XLOC_001122 (gene) - C. hemisphaerica

Overview
NameXLOC_001122
Unique NameXLOC_001122
Typegene
OrganismClytia hemisphaerica (Jellyfish)

Sequence
The following sequences are available for this feature:

gene from alignment at sc0000018:626970..636603-

Legend: gene
Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.
>XLOC_001122 ID=XLOC_001122|Name=XLOC_001122|organism=Clytia hemisphaerica|type=gene|length=9634bp|location=Sequence derived from alignment at sc0000018:626970..636603- (Clytia hemisphaerica)
ATTAGGTGGAAAACTTGAACAACTTGCTGAAAACGCTGTCAACAAGCTTG ATGAATTACAAAAGAAAGATAAAGAGATTTCAAATCTTCAAGACAACCTT GAGAATCTGACCATTGAAGATCCAGAAATCAAGAAGCTTAAGGAGACATT GTACTTGATCACCAGACAGATACAGAACATGCAATTCAATGAAGAAGAAA AAACAAGAAGTGATGGAAATTCTGGAATCAAACAAATCAGGACAAGAAAT GGTAAGTATATTATACGGTGATAAGCGAATATCTAACACTTTAACACGTC CCATACTAGATTCCTTTCTCACAGCCCCAGTGGAACTTTTTTCTCAGTGG GGATGAAAATTTCCATCAAAATCCCAATGGGGATAGAGATTCTATTGTTC CAAGGATAAAAAATCCAGTGGGATAGTTTTGGAGTGCAATTTTTGAACAT GGGATTTCGAGTGGGGATGAAATCAAAGTCAATTTCCCAGTGGGGCTGAA ATTCAAGGGTATTTTTCCACCGTTGGCTAAATTTTCCAGTGGGACTGGTG TCCCAGCAGGTCTGTGAGACAGGGGTGTTATACTGCGTATCAGCGCATAA GTGGATTTTGAGAACTTTAATGCGACTTGTTTACAAACCAAATGGACCAA AAGAAAACCCAGTGAGAATATACTCTAAAATTTTATCGACAAGGAAAAGC CATATTTAAGTCTCACCCTTATGTAATAAATCCTACAAATAAAAACAAGA GATATTCTTCCCTTTTGAGGTTTGACATTTAGCTTCTTGCAGGCTAAAAT TAGAAAAATATTAGAAAAATCTCAGCGGACTGATGTTGCCACAATTTCTA AAAACTATGATACAATTCCATAGAAAATACAATCTTTATCACGCTCAAGT AGAAAACATTCGATATAACACTTAGGGTGTTTTTACACTGACGGCTTAAG 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TCACAGTCACTGTGAACATAAAATGTGATAGCGAGCCGAGGTTAATTAAT CAGAGACTAAAAAGTGACAACTGGTACAAGATCTTAAACCAATACCTAAC CCTATTCTAGGGGCGGTTCAAAACTAGGGGGGGGGCTGACCACCCCTTAA CTTTTAATCTGGTGGGTCTTTTCGGATGAAATTTGGCACACAAGATCCTT GTCACATAAGTTAACTTTTGACAGGAAGTTTTTTTGACGATGTGACTCAT CATGCCCAAAATGAGCAAAAACCGAAAATTTCCTTTGATCTTATAACTAG CTATTGTGATTTAACAAAGGCACTAAGAACAATAAACGAGAATGCTTTTT CAAAACAATGAAAAATTAAATTGAATCTCGTCAATATATGAAGTGAAGGT AGAGAGTCTACCATCATGTTTCCCTAACACCCTGCCGGTTCTTGGGATTC GAACACAGCCCATTGCGGTGTAAGTTCGTGATCGAAATGTGCTTCCAGGT AGGGTTTAGGGAAATATTGTGATAGACTCTCTACCTTCACTTATATATCA CTCTCTCTCTCTCTCTCACTCTGGCTGATAATCGAAATGAGCTTAGTAAA GCTCAAATTGTAGATGTAGAACGATAAACTCGGTAGACATTTTATCATTA ACATAATTGTTAACTAAATTTAGAATAATTTAACTCTGGCAATGGAATCT TGTTTTTGAGAATCTTGAGTGGAAGTTCTTTCATGAAATACAGATTTTAG CTCTTGAAGGAGCTGAAAGAAAGTGCTGTAATCGTAATGAGTATTCATTG TCCGTTTGGAAATTCAGGGTCTTAATTATCACAATTTTTTTCAATGCATT TTGTCATAGTTACCTCAAAAACTGTTATTTATTCTTTAAACAGGTCACAC GGTGAATACACAAGCTTCTGGTGTTCGAATCATGTCCCCAGAGATTGCTG ACATTGAAGGTATCATTAGACAACGATATCCCATCATGCCCATTNTTAAA AAAATAGCCCAAAAGTGACTTTATTTATCGCCCTTTAAATTGCTAAATAC AAGGAATTTTGTCATAATTACGTCACAAACTATTATTTATTCTACATACA GGTCACACAGTGAATACACAAGCTTCTGGTGTTCGAATCATGTTCCCAGA GATAGCTGACATTGAAGGTATCATTCGACAACGATATCCCATCATGCCAA TATATGGTGAAGGAAACACTATCTGGAAACGTTTGAATGCATTCGAAGAT TCGTTGGACGGTTATGTAACCAAAGTTACCAACGATGATGTTTACTTCCA AATGGGTGTATCACATGCTGAAACGACTGGTGATTCTGAGAAGGATATAA CTGAACATAAACACACGATTCAGATGAGTTTGAAGAAATTCAAAGCAATG AAAGCTGACCCGTCTTTAAGACATACGGTAACAACAACCAAAGCTGTTCG ACATTCTCATGTATTGGTGCTTTATTATGATACAGTAGATGAGAAATTGA AGATTGAAGAGTGCGATGCCAAACCCAAAGGAGCTGGTGACTACGTTTGT TTTGATAAACATTTCACTAGCCTCACAAAACAAAATTGAGAACAAGAATG GAATATTTAAATGCTGCCAGCACCATAGATTTATAAAGCCCGAAGGGCTA GATGTCGTGCTTTAAGCAATCGCAGGCAAAAAAAGGTGAATATTGCAAGA AATATTGTTGTTATTGTTTTCAAAAATCCCCGAAGCTTCTGATTGGTCGA GCGCTGAAATTCTTTGTAATGTCACGTGACCTAGGTAGAATTTTCTACCT AACCACGGCACACTCTAGCCCTTCGGGCCTTATAGATCTATGGCTAGCAC CTGAACAGAGAGGAAATTACTATAAAATATACTTTAAGTATGATAATGTA CTCAGGCTAATATTTCTCCATATCAAGGTACTTTATTGAAAAAAAATTAG TTGTTTTAATTAACGAACTGTAAAAATTATTACAGCTAGTATGTTTAATA TTTCGTTATTGTGTAATATGAAGAGGAAAGAAAC
Gene-mRNA-Prot
The following transcript feature(s) are a part of this gene:
Feature NameUnique NameSpeciesType
TCONS_00002155TCONS_00002155Clytia hemisphaericatranscript
TCONS_00002154TCONS_00002154Clytia hemisphaericatranscript
TCONS_00002153TCONS_00002153Clytia hemisphaericatranscript
TCONS_00002152TCONS_00002152Clytia hemisphaericatranscript
TCONS_00002151TCONS_00002151Clytia hemisphaericatranscript
TCONS_00002150TCONS_00002150Clytia hemisphaericatranscript
TCONS_00002149TCONS_00002149Clytia hemisphaericatranscript
The following polypeptide feature(s) derives from this gene:
Feature NameUnique NameSpeciesType
TCONS_00002149-proteinTCONS_00002149-proteinClytia hemisphaericapolypeptide
Position
The following features are aligned
Aligned FeatureFeature TypeAlignment Location
sc0000018supercontigsc0000018:626970..636603 -
Expression

Hover the mouse over a column in the graph to view expression values in transcripts per million (tpm).
Sort Descending | Sort Ascending | Only Non-Zero Values | Tile/Chart | Reset | Show/Hide Values

Values :
    GrOo_1	 GrOo_2	 FGOo_1	 FGOo_2	 EG_1	 EG_2	 P1_1	 P1_2	 P2_1	 P2_2	 P3_1	 P3_2	 PoPr_1	 PoPr_2	 St_1	 St_2	 GO_1	 GO_2	 PH_1	 PH_2	 BMF_1	 BMF_2	 MMF_1	 MMF_2	 M_1	 M_2	 GEC_1	 GEC_2	 GEN_1	 GEN_2
0.42 0.51 0.78 0.52 0.27 0.34 0.96 0.8 18.38 13.48 12.15 17.78 71.43 110.24 0.48 0.29 10.47 27.88 344.73 387.48 1.41 1.44 0.6 0.89 0.34 0.4 0.16 0.09 0.05 0.06