XLOC_001122 (gene) - C. hemisphaerica

Overview
NameXLOC_001122
Unique NameXLOC_001122
Typegene
OrganismClytia hemisphaerica (Jellyfish)

Sequence
The following sequences are available for this feature:

gene from alignment at sc0000018:626970..636603-

Legend: gene
Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.
>XLOC_001122 ID=XLOC_001122|Name=XLOC_001122|organism=Clytia hemisphaerica|type=gene|length=9634bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000018:626970..636603- (Clytia hemisphaerica)
ATTAGGTGGAAAACTTGAACAACTTGCTGAAAACGCTGTCAACAAGCTTG
ATGAATTACAAAAGAAAGATAAAGAGATTTCAAATCTTCAAGACAACCTT
GAGAATCTGACCATTGAAGATCCAGAAATCAAGAAGCTTAAGGAGACATT
GTACTTGATCACCAGACAGATACAGAACATGCAATTCAATGAAGAAGAAA
AAACAAGAAGTGATGGAAATTCTGGAATCAAACAAATCAGGACAAGAAAT
GGTAAGTATATTATACGGTGATAAGCGAATATCTAACACTTTAACACGTC
CCATACTAGATTCCTTTCTCACAGCCCCAGTGGAACTTTTTTCTCAGTGG
GGATGAAAATTTCCATCAAAATCCCAATGGGGATAGAGATTCTATTGTTC
CAAGGATAAAAAATCCAGTGGGATAGTTTTGGAGTGCAATTTTTGAACAT
GGGATTTCGAGTGGGGATGAAATCAAAGTCAATTTCCCAGTGGGGCTGAA
ATTCAAGGGTATTTTTCCACCGTTGGCTAAATTTTCCAGTGGGACTGGTG
TCCCAGCAGGTCTGTGAGACAGGGGTGTTATACTGCGTATCAGCGCATAA
GTGGATTTTGAGAACTTTAATGCGACTTGTTTACAAACCAAATGGACCAA
AAGAAAACCCAGTGAGAATATACTCTAAAATTTTATCGACAAGGAAAAGC
CATATTTAAGTCTCACCCTTATGTAATAAATCCTACAAATAAAAACAAGA
GATATTCTTCCCTTTTGAGGTTTGACATTTAGCTTCTTGCAGGCTAAAAT
TAGAAAAATATTAGAAAAATCTCAGCGGACTGATGTTGCCACAATTTCTA
AAAACTATGATACAATTCCATAGAAAATACAATCTTTATCACGCTCAAGT
AGAAAACATTCGATATAACACTTAGGGTGTTTTTACACTGACGGCTTAAG
CTAACATAGATGATTAACGAAACGTTTACCAAAATGATAAATAGCCCAAA
CTATTCATATACCTTATCGGCCAAAACTTAGTCGGCCCTAAGTGACTAAA
TTTTGGCTTGGTGACTAAAATTAGGGCCGACTAATAATTAAGACCGACTA
ATAATTAAGGCTGACTAAAATTAGGGCCGACTAATAATTAAGGCCGACTA
AAATTAAGGCCGACTAAGTTTTGGCCGATAAGTTAATTTTTGGATGAAAA
GAGATGGTTGCACGTTAATTGTTTTCTTTTCAGAAAAATTTTGTATTACC
CAAAGCAACACAGGAGAAAATCGAAAAATAATTTGTTTATTGCACGTATT
TCCCTCAAATCTCTCTTTTTTATATTATAGCTGGTGGAAAAACTTACCAT
TCAAGTTCGCACACTGGACGTTCTTTTGCTTCCATCCATGACCATTCAAA
CAATAAGAAAATATGCGGTATGGGTGAGTTCATCGGCGTTTTAAACGGCG
TCGAATTCCGTACACGTCACAACGATTACGCATTACGTTCAGCCGCTCAT
AATGATAAAAGATATGAAGCAACAAAAGAGCTAGAATTCCCAGACGTTCC
GCCACGTGTTTTGAAAAAAACTACGGTAGCCGAACAAATTACAGAAATGA
AAGAATGGTTTAAAGCATTCAAAAATCAAGATTATAGCAACCGTGATTAT
CGTAAATATTTCAAACCGATTTTGTGTTACTTGGAAGGGGCCTGGACACG
ACCAAAAGATGACAAAGGGGGTATTGATGAACCTTTCGAATCGGATCGAC
ATTCTATTGATGCGAAATCTTGGTTTGAGCTTCAAAATAAGGTGTGAATA
TATTCTTACTATCTGCTTGGTATGAGCTTCAAAATAAGGTGTGAATATAT
TCTTACTATCTGCTTGGTATGAGCTTCAAAATAAGGTGTGAATATATTCT
TACTATCTGCTTGGTATGAGCTTCAAAATAAGGTGCCAATATATTCTTAC
TATCTGCTTGGTATGAGCTTCAAAATAAGGTGTCAATATATTCTTACTAT
CTGCTTGGTATGAGCTTCAAAATAAGGTGCCAATATATTCTTACTATCTG
CTTGGTATGAGCTTCAAAATAAGGTGTCAATATATTCTTACTATCTGCTT
GGTATGAGCTTCAAAATAAGGTGCCAATATATTCTTACTATCTGCTTGGT
ATGAGCTTCAAAATAAGGTGTCAATATATTCTTACTATCTGCTTGGTATG
AGCTTCAAAATAAGGTGCCAATATATTCTTACTATCTGCTTGGTATGAGC
TTCAAAATAAGGTGTCAATATATTCTTACTATCTGCTTGGTATGAGCTTC
AAAATAAGGTGCCAATATATTCTTACTATCTGCTTGGTATGAGCTTCAAA
ATAAGGTGTCAATATATTCTTACTATCTGCTTGGTATGAGCTTCAAAATA
AGGTGCCAATATATTCTTACTATCTGCTTGGTATGAGCTTCAAAATAAGG
TGTCAATATATTCTTACTATCTGCTTGGTATGAGCTTCAAAATAAGGTGC
CAATATATTCTTACTATCTGCTTGGTATGAGCTTCAAAATAAGGTGTCAA
TATATTCTTACTATCTGCTTGGTATGAGCTTCAAAATAAGGTGCCAATAT
ATTCTTACTATCTGCTTGGTATGAGCTTCAAAATAAGGTGTCAATATATT
CTTACTATCTGCTTGGTATGAGCTTCAAAATAAGGTGCCAATATATTCTT
ACTATCTGCTTGGTATGAGCTTCAAAATAAGGTGTCAATATATTCTTACT
ATCTGCTTGGTATGAGCTTCAAAATAAGGTGCCAATATATTCTTACTATC
TGCTTGGTATGAGCTTCAAAATAAGGTGTCAATATATTCTTACTATCTGC
TTGGTATGAGCTTCAAAATAAGGTGCCAATATATTCTTACTATCTGCTTG
GTATGAGCTTCAAAATAAGGTGTCAATATATTCTTACTATCTGCTTGGTA
TGAGCTTCAAAATAAGGTGCCAATATATTCTTACTATCTGCTTGGTATGA
GCTTCAAAATAAGGTGTCAATATATTCTTACTATCTGCTTGGTATGAGCT
TCAAAATAAGGTGCCAATATATTCTTACTATCTGCTTGGTATGAGCTTCA
AAATAAGGTGTCAATATATTCTTACTATCTGCTTGGTATGAGCTTCAAAA
TAAGGTGCCAATATATTCTTACTATCTGCTTGGTATGAGCTTCAAAATAA
GGTGTCAATATATTCTTACTATCTGCTTGGTATGAGCTTCAAAATAAGGT
GCCAATATATTCTTACTATCTGCTTGGTATGAGCTTCAAAATAAGGTGTC
AATATATTCTTACTATCTGCTTGGTATGAGCTTCAAAATAAGGTGCCAAT
ANTGAAAATATTCAGTGAAGTTTCCTTTTACCTTTTACCAAAATTCGAAC
GTTCGAAATGGATTAAGCCTGATTTACACTTCAACTCAAAAACAAAAAAC
TAGAAAATTAATTAGCGGGAGGGGGAAGTCTATTCGGGACCTTGAGTATC
CCTTTGTTTGGGAGACCCAACCTTATCTTCTCGCTGCAAATGCTGAAACC
CCCCGGATTTACCAATTTTACCCCCCAATTTTAGGTTTAAAGCCCTCTGG
AATTCTGAATTCTTGTTCAATTCTGCAACCCTCATGGGGGTATACGGTTT
TATCTTTCAAAAGCCCTTTCGAGTGATCACCTTATTCAATTTCTACTTTT
AACACAATTCTTGGTCAAATGGTATAAGAGATTATAGTTGATTCCCTCTA
ATTCGATCTTCAGACAATGAATTTTCTTCCCCAATAAAGATTCGAATTAC
GGAGAGTACTTTAAAAGATTTTCCAGTTGAAGGGACCAATGTATTAATTA
GCTCGAATTACAGAAACATTATGAATAGGAGAGAGTTGACAGTATTCTCT
TAATACATCGTTAACAACCTCGTGTCTAGCATAATGTTCTTAAAATTTAC
ATTAACCGCCTTAATGGATTGAGAATTTTAGAATCGTTTAATGGACATAG
GGCACTTCTCTCACTGGGCAATTTTTCTGCTAATTATTCCATGCGGGATG
GACAGTCCCCCGGGTTTATAATACGAGAGCGAGCGTCCTGTGAGTAAGGA
TTTCTTATCAATATACATTGATGCTTCTGAAAACCTTGTGGATATCGCAA
ACAAATGAAAAAAAATAACAATATTTCACAAGTTTACCCTAAGAATGCAT
AAGCTTCAATTCTGAACTTAGATATTTACTTATTAGCAATCTTTCCCTCA
TAACGTTGCCAATAAAAACTAAAAATACAGTTGATTATTCTTAAGGATTG
TTACAAAGCGCCGTTTCTTCCAAGATAACTTGACGACGGACATACATCAA
AACAAACAGCGACATGCTATGAAAGGACCGAAAATGCTGAGCCAAAAATG
TGAATCATTCTGAAATCTCTGCAGCTAAATTTCCATTCGAAATTTCTTAT
AGATTCGTTTCACATCTTATTCTGGAACCAAAGACTTATTAGAGAATCTA
GCATGGTTGCCAACTTCAATCTTTGGATTTGACGAGAACAAGAAACCTAA
GCTAGCTCAATGGAACTACCGTATCTTATGTCATCCTTTGTCTAAAGACT
TACCAACAAGCTATTTGAAACCCATTATGGATCCTCATTCTCAAAAAATG
AATGGCTGGAACGACGAGAAATTCTTAAACACCAGAGCTATTCGTTTTAA
TATCGAAGGTATGAACAATATTATCATATATCATAATGAAAAAAATGAAA
AATAGGCTAAATTTAAGTCATCCAGAGTTGCAACTCAGTAGGTACGAAAC
GTTAAATCAACGTCTATTTAACGTCCCTAACGTTCATAAAACGTTAAATG
AACGTGAAAAAATGTTGTGTACCGGCTTGGAAGATTATGAGCAATATAAT
TCAGTGGGGTTTTTAACTAACAGGGGTTCTAAAAGGGTGGTGCCTTGAAC
ATAGCATTCCATTTTTTTATATAATAGGCGTGGATCGCAACGGCAAGTGG
AGGGATCACCCACAAACATATAACCTCATGGATGAAATGATGGAAGAAAT
TCCTGGCAAAGATAATTATGGTGGGAATGTATCAGCAAGTTCTTTTGATT
CTATTGCAATGAGTGCAAACCCTTCCAAAAGTGGACAACCATTAAACGGA
GCTTATTACCATCGACCCTATAAACTATGTAAGAATTGATCTTTTTTGTT
TTTAAGTTTTAGTTAGTCTGTGACCACGCAGACGGAAGCGACCCAAAGGC
TCTTCTTTCGATAGCTAGCTACCCAAAGGTAGGGGAGAGCGCCACTCTTT
CTCCCTGGATTGTTCCACCTTCCCTTGATCCTTCCCTTAATTGCTGAGCA
TCAAGCAGAGAGGCGTCAAGTACAATGTAGGGAATATTTGGTATGACCCA
GCTGGGGATTGAACCTATATCCTTGCGCAACGTAGGCGGATGCTTTACCA
CTGTACTACGGTCACCTTTTTAGTTGTCTGTAAACACACCTGAAAATCTA
CGGAAATTTCAAAATTAATTTCCGAACACTACATTATACACGTGAGGTAC
ACTCTTGTGTAGAGAAGATTTTCAATAAAATTATTATCTTTGTTAAAGGG
TGCATATCTGTGTGACATAGATAATAAGGCTTTGTTGTAGCAAAAACCTT
TTTACTGCATCGTCCTTATTATCTGACCATTTGGAAATCCACCTCCCAAG
GATATGATGTAAAATTTCAATTTATTACGAACCAGGTTAAAAAAATCAAG
ATATTAAAATCTGAATAACATATTCTAAGGCTTGATGTTAGCAGAATTTT
ATTTGTTAGTTCGCTATAACTTTGATCCTATTTGCGCATGACTTCCTCTT
TATCTAGCTTTAACCGAATCATACGAGGCTATCTAGCACTAGAATATCTC
TGGTAAATTCCCCGATCTTTTTTACAAATTTAAGCTTTAGAACACCCTGT
GTCCAGCCCCACCGGAAAATTTCATTCCCGTTGGGAAAATATCCAGGAAT
TTCAGCACCTCTGGAAAATTGACTTTGATTTCATCCCTATTCGAAATTCA
TGATTAAAAATTACACTCCAAAACCATCCCCACTACATTTTTTAACCTTG
GAGCAATAGAAATACTATCTTTATTGGGATTTCAATAGGAATTTTTTATC
CCCACTGAGGAAAAAAGTTTCACCGAGGCTGTTTAGAAAGTGGTGTTTTA
GAAAAAGAAATTTCCGATGGAAAAAGGAGAGAAAGTGTGCGCGATTGAAA
TCACTGTATCATTAATAATAAACACACTAAAAACTAATAAACAATAAATA
CACCTTTTCGACCCTAAAAACGTCCCAGTCTTTTTTTACTACAGTATTGT
CTATAGGTGCGAAAAAAAAAGGATTGGGACGGTTTTGGGTAGTAAAACGG
ACCAAAAAATGCCCGCACAGCAATTGGTGGCTACGGTCAAAAAGGTGTAT
TTCCATATAAATATTCTGAATTTCATTATTCAGAACTTCCATTTATTTCA
TCATATGATCGATACCTTTTATTCCCTCGGTATAATGTAGCTAAAAAAGA
TGCCATGGGTACAGATTCAACGCAGCGTGGTTATTCAGATCGTTTGTACA
TGGCCATGAACAGTCAAGAGAGAATCGCTGGTCAAACTTACACAGATAAA
GATGGAAACGAAGTGGAGACCAAAGTCAGTTACGCTATCCCCATGGAGAT
CATTTACTTGACGCCATTAGCTAAATGGAATCCTTATGATATCCAATACT
CAGAGGACCCAAAGGTAAAAATTCATTTTTATTCATCCTTTTCTGATTCT
GATACCACTTACGATAGACCTTTTCATAACTTACGTCAAGAACATCACTT
GCCTCGTATTCAAACAATTACCATGGTGATTATGTCCCTTGAGACATTAA
TTGATCTTTTTATGAATAAAAAGTAGTTTTATCAAAATCCGCTGGGAGTT
AATCACCATGGCAATATTTTCAAAACGAGGCAAGTGATGTTCGTAACGTA
ATTTGTCTATTGTATATATCACATCCATCAGTCAAATCAAAAAGTGGTGT
ATAAGTGGCTTTGGGTACGAGATTGCATTCCCCTGGGAGGGATACTGTAG
GCTATGATTGTCAAAATCCGAGAAAAGATTGGGTTTTCGAGGCGAGTTTA
CAGTTACCTTATTACACGAATATTACTTGGCAAGTATTCAACGGCATCAA
TAAATAAATAAATTTTTGTTGCTTCTTGCCTGTGACCCATCCAAATATTC
AAGCTTTAATATTCAACGGCCTTGAAATTAACACAATTTAAAATTGTTTT
CTTCATTCATTCATCACCAGGCCACCGGGTCAGGCAGCAAAGGCAATCCA
TACAGTCACTCGGATCAAAGAAACTTTTTCCACACTCCTGCATCCTTCTT
CACTGGTGTTGGCGAATCTGATGCTGCTGATACTTCTAAAACTGGTGGTG
TATGGATCAAGAACTCAACAGGTACGAATAAATTCACATTTTAAGTCCAA
ACGTGTTGTTATTGACCAAACTCGTTCCCGGTCCCTTAGTTCGCTTTTAA
CTAATCTCGGTAGTGCTCACGAAAGTACCGACGCCCATCTGCCGTATGTA
TCACAGTCACTGTGAACATAAAATGTGATAGCGAGCCGAGGTTAATTAAT
CAGAGACTAAAAAGTGACAACTGGTACAAGATCTTAAACCAATACCTAAC
CCTATTCTAGGGGCGGTTCAAAACTAGGGGGGGGGCTGACCACCCCTTAA
CTTTTAATCTGGTGGGTCTTTTCGGATGAAATTTGGCACACAAGATCCTT
GTCACATAAGTTAACTTTTGACAGGAAGTTTTTTTGACGATGTGACTCAT
CATGCCCAAAATGAGCAAAAACCGAAAATTTCCTTTGATCTTATAACTAG
CTATTGTGATTTAACAAAGGCACTAAGAACAATAAACGAGAATGCTTTTT
CAAAACAATGAAAAATTAAATTGAATCTCGTCAATATATGAAGTGAAGGT
AGAGAGTCTACCATCATGTTTCCCTAACACCCTGCCGGTTCTTGGGATTC
GAACACAGCCCATTGCGGTGTAAGTTCGTGATCGAAATGTGCTTCCAGGT
AGGGTTTAGGGAAATATTGTGATAGACTCTCTACCTTCACTTATATATCA
CTCTCTCTCTCTCTCTCACTCTGGCTGATAATCGAAATGAGCTTAGTAAA
GCTCAAATTGTAGATGTAGAACGATAAACTCGGTAGACATTTTATCATTA
ACATAATTGTTAACTAAATTTAGAATAATTTAACTCTGGCAATGGAATCT
TGTTTTTGAGAATCTTGAGTGGAAGTTCTTTCATGAAATACAGATTTTAG
CTCTTGAAGGAGCTGAAAGAAAGTGCTGTAATCGTAATGAGTATTCATTG
TCCGTTTGGAAATTCAGGGTCTTAATTATCACAATTTTTTTCAATGCATT
TTGTCATAGTTACCTCAAAAACTGTTATTTATTCTTTAAACAGGTCACAC
GGTGAATACACAAGCTTCTGGTGTTCGAATCATGTCCCCAGAGATTGCTG
ACATTGAAGGTATCATTAGACAACGATATCCCATCATGCCCATTNTTAAA
AAAATAGCCCAAAAGTGACTTTATTTATCGCCCTTTAAATTGCTAAATAC
AAGGAATTTTGTCATAATTACGTCACAAACTATTATTTATTCTACATACA
GGTCACACAGTGAATACACAAGCTTCTGGTGTTCGAATCATGTTCCCAGA
GATAGCTGACATTGAAGGTATCATTCGACAACGATATCCCATCATGCCAA
TATATGGTGAAGGAAACACTATCTGGAAACGTTTGAATGCATTCGAAGAT
TCGTTGGACGGTTATGTAACCAAAGTTACCAACGATGATGTTTACTTCCA
AATGGGTGTATCACATGCTGAAACGACTGGTGATTCTGAGAAGGATATAA
CTGAACATAAACACACGATTCAGATGAGTTTGAAGAAATTCAAAGCAATG
AAAGCTGACCCGTCTTTAAGACATACGGTAACAACAACCAAAGCTGTTCG
ACATTCTCATGTATTGGTGCTTTATTATGATACAGTAGATGAGAAATTGA
AGATTGAAGAGTGCGATGCCAAACCCAAAGGAGCTGGTGACTACGTTTGT
TTTGATAAACATTTCACTAGCCTCACAAAACAAAATTGAGAACAAGAATG
GAATATTTAAATGCTGCCAGCACCATAGATTTATAAAGCCCGAAGGGCTA
GATGTCGTGCTTTAAGCAATCGCAGGCAAAAAAAGGTGAATATTGCAAGA
AATATTGTTGTTATTGTTTTCAAAAATCCCCGAAGCTTCTGATTGGTCGA
GCGCTGAAATTCTTTGTAATGTCACGTGACCTAGGTAGAATTTTCTACCT
AACCACGGCACACTCTAGCCCTTCGGGCCTTATAGATCTATGGCTAGCAC
CTGAACAGAGAGGAAATTACTATAAAATATACTTTAAGTATGATAATGTA
CTCAGGCTAATATTTCTCCATATCAAGGTACTTTATTGAAAAAAAATTAG
TTGTTTTAATTAACGAACTGTAAAAATTATTACAGCTAGTATGTTTAATA
TTTCGTTATTGTGTAATATGAAGAGGAAAGAAAC
Gene-mRNA-Prot
The following transcript feature(s) are a part of this gene:
Feature NameUnique NameSpeciesType
TCONS_00002155TCONS_00002155Clytia hemisphaericatranscript
TCONS_00002154TCONS_00002154Clytia hemisphaericatranscript
TCONS_00002153TCONS_00002153Clytia hemisphaericatranscript
TCONS_00002152TCONS_00002152Clytia hemisphaericatranscript
TCONS_00002151TCONS_00002151Clytia hemisphaericatranscript
TCONS_00002150TCONS_00002150Clytia hemisphaericatranscript
TCONS_00002149TCONS_00002149Clytia hemisphaericatranscript
The following polypeptide feature(s) derives from this gene:
Feature NameUnique NameSpeciesType
TCONS_00002149-proteinTCONS_00002149-proteinClytia hemisphaericapolypeptide
Position
The following features are aligned
Aligned FeatureFeature TypeAlignment Location
sc0000018supercontigsc0000018:626970..636603 -
Expression

Hover the mouse over a column in the graph to view expression values in transcripts per million (tpm).
Sort Descending | Sort Ascending | Only Non-Zero Values | Tile/Chart | Reset | Show/Hide Values

Values : 
    GrOo_1	 GrOo_2	 FGOo_1	 FGOo_2	 EG_1	 EG_2	 P1_1	 P1_2	 P2_1	 P2_2	 P3_1	 P3_2	 PoPr_1	 PoPr_2	 St_1	 St_2	 GO_1	 GO_2	 PH_1	 PH_2	 BMF_1	 BMF_2	 MMF_1	 MMF_2	 M_1	 M_2	 GEC_1	 GEC_2	 GEN_1	 GEN_2
0.42	0.51	0.78	0.52	0.27	0.34	0.96	0.8	18.38	13.48	12.15	17.78	71.43	110.24	0.48	0.29	10.47	27.88	344.73	387.48	1.41	1.44	0.6	0.89	0.34	0.4	0.16	0.09	0.05	0.06