XLOC_040721 (gene) - C. hemisphaerica

Overview
NameXLOC_040721
Unique NameXLOC_040721
Typegene
OrganismClytia hemisphaerica (Jellyfish)

Sequence
The following sequences are available for this feature:

gene from alignment at scaffold_427:218324..249368+

Legend: gene
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>XLOC_040721 ID=XLOC_040721|Name=XLOC_040721|organism=Clytia hemisphaerica|type=gene|length=31045bp|location=Sequence derived from alignment at scaffold_427:218324..249368+ (Clytia hemisphaerica)
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ACGTTGACGTCATAAGTTTATTCTATATACTTTTAGGCTGTTTACTTCAC TGCGACCTTCCCTTACGTCGTGTTGATCATTCTTTTCTTCGTTGGTGTCA CTCTCCCAGGAGCTGAGATTGGATTGAAAGCTCTCTTCACCCCTAAAGTA AGTAATTATCCCATCTTTTTCTTGCACGATCGAAGAAACTTAATCTTTCA CTTTGTACGAATGAAATGAAGACCAAGATATGATATAAAATAAATATCTG TCTTGATGGTCaggaatttcaaatttttcaaattctgttgTTTGAAGTTG TAGCTTCGTAATTAAGATTAGAGTTTGGATCCATCGGGGTGTTTAAGATG TTGGTAAAATTGCAATAAGACTGATGATTTATTACTTTCAGTGGGAGAAG CTGATGGAGCCAGAAATTTGGATGGATGCTGCAACACAAATGTTTTTCAC CCTGTCTCTTGGATTCGGTGCTCTTGTTTCTTTCGCTTCTTACATGCCAA GGAAGAATAACTGTGTTCGTGATGCCTACACTGTTGTCTTGATCAATTGT GGAACTTCAATCTTTGCCGCAATCGTTGTCTTTTCCATTCTTGGACATCG TCAGCTGATCACTGGCAATCCAGTCGAAAAGGTActtattgaatttgaaa taaattaacTTGTTCAAAGAACTATTTTCGACAAGTGCGAGAACTATTCA AGTGAACTTTTTTTCGTCCTATGTAAAAACTTTTATAATAAATAACTAAA CAAGCTTTATTTATAAGGTCCCTTTATCTATCCAATTTATTCTAGGTTGG TGGTGGTCCAGGGCTTGCCTTCATCACATTTTGCGATGCTTTCCTCCAAA TGCCGGTTTCACCGTTATGGTCTTCTCTCTTCTTTATCATGTTGATTCTG TTGGGAATAGATTCGGAATTCGGAACATTGGAAGGGGCCATCGCTCCTTT 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CACCACACGTGCCAACTAAATTTTGACTAATTGTAACTGAAAACTTTTAC CggaattttaaaatctaaaaaaactaaaataactaaaaatcgaCCCGACA GatacaaagtttgaaaattaataGTTCTGGGAACCTTTCAGATATCTTAA CAGCCTTAAAAAGGTCACGTCTATACCTAATTTTGCCTAGGTGCCCCCTG GGCTTGTGATACTTCACATCATAATAAAACaaggtaaaattttaaaataa aagatcTTTCCTAATTCGACAAAATACCCTAATAGAGGCCCCCCctagcg gcacccctaatcacgccatcacgcaaaaaaattttctcaatcacgcatca cgaaaatcgctaaaatttgtcatcacgcaaaaaatagctaaaatagccca aatcacgcatcacgcctcaaattttggccctatcacgcatcacgccaaaa tcttgatcacgccatcacgccaaaaaaaatcacaaatcacgccatcacgc aaggaaaaagtcccaatcacgccatcacgcaaaccgctgggggggggctc CTAATAACATAActaaatgaaaatgatttctaaGGTTAACAATAACGTTT CTTTCAAGTATAAGGTTTTCGCCTTTGAaagatataataaaaacaatgaa aattttcaaaaattgaatggtGCGAAAAATTTAGATAGCGCGTCAATCTT AAAAAGCGCGTTGGCACGTTTGGCGCGTAagaaaaaatatccaaaatctt tttaattgCGATTGAACTAATCATTCTTCCTCGTTCAGTAAATGACTTGG GAATAGAATGGTATAATGACAATATAACGTGCATATTATTCATCAATCAA TTCTATCATGGCCTTAATGAAAAGATTCtgtgaaatgtgaaaaaagttta tatATGATCAAGTAGACAGTTAGTTCGATTGGAGTGGTTGTGAACATAAT 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GAGTTCAAACATCAGACCCTACCAGGTGAAATTTGGATCTTAACACTATA TTATACTGTATTATGAGTGTTATTTTTAGGACAAAACAATCATTGTTGTA AAGAAGGAGCTTTCAAACCCGACAAACAAAACATTTGATTTCAATACCAT GACAACAAACGAAACAGCAGCAATCCTTAAGAAGTACACGATCCATAAAA CAATCGATCCAAACACGGGTGACGTCATCAACTACACAACAATTTATGAC ATCAACAATTACACTATTGGTGAAGGTCTGAAACATCCTGGTAAAGCAAA CTTCTTGGGCTTGATCATCTTCGCCATAGTGGTAGGGAAGATTGCAGGAG GGATGGGGAATCGAGCAAAACCTTTCGTTGAATTTGTGACAGTGTTTAAT GAAATCATCACACAGATAGTCATCTATGTTATGTGGTAATTTTGCCAGTT ATCTTTTGATCCATCTTCCTGTTGATTCATTTTCATATGCTTAGATCCAT TAGATTTGAGCGATAGATTCTTTTCTCTAAAGAGGCATTTTTTATGGAAC ACTATATAAATAGTGAAAAGATAATTCATGCATAGTTAAAGATCGCATTG ATAATTTCTTAAAACAAGGCCAATGCTACCTTTGTTTGTATTTAAATCGG CCATTTTCTAGGTGTGCACCATTCGGCATATTGAGTTTGATTGCAGCACA GTTTGCTCAGATGGAAGACATTGCGAGCACGTTTGAAAGTCTTGCATTGT TCATGGTGACTGTTTCACTTGGGGTATTTGCCCATGGATTCATCGTTCTT CCTTTCATCTTCTGGCTGTTCACCAGAACAAACCCTTTTCGTTACATTCA AGGTTTAACTGAAGCATTGTTTACTGCTTTTGGAACTGACTCCAGGTGAG ATATTTATTTCACATCCGAACTGTCCTCTTCGATGCGTTTGGCATGTTTT GATTCACGATCATTGTCAGCAAAGCGCACGCGTTATGTTATCACAGGCTT TGAGGTTCAATTAGTACCCTGGTGAATTCAAGTAgccttatttttattca aaaaacaatcaTCGATGttttttactttgattttaCCAGCGCTGCAACAC TACCAATTACCATGAGATGTTTAGAGGAGAATTTACACTTGGACCGCAGG ATCACTAGGTTTATTCTTCCAGTTGGTGCTACGATTAATATGGATGGCAC TGCTCTCTATGAGGCTGTTAGTGCTATTTTCATTGGTGAGTCGATAATAA TTCCCTTCATATACTGTCTTCGTTTAtcttttaaagcatttaaaaagATT CACCCATTCATCCACTCCATTACACTTTTAGCACAATCAGTGGGCGCTTC ACTCAGCTTTGGTGATTATGTGGCAATCAGGTAACAAATATTTCTTCACT TCTGAAACTCGAAAACCATGAAaccatttctttttaattcatgTCCATTA TTGAGTGTCATCTAAATTAAACATTTCTTTCGCATAGCTTCACCTCCATC TTGGCATCAGTGGGAGCAGCTGCAATACCACATGCTGGCTTGGTTACCAT GTTGATTGTCTTGGATACGGTTGGTTTGCCAACAGAAATGGTGGGCATCA TCTTTACGGTGGATTGGCTGTTGTAGGTTTATTTTCAACGttctttaaat tctttaaaGTCCAATTTCTCTACTATATCGATAAGTAGACCGGAAGCACA AAGCCCCCTCTCTCACCATCTACACTCTGTTTATTCTTCCCTCGTTGTTT TGCAGGGATCGTTTCCGCACAGTGGTCAATGTGTTGGGTGATGCTTTTGG AACAGGTATTGTTCAGCATCTATCACAGACCGATCTTAAAaagagtgaag aagaaaatacagcaaaaattgatcaaatacaAACAGATAATGAAAGTCGA ATTGATATTTCAGAAGATAATGGACTAAACTAAAATAATGTAAAAAGTGA AAGCAtacttcaaaaatgaaaattttaccagatttgaaatcttttgaaca TTCGATTTTGTATTTAGTTTTCTGTTGGatggaaaaactaatgataataC GATGGAGAATGGTGTGCAGGAAACAATGATgagaaataatttcaaatatt gTCATTCCGATAAACAAGTAATGgtgatttgatttattttatagaccagc ggccgaggtagtgaattgtgtcacttcgtagggcacccttagatcagggc aaatttttttatattatgttcctaatagggtgtagaattgaccaaaaaat ttgccctttgaatctcctgcagttttcgagtgaatcgactTTTAGTTTCT CCTATTAGGAGCAtagtatcaaaaatttgccctgatctaaggagtgccct acgaaaaccatttttaaggccttttctgaatctcggacgctggtctattA TATTTAATCAACATATTTAATCAAAAGACTGGTTAATCTCATTTCTGGTT GTATCATTGGAATctagtattttttaaacttttttagttttaagaaaAGG GGTTTTACAAGGGGGTTGCAATGCAGTGATCACAACTACATAAAC
Gene-mRNA-Prot
The following transcript feature(s) are a part of this gene:
Feature NameUnique NameSpeciesType
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TCONS_00064928TCONS_00064928Clytia hemisphaericatranscript
The following polypeptide feature(s) derives from this gene:
Feature NameUnique NameSpeciesType
TCONS_00064916-proteinTCONS_00064916-proteinClytia hemisphaericapolypeptide
Position
The following features are aligned
Aligned FeatureFeature TypeAlignment Location
scaffold_427supercontigscaffold_427:218324..249368 +
Expression

Hover the mouse over a column in the graph to view expression values in transcripts per million (tpm).
Sort Descending | Sort Ascending | Only Non-Zero Values | Tile/Chart | Reset | Show/Hide Values

Values :
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206.58 186.51 827.38 942.48 589.42 470.86 299.69 328.81 192.02 253.33 115.39 120.75 228.49 250.42 152.22 111.89 266.65 371.16 308.84 317.13 437.19 447.3 328.79 363.95 307.31 293.77 395.02 320.59 186 218.34