAGACTCCTACAGTTCAATGAAAGTATATGTAGGTGTTGTAAAACTCC
CTTACCTTTGCCCAGGGGTTGGGTAGTGCAGGGAGAAGAAGTGGAGGTAG
GGTTGAATGAGGGAATGCTGTCATTGAGGGTATTCTGTGACAGGCGGGTT
GAAGATGGGGATTCTGCAATGAAATCAGATGACATGTGTGAGTTGTCACT
GCTATTACTATCATTCCTATCCAGCAGGGGCTCATAAAAGGACCCCTCTC
TGTCACTGACCCATGAATGAAAATCAAACAAACTGGATGTAAAACTGGGC
ATTCCACAGTTGTTGCAAATCCAAGAGCAAGAAGAATTTTGGTAGTATTT
GTACATCTTGTCGCCCACTCCGCAGCATTTGATGTGGACCCATTGGTCGC
AATTATCACATTGCATGGCTCTGTGATTAGAGGCTACTGCTCGGCCACAG
CCACCGCATGGGAACTTCACTGGGCCGGGGTTGCTGTGGACATCACCAGA
TAATAGTATGATAGCCATCAGCAAACCCTCGGGGCCCCTGAAGCCCACTG
GGGCCGGCGCTCCGTAGCCTCTGATTAATTTAGGCCTCTGTGATTTACCC
AGTAATGAGAGTCCTAGGCCCAGCAGGCTGGGGGAATGGGGCATTATCGT
GCCTCTAGACAGTAGTACATGTTGTCTTAAGGATATTTGACGGACATGCA
GTTACTCTCTCATTGGTCGAACCACTAATTGTGATGGACAGGCAGGATCA
GTCTACTAGAGCTTGGATTTTCTATCAGTTCTCACCGCGCCATCGTAGCT
TTGCTCCTTTTATGTAGATGTGTAATGGTATAGTGTTATTGAAACTTACT
ATGTGTAGGAATGACTAGAAATCGGATTTTTTTATTCATGTCAGTACGTC
TGTACCGCTGGAATGAAAGAAGGGGGAAGAGAAAGGAAAAAAATACACAC
CAAATGATAAAAAAATCATAAGAAGGTTGATGGAAAAGCACATAAAGAAA
TCTGGAGCATATAACGTTATCGTACCTACAGAACAAAATTCTACAAAATT
TTGTACAAACTTTTGTCCATGAGCTAGCCATTCTTGTCTTTTTGAGCAAA
ACTAAATTAAAAGTTTTTAAATGAATAGCCTCAAATTTTTCTCAGCACAC
AGCTATGTTATACAGAGGTGCTGATTTGTGTGTAAGAAACCAACCAAGTT
ATGTTGATGAAGGTTAGACATCCAGGTAACAATATTTAAAGACAATTCCA
TCTCAACAACTGGATAAGATAATTTATGGAGATCACTTCCAGATGTTTTG
AGTTATGTTTATCACTTTTGTTCCATGACATCGGCGTGACGTAACAGTTA
GAGCGTTGAACTCGGAATCAACAGGTCCCGAGTTCGATACTCACCATGCC
CCGACGTTGTGCCCTTGGGAAAGGAACTTAGCACTACCTTCCCGGACAGT
GTAGTAACGCCCACCGAGCCTATTTGGCTAATCTGTCAAACTGTGTGCCA
AAAAACACACTGCGGATTTGGTTGCCGATGTGCCAACATCTAGCACATTT
GCCACTGAGAACCGTTAAGCTGTCTTCAGCATCATTAGATTGATTCTATT
TTGTTTGCCATAACAGGTGCAATGCCAGTCCACACTCTATTCTTCACTCC
CTACCATCATGAAAAGTGTGACTGCTGCCAAATTCAAGGCCTTCTTGGAA
GATTGTGCCTTACAGACATTTGTAGTGGAGGAACCAGACCCAAAACTATG
CCAATCAGTGACCAATGGCCTTCTGGCTGCACTAAAAGTGCCAGACCCAC
CACAAATGGCAACCCAGCTCCTCTACCACACAGTAGAGAAGGTGTGCAAA
GAGATACGTCTCAGCAGTGGGACCCATGAAGTGCTGTCCACCATCAGTGA
GTGTCTTGCTGAACTGCCAGAGGATCTGGCAGACAAGATCACTCAAGCAC
ATGGTCAGGTACGTTTGCTCATAGAAGTAGTAGTAGTTGTAGTAGTAGTA
GTTAATAATAGTATTCGGTATTTGATTATACTGCTGCGGGGTTCCCTGAC
TCTGGGGTGGGCAGCAGTCGGCTAGTCTTCACACCATGCTTCCTATAGCG
GCTCTGTCCAACGGGTCCACACTCATCCCAACTGAAAATCCCTATAGCTT
GGAAATCTAGAGAACGATGTACTGTGCCTTAGTAAAGGATACTGCAGTTA
AGACTACACAATCAGAGGAATCCAGTATCACATCTGCTTTGACAAATTTA
GATAATATTTAACAGTCAACATGCTATTAGCAGCTCCAAACTTCTGCGCT
TATAGAATGGCTCCCCAAGTTTCCTGAATACAGTTACTGCCTTGTACAAT
AGTTTCAACCACTTTAAAGGACATATGATTTATAAAAAATTTTTCTTTCA
GGCTGATCTTCTGAAGTCTTGCTATCTGCGAGGTCACTTGGTGTCTCATG
GCCATGTGCCTATGGCATGGTACAACGCCTGCATTAATGTGGCTATAGAG
GCCATAGAGGAGATAGAGGGAGATGAGGTGATACAACACCTTACCAAAAG
CTTCTATCAGTGTACTCGGTTTAAAAGTCGGCACACAGGTGGGTCTTTTT
GTATATAATTTGAGAAATTTCTTGCTAATACATGTACAAGTAGAGTACAA
GTACAAGTAGAATTAAGAGTACATGTAGGGGTCCTTCCCGGTATGAGTGG
ATCAAACCTTACAGTCTTGTGTACGTCTTAAGTACCGTGCTTGGAGTCCT
CAACTTAATGTAACAATGAAGAAGAAGAAAACAAACTATGTATAGCATCA
TTATGGAAAACCTTACTCCTTAAGTACACCCAGTTCTGGTTGAATTGATT
TTAGCAGTCCTGAACTGTGAAGTTGCACAACATGTAACAAGCCAGTTGAT
TACCTTCACCAAGAAGGTTATGTTTTTGCTTTTGCTGTGATGGAGTGGCT
ATGGATGTAGACAGAATAAGTCAAGAAGCTGTAAGTCAGTTCATGATTTT
TAGTAGATGGGTAGGGGCCGGGGAGACAAAGGTCATATTTGAGAATGGAC
CTCCTTAAGGCTTCCTATGTTTCTGCATTGGAACTTTTATAAAAGAACTT
TTATTTATTGCACGACAATTGTACATGGTACAATATAAGTATAGAATAAA
ACTTAACATCCTAATTACTTTTACAATGAGGGCTAGCATACATTTTGATA
AAGTGTTATAATCAAGTGGGGCTAATCATAATCATTGGTTTTGGTACTTT
TTTTAATGATAAAGCAGTCGTTTGAATATTTACCTATTTTTGCATTGTGG
GGATTGTTGCATTTAAATACATACTTAAAACAGTCTGTAACATCGAGACT
CTTAAAGCTTGCTGTACTTGTTTTGAGAAATGTAAATAACTTATTACGTA
AAGCATCATATTTAGAGCATTCCATGACAAAGTGAAATTCATCTTCAATT
TCCATTTCCATTGGACAAAATGGGCGAAACCTTTGGCCAGGGGCTACAAT
ATAATATCTACCCGTCTCTATTTTCAACTTATGACTGCTGATTCTTAACT
GAGTTATCGCTTTACGAATATCAAACTTATCTATGTCTGTGTTGTCACCA
GGATAACTTGAGATGCTGTGGATAGATTGTCATGATATTTGGCAGGAGGG
TAGGGTTTGGGAAAACGAAGGTCAAGTTTGATTATGGGCCTCCTAGCTCC
TATTTTTTACACTGTTTTTTGTTTTCATTCCTTTCCCCAGGTGATGCAGC
CAGGATCCAGTGGTTGCTGGAAGTGATGGGACAGTGCAGGAACATTGCCT
ATGGGAAGATCCCACTCTTACAGGCTCAGTCAACAGGGAGTGCACTAAAC
AAGGTTAGCACTCGTCTTACACTCTCCAGTCTATGTCACTACAAAATTGT
AATTCTTCATTATTCCTGCCATATTAACAATAACTTCTCTATATCAACAC
AACTTACACAAGTATGTACTGCAACTTTTACATACGTTTCCATTTTCATA
TATTATATTATATACATGTGTATAAAGAGCCTTCCCTATACTTTATACAT
TGTGGAGGCTCTGCCAAACCATGAGATTTCCACTTTTGTGGGGGTAGCCT
CTAACCAGCTGTGAGCCAATCAGAGAATTAGTTTTACCTAAAGAAAACAC
TAAGACTCATTCCTGTGATTGGCTGACAGCTGCTTGGAGGCCAAAGCCAC
AAAAGTGGAAATCTCAGTACATGTATATTGTATAGGTCGCAGGTGAGGCT
CTGCATGGGGGAAGTTTCTAGAGTCTAGACTGACCAGAATCTTGTATCCA
GTTTGTCTGTGACTGAATGTGTGTAAAGATCATATTCATTTAATCCATTG
TTGTTTATATGTTGAAAATGAAACCCACTTTTTACTTGATTGTTCTTTAT
ATGAAGATGAGCGCCAATCGCTGTTTAAGACAATAGGATTAGACAAGAAA
TGTACAAAAACGTCAAAGCAGGACACTTTTATATACCTGATGTCATGTGA
GAACGAACATATAATAGACAAAATATGTAGTCATGTTTCCAAATGTTTCA
AGAAGAGAGAAGAAACTACTAGGTGATCAACATTAGTTTAGCAATAGTTC
TCACAATCAGTTTATCTATCTTTTAGTTTTTCAATGTTAGAATGTAGCTG
CTTATCAATTCATGTCTTGCATTATGCTTCCTATAGACCACGTGTGGTCA
TATGTACATTTAGCCCATCTGGGCAGGAATATGCAATAAAGACTATTATT
ATTATTATTGTGTTTTTTGATCAGGTGACCCAATTCCTGGTTGATGTTTT
CTGTGCTGCTGTGACATGTTGGAGCTGTGTGAGCCTGCCTCTACTGTGGG
GAGTCACTGGGACTGGCTGTCAGACAGGTATCATCAGTTTAATAATATAT
ACCTTAAGTTCCACAGTAACTCCTGATGATGTTAAGGCAATACAAAGCCT
CGAAAAATAACAGTACTGCTTAAGTTGTTTTCTGGAAATCTTGAACTGTA
TTTTTCCATGTGCAGTAAATGTCGTAGTCTCCCAAGACTCACTGACATTA
GTTGTAGTATGATCAATTGTTGCATTCAAAAATCATGACAACACTGAACT
TGATGGTTTGTTTGTTTTGTGGTTGTTTGTATAATATTTGATGCCAAATT
ATGATGTTGAATGACAAGTTGTCCTTGGTTAGTATTTTCTTTCCAACTGG
TAAATACTTGCTAATTTGACCCCACATAATTGGACAGATTATACTCATTA
CCTGACAAAGGAATGCTAAGTAAAAAGCTAATTGAACCAGGGAGACAATA
AAGCATAACTTTGGGATATGATCACAACTGTAAAGTTTGAATCTTAGAGC
TATACCGCAGCTATCACTTCAGTACCATGGAGAACCATTATCTACAACAA
CACTCAGGTCATGCCTAAAGCTTTCAAGTCCTTTAAATATGTGATTTTTT
TCAAGCTCTGAGGCCCAGATACAGTTACTCTTGCAGCTCTTGTGTGCTCT
CGTGTGTTTTCGTGAGATCTCTCCCAGTTCTCGTGTGACAATTCCGTCAT
ATGCTGCGGCGACTGTCATCATATGTGCCTAAGTGCACCTAACTGTTCTT
TTTGTAAAAATCCAGACACTGCAGAAGCATCCTCAGAAAGCAGAATGCTG
GAGACAGTGCCAGTCTTGCCGTATGCCATTCTTCAGTTGGTATCATCAGA
GCCTTGGACCCACGTTGTGGATAAGGTACAAGATCATGTCCAGCACTAGC
CTGGGTGCCATCCTCTGTTGTAACCGCTGGTTCAATCTTTTAGCATGCTA
ACCACAGAGAGCCAGCGGTCACTACGGAGGATGGTGCCCAGGCTACTTCA
GCACCAAAGGAAGCTTTTGAATATTCTGCAAAGCCAAATACAATGGGTAG
TAATATTTAATTGTTTGTGTTCTTTGTAAAAGCAGTGATGTGGTGTCGCG
GTGGCGTAGTGGCAGGGGGTTTGGCCCCAGAACCCAGAGATACCGGGTTC
GAATCCGGGGTTCCCTGCAGCTGATTTGTCCTGTTGACGTTGTGCCCTTG
GGAAAGGCACTTTACATGACTTTCCCCACTCTACTCAGGTGAAAATGAGT
ACCTAGCTTAGGTTAGGGACGTCCCTCAGATAGGACAAATGGAGGTCCAG
TGTTTGAGGAGAGCCACACCTCAAGCATGTTAAAGAACCCAGCACACTTA
TCGAAAAGAGTAGGGGTCCTTACCGGTGTGTGTGGATTATATGAATCTGT
CCGAATATGCAGGTTGTACTCTTCAGTACAAACCTGGTGTGTTACGCCTT
GATGCGGTTTACCGGGTATGCAATACAAACAAACAATCTACTTTATACTT
GTATGGTTTTCGTTGCATCAAGAAATGTGTTTTTGTTGTTTGTGGTTAGA
GGCATGTTAACGTTAATAAATGAATTACATGATGCCCCATTTTAGAATTC
ACTACTATTGTACCATCCAGCTACATGTACTAGAGTATTATGGGCATGAA
CTTTGACCTAGTCTNAATTCACCACTATTGTACCATCCAGCTACATGTAC
TAGAGTATTATGGGCATGAACTTTGACCTAGTCTTTCTTACTATTTCCAG
CTTGTTGATTGGCTGATGGAGATGTACCAGGCTCCCGTGGATCTTCCTGA
CAAGTACAAGATAGCACTGATGGGTAATCACAGCTGTCACTGTAATCAAC
AATCTTAGACAAAGTACTGTCAATGTGGAAATGTTTGCTGTCTTTGCAGT
GACCTCTTCATTTCAAACTTGAAAGTTTAACCACTGCAGAAATGCTTGTT
CTGTATCCTGCCCACCCACCCCTTTGTTTCAACTGCAAACTTAGAACCCC
TGCAAACACTCCATTTTCTTCCTACCACGAAATTGAAGGCATCCAGAGCA
TTTTATGAGGCTTGAAACTTGAATTCCAAAACTCAAATTTCTAGTCATTC
CTACACATAGTAAGTTTCAATACCATTACATATCGAAATTAAATGAGCGA
AGATACGATGTTGTTGTGTGGTGAGAACTGATAGAAAATCCAAGCCCTAA
TAGACTGATCCTGGCTGCCCATCACAATTAGCGGTTCGACCAATGAGAGA
GTGACTGCATGTCCGTTAAACATTTGCATTTTTACGTTTAAATTTGCATT
TCTACGTTTTGGCGGAGGTGGGCAAGGCTATAGTATCTACAGTATTTACA
GTAGGCGCGTGAAACTAAAAGATCACCATGTAGATCATTTTTGTGCCGTT
TCTGCACACTTTTGATAAGAGATCCGAACGCAAATGTGGTAAACAGTAGC
ATTAAATGTCAAGTTCATAAAGATTACAGCAACTAGAATATTTCCAGTTT
TCAAGTCTCATAAAATACTCTGGTTGCCTTTAAATCCCCACAAGTGTAAA
TGCAGTTACACCATTTTTGCCTGCTTTCTATGATTTTTGTAGTCATTGAT
AAAAGTTGGGGGTTTTTTTTTCAGTAAACGTATTCGATTGGCCTTTGAAA
CTCAGTAATATCCTTAAGCTTGTTGTACAGTGCAAGACTTTATGCATTAA
TTTCATTATCAGCTGTTTGTAATAGAACATACTGTCATAACTGTTTGAAG
TCAAGATGCTGATTGTTCCCATGTTTGCTTCCTGCAGGGTCTGTGCTGGC
CTTACGCCATACAACTGTATTCAAGAAGTCTTCAGTCTGGACAAGAGCAT
ACCAGATGTTGTCTGCAGTCAAGTTGTGATCTTCTGCCATAGACATGATG
CACTTGCATTCACAAGTATAAATCCATAGATTTGAG
Gene-mRNA-Prot
The following mRNA feature(s) are a part of this gene:
The following polypeptide feature(s) derives from this gene:
Position
The following features are aligned
| Aligned Feature | Feature Type | Alignment Location |
|---|
| Sc0000179 | genome | Sc0000179:178768..189153 + |
Properties
| Property Name | Value |
|---|
| Logic name | gff3_genes |
| Gene id | BL96238 |
| Biotype | protein_coding |
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