XLOC_045230 (gene) - C. hemisphaerica

Overview
NameXLOC_045230
Unique NameXLOC_045230
Typegene
OrganismClytia hemisphaerica (Jellyfish)

Sequence
The following sequences are available for this feature:

gene from alignment at scaffold_86:541365..552241+

Legend: gene
Hold the cursor over a type above to highlight its positions in the sequence below.
>XLOC_045230 ID=XLOC_045230|Name=XLOC_045230|organism=Clytia hemisphaerica|type=gene|length=10877bp|location=Sequence derived from alignment at scaffold_86:541365..552241+ (Clytia hemisphaerica)
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cgaaaaaaaatcaacattgcTGCACGGTTTTATACCCCCTAATGAATCGT TCAATTTTTTATTAATATTTGCAGAATCaagatttcaatgtttttttcct tttactCTTTTCATCAGACGAATTgataagaaattaaatttttgcgttta agagagaaaaaaaacaaatagccAGAAAAAACATAGTCAGCGAAGATTTT TACCTGATTTCAATATCTCGCCGCTGGCTCACCATAGGATAACGATGGAT GGCCTCACAATATTATTTcaaactaaagtctgttccaaaaatgACAGTCA GCACATTTTGATACATTGTCCTTGAAGGTGTAGAGATAAATTAATATACT GCTAGAAATATCGTTTTGAGTGGATTTCCacctttttaaaactttggaaC TTccctgatttcaaatatgtattcgga
Gene-mRNA-Prot
The following transcript feature(s) are a part of this gene:
Feature NameUnique NameSpeciesType
TCONS_00072885TCONS_00072885Clytia hemisphaericatranscript
TCONS_00072886TCONS_00072886Clytia hemisphaericatranscript
TCONS_00072887TCONS_00072887Clytia hemisphaericatranscript
TCONS_00072888TCONS_00072888Clytia hemisphaericatranscript
TCONS_00072889TCONS_00072889Clytia hemisphaericatranscript
TCONS_00072890TCONS_00072890Clytia hemisphaericatranscript
TCONS_00072891TCONS_00072891Clytia hemisphaericatranscript
TCONS_00072892TCONS_00072892Clytia hemisphaericatranscript
TCONS_00072893TCONS_00072893Clytia hemisphaericatranscript
TCONS_00072894TCONS_00072894Clytia hemisphaericatranscript
TCONS_00072895TCONS_00072895Clytia hemisphaericatranscript
TCONS_00072896TCONS_00072896Clytia hemisphaericatranscript
The following polypeptide feature(s) derives from this gene:
Feature NameUnique NameSpeciesType
TCONS_00072895-proteinTCONS_00072895-proteinClytia hemisphaericapolypeptide
Position
The following features are aligned
Aligned FeatureFeature TypeAlignment Location
scaffold_86supercontigscaffold_86:541365..552241 +
Orthologs
The following orthologs are found for this feature:
Ortholog NameDescriptionOrganism
PCK2phosphoenolpyruvate carboxykinase [GTP], mitochondrial isoform 1 precursor Homo Sapiens
PCK1phosphoenolpyruvate carboxykinase, cytosolic [GTP] Homo Sapiens
Expression

Hover the mouse over a column in the graph to view expression values in transcripts per million (tpm).
Sort Descending | Sort Ascending | Only Non-Zero Values | Tile/Chart | Reset | Show/Hide Values

Values :
    GrOo_1	 GrOo_2	 FGOo_1	 FGOo_2	 EG_1	 EG_2	 P1_1	 P1_2	 P2_1	 P2_2	 P3_1	 P3_2	 PoPr_1	 PoPr_2	 St_1	 St_2	 GO_1	 GO_2	 PH_1	 PH_2	 BMF_1	 BMF_2	 MMF_1	 MMF_2	 M_1	 M_2	 GEC_1	 GEC_2	 GEN_1	 GEN_2
107.67 94.47 21.54 13.38 381.3 311.02 532.33 648.29 743.5 1025.14 1948.14 1093.38 426.66 696.1 526.3 369.39 297.83 216.39 450.58 394.67 1035.94 1062.78 628.6 831.55 735.11 796.7 1340.04 1941.42 279.3 328.21